FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7006, 1066 aa
1>>>pF1KB7006 1066 - 1066 aa - 1066 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1991+/-0.00114; mu= 0.9257+/- 0.070
mean_var=255.2208+/-52.144, 0's: 0 Z-trim(111.2): 16 B-trim: 396 in 2/53
Lambda= 0.080282
statistics sampled from 12139 (12154) to 12139 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 5.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7340.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1066) 6820 803.9 0
CCDS7341.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1134) 5878 694.8 2.7e-199
CCDS42703.2 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 905) 638 87.9 1.1e-16
CCDS7269.1 CTNNA3 gene_id:29119|Hs108|chr10 ( 895) 621 85.9 4.3e-16
CCDS62945.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 584) 610 84.5 7.3e-16
CCDS74531.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 537) 602 83.6 1.3e-15
CCDS62944.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 953) 601 83.6 2.2e-15
CCDS75315.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 ( 536) 580 81.0 7.6e-15
CCDS54371.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 860) 540 76.5 2.8e-13
>>CCDS7340.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1066 aa)
initn: 6820 init1: 6820 opt: 6820 Z-score: 4281.6 bits: 803.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6820; 100.0% identity (100.0% similar) in 1066 aa overlap (1-1066:1-1066)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQSDPYSVPARDYLIDGSRGILSGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQSDPYSVPARDYLIDGSRGILSGTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 INEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPSASPGDAGEQAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 INEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPSASPGDAGEQAIR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDSPEARALAKQVATALQNLQTKTNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDSPEARALAKQVATALQNLQTKTNRA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VANSRPAKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VANSRPAKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 LLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 DTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 IQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 SLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 EAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 DFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMM
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 AARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAKDIAKASDE
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 VTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQAT
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KB7 EMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ
1030 1040 1050 1060
>>CCDS7341.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1134 aa)
initn: 5877 init1: 5877 opt: 5878 Z-score: 3691.6 bits: 694.8 E(32554): 2.7e-199
Smith-Waterman score: 6437; 93.8% identity (93.8% similar) in 1098 aa overlap (1-1030:1-1098)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MPVFHTRTIESILEPVAQQISHLVIMHEEGEVDGKAIPDLTAPVAAVQAAVSNLVRVGKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQSDPYSVPARDYLIDGSRGILSGTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TVQTTEDQILKRDMPPAFIKVENACTKLVQAAQMLQSDPYSVPARDYLIDGSRGILSGTS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DLLLTFDEAEVRKIIRVCKGILEYLTVAEVVETMEDLVTYTKNLGPGMTKMAKMIDERQQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ELTHQEHRVMLVNSMNTVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 INEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPSASPGDAGEQAIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 INEIIRVLQLTSWDEDAWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPSASPGDAGEQAIR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 DVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DVLTAKVENAARKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 LCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDSPEARALAKQVATALQNLQTKTNRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LCDDPKERDDILRSLGEISALTSKLADLRRQGKGDSPEARALAKQVATALQNLQTKTNRA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 VANSRPAKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VANSRPAKAAVHLEGKIEQAQRWIDNPTVDDRGVGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 LLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 DTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 IQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 IQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 SLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 EAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 EAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREAFQPQEP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 DFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMM
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB7 AARQLHDEARKWSSK---------------------------------------------
:::::::::::::::
CCDS73 AARQLHDEARKWSSKPGIPAAEVGIGVVAEADAADAAGFPVPPDMEDDYEPELLLMPSNQ
910 920 930 940 950 960
920 930 940 950
pF1KB7 -----------------------GNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PVNQPILAAAQSLHREATKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRALIQCAK
970 980 990 1000 1010 1020
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 DIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNIS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB7 DEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ
::::::::::::::::::
CCDS73 DEESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ
1090 1100 1110 1120 1130
>>CCDS42703.2 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (905 aa)
initn: 706 init1: 231 opt: 638 Z-score: 413.0 bits: 87.9 E(32554): 1.1e-16
Smith-Waterman score: 713; 26.3% identity (55.9% similar) in 798 aa overlap (330-1063:88-863)
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 RQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQ----GSSPVAMQKAQQ
... : :.: .:. .:: : . ..
CCDS42 HVLAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSS
60 70 80 90 100 110
360 370 380 390 400
pF1KB7 VSQGLDVLTAK-VENAARKLEAMTN--------SKQSIAKK-IDAAQNWLADPNGGPE--
:..: : .:. . .:. .: ... :. .:... ..:..: . . . .
CCDS42 VKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFK
120 130 140 150 160 170
410 420 430 440 450
pF1KB7 --GEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISA-----LTSKLADLRRQGKGDS
:.:... . ::. :: ::. ::.. . : .. :.. : ::. . .
CCDS42 EFGKEMVKLNYVAARRQQEL-KDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAAT
180 190 200 210 220 230
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 PEARALA-KQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLE-GKIEQAQRWIDNPTV-DDRG
: . ::: :. .. .: : :.: .: : :.. : .:: . :
CCDS42 RANRDYVFKQVQEAIAGI---SNAAQATSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMT
240 250 260 270 280 290
520 530 540 550
pF1KB7 VGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGP------------YRQDLLAKCDRVDQ----LTAQLAD
..: .: . : :: ... : :. ..:.:. : : : .. .
CCDS42 FSEARFRPSLEE--RLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMN
300 310 320 330 340 350
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 LAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPP
..: : .: :. ... . .::. ....:. ...:: : .:..:. .: :: .
CCDS42 NTGRKEKGDPLNIAI-DKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSG-
360 370 380 390 400
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 DAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVS
:..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. .. : :::..
CCDS42 ---NEKEV-KEYAQVFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVIN
410 420 430 440 450 460
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 AARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKC
:: : : ...: ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : .:..::
CCDS42 AALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKC
470 480 490 500 510 520
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 KVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPM
.:. . . . : : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. ::.:. :
CCDS42 VIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPR
530 540 550 560 570 580
800 810 820 830 840 850
pF1KB7 VMDA-----KAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPPPPPDLEQ
. .:...:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. :.::
CCDS42 FAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQ
590 600 610 620 630 640
860 870 880 890 900
pF1KB7 ----LRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLH
.: . : :. :.:. .. :: :...: .:
CCDS42 EDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQE----KSKLD
650 660 670 680 690
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 DEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKASDEVTRL
:. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.... .:
CCDS42 AEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKL
700 710 720 730 740 750
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 AKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKA---TMLGRTNISDEESEQATE
:. :: :: :. . .:: .:: ::.: : ::: .. :. .: .: .
CCDS42 ARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDSATS--
760 770 780 790 800 810
1030 1040 1050 1060
pF1KB7 MLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFT------LRWVRKTPWYQ
:.. :.:::..: ::. . .:: : . : . . : :.:
CCDS42 -LIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPE
820 830 840 850 860 870
CCDS42 EFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
880 890 900
>>CCDS7269.1 CTNNA3 gene_id:29119|Hs108|chr10 (895 aa)
initn: 621 init1: 200 opt: 621 Z-score: 402.4 bits: 85.9 E(32554): 4.3e-16
Smith-Waterman score: 624; 25.7% identity (54.6% similar) in 877 aa overlap (227-1063:16-853)
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 TVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDED
:. ..:::::. . ::.: :.. ..
CCDS72 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPL--IIQVTTLVNCPQN
10 20 30 40
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 AWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPS---ASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELC
. : .. ::: . . : ...: : : . :. . . .. . :.:. : .:
CCDS72 PSSRKKGRS-KRASVLLAS-VEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEAL
50 60 70 80 90 100
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 AGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGLDV--LTAKVENAA
. .: : .: . : :: .:. . ... .:: : .:
CCDS72 KVSAERFTDDPC-FLPKREAVVQAARALL-----AAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQ
110 120 130 140 150
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 RKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDI
: .:.. : .:.: : ... . : : :. :: :. .: .:..::.:
CCDS72 RTFESLKN----VANKSDLQKTY---QKLGKELENL--DYLAFKRQ-QDL-KSPNQRDEI
160 170 180 190 200
440 450 460 470 480
pF1KB7 L---RSLGEISALTSKLADLRRQGKGDSPEARALAKQVATALQN-LQTKTN--RAVAN--
:: : : : .. . . ..: .: : .:: :.. .: ... :
CCDS72 AGARASLKENSPLLHSICSACLE-HSDVASLKASKDTVCEEIQNALNVISNASQGIQNMT
210 220 230 240 250 260
490 500 510 520 530
pF1KB7 SRPAKAAVHLEGKIEQAQRWID-NP-TVDD---RGVGQAAIRGLVAEGHRLAN--VMMGP
. : :. : . ... . : :: :: . : . ...... . ::.
CCDS72 TPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDL
270 280 290 300 310 320
540 550 560 570 580 590
pF1KB7 YRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLK---DLKARMQEAMTQ
.:. ..:.:. . : .: . . :.. .. .: :.. : ::. ....:. .
CCDS72 HRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIID
330 340 350 360 370 380
600 610 620 630 640 650
pF1KB7 EVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTA
.::: : :::.:. .: :: .::. . : :: :..:...: .:. : ...:
CCDS72 HVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKN-----GREKEIKEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMST-
390 400 410 420 430
660 670 680 690 700 710
pF1KB7 NKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLV
:.. .. .. ... . : ::...:: : : .::. . .: .: : .... .: :
CCDS72 NEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAV
440 450 460 470 480 490
720 730 740 750 760 770
pF1KB7 DEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVEN
:. . ..: .:: : .:..:: .:. . . . : .: .: :: :. .. :...
CCDS72 DDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDS
500 510 520 530 540 550
780 790 800 810 820
pF1KB7 SEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGN-ISDPGLQ----KSFLDSGYRILGAV
: . :.: . :..:. : . :: . .: .:. ..:.: . .: ..
CCDS72 YEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTI
560 570 580 590 600 610
830 840 850 860 870 880
pF1KB7 AKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPP-PEEKDEEFPE
.: . . . : :. .:. :. ::.. . :: . :.. :
CCDS72 HDIRCSVMMIRT--PEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAE
620 630 640 650 660 670
890 900 910 920 930 940
pF1KB7 QKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA-
: : . . .: : . :.. .::::. :: : ..: ::. ..:: . :..
CCDS72 QVAD------FKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTRGKGPLKHTT
680 690 700 710 720
950 960 970 980 990 1000
pF1KB7 -LIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATM
.: :: :....... ::...:.:: : . .:: :.: : :::: : ::: .
CCDS72 DVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLKICSQVKAEI
730 740 750 760 770 780
1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB7 LGRTNISDEESEQATEM---LVHNAQNLMQSVKETVREAEAAS---IKIRTDAGF---TL
:.. : .: . :.. :.:::..: .::. . :: :.:.. :: ..
CCDS72 ---QNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAGPRHPVV
790 800 810 820 830 840
1060
pF1KB7 RWVRKTPWYQ
: :.:
CCDS72 MWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY
850 860 870 880 890
>>CCDS62945.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (584 aa)
initn: 516 init1: 231 opt: 610 Z-score: 398.3 bits: 84.5 E(32554): 7.3e-16
Smith-Waterman score: 632; 27.9% identity (58.8% similar) in 544 aa overlap (545-1063:15-542)
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 GQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALA-
:.. .. :... ... :.. .. :
CCDS62 MDGWRRPLQSVGKVCEK-NMKTSEMHTMSGAQTGRKEKGDPLNI
10 20 30 40
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 --SQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAA
... . .::. ....:. ...:: : .:..:. .: :: . :..:: : :
CCDS62 AIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSG----NEKEV-KEYAQ
50 60 70 80 90
640 650 660 670 680 690
pF1KB7 NFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAA
:..:..:: .:. : .. . :. :. .. .. : :::..:: : : ...:
CCDS62 VFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVA
100 110 120 130 140 150
700 710 720 730 740 750
pF1KB7 YEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVA
......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : .:..:: .:. . . . :
CCDS62 QDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLDR
160 170 180 190 200 210
760 770 780 790 800
pF1KB7 GATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDA-----KAVAG
: .: :: :.. . . :.:: : . : : :. ::.:. : . .:...
CCDS62 TAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALSA
220 230 240 250 260 270
810 820 830 840 850 860
pF1KB7 NISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPPPPPDLEQ----LRLTDELAPP
:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. :.:: .: .
CCDS62 NVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQTE
280 290 300 310 320 330
870 880 890 900 910 920
pF1KB7 KPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDII
: :. :.:. .. :: :...: .: :. ::...:::::
CCDS62 DDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQ----EKSKLDAEVAKWDDSGNDII
340 350 360 370 380 390
930 940 950 960 970
pF1KB7 AAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIR
. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.... .::. :: :: :. .
CCDS62 VLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACK
400 410 420 430 440 450
980 990 1000 1010 1020 1030
pF1KB7 TNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKA---TMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVK
.:: .:: ::.: : ::: .. :. .: .: :: :.. :.:::..:
CCDS62 QDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDS--ATS-LIQAAKNLMNAVV
460 470 480 490 500
1040 1050 1060
pF1KB7 ETVREAEAASIKIRTDAGFT------LRWVRKTPWYQ
::. . .:: : . : . . : :.:
CCDS62 LTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKH
510 520 530 540 550 560
CCDS62 ISPVQALSEFKAMDSF
570 580
>>CCDS74531.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (537 aa)
initn: 512 init1: 231 opt: 602 Z-score: 393.8 bits: 83.6 E(32554): 1.3e-15
Smith-Waterman score: 624; 28.9% identity (58.8% similar) in 505 aa overlap (581-1063:6-495)
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 LTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLA
.::. ....:. ...:: : .:..:. .:
CCDS74 MTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLI
10 20 30
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 VAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARE
:: . :..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. ..
CCDS74 EAA----KSGNEKEV-KEYAQVFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDS
40 50 60 70 80
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 LTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAI
: :::..:: : : ...: ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. :
CCDS74 LCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHI
90 100 110 120 130 140
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 KKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDEL
.:..:: .:. . . . : : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. :
CCDS74 LEDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLL
150 160 170 180 190 200
800 810 820 830 840
pF1KB7 SKTISPMVMDA-----KAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPP
:.:. : . .:...:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :.
CCDS74 SETVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELE
210 220 230 240 250 260
850 860 870 880 890
pF1KB7 PPPDLEQ----LRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMM
:.:: .: . : :. :.:. .. :: :...:
CCDS74 DDSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQE--
270 280 290 300 310 320
900 910 920 930 940 950
pF1KB7 MAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKA
.: :. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:
CCDS74 --KSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEA
330 340 350 360 370 380
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 SDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKA---TMLGRTNISDE
.... .::. :: :: :. . .:: .:: ::.: : ::: .. :. .:
CCDS74 GSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGL
390 400 410 420 430 440
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB7 ESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFT------LRWVRKTPWYQ
.: . :.. :.:::..: ::. . .:: : . : . . : :.:
CCDS74 DSATS---LIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPL
450 460 470 480 490 500
CCDS74 VKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
510 520 530
>>CCDS62944.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (953 aa)
initn: 728 init1: 231 opt: 601 Z-score: 389.5 bits: 83.6 E(32554): 2.2e-15
Smith-Waterman score: 667; 26.3% identity (56.2% similar) in 729 aa overlap (330-1003:88-797)
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 RQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQ----GSSPVAMQKAQQ
... : :.: .:. .:: : . ..
CCDS62 HVLAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSS
60 70 80 90 100 110
360 370 380 390 400
pF1KB7 VSQGLDVLTAK-VENAARKLEAMTN--------SKQSIAKK-IDAAQNWLADPNGGPE--
:..: : .:. . .:. .: ... :. .:... ..:..: . . . .
CCDS62 VKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFK
120 130 140 150 160 170
410 420 430 440 450
pF1KB7 --GEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISA-----LTSKLADLRRQGKGDS
:.:... . ::. :: ::. ::.. . : .. :.. : ::. . .
CCDS62 EFGKEMVKLNYVAARRQQEL-KDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAAT
180 190 200 210 220 230
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 PEARALA-KQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLE-GKIEQAQRWIDNPTV-DDRG
: . ::: :. .. .: : :.: .: : :.. : .:: . :
CCDS62 RANRDYVFKQVQEAIAGI---SNAAQATSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMT
240 250 260 270 280 290
520 530 540 550
pF1KB7 VGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGP------------YRQDLLAKCDRVDQ----LTAQLAD
..: .: . : :: ... : :. ..:.:. : : : .. .
CCDS62 FSEARFRPSLEE--RLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMN
300 310 320 330 340 350
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 LAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPP
..: : .: :. ... . .::. ....:. ...:: : .:..:. .: ::
CCDS62 NTGRKEKGDPLNIAI-DKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAA----
360 370 380 390 400
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 DAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVS
. :..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. .. : :::..
CCDS62 KSGNEKEV-KEYAQVFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVIN
410 420 430 440 450 460
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 AARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKC
:: : : ...: ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : .:..::
CCDS62 AALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKC
470 480 490 500 510 520
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 KVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPM
.:. . . . : : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. ::.:. :
CCDS62 VIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPR
530 540 550 560 570 580
800 810 820 830 840 850
pF1KB7 VMDA-----KAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPPPPPDLEQ
. .:...:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. :.::
CCDS62 FAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQ
590 600 610 620 630 640
860 870 880 890 900
pF1KB7 ----LRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLH
.: . : :. :.:. .. :: :...: .:
CCDS62 EDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQE----KSKLD
650 660 670 680 690
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 DEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKASDEVTRL
:. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.... .:
CCDS62 AEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKL
700 710 720 730 740 750
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 AKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLV
:. :: :: :. . .:: .:: ::.: : :::
CCDS62 ARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGTGVQSTFT
760 770 780 790 800 810
1030 1040 1050 1060
pF1KB7 HNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ
CCDS62 TFYEVDCDVIDGGRASQLSTHLPTCAEGAPIGSGSSDSSMLDSATSLIQAAKNLMNAVVL
820 830 840 850 860 870
>>CCDS75315.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 (536 aa)
initn: 532 init1: 219 opt: 580 Z-score: 380.0 bits: 81.0 E(32554): 7.6e-15
Smith-Waterman score: 606; 28.8% identity (58.1% similar) in 504 aa overlap (581-1063:6-494)
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 LTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLA
.::. ....:. ..::: : .:..:. .:
CCDS75 MTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLI
10 20 30
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 VAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARE
:: :..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. :.. .
CCDS75 EAA----KNGNEKEV-KEYAQVFREHANKLIEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMSASQLEA
40 50 60 70 80
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 LTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAI
: :::..:: : .: .. : :... .:.:: .:. .: ::. . ..: .::. :
CCDS75 LCPQVINAALALAAKPQSKLAQENMDLFKEQWEKQVRVLTDAVDDITSIDDFLAVSENHI
90 100 110 120 130 140
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 KKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDEL
.:..:: .:. . . . : : .: :: :.. :. :..: : . : : :. :
CCDS75 LEDVNKCVIALQEKDVDGLDRTAGAIRGRAARVIHVVTSEMDNYEPGVYTEKVLEATKLL
150 160 170 180 190 200
800 810 820 830 840
pF1KB7 SKTISPMVMDA--KAVAGNISDPGL---QKSFLDSGYRILGAVAKVREAF----QPQEPD
:.:. : . :: . :::. .. :.:.. . .. .:.: :.: :
CCDS75 SNTVMPRFTEQVEAAVEALSSDPAQPMDENEFIDASRLVYDGIRDIRKAVLMIRTPEELD
210 220 230 240 250 260
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 FPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMM
. ..: . : :. :.:. .. :: :. ..
CCDS75 DSDFETEDFDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEQKAKIAEQVAS------FQE
270 280 290 300 310 320
910 920 930 940 950
pF1KB7 AARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKAS
.: :. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.
CCDS75 EKSKLDAEVSKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVISAAKKIAEAG
330 340 350 360 370 380
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB7 DEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKA---TMLGRTNISDEE
... .:.. .: .: :. . .:: .:: ::.: : ::: .. :. .: .
CCDS75 SRMDKLGRTIADHCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELVVSGVD
390 400 410 420 430 440
1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB7 SEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFT------LRWVRKTPWYQ
: .. :.. :.:::..: .::. . .:: : . . :.. . : :.:
CCDS75 SAMS---LIQAAKNLMNAVVQTVKASYVASTKYQKSQGMASLNLPAVSWKMKAPEKKPLV
450 460 470 480 490 500
CCDS75 KREKQDETQTKIKRASQKKHVNPVQALSEFKAMDSI
510 520 530
>>CCDS54371.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (860 aa)
initn: 634 init1: 231 opt: 540 Z-score: 352.0 bits: 76.5 E(32554): 2.8e-13
Smith-Waterman score: 606; 24.8% identity (55.5% similar) in 779 aa overlap (330-1053:88-839)
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 RQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQ----GSSPVAMQKAQQ
... : :.: .:. .:: : . ..
CCDS54 HVLAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSS
60 70 80 90 100 110
360 370 380 390 400
pF1KB7 VSQGLDVLTAK-VENAARKLEAMTN--------SKQSIAKK-IDAAQNWLADPNGGPE--
:..: : .:. . .:. .: ... :. .:... ..:..: . . . .
CCDS54 VKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFK
120 130 140 150 160 170
410 420 430 440 450
pF1KB7 --GEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISA-----LTSKLADLRRQGKGDS
:.:... . ::. :: ::. ::.. . : .. :.. : ::. . .
CCDS54 EFGKEMVKLNYVAARRQQEL-KDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAAT
180 190 200 210 220 230
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 PEARALA-KQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLE-GKIEQAQRWIDNPTV-DDRG
: . ::: :. .. .: : :.: .: : :.. : .:: . :
CCDS54 RANRDYVFKQVQEAIAGI---SNAAQATSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMT
240 250 260 270 280 290
520 530 540 550
pF1KB7 VGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGP------------YRQDLLAKCDRVDQ----LTAQLAD
..: .: . : :: ... : :. ..:.:. : : : .. .
CCDS54 FSEARFRPSLEE--RLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMN
300 310 320 330 340 350
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 LAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPP
..: : .: :. ... . .::. ....:. ...:: : .:..:. .: :: .
CCDS54 NTGRKEKGDPLNIAI-DKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSG-
360 370 380 390 400
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 DAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVS
:..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. .. : :::..
CCDS54 ---NEKEV-KEYAQVFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVIN
410 420 430 440 450 460
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 AARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKC
:: : : ...: ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : .:..::
CCDS54 AALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKC
470 480 490 500 510 520
740 750 760 770 780 790
pF1KB7 KVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPM
.:. . . . : : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. ::.:. :
CCDS54 VIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPR
530 540 550 560 570 580
800 810 820 830 840 850
pF1KB7 VMDA-----KAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPPPPPDLEQ
. .:...:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. :.::
CCDS54 FAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQ
590 600 610 620 630 640
860 870 880 890 900
pF1KB7 ----LRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLH
.: . : :. :.:. .. :: :...: .:
CCDS54 EDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQE----KSKLD
650 660 670 680 690
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 DEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKASDEVTRL
:. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.... .:
CCDS54 AEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKL
700 710 720 730 740 750
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB7 AKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLV
:. :: : . :.:.:. . . . .. ::::.... :. . . :.. :
CCDS54 ARAVADQLDSA---TSLIQAAKNLMN-----AVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPV
760 770 780 790 800 810
1030 1040 1050 1060
pF1KB7 HNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ
. . : :.. . .. :. :
CCDS54 VSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF
820 830 840 850 860
1066 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:49:19 2016 done: Thu Nov 3 22:49:20 2016
Total Scan time: 5.430 Total Display time: 0.330
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]