FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7032, 424 aa
1>>>pF1KB7032 424 - 424 aa - 424 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3972+/-0.00118; mu= 16.7661+/- 0.070
mean_var=58.7328+/-12.139, 0's: 0 Z-trim(100.0): 32 B-trim: 184 in 1/48
Lambda= 0.167353
statistics sampled from 5932 (5959) to 5932 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.525), E-opt: 0.2 (0.183), width: 16
Scan time: 2.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 ( 424) 2738 669.9 1.3e-192
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CCDS1193.1 KCNJ10 gene_id:3766|Hs108|chr1 ( 379) 828 208.7 7.8e-54
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CCDS74141.1 KCNJ16 gene_id:3773|Hs108|chr17 ( 453) 672 171.1 2e-42
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CCDS2498.1 KCNJ13 gene_id:3769|Hs108|chr2 ( 360) 551 141.8 1e-33
>>CCDS8692.1 KCNJ8 gene_id:3764|Hs108|chr12 (424 aa)
initn: 2738 init1: 2738 opt: 2738 Z-score: 3571.4 bits: 669.9 E(32554): 1.3e-192
Smith-Waterman score: 2738; 100.0% identity (100.0% similar) in 424 aa overlap (1-424:1-424)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKARFIAKSGACNLAHKNIREQGRFLQDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MLARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKARFIAKSGACNLAHKNIREQGRFLQDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLESTVC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 FTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLESTVC
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VTNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIFMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VTNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIFMK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 TAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLANQDLEVIVILEGVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 VPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLANQDLEVIVILEGVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARELDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 ETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARELDE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEGNQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 KPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEGNQN
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TSES
::::
CCDS86 TSES
>>CCDS31436.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 (390 aa)
initn: 1719 init1: 892 opt: 1278 Z-score: 1666.9 bits: 317.4 E(32554): 1.6e-86
Smith-Waterman score: 1774; 71.2% identity (87.8% similar) in 385 aa overlap (1-384:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKARFIAKSGACNLAHKNIREQGRFLQDI
::.::.::::::::.:.: :. ::: : : .:::..:.: ::.::::::::::::::.
CCDS31 MLSRKGIIPEEYVLTRLA-EDPAKPRYRARQRRARFVSKKGNCNVAHKNIREQGRFLQDV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLESTVC
::::::::: :::.::::::::::::::. :::.::::::. : : .. :
CCDS31 FTTLVDLKWPHTLLIFTMSFLCSWLLFAMAWWLIAFAHGDL-APSEGTAEP--------C
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VTNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIFMK
::...::.:::::::::::::::::::.:::::::: .::.::::::.:::.::::::::
CCDS31 VTSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIFMK
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEV
::::::::::::::.:::::.:.:.::::.:::::::::::::....:::.:::.:::::
CCDS31 TAQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEGEV
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB7 VPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLAN-QDLEVIVILEGV
::.::.:::..: . .:.::::::::: :::: :::::.. .:: . ::::.:::::::
CCDS31 VPLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILEGV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 VETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARELD
::::::::::::::.:.:: ::.::: ::.::.: :::::::::::::: .: :.::.::
CCDS31 VETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTVKVPTPLCTARQLD
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 EKPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEGNQ
: : :...: . : .. ::::.
CCDS31 EDHS-LLEALTLA--SARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
360 370 380 390
>>CCDS53606.1 KCNJ11 gene_id:3767|Hs108|chr11 (303 aa)
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Smith-Waterman score: 1324; 69.4% identity (86.9% similar) in 297 aa overlap (89-384:1-285)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 DIFTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLEST
. :::.::::::. . : .
CCDS53 MAWWLIAFAHGDL---APSEGTAEP-----
10 20
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VCVTNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIF
:::...::.:::::::::::::::::::.:::::::: .::.::::::.:::.::::::
CCDS53 -CVTSIHSFSSAFLFSIEVQVTIGFGGRMVTEECPLAILILIVQNIVGLMINAIMLGCIF
30 40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 MKTAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEG
::::::::::::::::.:::::.:.:.::::.:::::::::::::....:::.:::.:::
CCDS53 MKTAQAHRRAETLIFSKHAVIALRHGRLCFMLRVGDLRKSMIISATIHMQVVRKTTSPEG
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EVVPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLAN-QDLEVIVILE
::::.::.:::..: . .:.::::::::: :::: :::::.. .:: . ::::.:::::
CCDS53 EVVPLHQVDIPMENGVGGNSIFLVAPLIIYHVIDANSPLYDLAPSDLHHHQDLEIIVILE
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GVVETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARE
::::::::::::::::.:.:: ::.::: ::.::.: :::::::::::::: .: :.::.
CCDS53 GVVETTGITTQARTSYLADEILWGQRFVPIVAEEDGRYSVDYSKFGNTVKVPTPLCTARQ
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LDEKPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEG
::: :.: ..: . : .. ::::.
CCDS53 LDEDHSLL-EAL--TLASARGPLRKRSVPMAKAKPKFSISPDSLS
270 280 290 300
>>CCDS42927.1 KCNJ6 gene_id:3763|Hs108|chr21 (423 aa)
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Smith-Waterman score: 1167; 48.6% identity (77.6% similar) in 352 aa overlap (14-363:32-375)
10 20 30 40
pF1KB7 MLARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKA--RFIAKSG
: . : ..: . ::: . :.. :.:
CCDS42 AKLTESMTNVLEGDSMDQDVESPVAIHQPKLPKQARDDLPRHISRDRTKRKIQRYVRKDG
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 ACNLAHKNIREQGRFLQDIFTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDI
::. : :.:: :.: :::::::::::: .:.::.: . .::.:...:::.:. .::.
CCDS42 KCNVHHGNVRETYRYLTDIFTTLVDLKWRFNLLIFVMVYTVTWLFFGMIWWLIAYIRGDM
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 YAYMEKSGMEKSGLESTVCVTNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLIL
..: . : ::::. .:.::::::::...:::.: :..:..:: .: .:..
CCDS42 -DHIEDPSW-------TPCVTNLNGFVSAFLFSIETETTIGYGYRVITDKCPEGIILLLI
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 QNIVGLIINAVMLGCIFMKTAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMII
:...: :.:: :.::.:.: .: ..:::::.:: ::::..:.::::.::::::::.: :.
CCDS42 QSVLGSIVNAFMVGCMFVKISQPKKRAETLVFSTHAVISMRDGKLCLMFRVGDLRNSHIV
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 SASVRIQVVKKTTTPEGEVVPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDIS
::.: ...:. : ::: .:..: :: : .. .:::.:::: : :...::...::
CCDS42 EASIRAKLIKSKQTSEGEFIPLNQTDINVGYYTGDDRLFLVSPLIISHEINQQSPFWEIS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ATDLANQDLEVIVILEGVVETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSK
..: ...::..:::::.::.::.: :::.:::. :: ::.::. ..: :.: : :::..
CCDS42 KAQLPKEELEIVVILEGMVEATGMTCQARSSYITSEILWGYRFTPVLTLEDGFYEVDYNS
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 FGNTVKVAAPRCSARELDEKPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRN
: .: ....: ::.:: : :
CCDS42 FHETYETSTPSLSAKELAELASRAELPLSWSVSSKLNQHAELETEEEEKNLEEQTERNGD
360 370 380 390 400 410
>>CCDS1194.1 KCNJ9 gene_id:3765|Hs108|chr1 (393 aa)
initn: 1152 init1: 894 opt: 1142 Z-score: 1489.4 bits: 284.5 E(32554): 1.2e-76
Smith-Waterman score: 1147; 47.6% identity (78.0% similar) in 336 aa overlap (25-360:16-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MLARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKARFIAKSGACNLAHKNIREQGRFLQDI
:: : : :.. :.: ::. . :.:: :.: :.
CCDS11 MAQENAAFSPGQEEPPRRRGR---QRYVEKDGRCNVQQGNVRETYRYLTDL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLESTVC
:::::::.:: .:..:.... .::.:. .:::.:...::. ..: .. : :
CCDS11 FTTLVDLQWRLSLLFFVLAYALTWLFFGAIWWLIAYGRGDL-EHLEDTAW-------TPC
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VTNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIFMK
:.:. .:..:::::::...:::.: :..:..:: .:..:.:: :.: ..:: :.::.:.:
CCDS11 VNNLNGFVAAFLFSIETETTIGYGHRVITDQCPEGIVLLLLQAILGSMVNAFMVGCMFVK
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TAQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEV
.: ..:: ::.:: :::...:.:.::.::::::::.: :. ::.: ..... : :::
CCDS11 ISQPNKRAATLVFSSHAVVSLRDGRLCLMFRVGDLRSSHIVEASIRAKLIRSRQTLEGEF
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VPIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLANQDLEVIVILEGVV
.:.:: :. : .. .:::.::.: : :: ::... : : .:.:..:::::.:
CCDS11 IPLHQTDLSVGFDTGDDRLFLVSPLVISHEIDAASPFWEASRRALERDDFEIVVILEGMV
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ETTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARELDE
:.::.: :::.::...:. :::::.:..: :.: : :::..: .: .: .: :::::: :
CCDS11 EATGMTCQARSSYLVDEVLWGHRFTSVLTLEDGFYEVDYASFHETFEVPTPSCSARELAE
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 KPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEGNQN
CCDS11 AAARLDAHLYWSIPSRLDEKVEEEGAGEGAGGEAGADKEQNGCLPPPESESKV
350 360 370 380 390
>>CCDS8479.1 KCNJ5 gene_id:3762|Hs108|chr11 (419 aa)
initn: 1153 init1: 862 opt: 1139 Z-score: 1485.1 bits: 283.8 E(32554): 2.1e-76
Smith-Waterman score: 1139; 47.8% identity (77.1% similar) in 345 aa overlap (32-374:49-385)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 LARKSIIPEEYVLARIAAENLRKPRIRDRLPKARFIAKSGACNLAHKNIREQGRFLQDIF
:. :.. ::: ::. : :..: :.:.:.:
CCDS84 PWDPKKIPKQARDYVPIATDRTRLLAEGKKPRQRYMEKSGKCNVHHGNVQETYRYLSDLF
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 TTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAYMEKSGMEKSGLESTVCV
::::::::: .:..::: . .::.:...:::.:. .:: ... : . : ::
CCDS84 TTLVDLKWRFNLLVFTMVYTVTWLFFGFIWWLIAYIRGD----LDHVGDQ----EWIPCV
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 TNVRSFTSAFLFSIEVQVTIGFGGRMMTEECPLAITVLILQNIVGLIINAVMLGCIFMKT
:. .:.::::::::...:::.: :..::.:: .: .:..: :.: :.:: :.::.:.:
CCDS84 ENLSGFVSAFLFSIETETTIGYGFRVITEKCPEGIILLLVQAILGSIVNAFMVGCMFVKI
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 AQAHRRAETLIFSRHAVIAVRNGKLCFMFRVGDLRKSMIISASVRIQVVKKTTTPEGEVV
.: ..:::::.:: .:::..:. :::.::::::::.: :. ::.: ...:. : ::: .
CCDS84 SQPKKRAETLMFSNNAVISMRDEKLCLMFRVGDLRNSHIVEASIRAKLIKSRQTKEGEFI
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLANQDLEVIVILEGVVE
:..: :: : .. .:::.:::: : :...::....: ..: ....::.:::::.::
CCDS84 PLNQTDINVGFDTGDDRLFLVSPLIISHEINQKSPFWEMSQAQLHQEEFEVVVILEGMVE
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TTGITTQARTSYIAEEIQWGHRFVSIVTEEEGVYSVDYSKFGNTVKVAAPRCSARELDE-
.::.: :::.::. :. :::::. ..: :.: : :::. : .: .. .: : :.:: :
CCDS84 ATGMTCQARSSYMDTEVLWGHRFTPVLTLEKGFYEVDYNTFHDTYETNTPSCCAKELAEM
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410
pF1KB7 -KPSILIQTLQKSELSHQNSLRKRNSMRRNNSMRRNNSIRRNNSSLMVPKVQFMTPEGNQ
. . :.: : . :
CCDS84 KREGRLLQYLPSPPLLGGCAEAGLDAEAEQNEEDEPKGLGGSREARGSV
380 390 400 410
>>CCDS2200.1 KCNJ3 gene_id:3760|Hs108|chr2 (501 aa)
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.:... . :: ...::.
CCDS22 --MLLMSSPLIAPAITNSKERHNSVECLDGLDDITTKLPSKLQKITGREDFPKKLLRMSS
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>>CCDS11219.1 KCNJ12 gene_id:3768|Hs108|chr17 (433 aa)
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CCDS11 PLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVE
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CCDS11 ATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVE
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CCDS11 NKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQ
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>>CCDS74015.1 KCNJ18 gene_id:100134444|Hs108|chr17 (433 aa)
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CCDS74 VSLEEDGLHLVTMSGANGFGNGKVHTRRRCRNRFVKKNGQCNIAFANMDEKSQRYLADMF
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CCDS74 TTCVDIRWRYMLLIFSLAFLASWLLFGVIFWVIAVAHGD----LEPA----EGHGRTPCV
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CCDS74 MQVHGFMAAFLFSIETQTTIGYGLRCVTEECLVAVFMVVAQSIVGCIIDSFMIGAIMAKM
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CCDS74 ARPKKRAQTLLFSHNAVVALRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIKPRVTEEGEYI
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pF1KB7 PIHQLDIPVDNPIESNNIFLVAPLIICHVIDKRSPLYDISATDLANQDLEVIVILEGVVE
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CCDS74 PLDQIDIDVGFDKGLDRIFLVSPITILHEIDEASPLFGISRQDLETDDFEIVVILEGMVE
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CCDS74 ATAMTTQARSSYLANEILWGHRFEPVLFEEKNQYKIDYSHFHKTYEVPSTPRCSAKDLVE
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CCDS74 NKFLLPSANSFCYENELAFLSRDEEDEADGDQDGRSRDGLSPQARHDFDRLQAGGGVLEQ
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CCDS13 MHGHSRNGQAHVPR-RKR--RNRFVKKNGQCNVYFANLSNKSQRYMAD
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pF1KB7 IFTTLVDLKWRHTLVIFTMSFLCSWLLFAIMWWLVAFAHGDIYAY--MEKSGMEKSG---
:::: :: .::. :.::. .:: :::.:....: .:: :::. : . .: .:
CCDS13 IFTTCVDTRWRYMLMIFSAAFLVSWLFFGLLFWCIAFFHGDLEASPGVPAAGGPAAGGGG
50 60 70 80 90 100
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CCDS13 AAPVAPKPCIMHVNGFLGAFLFSVETQTTIGYGFRCVTEECPLAVIAVVVQSIVGCVIDS
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CCDS13 FMIGTIMAKMARPKKRAQTLLFSHHAVISVRDGKLCLMWRVGNLRKSHIVEAHVRAQLIK
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CCDS13 PYMTQEGEYLPLDQRDLNVGYDIGLDRIFLVSPIIIVHEIDEDSPLYGMGKEELESEDFE
230 240 250 260 270 280
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290 300 310 320 330 340
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CCDS13 PCCSARELQESKITVLPAPPPPPSAFCYENELALMSQEEEEMEEEAAAAAAVAAGLGLEA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]