Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7041
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7041, 572 aa
1>>>pF1KB7041 572 - 572 aa - 572 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4080+/-0.000958; mu= 8.6164+/- 0.058
mean_var=328.3975+/-82.891, 0's: 0 Z-trim(114.7): 200 B-trim: 1662 in 2/51
Lambda= 0.070774
statistics sampled from 14954 (15252) to 14954 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.759), E-opt: 0.2 (0.469), width: 16
Scan time: 4.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 ( 572) 3851 407.1 3e-113
CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 ( 520) 1604 177.6 3.2e-44
CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 429) 1464 163.2 5.8e-40
CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 455) 1464 163.3 6e-40
CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 466) 1464 163.3 6.1e-40
CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 475) 1464 163.3 6.2e-40
CCDS83269.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 ( 342) 1166 132.7 7.4e-31
CCDS7410.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 432) 753 90.6 4.2e-18
CCDS7409.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 445) 753 90.7 4.3e-18
CCDS7408.1 HTR7 gene_id:3363|Hs108|chr10 ( 479) 753 90.7 4.4e-18
CCDS6099.1 ADRB3 gene_id:155|Hs108|chr8 ( 408) 645 79.6 8.4e-15
CCDS4393.1 DRD1 gene_id:1812|Hs108|chr5 ( 446) 640 79.1 1.3e-14
CCDS14564.1 HTR2C gene_id:3358|Hs108|chrX ( 458) 600 75.0 2.2e-13
CCDS34168.1 HTR1A gene_id:3350|Hs108|chr5 ( 422) 582 73.2 7.4e-13
CCDS5936.1 HTR5A gene_id:3361|Hs108|chr7 ( 357) 544 69.2 9.9e-12
CCDS9405.1 HTR2A gene_id:3356|Hs108|chr13 ( 471) 537 68.6 1.9e-11
CCDS4292.1 ADRB2 gene_id:154|Hs108|chr5 ( 413) 524 67.2 4.4e-11
CCDS7586.1 ADRB1 gene_id:153|Hs108|chr10 ( 477) 524 67.3 4.8e-11
CCDS47004.1 ADRA2C gene_id:152|Hs108|chr4 ( 462) 514 66.3 9.6e-11
>>CCDS13079.1 ADRA1D gene_id:146|Hs108|chr20 (572 aa)
initn: 3851 init1: 3851 opt: 3851 Z-score: 2146.8 bits: 407.1 E(32554): 3e-113
Smith-Waterman score: 3851; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTFRDLLSVSFEGPRPDSSAGGSSAGGGGGSAGGAAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MTFRDLLSVSFEGPRPDSSAGGSSAGGGGGSAGGAAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 VACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCC
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERGKAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERGKAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 EVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLC
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 WFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 CRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEM
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 QAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGGAQRAEAACAQRSEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGGAQRAEAACAQRSEVE
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB7 AVSLGVPHEVAEGATCQAYELADYSNLRETDI
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVSLGVPHEVAEGATCQAYELADYSNLRETDI
550 560 570
>>CCDS4347.1 ADRA1B gene_id:147|Hs108|chr5 (520 aa)
initn: 1686 init1: 1016 opt: 1604 Z-score: 907.3 bits: 177.6 E(32554): 3.2e-44
Smith-Waterman score: 1605; 59.2% identity (79.1% similar) in 426 aa overlap (95-501:44-451)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 NRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACN
....::. :.::::.:..::.:::::::::
CCDS43 PAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAIVGNILVILSVACN
20 30 40 50 60 70
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASI
:::.: :::::::::.:::::: :::::::..::::.:..:: :::.:::::::::::::
CCDS43 RHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDIWAAVDVLCCTASI
80 90 100 110 120 130
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALL--WVVALVVSVGPLLGWKEPVPPD
::::.::.:::.:::.::.::...:.::: ::::: ::.. :.:.:::::::::.: :
CCDS43 LSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKA--ILALLSVWVLSTVISIGPLLGWKEPAPND
140 150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERGKASEV
.. ::.::: ::.:::. :::.:.:::.:::::::.::. ::..::::: .: ....:.
CCDS43 DKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLEAGVMKEMSNSKEL
200 210 220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWF
.:::: .. : . . ::::. :::..:.:.::::::::::::.::::.:.:::.
CCDS43 TLRIHSKN--FHEDTLSSTK-AKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTLGIVVGMFILCWL
260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 PFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQCR
:::..::::::: ::: ..::::.:::::::::.::.::::::.::::::.:.: ::::
CCDS43 PFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFKRAFVRILGCQCR
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460
pF1KB7 -----RRRRRRPL---------WRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALP
:::::: : : : :... :.: .::. :. .::
CCDS43 GRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQS---RKDSLDDSGSCLSGSQ---RTLP
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 DPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPP---SAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGG
. .: : : :: :: :: ::. :
CCDS43 SASPSP-GYLGRGAP------PPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPGRRGRHDSGPLFT
430 440 450 460 470
530 540 550 560 570
pF1KB7 AQRAEAACAQRSEVEAVSLGVPHEVAEGATCQAYELADYSNLRETDI
CCDS43 FKLLTEPESPGTDGGASNGGCEAAADVANGQPGFKSNMPLAPGQF
480 490 500 510 520
>>CCDS6052.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (429 aa)
initn: 1448 init1: 955 opt: 1464 Z-score: 830.9 bits: 163.2 E(32554): 5.8e-40
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
.: ..: .. . . : .... .::.:.
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
CCDS60 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:.. : .:...
CCDS60 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.
CCDS60 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
.:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..: : ::: .. .:::::::::::
CCDS60 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
CCDS60 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
::.:::.:: .:: : ::.. .. : . : .. : ..:
CCDS60 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
CCDS60 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARGHTPMT
390 400 410 420
>>CCDS6053.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (455 aa)
initn: 1448 init1: 955 opt: 1464 Z-score: 830.6 bits: 163.3 E(32554): 6e-40
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
.: ..: .. . . : .... .::.:.
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
CCDS60 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:.. : .:...
CCDS60 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.
CCDS60 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
.:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..: : ::: .. .:::::::::::
CCDS60 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
CCDS60 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
::.:::.:: .:: : ::.. .. : . : .. : ..:
CCDS60 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
CCDS60 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARRGMDCRYFTKNCREHIKHVNFMMP
390 400 410 420 430 440
>>CCDS6054.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (466 aa)
initn: 1448 init1: 955 opt: 1464 Z-score: 830.5 bits: 163.3 E(32554): 6.1e-40
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
.: ..: .. . . : .... .::.:.
CCDS60 MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
CCDS60 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:.. : .:...
CCDS60 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.
CCDS60 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
.:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..: : ::: .. .:::::::::::
CCDS60 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
CCDS60 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
270 280 290 300 310 320
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
::.:::.:: .:: : ::.. .. : . : .. : ..:
CCDS60 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
330 340 350 360 370 380
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
CCDS60 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARVRSKSFLQVCCCVGPSTPSLDKNH
390 400 410 420 430 440
>>CCDS34869.1 ADRA1A gene_id:148|Hs108|chr8 (475 aa)
initn: 1448 init1: 955 opt: 1464 Z-score: 830.4 bits: 163.3 E(32554): 6.2e-40
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)
50 60 70 80 90 100
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110 120 130 140 150 160
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CCDS83 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
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CCDS83 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKTKTH---FSVRLLKFSREK
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.:: : :.
CCDS74 QCQYRNINRKLSAAGMHEALKLAERPERPEFVL
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.:. .::.::.::.::: ....:.:: .. ...: : ::. ::.:. :.::.::::::
CCDS74 KLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI
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CCDS74 MMDVNSSGRPDLYGHLRSFLLPEVGRGLPDLSPDGGADPVAGSWAPHLLSE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 GEPGSAGAGGDVNGTAAVG-GLVVS---AQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACNR
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CCDS74 -VTASPAPTWDAPPDNASGCGEQINYGRVEKVVIGSILTLITLLTIAGNCLVVISVCFVK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGF-WAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASI
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CCDS74 KLRQPSNYLIVSLALADLSVAVAVMPFVSVTDLIGGKWIFGHFFCNVFIAMDVMCCTASI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVPPDER
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pF1KB7 FCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVAR-STTRSLEAGVKRERGKASEVV
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CCDS74 VCLISQDFGYTIYSTAVAFYIPMSVMLFMYYQIYKAARKSAAKHKFPGFPRVE-PDSVIA
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pF1KB7 LRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWFP
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CCDS74 LNGIVKLQKEVEECANLSRLLK-HE-RKNISI----FKREQKAATTLGIIVGAFTVCWLP
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pF1KB7 FFFVLPLGSLFPQLKPSEG------VFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLL
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CCDS74 FFL---LSTARPFICGTSCSCIPLWVERTFLWLGYANSLINPFIYAFFNRDLRTTYRSLL
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]