Result of FASTA (omim) for
pF1KB7022
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7022, 972 aa
1>>>pF1KB7022 972 - 972 aa - 972 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9826+/-0.000626; mu= 0.9924+/- 0.038
mean_var=802.7508+/-188.948, 0's: 0 Z-trim(115.5): 684 B-trim: 1522 in 1/55
Lambda= 0.045267
statistics sampled from 25332 (26052) to 25332 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.646), E-opt: 0.2 (0.305), width: 16
Scan time: 9.610
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001275634 (OMIM: 164770,221820) macrophage colo ( 972) 6601 448.9 5.8e-125
NP_005202 (OMIM: 164770,221820) macrophage colony- ( 972) 6601 448.9 5.8e-125
XP_016863669 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 971) 2274 166.4 6.7e-40
XP_016863668 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 972) 2272 166.2 7.4e-40
NP_001087241 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 972) 2267 165.9 9.3e-40
XP_016863667 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 975) 2266 165.8 9.7e-40
XP_005265799 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 973) 2265 165.8 1e-39
XP_005265798 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 976) 2264 165.7 1.1e-39
NP_000213 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60676 ( 976) 2259 165.4 1.3e-39
XP_005265797 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 977) 2257 165.2 1.5e-39
XP_016875975 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 921) 1475 114.1 3.4e-24
XP_016875978 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 694) 1465 113.3 4.7e-24
XP_016875977 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 700) 1465 113.3 4.7e-24
XP_011533319 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 818) 1465 113.4 5e-24
XP_011533320 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 818) 1465 113.4 5e-24
XP_016875976 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 818) 1465 113.4 5e-24
XP_011533317 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 974) 1465 113.5 5.4e-24
NP_004110 (OMIM: 136351,613065) receptor-type tyro ( 993) 1465 113.5 5.5e-24
NP_002244 (OMIM: 191306,602089) vascular endotheli (1356) 1184 95.4 2.1e-18
NP_002010 (OMIM: 165070) vascular endothelial grow (1338) 1176 94.9 3e-18
XP_011532786 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1210) 1163 94.0 5.2e-18
NP_002011 (OMIM: 136352,153100,602089) vascular en (1298) 1163 94.0 5.3e-18
XP_016864757 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1337) 1163 94.0 5.4e-18
NP_891555 (OMIM: 136352,153100,602089) vascular en (1363) 1163 94.1 5.5e-18
XP_016864755 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1375) 1163 94.1 5.5e-18
XP_016864756 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1375) 1163 94.1 5.5e-18
XP_016864752 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1385) 1163 94.1 5.5e-18
XP_016864754 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1385) 1163 94.1 5.5e-18
XP_016864753 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1385) 1163 94.1 5.5e-18
XP_011532780 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1440) 1163 94.1 5.6e-18
XP_016863771 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE ( 807) 950 79.7 6.6e-14
XP_016863770 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE ( 820) 950 79.8 6.7e-14
XP_006714104 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE ( 832) 950 79.8 6.7e-14
XP_016875974 (OMIM: 165070) PREDICTED: vascular en (1300) 763 67.9 3.9e-10
NP_006197 (OMIM: 173490,606764,607685) platelet-de (1089) 756 67.3 5e-10
XP_005265800 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE (1089) 756 67.3 5e-10
XP_011532687 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE (1089) 756 67.3 5e-10
XP_016863769 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE (1102) 756 67.3 5e-10
XP_006714102 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE (1114) 756 67.3 5e-10
XP_005268521 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,60 (1042) 697 63.4 7e-09
NP_002600 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,60181 (1106) 697 63.5 7.2e-09
XP_011535960 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,60 (1106) 697 63.5 7.2e-09
XP_011535961 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,60 (1106) 697 63.5 7.2e-09
XP_006713936 (OMIM: 100800,109800,114500,134934,14 ( 807) 651 60.2 5e-08
XP_011511724 (OMIM: 100800,109800,114500,134934,14 ( 808) 651 60.2 5e-08
XP_006713934 (OMIM: 100800,109800,114500,134934,14 ( 809) 651 60.2 5e-08
XP_011511722 (OMIM: 100800,109800,114500,134934,14 ( 809) 651 60.2 5e-08
XP_006713933 (OMIM: 100800,109800,114500,134934,14 ( 810) 651 60.2 5e-08
XP_006713931 (OMIM: 100800,109800,114500,134934,14 ( 811) 651 60.2 5e-08
NP_075254 (OMIM: 100800,109800,114500,134934,14600 ( 694) 639 59.3 8.1e-08
>>NP_001275634 (OMIM: 164770,221820) macrophage colony-s (972 aa)
initn: 6601 init1: 6601 opt: 6601 Z-score: 2364.5 bits: 448.9 E(85289): 5.8e-125
Smith-Waterman score: 6601; 100.0% identity (100.0% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGPPSPHWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGPPSPHWTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNVLAQEVVVFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNVLAQEVVVFED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEVSVIWTFINGSGTLLCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEVSVIWTFINGSGTLLCA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHN
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 QTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 KQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEAT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 AFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVL
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670 680 690 700 710 720
pF1KB7 VITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEKKYVRRDSGFSSQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEKKYVRRDSGFSSQGV
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730 740 750 760 770 780
pF1KB7 DTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVA
730 740 750 760 770 780
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pF1KB7 ARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 YGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHR
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB7 PTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTFQQICSFLQEQAQEDRRERDYTNLPSSSRSGGSGSSSSELEEESSSEHLTCCEQGDIA
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB7 QPLLQPNNYQFC
::::::::::::
NP_001 QPLLQPNNYQFC
970
>>NP_005202 (OMIM: 164770,221820) macrophage colony-stim (972 aa)
initn: 6601 init1: 6601 opt: 6601 Z-score: 2364.5 bits: 448.9 E(85289): 5.8e-125
Smith-Waterman score: 6601; 100.0% identity (100.0% similar) in 972 aa overlap (1-972:1-972)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGPPSPHWTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MGPGVLLLLLVATAWHGQGIPVIEPSVPELVVKPGATVTLRCVGNGSVEWDGPPSPHWTL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNVLAQEVVVFED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 YSDGSSSILSTNNATFQNTGTYRCTEPGDPLGGSAAIHLYVKDPARPWNVLAQEVVVFED
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QDALLPCLLTDPVLEAGVSLVRVRGRPLMRHTNYSFSPWHGFTIHRAKFIQSQDYQCSAL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 MGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MGGRKVMSISIRLKVQKVIPGPPALTLVPAELVRIRGEAAQIVCSASSVDVNFDVFLQHN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NTKLAIPQQSDFHNNRYQKVLTLNLDQVDFQHAGNYSCVASNVQGKHSTSMFFRVVESAY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LNLSSEQNLIQEVTVGEGLNLKVMVEAYPGLQGFNWTYLGPFSDHQPEPKLANATTKDTY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 RHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEVSVIWTFINGSGTLLCA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RHTFTLSLPRLKPSEAGRYSFLARNPGGWRALTFELTLRYPPEVSVIWTFINGSGTLLCA
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 ASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ASGYPQPNVTWLQCSGHTDRCDEAQVLQVWDDPYPEVLSQEPFHKVTVQSLLTVETLEHN
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pF1KB7 QTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QTYECRAHNSVGSGSWAFIPISAGAHTHPPDEFLFTPVVVACMSIMALLLLLLLLLLYKY
490 500 510 520 530 540
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pF1KB7 KQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 KQKPKYQVRWKIIESYEGNSYTFIDPTQLPYNEKWEFPRNNLQFGKTLGAGAFGKVVEAT
550 560 570 580 590 600
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pF1KB7 AFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 AFGLGKEDAVLKVAVKMLKSTAHADEKEALMSELKIMSHLGQHENIVNLLGACTHGGPVL
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pF1KB7 VITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEKKYVRRDSGFSSQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VITEYCCYGDLLNFLRRKAEAMLGPSLSPGQDPEGGVDYKNIHLEKKYVRRDSGFSSQGV
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB7 DTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 DTYVEMRPVSTSSNDSFSEQDLDKEDGRPLELRDLLHFSSQVAQGMAFLASKNCIHRDVA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB7 ARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ARNVLLTNGHVAKIGDFGLARDIMNDSNYIVKGNARLPVKWMAPESIFDCVYTVQSDVWS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB7 YGILLWEIFSLGLNPYPGILVNSKFYKLVKDGYQMAQPAFAPKNIYSIMQACWALEPTHR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]