FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7006, 1066 aa 1>>>pF1KB7006 1066 - 1066 aa - 1066 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.1991+/-0.00114; mu= 0.9257+/- 0.070 mean_var=255.2208+/-52.144, 0's: 0 Z-trim(111.2): 16 B-trim: 396 in 2/53 Lambda= 0.080282 statistics sampled from 12139 (12154) to 12139 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16 Scan time: 5.430 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS7340.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1066) 6820 803.9 0 CCDS7341.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1134) 5878 694.8 2.7e-199 CCDS42703.2 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 905) 638 87.9 1.1e-16 CCDS7269.1 CTNNA3 gene_id:29119|Hs108|chr10 ( 895) 621 85.9 4.3e-16 CCDS62945.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 584) 610 84.5 7.3e-16 CCDS74531.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 537) 602 83.6 1.3e-15 CCDS62944.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 953) 601 83.6 2.2e-15 CCDS75315.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 ( 536) 580 81.0 7.6e-15 CCDS54371.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 ( 860) 540 76.5 2.8e-13 >>CCDS7340.1 VCL gene_id:7414|Hs108|chr10 (1066 aa) initn: 6820 init1: 6820 opt: 6820 Z-score: 4281.6 bits: 803.9 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 6820; 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CCDS42 HVLAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSS 60 70 80 90 100 110 360 370 380 390 400 pF1KB7 VSQGLDVLTAK-VENAARKLEAMTN--------SKQSIAKK-IDAAQNWLADPNGGPE-- :..: : .:. . .:. .: ... :. .:... ..:..: . . . . CCDS42 VKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFK 120 130 140 150 160 170 410 420 430 440 450 pF1KB7 --GEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISA-----LTSKLADLRRQGKGDS :.:... . ::. :: ::. ::.. . : .. :.. : ::. . . CCDS42 EFGKEMVKLNYVAARRQQEL-KDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAAT 180 190 200 210 220 230 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 PEARALA-KQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLE-GKIEQAQRWIDNPTV-DDRG : . ::: :. .. .: : :.: .: : :.. : .:: . : CCDS42 RANRDYVFKQVQEAIAGI---SNAAQATSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMT 240 250 260 270 280 290 520 530 540 550 pF1KB7 VGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGP------------YRQDLLAKCDRVDQ----LTAQLAD ..: .: . : :: ... : :. ..:.:. : : : .. . CCDS42 FSEARFRPSLEE--RLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMN 300 310 320 330 340 350 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 LAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPP ..: : .: :. ... . .::. ....:. ...:: : .:..:. .: :: . CCDS42 NTGRKEKGDPLNIAI-DKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSG- 360 370 380 390 400 620 630 640 650 660 670 pF1KB7 DAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVS :..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. .. : :::.. CCDS42 ---NEKEV-KEYAQVFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVIN 410 420 430 440 450 460 680 690 700 710 720 730 pF1KB7 AARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKC :: : : ...: ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : .:..:: CCDS42 AALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKC 470 480 490 500 510 520 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 KVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPM .:. . . . : : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. ::.:. : CCDS42 VIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPR 530 540 550 560 570 580 800 810 820 830 840 850 pF1KB7 VMDA-----KAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPPPPPDLEQ . .:...:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. :.:: CCDS42 FAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQ 590 600 610 620 630 640 860 870 880 890 900 pF1KB7 ----LRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLH .: . : :. :.:. .. :: :...: .: CCDS42 EDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQE----KSKLD 650 660 670 680 690 910 920 930 940 950 960 pF1KB7 DEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKASDEVTRL :. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.... .: CCDS42 AEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKL 700 710 720 730 740 750 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB7 AKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKA---TMLGRTNISDEESEQATE :. :: :: :. . .:: .:: ::.: : ::: .. :. .: .: . CCDS42 ARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDSATS-- 760 770 780 790 800 810 1030 1040 1050 1060 pF1KB7 MLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFT------LRWVRKTPWYQ :.. :.:::..: ::. . .:: : . : . . : :.: CCDS42 -LIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPE 820 830 840 850 860 870 CCDS42 EFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF 880 890 900 >>CCDS7269.1 CTNNA3 gene_id:29119|Hs108|chr10 (895 aa) initn: 621 init1: 200 opt: 621 Z-score: 402.4 bits: 85.9 E(32554): 4.3e-16 Smith-Waterman score: 624; 25.7% identity (54.6% similar) in 877 aa overlap (227-1063:16-853) 200 210 220 230 240 250 pF1KB7 TVKELLPVLISAMKIFVTTKNSKNQGIEEALKNRNFTVEKMSAEINEIIRVLQLTSWDED :. ..:::::. . ::.: :.. .. CCDS72 MSAETPITLNIDPQDLQVQTFTVEKLLEPL--IIQVTTLVNCPQN 10 20 30 40 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 AWASKDTEAMKRALASIDSKLNQAKGWLRDPS---ASPGDAGEQAIRQILDEAGKVGELC . : .. ::: . . : ...: : : . :. . . .. . :.:. : .: CCDS72 PSSRKKGRS-KRASVLLAS-VEEATWNLLDKGEKIAQEATVLKDELTASLEEVRKESEAL 50 60 70 80 90 100 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 AGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQGSSPVAMQKAQQVSQGLDV--LTAKVENAA . .: : .: . : :: .:. . ... .:: : .: CCDS72 KVSAERFTDDPC-FLPKREAVVQAARALL-----AAVTRLLILADMIDVMCLLQHVSAFQ 110 120 130 140 150 380 390 400 410 420 430 pF1KB7 RKLEAMTNSKQSIAKKIDAAQNWLADPNGGPEGEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDI : .:.. : .:.: : ... . : : :. :: :. .: .:..::.: CCDS72 RTFESLKN----VANKSDLQKTY---QKLGKELENL--DYLAFKRQ-QDL-KSPNQRDEI 160 170 180 190 200 440 450 460 470 480 pF1KB7 L---RSLGEISALTSKLADLRRQGKGDSPEARALAKQVATALQN-LQTKTN--RAVAN-- :: : : : .. . . ..: .: : .:: :.. .: ... : CCDS72 AGARASLKENSPLLHSICSACLE-HSDVASLKASKDTVCEEIQNALNVISNASQGIQNMT 210 220 230 240 250 260 490 500 510 520 530 pF1KB7 SRPAKAAVHLEGKIEQAQRWID-NP-TVDD---RGVGQAAIRGLVAEGHRLAN--VMMGP . : :. : . ... . : :: :: . : . ...... . ::. CCDS72 TPPEPQAATLGSALDELENLIVLNPLTVTEEEIRPSLEKRLEAIISGAALLADSSCTRDL 270 280 290 300 310 320 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 YRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLK---DLKARMQEAMTQ .:. ..:.:. . : .: . . :.. .. .: :.. : ::. ....:. . CCDS72 HRERIIAECNAIRQALQDLLSEYMNNAGKKERSNTLNIALDNMCKKTRDLRRQLRKAIID 330 340 350 360 370 380 600 610 620 630 640 650 pF1KB7 EVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTA .::: : :::.:. .: :: .::. . : :: :..:...: .:. : ...: CCDS72 HVSDSFLDTTVPLLVLIEAAKN-----GREKEIKEYAAIFHEHTSRLVEVANLACSMST- 390 400 410 420 430 660 670 680 690 700 710 pF1KB7 NKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLV :.. .. .. ... . : ::...:: : : .::. . .: .: : .... .: : CCDS72 NEDGIKIVKIAANHLETLCPQIINAALALAARPKSQAVKNTMEMYKRTWENHIHVLTEAV 440 450 460 470 480 490 720 730 740 750 760 770 pF1KB7 DEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVEN :. . ..: .:: : .:..:: .:. . . . : .: .: :: :. .. :... CCDS72 DDITSIDDFLAVSESHILEDVNKCIIALRDQDADNLDRAAGAIRGRAARVAHIVTGEMDS 500 510 520 530 540 550 780 790 800 810 820 pF1KB7 SEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDAKAVAGN-ISDPGLQ----KSFLDSGYRILGAV : . :.: . :..:. : . :: . .: .:. ..:.: . .: .. CCDS72 YEPGAYTEGVMRNVNFLTSTVIPEFVTQVNVALEALSKSSLNVLDDNQFVDISKKIYDTI 560 570 580 590 600 610 830 840 850 860 870 880 pF1KB7 AKVREAFQPQEPDFPPPPPDLEQLRLTDELAPPKPPLPEGEVPPPRPPP-PEEKDEEFPE .: . . . : :. .:. :. ::.. . :: . :.. : CCDS72 HDIRCSVMMIRT--PEELEDVSDLEEEHEVRSHTSIQTEGKTDRAKMTQLPEAEKEKIAE 620 630 640 650 660 670 890 900 910 920 930 940 pF1KB7 QKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA- : : . . .: : . :.. .::::. :: : ..: ::. ..:: . :.. CCDS72 QVAD------FKKVKSKLDAEIEIWDDTSNDIIVLAKNMCMIMMEMTDFTRGKGPLKHTT 680 690 700 710 720 950 960 970 980 990 1000 pF1KB7 -LIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATM .: :: :....... ::...:.:: : . .:: :.: : :::: : ::: . CCDS72 DVIYAAKMISESGSRMDVLARQIANQCPDPSCKQDLLAYLEQIKFYSHQLKICSQVKAEI 730 740 750 760 770 780 1010 1020 1030 1040 1050 pF1KB7 LGRTNISDEESEQATEM---LVHNAQNLMQSVKETVREAEAAS---IKIRTDAGF---TL :.. : .: . :.. :.:::..: .::. . :: :.:.. :: .. CCDS72 ---QNLGGELIMSALDSVTSLIQAAKNLMNAVVQTVKMSYIASTKIIRIQSPAGPRHPVV 790 800 810 820 830 840 1060 pF1KB7 RWVRKTPWYQ : :.: CCDS72 MWRMKAPAKKPLIKREKPEETCAAVRRGSAKKKIHPLQVMSEFRGRQIY 850 860 870 880 890 >>CCDS62945.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (584 aa) initn: 516 init1: 231 opt: 610 Z-score: 398.3 bits: 84.5 E(32554): 7.3e-16 Smith-Waterman score: 632; 27.9% identity (58.8% similar) in 544 aa overlap (545-1063:15-542) 520 530 540 550 560 570 pF1KB7 GQAAIRGLVAEGHRLANVMMGPYRQDLLAKCDRVDQLTAQLADLAARGEGESPQARALA- :.. .. :... ... :.. .. : CCDS62 MDGWRRPLQSVGKVCEK-NMKTSEMHTMSGAQTGRKEKGDPLNI 10 20 30 40 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 --SQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPPDAPNREEVFDERAA ... . .::. ....:. ...:: : .:..:. .: :: . :..:: : : CCDS62 AIDKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAAKSG----NEKEV-KEYAQ 50 60 70 80 90 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 NFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVSAARILLRNPGNQAA :..:..:: .:. : .. . :. :. .. .. : :::..:: : : ...: CCDS62 VFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVINAALTLAARPQSKVA 100 110 120 130 140 150 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 YEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKCKVAMANIQPQMLVA ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : .:..:: .:. . . . : CCDS62 QDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKCVIALQEGDVDTLDR 160 170 180 190 200 210 760 770 780 790 800 pF1KB7 GATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPMVMDA-----KAVAG : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. ::.:. : . .:... CCDS62 TAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPRFAEQVEVAIEALSA 220 230 240 250 260 270 810 820 830 840 850 860 pF1KB7 NISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPPPPPDLEQ----LRLTDELAPP :. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. :.:: .: . CCDS62 NVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQEDYDVRSRTSVQTE 280 290 300 310 320 330 870 880 890 900 910 920 pF1KB7 KPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLHDEARKWSSKGNDII : :. :.:. .. :: :...: .: :. ::...::::: CCDS62 DDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQ----EKSKLDAEVAKWDDSGNDII 340 350 360 370 380 390 930 940 950 960 970 pF1KB7 AAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKASDEVTRLAKEVAKQCTDKRIR . ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.... .::. :: :: :. . CCDS62 VLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKLARAVADQCPDSACK 400 410 420 430 440 450 980 990 1000 1010 1020 1030 pF1KB7 TNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKA---TMLGRTNISDEESEQATEMLVHNAQNLMQSVK .:: .:: ::.: : ::: .. :. .: .: :: :.. :.:::..: CCDS62 QDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGLDS--ATS-LIQAAKNLMNAVV 460 470 480 490 500 1040 1050 1060 pF1KB7 ETVREAEAASIKIRTDAGFT------LRWVRKTPWYQ ::. . .:: : . : . . : :.: CCDS62 LTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKH 510 520 530 540 550 560 CCDS62 ISPVQALSEFKAMDSF 570 580 >>CCDS74531.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (537 aa) initn: 512 init1: 231 opt: 602 Z-score: 393.8 bits: 83.6 E(32554): 1.3e-15 Smith-Waterman score: 624; 28.9% identity (58.8% similar) in 505 aa overlap (581-1063:6-495) 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 LTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLA .::. ....:. ...:: : .:..:. .: CCDS74 MTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLI 10 20 30 620 630 640 650 660 670 pF1KB7 VAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARE :: . :..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. .. CCDS74 EAA----KSGNEKEV-KEYAQVFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDS 40 50 60 70 80 680 690 700 710 720 730 pF1KB7 LTPQVVSAARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAI : :::..:: : : ...: ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : CCDS74 LCPQVINAALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHI 90 100 110 120 130 140 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 KKDLDKCKVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDEL .:..:: .:. . . . : : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. : CCDS74 LEDVNKCVIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLL 150 160 170 180 190 200 800 810 820 830 840 pF1KB7 SKTISPMVMDA-----KAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPP :.:. : . .:...:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. CCDS74 SETVMPRFAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELE 210 220 230 240 250 260 850 860 870 880 890 pF1KB7 PPPDLEQ----LRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMM :.:: .: . : :. :.:. .. :: :...: CCDS74 DDSDFEQEDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQE-- 270 280 290 300 310 320 900 910 920 930 940 950 pF1KB7 MAARQLHDEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKA .: :. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.: CCDS74 --KSKLDAEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEA 330 340 350 360 370 380 960 970 980 990 1000 1010 pF1KB7 SDEVTRLAKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKA---TMLGRTNISDE .... .::. :: :: :. . .:: .:: ::.: : ::: .. :. .: CCDS74 GSRMDKLARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGL 390 400 410 420 430 440 1020 1030 1040 1050 1060 pF1KB7 ESEQATEMLVHNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFT------LRWVRKTPWYQ .: . :.. :.:::..: ::. . .:: : . : . . : :.: CCDS74 DSATS---LIQAAKNLMNAVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPVVSWKMKAPEKKPL 450 460 470 480 490 500 CCDS74 VKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF 510 520 530 >>CCDS62944.1 CTNNA2 gene_id:1496|Hs108|chr2 (953 aa) initn: 728 init1: 231 opt: 601 Z-score: 389.5 bits: 83.6 E(32554): 2.2e-15 Smith-Waterman score: 667; 26.3% identity (56.2% similar) in 729 aa overlap (330-1003:88-797) 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 RQILDEAGKVGELCAGKERREILGTCKMLGQMTDQVADLRARGQ----GSSPVAMQKAQQ ... : :.: .:. .:: : . .. CCDS62 HVLAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSS 60 70 80 90 100 110 360 370 380 390 400 pF1KB7 VSQGLDVLTAK-VENAARKLEAMTN--------SKQSIAKK-IDAAQNWLADPNGGPE-- :..: : .:. . .:. .: ... :. .:... ..:..: . . . . CCDS62 VKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFK 120 130 140 150 160 170 410 420 430 440 450 pF1KB7 --GEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISA-----LTSKLADLRRQGKGDS :.:... . ::. :: ::. ::.. . : .. :.. : ::. . . CCDS62 EFGKEMVKLNYVAARRQQEL-KDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAAT 180 190 200 210 220 230 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 PEARALA-KQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLE-GKIEQAQRWIDNPTV-DDRG : . ::: :. .. .: : :.: .: : :.. : .:: . : CCDS62 RANRDYVFKQVQEAIAGI---SNAAQATSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMT 240 250 260 270 280 290 520 530 540 550 pF1KB7 VGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGP------------YRQDLLAKCDRVDQ----LTAQLAD ..: .: . : :: ... : :. ..:.:. : : : .. . CCDS62 FSEARFRPSLEE--RLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMN 300 310 320 330 340 350 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 LAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPP ..: : .: :. ... . .::. ....:. ...:: : .:..:. .: :: CCDS62 NTGRKEKGDPLNIAI-DKMTKKTRDLRRQLRKAVMDHISDSFLETNVPLLVLIEAA---- 360 370 380 390 400 620 630 640 650 660 670 pF1KB7 DAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARELTPQVVS . :..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. .. : :::.. CCDS62 KSGNEKEV-KEYAQVFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVIN 410 420 430 440 450 460 680 690 700 710 720 730 pF1KB7 AARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKC :: : : ...: ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : .:..:: CCDS62 AALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKC 470 480 490 500 510 520 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 KVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPM .:. . . . : : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. ::.:. : CCDS62 VIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPR 530 540 550 560 570 580 800 810 820 830 840 850 pF1KB7 VMDA-----KAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPPPPPDLEQ . .:...:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. :.:: CCDS62 FAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQ 590 600 610 620 630 640 860 870 880 890 900 pF1KB7 ----LRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLH .: . : :. :.:. .. :: :...: .: CCDS62 EDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQE----KSKLD 650 660 670 680 690 910 920 930 940 950 960 pF1KB7 DEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKASDEVTRL :. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.... .: CCDS62 AEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKL 700 710 720 730 740 750 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB7 AKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLV :. :: :: :. . .:: .:: ::.: : ::: CCDS62 ARAVADQCPDSACKQDLLAYLQRIALYCHQLNICSKVKAEVQNLGGELIVSGTGVQSTFT 760 770 780 790 800 810 1030 1040 1050 1060 pF1KB7 HNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ CCDS62 TFYEVDCDVIDGGRASQLSTHLPTCAEGAPIGSGSSDSSMLDSATSLIQAAKNLMNAVVL 820 830 840 850 860 870 >>CCDS75315.1 CTNNA1 gene_id:1495|Hs108|chr5 (536 aa) initn: 532 init1: 219 opt: 580 Z-score: 380.0 bits: 81.0 E(32554): 7.6e-15 Smith-Waterman score: 606; 28.8% identity (58.1% similar) in 504 aa overlap (581-1063:6-494) 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 LTAQLADLAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLA .::. ....:. ..::: : .:..:. .: CCDS75 MTKKTRDLRRQLRKAVMDHVSDSFLETNVPLLVLI 10 20 30 620 630 640 650 660 670 pF1KB7 VAATAPPDAPNREEVFDERAANFENHSGKLGATAEKAAAVGTANKSTVEGIQASVKTARE :: :..:: : : :..:..:: .:. : .. . :. :. .. :.. . 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CCDS54 VKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFK 120 130 140 150 160 170 410 420 430 440 450 pF1KB7 --GEEQIRGALAEARKIAELCDDPKERDDILRSLGEISA-----LTSKLADLRRQGKGDS :.:... . ::. :: ::. ::.. . : .. :.. : ::. . . CCDS54 EFGKEMVKLNYVAARRQQEL-KDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAAT 180 190 200 210 220 230 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 PEARALA-KQVATALQNLQTKTNRAVANSRPAKAAVHLE-GKIEQAQRWIDNPTV-DDRG : . ::: :. .. .: : :.: .: : :.. : .:: . : CCDS54 RANRDYVFKQVQEAIAGI---SNAAQATSPTDEAKGHTGIGELAAALNEFDNKIILDPMT 240 250 260 270 280 290 520 530 540 550 pF1KB7 VGQAAIRGLVAEGHRLANVMMGP------------YRQDLLAKCDRVDQ----LTAQLAD ..: .: . : :: ... : :. ..:.:. : : : .. . CCDS54 FSEARFRPSLEE--RLESIISGAALMADSSCTRDDRRERIVAECNAVRQALQDLLSEYMN 300 310 320 330 340 350 560 570 580 590 600 610 pF1KB7 LAARGEGESPQARALASQLQDSLKDLKARMQEAMTQEVSDVFSDTTTPIKLLAVAATAPP ..: : .: :. ... . .::. ....:. ...:: : .:..:. .: :: . 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CCDS54 ---NEKEV-KEYAQVFREHANKLVEVANLACSI-SNNEEGVKLVRMAATQIDSLCPQVIN 410 420 430 440 450 460 680 690 700 710 720 730 pF1KB7 AARILLRNPGNQAAYEHFETMKNQWIDNVEKMTGLVDEAIDTKSLLDASEEAIKKDLDKC :: : : ...: ......:.:: .:. .: ::. .. ..:..::. : .:..:: CCDS54 AALTLAARPQSKVAQDNMDVFKDQWEKQVRVLTEAVDDITSVDDFLSVSENHILEDVNKC 470 480 490 500 510 520 740 750 760 770 780 790 pF1KB7 KVAMANIQPQMLVAGATSIARRANRILLVAKREVENSEDPKFREAVKAASDELSKTISPM .:. . . . : : .: :: :.. . . :.:: : . : : :. ::.:. : CCDS54 VIALQEGDVDTLDRTAGAIRGRAARVIHIINAEMENYEAGVYTEKVLEATKLLSETVMPR 530 540 550 560 570 580 800 810 820 830 840 850 pF1KB7 VMDA-----KAVAGNISDPGLQKSFLDSGYRILGAVAKVREA-FQPQEPDFPPPPPDLEQ . .:...:. .: .. :.:.. . .: .:.: .. . :. :.:: CCDS54 FAEQVEVAIEALSANVPQPFEENEFIDASRLVYDGVRDIRKAVLMIRTPEELEDDSDFEQ 590 600 610 620 630 640 860 870 880 890 900 pF1KB7 ----LRLTDELAPPKPPLPEGEVPPP-RPPPPEEKDEEFPEQKAGEVINQPMMMAARQLH .: . : :. :.:. .. :: :...: .: CCDS54 EDYDVRSRTSVQTEDDQLIAGQSARAIMAQLPQEEKAKIAEQV--EIFHQE----KSKLD 650 660 670 680 690 910 920 930 940 950 960 pF1KB7 DEARKWSSKGNDIIAAAKRMALLMAEMSRLVRGGSGTKRA--LIQCAKDIAKASDEVTRL :. ::...:::::. ::.: ..: ::. ..:: . : . .:. :: ::.:.... .: CCDS54 AEVAKWDDSGNDIIVLAKQMCMIMMEMTDFTRGKGPLKNTSDVINAAKKIAEAGSRMDKL 700 710 720 730 740 750 970 980 990 1000 1010 1020 pF1KB7 AKEVAKQCTDKRIRTNLLQVCERIPTISTQLKILSTVKATMLGRTNISDEESEQATEMLV :. :: : . :.:.:. . . . .. ::::.... :. . . :.. : CCDS54 ARAVADQLDSA---TSLIQAAKNLMN-----AVVLTVKASYVASTKYQKVYGTAAVNSPV 760 770 780 790 800 810 1030 1040 1050 1060 pF1KB7 HNAQNLMQSVKETVREAEAASIKIRTDAGFTLRWVRKTPWYQ . . : :.. . .. :. : CCDS54 VSWKMKAPEKKPLVKREKPEEFQTRVRRGSQKKHISPVQALSEFKAMDSF 820 830 840 850 860 1066 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Thu Nov 3 22:49:19 2016 done: Thu Nov 3 22:49:20 2016 Total Scan time: 5.430 Total Display time: 0.330 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]