FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7019, 751 aa 1>>>pF1KB7019 751 - 751 aa - 751 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3420+/-0.00106; mu= 14.3686+/- 0.063 mean_var=82.5350+/-15.793, 0's: 0 Z-trim(103.8): 58 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.141174 statistics sampled from 7540 (7596) to 7540 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.589), E-opt: 0.2 (0.233), width: 16 Scan time: 3.590 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 ( 751) 5112 1051.7 0 CCDS82779.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 754) 2862 593.5 4.1e-169 CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 686) 2734 567.4 2.7e-161 CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 ( 771) 2396 498.6 1.6e-140 CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 ( 785) 2358 490.8 3.4e-138 CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 ( 777) 2348 488.8 1.4e-137 CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 775) 2217 462.1 1.5e-129 CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 749) 2208 460.3 5.1e-129 CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 754) 2192 457.0 4.9e-128 CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 ( 715) 2191 456.8 5.4e-128 CCDS77744.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 748) 2191 456.8 5.6e-128 CCDS2856.1 SEMA3G gene_id:56920|Hs108|chr3 ( 782) 2059 429.9 7.3e-120 CCDS77745.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 ( 406) 1169 248.6 1.5e-65 CCDS45347.1 SEMA4B gene_id:10509|Hs108|chr15 ( 837) 1152 245.2 3.1e-64 CCDS47991.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 738) 1132 241.1 4.7e-63 CCDS6685.1 SEMA4D gene_id:10507|Hs108|chr9 ( 862) 1132 241.1 5.4e-63 CCDS7501.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 843) 1011 216.5 1.4e-55 CCDS55724.1 SEMA4G gene_id:57715|Hs108|chr10 ( 702) 965 207.1 7.8e-53 CCDS2029.1 SEMA4C gene_id:54910|Hs108|chr2 ( 833) 913 196.5 1.4e-49 CCDS1955.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 770) 836 180.8 6.9e-45 CCDS32228.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 597) 735 160.2 8.6e-39 CCDS32227.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 998) 735 160.3 1.4e-38 CCDS32224.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1011) 735 160.3 1.4e-38 CCDS32226.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1017) 735 160.3 1.4e-38 CCDS32225.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 (1073) 735 160.3 1.4e-38 CCDS32229.1 SEMA6D gene_id:80031|Hs108|chr15 ( 476) 726 158.4 2.5e-38 CCDS47256.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1030) 703 153.8 1.3e-36 CCDS75288.1 SEMA6A gene_id:57556|Hs108|chr5 (1047) 703 153.8 1.3e-36 CCDS74529.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 737) 668 146.6 1.3e-34 CCDS984.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 930) 659 144.8 5.8e-34 CCDS53364.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 962) 659 144.8 6e-34 CCDS12131.1 SEMA6B gene_id:10501|Hs108|chr19 ( 888) 600 132.8 2.3e-30 CCDS53363.1 SEMA6C gene_id:10500|Hs108|chr1 ( 922) 510 114.5 7.9e-25 CCDS74995.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1057) 486 109.6 2.6e-23 CCDS35491.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1151) 486 109.6 2.8e-23 CCDS58848.1 SEMA5B gene_id:54437|Hs108|chr3 (1205) 486 109.6 3e-23 CCDS62942.1 SEMA4F gene_id:10505|Hs108|chr2 ( 615) 462 104.6 4.8e-22 CCDS53378.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 629) 445 101.2 5.4e-21 CCDS53958.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 501) 417 95.4 2.3e-19 CCDS53959.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 652) 417 95.5 2.9e-19 CCDS10262.1 SEMA7A gene_id:8482|Hs108|chr15 ( 666) 417 95.5 3e-19 CCDS1132.1 SEMA4A gene_id:64218|Hs108|chr1 ( 761) 369 85.7 2.9e-16 CCDS3875.1 SEMA5A gene_id:9037|Hs108|chr5 (1074) 295 70.7 1.4e-11 >>CCDS5596.1 SEMA3C gene_id:10512|Hs108|chr7 (751 aa) initn: 5112 init1: 5112 opt: 5112 Z-score: 5626.2 bits: 1051.7 E(32554): 0 Smith-Waterman score: 5112; 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CCDS82 PQATVKWLFQRDPGDRRREIRAEDRFLRTEQGLLLRALQLSDRGLYSCTATENNFKHVVT 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB7 KINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVR--ALPFHP--KDIMGAFSHSEMQMINQYCKD .....:: . : .. . : . .. : : : ... ... :. .:.:::. CCDS82 RVQLHVLGRDAVHAAL--FPPLSMSAPPPPGAGPPTPPYQELAQLLAQPEVGLIHQYCQG 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 TRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES .: : . . ...: ::::.. :.. CCDS82 -YWRHV--PPSPREAPGAPRSPEPQDQKKPRNRRHHPPDT 720 730 740 750 >>CCDS82780.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 (686 aa) initn: 2046 init1: 2046 opt: 2734 Z-score: 3009.3 bits: 567.4 E(32554): 2.7e-161 Smith-Waterman score: 2734; 54.9% identity (82.5% similar) in 692 aa overlap (66-751:1-686) 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 LRETKTSEYFSLSHHPLDYRILLMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPAST .::::::..:::....:..: : . : :: CCDS82 MYVGSKDYVLSLDLHDINREPLIIHWAASP 10 20 30 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 IKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMI ..::: ..::: . ::::::.:: .:::::::::.::..:.:::.:::::..: .:.. CCDS82 QRIEECVLSGKDVNGECGNFVRLIQPWNRTHLYVCGTGAYNPMCTYVNRGRRAQDYIFYL 40 50 60 70 80 90 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 DS-KCESGKGRCSFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHN . . :::::.: ..:...:.:..:::::..:.:::::::::::::.: :..:.::::.: CCDS82 EPERLESGKGKCPYDPKLDTASALINEELYAGVYIDFMGTDAAIFRTLGKQTAMRTDQYN 100 110 120 130 140 150 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 SKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLR :.::..: :. :..:::... :: :.::::.:. .. .: ... :.::: :: :: CCDS82 SRWLNDPSFIHAELIPDSAERNDDKLYFFFRERSAEAPQSPA-VYARIGRICLNDDGGHC 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 SLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKG :::::.::::::::::: ::: :::::::.:::. .:.. :. ..:..::.:.:::.: CCDS82 CLVNKWSTFLKARLVCSVPGEDGIETHFDELQDVFVQQTQDVRNPVIYAVFTSSGSVFRG 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 SAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFP :::::: ..::. :::::::::::::.: . ..:..:::::::::::.:::.:..::..: CCDS82 SAVCVYSMADIRMVFNGPFAHKEGPNYQWMPFSGKMPYPRPGTCPGGTFTPSMKSTKDYP 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 DDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRG :.:..:.:.:::::...::...:::.:: :. :. : ::::.:.::::::.::::::::: CCDS82 DEVINFMRSHPLMYQAVYPLQRRPLVVRTGAPYRLTTIAVDQVDAADGRYEVLFLGTDRG 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 TVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRC :::::.::: ... ::.:::.::::. ::. :: ::::.:::::.: ::...::::: CCDS82 TVQKVIVLPKDDQELEELMLEEVEVFKDPAPVKTMTISSKRQQLYVASAVGVTHLSLHRC 390 400 410 420 430 440 520 530 540 550 560 570 pF1KB7 HIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRN . ::.:::::::::::::::::..:::. ..::::::::::::::. :::::: .: .: CCDS82 QAYGAACADCCLARDPYCAWDGQACSRYTASSKRRSRRQDVRHGNPIRQCRGFNSNANKN 450 460 470 480 490 500 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 AAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQASIKWLLQKDK-DRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSV :.: ::::: ....:::: :.::::..:::.:.: :::.:.. ..:.. : ::::.:.. CCDS82 AVESVQYGVAGSAAFLECQPRSPQATVKWLFQRDPGDRRREIRAEDRFLRTEQGLLLRAL 510 520 530 540 550 560 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 QGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVR--ALPFHP- : ::.::: : ::::.::.........:: . :: . . : . .. : : : CCDS82 QLSDRGLYSCTATENNFKHVVTRVQLHVLGRD--AVHAALFPPLSMSAPPPPGAGPPTPP 570 580 590 600 610 620 700 710 720 730 740 pF1KB7 -KDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLP ... ... :. .:.:::. .: : . . ...: ::::.. : CCDS82 YQELAQLLAQPEVGLIHQYCQG-YWRHVP--PSPREAPGAPRSPEPQDQKKPRNRRHHPP 630 640 650 660 670 680 750 pF1KB7 ES .. CCDS82 DT >>CCDS5599.1 SEMA3A gene_id:10371|Hs108|chr7 (771 aa) initn: 1916 init1: 1330 opt: 2396 Z-score: 2636.5 bits: 498.6 E(32554): 1.6e-140 Smith-Waterman score: 2458; 44.9% identity (78.4% similar) in 759 aa overlap (4-747:6-762) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICS-ICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRIL : .:.. ::.. . ..... :. :.. :. :... :. . .:. . CCDS55 MGWLTRIVCLFWGVLLTARANYQNGKNNVPRLKLSYKEMLESNNVITFNGLANSSSYHTF 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 LMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVR :.::...:.:::.::::.:... :: .. .. ::.: . .::: :::: . :.::.. CCDS55 LLDEERSRLYVGAKDHIFSFDLVNI-KDFQKIVWPVSYTRRDECKWAGKDILKECANFIK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 VIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMID-SKCESGKGRCSFNPNVNTVS :....:.::::.::.::: :.:::.. :.. ::..: .. :. :.:.:. ..:.. :.: CCDS55 VLKAYNQTHLYACGTGAFHPICTYIEIGHHPEDNIFKLENSHFENGRGKSPYDPKLLTAS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPN ..:. ::.:: :::: : ::::.: ... .::.::.:.::..: :..::.: .. .:. CCDS55 LLIDGELYSGTAADFMGRDFAIFRTLGHHHPIRTEQHDSRWLNDPKFISAHLISESDNPE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 DAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED : ::::::.:. :...: : :. :..:: :: :: :::::::::::::::.::: . CCDS55 DDKVYFFFRENAIDGEHSGKATHARIGQICKNDFGGHRSLVNKWTTFLKARLICSVPGPN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 GPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHK : .::::::.::::.. .:.. .:::.:::::..:::::::.: .::.. :: ::.::. CCDS55 GIDTHFDELQDVFLMNFKDPKNPVVYGVFTTSSNIFKGSAVCMYSMSDVRRVFLGPYAHR 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 EGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHK .:::.: . ::::.:::::::::. .: .. .::..::::.:: :.:: ::: ..:... CCDS55 DGPNYQWVPYQGRVPYPRPGTCPSKTFG-GFDSTKDLPDDVITFARSHPAMYNPVFPMNN 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 RPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVS-GELILE ::.... ..:..:.:.::::.: ::.: :.:.::: ::: ::: .: .. . :..:: CCDS55 RPIVIKTDVNYQFTQIVVDRVDAEDGQYDVMFIGTDVGTVLKVVSIPKETWYDLEEVLLE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 ELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWD :. ::.. . :..:..:.:.::::..:. ::.:. :::: ::: :::.:::::::::::: CCDS55 EMTVFREPTAISAMELSTKQQQLYIGSTAGVAQLPLHRCDIYGKACAECCLARDPYCAWD 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 GHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAA--EIVQYGVKNNTTFLECA : .:::..::.:::.::::.:.:.:::.: .. ... . : . :::.:..:::::. CCDS55 GSACSRYFPTAKRRTRRQDIRNGDPLTHCSDLHHDNHHGHSPEERIIYGVENSSTFLECS 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB7 PKSPQASIKWLLQK-DKDRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQ ::: .: . : .:. ...:..:......:: :.::::.::.: .:.: : : :.:..: : CCDS55 PKSQRALVYWQFQRRNEERKEEIRVDDHIIRTDQGLLLRSLQQKDSGNYLCHAVEHGFIQ 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 pF1KB7 TIAKINFKVLDSEMVAVVT----DKWSPWTWASSVRALPFHP---KDIMGAFSHSEMQMI :. :....:.:.: . . : . : : : . .:.: ..: ... . CCDS55 TLLKVTLEVIDTEHLEELLHKDDDGDGSKTKEMSNSMTPSQKVWYRDFMQLINHPNLNTM 660 670 680 690 700 710 710 720 730 740 750 pF1KB7 NQYCKDT--RQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES ...:... :...:. .. . :. .: : : ...:.::::.. CCDS55 DEFCEQVWKRDRKQRRQRPGHTPGNSNKWKHLQENKKGRNRRTHEFERAPRSV 720 730 740 750 760 770 >>CCDS2811.1 SEMA3F gene_id:6405|Hs108|chr3 (785 aa) initn: 2238 init1: 1744 opt: 2358 Z-score: 2594.5 bits: 490.8 E(32554): 3.4e-138 Smith-Waterman score: 2790; 52.4% identity (78.8% similar) in 761 aa overlap (28-751:31-785) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRIL :: :.: ::. : :...:.. . ::::: CCDS28 MLVAGLLLWASLLTGAWPSFPTQDHLPATPRVRLSFKELKATGTAHFFNFLLNTTDYRIL 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 LMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVR : :::.::.::::::..:::....:..: : . : :: ..::: ..::: . :::::: CCDS28 LKDEDHDRMYVGSKDYVLSLDLHDINREPLIIHWAASPQRIEECVLSGKDVNGECGNFVR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 pF1KB7 VIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSE---------------------------- .:: .:::::::::.::..:.:::.:::::.. CCDS28 LIQPWNRTHLYVCGTGAYNPMCTYVNRGRRAQATPWTQTQAVRGRGSRATDGALRPMPTA 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 ---DQVFMIDS-KCESGKGRCSFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKR : .:... . :::::.: ..:...:.:..:::::..:.:::::::::::::.: :. CCDS28 PRQDYIFYLEPERLESGKGKCPYDPKLDTASALINEELYAGVYIDFMGTDAAIFRTLGKQ 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 NAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARI .:.::::.::.::..: :. :..:::... :: :.::::.:. .. .: ... :.:: CCDS28 TAMRTDQYNSRWLNDPSFIHAELIPDSAERNDDKLYFFFRERSAEAPQSPA-VYARIGRI 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 CPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIF : :: :: :::::.::::::::::: ::: :::::::.:::. .:.. :. ..:..: CCDS28 CLNDDGGHCCLVNKWSTFLKARLVCSVPGEDGIETHFDELQDVFVQQTQDVRNPVIYAVF 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 TTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTP :.:.:::.::::::: ..::. :::::::::::::.: . ..:..:::::::::::.::: CCDS28 TSSGSVFRGSAVCVYSMADIRMVFNGPFAHKEGPNYQWMPFSGKMPYPRPGTCPGGTFTP 360 370 380 390 400 410 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 NMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYH .:..::..::.:..:.:.:::::...::...:::.:: :. :. : ::::.:.::::::. CCDS28 SMKSTKDYPDEVINFMRSHPLMYQAVYPLQRRPLVVRTGAPYRLTTIAVDQVDAADGRYE 420 430 440 450 460 470 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 VLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGELILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEG ::::::::::::::.::: ... ::.:::.::::. ::. :: ::::.:::::.: : CCDS28 VLFLGTDRGTVQKVIVLPKDDQELEELMLEEVEVFKDPAPVKTMTISSKRQQLYVASAVG 480 490 500 510 520 530 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 VSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCR :...:::::. ::.:::::::::::::::::..:::. ..::::::::::::::. ::: CCDS28 VTHLSLHRCQAYGAACADCCLARDPYCAWDGQACSRYTASSKRRSRRQDVRHGNPIRQCR 540 550 560 570 580 590 570 580 590 600 610 620 pF1KB7 GFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQASIKWLLQKDK-DRRKEVKLNERIIAT ::: .: .::.: ::::: ....:::: :.::::..:::.:.: :::.:.. ..:.. : CCDS28 GFNSNANKNAVESVQYGVAGSAAFLECQPRSPQATVKWLFQRDPGDRRREIRAEDRFLRT 600 610 620 630 640 650 630 640 650 660 670 680 pF1KB7 SQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTIAKINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVR ::::.:..: ::.::: : ::::.::.........:: . : .. . : . .. CCDS28 EQGLLLRALQLSDRGLYSCTATENNFKHVVTRVQLHVLGRDAVHAAL--FPPLSMSAPPP 660 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 740 pF1KB7 --ALPFHP--KDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRK : : : ... ... :. .:.:::. .: : . . ...: CCDS28 PGAGPPTPPYQELAQLLAQPEVGLIHQYCQG-YWRHV--PPSPREAPGAPRSPEPQDQKK 720 730 740 750 760 770 750 pF1KB7 SRNRRNQLPES ::::.. :.. CCDS28 PRNRRHHPPDT 780 >>CCDS34676.1 SEMA3D gene_id:223117|Hs108|chr7 (777 aa) initn: 2189 init1: 1497 opt: 2348 Z-score: 2583.6 bits: 488.8 E(32554): 1.4e-137 Smith-Waterman score: 2348; 46.2% identity (75.7% similar) in 738 aa overlap (19-747:34-765) 10 20 30 40 pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICSICVKGS-SQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSL : :. .: :. ::. .: ... : CCDS34 NKDERLKARSQDFHLFPALMMLSMTMLFLPVTGTLKQNIPRLKLTYKDLLLSNSCIPFLG 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 SHHPLDYRILLMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKD : . ::.. ::.::.. :. .:.::::. :.. ..... ...:::. .:: ::.:::: CCDS34 SSEGLDFQTLLLDEERGRLLLGAKDHIFLLSLVDLNKNFKKIYWPAAKERVELCKLAGKD 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 PTHGCGNFVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMIDSKC-ESGKGRC . :.::.::.: .:.::.::::.::: :.: :.. : .:: .: .:.. :::. .: CCDS34 ANTECANFIRVLQPYNKTHIYVCGTGAFHPICGYIDLGVYKEDIIFKLDTHNLESGRLKC 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 SFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTK---RNAVRTDQHNSKWLSEPMF :.:. .::: .: :.:: ::.: :.:. ::: .. .::: . ::. : CCDS34 PFDPQQPFASVMTDEYLYSGTASDFLGKDTAFTRSLGPTHDHHYIRTDISEHYWLNGAKF 190 200 210 220 230 240 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 VDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTF . . ::: .:.: :.::::.:. ... : : : : ..:.: ::.:: :::.:::::: CCDS34 IGTFFIPDTYNPDDDKIYFFFRESSQEGSTSDKTILSRVGRVCKNDVGGQRSLINKWTTF 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 LKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLS :::::.::. :: .:.::::.:..:: : . :. .:::.:::.::.::::::::: .. CCDS34 LKARLICSIPGSDGADTYFDELQDIYLLPTRDERNPVVYGVFTTTSSIFKGSAVCVYSMA 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 pF1KB7 DIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRN ::..:::::.::::. .:. ..:.::::::::::::. .. : ...:..:::::..::. CCDS34 DIRAVFNGPYAHKESADHRWVQYDGRIPYPRPGTCPSKTYDPLIKSTRDFPDDVISFIKR 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 pF1KB7 HPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLP : .::.:.::. : . ::..::. :.:.::.: : ::.: :.::::: ::: ::: . CCDS34 HSVMYKSVYPVAGGPTFKRINVDYRLTQIVVDHVIAEDGQYDVMFLGTDIGTVLKVVSIS 430 440 450 460 470 480 470 480 490 500 510 520 pF1KB7 TNNSVSGELILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACAD .. :..::::..::. . : .:..: :.::::..: .:. :.::::: :: :::: CCDS34 KEKWNMEEVVLEELQIFKHSSIILNMELSLKQQQLYIGSRDGLVQLSLHRCDTYGKACAD 490 500 510 520 530 540 530 540 550 560 570 580 pF1KB7 CCLARDPYCAWDGHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLK-AYRNAAEIVQYG :::::::::::::..:::. ::.:::.:::::..:.:.::: .. . ....: : : .: CCDS34 CCLARDPYCAWDGNACSRYAPTSKRRARRQDVKYGDPITQCWDIEDSISHETADEKVIFG 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 640 pF1KB7 VKNNTTFLECAPKSPQASIKWLLQKDKDR-RKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLY .. :.::::: ::: ::.::: .:.. :. :.:.: .:::: : ::::::.: .:.:.: CCDS34 IEFNSTFLECIPKSQQATIKWYIQRSGDEHREELKPDERIIKTEYGLLIRSLQKKDSGMY 610 620 630 640 650 660 650 660 670 680 690 700 pF1KB7 HCIATENSFKQTIAKINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALP-FHPKDIMGAFSHS .: : :..: .::.:....:...:.. . .... : .. :: . .: CCDS34 YCKAQEHTFIHTIVKLTLNVIENEQMENTQRAEHEEGKVKDLLAESRLRYKDYIQILSSP 670 680 690 700 710 720 710 720 730 740 750 pF1KB7 EMQMINQYCKDTRQQHQQGDESQKMRGDYG-KLKALINSRKSRNRRNQLPES .... .:::. .. :. :....:. : : : . . .:.::::.. CCDS34 NFSL-DQYCE--QMWHR---EKRRQRNKGGPKWKHMQEMKKKRNRRHHRDLDELPRAVAT 730 740 750 760 770 >>CCDS34674.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 (775 aa) initn: 2164 init1: 1242 opt: 2217 Z-score: 2439.4 bits: 462.1 E(32554): 1.5e-129 Smith-Waterman score: 2235; 45.8% identity (74.5% similar) in 707 aa overlap (22-710:28-730) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDY ...: :. :. :: . . . : :: CCDS34 MASAGHIITLLLWGYLLELWTGGHTADTTHP--RLRLSHKELLNLNRTSIFHSPFGFLDL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 RILLMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGN . .:.:: :.:..::..: . ::... ::. . ::....:.::: : ::: . :.: CCDS34 HTMLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLERISDGYKEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGE-CAN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 FVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMIDS-KCESGKGRCSFNPNVN .:::.. .::::: .::.:::.:::... : . :: .: ..: . : :.::: :.:. . CCDS34 YVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGYHLEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSS 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 TVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGT .:..:. :::.:.: :. . :::::::. . .::.. . . :.:: :: ...:::. CCDS34 FISTLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRLAHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNE 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 DPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVT : .: :::::: :: . . ... :.. ..:.: ::.:: : :::::.::::::::::: CCDS34 DRDDNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRLCVNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVP 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 DEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPF .: .:.:::::::::: : . .. ...:.:.:.:..:.: :.::::.:.:...::::. CCDS34 GMNGIDTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLFNTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPY 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 AHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYP ::::::... :.:..::::::.: . . . :::..:::.. : :.:::::..: : CCDS34 AHKEGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGGRYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKP 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 IHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGE-L ::.:..:. :. .::::::.: ::.: :::.::: : : ::... ... : : . CCDS34 AHKKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYDVLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEV 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 ILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYC :::::..::. .:: .:.::::.::::..: .:.:: .:.: .::.::::::::::::: CCDS34 ILEELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSASAVAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYC 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 pF1KB7 AWDGHSCSRFYPTG---KRRSRRQDVRHGNPLTQCRG--FNLKAYRNAAEIVQYGVKNNT :::: ::::.:::: ::: ::::::::: :: : : : .. : . ::..::. CCDS34 AWDGISCSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAAQQCFGQQFVGDALDKTEEHLAYGIENNS 540 550 560 570 580 590 590 600 610 620 630 640 pF1KB7 TFLECAPKSPQASIKWLLQKDKDRRKE-VKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIAT :.:::.:.: ::.. :..:: .. ::: :: ..:.. . :::. .. :: : : : .. CCDS34 TLLECTPRSLQAKVIWFVQKGRETRKEEVKTDDRVVKMDLGLLFLRLHKSDAGTYFCQTV 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 pF1KB7 ENSFKQTIAKINFKVLDSEMVAVVTDKWS--------PWTWASSVR--ALPFHPKDIMGA :.:: .:. ::...:.. : : . .: . : ::. : :.. :... CCDS34 EHSFVHTVRKITLEVVEEEKVEDMFNKDDEEDRHHRMPCPAQSSISQGAKPWY-KEFLQL 660 670 680 690 700 710 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 FSHSEMQMINQYCKDTRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKALINSRKSRNRRNQLPES ...:..: ...::. CCDS34 IGYSNFQRVEEYCEKVWCTDRKRKKLKMSPSKWKYANPQEKKLRSKPEHYRLPRHTLDS 720 730 740 750 760 770 >>CCDS74941.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 (749 aa) initn: 1168 init1: 1036 opt: 2208 Z-score: 2429.7 bits: 460.3 E(32554): 5.1e-129 Smith-Waterman score: 2213; 45.9% identity (73.9% similar) in 737 aa overlap (21-750:22-736) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQA-RVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILL ::. :. :. :.:.::. . . ::: .. :. :: CCDS74 MGRAGAAAVIPGLALLWAVGLGSAAPSPPRLRLSFQELQAWHGLQTFSL-ERTCCYQALL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 MDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRV .::.. :..::...:. :::..:::..: .. ::: . :::. :::: : :::.. CCDS74 VDEERGRLFVGAENHVASLNLDNISKRAKKLAWPAPVEWREECNWAGKDIGTECMNFVKL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 IQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMID-SKCESGKGRCSFNPNVNTVSV ....::::: .::.::: :.:.... :.:.:. :. .: .. :.:::. ..: ..:: CCDS74 LHAYNRTHLLACGTGAFHPTCAFVEVGHRAEEPVLRLDPGRIEDGKGKSPYDPRHRAASV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 MINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPND ...:::.::. :.:: : .::::: .: ..::. :.:.::.:: :: . ::.. .:.: CCDS74 LVGEELYSGVAADLMGRDFTIFRSLGQRPSLRTEPHDSRWLNEPKFVKVFWIPESENPDD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 AKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIH-SMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED :.::::.: .. . .. : ...:: ::.:: ::::::::::::::::::: . CCDS74 DKIYFFFRETAVEAAPALGRLSVSRVGQICRNDVGGQRSLVNKWTTFLKARLVCSVPGVE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 GPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHK : .::::.:.::::: . . :: :.:..:.::::.:.::::::: ..:.. .: :::::: CCDS74 G-DTHFDQLQDVFLLSSRDHRTPLLYAVFSTSSSIFQGSAVCVYSMNDVRRAFLGPFAHK 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 EGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHK ::: :: .:::::.:::::: ::. .: .. .::.:::::. : :::::::::. : CCDS74 EGPMHQWVSYQGRVPYPRPGMCPSKTFG-TFSSTKDFPDDVIQFARNHPLMYNSVLPTGG 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 RPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGE-LILE :::....:..: .:.::.::: ::::.: :::.::: ::: ::. .: .. :.: :.:: CCDS74 RPLFLQVGANYTFTQIAADRVAAADGHYDVLFIGTDVGTVLKVISVPKGSRPSAEGLLLE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 ELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWD ::.::.. : .:.:.::::..::::.: .:.:..:::: .: .:..:::::::::::: CCDS74 ELHVFEDSAAVTSMQISSKRHQLYVASRSAVAQIALHRCAAHGRVCTECCLARDPYCAWD 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 GHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPK : .:.:: :..::: ::::::.:.: : : : . . .. .::.....:::: :. CCDS74 GVACTRFQPSAKRRFRRQDVRNGDPSTLCSGDSSRPALLEHKV--FGVEGSSAFLECEPR 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 pF1KB7 SPQASIKWLLQKDK-DRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENSFKQTI : :: ..: .:. . .: .:: :..:::.: .. :.:.: : :.:..: : . CCDS74 SLQARVEWTFQRAGVTAHTQVLAEERTERTARGLLLRRLRRRDSGVYLCAAVEQGFTQPL 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 pF1KB7 AKINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALPFHPKDIMGAFSHSEMQMINQYCKDTRQ .....::. :. ... . :. : : :: . : .:... . . CCDS74 RRLSLHVLS----ATQAERLARAEEAAP--AAPPGPKLWYRDF----LQLVEPGGGGSAN 660 670 680 690 700 720 730 740 750 pF1KB7 QHQQGDESQKMRGDYGKLKAL-INSR-KSRNRRNQLPES : .: :..: ..:: :.::::.. :: CCDS74 -------SLRMCRPQPALQSLPLESRRKGRNRRTHAPEPRAERGPRSATHW 710 720 730 740 >>CCDS77743.1 SEMA3B gene_id:7869|Hs108|chr3 (754 aa) initn: 1685 init1: 741 opt: 2192 Z-score: 2412.1 bits: 457.0 E(32554): 4.9e-128 Smith-Waterman score: 2197; 45.7% identity (73.5% similar) in 742 aa overlap (21-750:22-741) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MAFRTICVLVGVFICSICVKGSSQPQA-RVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILL ::. :. :. :.:.::. . . ::: .. :. :: CCDS77 MGRAGAAAVIPGLALLWAVGLGSAAPSPPRLRLSFQELQAWHGLQTFSL-ERTCCYQALL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 MDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEALSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRV .::.. :..::...:. :::..:::..: .. ::: . :::. :::: : :::.. CCDS77 VDEERGRLFVGAENHVASLNLDNISKRAKKLAWPAPVEWREECNWAGKDIGTECMNFVKL 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 IQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGRRSEDQVFMID-SKCESGKGRCSFNPNVNTVSV ....::::: .::.::: :.:.... :.:.:. :. .: .. :.:::. ..: ..:: CCDS77 LHAYNRTHLLACGTGAFHPTCAFVEVGHRAEEPVLRLDPGRIEDGKGKSPYDPRHRAASV 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 MINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKRNAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPND ...:::.::. :.:: : .::::: .: ..::. :.:.::.:: :: . ::.. .:.: CCDS77 LVGEELYSGVAADLMGRDFTIFRSLGQRPSLRTEPHDSRWLNEPKFVKVFWIPESENPDD 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 AKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIH-SMIARICPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDED :.::::.: .. . .. : ...:: ::.:: ::::::::::::::::::: . CCDS77 DKIYFFFRETAVEAAPALGRLSVSRVGQICRNDVGGQRSLVNKWTTFLKARLVCSVPGVE 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 GPETHFDEL-----EDVFLLETDNPRTTLVYGIFTTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNG : .::::.: :::::: . . :: :.:..:.::::.:.::::::: ..:.. .: : CCDS77 G-DTHFDQLRPFPAEDVFLLSSRDHRTPLLYAVFSTSSSIFQGSAVCVYSMNDVRRAFLG 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 PFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTPNMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSI :::::::: :: .:::::.:::::: ::. .: .. .::.:::::. : :::::::::. CCDS77 PFAHKEGPMHQWVSYQGRVPYPRPGMCPSKTFG-TFSSTKDFPDDVIQFARNHPLMYNSV 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 YPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYHVLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGE : :::....:..: .:.::.::: ::::.: :::.::: ::: ::. .: .. :.: CCDS77 LPTGGRPLFLQVGANYTFTQIAADRVAAADGHYDVLFIGTDVGTVLKVISVPKGSRPSAE 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 -LILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNEGVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDP :.::::.::.. : .:.:.::::..::::.: .:.:..:::: .: .:..::::::: CCDS77 GLLLEELHVFEDSAAVTSMQISSKRHQLYVASRSAVAQIALHRCAAHGRVCTECCLARDP 480 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 pF1KB7 YCAWDGHSCSRFYPTGKRRSRRQDVRHGNPLTQCRGFNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFL :::::: .:.:: :..::: ::::::.:.: : : : . . .. .::.....:: CCDS77 YCAWDGVACTRFQPSAKRRFRRQDVRNGDPSTLCSGDSSRPALLEHKV--FGVEGSSAFL 540 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 pF1KB7 ECAPKSPQASIKWLLQKDK-DRRKEVKLNERIIATSQGLLIRSVQGSDQGLYHCIATENS :: :.: :: ..: .:. . .: .:: :..:::.: .. :.:.: : :.:.. CCDS77 ECEPRSLQARVEWTFQRAGVTAHTQVLAEERTERTARGLLLRRLRRRDSGVYLCAAVEQG 600 610 620 630 640 650 650 660 670 680 690 700 pF1KB7 FKQTIAKINFKVLDSEMVAVVTDKWSPWTWASSVRALPFHPKDIMGAFSHSEMQMINQYC : : . .....::. :. ... . :. : : :: . : .:... CCDS77 FTQPLRRLSLHVLS----ATQAERLARAEEAAP--AAPPGPKLWYRDF----LQLVEPGG 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 pF1KB7 KDTRQQHQQGDESQKMRGDYGKLKAL-INSR-KSRNRRNQLPES . . : .: :..: ..:: :.::::.. :: CCDS77 GGSAN-------SLRMCRPQPALQSLPLESRRKGRNRRTHAPEPRAERGPRSATHW 710 720 730 740 750 >>CCDS55121.1 SEMA3E gene_id:9723|Hs108|chr7 (715 aa) initn: 2140 init1: 1218 opt: 2191 Z-score: 2411.4 bits: 456.8 E(32554): 5.4e-128 Smith-Waterman score: 2209; 47.0% identity (75.9% similar) in 672 aa overlap (57-710:1-670) 30 40 50 60 70 80 pF1KB7 ARVYLTFDELRETKTSEYFSLSHHPLDYRILLMDEDQDRIYVGSKDHILSLNINNISQEA .:.:: :.:..::..: . ::... ::. CCDS55 MLLDEYQERLFVGGRDLVYSLSLERISDGY 10 20 30 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 LSVFWPASTIKVEECKMAGKDPTHGCGNFVRVIQTFNRTHLYVCGSGAFSPVCTYLNRGR . ::....:.::: : ::: . :.:.:::.. .::::: .::.:::.:::... : CCDS55 KEIHWPSTALKMEECIMKGKDAGE-CANYVRVLHHYNRTHLLTCGTGAFDPVCAFIRVGY 40 50 60 70 80 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 RSEDQVFMIDS-KCESGKGRCSFNPNVNTVSVMINEELFSGMYIDFMGTDAAIFRSLTKR . :: .: ..: . : :.::: :.:. . .:..:. :::.:.: :. . :::::::. . CCDS55 HLEDPLFHLESPRSERGRGRCPFDPSSSFISTLIGSELFAGLYSDYWSRDAAIFRSMGRL 90 100 110 120 130 140 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 NAVRTDQHNSKWLSEPMFVDAHVIPDGTDPNDAKVYFFFKEKLTDNNRSTKQIHSMIARI .::.. . . :.:: :: ...:::. : .: :::::: :: . . ... :.. ..:. CCDS55 AHIRTEHDDERLLKEPKFVGSYMIPDNEDRDDNKVYFFFTEKALEAENNAHAIYTRVGRL 150 160 170 180 190 200 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 CPNDTGGLRSLVNKWTTFLKARLVCSVTDEDGPETHFDELEDVFLLETDNPRTTLVYGIF : ::.:: : :::::.::::::::::: .: .:.:::::::::: : . .. ...:.: CCDS55 CVNDVGGQRILVNKWSTFLKARLVCSVPGMNGIDTYFDELEDVFLLPTRDHKNPVIFGLF 210 220 230 240 250 260 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 TTSSSVFKGSAVCVYHLSDIQTVFNGPFAHKEGPNHQLISYQGRIPYPRPGTCPGGAFTP .:.:..:.: :.::::.:.:...::::.::::::... :.:..::::::.: . . CCDS55 NTTSNIFRGHAICVYHMSSIRAAFNGPYAHKEGPEYHWSVYEGKVPYPRPGSCASKVNGG 270 280 290 300 310 320 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 NMRTTKEFPDDVVTFIRNHPLMYNSIYPIHKRPLIVRIGTDYKYTKIAVDRVNAADGRYH . :::..:::.. : :.:::::..: : ::.:..:. :. .::::::.: ::.: CCDS55 RYGTTKDYPDDAIRFARSHPLMYQAIKPAHKKPILVKTDGKYNLKQIAVDRVEAEDGQYD 330 340 350 360 370 380 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 VLFLGTDRGTVQKVVVLPTNNSVSGE-LILEELEVFKNHAPITTMKISSKKQQLYVSSNE :::.::: : : ::... ... : : .:::::..::. .:: .:.::::.::::..: CCDS55 VLFIGTDNGIVLKVITIYNQEMESMEEVILEELQIFKDPVPIISMEISSKRQQLYIGSAS 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 GVSQVSLHRCHIYGTACADCCLARDPYCAWDGHSCSRFYPTG---KRRSRRQDVRHGNPL .:.:: .:.: .::.::::::::::::::::: ::::.:::: ::: ::::::::: CCDS55 AVAQVRFHHCDMYGSACADCCLARDPYCAWDGISCSRYYPTGTHAKRRFRRQDVRHGNAA 450 460 470 480 490 500 570 580 590 600 610 pF1KB7 TQCRG--FNLKAYRNAAEIVQYGVKNNTTFLECAPKSPQASIKWLLQKDKDRRKE-VKLN :: : : : .. : . ::..::.:.:::.:.: ::.. :..:: .. ::: :: . 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