Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7022
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7022, 972 aa
1>>>pF1KB7022 972 - 972 aa - 972 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1116+/-0.00131; mu= -7.6051+/- 0.074
mean_var=495.5579+/-117.628, 0's: 0 Z-trim(108.1): 309 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.057614
statistics sampled from 9725 (10013) to 9725 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.308), width: 16
Scan time: 3.390
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 ( 972) 6601 565.3 2e-160
CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 972) 2267 205.1 5.6e-52
CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 ( 976) 2259 204.4 8.9e-52
CCDS31953.1 FLT3 gene_id:2322|Hs108|chr13 ( 993) 1465 138.4 6.6e-32
CCDS3497.1 KDR gene_id:3791|Hs108|chr4 (1356) 1184 115.2 8.7e-25
CCDS9330.1 FLT1 gene_id:2321|Hs108|chr13 (1338) 1176 114.6 1.4e-24
CCDS43412.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1298) 1163 113.5 2.8e-24
CCDS4457.1 FLT4 gene_id:2324|Hs108|chr5 (1363) 1163 113.5 2.9e-24
CCDS3495.1 PDGFRA gene_id:5156|Hs108|chr4 (1089) 756 79.6 3.9e-14
CCDS4303.1 PDGFRB gene_id:5159|Hs108|chr5 (1106) 697 74.7 1.2e-12
CCDS3354.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 694) 639 69.6 2.5e-11
CCDS3353.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 806) 639 69.7 2.7e-11
CCDS54706.1 FGFR3 gene_id:2261|Hs108|chr4 ( 808) 639 69.7 2.7e-11
CCDS81514.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 593) 626 68.4 4.7e-11
CCDS44488.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 680) 626 68.5 5.1e-11
CCDS44485.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 704) 626 68.5 5.2e-11
CCDS44487.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 705) 626 68.5 5.2e-11
CCDS53584.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 707) 626 68.5 5.3e-11
CCDS44486.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 709) 626 68.5 5.3e-11
CCDS73210.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 732) 626 68.5 5.4e-11
CCDS44489.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 769) 626 68.6 5.5e-11
CCDS81515.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 819) 626 68.6 5.8e-11
CCDS31298.1 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 821) 626 68.6 5.8e-11
CCDS7620.2 FGFR2 gene_id:2263|Hs108|chr10 ( 822) 626 68.6 5.8e-11
CCDS53525.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1072) 627 68.8 6.5e-11
CCDS7200.1 RET gene_id:5979|Hs108|chr10 (1114) 627 68.8 6.6e-11
CCDS78096.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 734) 616 67.7 9.6e-11
CCDS4411.1 FGFR4 gene_id:2264|Hs108|chr5 ( 762) 616 67.7 9.8e-11
>>CCDS4302.1 CSF1R gene_id:1436|Hs108|chr5 (972 aa)
initn: 6601 init1: 6601 opt: 6601 Z-score: 2993.5 bits: 565.3 E(32554): 2e-160
Smith-Waterman score: 6601; 100.0% identity (100.0% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGPPSPHWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGPPSPHWTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNVLAQEVVVFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNVLAQEVVVFED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEVSVIWTFINGSGTLLCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEVSVIWTFINGSGTLLCA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 QTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEAT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 AFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEKKYVRRDSGFSSQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEKKYVRRDSGFSSQGV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 DTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 ARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 YGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 PTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIA
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB7 QPLLQPNNYQFC
::::::::::::
CCDS43 QPLLQPNNYQFC
970
>>CCDS47058.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (972 aa)
initn: 1838 init1: 822 opt: 2267 Z-score: 1046.6 bits: 205.1 E(32554): 5.6e-52
Smith-Waterman score: 2301; 42.1% identity (69.5% similar) in 932 aa overlap (21-930:37-939)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEW
: :.:. .:.:. : . : :. : :.:
CCDS47 AWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTDPGFVKW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 DGPPSPHWTLYSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNV
. ...... :..: ::: : :: . : : .:...:.:::. . .
CCDS47 TFEILDE---TNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCT---NKHGLSNSIYVFVRDPAKLF-L
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFI
. . . ::.:.:. : :::: . .. :: .:.:: . . .: :. :. .:
CCDS47 VDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEV-TNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 QSQD-YQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSV
. .::. . :..:.: .. :::. .. . :.... : . .:: ..:. ..:
CCDS47 YHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 DVN-FDVFLQHNN-TKLAIPQQSDFHNN-RYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGK
. . .... ..:. ::: .: :.. :.. ::..... . .: . : :.:. :.
CCDS47 SSSVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 HSTSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLG-PFSDH
... ..::.....:. : :. ::...: : ::.: . .: :.. :.:.
CCDS47 ANVTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 QPE-PKLANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEV
. :: : ... :.. : : ::: .:.: :.::. : :..:.. . ::.
CCDS47 WEDYPKSEN---ESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 SVIWTFINGSGTLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFH
. ..: : : :.:.:.:.:.. : : : .::. :.:: : : : ::
CCDS47 LTYDRLVN--GMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCS-ASVLPV--DVQTLNSSGPPFG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 KVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMS
:..::: . ...:: : ::.:.:.::. : :.. .. . :: . ::::.... .
CCDS47 KLVVQSSIDSSAFKHNGTVECKAYNDVGKTS-AYFNFAFKEQIHP--HTLFTPLLIGFVI
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 IMALLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQF
. ... .....: ::: ::: :.:.::..: .::.:..::::::::..::::::: :.:
CCDS47 VAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNRLSF
530 540 550 560 570 580
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pF1KB7 GKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHE
:::::::::::::::::.:: : ::.. ::::::: .:: :.::::::::..:.::.:
CCDS47 GKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLGNHM
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB7 NIVNLLGACTHGGPVLVITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHL
:::::::::: :::.::::::::::::::::::: .... : .: .. :::.
CCDS47 NIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFI---CSKQEDHAEAALYKNLLH
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740
pF1KB7 EKKYVRRDSGFSSQGVDTYVEMRP----VSTSSND--------SFSEQDLD----KEDGR
:. :: .. :..:.: : .. : :. :.:. ..:
CCDS47 SKESSCSDS------TNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMEDDEL
710 720 730 740 750
750 760 770 780 790 800
pF1KB7 PLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSN
:.:.::: :: :::.::::::::::::::.::::.:::.:...:: :::::::: ::::
CCDS47 ALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKNDSN
760 770 780 790 800 810
810 820 830 840 850 860
pF1KB7 YIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKL
:.::::::::::::::::::.:::: .::::::::.:::.:::: .::::. :.:::::.
CCDS47 YVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKFYKM
820 830 840 850 860 870
870 880 890 900 910 920
pF1KB7 VKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPS
.:.:..: .: :: ..:.::..:: .: .::::.:: .....: .:. .. :.:: .
CCDS47 IKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISEST-NHIYSNLAN
880 890 900 910 920 930
930 940 950 960 970
pF1KB7 SSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
:
CCDS47 CSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
940 950 960 970
>>CCDS3496.1 KIT gene_id:3815|Hs108|chr4 (976 aa)
initn: 1838 init1: 822 opt: 2259 Z-score: 1043.0 bits: 204.4 E(32554): 8.9e-52
Smith-Waterman score: 2293; 42.0% identity (69.0% similar) in 935 aa overlap (21-930:37-943)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEW
: :.:. .:.:. : . : :. : :.:
CCDS34 AWDFLCVLLLLLRVQTGSSQPSVSPGEPSPPSIHPGKSDLIVRVGDEIRLLCTDPGFVKW
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 DGPPSPHWTLYSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNV
. ...... :..: ::: : :: . : : .:...:.:::. . .
CCDS34 TFEILDE---TNENKQNEWITEKAEATNTGKYTCT---NKHGLSNSIYVFVRDPAKLF-L
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LAQEVVVFEDQDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFI
. . . ::.:.:. : :::: . .. :: .:.:: . . .: :. :. .:
CCDS34 VDRSLYGKEDNDTLVRCPLTDPEV-TNYSLKGCQGKPLPKDLRFIPDPKAGIMIKSVKRA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 QSQD-YQCSALMGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSV
. .::. . :..:.: .. :::. .. . :.... : . .:: ..:. ..:
CCDS34 YHRLCLHCSVDQEGKSVLSEKFILKVRPAFKAVPVVSVSKASYLLREGEEFTVTCTIKDV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 DVN-FDVFLQHNN-TKLAIPQQSDFHNN-RYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGK
. . .... ..:. ::: .: :.. :.. ::..... . .: . : :.:. :.
CCDS34 SSSVYSTWKRENSQTKLQEKYNSWHHGDFNYERQATLTISSARVNDSGVFMCYANNTFGS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 HSTSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLG-PFSDH
... ..::.....:. : :. ::...: : ::.: . .: :.. :.:.
CCDS34 ANVTTTLEVVDKGFINIFPMINTTVFVNDGENVDLIVEYEAFPKPEHQQWIYMNRTFTDK
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 QPE-PKLANATTKDTYRHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEV
. :: : ... :.. : : ::: .:.: :.::. : :..:.. . ::.
CCDS34 WEDYPKSEN---ESNIRYVSELHLTRLKGTEGGTYTFLVSNSDVNAAIAFNVYVNTKPEI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 SVIWTFINGSGTLLCAASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFH
. ..: : : :.:.:.:.:.. : : : .::. :.:: : : : ::
CCDS34 LTYDRLVN--GMLQCVAAGFPEPTIDWYFCPGTEQRCS-ASVLPV--DVQTLNSSGPPFG
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 KVTVQSLLTVETLEHNQTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHT---HPPDEFLFTPVVVA
:..::: . ...:: : ::.:.:.::. : : : . :: . ::::....
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. . ... .....: ::: ::: :.:.::..: .::.:..::::::::..:::::::
CCDS34 FVIVAGMMCIIVMILTYKYLQKPMYEVQWKVVEEINGNNYVYIDPTQLPYDHKWEFPRNR
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pF1KB7 LQFGKTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLG
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CCDS34 LSFGKTLGAGAFGKVVEATAYGLIKSDAAMTVAVKMLKPSAHLTEREALMSELKVLSYLG
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CCDS34 NHMNIVNLLGACTIGGPTLVITEYCCYGDLLNFLRRKRDSFI---CSKQEDHAEAALYKN
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CCDS34 LLHSKESSCSDS------TNEYMDMKPGVSYVVPTKADKRRSVRIGSYIERDVTPAIMED
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CCDS34 DELALDLEDLLSFSYQVAKGMAFLASKNCIHRDLAARNILLTHGRITKICDFGLARDIKN
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CCDS34 DSNYVVKGNARLPVKWMAPESIFNCVYTFESDVWSYGIFLWELFSLGSSPYPGMPVDSKF
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CCDS34 YKMIKEGFRMLSPEHAPAEMYDIMKTCWDADPLKRPTFKQIVQLIEKQISEST-NHIYSN
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: . :
CCDS34 LANCSPNRQKPVVDHSVRINSVGSTASSSQPLLVHDDV
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240 250 260 270 280
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pF1KB7 LLLLLLLLLLYKYKQKPKYQVRWKIIE--SYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFG
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pF1KB7 KTLGAGAFGKVVEATAFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHEN
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CCDS31 KVLGSGAFGKVMNATAYGISKTGVSIQVAVKMLKEKADSSEREALMSELKMMTQLGSHEN
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CCDS31 IVNLLGACTLSGPIYLIFEYCCYGDLLNYLRSKREKFHRTWTEIFKEHNFSF-YPTFQSH
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pF1KB7 KKYVRRDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSNDSF-SEQDLDKEDGRPLE---------LRDL
. .: .:. :. . . .: ..:: ::.... :. . :: ..::
CCDS31 PN----SSMPGSREVQIHPDSDQISGLHGNSFHSEDEIEYENQKRLEEEEDLNVLTFEDL
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pF1KB7 LHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNA
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CCDS31 LCFAYQVAKGMEFLEFKSCVHRDLAARNVLVTHGKVVKICDFGLARDIMSDSNYVVRGNA
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pF1KB7 RLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQM
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CCDS31 RLPVKWMAPESLFEGIYTIKSDVWSYGILLWEIFSLGVNPYPGIPVDANFYKLIQNGFKM
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pF1KB7 AQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGS
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CCDS31 DQPFYATEEIYIIMQSCWAFDSRKRPSFPNLTSFLGCQLA-DAEEAMYQNVDGRVSECPH
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pF1KB7 GSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
CCDS31 TYQNRRPFSREMDLGLLSPQAQVEDS
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CCDS34 VIAMFFWLLLVIILRTVKRANGGELK-------TGYLSIVMDPDELPLDEHCERLPYDAS
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CCDS34 LKILIHIGHHLNVVNLLGACTKPGGPLMVIVEFCKFGNLSTYLRSKRNEFV-PYKTKGAR
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CCDS34 FRQGKDYVGAIPVDLKR-RLDSITSSQSSASSGFVEEKSLSDVEEEEAPE-DLYKD---F
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pF1KB7 LELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNY
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CCDS34 LTLEHLICYSFQVAKGMEFLASRKCIHRDLAARNILLSEKNVVKICDFGLARDIYKDPDY
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pF1KB7 IVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLV
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CCDS34 VRKGDARLPLKWMAPETIFDRVYTIQSDVWSFGVLLWEIFSLGASPYPGVKIDEEFCRRL
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pF1KB7 KDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHRPTFQQIC----SFLQEQAQEDRRERDYTN
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CCDS34 KEGTRMRAPDYTTPEMYQTMLDCWHGEPSQRPTFSELVEHLGNLLQANAQQDGK--DYIV
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pF1KB7 LPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
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CCDS34 LPISETL--SMEEDSGLSLPTSP--VSCMEEEEVCDPKFHYDNTAGISQYLQNSKRKSRP
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CCDS34 VSVKTFEDIPLEEPEVKVIPDDNQTDSGMVLASEELKTLEDRTKLSPSFGGMVPSKSRES
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pF1KB7 SISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHNNTKLAIP
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CCDS93 GSRQILTCTAYGIPQPTIKWFWHPCNHNHSEARCDFCSNNEESFILDADSNMGNRIESIT
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CCDS93 QRMAIIEGKNKMASTLVV--ADSRISGIYICIASNKVGTVGRNISFYITD---VPNGFHV
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CCDS93 LTIMNVSLQDSGTYACRARNVYTGEEILQKKEITIRDQEAPYLLRNLSDHTVAISSSTTL
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CCDS93 DCHANGVPEPQITWFK-NNHKIQQEPGIIL----GPGSSTLFIE---RV---------TE
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CCDS93 FIRKMKRSSSEIKTDYLSIIMDPDEVPLDEQCERLPYDASKWEFARERLKLGKSLGRGAF
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CCDS93 GKVVQASAFGIKKSPTCRTVAVKMLKEGATASEYKALMTELKILTHIGHHLNVVNLLGAC
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CCDS93 TKQGGPLMVIVEYCKYGNLSNYLKSKRDLFFLNKDAALHMEPKK--EKMEPGLEQGKKPR
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pF1KB7 RDSGFSSQGVDTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLA
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CCDS93 LDSVTSSESFASSGFQEDKSLS--DVEEEEDSDGFYKEPITMEDLISYSFQVARGMEFLS
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pF1KB7 SKNCIHRDVAARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDC
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CCDS93 SRKCIHRDLAARNILLSENNVVKICDFGLARDIYKNPDYVRKGDTRLPLKWMAPESIFDK
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pF1KB7 VYTVQSDVWSYGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQ
.:...:::::::.::::::::: .::::. .. : . ...:..: : .. .::.::
CCDS93 IYSTKSDVWSYGVLLWEIFSLGGSPYPGVQMDEDFCSRLREGMRMRAPEYSTPEIYQIML
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pF1KB7 ACWALEPTHRPTF----QQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEES
:: .: .:: : ... ..:: ..:.: . :: . .. .:.:: . :
CCDS93 DCWHRDPKERPRFAELVEKLGDLLQANVQQDGK--DYIPI-NAILTGNSGFTYSTPAFSE
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pF1KB7 SSEHLTCCEQGDIAQPLLQPNNYQFC
CCDS93 DFFKESISAPKFNSGSSDDVRYVNAFKFMSLERIKTFEELLPNATSMFDDYQGDSSTLLA
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pF1KB7 AQIVCSASSVDVNFDVFLQHNNTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCV
..: ... . : : ..... .. :.::
CCDS43 QQQDLMPQCRDWRAVTTQDAVNPIESLDTWTEFVEGKNKTVSKLVIQNANV--SAMYKCV
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pF1KB7 ASNVQGKHSTSMFFRVVESAYLNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYL
.:: :. ..: :. . ... :.. .:. :. . :. ....: . . : :
CCDS43 VSNKVGQDERLIYFYVT-TIPDGFTIESKPSEELLEGQPVLLSCQADSYK-YEHLRWYRL
540 550 560 570 580 590
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pF1KB7 G--PFSDHQPEPKLANATTKDTY---------------RH-TFTLSLPRLKPSEAGRY--
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