Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6699
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6699, 304 aa
1>>>pF1KB6699 304 - 304 aa - 304 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0613+/-0.000757; mu= 12.5396+/- 0.046
mean_var=88.1834+/-17.717, 0's: 0 Z-trim(110.7): 74 B-trim: 104 in 2/50
Lambda= 0.136578
statistics sampled from 11741 (11815) to 11741 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.731), E-opt: 0.2 (0.363), width: 16
Scan time: 2.700
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 ( 341) 2020 407.5 7e-114
CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 ( 348) 1887 381.3 5.5e-106
CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 ( 444) 1635 331.7 6e-91
CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 455) 1599 324.7 8.3e-89
CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 ( 438) 1144 235.0 7.9e-62
CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 273) 1068 219.9 1.7e-57
CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 ( 410) 1055 217.4 1.4e-56
CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 ( 342) 916 190.0 2.1e-48
CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 631) 683 144.3 2.4e-34
CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 ( 632) 683 144.3 2.4e-34
CCDS62803.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 634) 673 142.3 9.3e-34
CCDS42615.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 631 134.0 2.9e-31
CCDS42614.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 652) 631 134.0 2.9e-31
CCDS42617.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 650) 629 133.6 3.8e-31
CCDS42616.1 LILRB1 gene_id:10859|Hs108|chr19 ( 651) 629 133.6 3.9e-31
CCDS62791.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 482) 600 127.8 1.6e-29
CCDS62792.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 510) 600 127.8 1.7e-29
CCDS12886.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 598) 600 127.9 1.9e-29
CCDS42612.1 LILRB2 gene_id:10288|Hs108|chr19 ( 597) 598 127.5 2.5e-29
CCDS42610.1 LILRA6 gene_id:79168|Hs108|chr19 ( 481) 594 126.6 3.6e-29
CCDS12901.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 489) 579 123.7 2.8e-28
CCDS46179.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 483) 568 121.5 1.2e-27
CCDS12890.1 LILRA4 gene_id:23547|Hs108|chr19 ( 499) 562 120.4 2.9e-27
CCDS74453.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 454) 557 119.3 5.3e-27
CCDS12900.1 LILRA2 gene_id:11027|Hs108|chr19 ( 466) 557 119.3 5.4e-27
CCDS42611.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 491) 549 117.8 1.7e-26
CCDS12885.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 590) 549 117.8 2e-26
CCDS46176.1 LILRB5 gene_id:10990|Hs108|chr19 ( 591) 549 117.8 2e-26
CCDS12888.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 299) 509 109.8 2.7e-24
CCDS12889.1 LILRA5 gene_id:353514|Hs108|chr19 ( 287) 493 106.6 2.3e-23
CCDS46182.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 287) 455 99.1 4.1e-21
CCDS46181.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 303) 437 95.6 5e-20
CCDS12911.1 NCR1 gene_id:9437|Hs108|chr19 ( 304) 437 95.6 5e-20
CCDS62802.1 LILRA1 gene_id:11024|Hs108|chr19 ( 289) 427 93.6 1.9e-19
CCDS46184.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 339) 368 82.0 6.8e-16
CCDS42626.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 620) 368 82.2 1.1e-15
CCDS58678.1 GP6 gene_id:51206|Hs108|chr19 ( 321) 339 76.3 3.4e-14
CCDS62789.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 271) 319 72.3 4.6e-13
CCDS74444.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 282) 309 70.4 1.8e-12
CCDS12876.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 286) 309 70.4 1.9e-12
CCDS12874.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 252) 293 67.2 1.5e-11
CCDS42622.1 FCAR gene_id:2204|Hs108|chr19 ( 265) 286 65.8 4.1e-11
CCDS12875.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 263) 283 65.2 6.1e-11
CCDS12873.1 OSCAR gene_id:126014|Hs108|chr19 ( 267) 283 65.2 6.1e-11
>>CCDS33107.1 KIR2DL3 gene_id:3804|Hs108|chr19 (341 aa)
initn: 2020 init1: 2020 opt: 2020 Z-score: 2158.0 bits: 407.5 E(32554): 7e-114
Smith-Waterman score: 2020; 95.7% identity (98.0% similar) in 304 aa overlap (1-304:1-304)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS33 MSLMVVSMVCVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFQHFLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 HREGKFKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS33 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSETGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQE
::::::::::::: : : .:::::::::: :::::.::::::::::::: ::::::: ::
CCDS33 PRHLHVLIGTSVVIILFILLLFFLLHRWCCNKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDSDEQDPQE
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 VSYA
:.::
CCDS33 VTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAEP
310 320 330 340
>>CCDS12904.1 KIR2DL1 gene_id:3802|Hs108|chr19 (348 aa)
initn: 2144 init1: 1643 opt: 1887 Z-score: 2016.2 bits: 381.3 E(32554): 5.5e-106
Smith-Waterman score: 1887; 91.4% identity (95.7% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-302)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
:::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::: ::::::
CCDS12 MSLLVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGRLVKSEETVILQCWSDVMFEHFLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
:::: ..:::.::::::::::::::::. : :::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS12 HREGMFNDTLRLIGEHHDGVSKANFSISRMTQDLAGTYRCYGSVTHSPYQVSAPSDPLDI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
:: ::::::::::: ::::::::.::::::::::::::::::::::::::. ::::::::
CCDS12 VIIGLYEKPSLSAQLGPTVLAGENVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRLPAGPKVNGT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB6 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FQADFPLGPATHGGTYRCFGSFHDSPYEWSKSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKTGN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB6 PRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDHQE
:::::.::::::: : : ::::::::::::::::::::::: :::::.::::::::: ::
CCDS12 PRHLHILIGTSVVIILF-ILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQESAGNRTANSEDSDEQDPQE
250 260 270 280 290
pF1KB6 VSYA
:.:
CCDS12 VTYTQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDIIVYTELPNAESRSKVVSCP
300 310 320 330 340
>>CCDS42621.1 KIR3DL1 gene_id:3811|Hs108|chr19 (444 aa)
initn: 1635 init1: 1635 opt: 1635 Z-score: 1746.3 bits: 331.7 E(32554): 6e-91
Smith-Waterman score: 1635; 84.7% identity (90.7% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-399)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
: :::::::::::::::: : ::::::::.
CCDS42 HAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDI
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
::::.::.:: :: .:.:. ::::::::::::::: :::::::::::::.::::::
CCDS42 MFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPMMLALAGTYRCYGSVTHTPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
::::::::.:: :::::::::::: : :::::::::::::::::::::::: :::::. :
CCDS42 PSDPLDIVVTGPYEKPSLSAQPGPKVQAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGGAHERRLPA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
::: :::::::::::::::::::::::: ::::::. :::::::::::::.:::::::
CCDS42 VRKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRHSPYEWSDPSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
::::.:::::::.::::::: : : .::::::: ::::::::::::::::::::.:::::
CCDS42 PSSKSGNPRHLHILIGTSVVIILFILLLFFLLHLWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTANSEDS
330 340 350 360 370 380
300
pF1KB6 DEQDHQEVSYA
:::: .::.::
CCDS42 DEQDPEEVTYAQLDHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTILYTELPNAKPRSKVVSCP
390 400 410 420 430 440
>--
initn: 335 init1: 198 opt: 315 Z-score: 340.6 bits: 71.7 E(32554): 1.2e-12
Smith-Waterman score: 315; 44.7% identity (64.2% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
::::::::::::.::.: : :: : . :: : : :. .: : :.: ::..:.:
CCDS42 MSLMVVSMACVGLFLVQRAGPHMGGQDKPFLSAWPSAVVPRGGHVTLRCHYRHRFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
..: : .: : : . . .:...:. ::.: : :: ::: ::::.:. :
CCDS42 YKE----DRIH-IPIFHGRIFQESFNMSPVTTAHAGNYTCRGSHPHSPTGWSAPSNPVVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
..:
CCDS42 MVTGNHRKPSLLAHPGPLVKSGERVILQCWSDIMFEHFFLHKEGISKDPSRLVGQIHDGV
120 130 140 150 160 170
>>CCDS12906.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (455 aa)
initn: 1599 init1: 1599 opt: 1599 Z-score: 1707.8 bits: 324.7 E(32554): 8.3e-89
Smith-Waterman score: 1599; 84.0% identity (90.4% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-399)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
: :::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
::::.::::: .: .:.:. :::::::::::::.: ::::::::::: ::::::::
CCDS12 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
:::::::::::::::::::::::::: :::.::::::: ::::.:::::::::::::. :
CCDS12 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
:::: :::::::::::::::::::::::: : :::::::::::::::::.:::::::
CCDS12 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGNPSSSWPSPTE
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
::::.: :::::::::::: . : .::::::.::::::::::::::::::.:::: .::
CCDS12 PSSKSGICRHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS
330 340 350 360 370 380
300
pF1KB6 DEQDHQEVSYA
:::: :::.::
CCDS12 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ
390 400 410 420 430 440
>--
initn: 323 init1: 192 opt: 336 Z-score: 362.8 bits: 75.8 E(32554): 6.9e-14
Smith-Waterman score: 336; 48.0% identity (62.6% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
::: ::::::::::::::::: : . :: : :.:. .: : ::: :..:.:
CCDS12 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
..: : : . : . . .: .::. :::::: :: :: ::::.:: :
CCDS12 YKE----DRSH-VPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
..:
CCDS12 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV
120 130 140 150 160 170
>>CCDS58677.1 KIR3DL2 gene_id:3812|Hs108|chr19 (438 aa)
initn: 1144 init1: 1144 opt: 1144 Z-score: 1223.5 bits: 235.0 E(32554): 7.9e-62
Smith-Waterman score: 1440; 78.6% identity (84.3% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-382)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
: :::::::::::::.:: :::::::::::
CCDS58 HAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVIMVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
::::.::::: .: .:.:. :::::::::::::.: ::::::::::: ::::::::
CCDS58 MFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGVSKANFSIGPLMPVLAGTYRCYGSVPHSPYQLSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
:::::::::::::::::::::::::: :::.::::::: ::::.:::::::::::::. :
CCDS58 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSWSSYDIYHLSREGEAHERRLRA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
:::: :::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::::
CCDS58 VPKVNRTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRALPCVWSNSSDPLLVSVTGIC---------
270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
:::::::::::: . : .::::::.::::::::::::::::::.:::: .::
CCDS58 --------RHLHVLIGTSVVIFLFILLLFFLLYRWCSNKKNAAVMDQEPAGDRTVNRQDS
320 330 340 350 360 370
300
pF1KB6 DEQDHQEVSYA
:::: :::.::
CCDS58 DEQDPQEVTYAQLDHCVFIQRKISRPSQRPKTPLTDTSVYTELPNAEPRSKVVSCPRAPQ
380 390 400 410 420 430
>--
initn: 323 init1: 192 opt: 336 Z-score: 363.1 bits: 75.8 E(32554): 6.6e-14
Smith-Waterman score: 336; 48.0% identity (62.6% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
::: ::::::::::::::::: : . :: : :.:. .: : ::: :..:.:
CCDS58 MSLTVVSMACVGFFLLQGAWPLMGGQDKPFLSARPSTVVPRGGHVALQCHYRRGFNNFML
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
..: : : . : . . .: .::. :::::: :: :: ::::.:: :
CCDS58 YKE----DRSH-VPIFHGRIFQESFIMGPVTPAHAGTYRCRGSRPHSLTGWSAPSNPLVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
..:
CCDS58 MVTGNHRKPSLLAHPGPLLKSGETVILQCWSDVMFEHFFLHREGISEDPSRLVGQIHDGV
120 130 140 150 160 170
>>CCDS42620.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (273 aa)
initn: 1042 init1: 949 opt: 1068 Z-score: 1145.6 bits: 219.9 E(32554): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 1068; 60.8% identity (75.8% similar) in 273 aa overlap (1-273:3-270)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHF
:: :. .::.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL
:.. :: . . : .. . .: :.:. :::::: : ::: . ::::.::
CCDS42 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN
:..:::::::::.:.::::: :::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..:
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
::::::::::::::: ::::::::. ::::::. :::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 GNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDH
: ::::..: ::. : :::: :::::::::.::
CCDS42 GIARHLHAVIRYSVAIILFTILPFFLLHRWCSKKKMLL
240 250 260 270
300
pF1KB6 QEVSYA
>>CCDS12903.1 KIR3DL3 gene_id:115653|Hs108|chr19 (410 aa)
initn: 1663 init1: 1055 opt: 1055 Z-score: 1129.2 bits: 217.4 E(32554): 1.4e-56
Smith-Waterman score: 1374; 73.7% identity (84.7% similar) in 281 aa overlap (24-304:119-382)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
:::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS12 HAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVIMVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDV
90 100 110 120 130 140
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSA
:::.::::::: .: :.:.:. ::. :..:.:.::: :::::::.::::: ::.:::
CCDS12 RFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAGSQVNYSMGPMTPALAGTYRCFGSVTHLPYELSA
150 160 170 180 190 200
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 PSDPLDIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSA
::::::::..::: :::::::::::: :::.::::::::: .:.::::::.:: : :..:
CCDS12 PSDPLDIVVVGLYGKPSLSAQPGPTVQAGENVTLSCSSRSLFDIYHLSREAEAGELRLTA
210 220 230 240 250 260
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GPKVNGTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTE
.:::::::.:::::.::::.:::::::: :. ::. :::: ::::::
CCDS12 VLRVNGTFQANFPLGPVTHGGNYRCFGSFRALPHAWSDPSDPLPVSVTGNS---------
270 280 290 300 310
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 PSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDS
:.:::::::::: :::.:::::::::::.:::::.::::::::::::: :::
CCDS12 --------RNLHVLIGTSVVIIPFAILLFFLLHRWCANKKNAVVMDQEPAGNRTVNREDS
320 330 340 350 360 370
300
pF1KB6 DEQDHQEVSYA
:::: :::.::
CCDS12 DEQDPQEVTYAQLNHCVFTQRKITRPSQRPKTPPTDTSV
380 390 400 410
>--
initn: 361 init1: 236 opt: 353 Z-score: 381.6 bits: 79.1 E(32554): 6.2e-15
Smith-Waterman score: 353; 48.0% identity (66.7% similar) in 123 aa overlap (1-123:1-118)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
::::::::::::::::.: ::: : . :: : : :: .:. . : ::: : . :..: :
CCDS12 MSLMVVSMACVGFFLLEGPWPHVGGQDKPFLSAWPGTVVSEGQHVTLQCRSRLGFNEFSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
.: : . . : .. . . .: .::. :::::: .: ::: ::::.:. :
CCDS12 SKE----DGMP-VPELYNRIFRNSFLMGPVTPAHAGTYRCCSSHPHSPTGWSAPSNPVVI
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVNGT
..:
CCDS12 MVTGVHRKPSLLAHPGPLVKSGETVILQCWSDVRFERFLLHREGITEDPLRLVGQLHDAG
120 130 140 150 160 170
>>CCDS42619.1 KIR2DL4 gene_id:3805|Hs108|chr19 (342 aa)
initn: 890 init1: 797 opt: 916 Z-score: 982.3 bits: 190.0 E(32554): 2.1e-48
Smith-Waterman score: 1001; 54.9% identity (68.4% similar) in 304 aa overlap (1-304:3-266)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHF
:: :. .::.:::: :..: : : . :: : :. .: . : :.: :. :
CCDS42 MSMSPTVIILACLGFFLDQSVWAHVGGQDKPFCSAWPSAVVPQGGHVTLRCHYRRGFNIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LLHREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPL
:.. :: . . : .. . .: :.:. :::::: : ::: . ::::.::
CCDS42 TLYK----KDGVP-VPELYNRIFWNSFLISPVTPAHAGTYRCRGFHPHSPTEWSAPSNPL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 DIVITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRFSAGPKVN
:..:::::::::.:.::::: :::.:::::::.::.:.::::::::::: :. : :..:
CCDS42 VIMVTGLYEKPSLTARPGPTVRAGENVTLSCSSQSSFDIYHLSREGEAHELRLPAVPSIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GTFQADFPLGPATHGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSSKT
::::::::::::::: ::::::::. ::::::. :::: ::::::::.::::::::: ::
CCDS42 GTFQADFPLGPATHGETYRCFGSFHGSPYEWSDPSDPLPVSVTGNPSSSWPSPTEPSFKT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 GNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQDH
.::::.:::::.:::: :::::::
CCDS42 -----------------------------------DAAVMNQEPAGHRTVNREDSDEQDP
240 250 260
300
pF1KB6 QEVSYA
:::.::
CCDS42 QEVTYAQLDHCIFTQRKITGPSQRSKRPSTDTSVCIELPNAEPRALSPAHEHHSQALMGS
270 280 290 300 310 320
>>CCDS33105.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (631 aa)
initn: 999 init1: 402 opt: 683 Z-score: 730.3 bits: 144.3 E(32554): 2.4e-34
Smith-Waterman score: 687; 43.1% identity (69.4% similar) in 281 aa overlap (24-292:220-495)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
:: ::::::. ::.. ... ::: :::
CCDS33 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLS
...:.:..::. .: :. :.. . :.:.:::..::. .. .: :::::. . : . :
CCDS33 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
250 260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 APSDPLDIVITG-LYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRF
::::::::.::: .:. :::::::::: .::..:: :.::. .: . :..:: ::
CCDS33 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLR
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220
pF1KB6 SAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWP
. .::.::..:.: :.:::::.:: ..:. : :.:: . :.:. ..:
CCDS33 LRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSL
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SPTEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLL--------HRWCSNKKNAAVMDQE
:: : : : :.:.::::.::. . . .::.::: :: ...:. :.
CCDS33 PPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDF---QR
430 440 450 460 470 480
290 300
pF1KB6 PAGNRTVNSEDSDEQDHQEVSYA
::: .. .:
CCDS33 PAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQSPHDEDPQAVTYA
490 500 510 520 530 540
>--
initn: 312 init1: 197 opt: 440 Z-score: 471.5 bits: 96.4 E(32554): 6.1e-20
Smith-Waterman score: 440; 34.7% identity (63.5% similar) in 222 aa overlap (1-218:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
:. .... :.:. : . . : ::.: :.:: ... : . : .... ... :
CCDS33 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
.::. . . .. . .:: ::: : : :: :::. .: : :::::..
CCDS33 DKEGSPEPWDR--NNPLEPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCH---YYSSAGWSEPSDPLEL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRFSAGPKVN
:.::.:.::.::: :.:.: .: ..:: :.:...: . : .::: :. : ... .
CCDS33 VMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDSQQLHS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSS
: ::: ::.::.: : . :. . ..:. ::. :::: .
CCDS33 GGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQ
CCDS33 LAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY
240 250 260 270 280 290
>>CCDS46175.1 LILRB3 gene_id:11025|Hs108|chr19 (632 aa)
initn: 999 init1: 402 opt: 683 Z-score: 730.2 bits: 144.3 E(32554): 2.4e-34
Smith-Waterman score: 687; 43.1% identity (69.4% similar) in 281 aa overlap (24-292:220-495)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDV
:: ::::::. ::.. ... ::: :::
CCDS46 HRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPVLAPGQSLTLQCGSDV
190 200 210 220 230 240
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RFEHFLLHREGKYKDTLHLIGEH-HDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLS
...:.:..::. .: :. :.. . :.:.:::..::. .. .: :::::. . : . :
CCDS46 GYDRFVLYKEGE-RDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQYRCYGAHNLSS-EWS
250 260 270 280 290 300
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 APSDPLDIVITG-LYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHERRF
::::::::.::: .:. :::::::::: .::..:: :.::. .: . :..:: ::
CCDS46 APSDPLDILITGQIYDTVSLSAQPGPTVASGENMTLLCQSRGYFDTFLLTKEGAAHPPLR
310 320 330 340 350 360
180 190 200 210 220
pF1KB6 SAGPKVNGTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWP
. .::.::..:.: :.:::::.:: ..:. : :.:: . :.:. ..:
CCDS46 LRSMYGAHKYQAEFPMSPVTSAHAGTYRCYGSRSSNPHLLSFPSEPLELMVSGHSGGSSL
370 380 390 400 410 420
230 240 250 260 270 280
pF1KB6 SPTEPSSKTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLL--------HRWCSNKKNAAVMDQE
:: : : : :.:.::::.::. . . .::.::: :: ...:. :.
CCDS46 PPTGPPSTPGLGRYLEVLIGVSVAFVLLLFLLLFLLLLRQRHSKHRTSDQRKTDF---QR
430 440 450 460 470 480
290 300
pF1KB6 PAGNRTVNSEDSDEQDHQEVSYA
::: .. .:
CCDS46 PAGAAETEPKDRGLLRRSSPAADVQEENLYAAVKDTQSEDRVELDSQQSPHDEDPQAVTY
490 500 510 520 530 540
>--
initn: 312 init1: 197 opt: 440 Z-score: 471.5 bits: 96.4 E(32554): 6.1e-20
Smith-Waterman score: 440; 34.7% identity (63.5% similar) in 222 aa overlap (1-218:1-216)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MSLMVVSMACVGFFLLQGAWPHEGVHRKPSLLAHPGPLVKSEETVILQCWSDVRFEHFLL
:. .... :.:. : . . : ::.: :.:: ... : . : .... ... :
CCDS46 MTPALTALLCLGLSLGPRTRMQAGPFPKPTLWAEPGSVISWGSPVTIWCQGSLEAQEYQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 HREGKYKDTLHLIGEHHDGVSKANFSIGPMMQDLAGTYRCYGSVTHSPYQLSAPSDPLDI
.::. . . .. . .:: ::: : : :: :::. .: : :::::..
CCDS46 DKEGSPEPWDR--NNPLEPKNKARFSIPSMTQHHAGRYRCH---YYSSAGWSEPSDPLEL
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB6 VITGLYEKPSLSAQPGPTVLAGESVTLSCSSRSSYDMYHLSREGEAHE--RRFSAGPKVN
:.::.:.::.::: :.:.: .: ..:: :.:...: . : .::: :. : ... .
CCDS46 VMTGFYNKPTLSALPSPVVASGGNMTLRCGSQKGYHHFVLMKEGE-HQLPRTLDSQQLHS
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB6 GTFQADFPLGPAT--HGGTYRCFGSFRDSPYEWSNSSDPLLVSVTGNPSNSWPSPTEPSS
: ::: ::.::.: : . :. . ..:. ::. :::: .
CCDS46 GGFQALFPVGPVTPSHRWRFTCYYYYTNTPWVWSHPSDPLEILPSGVSRKPSLLTLQGPV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB6 KTGNPRHLHVLIGTSVVKIPFTILLFFLLHRWCSNKKNAAVMDQEPAGNRTVNSEDSDEQ
CCDS46 LAPGQSLTLQCGSDVGYDRFVLYKEGERDFLQRPGQQPQAGLSQANFTLGPVSRSYGGQY
240 250 260 270 280 290
304 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 01:59:07 2016 done: Sat Nov 5 01:59:07 2016
Total Scan time: 2.700 Total Display time: 0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]