Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7119
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7119, 287 aa
1>>>pF1KB7119 287 - 287 aa - 287 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3522+/-0.000947; mu= 10.9036+/- 0.056
mean_var=98.4260+/-19.554, 0's: 0 Z-trim(106.8): 38 B-trim: 40 in 1/49
Lambda= 0.129276
statistics sampled from 9149 (9177) to 9149 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5205.1 STX11 gene_id:8676|Hs108|chr6 ( 287) 1888 362.4 2.2e-100
CCDS33793.1 STX19 gene_id:415117|Hs108|chr3 ( 294) 727 145.8 3.4e-35
CCDS10699.1 STX1B gene_id:112755|Hs108|chr16 ( 288) 565 115.6 4.2e-26
CCDS9269.1 STX2 gene_id:2054|Hs108|chr12 ( 287) 546 112.1 4.9e-25
CCDS9270.1 STX2 gene_id:2054|Hs108|chr12 ( 288) 542 111.3 8.2e-25
CCDS34655.1 STX1A gene_id:6804|Hs108|chr7 ( 288) 500 103.5 1.9e-22
CCDS53637.1 STX3 gene_id:6809|Hs108|chr11 ( 277) 462 96.4 2.5e-20
CCDS7975.1 STX3 gene_id:6809|Hs108|chr11 ( 289) 462 96.4 2.5e-20
CCDS55120.1 STX1A gene_id:6804|Hs108|chr7 ( 251) 408 86.3 2.4e-17
CCDS10700.1 STX4 gene_id:6810|Hs108|chr16 ( 297) 393 83.6 2e-16
CCDS61916.1 STX4 gene_id:6810|Hs108|chr16 ( 295) 373 79.8 2.6e-15
>>CCDS5205.1 STX11 gene_id:8676|Hs108|chr6 (287 aa)
initn: 1888 init1: 1888 opt: 1888 Z-score: 1915.7 bits: 362.4 E(32554): 2.2e-100
Smith-Waterman score: 1888; 100.0% identity (100.0% similar) in 287 aa overlap (1-287:1-287)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
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CCDS52 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
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CCDS52 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HSAVARISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIEDM
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CCDS52 HSAVARISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIEDM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 FEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVLVEKQAD
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CCDS52 FEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVLVEKQAD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280
pF1KB7 TLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNPCRTLCCFCCPCLK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNPCRTLCCFCCPCLK
250 260 270 280
>>CCDS33793.1 STX19 gene_id:415117|Hs108|chr3 (294 aa)
initn: 675 init1: 579 opt: 727 Z-score: 745.3 bits: 145.8 E(32554): 3.4e-35
Smith-Waterman score: 727; 37.1% identity (76.3% similar) in 291 aa overlap (1-285:1-290)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MKDRLAEL------LDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDE
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CCDS33 MKDRLQELKQRTKEIELSRDSHVSTTETEEQGVFLQQAVIYEREPVAERHLHEIQKLQES
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NQLLVADVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAA
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CCDS33 INNLADNVQKFGQQQKSLVASMRRFSLLKRES-TITKEIKIQAEYINRSLNDLVKEVKKS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 EAQHGPHSAVARISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSG
:...:: :.:.:: ..:. :. ::. : ::.. ....:: : ::::. :::.:
CCDS33 EVENGPSSVVTRILKSQHAAMFRHFQQIMFIYNDTIAAKQEKCKTFILRQLEVAGKEMSE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DQIEDMFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVL
....::..::::.::.:.::.... ..: :.:::.::.::. ::..:.:...::.:...:
CCDS33 EDVNDMLHQGKWEVFNESLLTEINITKAQLSEIEQRHKELVNLENQIKDLRDLFIQISLL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 VEKQADTLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNPCRTLCCFCCPCLK
::.:....: ::..:..: .:....: . ::.:...::::.:::.::::
CCDS33 VEEQGESINNIEMTVNSTKEYVNNTKEKFGLAVKYKKRNPCRVLCCWCCPCCSSK
240 250 260 270 280 290
>>CCDS10699.1 STX1B gene_id:112755|Hs108|chr16 (288 aa)
initn: 588 init1: 456 opt: 565 Z-score: 582.1 bits: 115.6 E(32554): 4.2e-26
Smith-Waterman score: 573; 34.1% identity (69.0% similar) in 287 aa overlap (1-286:1-274)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
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CCDS10 MKDRTQEL--------RSAKDSDDEEEVVHVD----RDHFMDEFFEQVEEIRGCIEKLSE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
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CCDS10 DVEQVKKQHSAILAAPNPDEKTKQELEDLTADIKKTANKVRSKLKAIEQSIEQEEGLNRS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HSAVARISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIEDM
:: :: ..:...:. : ..: .:: .. : :: :: :::::::: :. ......:::
CCDS10 -SADLRIRKTQHSTLSRKFVEVMTEYNATQSKYRDRCKDRIQRQLEITGRTTTNEELEDM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 FEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVLVEKQAD
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CCDS10 LESGKLAIFTDDIKMDSQMTKQALNEIETRHNEIIKLETSIRELHDMFVDMAMLVESQGE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280
pF1KB7 TLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNP-CRTLCCFCCPCLK
.. :: ::...:::. .: ....:::.:. : . . .:: :
CCDS10 MIDRIEYNVEHSVDYVERAVSDTKKAVKYQSKARRKKIMIIICCVVLGVVLASSIGGTLG
230 240 250 260 270 280
CCDS10 L
>>CCDS9269.1 STX2 gene_id:2054|Hs108|chr12 (287 aa)
initn: 489 init1: 451 opt: 546 Z-score: 563.0 bits: 112.1 E(32554): 4.9e-25
Smith-Waterman score: 557; 33.5% identity (70.8% similar) in 284 aa overlap (1-283:1-270)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
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CCDS92 MRDRLPDLTACRKN-----DDGDTV-------VVVEKDHFMDDFFHQVEEIRNSIDKITQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
:... :... .:.. ..::.. ... : :: .. :. ::.:... . :. :
CCDS92 YVEEVKKNHSIILSAPNPEGKIKEELEDLNKEIKKTANKIRAKLKAIEQSFDQDES--GN
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB7 HSAVA-RISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIED
...: :: :.:...:. : .:: .::.:. :. : :::::::: :. .. :..:.
CCDS92 RTSVDLRIRRTQHSVLSRKFVEAMAEYNEAQTLFRERSKGRIQRQLEITGRTTTDDELEE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 MFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVLVEKQA
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CCDS92 MLESGKPSIFTSDIISDSQITRQALNEIESRHKDIMKLETSIRELHEMFMDMAMFVETQG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB7 DTLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNPCRTLCCFCCPCLK
. .: :: ::....::. .:: ...::..:. : . . . :
CCDS92 EMINNIERNVMNATDYVEHAKEETKKAIKYQSKARRKLMFIIICVIVLLVILGIILATTL
230 240 250 260 270 280
CCDS92 S
>>CCDS9270.1 STX2 gene_id:2054|Hs108|chr12 (288 aa)
initn: 489 init1: 451 opt: 542 Z-score: 558.9 bits: 111.3 E(32554): 8.2e-25
Smith-Waterman score: 553; 34.4% identity (72.2% similar) in 273 aa overlap (1-272:1-259)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
:.::: .: :. ::: .: : ::...........:.. . ..
CCDS92 MRDRLPDLTACRKN-----DDGDTV-------VVVEKDHFMDDFFHQVEEIRNSIDKITQ
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
:... :... .:.. ..::.. ... : :: .. :. ::.:... . :. :
CCDS92 YVEEVKKNHSIILSAPNPEGKIKEELEDLNKEIKKTANKIRAKLKAIEQSFDQDES--GN
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB7 HSAVA-RISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIED
...: :: :.:...:. : .:: .::.:. :. : :::::::: :. .. :..:.
CCDS92 RTSVDLRIRRTQHSVLSRKFVEAMAEYNEAQTLFRERSKGRIQRQLEITGRTTTDDELEE
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 MFEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVLVEKQA
:.:.:: ..:. ....: . .: :::::::::.....::. ::..::.:..::..:: :.
CCDS92 MLESGKPSIFTSDIISDSQITRQALNEIESRHKDIMKLETSIRELHEMFMDMAMFVETQG
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KB7 DTLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNPCRTLCCFCCPCLK
. .: :: ::....::. .:: ...::..:. :
CCDS92 EMINNIERNVMNATDYVEHAKEETKKAIKYQSKARRKKWIIIAVSVVLVAIIALIIGLSV
230 240 250 260 270 280
CCDS92 GK
>>CCDS34655.1 STX1A gene_id:6804|Hs108|chr7 (288 aa)
initn: 495 init1: 426 opt: 500 Z-score: 516.6 bits: 103.5 E(32554): 1.9e-22
Smith-Waterman score: 505; 30.3% identity (69.0% similar) in 284 aa overlap (1-283:1-272)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
:::: :: . :.::. : .. . :.... .......:. . ..
CCDS34 MKDRTQEL--------RTAKDSDDDDDVA---VTVDRDRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
.:... .... .:.: . :.. . . . :: .. .. ::..... : :. .
CCDS34 NVEEVKRKHSAILASPNPDEKTKEELEELMSDIKKTANKVRSKLKSIEQSIEQEEGLNRS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HSAVARISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIEDM
:: :: ..:...:. : ..: .:: .. :. :: :::::::: :. ......:::
CCDS34 -SADLRIRKTQHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERCKGRIQRQLEITGRTTTSEELEDM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 FEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVLVEKQAD
.:.:. .:. ... : . .. ::.:::.:: :...::. ::..:..:..::.:::.:..
CCDS34 LESGNPAIFASGIIMDSSISKQALSEIETRHSEIIKLENSIRELHDMFMDMAMLVESQGE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280
pF1KB7 TLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNP-CRTLCCFCCPCLK
.. :: ::...:::. .: ....:::.:. : . . .::
CCDS34 MIDRIEYNVEHAVDYVERAVSDTKKAVKYQSKARRKKIMIIICCVILGIVIASTVGGIFA
230 240 250 260 270 280
>>CCDS53637.1 STX3 gene_id:6809|Hs108|chr11 (277 aa)
initn: 416 init1: 235 opt: 462 Z-score: 478.6 bits: 96.4 E(32554): 2.5e-20
Smith-Waterman score: 483; 32.7% identity (70.6% similar) in 272 aa overlap (1-272:1-259)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
::::: .: .:: : ::. :. .:.... ... .. .:.. . . . .
CCDS53 MKDRLEQL--KAKQLTQ-----DDDTDAV--EIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
:.. : . .:.. . : : .... :: :.. .. ::..:.. : :..
CCDS53 HVEEAKKLYSIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDEVRS--
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HSAVARISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIEDM
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CCDS53 -SADLRIRKSQHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 FEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVLVEKQAD
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CCDS53 LESGNPAIFTSGII-DSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280
pF1KB7 TLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNPCRTLCCFCCPCLK
:. :::::..:::.. .:. ...:::.:. .
CCDS53 MLDNIELNVMHTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLISLQTGVATLVFR
230 240 250 260 270
>>CCDS7975.1 STX3 gene_id:6809|Hs108|chr11 (289 aa)
initn: 416 init1: 235 opt: 462 Z-score: 478.3 bits: 96.4 E(32554): 2.5e-20
Smith-Waterman score: 483; 32.7% identity (70.6% similar) in 272 aa overlap (1-272:1-259)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
::::: .: .:: : ::. :. .:.... ... .. .:.. . . . .
CCDS79 MKDRLEQL--KAKQLTQ-----DDDTDAV--EIAIDNTAFMDEFFSEIEETRLNIDKISE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
:.. : . .:.. . : : .... :: :.. .. ::..:.. : :..
CCDS79 HVEEAKKLYSIILSAPIPEPKTKDDLEQLTTEIKKRANNVRNKLKSMEKHIEEDEVRS--
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HSAVARISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIEDM
:: :: ..:...:. : ..: ::.:.. :. : :::::::: ::... ...:.:
CCDS79 -SADLRIRKSQHSVLSRKFVEVMTKYNEAQVDFRERSKGRIQRQLEITGKKTTDEELEEM
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 FEQGKWDVFSENLLADVKGARAALNEIESRHRELLRLESRIRDVHELFLQMAVLVEKQAD
.:.:. .:. ... : . .. ::.:::.::....:::: :...:..:...:.:::.:..
CCDS79 LESGNPAIFTSGII-DSQISKQALSEIEGRHKDIVRLESSIKELHDMFMDIAMLVENQGE
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280
pF1KB7 TLNVIELNVQKTVDYTGQAKAQVRKAVQYEEKNPCRTLCCFCCPCLK
:. :::::..:::.. .:. ...:::.:. .
CCDS79 MLDNIELNVMHTVDHVEKARDETKKAVKYQSQARKKLIIIIVLVVVLLGILALIIGLSVG
230 240 250 260 270 280
CCDS79 LN
>>CCDS55120.1 STX1A gene_id:6804|Hs108|chr7 (251 aa)
initn: 411 init1: 342 opt: 408 Z-score: 424.8 bits: 86.3 E(32554): 2.4e-17
Smith-Waterman score: 413; 29.8% identity (68.5% similar) in 238 aa overlap (1-238:1-226)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MKDRLAELLDLSKQYDQQFPDGDDEFDSPHEDIVFETDHILESLYRDIRDIQDENQLLVA
:::: :: . :.::. : .. . :.... .......:. . ..
CCDS55 MKDRTQEL--------RTAKDSDDDDDVA---VTVDRDRFMDEFFEQVEEIRGFIDKIAE
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DVKRLGKQNARFLTSMRRLSSIKRDTNSIAKAIKARGEVIHCKLRAMKELSEAAEAQHGP
.:... .... .:.: . :.. . . . :: .. .. ::..... : :. .
CCDS55 NVEEVKRKHSAILASPNPDEKTKEELEELMSDIKKTANKVRSKLKSIEQSIEQEEGLNRS
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 HSAVARISRAQYNALTLTFQRAMHDYNQAEMKQRDNCKIRIQRQLEIMGKEVSGDQIEDM
:: :: ..:...:. : ..: .:: .. :. :: :::::::: :. ......:::
CCDS55 -SADLRIRKTQHSTLSRKFVEVMSEYNATQSDYRERCKGRIQRQLEITGRTTTSEELEDM
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