Result of FASTA (omim) for pF1KB7041
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7041, 572 aa
  1>>>pF1KB7041 572 - 572 aa - 572 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9723+/-0.000397; mu= 10.5852+/- 0.025
 mean_var=297.7505+/-63.550, 0's: 0 Z-trim(121.7): 448  B-trim: 3630 in 2/53
 Lambda= 0.074327
 statistics sampled from 38143 (38750) to 38143 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.454), width:  16
 Scan time: 10.890

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic recep ( 572) 3851 426.7  1e-118
NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520) 1604 185.7 3.2e-46
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 1464 170.5 9.6e-42
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 1464 170.5 9.6e-42
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 1464 170.6 9.9e-42
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 1464 170.6   1e-41
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 1464 170.6   1e-41
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 1464 170.6   1e-41
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 1464 170.6   1e-41
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 1464 170.6   1e-41
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 1257 148.3 4.4e-35
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 1245 147.0 1.1e-34
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 1243 146.7 1.1e-34
XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556) 1244 147.1 1.4e-34
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 1237 146.1 1.9e-34
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 1235 145.8   2e-34
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 1190 141.0 5.6e-33
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 1189 141.0 6.6e-33
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 1176 139.5 1.6e-32
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 1166 138.4 3.3e-32
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 1166 138.5 3.5e-32
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 1166 138.5 3.7e-32
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432)  753 94.3 8.6e-19
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445)  753 94.3 8.7e-19
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479)  753 94.4 9.1e-19
NP_000016 (OMIM: 109691,601665) beta-3 adrenergic  ( 408)  645 82.7 2.5e-15
NP_000785 (OMIM: 126449) D(1A) dopamine receptor [ ( 446)  640 82.2 3.9e-15
NP_001243689 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine re ( 458)  600 77.9 7.7e-14
NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458)  600 77.9 7.7e-14
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422)  582 76.0 2.8e-13
NP_076917 (OMIM: 601305) 5-hydroxytryptamine recep ( 357)  544 71.8 4.3e-12
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471)  537 71.2 8.5e-12
NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic  ( 477)  524 69.8 2.2e-11
NP_000015 (OMIM: 109690,600807,601665) beta-2 adre ( 413)  518 69.1 3.2e-11
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462)  514 68.7 4.6e-11
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465)  512 68.5 5.4e-11
NP_071640 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor iso ( 359)  509 68.0 5.8e-11
XP_006714928 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 362)  509 68.0 5.8e-11
NP_001124527 (OMIM: 142703) histamine H2 receptor  ( 397)  509 68.1 6.1e-11
XP_011532851 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422)  509 68.1 6.4e-11
XP_016864915 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422)  509 68.1 6.4e-11
XP_006714927 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422)  509 68.1 6.4e-11
XP_005265961 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422)  509 68.1 6.4e-11
XP_011532850 (OMIM: 142703) PREDICTED: histamine H ( 422)  509 68.1 6.4e-11
NP_000789 (OMIM: 126453,143465,606798) D(1B) dopam ( 477)  500 67.2 1.3e-10
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450)  499 67.1 1.4e-10
NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390)  483 65.3 4.2e-10
NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine recep ( 377)  479 64.8 5.5e-10
NP_000786 (OMIM: 126450,159900) D(2) dopamine rece ( 443)  480 65.0 5.7e-10
XP_016872785 (OMIM: 126450,159900) PREDICTED: D(2) ( 443)  480 65.0 5.7e-10


>>NP_000669 (OMIM: 104219) alpha-1D adrenergic receptor   (572 aa)
 initn: 3851 init1: 3851 opt: 3851  Z-score: 2252.4  bits: 426.7 E(85289): 1e-118
Smith-Waterman score: 3851; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MTFRDLLSVSFEGPRPDSSAGGSSAGGGGGSAGGAAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MTFRDLLSVSFEGPRPDSSAGGSSAGGGGGSAGGAAPSEGPAVGGVPGGAGGGGGVVGAG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 SGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILS
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 VACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCC
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 TASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVALVVSVGPLLGWKEPVP
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 PDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERGKAS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERGKAS
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 EVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 WFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQ
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 CRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 CRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALPDPDPEPPGTPEM
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 QAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGGAQRAEAACAQRSEVE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 QAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGGAQRAEAACAQRSEVE
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570  
pF1KB7 AVSLGVPHEVAEGATCQAYELADYSNLRETDI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AVSLGVPHEVAEGATCQAYELADYSNLRETDI
              550       560       570  

>>NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic receptor   (520 aa)
 initn: 1686 init1: 1016 opt: 1604  Z-score: 950.7  bits: 185.7 E(85289): 3.2e-46
Smith-Waterman score: 1605; 59.2% identity (79.1% similar) in 426 aa overlap (95-501:44-451)

           70        80        90       100       110       120    
pF1KB7 NRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLAAFILMAVAGNLLVILSVACN
                                     ....::. :.::::.:..::.:::::::::
NP_000 PAHWGELKNANFTGPNQTSSNSTLPQLDITRAISVGLVLGAFILFAIVGNILVILSVACN
            20        30        40        50        60        70   

          130       140       150       160       170       180    
pF1KB7 RHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAFGRAFCDVWAAVDVLCCTASI
       :::.: :::::::::.:::::: :::::::..::::.:..:: :::.:::::::::::::
NP_000 RHLRTPTNYFIVNLAMADLLLSFTVLPFSAALEVLGYWVLGRIFCDIWAAVDVLCCTASI
            80        90       100       110       120       130   

          190       200       210       220         230       240  
pF1KB7 LSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALL--WVVALVVSVGPLLGWKEPVPPD
       ::::.::.:::.:::.::.::...:.:::  :::::  ::.. :.:.:::::::::.: :
NP_000 LSLCAISIDRYIGVRYSLQYPTLVTRRKA--ILALLSVWVLSTVISIGPLLGWKEPAPND
           140       150       160         170       180       190 

            250       260       270       280       290       300  
pF1KB7 ERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARSTTRSLEAGVKRERGKASEV
       .. ::.:::  ::.:::. :::.:.:::.:::::::.::. ::..::::: .: ....:.
NP_000 DKECGVTEEPFYALFSSLGSFYIPLAVILVMYCRVYIVAKRTTKNLEAGVMKEMSNSKEL
             200       210       220       230       240       250 

            310       320       330       340       350       360  
pF1KB7 VLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREKKAAKTLAIVVGVFVLCWF
       .:::: ..     :   . . ::::. :::..:.:.::::::::::::.::::.:.:::.
NP_000 TLRIHSKN--FHEDTLSSTK-AKGHNPRSSIAVKLFKFSREKKAAKTLGIVVGMFILCWL
               260        270       280       290       300        

            370       380       390       400       410       420  
pF1KB7 PFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPCSSREFKRAFLRLLRCQCR
       :::..:::::::  ::: ..::::.:::::::::.::.::::::.::::::.:.: ::::
NP_000 PFFIALPLGSLFSTLKPPDAVFKVVFWLGYFNSCLNPIIYPCSSKEFKRAFVRILGCQCR
      310       320       330       340       350       360        

                 430                440       450       460        
pF1KB7 -----RRRRRRPL---------WRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPLALTALP
            :::::: :         :   :   :...   :.:   .::.   :.     .::
NP_000 GRGRRRRRRRRRLGGCAYTYRPWTRGGSLERSQS---RKDSLDDSGSCLSGSQ---RTLP
      370       380       390       400          410          420  

      470       480       490          500       510       520     
pF1KB7 DPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPP---SAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIRAGG
       . .: : :     ::      ::    :: ::.  :                        
NP_000 SASPSP-GYLGRGAP------PPVELCAFPEWKAPGALLSLPAPEPPGRRGRHDSGPLFT
             430             440       450       460       470     

         530       540       550       560       570  
pF1KB7 AQRAEAACAQRSEVEAVSLGVPHEVAEGATCQAYELADYSNLRETDI
                                                      
NP_000 FKLLTEPESPGTDGGASNGGCEAAADVANGQPGFKSNMPLAPGQF  
         480       490       500       510       520  

>>XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A adrene  (429 aa)
 initn: 1448 init1: 955 opt: 1464  Z-score: 870.4  bits: 170.5 E(85289): 9.6e-42
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
                                     .: ..: .. .   . :  .... .::.:.
XP_006                           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
                                         10        20        30    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
       ..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
XP_006 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
           40        50        60        70        80        90    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
       ::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:..   :  .:...
XP_006 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
          100       110       120       130       140       150    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
       ::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.  
XP_006 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
          160       170       180       190       200       210    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
       .:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..:   : :::    .. .:::::::::::
XP_006 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
          220       230       240          250          260        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
       ::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
XP_006 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
      270       280       290       300       310       320        

          410         420       430       440       450       460  
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
       ::.:::.::  .::  : ::..  .. :  .  :    .. : ..:              
XP_006 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
      330       340       350       360        370       380       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
                                                                   
XP_006 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARGHTPMT                  
       390       400       410       420                           

>>NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic receptor   (429 aa)
 initn: 1448 init1: 955 opt: 1464  Z-score: 870.4  bits: 170.5 E(85289): 9.6e-42
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
                                     .: ..: .. .   . :  .... .::.:.
NP_150                           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
                                         10        20        30    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
       ..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
NP_150 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
           40        50        60        70        80        90    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
       ::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:..   :  .:...
NP_150 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
          100       110       120       130       140       150    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
       ::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.  
NP_150 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
          160       170       180       190       200       210    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
       .:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..:   : :::    .. .:::::::::::
NP_150 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
          220       230       240          250          260        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
       ::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
NP_150 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
      270       280       290       300       310       320        

          410         420       430       440       450       460  
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
       ::.:::.::  .::  : ::..  .. :  .  :    .. : ..:              
NP_150 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
      330       340       350       360        370       380       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
                                                                   
NP_150 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARGHTPMT                  
       390       400       410       420                           

>>NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic receptor   (455 aa)
 initn: 1448 init1: 955 opt: 1464  Z-score: 870.2  bits: 170.6 E(85289): 9.9e-42
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
                                     .: ..: .. .   . :  .... .::.:.
NP_150                           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
                                         10        20        30    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
       ..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
NP_150 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
           40        50        60        70        80        90    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
       ::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:..   :  .:...
NP_150 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
          100       110       120       130       140       150    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
       ::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.  
NP_150 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
          160       170       180       190       200       210    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
       .:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..:   : :::    .. .:::::::::::
NP_150 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
          220       230       240          250          260        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
       ::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
NP_150 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
      270       280       290       300       310       320        

          410         420       430       440       450       460  
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
       ::.:::.::  .::  : ::..  .. :  .  :    .. : ..:              
NP_150 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
      330       340       350       360        370       380       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
                                                                   
NP_150 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARRGMDCRYFTKNCREHIKHVNFMMP
       390       400       410       420       430       440       

>>NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic receptor   (466 aa)
 initn: 1448 init1: 955 opt: 1464  Z-score: 870.1  bits: 170.6 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
                                     .: ..: .. .   . :  .... .::.:.
NP_000                           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
                                         10        20        30    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
       ..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
NP_000 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
           40        50        60        70        80        90    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
       ::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:..   :  .:...
NP_000 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
          100       110       120       130       140       150    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
       ::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.  
NP_000 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
          160       170       180       190       200       210    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
       .:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..:   : :::    .. .:::::::::::
NP_000 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
          220       230       240          250          260        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
       ::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
NP_000 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
      270       280       290       300       310       320        

          410         420       430       440       450       460  
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
       ::.:::.::  .::  : ::..  .. :  .  :    .. : ..:              
NP_000 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
      330       340       350       360        370       380       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
                                                                   
NP_000 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARVRSKSFLQVCCCVGPSTPSLDKNH
       390       400       410       420       430       440       

>>NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic receptor   (475 aa)
 initn: 1448 init1: 955 opt: 1464  Z-score: 870.0  bits: 170.6 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
                                     .: ..: .. .   . :  .... .::.:.
NP_150                           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
                                         10        20        30    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
       ..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
NP_150 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
           40        50        60        70        80        90    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
       ::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:..   :  .:...
NP_150 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
          100       110       120       130       140       150    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
       ::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.  
NP_150 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
          160       170       180       190       200       210    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
       .:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..:   : :::    .. .:::::::::::
NP_150 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
          220       230       240          250          260        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
       ::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
NP_150 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
      270       280       290       300       310       320        

          410         420       430       440       450       460  
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
       ::.:::.::  .::  : ::..  .. :  .  :    .. : ..:              
NP_150 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
      330       340       350       360        370       380       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
                                                                   
NP_150 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARTKSRSVTRLECSGMILAHCNLRLP
       390       400       410       420       430       440       

>>XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A adrene  (475 aa)
 initn: 1448 init1: 955 opt: 1464  Z-score: 870.0  bits: 170.6 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
                                     .: ..: .. .   . :  .... .::.:.
XP_016                           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
                                         10        20        30    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
       ..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
XP_016 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
           40        50        60        70        80        90    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
       ::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:..   :  .:...
XP_016 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
          100       110       120       130       140       150    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
       ::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.  
XP_016 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
          160       170       180       190       200       210    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
       .:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..:   : :::    .. .:::::::::::
XP_016 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
          220       230       240          250          260        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
       ::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
XP_016 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
      270       280       290       300       310       320        

          410         420       430       440       450       460  
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
       ::.:::.::  .::  : ::..  .. :  .  :    .. : ..:              
XP_016 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
      330       340       350       360        370       380       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
                                                                   
XP_016 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARTKSRSVTRLECSGMILAHCNLRLP
       390       400       410       420       430       440       

>>XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A adrene  (475 aa)
 initn: 1448 init1: 955 opt: 1464  Z-score: 870.0  bits: 170.6 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
                                     .: ..: .. .   . :  .... .::.:.
XP_016                           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
                                         10        20        30    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
       ..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
XP_016 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
           40        50        60        70        80        90    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
       ::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:..   :  .:...
XP_016 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
          100       110       120       130       140       150    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
       ::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.  
XP_016 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
          160       170       180       190       200       210    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
       .:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..:   : :::    .. .:::::::::::
XP_016 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
          220       230       240          250          260        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
       ::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
XP_016 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
      270       280       290       300       310       320        

          410         420       430       440       450       460  
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
       ::.:::.::  .::  : ::..  .. :  .  :    .. : ..:              
XP_016 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
      330       340       350       360        370       380       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
                                                                   
XP_016 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARTKSRSVTRLECSGMILAHCNLRLP
       390       400       410       420       430       440       

>>XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A adrene  (475 aa)
 initn: 1448 init1: 955 opt: 1464  Z-score: 870.0  bits: 170.6 E(85289): 1e-41
Smith-Waterman score: 1464; 55.6% identity (83.8% similar) in 376 aa overlap (75-448:5-373)

           50        60        70        80        90       100    
pF1KB7 GVPGGAGGGGGVVGAGSGEDNRSSAGEPGSAGAGGDVNGTAAVGGLVVSAQGVGVGVFLA
                                     .: ..: .. .   . :  .... .::.:.
XP_006                           MVFLSGNASDSSNCTQPPAPVNISKAILLGVILG
                                         10        20        30    

          110       120       130       140       150       160    
pF1KB7 AFILMAVAGNLLVILSVACNRHLQTVTNYFIVNLAVADLLLSATVLPFSATMEVLGFWAF
       ..::..: ::.::::::::.:::..::.:.:::::::::::..::::::: .::::.:::
XP_006 GLILFGVLGNILVILSVACHRHLHSVTHYYIVNLAVADLLLTSTVLPFSAIFEVLGYWAF
           40        50        60        70        80        90    

          170       180       190       200       210       220    
pF1KB7 GRAFCDVWAAVDVLCCTASILSLCTISVDRYVGVRHSLKYPAIMTERKAAAILALLWVVA
       ::.::..:::::::::::::..:: ::.:::.:: . :.::.:.:.:..   :  .:...
XP_006 GRVFCNIWAAVDVLCCTASIMGLCIISIDRYIGVSYPLRYPTIVTQRRGLMALLCVWALS
          100       110       120       130       140       150    

          230       240       250       260       270       280    
pF1KB7 LVVSVGPLLGWKEPVPPDERFCGITEEAGYAVFSSVCSFYLPMAVIVVMYCRVYVVARST
       ::.:.:::.::..:.: :: .: :.:: ::..::.. :::::.:.:.::::::::::.  
XP_006 LVISIGPLFGWRQPAPEDETICQINEEPGYVLFSALGSFYLPLAIILVMYCRVYVVAKRE
          160       170       180       190       200       210    

          290       300       310       320       330       340    
pF1KB7 TRSLEAGVKRERGKASEVVLRIHCRGAATGADGAHGMRSAKGHTFRSSLSVRLLKFSREK
       .:.:..:.: ... . .:.:::: ..: .:..:   : :::    .. .:::::::::::
XP_006 SRGLKSGLKTDKSDSEQVTLRIHRKNAPAGGSG---MASAKT---KTHFSVRLLKFSREK
          220       230       240          250          260        

          350       360       370       380       390       400    
pF1KB7 KAAKTLAIVVGVFVLCWFPFFFVLPLGSLFPQLKPSEGVFKVIFWLGYFNSCVNPLIYPC
       ::::::.:::: :::::.:::.:.:.::.::..:::: :::..:::::.:::.::.::::
XP_006 KAAKTLGIVVGCFVLCWLPFFLVMPIGSFFPDFKPSETVFKIVFWLGYLNSCINPIIYPC
      270       280       290       300       310       320        

          410         420       430       440       450       460  
pF1KB7 SSREFKRAFLRLLR--CQCRRRRRRRPLWRVYGHHWRASTSGLRQDCAPSSGDAPPGAPL
       ::.:::.::  .::  : ::..  .. :  .  :    .. : ..:              
XP_006 SSQEFKKAFQNVLRIQCLCRKQSSKHALGYTL-HPPSQAVEGQHKDMVRIPVGSRETFYR
      330       340       350       360        370       380       

            470       480       490       500       510       520  
pF1KB7 ALTALPDPDPEPPGTPEMQAPVASRRKPPSAFREWRLLGPFRRPTTQLRAKVSSLSHKIR
                                                                   
XP_006 ISKTDGVCEWKFFSSMPRGSARITVSKDQSSCTTARTKSRSVTRLECSGMILAHCNLRLP
       390       400       410       420       430       440       




572 residues in 1 query   sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Sun Nov  6 13:07:58 2016 done: Sun Nov  6 13:08:00 2016
 Total Scan time: 10.890 Total Display time:  0.060

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com