Result of FASTA (ccds) for pF1KB7018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7018, 972 aa
  1>>>pF1KB7018 972 - 972 aa - 972 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.9803+/-0.00159; mu= -6.4775+/- 0.091
 mean_var=473.6061+/-114.876, 0's: 0 Z-trim(105.8): 368  B-trim: 308 in 1/53
 Lambda= 0.058934
 statistics sampled from 8252 (8619) to 8252 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.61), E-opt: 0.2 (0.265), width:  16
 Scan time:  4.500

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4            ( 972) 6533 572.2 1.7e-162
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4             ( 976) 6515 570.7 5.1e-162
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5           ( 972) 2267 209.5 2.7e-53
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13          ( 993) 1512 145.3 5.7e-34
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13           (1338) 1081 108.8 7.5e-23
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4          (1089)  822 86.7 2.8e-16
CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5          (1106)  759 81.3 1.2e-14
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4             (1356)  747 80.4 2.7e-14
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5           (1298)  721 78.2 1.2e-13
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5            (1363)  721 78.2 1.2e-13
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 593)  695 75.6 3.4e-13
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 704)  695 75.7 3.7e-13
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 705)  695 75.7 3.7e-13
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 709)  695 75.7 3.8e-13
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 732)  695 75.7 3.8e-13
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 819)  695 75.7 4.1e-13
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 821)  695 75.7 4.1e-13
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10          ( 822)  695 75.7 4.1e-13
CCDS43731.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 731)  690 75.2 5.2e-13
CCDS43730.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 733)  690 75.3 5.2e-13
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 680)  689 75.1 5.2e-13
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 694)  689 75.1 5.3e-13
CCDS55221.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 812)  690 75.3 5.5e-13
CCDS55222.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  690 75.3 5.5e-13
CCDS43732.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 820)  690 75.3 5.5e-13
CCDS6107.2 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8           ( 822)  690 75.3 5.6e-13
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 769)  689 75.2 5.6e-13
CCDS55223.1 FGFR1 gene_id:2260|Hs108|chr8          ( 853)  690 75.3 5.7e-13
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4           ( 806)  689 75.2 5.8e-13
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4          ( 808)  689 75.2 5.8e-13
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10         ( 707)  685 74.8 6.8e-13
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5          ( 734)  678 74.2   1e-12
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 762)  678 74.3 1.1e-12
CCDS4410.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5           ( 802)  678 74.3 1.1e-12
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10           (1072)  631 70.4 2.1e-11
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10            (1114)  631 70.4 2.2e-11


>>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4                 (972 aa)
 initn: 6533 init1: 6533 opt: 6533  Z-score: 3030.6  bits: 572.2 E(32554): 1.7e-162
Smith-Waterman score: 6533; 100.0% identity (100.0% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-972)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGLSNSIYVFVRDPAKLFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGLSNSIYVFVRDPAKLFLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 DYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDR
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 LVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDS
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 SAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMILT
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 YKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVV
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 EATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGG
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 PTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSDSTNEYMDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSDSTNEYMDM
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760       770       780
pF1KB7 KPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLA
              730       740       750       760       770       780

              790       800       810       820       830       840
pF1KB7 SKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNC
              790       800       810       820       830       840

              850       860       870       880       890       900
pF1KB7 VYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMK
              850       860       870       880       890       900

              910       920       930       940       950       960
pF1KB7 TCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTA
              910       920       930       940       950       960

              970  
pF1KB7 SSSQPLLVHDDV
       ::::::::::::
CCDS47 SSSQPLLVHDDV
              970  

>>CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4                  (976 aa)
 initn: 3428 init1: 3428 opt: 6515  Z-score: 3022.3  bits: 570.7 E(32554): 5.1e-162
Smith-Waterman score: 6515; 99.6% identity (99.6% similar) in 976 aa overlap (1-972:1-976)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 PGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGLSNSIYVFVRDPAKLFLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 PGFVKWTFEILDETNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCTNKHGLSNSIYVFVRDPAKLFLV
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 DRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYH
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 RLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWE
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DYPKSENESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEILTYDR
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVNGMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSIDS
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       :::::::::::::::::::::::::::::    :::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKGNNKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIV
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CCDS34 MILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAF
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CCDS34 GKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGAC
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CCDS34 TIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSDSTNE
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFSYQVAKGM
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CCDS34 AFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPES
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CCDS34 IFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMY
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       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSV
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pF1KB7 GSTASSSQPLLVHDDV
       ::::::::::::::::
CCDS34 GSTASSSQPLLVHDDV
              970      

>>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5                (972 aa)
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Smith-Waterman score: 2301; 42.1% identity (69.5% similar) in 932 aa overlap (37-939:21-930)

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CCDS43           MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEW
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pF1KB7 TFEILDE---TNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCT---NKHGLSNSIYVFVRDPAKLF-L
             .    ......   :..:   ::: : ::   .  : : .:...:.:::. . .
CCDS43 DGPPSPHWTLYSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNV
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pF1KB7 VDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEV-TNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRA
       . . .   ::.:.:. : :::: . .. ::   .:.:: .   .  .:  :. :. .:  
CCDS43 LAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFI
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pF1KB7 YHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDV
         .   .::. . :..:.: .. :::. .. . :....  :  .  .::   ..:. ..:
CCDS43 QSQD-YQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSV
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pF1KB7 SSSVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGS
       . . .... ..:. :::    .:  :..  :..  ::.....  . .: . : :.:. :.
CCDS43 DVN-FDVFLQHNN-TKLAIPQQSDFHNN-RYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGK
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pF1KB7 ANVTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDK
        ...  ..::.....:.    :    :. ::...: :  ::.:  .  .: :..  :.:.
CCDS43 HSTSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLG-PFSDH
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pF1KB7 WEDYPKSENESN---IRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEI
         . ::  : ..    :..  : : ::: .:.: :.::. :     :..:.. .   ::.
CCDS43 QPE-PKLANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEV
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pF1KB7 LTYDRLVNG--MLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCS-ASVLPV--DVQTLNSSGPPFG
        .   ..::   : :.:.:.:.:.. :  : :  .::. :.:: :  :      :  :: 
CCDS43 SVIWTFINGSGTLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFH
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pF1KB7 KLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTS-AYFNFAFKEQIHP--HTLFTPLLIGFVI
       :..::: .   ...:: : ::.:.:.::. : :.. ..   . ::  . ::::.... . 
CCDS43 KVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMS
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pF1KB7 VAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSF
       . ... .....: ::: ::: :.:.::..:  .::.:..::::::::..::::::: :.:
CCDS43 IMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQF
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       590       600       610       620       630       640       
pF1KB7 GKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHM
       :::::::::::::::::.:: : ::.. ::::::: .::  :.::::::::..:.::.: 
CCDS43 GKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHE
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pF1KB7 NIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFI---CSKQEDHAEAALYKNLLH
       :::::::::: :::.::::::::::::::::::: ....    :  .:   .. :::.  
CCDS43 NIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHL
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pF1KB7 SKESSCSDS------TNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDEL
        :.    ::      .. :..:.:     : :...        :. :.:.     ..:  
CCDS43 EKKYVRRDSGFSSQGVDTYVEMRP-----VSTSSND-------SFSEQDLD----KEDGR
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      760       770       780       790       800       810        
pF1KB7 ALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSN
        :.:.::: :: :::.::::::::::::::.::::.:::.:...:: :::::::: ::::
CCDS43 PLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSN
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pF1KB7 YVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKM
       :.::::::::::::::::::.:::: .::::::::.:::.:::: .::::. :.:::::.
CCDS43 YIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKL
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      880       890       900       910       920        930       
pF1KB7 IKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISEST-NHIYSNLAN
       .:.:..: .:  :: ..:.::..::  .: .::::.:: .....: .:.  .. :.:: .
CCDS43 VKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPS
      870       880       890       900       910       920        

       940       950       960       970           
pF1KB7 CSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV         
        :                                          
CCDS43 SSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
      930       940       950       960       970  

>>CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13               (993 aa)
 initn: 1394 init1: 781 opt: 1512  Z-score: 723.3  bits: 145.3 E(32554): 5.7e-34
Smith-Waterman score: 1639; 33.9% identity (61.8% similar) in 956 aa overlap (20-935:47-958)

                          10        20        30         40        
pF1KB7            MRGARGAWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPG-EPSPPSIHPGKSDLI-
                                     :  .:: : :: . :    ...: .:  . 
CCDS31 FSAMIFGTITNQDLPVIKCVLINHKNNDSSVGKSSSYPMVSESPEDLGCALRPQSSGTVY
         20        30        40        50        60        70      

              50          60            70         80            90
pF1KB7 ------VRVGDEIRL--LCTDPGFVK--WTFE--ILD-ETNENKQNEWITE----KAEAT
             : :.  : :  :   :: ..  :.:.   :. . . . ::. ..     :   :
CCDS31 EAAAVEVDVSASITLQVLVDAPGNISCLWVFKHSSLNCQPHFDLQNRGVVSMVILKMTET
         80        90       100       110       120       130      

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pF1KB7 NTGKYTCTNKHGLSNSIYVF---VRDPAKLFLVDRSLYGK-EDNDTLVRCPLTDPE-VTN
       ..:.:    .   .:   .:   .:. . :. . :  . : :..:.::    . :: ...
CCDS31 QAGEYLLFIQSEATNYTILFTVSIRN-TLLYTLRRPYFRKMENQDALVCISESVPEPIVE
        140       150       160        170       180       190     

         150       160       170       180          190       200  
pF1KB7 YSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLC---LHCSVDQEGKSVLSEKFIL
       . :   ::.   ..     .:    ..:. ... :.:    ..: . .:     .. : .
CCDS31 WVLCDSQGESCKEE-----SP---AVVKKEEKVLHELFGTDIRCCARNELGRECTRLFTI
         200            210          220       230       240       

            210       220       230       240       250       260  
pF1KB7 KVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWKRENSQTKLQEKYNSW
        .    . .: ... .   .:. :: . . :    :. .   ::. ::   :  :. : .
CCDS31 DL----NQTPQTTLPQ--LFLKVGEPLWIRCKAVHVNHGFGLTWELEN---KALEEGNYF
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       . . .. .:         .::.  ::.: . : ...  ... ..:   .:.:::::    
CCDS31 EMSTYSTNRTMIRILFAFVSSVARNDTGYYTCSSSKHPSQSALVT---IVEKGFINA-TN
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        .    ... :.  . :...:.:. .   : .  ..:  . .   .. . :  .. .. :
CCDS31 SSEDYEIDQYEEFCFSVRFKAYPQIRCT-WTFSRKSFPCEQKGLDNGYSIS--KFCNHKH
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              . : : : . :.:.. .  :.. .  ::..:.  .   .. .: . :.: :. 
CCDS31 -------QPGEYIFHAENDDAQFTKMFTLNIRRKPQVLA--EASASQASCFSDGYPLPSW
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        :  :      :.  .    : . ...   ::. : .:... :   ..  :.: :::..:
CCDS31 TWKKCSDKSPNCTEEITE-GVWNRKANRKVFGQWVSSSTLNMSEAIKGFLVKCCAYNSLG
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        ::    .  .    :   :    :.:  . :.  .....::    .:: ..  :: : .
CCDS31 -TSCETILLNSPGPFP---FIQDNISFYATIGVCLLFIVVLTLLICHKYKKQFRYESQLQ
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pF1KB7 VVEEING---NNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSD
       .:. ..:   :.: :.:  .  :: ::::::. : :::.::.::::::..:::::. :. 
CCDS31 MVQ-VTGSSDNEYFYVDFREYEYDLKWEFPRENLEFGKVLGSGAFGKVMNATAYGISKTG
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pF1KB7 AAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCY
       ... ::::::: .:  .::::::::::... ::.: ::::::::::..::  .: :::::
CCDS31 VSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHENIVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCY
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pF1KB7 GDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAAL-YKNLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSYVVPT
       :::::.:: ::..:  .  :   :  . .   ..:. .:   .. : ....:  . .   
CCDS31 GDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSFYPTFQSHPNSSMPGSRE-VQIHPDSDQISGL
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pF1KB7 KADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDEL-ALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDL
       .... .:    . :: .    . :...: .: .:::: :.::::::: ::  :.:.::::
CCDS31 HGNSFHSE---DEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDLLCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDL
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pF1KB7 AARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVW
       ::::.:.:::...::::::::::: .::::::.::::::::::::::.:. .::..::::
CCDS31 AARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNARLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVW
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pF1KB7 SYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLK
       ::::.:::.:::: .::::.:::..:::.:..::.: .: .:  :.: ::..::  :  :
CCDS31 SYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKMDQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRK
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       ::.: ......  :.... . .:.:.                                  
CCDS31 RPSFPNLTSFLGCQLADAEEAMYQNVDGRVSECPHTYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVED
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>>CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13                (1338 aa)
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CCDS93 FILDADSNMGNRIESITQRMAIIEGKNKMASTLVVADSRI--SGIYICIASNKVGTVGRN
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CCDS93 ISFYITDVPNGF-----HVNLEKMPTEGEDLKLSCTVNKFLYRD-VTWILL-RTVNNRTM
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CCDS93 HYSISKQKMAITKEHSITLNLTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEA
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CCDS93 PYLLRNLSDHTVAISSSTTLDCHANGVPEPQITWFKNNHKIQQEPGIIL----------G
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CCDS93 PGSSTLFIERVTE----EDEGVYHCKATNQKGSVESSAYLTVQGTSDKSNLELIT---LT
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pF1KB7 FVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPT--QLPYD-HKWEFP
        . ::. .  ... :  . ...   :..   .  :   . : .:    .::::  :::: 
CCDS93 CTCVAATLFWLLLTLFIRKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFA
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pF1KB7 RNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLS
       :.::..::.:: :::::::.:.:.:. :: .  :::::::: .:  .: .:::.:::.:.
CCDS93 RERLKLGKSLGRGAFGKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILT
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pF1KB7 YLGNHMNIVNLLGACTI-GGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYK
       ..:.:.:.::::::::  ::: .::.::: ::.: :.:. ::: :. .:     .:::. 
CCDS93 HIGHHLNVVNLLGACTKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNK-----DAALH-
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pF1KB7 NLLHSKESSCSDSTNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVR--IGSYIERDVTPAIMEDDEL
        .  .::.           :.::.      . :.  : .   .: ...: . . .:..: 
CCDS93 -MEPKKEK-----------MEPGLEQGKKPRLDSVTSSESFASSGFQEDKSLSDVEEEED
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pF1KB7 A-------LDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLAR
       .       . .:::.:.:.:::.:: ::.:..:::::::::::::... ..:::::::::
CCDS93 SDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLSSRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLAR
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pF1KB7 DIKNDSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPV
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CCDS93 DIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDKIYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQM
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CCDS93 DEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIMLDCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQD
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pF1KB7 YSNLANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV                   
                                                                   
CCDS93 GKDYIPINAILTGNSGFTYSTPAFSEDFFKESISAPKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERI
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>>CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4               (1089 aa)
 initn: 1503 init1: 788 opt: 822  Z-score: 405.8  bits: 86.7 E(32554): 2.8e-16
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CCDS34      MGTSHPAFLVLGCLLTGLSLILCQLSLPSILPNENEKVVQLNSSFSLRCFGESEV
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pF1KB7 KWTFEILDETN--------ENKQNEWIT----EKAEATNTGKYTCTNKHGLSNS------
       .: . . .: .        ::... ..:     .: :..:: :::  .:  ..       
CCDS34 SWQYPMSEEESSDVEIRNEENNSGLFVTVLEVSSASAAHTGLYTCYYNHTQTEENELEGR
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pF1KB7 -IYVFVRDPAKLF----LVDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEVTNYSLKGCQGKPLPKDLR
        ::..: ::   :    ..:  .  ..:..... :  :::: :  .:.. .:  .: .  
CCDS34 HIYIYVPDPDVAFVPLGMTDYLVIVEDDDSAIIPCRTTDPE-TPVTLHNSEGV-VPASY-
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pF1KB7 FIPDPKAGIMIKSVKRAYHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPV-VSVSKAS
          : . :.    .   :      : .  .::.  .  : . .  : . . . . . :. 
CCDS34 ---DSRQGFNGTFTVGPYI-----CEATVKGKKFQTIPFNVYALKATSELDLEMEALKTV
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pF1KB7 YLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYSTWK-----RENSQTKLQE-KYNSWHHGDFNYERQAT
       :  . :: ..:::.. . .  :   :      . .. : :.: :  : .   . :    :
CCDS34 Y--KSGETIVVTCAVFN-NEVVDLQWTYPGEVKGKGITMLEEIKVPSIK---LVY----T
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       ..:: .:.: :.  .:.  : :. ..  .   . :. ..::: :.:.: : :  ..: ::
CCDS34 FVVEVRAYPPPR-ISWLKNNLTLIENLTEITTDVEKIQEIRYRSKLKLIRAKEEDSGHYT
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       ....: :.  . .:.. ...   ::      .:      ..:.: : : : :.:..:   
CCDS34 IVAQNEDAVKSYTFELLTQVPSSILDLVDDHHGSTGGQTVRCTAEGTPLPDIEWMICKDI
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CCDS34 -KKCNNETSWTILANNVSNIITEIHSRDRSTVEGRVTFAKVEETIAVRCLAKNLLGAENR
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CCDS34 ELKLVAPTLRSELTVAAAVLVLLVIV--IISLIVLVVIWK--QKPRYEIRWRVIESISPD
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CCDS34 LKPTARSSEKQALMSELKIMTHLGPHLNIVNLLGACTKSGPIYIITEYCFYGDLVNYLHK
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CCDS34 NRDSFLSHHPEKPKKELDIFGLNPADESTRSYVILSFENNGDYMDMKQADTTQYVPMLER
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CCDS34 KEVSKYSDIQRSLYDRPASYKKKSMLDSEVKNLLSDDNSEGLTLLDLLSFTYQVARGMEF
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CCDS34 LASKNCVHRDLAARNVLLAQGKIVKICDFGLARDIMHDSNYVSKGSTFLPVKWMAPESIF
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CCDS34 DNLYTTLSDVWSYGILLWEIFSLGGTPYPGMMVDSTFYNKIKSGYRMAKPDHATSEVYEI
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CCDS34 MVKCWNSEPEKRPSFYHLSEIVENLLPGQYKKSYEKIHLDFLKSDHPAVAR-MRVDSDNA
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CCDS34 YIGVTYKNEEDKLKDWEGGLDEQRLSADSGYIIPLPDIDPVPEEEDLGKRNRHSSQTSEE
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CCDS43 MRLPGAMPALALKGELLLLSLLLLL--------EPQISQGLVVTP---PGP-ELVLNVSS
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CCDS43 LPVPYD------HQRGFSGIFEDRSY--ICKTTIGDRE---VDSDAYYV-YRLQVSSINV
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pF1KB7 VSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDVSSSVYS-TWKRENSQT-KLQEKYNSWHHGDFNYER
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CCDS43 -SVNAVQTVVRQGENITLMCIV--IGNEVVNFEWTYPRKESGRLVEPVTDFLL-DMPYHI
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CCDS43 RSILHIPSAELEDSGTYTCNVTESVNDHQDEKAINITVVESGYVRLLGEVGTLQFAELHR
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CCDS43 GHYTMRAFHEDAEVQLSFQLQINVPVRVLELSESHPDSGEQTVRCRGRGMPQPNIIWSAC
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pF1KB7 PGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSS----------IDSSAFKHNG---TVE
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CCDS43 RDL-KRCPRELPPT---LLGNSSEEESQLETNVTYWEEEQEFEVVSTLRLQHVDRPLSVR
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pF1KB7 CKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTL-FTPLLIGFVIVAGMMCII-VMILTYKYLQKPM
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CCDS43 CTLRNAVGQDTQ------EVIVVPHSLPFKVVVISAILALVVLTIISLIILIMLWQKKPR
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pF1KB7 YEVQWKVVEEI--NGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSFGKTLGAGAFGKVVEATAYG
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CCDS43 YEIRWKVIESVSSDGHEYIYVDPMQLPYDSTWELPRDQLVLGRTLGSGAFGQVVEATAHG
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pF1KB7 LIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLLGACTIGGPTLVIT
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CCDS43 LSHSQATMKVAVKMLKSTARSSEKQALMSELKIMSHLGPHLNVVNLLGACTKGGPIYIIT
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pF1KB7 EYCCYGDLLNFLRRKRDSFIC--SKQEDHAEAALYKNLLH------SKESSCSDSTNEYM
       ::: ::::...:.:.. .:.   : ..    : ::.: :       :. :  ..: . ::
CCDS43 EYCRYGDLVDYLHRNKHTFLQHHSDKRRPPSAELYSNALPVGLPLPSHVSLTGESDGGYM
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pF1KB7 DMKP--GVSYV--VPTKAD-KRRSVRIGSYI-----------ERDVTPAIMEDDELALDL
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CCDS43 DMSKDESVDYVPMLDMKGDVKYADIESSNYMAPYDNYVPSAPERTCRATLINESPV-LSY
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pF1KB7 EDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVK
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CCDS43 MDLVGFSYQVANGMEFLASKNCVHRDLAARNVLICEGKLVKICDFGLARDIMRDSNYISK
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pF1KB7 GNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEG
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CCDS43 GSTFLPLKWMAPESIFNSLYTTLSDVWSFGILLWEIFTLGGTPYPELPMNEQFYNAIKRG
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pF1KB7 FRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNR
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CCDS43 YRMAQPAHASDEIYEIMQKCWEEKFEIRPPFSQLVLLLERLLGEGYKKKYQQVDEEFLRS
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       ..:.. .:                                                    
CCDS43 DHPAILRSQARLPGFHGLRSPLDTSSVLYTAVQPNEGDNDYIIPLPDPKPEVADEGPLEG
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CCDS34 KKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGVTRSDQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKPF
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       ..  : . .  . :.   :: :        ::.  :.    .: :: ..  .       :
CCDS34 VAFGSGMESLVEATVGERVRIPAKYLGYPPPEIKWYK----NGIPLESNHTIKAGHVLTI
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       : ..    . . . :   ...: .: :.:  ... : : .    ..: :.. .:    : 
CCDS34 MEVSERDTGNYTVILTNPISKEKQSHVVS--LVVYVPPQIGEKSLISPVDSYQY----GT
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         :.:::.  .    .  :          : ::. .. . :  . :.   ::        
CCDS34 TQTLTCTVYAIPPPHHIHWYWQLEEECANEPSQAVSVTNPYPCEEWRSVEDFQGGNKIEV
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       : .. : .     :.:.  .   : :... : : :  : .. . ...:.    :.. : .
CCDS34 NKNQFALIEGKNKTVSTLVIQAANVSALYKCEAVNKVGRGERVISFHVTRGPEITLQPDM
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       . :         . :  . . .. :.  :.:   :  .    . ...   :. .     :
CCDS34 QPTEQESVSLWCTADRSTFENLTWYKLGPQPLPIHVGELPTPVCKNLDTLWKLNATMFSN
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pF1KB7 ESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVN----AAIAFNVYVNTKPEI---LTYDR
        .:   . ::. . :.  . : :. :...  ..    ..  ..:   . : :   :  . 
CCDS34 STNDILIMELKNASLQ--DQGDYVCLAQDRKTKKRHCVVRQLTVLERVAPTITGNLENQT
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          :    ..:.:.: : : : :.                : .:: ..::  .     . 
CCDS34 TSIGESIEVSCTASGNPPPQIMWF---------------KDNETLVEDSGIVLKDGNRNL
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pF1KB7 SIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIV
       .:     . .:   :.: . .: ...   : ..   .  .:   .:.: ...: .. ...
CCDS34 TIRRVRKEDEGLYTCQACSVLGCAKVEAFFIIEGAQEKTNLEIIILVGTAVIAMFFWLLL
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       .:.     .    :..   .  .   . . .:    .::::  ::::::.::..:: :: 
CCDS34 VIILRTVKRANGGELKTGYLSIVMDPDELPLDEHCERLPYDASKWEFPRDRLKLGKPLGR
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pF1KB7 GAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNIVNLL
       ::::.:.:: :.:. :. .  :::::::: .:  .:..:::::::.: ..:.:.:.::::
CCDS34 GAFGQVIEADAFGIDKTATCRTVAVKMLKEGATHSEHRALMSELKILIHIGHHLNVVNLL
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pF1KB7 GACTI-GGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKESSCSD
       ::::  ::: .::.:.: .:.: ..:: ::. :.  :    ...: ..   ..:.   . 
CCDS34 GACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFVPYK----TKGARFR---QGKDYVGAI
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pF1KB7 STNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSV---RIGSYIERDVTPAIMEDDELALDLEDLLSFS
            .:.:  .. .. ....   .    .  : .:.. .:  .  : :.:  : :. .:
CCDS34 P----VDLKRRLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPEDLYKDFLTL--EHLICYS
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pF1KB7 YQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNARLPV
       .:::::: ::::..:::::::::::::..  ..::::::::::: .: .:: ::.::::.
CCDS34 FQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGDARLPL
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pF1KB7 KWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRMLSPE
       ::::::.::. :::..:::::.:..:::.::::.:::::. .: .: . .::: :: .:.
CCDS34 KWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRLKEGTRMRAPD
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CCDS34 YTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGKDYIVLPISETLSMEED
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CCDS43 HWRPWTPCKMFAQRSLRRRQQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDTWT--EFVEGKNK
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pF1KB7 T---LTISSARVNDSGVFMCYANNTFGSAN--VTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDG
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CCDS43 TVSKLVIQNANV--SAMYKCVVSNKVGQDERLIYFYVTTIPDGF-TIESKPSEELL--EG
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pF1KB7 ENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDKWEDYPKSENESNI-----------------
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CCDS43 QPVLLSCQADSY-KYEHLRWYRLNLSTLHDAHGNPLLLDCKNVHLFATPLAASLEEVAPG
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pF1KB7 -RYVS-ELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTK----PEILTY--DRLVN
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CCDS43 ARHATLSLSIPRVAPEHEGHYVCEVQDRRSHDKHCHKKYLSVQALEAPRLTQNLTDLLVN
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pF1KB7 GM----LQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCSASVLPVDVQTLNSSGPPFGKLVVQSSID
             .::..::   :.: ::     ..:       ::.   :.      :: .:   .
CCDS43 VSDSLEMQCLVAGAHAPSIVWY----KDERLLEEKSGVDLADSNQ------KLSIQRVRE
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pF1KB7 SSAFKHNGTVECKAYNDVGKTSAYFNFAFKEQIHPHTLFTPLLIGFVIVAGMMCIIVMIL
        .:    :   :.. :  : ...  . : . .    ..   .:.:  ..: ..  ....:
CCDS43 EDA----GRYLCSVCNAKGCVNSSASVAVEGSEDKGSMEIVILVGTGVIA-VFFWVLLLL
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pF1KB7 TYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLP---------YD-HKWEFPRNRLSFGK
        .  ...: .      ..  .:   . .:: ..:         ::  .:::::.:: .:.
CCDS43 IFCNMRRPAH------ADIKTGYLSIIMDPGEVPLEEQCEYLSYDASQWEFPRERLHLGR
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pF1KB7 TLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHMNI
       .:: :::::::::.:.:. :...  :::::::: .:  .:..:::::::.: ..:::.:.
CCDS43 VLGYGAFGKVVEASAFGIHKGSSCDTVAVKMLKEGATASEHRALMSELKILIHIGNHLNV
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pF1KB7 VNLLGACTIG-GPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFICSKQEDHAEAALYKNLLHSKES
       ::::::::   :: .::.:.: ::.: :::: :::.:    ...  . . .. ..   : 
CCDS43 VNLLGACTKPQGPLMVIVEFCKYGNLSNFLRAKRDAFSPCAEKSPEQRGRFRAMV---EL
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pF1KB7 SCSDSTNEYMDMKPGVS-YVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAI-MEDDELA-LDLEDL
       .  :        .:: :  :. .. .: ..   :.   : ..:    ::  :. : .:::
CCDS43 ARLDRR------RPGSSDRVLFARFSKTEG---GA---RRASPDQEAEDLWLSPLTMEDL
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pF1KB7 LSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSNYVVKGNA
       . .:.:::.:: ::::..:::::::::::::... ..::::::::::: .: .:: ::.:
CCDS43 VCYSFQVARGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSESDVVKICDFGLARDIYKDPDYVRKGSA
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pF1KB7 RLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKMIKEGFRM
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CCDS43 RLPLKWMAPESIFDKVYTTQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVQINEEFCQRLRDGTRM
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pF1KB7 LSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISESTNHIYSNLANCSPNRQKP
        .:: :   .  :: .::..::  ::.:...:...                         
CCDS43 RAPELATPAIRRIMLNCWSGDPKARPAFSELVEILGDLLQGRGLQEEEEVCMAPRSSQSS
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pF1KB7 VVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV                                 
                                                                   
CCDS43 EEGSFSQVSTMALHIAQADAEDSPPSLQRHSLAARYYNWVSFPGCLARGAETRGSSRMKT
         1200      1210      1220      1230      1240      1250    

>>CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5                 (1363 aa)
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