FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7023, 1106 aa 1>>>pF1KB7023 1106 - 1106 aa - 1106 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.4310+/-0.00064; mu= -10.9605+/- 0.039 mean_var=884.2683+/-204.479, 0's: 0 Z-trim(114.7): 670 B-trim: 0 in 0/60 Lambda= 0.043130 statistics sampled from 24024 (24696) to 24024 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.631), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16 Scan time: 15.940 The best scores are: opt bits E(85289) XP_011535961 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,60 (1106) 7360 476.1 5.1e-133 XP_011535960 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,60 (1106) 7360 476.1 5.1e-133 NP_002600 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,60181 (1106) 7360 476.1 5.1e-133 XP_005268521 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,60 (1042) 6950 450.5 2.4e-125 XP_016863769 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE (1102) 3024 206.3 8.4e-52 XP_006714102 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE (1114) 3024 206.3 8.5e-52 XP_011532687 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE (1089) 3019 205.9 1e-51 XP_005265800 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE (1089) 3019 205.9 1e-51 NP_006197 (OMIM: 173490,606764,607685) platelet-de (1089) 3019 205.9 1e-51 XP_016863770 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE ( 820) 2069 146.6 5.5e-34 XP_006714104 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE ( 832) 2069 146.7 5.6e-34 XP_016863771 (OMIM: 173490,606764,607685) PREDICTE ( 807) 2064 146.3 6.8e-34 XP_016863669 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 971) 768 65.8 1.4e-09 XP_016863668 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 972) 768 65.8 1.4e-09 XP_016863667 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 975) 768 65.8 1.4e-09 XP_005265798 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 976) 768 65.8 1.4e-09 NP_001087241 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 972) 759 65.2 2.1e-09 XP_005265799 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 973) 759 65.2 2.1e-09 NP_000213 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60676 ( 976) 759 65.2 2.1e-09 XP_005265797 (OMIM: 154800,164920,172800,273300,60 ( 977) 759 65.2 2.1e-09 XP_016875978 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 694) 735 63.5 4.9e-09 XP_016875977 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 700) 735 63.5 4.9e-09 XP_011533320 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 818) 735 63.6 5.4e-09 XP_016875976 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 818) 735 63.6 5.4e-09 XP_011533319 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 818) 735 63.6 5.4e-09 XP_016875975 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 921) 735 63.7 5.7e-09 XP_011533317 (OMIM: 136351,613065) PREDICTED: rece ( 974) 735 63.8 5.9e-09 NP_004110 (OMIM: 136351,613065) receptor-type tyro ( 993) 735 63.8 6e-09 NP_005202 (OMIM: 164770,221820) macrophage colony- ( 972) 697 61.4 3e-08 NP_001275634 (OMIM: 164770,221820) macrophage colo ( 972) 697 61.4 3e-08 XP_011532786 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1210) 699 61.7 3.1e-08 NP_002011 (OMIM: 136352,153100,602089) vascular en (1298) 699 61.7 3.3e-08 XP_016864757 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1337) 699 61.7 3.3e-08 NP_891555 (OMIM: 136352,153100,602089) vascular en (1363) 699 61.7 3.3e-08 XP_016864756 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1375) 699 61.7 3.4e-08 XP_016864755 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1375) 699 61.7 3.4e-08 XP_016864754 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1385) 699 61.7 3.4e-08 XP_016864753 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1385) 699 61.7 3.4e-08 XP_016864752 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1385) 699 61.7 3.4e-08 XP_011532780 (OMIM: 136352,153100,602089) PREDICTE (1440) 699 61.8 3.4e-08 XP_016875974 (OMIM: 165070) PREDICTED: vascular en (1300) 696 61.5 3.7e-08 NP_002010 (OMIM: 165070) vascular endothelial grow (1338) 696 61.5 3.8e-08 NP_002244 (OMIM: 191306,602089) vascular endotheli (1356) 668 59.8 1.3e-07 XP_016868719 (OMIM: 101600,123150,136350,147950,16 ( 498) 638 57.3 2.7e-07 XP_016868718 (OMIM: 101600,123150,136350,147950,16 ( 508) 634 57.0 3.2e-07 XP_016868717 (OMIM: 101600,123150,136350,147950,16 ( 729) 638 57.5 3.3e-07 NP_075594 (OMIM: 101600,123150,136350,147950,16625 ( 731) 638 57.5 3.3e-07 NP_001167537 (OMIM: 101600,123150,136350,147950,16 ( 733) 638 57.5 3.3e-07 NP_075593 (OMIM: 101600,123150,136350,147950,16625 ( 733) 638 57.5 3.3e-07 NP_075254 (OMIM: 100800,109800,114500,134934,14600 ( 694) 637 57.4 3.4e-07 >>XP_011535961 (OMIM: 131440,173410,213600,228550,601812 (1106 aa) initn: 7360 init1: 7360 opt: 7360 Z-score: 2509.1 bits: 476.1 E(85289): 5.1e-133 Smith-Waterman score: 7360; 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