FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6655, 423 aa
1>>>pF1KB6655 423 - 423 aa - 423 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6508+/-0.000919; mu= 15.4969+/- 0.056
mean_var=63.5448+/-12.609, 0's: 0 Z-trim(104.4): 27 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.160892
statistics sampled from 7874 (7898) to 7874 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.614), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 ( 423) 2780 654.1 7.4e-188
CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 ( 419) 1980 468.4 5.8e-132
CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 ( 393) 1847 437.5 1.1e-122
CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 501) 1501 357.2 2e-98
CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 ( 433) 1283 306.6 3e-83
CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 ( 427) 1277 305.2 7.8e-83
CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 ( 433) 1267 302.9 3.9e-82
CCDS12721.1 KCNJ14 gene_id:3770|Hs108|chr19 ( 436) 1169 280.1 2.8e-75
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 1167 279.7 3.8e-75
CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 390) 1159 277.8 1.3e-74
CCDS8477.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 372) 1063 255.5 6.2e-68
CCDS8476.1 KCNJ1 gene_id:3758|Hs108|chr11 ( 391) 1063 255.5 6.5e-68
CCDS13971.1 KCNJ4 gene_id:3761|Hs108|chr22 ( 445) 1046 251.6 1.1e-66
CCDS11687.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 418) 961 231.9 9.2e-61
CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 961 231.9 9.9e-61
CCDS58733.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 ( 235) 955 230.4 1.4e-60
CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 ( 303) 920 222.3 5e-58
CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 903 218.4 9.5e-57
CCDS13656.1 KCNJ15 gene_id:3772|Hs108|chr21 ( 375) 844 204.7 1.2e-52
CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 640 157.3 2.2e-38
>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 (423 aa)
initn: 2780 init1: 2780 opt: 2780 Z-score: 3486.2 bits: 654.1 E(32554): 7.4e-188
Smith-Waterman score: 2780; 100.0% identity (100.0% similar) in 423 aa overlap (1-423:1-423)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAKLTESMTNVLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAKLTESMTNVLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GKCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GKCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 MDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 LIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 ELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYET
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 STPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLENE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 STPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLENE
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 SKV
:::
CCDS42 SKV
>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 1948 init1: 1881 opt: 1980 Z-score: 2482.6 bits: 468.4 E(32554): 5.8e-132
Smith-Waterman score: 1980; 72.7% identity (86.7% similar) in 421 aa overlap (12-414:1-419)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MAKLTESMTNVLEGDS---MDQDVESPVAIHQPK-LPKQARDDLPRHISRDRT------K
. ::: :.::.: :. .:: .:::::: .: :. ::: :
CCDS84 MAGDSRNAMNQDMEIGVTPWDPKKIPKQARDYVP--IATDRTRLLAEGK
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RKIQRYVRKDGKCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMI
. :::..:.::::::::::.::::::.:.::::::::::::::.:.:::::::::::.:
CCDS84 KPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSDLFTTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFI
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 WWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIIL
::::::::::.::. : : ::: ::.:::::::::::::::::::.::::.::::::::
CCDS84 WWLIAYIRGDLDHVGDQEWIPCVENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIIL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 LLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNS
::.:..:::::::::::::::::::::::::::.::..::::::: ::::::::::::::
CCDS84 LLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 HIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFW
::::::::::::::.::.:::::::::::::::. ::::::::::::::::::::.::::
CCDS84 HIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFIPLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFW
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 EISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVD
:.:.::: .::.:.:::::::::::::::::::::. .:.:::.::::::::: ::::::
CCDS84 EMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVEATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVD
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB6 YNSFHETYETSTPSLSAKELAELASRAEL-------PL-SWSVSSKLNQHAELETEEEEK
::.::.::::.::: ::::::. ...: :: . . . :. .:: . :.: :
CCDS84 YNTFHDTYETNTPSCCAKELAEMKREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPK
350 360 370 380 390 400
410 420
pF1KB6 NLEEQTERNGDVANLENESKV
.: . : :.:
CCDS84 GLGGSREARGSV
410
>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 1847 init1: 1820 opt: 1847 Z-score: 2316.3 bits: 437.5 E(32554): 1.1e-122
Smith-Waterman score: 1847; 71.8% identity (89.6% similar) in 376 aa overlap (50-423:18-393)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 DVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKDGKCNVHHGNVRETYRYLTD
.: ::::.:::.:::..::::::::::::
CCDS11 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGRQRYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTD
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 IFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPCVTNLNGF
.:::::::.::..::.::..:..:::::: ::::::: :::..:.:: .:::::.:::::
CCDS11 LFTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDLEHLEDTAWTPCVNNLNGF
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 VSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKR
:.:::::::::::::::.:::::.:::::.:::.:..:::.::::::::::::::::.::
CCDS11 VAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVKISQPNKR
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 AETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTD
: :::::.:::.:.:::.:::::::::::.:::::::::::::.:.:: :::::::.:::
CCDS11 AATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEFIPLHQTD
170 180 190 200 210 220
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 INVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATGMTC
..::. ::::::::::::.:::::. ::::: :. : ....:::::::::::::::::
CCDS11 LSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMVEATGMTC
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 QARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYETSTPSLSAKELAELASRAEL
::::::...:.:::.::: ::::::::::::: :::::.:. ::: ::.:::: :.: .
CCDS11 QARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAEAAARLDA
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420
pF1KB6 PLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEE--QTERNGDVANLENESKV
: ::. :.:....: : : . : . :.:: . :.::::
CCDS11 HLYWSIPSRLDEKVEEEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
350 360 370 380 390
>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 (501 aa)
initn: 1505 init1: 1403 opt: 1501 Z-score: 1880.5 bits: 357.2 E(32554): 2e-98
Smith-Waterman score: 1501; 59.1% identity (83.5% similar) in 369 aa overlap (29-396:25-387)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MAKLTESMTNVLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKD
::. : : : . . :.: ::.: :.
CCDS22 MSALRRKFGDDYQVVTTSSSGSGLQPQGPGQ--DPQQQLVP----KKKRQRFVDKN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB6 GKCNVHHGNV-RETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRG
:.:::.:::. :: :::.:.::::::::::.::.::...:::.:::.. .::.::: ::
CCDS22 GRCNVQHGNLGSETSRYLSDLFTTLVDLKWRWNLFIFILTYTVAWLFMASMWWVIAYTRG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DMDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGS
:... . ..::::.:. .: ::::: ::::.::::::: :::::::::::.:.::.:::
CCDS22 DLNKAHVGNYTPCVANVYNFPSAFLFFIETEATIGYGYRYITDKCPEGIILFLFQSILGS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 IVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRA
::.::..::::.:.::::::::::.:: ::::::::::: ::::::.:::::.: :.::
CCDS22 IVDAFLIGCMFIKMSQPKKRAETLMFSEHAVISMRDGKLTLMFRVGNLRNSHMVSAQIRC
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KLIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPK
::.::.:: ::::.::.: ...::. :: :.::::::: : : :. .:::...:. ..
CCDS22 KLLKSRQTPEGEFLPLDQLELDVGFSTGADQLFLVSPLTICHVIDAKSPFYDLSQRSMQT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 EELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYE
:..::::::::.::.::::::::.:: .:.:::.:: ::..::.::..:::..:: :.:
CCDS22 EQFEIVVILEGIVETTGMTCQARTSYTEDEVLWGHRFFPVISLEEGFFKVDYSQFHATFE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 TSTPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLEN
. :: :.:: :. . .. ..... ..: .:
CCDS22 VPTPPYSVKEQEEMLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGRE
360 370 380 390 400 410
420
pF1KB6 ESKV
CCDS22 DFPKKLLRMSSTTSEKAYSLGDLPMKLQRISSVPGNSEEKLVSKTTKMLSDPMSQSVADL
420 430 440 450 460 470
>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
initn: 1221 init1: 1163 opt: 1283 Z-score: 1608.1 bits: 306.6 E(32554): 3e-83
Smith-Waterman score: 1283; 51.9% identity (81.0% similar) in 368 aa overlap (49-413:38-402)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 QDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQ-RYVRKDGKCNVHHGNVRE-TYRY
:.:. . :.:.:.:.::.. .:. : . ::
CCDS11 NPYSIVSSEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIEFANMDEKSQRY
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 LTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPCVTNL
:.:.::: ::..::. :::: ... ..::.::.:.:.:: .::.. : . :::: ..
CCDS11 LADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGIIFWVIAVAHGDLEPAEGRGRTPCVMQV
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 NGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQP
.::..::::::::.:::::: : .:..:: ...... ::..: :...::.: ...:...:
CCDS11 HGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECPVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARP
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 KKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLN
::::.::.:: .::...::::::::.:::.::.:::::: .::.::: . : :::.:::.
CCDS11 KKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLD
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 QTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATG
: ::.::. : ::.:::::. : :::.. ::.. ::. .: ...:::::::::::::.
CCDS11 QIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATA
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 MTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYET-STPSLSAKELAELAS
:: ::::::...:::::.:: ::: : . :..::. ::.:::. ::: :::.:.: .
CCDS11 MTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVE--N
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KB6 RAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLENESKV
. :: . : . :. : : .::.. .: :. :
CCDS11 KFLLPSANSFCYE-NELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQ
370 380 390 400 410 420
CCDS11 RPYRRESEI
430
>>CCDS11688.1 KCNJ2 gene_id:3759|Hs108|chr17 (427 aa)
initn: 1228 init1: 977 opt: 1277 Z-score: 1600.6 bits: 305.2 E(32554): 7.8e-83
Smith-Waterman score: 1277; 50.9% identity (81.7% similar) in 387 aa overlap (45-423:35-414)
20 30 40 50 60 70
pF1KB6 DSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQ-RYVRKDGKCNVHHGNVRET
:. .:... . :.:.:::.:::. :: :
CCDS11 RTNRYSIVSSEEDGMKLATMAVANGFGNGKSKVHTRQQCRSRFVKKDGHCNVQFINVGEK
10 20 30 40 50 60
80 90 100 110 120 130
pF1KB6 -YRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPC
:::.::::: ::..::. :.:: ......::::: ..:::: ..::.: .. . :
CCDS11 GQRYLADIFTTCVDIRWRWMLVIFCLAFVLSWLFFGCVFWLIALLHGDLDASKEGK--AC
70 80 90 100 110 120
140 150 160 170 180 190
pF1KB6 VTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVK
:...:.:..::::::::.::::::.: .::.:: .......::..: :..::..: ...:
CCDS11 VSEVNSFTAAFLFSIETQTTIGYGFRCVTDECPIAVFMVVFQSIVGCIIDAFIIGAVMAK
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 ISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSEGEF
...:::: :::::: .:::.:::::::::.:::.::.::.::: .::.:.::. :::::.
CCDS11 MAKPKKRNETLVFSHNAVIAMRDGKLCLMWRVGNLRKSHLVEAHVRAQLLKSRITSEGEY
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 IPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILEGMV
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CCDS11 IPLDQIDINVGFDSGIDRIFLVSPITIVHEIDEDSPLYDLSKQDIDNADFEIVVILEGMV
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 EATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYET-STPSLSAKELA
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CCDS11 EATAMTTQCRSSYLANEILWGHRYEPVLFEEKHYYKVDYSRFHKTYEVPNTPLCSARDLA
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KB6 ELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEE---EKNLEEQTERNG--DVANLENESKV
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CCDS11 E----KKYILSNANSFCYENEVALTSKEEDDSENGVPESTSTDTPPDI-DLHNQASVPLE
370 380 390 400 410
CCDS11 PRPLRRESEI
420
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20 30 40 50 60 70
pF1KB6 QDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQ-RYVRKDGKCNVHHGNVRE-TYRY
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CCDS74 NPYSIVSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKSQRY
10 20 30 40 50 60
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pF1KB6 LTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDMDHIEDPSWTPCVTNL
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CCDS74 LADMFTTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGDLEPAEGHGRTPCVMQV
70 80 90 100 110 120
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pF1KB6 NGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQP
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CCDS74 HGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKMARP
130 140 150 160 170 180
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 KKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLN
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CCDS74 KKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYIPLD
190 200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 QTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPKEELEIVVILEGMVEATG
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CCDS74 QIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVEATA
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 MTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYET-STPSLSAKELAELAS
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CCDS74 MTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVE--N
310 320 330 340 350 360
380 390 400 410 420
pF1KB6 RAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGDVANLENESKV
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CCDS74 KFLLPSANSFCYE-NELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQ
370 380 390 400 410 420
CCDS74 RPYRRGSEI
430
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10 20 30 40 50
pF1KB6 MAKLTESMTNVLE-GDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYV
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CCDS12 MGLARALRRLSGALDSGDSRAGDEEEA----GPGLCRNGWAPAP---VQSPVGRRRGRFV
10 20 30 40 50
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pF1KB6 RKDGKCNVHHGNVR-ETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAY
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CCDS12 KKDGHCNVRFVNLGGQGARYLSDLFTTCVDVRWRWMCLLFSCSFLASWLLFGLAFWLIAS
60 70 80 90 100 110
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pF1KB6 IRGDMDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSV
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CCDS12 LHGDLAAPPPPA--PCFSHVASFLAAFLFALETQTSIGYGVRSVTEECPAAVAAVVLQCI
120 130 140 150 160 170
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pF1KB6 LGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEAS
: ...::.:: ...:...:::: :::::: .::...:: .::::.:::.:: ::.:::
CCDS12 AGCVLDAFVVGAVMAKMAKPKKRNETLVFSENAVVALRDHRLCLMWRVGNLRRSHLVEAH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 IRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQ
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CCDS12 VRAQLLQPRVTPEGEYIPLDHQDVDVGFDGGTDRIFLVSPITIVHEIDSASPLYELGRAE
240 250 260 270 280 290
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pF1KB6 LPKEELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHE
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CCDS12 LARADFELVVILEGMVEATAMTTQCRSSYLPGELLWGHRFEPVLFQRGSQYEVDYRHFHR
300 310 320 330 340 350
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pF1KB6 TYET-STPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLN-----QHAELETEEEEKNLEEQTER
:::. .:: ::::: : : .: :. : ..:. .. : .:: . .: :
CCDS12 TYEVPGTPVCSAKELDERAEQASHSLKSSFPGSLTAFCYENELALSCCQEEDEDDETEEG
360 370 380 390 400 410
420
pF1KB6 NGDVANLENESKV
::
CCDS12 NGVETEDGAASPRVLTPTLALTLPP
420 430
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10 20 30 40 50 60
pF1KB6 AKLTESMTNVLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKDG
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CCDS86 MLARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKA--RFIAKSG
10 20 30 40
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pF1KB6 KCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDM
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CCDS86 ACNLAHKNIREQGRFLQDIFTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDI
50 60 70 80 90 100
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pF1KB6 DHIEDPSW--------TPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLI
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CCDS86 YAYMEKSGMEKSGLESTVCVTNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLIL
110 120 130 140 150 160
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pF1KB6 QSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIV
:...: :.:: :.::.:.: .: ..:::::.:: ::::..:.::::.::::::::.: :.
CCDS86 QNIVGLIINAVMLGCIFMKTAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMII
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 EASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEIS
::.: ...:. : ::: .:..: :: : .. .:::.:::: : :...::...::
CCDS86 SASVRIQVVKKTTTPEGEVVPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDIS
230 240 250 260 270 280
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pF1KB6 KAQLPKEELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNS
..: ...::..:::::.::.::.: :::.:::. :: ::.::. ..: :.: : :::..
CCDS86 ATDLANQDLEVIVILEGVVETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSK
290 300 310 320 330 340
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pF1KB6 FHETYETSTPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGD
: .: ....: ::.:: : :
CCDS86 FGNTVKVAAPRCSARELDEKPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRN
350 360 370 380 390 400
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pF1KB6 AKLTESMTNVLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDL-PRHISRDRTKRKIQRYVRKD
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CCDS31 MLSRKGIIPEEYVLTRLAEDPAKPRY--RARQRRA--RFVSKK
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70 80 90 100 110 120
pF1KB6 GKCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGD
:.::: : :.:: :.: :.::::::::: .::::.: . .::.:.: :::::. .::
CCDS31 GNCNVAHKNIREQGRFLQDVFTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGD
40 50 60 70 80 90
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pF1KB6 MDHIEDPSWTPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLIQSVLGSI
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CCDS31 LAPSEGTA-EPCVTSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLM
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 VNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAK
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CCDS31 INAIMLGCIFMKTAQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQ
160 170 180 190 200 210
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pF1KB6 LIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEISKAQLPK-
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CCDS31 VVRKTTSPEGEVVPLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHH
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 EELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNSFHETYE
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CCDS31 QDLEIIVILEGVVETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTVK
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
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CCDS31 VPTPLCTARQLDEDHSLLEALTLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
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423 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]