Result of FASTA (omim) for
pF1KB6658
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6658, 451 aa
1>>>pF1KB6658 451 - 451 aa - 451 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4583+/-0.000693; mu= -17.8980+/- 0.041
mean_var=800.0634+/-180.606, 0's: 0 Z-trim(115.7): 1482 B-trim: 1605 in 1/55
Lambda= 0.045343
statistics sampled from 24237 (26263) to 24237 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 8.940
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005966 (OMIM: 602004) protein-tyrosine kinase 6 ( 451) 3118 220.3 8.2e-57
XP_016883471 (OMIM: 602004) PREDICTED: protein-tyr ( 272) 1559 118.0 3.1e-26
NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Y ( 543) 1300 101.5 5.8e-21
XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-pr ( 543) 1300 101.5 5.8e-21
XP_016866142 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1293 101.0 7.9e-21
XP_016866139 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1293 101.0 7.9e-21
NP_002028 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 537) 1293 101.0 7.9e-21
XP_016866143 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1293 101.0 7.9e-21
XP_016866140 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1293 101.0 7.9e-21
XP_016866141 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 537) 1293 101.0 7.9e-21
XP_011527315 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 536) 1279 100.1 1.5e-20
NP_938033 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 1279 100.1 1.5e-20
NP_005408 (OMIM: 114500,190090,616937) proto-oncog ( 536) 1279 100.1 1.5e-20
XP_005266937 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1271 99.6 2.1e-20
XP_011533957 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1271 99.6 2.1e-20
XP_016866134 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1271 99.6 2.1e-20
NP_002022 (OMIM: 606573) tyrosine-protein kinase F ( 505) 1271 99.6 2.1e-20
XP_005266939 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1271 99.6 2.1e-20
XP_011533955 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1271 99.6 2.1e-20
XP_011533956 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1271 99.6 2.1e-20
XP_005266938 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 505) 1271 99.6 2.1e-20
XP_016883515 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1268 99.4 2.5e-20
XP_016883516 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1268 99.4 2.5e-20
XP_016883513 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1268 99.4 2.5e-20
XP_016883514 (OMIM: 114500,190090,616937) PREDICTE ( 542) 1268 99.4 2.5e-20
XP_005266947 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-pr ( 534) 1243 97.8 7.6e-20
NP_694592 (OMIM: 137025) tyrosine-protein kinase F ( 534) 1243 97.8 7.6e-20
XP_006710515 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 1219 96.2 2.2e-19
NP_001036194 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 1219 96.2 2.2e-19
XP_011539312 (OMIM: 164940) PREDICTED: tyrosine-pr ( 529) 1219 96.2 2.2e-19
NP_005239 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinase F ( 529) 1219 96.2 2.2e-19
NP_001036212 (OMIM: 164940) tyrosine-protein kinas ( 529) 1219 96.2 2.2e-19
NP_001165602 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 504) 1189 94.2 8.5e-19
NP_001165600 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 1189 94.2 8.5e-19
NP_001165604 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 505) 1189 94.2 8.5e-19
NP_001165603 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 506) 1189 94.2 8.5e-19
NP_001165601 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinas ( 525) 1189 94.2 8.7e-19
NP_002101 (OMIM: 142370) tyrosine-protein kinase H ( 526) 1189 94.2 8.7e-19
NP_001036236 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protei ( 509) 1183 93.8 1.1e-18
NP_005347 (OMIM: 153390,615758) tyrosine-protein k ( 509) 1183 93.8 1.1e-18
XP_016868905 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 491) 1154 91.9 4.1e-18
NP_001104567 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinas ( 491) 1154 91.9 4.1e-18
NP_002341 (OMIM: 165120) tyrosine-protein kinase L ( 512) 1154 91.9 4.2e-18
XP_011515831 (OMIM: 165120) PREDICTED: tyrosine-pr ( 682) 1154 92.1 4.9e-18
NP_001706 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protein k ( 505) 1133 90.5 1.1e-17
NP_001317394 (OMIM: 191305,613375) tyrosine-protei ( 434) 1111 89.0 2.7e-17
XP_011533958 (OMIM: 606573) PREDICTED: tyrosine-pr ( 392) 1076 86.7 1.2e-16
NP_001129473 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote ( 542) 1008 82.4 3.2e-15
NP_001161711 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1043) 1008 82.8 4.7e-15
NP_001161710 (OMIM: 164690) Abelson tyrosine-prote (1058) 1008 82.8 4.7e-15
>>NP_005966 (OMIM: 602004) protein-tyrosine kinase 6 iso (451 aa)
initn: 3118 init1: 3118 opt: 3118 Z-score: 1140.9 bits: 220.3 E(85289): 8.2e-57
Smith-Waterman score: 3118; 100.0% identity (100.0% similar) in 451 aa overlap (1-451:1-451)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEEQWWWATLLDEAGGAVAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEEQWWWATLLDEAGGAVAQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YVPHNYLAERETVESEPWFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAFLIRVSEKPSADYVLSVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YVPHNYLAERETVESEPWFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAFLIRVSEKPSADYVLSVRD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TQAVRHYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYHRAQSLSHGLRLAAPCRKHEPEPLPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TQAVRHYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYHRAQSLSHGLRLAAPCRKHEPEPLPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 WDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQVAIKVISRDNLLHQQMLQSEIQAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 WDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQVAIKVISRDNLLHQQMLQSEIQAMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLLELLRDSDEKVLPVSELLDIAWQVAEGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLLELLRDSDEKVLPVSELLDIAWQVAEGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 CYLESQNYIHRDLAARNILVGENTLCKVGDFGLARLIKEDVYLSHDHNIPYKWTAPEALS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CYLESQNYIHRDLAARNILVGENTLCKVGDFGLARLIKEDVYLSHDHNIPYKWTAPEALS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 RGHYSTKSDVWSFGILLHEMFSRGQVPYPGMSNHEAFLRVDAGYRMPCPLECPPSVHKLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RGHYSTKSDVWSFGILLHEMFSRGQVPYPGMSNHEAFLRVDAGYRMPCPLECPPSVHKLM
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 LTCWCRDPEQRPCFKALRERLSSFTSYENPT
:::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LTCWCRDPEQRPCFKALRERLSSFTSYENPT
430 440 450
>>XP_016883471 (OMIM: 602004) PREDICTED: protein-tyrosin (272 aa)
initn: 1559 init1: 1559 opt: 1559 Z-score: 592.0 bits: 118.0 E(85289): 3.1e-26
Smith-Waterman score: 1559; 100.0% identity (100.0% similar) in 224 aa overlap (1-224:1-224)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEEQWWWATLLDEAGGAVAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEEQWWWATLLDEAGGAVAQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 YVPHNYLAERETVESEPWFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAFLIRVSEKPSADYVLSVRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YVPHNYLAERETVESEPWFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAFLIRVSEKPSADYVLSVRD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TQAVRHYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYHRAQSLSHGLRLAAPCRKHEPEPLPH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TQAVRHYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYHRAQSLSHGLRLAAPCRKHEPEPLPH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 WDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQVAIKVISRDNLLHQQMLQSEIQAMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 WDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQVAIKVISRDAAVGDPGHEEAAAQTH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLLELLRDSDEKVLPVSELLDIAWQVAEGM
XP_016 PGAVRRGVRGGPRVHHHGAHGQGQPAGAAPRL
250 260 270
>>NP_005424 (OMIM: 164880) tyrosine-protein kinase Yes [ (543 aa)
initn: 1162 init1: 410 opt: 1300 Z-score: 497.4 bits: 101.5 E(85289): 5.8e-21
Smith-Waterman score: 1300; 44.4% identity (71.7% similar) in 446 aa overlap (13-450:96-535)
10 20 30 40
pF1KB6 MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEE
.:.:.:...:: :.:::. :. :.. . :
NP_005 SGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQIINNTE
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 QWWWATLLDEAGGAVAQGYVPHNYLAERETVESEPWFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAF
:: . .: .::.: ::.: .....: :.:: ..:..: : : :: : :
NP_005 GDWWEARSIATG---KNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRGIF
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150
pF1KB6 LIRVSEKPSADYVLSVRDTQAVR-----HYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYH--
:.: :: .. : ::.:: . .: :::: . .: ... ..: .: .::...
NP_005 LVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHYTE
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 RAQSLSHGLRLAAPCRKHEPEPLPHWDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQ
.:..: : : . : : . . : . : :: ::: . : :::.: ::::. : :. ..
NP_005 HADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAK-DAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTK
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 VAIKVISRDNLLHQQMLQSEIQAMKKLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLLEL
::::... ... . .:: : : :::::: ... :::::: .:.::.::.:.:::::..
NP_005 VAIKTLKPGTMMPEAFLQ-EAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSE-EPIYIVTEFMSKGSLLDF
310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LRDSDEKVLPVSELLDIAWQVAEGMCYLESQNYIHRDLAARNILVGENTLCKVGDFGLAR
:...: : : . .:.:.: :.:.:: :.: .::::::: : ::::::: .::..::::::
NP_005 LKEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLAR
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LIKEDVYLSHDH-NIPYKWTAPEALSRGHYSTKSDVWSFGILLHEMFSRGQVPYPGMSNH
::... : ... ..: ::::::: :... :::::::::: :. ..:.:::::: :.
NP_005 LIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNR
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 EAFLRVDAGYRMPCPLECPPSVHKLMLTCWCRDPEQRPCFKALRERLSSFTSYENPT
:.. .:. ::::::: :: :.:.:: :: .::..:: :. .. : .. . .:
NP_005 EVLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQP
480 490 500 510 520 530
NP_005 GENL
540
>>XP_016881449 (OMIM: 164880) PREDICTED: tyrosine-protei (543 aa)
initn: 1162 init1: 410 opt: 1300 Z-score: 497.4 bits: 101.5 E(85289): 5.8e-21
Smith-Waterman score: 1300; 44.4% identity (71.7% similar) in 446 aa overlap (13-450:96-535)
10 20 30 40
pF1KB6 MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEE
.:.:.:...:: :.:::. :. :.. . :
XP_016 SGVTPFGGASSSFSVVPSSYPAGLTGGVTIFVALYDYEARTTEDLSFKKGERFQIINNTE
70 80 90 100 110 120
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 QWWWATLLDEAGGAVAQGYVPHNYLAERETVESEPWFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAF
:: . .: .::.: ::.: .....: :.:: ..:..: : : :: : :
XP_016 GDWWEARSIATG---KNGYIPSNYVAPADSIQAEEWYFGKMGRKDAERLLLNPGNQRGIF
130 140 150 160 170 180
110 120 130 140 150
pF1KB6 LIRVSEKPSADYVLSVRDTQAVR-----HYKIWRRAGGRLHLNEAVSFLSLPELVNYH--
:.: :: .. : ::.:: . .: :::: . .: ... ..: .: .::...
XP_016 LVRESETTKGAYSLSIRDWDEIRGDNVKHYKIRKLDNGGYYITTRAQFDTLQKLVKHYTE
190 200 210 220 230 240
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 RAQSLSHGLRLAAPCRKHEPEPLPHWDDWERPREEFTLCRKLGSGYFGEVFEGLWKDRVQ
.:..: : : . : : . . : . : :: ::: . : :::.: ::::. : :. ..
XP_016 HADGLCHKLTTVCPTVKPQTQGLAK-DAWEIPRESLRLEVKLGQGCFGEVWMGTWNGTTK
250 260 270 280 290 300
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 VAIKVISRDNLLHQQMLQSEIQAMKKLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLLEL
::::... ... . .:: : : :::::: ... :::::: .:.::.::.:.:::::..
XP_016 VAIKTLKPGTMMPEAFLQ-EAQIMKKLRHDKLVPLYAVVSE-EPIYIVTEFMSKGSLLDF
310 320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 LRDSDEKVLPVSELLDIAWQVAEGMCYLESQNYIHRDLAARNILVGENTLCKVGDFGLAR
:...: : : . .:.:.: :.:.:: :.: .::::::: : ::::::: .::..::::::
XP_016 LKEGDGKYLKLPQLVDMAAQIADGMAYIERMNYIHRDLRAANILVGENLVCKIADFGLAR
360 370 380 390 400 410
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LIKEDVYLSHDH-NIPYKWTAPEALSRGHYSTKSDVWSFGILLHEMFSRGQVPYPGMSNH
::... : ... ..: ::::::: :... :::::::::: :. ..:.:::::: :.
XP_016 LIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILQTELVTKGRVPYPGMVNR
420 430 440 450 460 470
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 EAFLRVDAGYRMPCPLECPPSVHKLMLTCWCRDPEQRPCFKALRERLSSFTSYENPT
:.. .:. ::::::: :: :.:.:: :: .::..:: :. .. : .. . .:
XP_016 EVLEQVERGYRMPCPQGCPESLHELMNLCWKKDPDERPTFEYIQSFLEDYFTATEPQYQP
480 490 500 510 520 530
XP_016 GENL
540
>>XP_016866142 (OMIM: 137025) PREDICTED: tyrosine-protei (537 aa)
initn: 1236 init1: 435 opt: 1293 Z-score: 495.0 bits: 101.0 E(85289): 7.9e-21
Smith-Waterman score: 1293; 43.3% identity (72.8% similar) in 448 aa overlap (13-450:87-529)
10 20 30 40
pF1KB6 MVSRDQAHLGPKYVGLWDFKSRTDEELSFRAGDVFHVARKEE
.:.:.:...::...:::. :. :.. . :
XP_016 GGQGLTVFGGVNSSSHTGTLRTRGGTGVTLFVALYDYEARTEDDLSFHKGEKFQILNSSE
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 QWWWATLLDEAGGAVAQGYVPHNYLAERETVESEPWFFGCISRSEAVRRLQAEGNATGAF
:: . .: ::.: ::.: .....: :.:: ..:..: :.: . :: :.:
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pF1KB6 VQVAIKVISRDNLLHQQMLQSEIQAMKKLRHKHILALYAVVSVGDPVYIITELMAKGSLL
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pF1KB6 ARLIKEDVYLSHDH-NIPYKWTAPEALSRGHYSTKSDVWSFGILLHEMFSRGQVPYPGMS
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XP_016 ARLIEDNEYTARQGAKFPIKWTAPEAALYGRFTIKSDVWSFGILLTELVTKGRVPYPGMN
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pF1KB6 NHEAFLRVDAGYRMPCPLECPPSVHKLMLTCWCRDPEQRPCFKALRERLSSFTSYENPT
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XP_016 NREVLEQVERGYRMPCPQDCPISLHELMIHCWKKDPEERPTFEYLQSFLEDYFTATEPQY
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XP_016 QPGENL
451 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:17:51 2016 done: Sat Nov 5 11:17:52 2016
Total Scan time: 8.940 Total Display time: 0.080
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]