Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6695
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6695, 429 aa
1>>>pF1KB6695 429 - 429 aa - 429 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1163+/-0.000796; mu= 9.6044+/- 0.048
mean_var=107.1476+/-21.718, 0's: 0 Z-trim(111.0): 49 B-trim: 669 in 1/51
Lambda= 0.123903
statistics sampled from 11984 (12033) to 11984 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.728), E-opt: 0.2 (0.37), width: 16
Scan time: 3.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 2876 524.4 8.1e-149
CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 1243 232.5 4.6e-61
CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 1214 227.3 1.7e-59
CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 1191 223.2 2.9e-58
CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 1188 222.6 4.2e-58
CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 1188 222.6 4.2e-58
CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 1188 222.6 4.2e-58
CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 1173 220.0 2.7e-57
CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 1158 217.3 1.7e-56
CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 1158 217.3 1.7e-56
CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 1078 203.0 4e-52
CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 1011 191.0 1.4e-48
CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 962 182.2 6.2e-46
CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 889 169.2 5.6e-42
CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 866 165.1 9.7e-41
CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 861 164.2 1.8e-40
CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 810 155.1 1e-37
CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 809 154.9 1.1e-37
CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 809 154.9 1.1e-37
CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 802 153.7 2.7e-37
CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 790 151.5 1.3e-36
CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 769 147.8 1.6e-35
CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 761 146.5 1.2e-34
CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 715 138.1 1.5e-32
CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 662 128.6 7.5e-30
CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 639 124.5 1.4e-28
CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 564 111.1 1.6e-24
CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 568 112.0 2.6e-24
CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 565 111.4 3.1e-24
CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 563 111.0 3.2e-24
CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 564 111.2 3.2e-24
CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 565 111.4 3.3e-24
CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 564 111.3 4.5e-24
CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 564 111.4 6e-24
CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 539 106.8 7.4e-23
CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 539 106.8 7.4e-23
CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 539 106.8 7.5e-23
CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 532 105.4 8.2e-23
CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 523 104.0 8.6e-22
CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 513 102.2 2.4e-21
CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 496 99.1 1.4e-20
CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 438 88.6 9.7e-18
CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 424 86.2 8.5e-17
CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 365 75.5 5.9e-14
>>CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX (429 aa)
initn: 2876 init1: 2876 opt: 2876 Z-score: 2785.2 bits: 524.4 E(32554): 8.1e-149
Smith-Waterman score: 2876; 100.0% identity (100.0% similar) in 429 aa overlap (1-429:1-429)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 METQFRRGGLGCSPASIKRKKKREDSGDFGLQVSTMFSEDDFQSTERAPYGPQLQWSQDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 METQFRRGGLGCSPASIKRKKKREDSGDFGLQVSTMFSEDDFQSTERAPYGPQLQWSQDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 PRVQVFREQANLEDRSPRRTQRITGGEQVLWGPITQIFPTVRPADLTRVIMPLEQRSQHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 PRVQVFREQANLEDRSPRRTQRITGGEQVLWGPITQIFPTVRPADLTRVIMPLEQRSQHC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 KPEEGLQAQEEDLGLVGAQALQAEEQEAAFFSSTLNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KPEEGLQAQEEDLGLVGAQALQAEEQEAAFFSSTLNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 SPTAMDAIFGSLSDEGSGSQEKEGPSTSPDLIDPESFSQDILHDKIIDLVHLLLRKYRVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SPTAMDAIFGSLSDEGSGSQEKEGPSTSPDLIDPESFSQDILHDKIIDLVHLLLRKYRVK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 GLITKAEMLGSVIKNYEDYFPEIFREASVCMQLLFGIDVKEVDPTSHSYVLVTSLNLSYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GLITKAEMLGSVIKNYEDYFPEIFREASVCMQLLFGIDVKEVDPTSHSYVLVTSLNLSYD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB6 GIQCNEQSMPKSGLLIIVLGVIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GIQCNEQSMPKSGLLIIVLGVIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 QNWVQEKYLVYRQVPGTDPACYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QNWVQEKYLVYRQVPGTDPACYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYED
370 380 390 400 410 420
pF1KB6 ALREEGEGV
:::::::::
CCDS48 ALREEGEGV
>>CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX (317 aa)
initn: 1082 init1: 873 opt: 1243 Z-score: 1209.7 bits: 232.5 E(32554): 4.6e-61
Smith-Waterman score: 1243; 62.2% identity (80.3% similar) in 320 aa overlap (111-429:1-317)
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 QRITGGEQVLWGPITQIFPTVRPADLTRVIMPLEQRSQHCKPEEGLQAQEEDLGLVGAQA
: ::.:::::::::..:::: ::::::::
CCDS14 MSSEQKSQHCKPEEGVEAQEEALGLVGAQA
10 20 30
150 160 170 180 190
pF1KB6 LQAEEQEAAFFSST-LNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESFSPTAMDAIFGSLSDEGSGS
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CCDS14 PTTEEQEAAVSSSSPLVPGTLEEVPAAESAGPPQSPQGASALPTTISFTCWRQPNEGSSS
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB6 QEKEGPSTSPDLIDPESFSQDILHDKIIDLVHLLLRKYRVKGLITKAEMLGSVIKNYEDY
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CCDS14 QEEEGPSTSPD---AESLFREALSNKVDELAHFLLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRC
100 110 120 130 140
260 270 280 290 300 310
pF1KB6 FPEIFREASVCMQLLFGIDVKEVDPTSHSYVLVTSLNLSYDGIQCNEQSMPKSGLLIIVL
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CCDS14 FPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPASNTYTLVTCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVL
150 160 170 180 190 200
320 330 340 350 360 370
pF1KB6 GVIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLTQNWVQEKYLVYRQVPGTDP
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CCDS14 GTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNP
210 220 230 240 250 260
380 390 400 410 420
pF1KB6 ACYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYEDALREEGEGV
: ::::::::: :::: .::::... .:.: .:::: : :: :: :::
CCDS14 ARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRIAYPSLREAALLEEEEGV
270 280 290 300 310
>>CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX (318 aa)
initn: 1212 init1: 1212 opt: 1214 Z-score: 1181.7 bits: 227.3 E(32554): 1.7e-59
Smith-Waterman score: 1214; 60.5% identity (81.8% similar) in 319 aa overlap (111-429:1-318)
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 QRITGGEQVLWGPITQIFPTVRPADLTRVIMPLEQRSQHCKPEEGLQAQEEDLGLVGAQA
: : :.::. : ::::::: : ::. .:
CCDS14 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQI
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 LQAEEQEAAFFSSTLNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESFSPTAMDAIFGSLSDEGSGSQ
::::.:: :::: .:::::. . ::::::::. : : :. :. . : :::::.:.
CCDS14 PTAEEQKAASSSSTLIMGTLEEVTDSGSPSPPQSPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSN
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 EKEGPSTSPDLIDPESFSQDILHDKIIDLVHLLLRKYRVKGLITKAEMLGSVIKNYEDYF
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CCDS14 EEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAELVRFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHF
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 PEIFREASVCMQLLFGIDVKEVDPTSHSYVLVTSLNLSYDGIQCNEQSMPKSGLLIIVLG
:.:: .:: :::..::::::::::..:::.::: :.:::::. ..:: ::.::::::::
CCDS14 PDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSYILVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLG
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 VIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLTQNWVQEKYLVYRQVPGTDPA
.:.:::. :::..::.::.::.: :::: .. . ..::::.::::.:: :::.::.::.
CCDS14 MILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREHSVYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPV
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420
pF1KB6 CYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYEDALREEGEGV
::::::::: :::: .::::... .:.: :::::.:.:: :: .::
CCDS14 RYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRISYPSLHEEALGEE-KGV
280 290 300 310
>>CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 800 init1: 800 opt: 1191 Z-score: 1159.5 bits: 223.2 E(32554): 2.9e-58
Smith-Waterman score: 1191; 59.9% identity (78.9% similar) in 317 aa overlap (111-427:1-313)
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 QRITGGEQVLWGPITQIFPTVRPADLTRVIMPLEQRSQHCKPEEGLQAQEEDLGLVGAQA
::::::::::::::::.:. : ::::::::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQA
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 LQAEEQEAAFFSSTLNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESFSPTAMDAIFGSLSDEGSGSQ
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CCDS76 PATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPDPPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQ
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 EKEGPSTSPDLIDPESFSQDILHDKIIDLVHLLLRKYRVKGLITKAEMLGSVIKNYEDYF
:.::::: ::: :: : : :. .:::.:: :::.. .:::::::::. :.. .:
CCDS76 EEEGPSTFPDL---ESEFQAALSRKVAELVHFLLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFF
100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 PEIFREASVCMQLLFGIDVKEVDPTSHSYVLVTSLNLSYDGIQCNEQSMPKSGLLIIVLG
: :: .:: .::.:::.. :::: .: :...: :.:::::. ..: :::.:::::::.
CCDS76 PVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFATCLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLA
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 VIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLTQNWVQEKYLVYRQVPGTDPA
.: ::.: ::: .:: ::.. :. ::: ..:.::.::::..:::.:: ::::::.:::
CCDS76 IIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSILGDPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPA
210 220 230 240 250 260
390 400 410 420
pF1KB6 CYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYEDALREEGEGV
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CCDS76 CYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHISYPPLHEWVLRE-GEE
270 280 290 300 310
>>CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX (314 aa)
initn: 797 init1: 797 opt: 1188 Z-score: 1156.6 bits: 222.6 E(32554): 4.2e-58
Smith-Waterman score: 1188; 59.9% identity (77.9% similar) in 317 aa overlap (111-427:1-313)
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 QRITGGEQVLWGPITQIFPTVRPADLTRVIMPLEQRSQHCKPEEGLQAQEEDLGLVGAQA
::::::::::::::::.:. : ::::::::
CCDS76 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQA
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 LQAEEQEAAFFSSTLNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESFSPTAMDAIFGSLSDEGSGSQ
.:::::: :::: :: :.::::::.:::::: : ::.:. . : : : :..:
CCDS76 PATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPDPPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQ
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB6 EKEGPSTSPDLIDPESFSQDILHDKIIDLVHLLLRKYRVKGLITKAEMLGSVIKNYEDYF
:.::::: ::: :: : : :. :::.:: :::.. .:::::::::. :.. .:
CCDS76 EEEGPSTFPDL---ESEFQAALSRKVAKLVHFLLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFF
100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KB6 PEIFREASVCMQLLFGIDVKEVDPTSHSYVLVTSLNLSYDGIQCNEQSMPKSGLLIIVLG
: :: .:: .::.:::.. :::: .: :...: :.:::::. ..: :::.:.:::.:.
CCDS76 PVIFSKASDSLQLVFGIELMEVDPIGHVYIFATCLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIILA
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KB6 VIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLTQNWVQEKYLVYRQVPGTDPA
.: ::.: ::: .:: ::.. :. ::: .::.::.:::: .:::.:: ::::::.:::
CCDS76 IIAKEGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSIFGDPKKLLTQYFVQENYLEYRQVPGSDPA
210 220 230 240 250 260
390 400 410 420
pF1KB6 CYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYEDALREEGEGV
:::::::::: ::: .:::..... .: ::: :.: :::: ::
CCDS76 CYEFLWGPRALIETSYVKVLHHMVKISGGPRISYPLLHEWALRE-GEE
270 280 290 300 310
>>CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX (315 aa)
initn: 1195 init1: 1044 opt: 1188 Z-score: 1156.6 bits: 222.6 E(32554): 4.2e-58
Smith-Waterman score: 1188; 58.9% identity (79.6% similar) in 319 aa overlap (111-429:1-315)
90 100 110 120 130 140
pF1KB6 QRITGGEQVLWGPITQIFPTVRPADLTRVIMPLEQRSQHCKPEEGLQAQEEDLGLVGAQA
: ::::: ::::.: :.:: :::::.:::
CCDS14 MSLEQRSPHCKPDEDLEAQGEDLGLMGAQE
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB6 LQAEEQEAAFFSSTLNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESFSPTAMDAIFGSLSDEGSGSQ
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CCDS76 EEEGPRMFPDL---ESEFQAAISRKMVELVHFLLLKYRAREPVTKAEMLESVLRNCQDFF
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pF1KB6 CYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYEDALREEGEGV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]