Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6656
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6656, 450 aa
1>>>pF1KB6656 450 - 450 aa - 450 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.6345+/-0.00159; mu= -26.0905+/- 0.090
mean_var=493.7898+/-111.346, 0's: 0 Z-trim(105.7): 580 B-trim: 92 in 1/52
Lambda= 0.057717
statistics sampled from 7939 (8566) to 7939 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.263), width: 16
Scan time: 2.740
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15 ( 450) 3029 267.8 1.6e-71
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 466) 1621 150.6 3.1e-36
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 507) 1621 150.6 3.3e-36
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 508) 1621 150.6 3.4e-36
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 1094 106.8 5.7e-23
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 1094 107.0 9.6e-23
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 1094 107.0 9.7e-23
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 1094 107.0 9.7e-23
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 1094 107.0 9.8e-23
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 1094 107.0 1e-22
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 1094 107.0 1e-22
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 1094 107.0 1.1e-22
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 1080 105.8 2.3e-22
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 1080 105.8 2.3e-22
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 1013 100.0 5.8e-21
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 997 98.6 1.3e-20
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 981 97.3 3.7e-20
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 960 95.6 1.2e-19
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 960 95.6 1.2e-19
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 960 95.6 1.3e-19
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 960 95.6 1.3e-19
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 935 93.5 5.1e-19
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 935 93.5 5.3e-19
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 928 92.9 8.2e-19
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 927 92.9 8.8e-19
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 925 92.7 9.7e-19
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 920 92.3 1.3e-18
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20 ( 451) 909 91.3 2.1e-18
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 891 89.9 7e-18
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 866 87.7 2.6e-17
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 866 87.9 4.1e-17
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 659) 857 87.1 5.8e-17
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 693) 857 87.1 6.1e-17
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 850 86.4 7.3e-17
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 814 83.4 5.5e-16
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 809 83.1 9e-16
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX ( 675) 808 83.0 1e-15
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 789 81.5 3.3e-15
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 789 81.5 3.5e-15
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5 ( 620) 764 79.3 1.2e-14
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 703 74.3 4.4e-13
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 703 74.3 4.7e-13
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 683 72.5 1.1e-12
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 651 69.9 6.6e-12
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 654 70.3 9.7e-12
CCDS225.1 EPHA8 gene_id:2046|Hs108|chr1 (1005) 647 69.7 1.5e-11
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 625 67.9 5.2e-11
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 620 67.5 7.1e-11
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 620 67.5 7.1e-11
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 620 67.5 7.1e-11
>>CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15 (450 aa)
initn: 3029 init1: 3029 opt: 3029 Z-score: 1397.8 bits: 267.8 E(32554): 1.6e-71
Smith-Waterman score: 3029; 100.0% identity (100.0% similar) in 450 aa overlap (1-450:1-450)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKVGREGII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 SCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DEFYRSGWALNMKELKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DEFYRSGWALNMKELKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 TQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 AMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPEALRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPEALRE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 KKFSTKSDVWSFGILLWEIYSFGRVPYPRIPLKDVVPRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KKFSTKSDVWSFGILLWEIYSFGRVPYPRIPLKDVVPRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVMK
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 NCWHLDAAMRPSFLQLREQLEHIKTHELHL
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NCWHLDAAMRPSFLQLREQLEHIKTHELHL
430 440 450
>>CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 (466 aa)
initn: 1597 init1: 764 opt: 1621 Z-score: 763.9 bits: 150.6 E(32554): 3.1e-36
Smith-Waterman score: 1621; 54.1% identity (81.3% similar) in 434 aa overlap (8-440:6-437)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLTIVAVTKDPNWYKAKNKV-GREGI
: ::.::.: . .: : ::::.::. . .. .::..:... :.::.
CCDS42 MPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVTILEACENKSWYRVKHHTSGQEGL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 IPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLLYPPETGLFLVRESTNYPGDYTLC
. :. ...::...: ::::::::::::. ..: . : ::: ::::::::. .::::.::
CCDS42 LAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQLQPPEDGLFLVRESARHPGDYVLC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHYTSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAA
:: : :::.... ..:.::: :.: :::..::::..: ..::.:..:: .:: .:
CCDS42 VSFGRDVIHYRVLHRDGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHYSKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 QDEFYRSGWALNMKELKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRGNKVAVKCIKNDATAQAFLAEASV
..:. :.:: ::...: : ::.:::: :. :.: :.::::: :: :.:::::: :..:
CCDS42 EEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLGQKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 MTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVDYLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVC
::...: :::.:::::... ::::: :...::.::..::.:::.... ::.::: :
CCDS42 MTKMQHENLVRLLGVILHQ--GLYIVMEHVSKGNLVNFLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB6 EAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLTKEASSTQDTGKLPVKWTAPEALR
:.:::::....:::::::::.::::: :::::::::.: . :...:::::::::::.
CCDS42 EGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLAKAERKGLDSSRLPVKWTAPEALK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB6 EKKFSTKSDVWSFGILLWEIYSFGRVPYPRIPLKDVVPRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVM
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CCDS42 HGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVSEAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLM
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450
pF1KB6 KNCWHLDAAMRPSFLQLREQLEHIKTHELHL
..::. . : :: : .: :.:
CCDS42 SSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQDADGSTSPRSQEP
420 430 440 450 460
>>CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 (507 aa)
initn: 1597 init1: 764 opt: 1621 Z-score: 763.4 bits: 150.6 E(32554): 3.3e-36
Smith-Waterman score: 1621; 54.1% identity (81.3% similar) in 434 aa overlap (8-440:47-478)
10 20 30
pF1KB6 MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLT
: ::.::.: . .: : ::::.:
CCDS12 DSAEELPRVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 IVAVTKDPNWYKAKNKV-GREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLL
:. . .. .::..:... :.::.. :. ...::...: ::::::::::::. ..: . :
CCDS12 ILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 YPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHY
::: ::::::::. .::::.:::: : :::.... ..:.::: :.: :::..::::
CCDS12 QPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHY
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFYRSGWALNMKELKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRG
..: ..::.:..:: .:: .:..:. :.:: ::...: : ::.:::: :. :.: :
CCDS12 SKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLG
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 NKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVD
.::::: :: :.:::::: :..:::...: :::.:::::... ::::: :...::.::.
CCDS12 QKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQ--GLYIVMEHVSKGNLVN
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 YLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLT
.::.:::.... ::.::: : :.:::::....:::::::::.::::: :::::::::.
CCDS12 FLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 KEASSTQDTGKLPVKWTAPEALREKKFSTKSDVWSFGILLWEIYSFGRVPYPRIPLKDVV
: . :...:::::::::::.. ::..::::::::.::::..:.::.:::.. ::.:
CCDS12 KAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVS
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 PRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVMKNCWHLDAAMRPSFLQLREQLEHIKTHELHL
:::::.:. :.::: :. .:..::. . : :: : .: :.:
CCDS12 EAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQ
440 450 460 470 480 490
CCDS12 DADGSTSPRSQEP
500
>>CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 (508 aa)
initn: 1597 init1: 764 opt: 1621 Z-score: 763.4 bits: 150.6 E(32554): 3.4e-36
Smith-Waterman score: 1621; 54.1% identity (81.3% similar) in 434 aa overlap (8-440:48-479)
10 20 30
pF1KB6 MSAIQAAWPSGTECIAKYNFHGTAEQDLPFCKGDVLT
: ::.::.: . .: : ::::.:
CCDS12 TRGQQQLLVSPRFLRAWHPPPVSARMPTRRWAPGTQCITKCEHTRPKPGELAFRKGDVVT
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 IVAVTKDPNWYKAKNKV-GREGIIPANYVQKREGVKAGTKLSLMPWFHGKITREQAERLL
:. . .. .::..:... :.::.. :. ...::...: ::::::::::::. ..: . :
CCDS12 ILEACENKSWYRVKHHTSGQEGLLAAGALREREALSADPKLSLMPWFHGKISGQEAVQQL
80 90 100 110 120 130
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 YPPETGLFLVRESTNYPGDYTLCVSCDGKVEHYRIMYHASKLSIDEEVYFENLMQLVEHY
::: ::::::::. .::::.:::: : :::.... ..:.::: :.: :::..::::
CCDS12 QPPEDGLFLVRESARHPGDYVLCVSFGRDVIHYRVLHRDGHLTIDEAVFFCNLMDMVEHY
140 150 160 170 180 190
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 TSDADGLCTRLIKPKVMEGTVAAQDEFYRSGWALNMKELKLLQTIGKGEFGDVMLGDYRG
..: ..::.:..:: .:: .:..:. :.:: ::...: : ::.:::: :. :.: :
CCDS12 SKDKGAICTKLVRPKRKHGTKSAEEELARAGWLLNLQHLTLGAQIGEGEFGAVLQGEYLG
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 NKVAVKCIKNDATAQAFLAEASVMTQLRHSNLVQLLGVIVEEKGGLYIVTEYMAKGSLVD
.::::: :: :.:::::: :..:::...: :::.:::::... ::::: :...::.::.
CCDS12 QKVAVKNIKCDVTAQAFLDETAVMTKMQHENLVRLLGVILHQ--GLYIVMEHVSKGNLVN
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 YLRSRGRSVLGGDCLLKFSLDVCEAMEYLEGNNFVHRDLAARNVLVSEDNVAKVSDFGLT
.::.:::.... ::.::: : :.:::::....:::::::::.::::: :::::::::.
CCDS12 FLRTRGRALVNTAQLLQFSLHVAEGMEYLESKKLVHRDLAARNILVSEDLVAKVSDFGLA
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 KEASSTQDTGKLPVKWTAPEALREKKFSTKSDVWSFGILLWEIYSFGRVPYPRIPLKDVV
: . :...:::::::::::.. ::..::::::::.::::..:.::.:::.. ::.:
CCDS12 KAERKGLDSSRLPVKWTAPEALKHGKFTSKSDVWSFGVLLWEVFSYGRAPYPKMSLKEVS
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 PRVEKGYKMDAPDGCPPAVYEVMKNCWHLDAAMRPSFLQLREQLEHIKTHELHL
:::::.:. :.::: :. .:..::. . : :: : .: :.:
CCDS12 EAVEKGYRMEPPEGCPGPVHVLMSSCWEAEPARRPPFRKLAEKLARELRSAGAPASVSGQ
440 450 460 470 480 490
CCDS12 DADGSTSPRSQEP
500
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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