FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7011, 1045 aa 1>>>pF1KB7011 1045 - 1045 aa - 1045 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9648+/-0.000427; mu= -0.2701+/- 0.027 mean_var=257.2856+/-52.629, 0's: 0 Z-trim(118.6): 452 B-trim: 0 in 0/55 Lambda= 0.079959 statistics sampled from 31205 (31719) to 31205 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.372), width: 16 Scan time: 16.100 The best scores are: opt bits E(85289) NP_005757 (OMIM: 602654) FERM, RhoGEF and pleckstr (1045) 6988 820.5 0 XP_016875801 (OMIM: 602654) PREDICTED: FERM, RhoGE (1045) 6988 820.5 0 XP_011519348 (OMIM: 602654) PREDICTED: FERM, RhoGE (1076) 5080 600.4 1.8e-170 NP_001273768 (OMIM: 602654) FERM, RhoGEF and pleck (1076) 5080 600.4 1.8e-170 XP_016875802 (OMIM: 602654) PREDICTED: FERM, RhoGE (1025) 4699 556.4 2.9e-157 NP_919253 (OMIM: 300628,310700) FERM domain-contai ( 714) 1459 182.6 7.1e-45 XP_016885436 (OMIM: 300628,310700) PREDICTED: FERM ( 698) 1398 175.5 9.1e-43 NP_001293122 (OMIM: 300628,310700) FERM domain-con ( 699) 1134 145.1 1.3e-33 XP_016885437 (OMIM: 300628,310700) PREDICTED: FERM ( 629) 1089 139.8 4.5e-32 XP_016881133 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 847) 958 124.8 2e-27 XP_016881149 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 750) 954 124.3 2.5e-27 XP_016881111 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 925) 954 124.4 3e-27 XP_016881142 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 789) 952 124.1 3.1e-27 XP_016881138 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 816) 952 124.1 3.2e-27 XP_016881144 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 779) 951 124.0 3.3e-27 XP_016881131 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 865) 949 123.8 4.2e-27 XP_016881128 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 873) 949 123.8 4.3e-27 XP_016881118 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 900) 949 123.8 4.4e-27 XP_016881119 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 900) 949 123.8 4.4e-27 XP_016881147 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 764) 947 123.5 4.5e-27 XP_016881141 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 791) 947 123.5 4.6e-27 NP_036439 (OMIM: 605331) band 4.1-like protein 3 i (1087) 949 123.8 5.1e-27 XP_016865847 (OMIM: 603237) PREDICTED: band 4.1-li ( 870) 944 123.2 6.3e-27 XP_016865843 (OMIM: 603237) PREDICTED: band 4.1-li (1036) 945 123.4 6.7e-27 XP_011533830 (OMIM: 603237) PREDICTED: band 4.1-li ( 953) 944 123.2 6.8e-27 XP_016881130 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 820) 941 122.8 7.7e-27 XP_011523939 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 847) 941 122.8 7.9e-27 XP_016881127 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 830) 940 122.7 8.4e-27 XP_016881135 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 838) 940 122.7 8.5e-27 XP_016881124 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 842) 940 122.7 8.5e-27 XP_016881123 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 842) 940 122.7 8.5e-27 XP_016881132 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 850) 940 122.7 8.6e-27 XP_016881120 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 853) 940 122.7 8.6e-27 NP_001268463 (OMIM: 605331) band 4.1-like protein ( 865) 940 122.7 8.7e-27 XP_016881129 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 869) 940 122.7 8.7e-27 XP_016881115 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 871) 940 122.7 8.7e-27 XP_016881113 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 875) 940 122.7 8.8e-27 XP_016881126 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 877) 940 122.7 8.8e-27 XP_016881112 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 879) 940 122.7 8.8e-27 XP_011523936 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 881) 940 122.7 8.8e-27 NP_001268462 (OMIM: 605331) band 4.1-like protein ( 883) 940 122.7 8.8e-27 XP_016881125 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 883) 940 122.7 8.8e-27 XP_016881110 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 888) 940 122.7 8.9e-27 XP_016881109 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 890) 940 122.7 8.9e-27 XP_016881122 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 891) 940 122.7 8.9e-27 XP_016881121 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 891) 940 122.7 8.9e-27 XP_016881108 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 896) 940 122.7 8.9e-27 XP_011523934 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 902) 940 122.8 9e-27 XP_016881107 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 904) 940 122.8 9e-27 XP_016881117 (OMIM: 605331) PREDICTED: band 4.1-li ( 906) 940 122.8 9e-27 >>NP_005757 (OMIM: 602654) FERM, RhoGEF and pleckstrin d (1045 aa) initn: 6988 init1: 6988 opt: 6988 Z-score: 4371.3 bits: 820.5 E(85289): 0 Smith-Waterman score: 6988; 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