Result of FASTA (ccds) for pF1KB6659
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB6659, 424 aa
  1>>>pF1KB6659 424 - 424 aa - 424 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3408+/-0.00153; mu= -6.6257+/- 0.089
 mean_var=286.6150+/-59.461, 0's: 0 Z-trim(105.7): 127  B-trim: 68 in 2/51
 Lambda= 0.075757
 statistics sampled from 8441 (8555) to 8441 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.263), width:  16
 Scan time:  2.510

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17        ( 424) 2646 303.3 2.9e-82
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17         ( 432) 1298 156.0 6.6e-38
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17         ( 472) 1291 155.2 1.2e-37
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17         ( 456) 1205 145.8   8e-35
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17         ( 473) 1205 145.8 8.2e-35
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 420) 1181 143.2 4.6e-34
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17         ( 458) 1181 143.2 4.9e-34
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17         ( 400) 1168 141.7 1.2e-33
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17         ( 467) 1102 134.6   2e-31
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17         ( 455) 1093 133.6 3.8e-31
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17       ( 459) 1077 131.8 1.3e-30
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17         ( 494) 1073 131.4 1.9e-30
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17       ( 525) 1069 131.0 2.7e-30
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17         ( 584) 1068 130.9 3.1e-30
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17       ( 464) 1049 128.8 1.1e-29
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17         ( 448) 1027 126.4 5.6e-29
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17        ( 422) 1020 125.6 9.1e-29
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17        ( 404) 1016 125.1 1.2e-28
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17         ( 416) 1014 124.9 1.4e-28
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17        ( 404) 1010 124.5 1.9e-28
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17         ( 436) 1003 123.7 3.4e-28
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12         ( 430)  981 121.3 1.8e-27
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17       ( 450)  978 121.0 2.3e-27
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17       ( 431)  954 118.4 1.4e-26
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17       ( 468)  951 118.1 1.8e-26
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17          ( 623)  947 117.7 3.1e-26
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17         ( 449)  911 113.7 3.7e-25
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17         ( 456)  908 113.4 4.7e-25
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17       ( 491)  896 112.1 1.2e-24
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17        ( 285)  735 94.3 1.6e-19
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 431)  612 81.0 2.5e-15
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 432)  611 80.9 2.7e-15
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17          ( 438)  606 80.3 3.9e-15
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10            ( 466)  596 79.3 8.8e-15
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8            ( 916)  591 78.9 2.2e-14
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2            ( 470)  574 76.9 4.7e-14
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10            ( 499)  558 75.1 1.7e-13
CCDS33859.1 BFSP2 gene_id:8419|Hs108|chr3          ( 415)  550 74.2 2.6e-13
CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12           ( 470)  550 74.2 2.9e-13
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8           ( 543)  551 74.4   3e-13
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12           ( 483)  534 72.5 9.9e-13
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12          ( 511)  534 72.5   1e-12
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12           ( 469)  532 72.3 1.1e-12
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12          ( 600)  498 68.6 1.8e-11
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12          ( 493)  490 67.7 2.8e-11
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12          ( 520)  489 67.6 3.2e-11
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12         ( 486)  486 67.3 3.8e-11
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12         ( 505)  484 67.1 4.5e-11
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12          ( 507)  483 66.9 4.9e-11


>>CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17             (424 aa)
 initn: 2646 init1: 2646 opt: 2646  Z-score: 1590.3  bits: 303.3 E(32554): 2.9e-82
Smith-Waterman score: 2646; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB6 MDFSRRSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRISNSRHTVNYGSDLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MDFSRRSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRISNSRHTVNYGSDLT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB6 GGGDLFVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNAPRAGRDYSAY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GGGDLFVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNAPRAGRDYSAY
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB6 YRQIEELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVEADLQGLNKVF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 YRQIEELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVEADLQGLNKVF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB6 DDLTLHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAAPGLNLGVIMN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DDLTLHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAAPGLNLGVIMN
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB6 EMRQKYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELRRTSQSLEIEL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EMRQKYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELRRTSQSLEIEL
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB6 QSHLSMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQNNEYHILLDIK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QSHLSMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQNNEYHILLDIK
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB6 TRLEQEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEERDIKKTRKIKTVVQEVVDGKVVSSEVKEV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TRLEQEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEERDIKKTRKIKTVVQEVVDGKVVSSEVKEV
              370       380       390       400       410       420

           
pF1KB6 EENI
       ::::
CCDS11 EENI
           

>>CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17              (432 aa)
 initn: 1369 init1: 1219 opt: 1298  Z-score: 794.0  bits: 156.0 E(32554): 6.6e-38
Smith-Waterman score: 1298; 52.7% identity (82.0% similar) in 395 aa overlap (29-415:35-423)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB6   MDFSRRSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRISNSRHTV-----
                                     ::.     :.::: :  ...: ..      
CCDS11 IRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSCRLGSAGGLGSTLGGSSYSSCYSFG
           10        20        30        40        50        60    

               60        70        80        90       100       110
pF1KB6 ---NYGSDLTGGGDLFVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNA
          .:::.. :   :..:.:: .::::::::::::.:::.::..:..:::.:..::. .:
CCDS11 SGGGYGSSFGGVDGLLAGGEKATMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQA
           70        80        90       100       110       120    

              120       130       140       150       160       170
pF1KB6 PRAGRDYSAYYRQIEELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVE
       :  .:::: ::: ::::...:  : ..::  .::::::.:::.::: :.:::...::.::
CCDS11 PGPARDYSQYYRTIEELQNKILTATVDNANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVE
          130       140       150       160       170       180    

              180       190       200       210       220       230
pF1KB6 ADLQGLNKVFDDLTLHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAA
       ::..:: .:.:.::: ..:::.:::.:...:: :::.:.::...:. ..:. .:::.:::
CCDS11 ADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAA
          190       200       210       220       230       240    

              240       250       260       270       280       290
pF1KB6 PGLNLGVIMNEMRQKYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELR
       ::..:. :.::::..:: ::.:: ..:.. :  .:  :...:..:.: ... . ...:::
CCDS11 PGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDAEDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELR
          250       260       270       280       290       300    

              300       310       320       330       340       350
pF1KB6 RTSQSLEIELQSHLSMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQN
       :: :.:::::::.:::: ::: .: ::. ::  ::...:.:..:.: :: :.: .::.::
CCDS11 RTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAETENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQN
          310       320       330       340       350       360    

              360       370       380       390       400       410
pF1KB6 NEYHILLDIKTRLEQEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEERDIKKTRKIKTVVQEVVDG
       .::.::::.:::::::::::::::::::.. :.:.      ..   ::...:.:.:: ::
CCDS11 QEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLTQYK------KEPVTTRQVRTIVEEVQDG
          370       380       390             400       410        

              420    
pF1KB6 KVVSSEVKEVEENI
       ::.::         
CCDS11 KVISSREQVHQTTR
      420       430  

>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17              (472 aa)
 initn: 1326 init1: 1227 opt: 1291  Z-score: 789.3  bits: 155.2 E(32554): 1.2e-37
Smith-Waterman score: 1291; 53.8% identity (83.3% similar) in 383 aa overlap (36-415:88-463)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB6 RSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRISNSRHTVNYGSDLTGGGDL
                                     :::. : :.         ..:. ..::  :
CCDS11 SSGGACGLGGGYGGGFSSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGL-------GGGFGGGFAGGDGL
        60        70        80        90              100       110

          70        80        90       100       110       120     
pF1KB6 FVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNAPRAGRDYSAYYRQIE
       .::.::..::::::::::::.:::.::..:. :::.:..::. . :   .::: :.. ::
CCDS11 LVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEIKDYSPYFKTIE
              120       130       140       150       160       170

         130       140       150       160       170       180     
pF1KB6 ELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVEADLQGLNKVFDDLTL
       .::..:  : ..::  .::::::.:::.::: ::::: ..:..::::..:: .:.:.:::
CCDS11 DLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELTL
              180       190       200       210       220       230

         190       200       210       220       230       240     
pF1KB6 HKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAAPGLNLGVIMNEMRQK
        ..:::.::: :...:: :::.:.::...:. ..:. ::::.:::::..:. :.::::..
CCDS11 ARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQ
              240       250       260       270       280       290

         250       260       270       280       290       300     
pF1KB6 YEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELRRTSQSLEIELQSHLS
       :: ::.:: ..:.: :  .:  :...:..:.: ... . ...::::: :.:::::::.::
CCDS11 YEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQLS
              300       310       320       330       340       350

         310       320       330       340       350       360     
pF1KB6 MKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQNNEYHILLDIKTRLEQ
       :: :::..:::::.::  :::..: ...:.: :: :.: .::.::.::.::::.::::::
CCDS11 MKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQ
              360       370       380       390       400       410

         370       380       390          400       410       420  
pF1KB6 EIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEE--RDI-KKTRKIKTVVQEVVDGKVVSSEVKEVEE
       :::::::::::::.. .  :.:.  .  ::. ...:.:.: :..: ::::::.       
CCDS11 EIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDVTSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQVLRT
              420       430       440       450       460       470

         
pF1KB6 NI
         
CCDS11 KN
         

>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17              (456 aa)
 initn: 1250 init1: 974 opt: 1205  Z-score: 738.7  bits: 145.8 E(32554): 8e-35
Smith-Waterman score: 1205; 50.1% identity (79.4% similar) in 393 aa overlap (30-420:71-456)

                10        20        30        40        50         
pF1KB6  MDFSRRSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRISNSRHTVNYGSDL
                                     : . ::.::. : :.         ..:. .
CCDS11 SRSISASSARFVSSGSGGGYGGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGV-------GGGFGGGF
               50        60        70        80               90   

      60         70        80        90       100       110        
pF1KB6 TGG-GDLFVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNAPRAGR-DY
        :: : :. ::::..::::::::::::.:::.::..:. :::.:..::. ..: . . ::
CCDS11 GGGDGGLLSGNEKITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDY
           100       110       120       130       140       150   

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB6 SAYYRQIEELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVEADLQGLN
       : :.. :::::..:  . ..:.: .:.::::.:::.:::::::.: ..:  ::::..:: 
CCDS11 SQYFKTIEELRDKIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLR
           160       170       180       190       200       210   

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB6 KVFDDLTLHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAAPGLNLGV
       .:.:.::: .::::.::: ::..:: :::.:.::.  . ..:.. ::::.:::::..:  
CCDS11 RVLDELTLARTDLEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTR
           220       230       240       250       260       270   

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB6 IMNEMRQKYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELRRTSQSLE
       .. :::..::.::.:: ....  :  .:  :...:. ::: .. .....:.:::: : ::
CCDS11 VLAEMREQYEAMAEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELE
           280       290       300       310       320       330   

       300       310       320       330       340       350       
pF1KB6 IELQSHLSMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQNNEYHILL
       :::::.:::: .::..: ::. ::..:: ..:.:...::::: ..: .:: ::.::..::
CCDS11 IELQSQLSMKAGLENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLL
           340       350       360       370       380       390   

       360       370       380       390       400       410       
pF1KB6 DIKTRLEQEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEERDIKKTRKIKTVVQEVVDGKVVSSEV
       :::::::::::::: ::::.:.: .   .         .. ...  :.: :::.::::. 
CCDS11 DIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMAGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHK
           400       410       420       430       440       450   

       420    
pF1KB6 KEVEENI
       .:.    
CCDS11 REI    
              

>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17              (473 aa)
 initn: 1267 init1: 1195 opt: 1205  Z-score: 738.5  bits: 145.8 E(32554): 8.2e-35
Smith-Waterman score: 1205; 49.9% identity (80.6% similar) in 391 aa overlap (25-406:71-461)

                     10        20        30        40         50   
pF1KB6       MDFSRRSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRIS-NSRHTV
                                     :..  ..  : .::. : :.  . ..   .
CCDS11 RAPSTYGGGLSVSSRFSSGGACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGA
               50        60        70        80        90       100

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB6 NYGSDLTGGGDLFVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNAPRA
       ..:. ..::  :.::.::..::::::::::::.:::.::..:. :::.:..::. . :  
CCDS11 GFGGGFAGGDGLLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPSE
              110       120       130       140       150       160

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 GRDYSAYYRQIEELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVEADL
        .::: :.. ::.::..:  : ..::. .::::::.:::.::: ::: : ..: :::::.
CCDS11 IKDYSPYFKTIEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADV
              170       180       190       200       210       220

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 QGLNKVFDDLTLHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAAPGL
       .:: .:.:.::: .::::.::: :...:: :.:.:.::. .:. . :. ::::.:::::.
CCDS11 NGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGV
              230       240       250       260       270       280

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 NLGVIMNEMRQKYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELRRTS
       .:. :.::::..:: ::.:: ..:.  :  .:  :...:. :.: ..... ..:::::. 
CCDS11 DLSRILNEMRDQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVL
              290       300       310       320       330       340

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB6 QSLEIELQSHLSMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQNNEY
       :.:::::::.:::: :::..:::::.::  ::...:.:..:.: :: :.: .::.:..::
CCDS11 QGLEIELQSQLSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEY
              350       360       370       380       390       400

           360       370       380         390             400     
pF1KB6 HILLDIKTRLEQEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLS--TLEERDI------KKTRKIKTVVQ
       .::::.:::::::::::::::::::.. .  : :  .   :..      ...:. . ...
CCDS11 QILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILK
              410       420       430       440       450       460

         410       420    
pF1KB6 EVVDGKVVSSEVKEVEENI
       :                  
CCDS11 EQSSSSFSQGQSS      
              470         

>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17              (420 aa)
 initn: 1165 init1: 966 opt: 1181  Z-score: 725.0  bits: 143.2 E(32554): 4.6e-34
Smith-Waterman score: 1181; 54.6% identity (83.8% similar) in 346 aa overlap (36-380:73-415)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB6 RSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRISNSRHTVNYGSDLTGGGDL
                                     :::. : :.  . .   :..:.    :: :
CCDS11 GGYGGGVSCGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGA--CDGG-L
             50        60        70        80        90            

          70        80        90       100       110        120    
pF1KB6 FVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNAPRAG-RDYSAYYRQI
       ..::::..::::::::::::::::.::..:. :::.:..:.  ..: .  :::: ::. :
CCDS11 LTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTI
     100       110       120       130       140       150         

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB6 EELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVEADLQGLNKVFDDLT
       ::::..:  : ..: : .:.::::.:::.:::::::.: ..: .::::..:: .:.:.::
CCDS11 EELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELT
     160       170       180       190       200       210         

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB6 LHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAAPGLNLGVIMNEMRQ
       : :::::.::: ::..:: .::.:.::.  . ... . ::::.::.::..:  .. :::.
CCDS11 LSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMRE
     220       230       240       250       260       270         

          250       260       270       280       290       300    
pF1KB6 KYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELRRTSQSLEIELQSHL
       .::.::..: ..:.: :. ..: :...:..::  .. .....:::::: :.:::::::.:
CCDS11 QYEAMAERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQL
     280       290       300       310       320       330         

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB6 SMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQNNEYHILLDIKTRLE
       ::: .::.:. ::. ::. :: ..:.:.::.:::: ..::.:: ::.::..:::::::::
CCDS11 SMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLE
     340       350       360       370       380       390         

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB6 QEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEERDIKKTRKIKTVVQEVVDGKVVSSEVKEVEENI
       ::::::: ::::.:.:                                            
CCDS11 QEIATYRSLLEGQDAKKRQPP                                       
     400       410       420                                       

>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17              (458 aa)
 initn: 1165 init1: 966 opt: 1181  Z-score: 724.5  bits: 143.2 E(32554): 4.9e-34
Smith-Waterman score: 1181; 54.6% identity (83.8% similar) in 346 aa overlap (36-380:73-415)

          10        20        30        40        50        60     
pF1KB6 RSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRISNSRHTVNYGSDLTGGGDL
                                     :::. : :.  . .   :..:.    :: :
CCDS11 GGYGGGVSCGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGA--CDGG-L
             50        60        70        80        90            

          70        80        90       100       110        120    
pF1KB6 FVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNAPRAG-RDYSAYYRQI
       ..::::..::::::::::::::::.::..:. :::.:..:.  ..: .  :::: ::. :
CCDS11 LTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTI
     100       110       120       130       140       150         

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB6 EELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVEADLQGLNKVFDDLT
       ::::..:  : ..: : .:.::::.:::.:::::::.: ..: .::::..:: .:.:.::
CCDS11 EELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELT
     160       170       180       190       200       210         

          190       200       210       220       230       240    
pF1KB6 LHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAAPGLNLGVIMNEMRQ
       : :::::.::: ::..:: .::.:.::.  . ... . ::::.::.::..:  .. :::.
CCDS11 LSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMRE
     220       230       240       250       260       270         

          250       260       270       280       290       300    
pF1KB6 KYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELRRTSQSLEIELQSHL
       .::.::..: ..:.: :. ..: :...:..::  .. .....:::::: :.:::::::.:
CCDS11 QYEAMAERNRRDAEEWFHTKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQL
     280       290       300       310       320       330         

          310       320       330       340       350       360    
pF1KB6 SMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQNNEYHILLDIKTRLE
       ::: .::.:. ::. ::. :: ..:.:.::.:::: ..::.:: ::.::..:::::::::
CCDS11 SMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLE
     340       350       360       370       380       390         

          370       380       390       400       410       420    
pF1KB6 QEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEERDIKKTRKIKTVVQEVVDGKVVSSEVKEVEENI
       ::::::: ::::.:.:                                            
CCDS11 QEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP 
     400       410       420       430       440       450         

>>CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17              (400 aa)
 initn: 1292 init1: 1168 opt: 1168  Z-score: 717.6  bits: 141.7 E(32554): 1.2e-33
Smith-Waterman score: 1229; 53.5% identity (84.2% similar) in 355 aa overlap (33-378:34-388)

             10        20        30        40        50        60  
pF1KB6 FSRRSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGRGIRISNSRHTVNYGSDLTGG
                                     ::..::.::::. .:..: . . .:   ::
CCDS11 YSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPSIHGGSGGRGVSVSSARFVSSSSSGAYGG
            10        20        30        40        50        60   

                      70        80        90       100       110   
pF1KB6 G---------DLFVGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLEQSNSKLEVQIKQWYETNAPRA
       :          :..::::..::::::::::::.:::.:: .:..:::.:..::. ..:  
CCDS11 GYGGVLTASDGLLAGNEKLTMQNLNDRLASYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPGP
            70        80        90       100       110       120   

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB6 GRDYSAYYRQIEELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAAEDFRLKYETERGIRLTVEADL
       .:::: ::  :..::..:  : ..:.: :::::::.:::.::: :.:::...:..::::.
CCDS11 SRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRIVLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADI
           130       140       150       160       170       180   

           180       190       200       210       220       230   
pF1KB6 QGLNKVFDDLTLHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEVDGLHKHLGNTVNVEVDAAPGL
       .:: .:.:.::: .::::.::: :...:: :::.:.::.. :. ..:. :.::::.::: 
CCDS11 NGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEELAYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGT
           190       200       210       220       230       240   

           240       250       260       270       280       290   
pF1KB6 NLGVIMNEMRQKYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQVTVNTEELKGTEVQLTELRRTS
       .:. :...::..:::::..: ..:.  :  .:  :...:. .::.:. .. ..:.:::: 
CCDS11 DLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWFTSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTL
           250       260       270       280       290       300   

           300       310       320       330       340       350   
pF1KB6 QSLEIELQSHLSMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLLSSLEAQLMQIRSNMERQNNEY
       :.:::::::.:::: .:: :: ::.::...:::..:.:.:..:::: ..:.. ::::.::
CCDS11 QGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARFGAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEY
           310       320       330       340       350       360   

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pF1KB6 HILLDIKTRLEQEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEERDIKKTRKIKTVVQEVVDGKVV
       . :.:::.:::::::::: ::::..                                   
CCDS11 QRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHYNNLSASKVL                       
           370       380       390       400                       

>>CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17              (467 aa)
 initn: 1228 init1: 1087 opt: 1102  Z-score: 677.7  bits: 134.6 E(32554): 2e-31
Smith-Waterman score: 1112; 45.9% identity (72.6% similar) in 438 aa overlap (4-415:26-458)

                                     10        20        30        
pF1KB6                       MDFSRRSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGG
                                :: :  ::..:  ..:  : .:    :   :. .:
CCDS11 MATQTCTPTFSTGSIKGLCGTAGGISRVSSIRSVGSC-RVP--SLAGAA--GYISSARSG
               10        20        30         40            50     

       40        50         60             70        80        90  
pF1KB6 AGGRGIRISNSRHTVN-YGSDLTGGGDLFV-----GNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLE
        .: :  . .:  . . . : ..:.:  :      :.:: .:: ::::::.:::::: ::
CCDS11 LSGLGSCLPGSYLSSECHTSGFVGSGGWFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLANYLEKVRQLE
          60        70        80        90       100       110     

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB6 QSNSKLEVQIKQWYETNAPRAGRDYSAYYRQIEELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAA
       . :..:: .:..::: . :    ::..:.. ::.....:  .. .::: :::::::::::
CCDS11 RENAELESRIQEWYEFQIPYICPDYQSYFKTIEDFQQKILLTKSENARLVLQIDNAKLAA
         120       130       140       150       160       170     

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB6 EDFRLKYETERGIRLTVEADLQGLNKVFDDLTLHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEV
       .::: ::::: ..:  ::::..:: ...:.::: :.::: :.: :...:  :::.:.:::
CCDS11 DDFRTKYETELSLRQLVEADINGLRRILDELTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEV
         180       190       200       210       220       230     

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB6 DGLHKHLGNTVNVEVDAAPGLNLGVIMNEMRQKYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQV
       . :. .::. .:::::::: ..:. :...:: .::.....: ....  :. ::  :.:::
CCDS11 SVLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNKILEDMRCQYEALVENNRRDVEAWFNTQTEELNQQV
         240       250       260       270       280       290     

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB6 TVNTEELKGTEVQLTELRRTSQSLEIELQSHLSMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLL
       . ..:.:.  .... ::::: ..::::::.. ::..::: :: ::.::::::::..: :.
CCDS11 VSSSEQLQCCQTEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRNSLESTLAETEARYSSQLAQMQCLI
         300       310       320       330       340       350     

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB6 SSLEAQLMQIRSNMERQNNEYHILLDIKTRLEQEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEER
       :..:::: .:: ..::::.::..:::.:.::: ::::::.:::::: :      .:  . 
CCDS11 SNVEAQLSEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEIATYRHLLEGEDCKLPPQPCATACKP
         360       370       380       390       400       410     

                                400       410       420    
pF1KB6 DIKKTR--------------------KIKTVVQEVVDGKVVSSEVKEVEENI
        :.                       .:.:...:. ::::.::         
CCDS11 VIRVPSVPPVPCVPSVPCTPAPQVGTQIRTITEEIRDGKVISSREHVQSRPL
         420       430       440       450       460       

>>CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17              (455 aa)
 initn: 1177 init1: 1077 opt: 1093  Z-score: 672.6  bits: 133.6 E(32554): 3.8e-31
Smith-Waterman score: 1097; 47.9% identity (78.6% similar) in 378 aa overlap (13-380:34-407)

                                 10        20        30        40  
pF1KB6                   MDFSRRSFHRSLSSSLQAPVVSTVGMQRLGTTPSVYGGAGGR
                                     ::: . : .: :.  :  .. ::  : :  
CCDS11 KCLKAGFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVA--RSFSACSV--GLGRS
            10        20        30        40          50           

             50             60             70        80        90  
pF1KB6 GIRISNSRHTV-----NYGSDLTGGGDLF-----VGNEKMAMQNLNDRLASYLEKVRTLE
       . : ..   ..     ..... .:::  :     .:::: .::.::::::.:::::: ::
CCDS11 SYRATSCLPALCLPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLNDRLAGYLEKVRQLE
      60        70        80        90       100       110         

            100       110       120       130       140       150  
pF1KB6 QSNSKLEVQIKQWYETNAPRAGRDYSAYYRQIEELRSQIKDAQLQNARCVLQIDNAKLAA
       : :..:: .:..: : ..:    ::..:.: ::::...   .. .::: :..::::::::
CCDS11 QENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENARLVVEIDNAKLAA
     120       130       140       150       160       170         

            160       170       180       190       200       210  
pF1KB6 EDFRLKYETERGIRLTVEADLQGLNKVFDDLTLHKTDLEIQIEELNKDLALLKKEHQEEV
       .::: ::::: ..:  ::.:..:: ...::::: :.::: :.: :...:  :::.:.:::
CCDS11 DDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKKNHEEEV
     180       190       200       210       220       230         

            220       230       240       250       260       270  
pF1KB6 DGLHKHLGNTVNVEVDAAPGLNLGVIMNEMRQKYEVMAQKNLQEAKEQFERQTAVLQQQV
       ..:. .::. .:::::::: ..:. ...::: .::.....: ..:.. .. :.  :.:::
CCDS11 NSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAEDWLDTQSEELNQQV
     240       250       260       270       280       290         

            280       290       300       310       320       330  
pF1KB6 TVNTEELKGTEVQLTELRRTSQSLEIELQSHLSMKESLEHTLEETKARYSSQLANLQSLL
       . ..:.:.. .... ::::: ..::::::.. ::...:: :: ::.::::::::..: ..
CCDS11 VSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEARYSSQLAQMQCMI
     300       310       320       330       340       350         

            340       350       360       370       380       390  
pF1KB6 SSLEAQLMQIRSNMERQNNEYHILLDIKTRLEQEIATYRRLLEGEDVKTTEYQLSTLEER
       ...:::: .::...::::.::..:::...::: :: ::: :::.:: :            
CCDS11 TNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDSKLPCNPCAPDYSP
     360       370       380       390       400       410         

            400       410       420        
pF1KB6 DIKKTRKIKTVVQEVVDGKVVSSEVKEVEENI    
                                           
CCDS11 SKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
     420       430       440       450     




424 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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