Result of FASTA (ccds) for
pF1KB6909
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB6909, 205 aa
1>>>pF1KB6909 205 - 205 aa - 205 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8549+/-0.00061; mu= 12.4808+/- 0.037
mean_var=88.1342+/-17.702, 0's: 0 Z-trim(113.7): 17 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.136616
statistics sampled from 14291 (14308) to 14291 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.794), E-opt: 0.2 (0.44), width: 16
Scan time: 2.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5583.1 HSPB1 gene_id:3315|Hs108|chr7 ( 205) 1405 285.7 1.4e-77
CCDS9189.1 HSPB8 gene_id:26353|Hs108|chr12 ( 196) 395 86.6 1.1e-17
CCDS8351.1 CRYAB gene_id:1410|Hs108|chr11 ( 175) 384 84.4 4.5e-17
CCDS82651.1 LOC102724652 gene_id:102724652|Hs108|c ( 173) 360 79.7 1.2e-15
CCDS13695.1 CRYAA gene_id:1409|Hs108|chr21 ( 173) 360 79.7 1.2e-15
CCDS81626.1 CRYAB gene_id:1410|Hs108|chr11 ( 108) 345 76.6 6.3e-15
CCDS12475.1 HSPB6 gene_id:126393|Hs108|chr19 ( 160) 320 71.8 2.6e-13
CCDS82652.1 LOC102724652 gene_id:102724652|Hs108|c ( 136) 313 70.3 6e-13
CCDS8352.1 HSPB2 gene_id:3316|Hs108|chr11 ( 182) 309 69.6 1.3e-12
>>CCDS5583.1 HSPB1 gene_id:3315|Hs108|chr7 (205 aa)
initn: 1405 init1: 1405 opt: 1405 Z-score: 1506.5 bits: 285.7 E(32554): 1.4e-77
Smith-Waterman score: 1405; 100.0% identity (100.0% similar) in 205 aa overlap (1-205:1-205)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVEI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQSNEIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQSNEIT
130 140 150 160 170 180
190 200
pF1KB6 IPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
:::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
190 200
>>CCDS9189.1 HSPB8 gene_id:26353|Hs108|chr12 (196 aa)
initn: 441 init1: 303 opt: 395 Z-score: 430.9 bits: 86.6 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 405; 39.6% identity (62.0% similar) in 187 aa overlap (1-174:1-176)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSW---DPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEE----WSQWLG---GSS
:.. ..::: . :: ::::: :::.:..::. .:.. : .: .:.
CCDS91 MADGQMPFSC-HYPSRLRRDPFRDSPLSSRLLDDGFGMDPFPDDLTASWPDWALPRLSSA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB6 WPGYVRP--LPPAAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDE
::: .: .: . . ..:: .: . .. :.: ..:. : :.:
CCDS91 WPGTLRSGMVPRGPTATARFGVPAEGR----------TPPPFPGEPWKVCVNVHSFKPEE
60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB6 LTVKTKDGVVEITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAP
: :::::: ::..:::::.:.: : .:. ::.: :: :::. : .:::::: : .:::
CCDS91 LMVKTKDGYVEVSGKHEEKQQEGGIVSKNFTKKIQLPAEVDPVTVFASLSPEGLLIIEAP
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200
pF1KB6 -MPKLATQSNEITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
.: .:
CCDS91 QVPPYSTFGESSFNNELPQDSQEVTCT
170 180 190
>>CCDS8351.1 CRYAB gene_id:1410|Hs108|chr11 (175 aa)
initn: 420 init1: 349 opt: 384 Z-score: 419.9 bits: 84.4 E(32554): 4.5e-17
Smith-Waterman score: 417; 44.4% identity (64.3% similar) in 171 aa overlap (18-188:13-166)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
:: .. :::::: :: : . . : : :.::
CCDS83 MDIAIHHPWIRRPFFPFHSPSRLFDQFFGEHLLESDLFP-TSTSLSPFYLRP---
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB6 AAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVEI
:.. :: : ...:.::.: ::. :.:::.::.:.:: ::. :.:.
CCDS83 ----------PSFLRAPS-WFDTGLSEMRLEKDRFSVNLDVKHFSPEELKVKVLGDVIEV
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB6 TGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQSNEIT
:::::::::::.::: : ::: .: ::: ..:::: .:.:::..: ... . : :
CCDS83 HGKHEERQDEHGFISREFHRKYRIPADVDPLTITSSLSSDGVLTVNGPRKQVS--GPERT
110 120 130 140 150
190 200
pF1KB6 IPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
::.: : .
CCDS83 IPITREEKPAVTAAPKK
160 170
>>CCDS82651.1 LOC102724652 gene_id:102724652|Hs108|chr21 (173 aa)
initn: 382 init1: 327 opt: 360 Z-score: 394.4 bits: 79.7 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 364; 41.4% identity (60.9% similar) in 174 aa overlap (18-188:16-166)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
:: :: :::::: :: . . .:...
CCDS82 MDVTIQHPWFKRTLGPF---YP-SRLFDQFFGEGLFEYDLLPFLSST-----------
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 AAIESPAVAAPAYSRALSRQ-LSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVE
.: : ..: : :.::.::.: :.. . :::.::.:..::::..: ::
CCDS82 --------ISPYYRQSLFRTVLDSGISEVRSDRDKFVIFLDVKHFSPEDLTVKVQDDFVE
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPK--LATQSN
: :::.::::.:::::: : :.: :: .:: . .: ::: .: :: .: . : .
CCDS82 IHGKHNERQDDHGYISREFHRRYRLPSNVDQSALSCSLSADGMLTFCGPKIQTGLDATHA
100 110 120 130 140 150
180 190 200
pF1KB6 EITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
: .:::. : .
CCDS82 ERAIPVSREEKPTSAPSS
160 170
>>CCDS13695.1 CRYAA gene_id:1409|Hs108|chr21 (173 aa)
initn: 382 init1: 327 opt: 360 Z-score: 394.4 bits: 79.7 E(32554): 1.2e-15
Smith-Waterman score: 364; 41.4% identity (60.9% similar) in 174 aa overlap (18-188:16-166)
10 20 30 40 50 60
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYVRPLPP
:: :: :::::: :: . . .:...
CCDS13 MDVTIQHPWFKRTLGPF---YP-SRLFDQFFGEGLFEYDLLPFLSST-----------
10 20 30 40
70 80 90 100 110
pF1KB6 AAIESPAVAAPAYSRALSRQ-LSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVE
.: : ..: : :.::.::.: :.. . :::.::.:..::::..: ::
CCDS13 --------ISPYYRQSLFRTVLDSGISEVRSDRDKFVIFLDVKHFSPEDLTVKVQDDFVE
50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPK--LATQSN
: :::.::::.:::::: : :.: :: .:: . .: ::: .: :: .: . : .
CCDS13 IHGKHNERQDDHGYISREFHRRYRLPSNVDQSALSCSLSADGMLTFCGPKIQTGLDATHA
100 110 120 130 140 150
180 190 200
pF1KB6 EITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
: .:::. : .
CCDS13 ERAIPVSREEKPTSAPSS
160 170
>>CCDS81626.1 CRYAB gene_id:1410|Hs108|chr11 (108 aa)
initn: 341 init1: 321 opt: 345 Z-score: 381.4 bits: 76.6 E(32554): 6.3e-15
Smith-Waterman score: 345; 52.5% identity (75.2% similar) in 101 aa overlap (88-188:1-99)
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 LPPAAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGV
.: ::. :.:::.::.:.:: ::. :
CCDS81 MRLEKDRFSVNLDVKHFSPEELKVKVLGDV
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VEITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQSN
.:. :::::::::::.::: : ::: .: ::: ..:::: .:.:::..: ... .
CCDS81 IEVHGKHEERQDEHGFISREFHRKYRIPADVDPLTITSSLSSDGVLTVNGPRKQVS--GP
40 50 60 70 80
180 190 200
pF1KB6 EITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
: :::.: : .
CCDS81 ERTIPITREEKPAVTAAPKK
90 100
>>CCDS12475.1 HSPB6 gene_id:126393|Hs108|chr19 (160 aa)
initn: 367 init1: 289 opt: 320 Z-score: 352.3 bits: 71.8 E(32554): 2.6e-13
Smith-Waterman score: 330; 38.4% identity (58.5% similar) in 159 aa overlap (14-167:9-146)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSW-----DPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGYV
::: :. .::::: :: : : . . : :.
CCDS12 MEIPVPVQPSWLRRASAPLPGLSAPGRLFDQRFGEGLLEAELAALCPTTLAPYYL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 RPLPPAAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKD
: .:.:: : :... .. : :::.::.:.:..::.
CCDS12 R--------APSVALP-------------VAQVPTDPGHFSVLLDVKHFSPEEIAVKVVG
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 GVVEITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPKLATQ
::. ..:::: ::::...: : :.: :::::::. :.:.:::::.:...:
CCDS12 EHVEVHARHEERPDEHGFVAREFHRRYRLPPGVDPAAVTSALSPEGVLSIQAAPASAQAP
100 110 120 130 140 150
180 190 200
pF1KB6 SNEITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
CCDS12 PPAAAK
160
>>CCDS82652.1 LOC102724652 gene_id:102724652|Hs108|chr21 (136 aa)
initn: 312 init1: 282 opt: 313 Z-score: 345.9 bits: 70.3 E(32554): 6e-13
Smith-Waterman score: 313; 48.1% identity (71.2% similar) in 104 aa overlap (87-188:26-129)
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PLPPAAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDG
..: :.. . :::.::.:..::::..:
CCDS82 MPVCPGDSHRPPKALPHLVCGRRGRQVRSDRDKFVIFLDVKHFSPEDLTVKVQDD
10 20 30 40 50
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 VVEITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMPK--LAT
::: :::.::::.:::::: : :.: :: .:: . .: ::: .: :: .: . : .
CCDS82 FVEIHGKHNERQDDHGYISREFHRRYRLPSNVDQSALSCSLSADGMLTFCGPKIQTGLDA
60 70 80 90 100 110
180 190 200
pF1KB6 QSNEITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
: .:::. : .
CCDS82 THAERAIPVSREEKPTSAPSS
120 130
>>CCDS8352.1 HSPB2 gene_id:3316|Hs108|chr11 (182 aa)
initn: 351 init1: 294 opt: 309 Z-score: 339.8 bits: 69.6 E(32554): 1.3e-12
Smith-Waterman score: 341; 37.2% identity (58.9% similar) in 207 aa overlap (1-204:1-178)
10 20 30 40 50
pF1KB6 MTERRVPFSLLRGPSWDPFRDWYPHSRLFDQAFGLPRLPEEWSQWLGGSSWPGY-VRPLP
:. : :: . :. .. : ::: .: :: :::: : . . :: :::
CCDS83 MSGRSVPHA---HPATAEYEFANP-SRLGEQRFGEGLLPEE---ILTPTLYHGYYVRPRA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB6 PAAIESPAVAAPAYSRALSRQLSSGVSEIRHTADRWRVSLDVNHFAPDELTVKTKDGVVE
: :. ::: :.::.: . .... :::.::.:::.::.: :...:
CCDS83 APAGEG--------SRA-------GASELRLSEGKFQAFLDVSHFTPDEVTVRTVDNLLE
60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB6 ITGKHEERQDEHGYISRCFTRKYTLPPGVDPTQVSSSLSPEGTLTVEAPMP--KLATQSN
....: .: :.::..:: : : :.:: ::: .: ..:: .: :..::: .: :. :
CCDS83 VSARHPQRLDRHGFVSREFCRTYVLPADVDPWRVRAALSHDGILNLEAPRGGRHLDTEVN
100 110 120 130 140 150
180 190 200
pF1KB6 EITIPVTFESRAQLGGPEAAKSDETAAK
:. : . : .: . .: ::
CCDS83 EVYISL-------LPAPPDPEEEEEAAIVEP
160 170 180
205 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 13:02:13 2016 done: Fri Nov 4 13:02:14 2016
Total Scan time: 2.400 Total Display time: -0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]