Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6686
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6686, 458 aa
1>>>pF1KB6686 458 - 458 aa - 458 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.3323+/-0.00148; mu= 0.5291+/- 0.089
mean_var=312.5421+/-61.832, 0's: 0 Z-trim(109.2): 132 B-trim: 79 in 1/53
Lambda= 0.072547
statistics sampled from 10601 (10728) to 10601 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.654), E-opt: 0.2 (0.33), width: 16
Scan time: 2.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 2936 321.4 1.2e-87
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 2677 294.2 1.7e-79
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 2014 224.9 1.4e-58
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1797 202.2 9.8e-52
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1794 201.9 1.2e-51
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1613 182.9 5.8e-46
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 1582 179.8 6.7e-45
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 1524 173.6 4e-43
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 1510 172.1 9.6e-43
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 1462 167.2 3.8e-41
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 1449 165.9 1.1e-40
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 1385 159.0 9.2e-39
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 1338 154.1 2.8e-37
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 1286 148.7 1.2e-35
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1256 145.5 1.1e-34
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1247 144.6 2.1e-34
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 1243 144.2 2.8e-34
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 1175 137.0 3.6e-32
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1171 136.6 5e-32
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1161 135.5 9.6e-32
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1154 134.8 1.6e-31
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1143 133.6 3.5e-31
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1120 131.3 2e-30
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 1070 126.0 7.4e-29
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 1046 123.5 4.2e-28
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 1038 122.7 7.8e-28
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 1021 121.0 2.8e-27
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 1020 120.8 2.9e-27
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 1019 120.7 2.9e-27
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 754 92.8 5e-19
CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 695 87.0 6.3e-17
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 689 86.2 7.9e-17
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 677 85.0 2.1e-16
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 668 84.0 3.4e-16
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 665 83.8 5.1e-16
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 663 83.6 5.9e-16
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 661 83.4 6.8e-16
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 657 82.8 7.6e-16
CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 658 83.0 7.6e-16
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 657 82.8 7.7e-16
CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 658 83.0 7.9e-16
CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 656 82.8 9.3e-16
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 640 81.1 2.7e-15
CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 646 82.0 2.8e-15
CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 632 80.3 5.4e-15
CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 631 80.2 5.5e-15
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 618 78.8 1.4e-14
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 609 77.9 3.1e-14
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 606 77.5 3.2e-14
CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 599 76.9 6.2e-14
>>CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (458 aa)
initn: 2936 init1: 2936 opt: 2936 Z-score: 1686.8 bits: 321.4 E(32554): 1.2e-87
Smith-Waterman score: 2936; 99.6% identity (100.0% similar) in 458 aa overlap (1-458:1-458)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCGFGGGAGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCGFGGGAGSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DNARLAVDDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMK
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHAKS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 KNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHTKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 AELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMIGFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMIGFP
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KB6 SSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
430 440 450
>>CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 (420 aa)
initn: 2677 init1: 2677 opt: 2677 Z-score: 1540.7 bits: 294.2 E(32554): 1.7e-79
Smith-Waterman score: 2677; 99.5% identity (100.0% similar) in 415 aa overlap (1-415:1-415)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCGFGGGAGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCGFGGGAGSG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 FGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 DNARLAVDDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMK
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DNARLAADDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 KNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHAKS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS11 KNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHTKS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 AELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMIGFP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKKRQPP
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430 440 450
pF1KB6 SSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
>>CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 2244 init1: 1871 opt: 2014 Z-score: 1165.3 bits: 224.9 E(32554): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 2093; 75.5% identity (89.1% similar) in 440 aa overlap (13-446:27-451)
10 20 30 40
pF1KB6 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGG-RGVSTCSTRFVSGGSAGGY
:::::::: . ::: :..:. :.::::.::.:::
CCDS11 MTTTFLQTSSSTFGGGSTRGGSLLAGGGGFGGGSLSGGGGSRSISASSARFVSSGSGGGY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB6 GGGVS-CGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNE
:::. ::::::::: ::::.:::.:::.:::.::: :::::.:::
CCDS11 GGGMRVCGFGGGAGSVFGGGFGGGVGGGFGGGFGGG---------------DGGLLSGNE
70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 KITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRD
:::::::::::::::.::::::::::::::::.::. ::.:.::: ::: :.::::::::
CCDS11 KITMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIHDWYQKQTPTSPECDYSQYFKTIEELRD
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KB6 KILTATIENNRVILEIDNARLAVDDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTD
::...::.:.::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::..::
CCDS11 KIMATTIDNSRVILEIDNARLAADDFRLKYENELALRQGVEADINGLRRVLDELTLARTD
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 LEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAM
::::::.:::::::.::::::::::::.:..:::::::::.::.::::::::::::::::
CCDS11 LEMQIEGLNEELAYLKKNHEEEMKEFSSQLAGQVNVEMDAAPGVDLTRVLAEMREQYEAM
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB6 AERNRRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAG
::.::::.: :: .:. ::::::..:: ::::::::::.::::.: ::::::::::::::
CCDS11 AEKNRRDVEAWFFSKTEELNKEVASNTEMIQTSKTEITDLRRTMQELEIELQSQLSMKAG
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB6 LENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIAT
:::..:::::::: :::::::::...:::::::: ::: :::::::::::::::::::::
CCDS11 LENSLAETECRYATQLQQIQGLIGGLEAQLSELRCEMEAQNQEYKMLLDIKTRLEQEIAT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB6 YRSLLEGQDAKMIGFP----SSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
:::::::::::: :. ::.:. : . ... :.. ..:.
CCDS11 YRSLLEGQDAKMAGIAIREASSGGGGSSSNFHINVEESVDGQVVSSHKREI
410 420 430 440 450
>>CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 (473 aa)
initn: 1717 init1: 1294 opt: 1797 Z-score: 1042.3 bits: 202.2 E(32554): 9.8e-52
Smith-Waterman score: 1835; 65.5% identity (84.6% similar) in 449 aa overlap (9-443:17-455)
10 20 30 40
pF1KB6 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQ----LGGG--RGVST------CSTRFVSGG
: . :::.:::: . :.:: :. :: :.:: :::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSRFSSGG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB6 SAGGYGGGVSCGFGGGA--GSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGG
: : ::: . ::.... :::::::::::::.:.:::::.::::::::: :
CCDS11 -ACGLGGGYGGGFSSSSSFGSGFGGGYGGGLGAGFGGGLGAGFGGGFAGG--------DG
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKT
::.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::. .: : : .:::::.::
CCDS11 LLVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRP-SEIKDYSPYFKT
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 IEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAVDDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDEL
::.::.::..::::: . ::.:::::::.:::: :::.::::::.::::.::::::::::
CCDS11 IEDLRNKIIAATIENAQPILQIDNARLAADDFRTKYEHELALRQTVEADVNGLRRVLDEL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 TLSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMR
::..::::::::.:.:::::..::::::: . .:. :.:::::::.::.::.:.: :::
CCDS11 TLARTDLEMQIEGLKEELAYLRKNHEEEMLALRGQTGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMR
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 EQYEAMAERNRRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQ
.::: :::.:::::: :: .:. ::::::..:. ..:.:..:.:::::.:::::::::::
CCDS11 DQYEQMAEKNRRDAETWFLSKTEELNKEVASNSELVQSSRSEVTELRRVLQGLEIELQSQ
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 LSMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRL
:::::.:::.. ::. :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: :.:::..:::.::::
CCDS11 LSMKASLENSLEETKGRYCMQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQSQEYQILLDVKTRL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 EQEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
:::::::: ::::.::.. . .:. : : : . ....::.: :
CCDS11 EQEIATYRRLLEGEDAHLSSQQASGQSYSSREVFTSSSSSSSRQTRPILKEQSSSSFSQG
420 430 440 450 460 470
CCDS11 QSS
>>CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 (472 aa)
initn: 1649 init1: 1283 opt: 1794 Z-score: 1040.6 bits: 201.9 E(32554): 1.2e-51
Smith-Waterman score: 1809; 65.0% identity (83.7% similar) in 448 aa overlap (9-443:17-450)
10 20 30
pF1KB6 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQL-----GG--------GRGVSTCSTRFVSG
: . :::.:::: .. :: : :.:. :.:: ::
CCDS11 MTTCSRQFTSSSSMKGSCGIGGGIGGGSSRISSVLAGGSCRAPSTYGGGLSVSSSRFSSG
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB6 GSAGGYGGGVSCGFGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGL
: : : ::: . ::.. ..:.::.:.::: ::: :.::::::::::::: ::
CCDS11 G-ACGLGGGYGGGFSS-SSSSFGSGFGGGYGGGLGAGLGGGFGGGFAGG--------DGL
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB6 LTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTI
:.:.::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::. .: :: .:::::.:::
CCDS11 LVGSEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEEANADLEVKIRDWYQRQRPAEI-KDYSPYFKTI
120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KB6 EELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAVDDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELT
:.::.::::::..: :.:.:::::::.:::: :::.:: ::.:::::::::::::::::
CCDS11 EDLRNKILTATVDNANVLLQIDNARLAADDFRTKYETELNLRMSVEADINGLRRVLDELT
170 180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB6 LSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMRE
:...:::::::::.:::::.::::::::. . .:: :.:::::::.::.::.:.: :::.
CCDS11 LARADLEMQIESLKEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGDVNVEMDAAPGVDLSRILNEMRD
230 240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB6 QYEAMAERNRRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQL
::: :::.::.:::::: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::
CCDS11 QYEKMAEKNRKDAEEWFFTKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQNLEIELQSQL
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB6 SMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLE
::::.:::.. ::. :: .:: ::: .:.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::
CCDS11 SMKASLENSLEETKGRYCMQLAQIQEMIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLE
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB6 QEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
::::::: ::::.::.. . :.:: : :.. :.:: .. :
CCDS11 QEIATYRRLLEGEDAHLSSSQFSSGSQSSRDV---TSSSRQIRTKVMDVHDGKVVSTHEQ
410 420 430 440 450 460
CCDS11 VLRTKN
470
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10 20 30 40 50
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:.: .::.: : :.:::: :.:.:: :...: :. ::::: :. .
CCDS11 MTTSIRQFTSSSSIKGSSGLGGGSSRTSCRLSGGLGAGSC--RL---GSAGGLGSTL---
10 20 30 40 50
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pF1KB6 FGGGAGSGFGGGYGGGLGGGYGGGLGGGFGGGFAGGFVDFGACDGGLLTGNEKITMQNLN
.::.... :. : :::::...:: :: :::.:.:: ::::::
CCDS11 ----GGSSYSSCYSFGSGGGYGSSFGG----------VD------GLLAGGEKATMQNLN
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIE
:::::::.:::::::::..::::::::. .:.:. : :::: ::.:::::..::::::..
CCDS11 DRLASYLDKVRALEEANTELEVKIRDWYQRQAPG-PARDYSQYYRTIEELQNKILTATVD
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pF1KB6 NNRVILEIDNARLAVDDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESL
: ..:.:::::::.:::: :.:.: ::: ::::::::::::::::::...:::::::.:
CCDS11 NANILLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRLSVEADINGLRRVLDELTLARADLEMQIENL
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pF1KB6 NEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDA
.:::::.::::::::. . .:: :..::::::.::.::.:.: :::.::: :::.::.::
CCDS11 KEELAYLKKNHEEEMNALRGQVGGEINVEMDAAPGVDLSRILNEMRDQYEKMAEKNRKDA
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 EEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAET
:.:: .:. :::.::.::. ..:..:.::.:::::.:.:::::::::::::.::...:::
CCDS11 EDWFFSKTEELNREVATNSELVQSGKSEISELRRTMQALEIELQSQLSMKASLEGNLAET
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pF1KB6 ECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQ
: :: .::.::::::.:.: ::..:: ::: ::::::.:::.:::::::::::: ::::.
CCDS11 ENRYCVQLSQIQGLIGSVEEQLAQLRCEMEQQNQEYKILLDVKTRLEQEIATYRRLLEGE
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 DAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
::.. . . .. : : .....: ..
CCDS11 DAHLTQYKKEPVTTRQVRTIVEEVQDGKVISSREQVHQTTR
400 410 420 430
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10 20 30
pF1KB6 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGG-GRGVS
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CCDS11 VRYSSSKHYSSSRSGGGGGGGGCGGGGGVSSLRISSSKGSLGGGFSSGGFSGGSFSRG-S
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70
pF1KB6 TCSTRFVSGGSAGGYGGGVSCGFGGGA------GSGFGGGYGGGLGGG-YGGGL------
. . : :::.::::: :::::. .:.:::.::: .::: .:::
CCDS11 SGGGCF--GGSSGGYGG--LGGFGGGSFRGSYGSSSFGGSYGGIFGGGSFGGGSFGGGSF
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80 90 100 110 120 130
pF1KB6 -GGGFGGG-FAGGFVD-FGACDGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEV
::::::: :.::: ::. :::::.::::.:::::::::::::.:::::::.: .::
CCDS11 GGGGFGGGGFGGGFGGGFGG-DGGLLSGNEKVTMQNLNDRLASYLDKVRALEESNYELEG
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140 150 160 170 180 190
pF1KB6 KIRDWHLKQ--SPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAVDDFRL
::..:. :. : . :::: :::::..:...::. : .: ..:.:::::::.:::::
CCDS11 KIKEWYEKHGNSHQGEPRDYSKYYKTIDDLKNQILNLTTDNANILLQIDNARLAADDFRL
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200 210 220 230 240 250
pF1KB6 KYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSN
:::::.::::::::::::::::::::::.:.:::::::::.:::::.:::::::::.. :
CCDS11 KYENEVALRQSVEADINGLRRVLDELTLTKADLEMQIESLTEELAYLKKNHEEEMKDLRN
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260 270 280 290 300 310
pF1KB6 QVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTA
.:.:::::.:.::.:::..: .:: ::: .::.::.::: ::. :: ::. :...:
CCDS11 VSTGDVNVEMNAAPGVDLTQLLNNMRSQYEQLAEQNRKDAEAWFNEKSKELTTEIDNNIE
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pF1KB6 MIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEA
.:.. :.:::::::..:.:::::::::..: .:: ..:::: :: .::.:::. ::..:
CCDS11 QISSYKSEITELRRNVQALEIELQSQLALKQSLEASLAETEGRYCVQLSQIQAQISALEE
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pF1KB6 QLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRSTS
::...:.: :::: ::..::::: :::.:: ::::::::. .. :
CCDS11 QLQQIRAETECQNTEYQQLLDIKIRLENEIQTYRSLLEGEGSSGGGGRGGGSFGGGYGGG
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440 450
pF1KB6 VTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
CCDS11 SSGGGSSGGGHGGGHGGSSGGGYGGGSSGGGSSGGGYGGGSSSGGHGGSSSGGYGGGSSG
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10 20 30
pF1KB6 MSLRLQSSSASYGGGFGGGSCQLGGGRGVSTCSTRFV
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CCDS11 SNNTMSLSVRTPGLSRRLSSQSVIGRPRGMSASSVGSGYGGSAFGFG-----ASCG----
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40 50 60 70 80 90
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CCDS11 -GGFSAASMFGSSSGFGGGSGSSMAGGLGAGYGRALGGGSFGGLGMGFGGSPGGGSLGIL
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.. :::::.:.:: :::::::::::::.:::::::::..:: :::.:. .. .. .
CCDS11 SGNDGGLLSGSEKETMQNLNDRLASYLDKVRALEEANTELENKIREWYETRGTGTADASQ
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pF1KB6 RDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRVILEIDNARLAVDDFRLKYENELALRQSVEADIN
::: :: ::.::.::..:.: : ...:.:::::::..:::.::::::::::.::::::
CCDS11 SDYSKYYPLIEDLRNKIISASIGNAQLLLQIDNARLAAEDFRMKYENELALRQGVEADIN
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pF1KB6 GLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGID
:::::::::::..::::::::::::::::::::::.:.. : :.:.:::::.::.:
CCDS11 GLRRVLDELTLTRTDLEMQIESLNEELAYMKKNHEDELQSFRVGGPGEVSVEMDAAPGVD
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 LTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWFHAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQ
:::.: .:: :::..::.::.::: :: ::.:: ::.:::: ..:.::.:.:.:::..:
CCDS11 LTRLLNDMRAQYETIAEQNRKDAEAWFIEKSGELRKEISTNTEQLQSSKSEVTDLRRAFQ
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pF1KB6 GLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRYALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYK
.:::::::::.:: .::...::.: : ::.:.: :::..:::: ..:.. : :: ...
CCDS11 NLEIELQSQLAMKKSLEDSLAEAEGDYCAQLSQVQQLISNLEAQLLQVRADAERQNVDHQ
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390 400 410 420 430 440
pF1KB6 MLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKMIGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASG
::..:.::: :: ::: ::.:. :. :. : .. .: . .: :: . : :
CCDS11 RLLNVKARLELEIETYRRLLDGE-AQGDGLEESLFVTDSKSQAQSTDSSKDPTKTRKIKT
420 430 440 450 460 470
450
pF1KB6 RRTSDVRRP
CCDS11 VVQEMVNGEVVSSQVQEIEELM
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CCDS11 MTSYSYRQSSATSSFGGLGGGSVRFGPGVAFRAPS---IHGGS-GGRGVSVSSARFVSSS
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.:: .:::::: : : :: ::.::::.::::::::::
CCDS11 SSGAYGGGYGGVLT-----------------------ASDG-LLAGNEKLTMQNLNDRLA
60 70 80 90
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pF1KB6 SYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQSPASPERDYSPYYKTIEELRDKILTATIENNRV
:::.:::::: ::..::::::::. ::.:. : :::: :: ::..:::::: :::::.:.
CCDS11 SYLDKVRALEAANGELEVKIRDWYQKQGPG-PSRDYSHYYTTIQDLRDKILGATIENSRI
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pF1KB6 ILEIDNARLAVDDFRLKYENELALRQSVEADINGLRRVLDELTLSKTDLEMQIESLNEEL
.:.:::::::.:::: :.:.: :::.::::::::::::::::::..::::::::.:.:::
CCDS11 VLQIDNARLAADDFRTKFETEQALRMSVEADINGLRRVLDELTLARTDLEMQIEGLKEEL
160 170 180 190 200 210
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pF1KB6 AYMKKNHEEEMKEFSNQVVGQVNVEMDATPGIDLTRVLAEMREQYEAMAERNRRDAEEWF
::.:::::::.. . .:: :::.::.:..:: ::...:..:: :::.:::.::.::: ::
CCDS11 AYLKKNHEEEISTLRGQVGGQVSVEVDSAPGTDLAKILSDMRSQYEVMAEQNRKDAEAWF
220 230 240 250 260 270
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pF1KB6 HAKSAELNKEVSTNTAMIQTSKTEITELRRTLQGLEIELQSQLSMKAGLENTVAETECRY
... :::.::. .: ..: :..:.:.::::::::::::::::::::.::.:.:::: :.
CCDS11 TSRTEELNREVAGHTEQLQMSRSEVTDLRRTLQGLEIELQSQLSMKAALEDTLAETEARF
280 290 300 310 320 330
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pF1KB6 ALQLQQIQGLISSIEAQLSELRSEMECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQDAKM
. :: .::.:::.:::::...:.. : :::::. :.:::.::::::::::::::::. ..
CCDS11 GAQLAHIQALISGIEAQLGDVRADSERQNQEYQRLMDIKSRLEQEIATYRSLLEGQEDHY
340 350 360 370 380 390
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pF1KB6 IGFPSSAGSVSPRSTSVTTTSSASVTTTSNASGRRTSDVRRP
.. .:
CCDS11 NNLSASKVL
400
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pF1KB6 MSLRLQSSSA--SYGGG-FGGGS-CQLGGGR------GVSTCSTRFVSGGSA
:::: : ::. :..:: : :::. :.:.:: :.:.
CCDS11 MSCSSRASSSRAGGSSSARVSAGGSSFSSGSRCGLGGSSAQGFRGGASSCSLSGGSSGAF
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pF1KB6 GG-YGGGV-SC----GFGG--GAGSGFGGG--YGGGLGGGYGGGLGGG--FGGGFAGGFV
:: .::: :: :::: :.:.::::: .:: : : :.:. :. :..: .:::
CCDS11 GGSFGGGFGSCSVGGGFGGASGSGTGFGGGSSFGGVSGFGRGSGFCGSSRFSSGATGGFY
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pF1KB6 DFGAC------DGGLLTGNEKITMQNLNDRLASYLEKVRALEEANADLEVKIRDWHLKQS
..:. ::::..:.:: ::::::::::.::.:::::::::.::: ::..:. : .
CCDS11 SYGGGMGGGVGDGGLFSGGEKQTMQNLNDRLANYLDKVRALEEANTDLENKIKEWYDKYG
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:.: . :::: ::. ::.::..:..::.:: .::.:::::::.::::::::::: :
CCDS11 PGSGDGGSGRDYSKYYSIIEDLRNQIIAATVENAGIILHIDNARLAADDFRLKYENELCL
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::::::::::::.:::.::....::::::::..:::::..::::::::..... :.:.:
CCDS11 RQSVEADINGLRKVLDDLTMTRSDLEMQIESFTEELAYLRKNHEEEMKNMQGSSGGEVTV
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::.:.:: :::..: .:: ::: .::.:::.::: :. .:: :. ..::... ..:.:
CCDS11 EMNAAPGTDLTKLLNDMRAQYEELAEQNRREAEERFNKQSASLQAQISTDAGAATSAKNE
310 320 330 340 350 360
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CCDS11 ITELKRTLQALEIELQSQLAMKSSLEGTLADTEAGYVAQLSEIQTQISALEEEICQIWGE
370 380 390 400 410 420
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pF1KB6 MECQNQEYKMLLDIKTRLEQEIATYRSLLEGQD--AKMIGFPS-SAGSVSPRSTSVTTTS
.::: :::.::::::::: :: ::: ::.:. ... : . ..:::. : .... .
CCDS11 TKCQNAEYKQLLDIKTRLEVEIETYRRLLDGEGGGSSFAEFGGRNSGSVNMGSRDLVSGD
430 440 450 460 470 480
440 450
pF1KB6 SASVTTTSNASGRRTSDVRRP
: : . ...:: .: .:
CCDS11 SRS--GSCSGQGRDSSKTRVTKTIVEELVDGKVVSSQVSSISEVKVK
490 500 510 520
458 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 11:46:33 2016 done: Sat Nov 5 11:46:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]