Result of FASTA (ccds) for pF1KB7125
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7125, 312 aa
  1>>>pF1KB7125 312 - 312 aa - 312 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4066+/-0.00135; mu= 14.8548+/- 0.079
 mean_var=140.4433+/-49.169, 0's: 0 Z-trim(100.5): 370  B-trim: 787 in 2/45
 Lambda= 0.108224
 statistics sampled from 5658 (6122) to 5658 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.52), E-opt: 0.2 (0.188), width:  16
 Scan time:  2.040

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11       ( 312) 2060 334.3 7.4e-92
CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11      ( 316) 1610 264.0 1.1e-70
CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11      ( 325) 1089 182.7 3.3e-46
CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11      ( 321) 1084 181.9 5.6e-46
CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11      ( 317) 1078 181.0 1.1e-45
CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11      ( 312) 1077 180.8 1.2e-45
CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11      ( 311) 1045 175.8 3.8e-44
CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11      ( 321) 1044 175.7 4.3e-44
CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11      ( 314) 1039 174.9 7.3e-44
CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11      ( 318) 1037 174.6 9.1e-44
CCDS31398.1 OR52N1 gene_id:79473|Hs108|chr11       ( 320) 1037 174.6 9.1e-44
CCDS7751.1 OR51E2 gene_id:81285|Hs108|chr11        ( 320) 1034 174.1 1.3e-43
CCDS44529.1 OR52L1 gene_id:338751|Hs108|chr11      ( 329) 1024 172.6 3.8e-43
CCDS31353.1 OR52M1 gene_id:119772|Hs108|chr11      ( 317) 1021 172.1 5.1e-43
CCDS31352.1 OR52K1 gene_id:390036|Hs108|chr11      ( 314) 1020 171.9 5.7e-43
CCDS31397.1 OR52N5 gene_id:390075|Hs108|chr11      ( 324) 1010 170.4 1.7e-42
CCDS53597.1 OR52E6 gene_id:390078|Hs108|chr11      ( 313) 1009 170.2 1.9e-42
CCDS53598.1 OR52B2 gene_id:255725|Hs108|chr11      ( 323) 1007 169.9 2.4e-42
CCDS31358.2 OR51E1 gene_id:143503|Hs108|chr11      ( 318)  992 167.5 1.2e-41
CCDS31386.1 OR52H1 gene_id:390067|Hs108|chr11      ( 320)  981 165.8 3.9e-41
CCDS31361.1 OR51F2 gene_id:119694|Hs108|chr11      ( 342)  973 164.6 9.7e-41
CCDS31383.1 OR51I2 gene_id:390064|Hs108|chr11      ( 312)  957 162.1 5.2e-40
CCDS31365.1 OR51G2 gene_id:81282|Hs108|chr11       ( 314)  937 158.9 4.5e-39
CCDS41611.1 OR52B6 gene_id:340980|Hs108|chr11      ( 335)  926 157.3 1.5e-38
CCDS31369.1 OR51L1 gene_id:119682|Hs108|chr11      ( 315)  910 154.7 8.4e-38
CCDS31382.1 OR51I1 gene_id:390063|Hs108|chr11      ( 314)  907 154.3 1.2e-37
CCDS31407.1 OR52W1 gene_id:120787|Hs108|chr11      ( 320)  902 153.5   2e-37
CCDS53596.1 OR51M1 gene_id:390059|Hs108|chr11      ( 326)  892 151.9   6e-37
CCDS31357.1 OR51D1 gene_id:390038|Hs108|chr11      ( 324)  877 149.6   3e-36
CCDS31367.1 OR51A4 gene_id:401666|Hs108|chr11      ( 313)  869 148.3 7.1e-36
CCDS31379.1 OR51B6 gene_id:390058|Hs108|chr11      ( 312)  856 146.3 2.9e-35
CCDS31375.1 OR51V1 gene_id:283111|Hs108|chr11      ( 321)  850 145.4 5.6e-35
CCDS31368.1 OR51A2 gene_id:401667|Hs108|chr11      ( 313)  844 144.4 1.1e-34
CCDS31378.1 OR51B5 gene_id:282763|Hs108|chr11      ( 312)  832 142.6 3.9e-34
CCDS31364.1 OR51A7 gene_id:119687|Hs108|chr11      ( 312)  823 141.1   1e-33
CCDS31363.1 OR51T1 gene_id:401665|Hs108|chr11      ( 354)  822 141.1 1.2e-33
CCDS31355.1 OR52I2 gene_id:143502|Hs108|chr11      ( 350)  785 135.3 6.7e-32
CCDS31381.1 OR51Q1 gene_id:390061|Hs108|chr11      ( 317)  771 133.0 2.9e-31
CCDS59223.1 OR52I1 gene_id:390037|Hs108|chr11      ( 324)  767 132.4 4.5e-31
CCDS31395.1 OR56B1 gene_id:387748|Hs108|chr11      ( 324)  734 127.3 1.6e-29
CCDS31405.1 OR56A1 gene_id:120796|Hs108|chr11      ( 318)  699 121.8   7e-28
CCDS7757.1 OR51B4 gene_id:79339|Hs108|chr11        ( 310)  694 121.0 1.2e-27
CCDS31404.1 OR56A4 gene_id:120793|Hs108|chr11      ( 365)  682 119.2 4.8e-27
CCDS31406.1 OR56B4 gene_id:196335|Hs108|chr11      ( 319)  674 117.9   1e-26
CCDS73248.1 OR56A5 gene_id:390084|Hs108|chr11      ( 313)  664 116.3 3.1e-26
CCDS41614.1 OR56A3 gene_id:390083|Hs108|chr11      ( 315)  629 110.9 1.4e-24
CCDS31362.1 OR51S1 gene_id:119692|Hs108|chr11      ( 323)  621 109.6 3.3e-24
CCDS31639.1 OR2AT4 gene_id:341152|Hs108|chr11      ( 320)  596 105.7 4.9e-23
CCDS30903.2 OR6K3 gene_id:391114|Hs108|chr1        ( 315)  547 98.1 9.7e-21
CCDS35090.1 OR13C8 gene_id:138802|Hs108|chr9       ( 320)  539 96.8 2.3e-20


>>CCDS31374.1 OR52A1 gene_id:23538|Hs108|chr11            (312 aa)
 initn: 2060 init1: 2060 opt: 2060  Z-score: 1762.6  bits: 334.3 E(32554): 7.4e-92
Smith-Waterman score: 2060; 99.7% identity (99.7% similar) in 312 aa overlap (1-312:1-312)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHISPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
              250       260       270       280       290       300

              310  
pF1KB7 QIRIHVVKMFCS
       ::::::::::::
CCDS31 QIRIHVVKMFCS
              310  

>>CCDS31373.1 OR52A5 gene_id:390054|Hs108|chr11           (316 aa)
 initn: 1638 init1: 1594 opt: 1610  Z-score: 1382.8  bits: 264.0 E(32554): 1.1e-70
Smith-Waterman score: 1610; 75.2% identity (91.3% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
       :   : .:.:::.. :.:::::::::::::::: :.:::..:::::.: ::: : ::: :
CCDS31 MPTFNGSVFMPSAFILIGIPGLESVQCWIGIPFSAMYLIGVIGNSLILVIIKYENSLHIP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
       .::::.::.:::::: . :.:::::::::..::: ::.::.:::.::..:.::::::.::
CCDS31 MYIFLAMLAATDIALNTCILPKMLGIFWFHLPEISFDACLFQMWLIHSFQAIESGILLAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
       ::::::::: :::::.::..:.. .::  :.::::::. : : :::: .. :.:::::::
CCDS31 ALDRYVAICIPLRHATIFSQQFLTHIGLGVTLRAAILIIPSLGLIKCCLKHYRTTVISHS
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
       :::::::::::. ...:::::::::::.. :::. ::::::.:::::::.::::::::::
CCDS31 YCEHMAIVKLATEDIRVNKIYGLFVAFAILGFDIIFITLSYVQIFITVFQLPQKEARFKA
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..::::::::::.:::.:: 
CCDS31 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILLSNLYLLVPPFLNPIVYGVKTK
              250       260       270       280       290       300

              310      
pF1KB7 QIRIHVVKMFCS    
       ::: :.::.:      
CCDS31 QIRDHIVKVFFFKKVT
              310      

>>CCDS31371.1 OR52E2 gene_id:119678|Hs108|chr11           (325 aa)
 initn: 1079 init1: 600 opt: 1089  Z-score: 943.0  bits: 182.7 E(32554): 3.3e-46
Smith-Waterman score: 1089; 50.3% identity (81.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
       : . : : . :: . :.::::::... :::.::::.:.::.:::  .: .::.. :::.:
CCDS31 MFLPNDTQFHPSSFLLLGIPGLETLHIWIGFPFCAVYMIALIGNFTILLVIKTDSSLHQP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
       .. ::.::..::..:... .::::::::.:.  : :..:: ::.:::..  .::..::::
CCDS31 MFYFLAMLATTDVGLSTATIPKMLGIFWINLRGIIFEACLTQMFFIHNFTLMESAVLVAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
       : : ::::: ::... :.:...:  ::  : .:: :.: : ..::  :. :  . :: :.
CCDS31 AYDSYVAICNPLQYSAILTNKVVSVIGLGVFVRALIFVIPSILLI-LRLPFCGNHVIPHT
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
       :::::....:. :....: :::: .  ... ::.: :.:::..:. .::::: .:::.:.
CCDS31 YCEHMGLAHLSCASIKINIIYGLCAICNLV-FDITVIALSYVHILCAVFRLPTHEARLKS
     180       190       200        210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
       ..:: .:.::.: ::  :.:::.::::: ..: :::::....:..:::.:::..::..: 
CCDS31 LSTCGSHVCVILAFYTPALFSFMTHRFGRNVPRYIHILLANLYVVVPPMLNPVIYGVRTK
      240       250       260       270       280       290        

              310                 
pF1KB7 QIRIHVVKMFCS               
       ::   : :..                 
CCDS31 QIYKCVKKILLQEQGMEKEEYLIHTRF
      300       310       320     

>>CCDS44528.1 OR52N4 gene_id:390072|Hs108|chr11           (321 aa)
 initn: 608 init1: 608 opt: 1084  Z-score: 938.9  bits: 181.9 E(32554): 5.6e-46
Smith-Waterman score: 1084; 50.5% identity (78.2% similar) in 307 aa overlap (5-310:5-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
           : :  .:. . : :.::::..: ::..:::..:..::.::  :: .:. : .::.:
CCDS44 MLTLNKTDLIPASFILNGVPGLEDTQLWISFPFCSMYVVAMVGNCGLLYLIHYEDALHKP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
       .: ::.::. ::... :: .:: : ::::.. .: :: ::.::.: ::. :.:::.:. :
CCDS44 MYYFLAMLSFTDLVMCSSTIPKALCIFWFHLKDIGFDECLVQMFFTHTFTGMESGVLMLM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
       :::::::::::::...:.:. .. ..:: . ::...:. :   : :  . . . ... :.
CCDS44 ALDRYVAICYPLRYSTILTNPVIAKVGTATFLRGVLLIIPFTFLTKL-LPYCRGNILPHT
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
       ::.::...::. .::.:: ::::.::. . :::.  :: :: .:. .:  : . .:: ::
CCDS44 YCDHMSVAKLSCGNVKVNAIYGLMVALLIWGFDILCITNSYTMILRAVVSLSSADARQKA
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270        280       290         
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHI-PPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKT
       :::: ::::...  :  ::::::.:::: :: ::  ::. ..::::.:: .::.:::.::
CCDS44 FNTCTAHICAIVFSYTPAFFSFFSHRFGEHIIPPSCHIIVANIYLLLPPTMNPIVYGVKT
     240       250       260       270       280       290         

     300       310           
pF1KB7 TQIRIHVVKMFCS         
        :::  :....           
CCDS44 KQIRDCVIRILSGSKDTKSYSM
     300       310       320 

>>CCDS31400.1 OR52E8 gene_id:390079|Hs108|chr11           (317 aa)
 initn: 957 init1: 603 opt: 1078  Z-score: 933.9  bits: 181.0 E(32554): 1.1e-45
Smith-Waterman score: 1078; 50.6% identity (80.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:5-312)

                   10        20        30        40        50      
pF1KB7     MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERS
           :: :: : . :: . :.::::::.:. :::.::  .::.:..::. :: .:..:.:
CCDS31 MAGRMSTSNHTQFHPSSFLLLGIPGLEDVHIWIGVPFFFVYLVALLGNTALLFVIQTEQS
               10        20        30        40        50        60

         60        70        80        90       100       110      
pF1KB7 LHEPLYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGI
       ::::.: ::.:: . :..:... .::::::::::. :: : .:: .:.::: . ..:: .
CCDS31 LHEPMYYFLAMLDSIDLGLSTATIPKMLGIFWFNTKEISFGGCLSHMFFIHFFTAMESIV
               70        80        90       100       110       120

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB7 LVAMALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTV
       :::::.:::.::: :::.. :.: ...  :. ..:::.  .:.: ::..  :. :    .
CCDS31 LVAMAFDRYIAICKPLRYTMILTSKIISLIAGIAVLRSLYMVVP-LVFLLLRLPFCGHRI
              130       140       150       160        170         

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB7 ISHSYCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEA
       : :.:::::.:..:: :...::  .::   ...  .:. .: :::..:. .:: ::. ::
CCDS31 IPHTYCEHMGIARLACASIKVNIRFGLG-NISLLLLDVILIILSYVRILYAVFCLPSWEA
     180       190       200        210       220       230        

        240       250       260       270       280       290      
pF1KB7 RFKAFNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYG
       :.::.::: .:: :.: :.  :::::.::::: .:: ::::.....:..::: :::..::
CCDS31 RLKALNTCGSHIGVILAFFTPAFFSFLTHRFGHNIPQYIHIILANLYVVVPPALNPVIYG
      240       250       260       270       280       290        

        300       310     
pF1KB7 AKTTQIRIHVVKMFCS   
       ..: ::: .:...:     
CCDS31 VRTKQIRERVLRIFLKTNH
      300       310       

>>CCDS31401.1 OR52E4 gene_id:390081|Hs108|chr11           (312 aa)
 initn: 1041 init1: 580 opt: 1077  Z-score: 933.1  bits: 180.8 E(32554): 1.2e-45
Smith-Waterman score: 1077; 49.7% identity (80.1% similar) in 306 aa overlap (5-310:5-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
           : : ..:  . :.:::::.... ::..::: .::::..::  .: .::.:.:::.:
CCDS31 MPSINDTHFYPPFFLLLGIPGLDTLHIWISFPFCIVYLIAIVGNMTILFVIKTEHSLHQP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
       .. ::.::.  :..:..: .::::::::::. :: : .:::::.::: . :.:. .::.:
CCDS31 MFYFLAMLSMIDLGLSTSTIPKMLGIFWFNLQEISFGGCLLQMFFIHMFTGMETVLLVVM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
       : ::.:::: ::... :.:.. .  ....:: :  .::.: . ::  :. :   ... :.
CCDS31 AYDRFVAICNPLQYTMILTNKTISILASVVVGRNLVLVTPFVFLI-LRLPFCGHNIVPHT
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
       :::: ... :: : ...: ::::.:   .   :. .:. ::. :. .:::::....:.::
CCDS31 YCEHRGLAGLACAPIKINIIYGLMVISYII-VDVILIASSYVLILRAVFRLPSQDVRLKA
     180       190       200        210       220       230        

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
       :::: .:.::.: ::  :::::.:::::..:: :::::....:..::: :::..::..: 
CCDS31 FNTCGSHVCVMLCFYTPAFFSFMTHRFGQNIPHYIHILLANLYVVVPPALNPVIYGVRTK
      240       250       260       270       280       290        

              310    
pF1KB7 QIRIHVVKMFCS  
       ::: ..::.:    
CCDS31 QIREQIVKIFVQKE
      300       310  

>>CCDS31370.1 OR52J3 gene_id:119679|Hs108|chr11           (311 aa)
 initn: 1029 init1: 558 opt: 1045  Z-score: 906.1  bits: 175.8 E(32554): 3.8e-44
Smith-Waterman score: 1045; 46.9% identity (81.4% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-308)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
       :   : ... : .. :.::::::. . ::. :::..::.:..::. .: .:: :..:.::
CCDS31 MFYHNKSIFHPVTFFLIGIPGLEDFHMWISGPFCSVYLVALLGNATILLVIKVEQTLREP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
       .. ::..:.. :.::... .:.:::::::.. :: . .:. ::..::.. :.:. .:.::
CCDS31 MFYFLAILSTIDLALSTTSVPRMLGIFWFDAHEINYGACVAQMFLIHAFTGMEAEVLLAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
       :.:::::.: ::..:.:.: :... :.  .:.: ..:. : . ::  :. : .. .:.::
CCDS31 AFDRYVAVCAPLHYATILTSQVLVGISMCIVIRPVLLTLPMVYLIY-RLPFCQAHIIAHS
              130       140       150       160        170         

              190       200        210       220       230         
pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFV-AFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFK
       :::::.:.::. .:...: :::::: .: :  ..:..: .::. :. .:::::...:..:
CCDS31 YCEHMGIAKLSCGNIRINGIYGLFVVSFFV--LNLVLIGISYVYILRAVFRLPSHDAQLK
     180       190       200         210       220       230       

     240       250       260       270       280       290         
pF1KB7 AFNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKT
       :..:: ::. :.  ::. . :::.::::: .:: ::::: ...::..:: :::..::..:
CCDS31 ALSTCGAHVGVICVFYIPSVFSFLTHRFGHQIPGYIHILVANLYLIIPPSLNPIIYGVRT
       240       250       260       270       280       290       

     300       310   
pF1KB7 TQIRIHVVKMFCS 
        ::: .:. .:   
CCDS31 KQIRERVLYVFTKK
       300       310 

>>CCDS31399.1 OR52N2 gene_id:390077|Hs108|chr11           (321 aa)
 initn: 921 init1: 602 opt: 1044  Z-score: 905.1  bits: 175.7 E(32554): 4.3e-44
Smith-Waterman score: 1044; 46.9% identity (78.5% similar) in 311 aa overlap (1-310:1-310)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
       :: .: .   :. . : :.::::... ::..::: .:.::..::  :. .:. :..::.:
CCDS31 MSGDNSSSLTPGFFILNGVPGLEATHIWISLPFCFMYIIAVVGNCGLICLISHEEALHRP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
       .: ::..:. ::..: ....:.:: :::::. :: :..:: ::.:.: : :.:::.:. :
CCDS31 MYYFLALLSFTDVTLCTTMVPNMLCIFWFNLKEIDFNACLAQMFFVHMLTGMESGVLMLM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
       :::::::::::::.:.:.:. .. . :  . :: ..:. :  .: : :. . . . : :.
CCDS31 ALDRYVAICYPLRYATILTNPVIAKAGLATFLRNVMLIIPFTLLTK-RLPYCRGNFIPHT
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
       ::.::...:.. .: .:: ::::.::. .. ::.  :..:: .:. .:. : . .:: ::
CCDS31 YCDHMSVAKVSCGNFKVNAIYGLMVALLIGVFDICCISVSYTMILQAVMSLSSADARHKA
     180       190       200       210       220       230         

              250       260        270       280       290         
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRF-GSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKT
       :.:: .:.: ..  :. :::.:::::: : .:: .:::. ...:::.:: .::.:::.::
CCDS31 FSTCTSHMCSIVITYVAAFFTFFTHRFVGHNIPNHIHIIVANLYLLLPPTMNPIVYGVKT
     240       250       260       270       280       290         

     300       310           
pF1KB7 TQIRIHVVKMFCS         
        ::.  :.:..           
CCDS31 KQIQEGVIKFLLGDKVSFTYDK
     300       310       320 

>>CCDS31351.1 OR52K2 gene_id:119774|Hs108|chr11           (314 aa)
 initn: 1007 init1: 586 opt: 1039  Z-score: 901.0  bits: 174.9 E(32554): 7.3e-44
Smith-Waterman score: 1039; 48.4% identity (79.0% similar) in 310 aa overlap (1-310:1-309)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MSISNITVYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHEP
       :: ::::.  :... :::::::: .. ::.::::  : .:..::  :: ::... .::::
CCDS31 MSASNITLTHPTAFLLVGIPGLEHLHIWISIPFCLAYTLALLGNCTLLLIIQADAALHEP
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVAM
       .:.::.::.: :..:.:: .::::.::::   :: : .:: ::.:.:... .::..:.::
CCDS31 MYLFLAMLAAIDLVLSSSALPKMLAIFWFRDREINFFACLAQMFFLHSFSIMESAVLLAM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 ALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISHS
       :.::::::: ::......: .:. .::  .: ::. :..:   :..: :.. .  ::.: 
CCDS31 AFDRYVAICKPLHYTKVLTGSLITKIGMAAVARAVTLMTPLPFLLRC-FHYCRGPVIAHC
              130       140       150       160        170         

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 YCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFKA
       ::::::.:.:: .... :.:::. ::. .. .:: .. :::: :. .:. : ..:::.::
CCDS31 YCEHMAVVRLACGDTSFNNIYGIAVAMFIVVLDLLLVILSYIFILQAVLLLASQEARYKA
     180       190       200       210       220       230         

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 FNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSHIPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAKTT
       :.::..:: ..: ::  . .:   :: . :  :..:::....::: ::..::..::.:: 
CCDS31 FGTCVSHIGAILAFYTTVVISSVMHRVARHAAPHVHILLANFYLLFPPMVNPIIYGVKTK
     240       250       260       270       280       290         

              310     
pF1KB7 QIRIHVVKMFCS   
       :::  .. .:     
CCDS31 QIRESILGVFPRKDM
     300       310    

>>CCDS31384.1 OR52D1 gene_id:390066|Hs108|chr11           (318 aa)
 initn: 863 init1: 555 opt: 1037  Z-score: 899.2  bits: 174.6 E(32554): 9.1e-44
Smith-Waterman score: 1037; 46.8% identity (82.1% similar) in 312 aa overlap (1-310:1-311)

                10        20        30        40        50         
pF1KB7 MSISNIT-VYMPSVLTLVGIPGLESVQCWIGIPFCAIYLIAMIGNSLLLSIIKSERSLHE
       :: ::..  ..:... :.::::::... ::.:::::.::.:..::. :. .:  . .:: 
CCDS31 MSDSNLSDNHLPDTFFLTGIPGLEAAHFWIAIPFCAMYLVALVGNAALILVIAMDNALHA
               10        20        30        40        50        60

      60        70        80        90       100       110         
pF1KB7 PLYIFLGMLGATDIALASSIMPKMLGIFWFNVPEIYFDSCLLQMWFIHTLQGIESGILVA
       :.:.:: .:. ::.::.:. .::::.:.:... :: : .:: ::. .:.. ..::.::.:
CCDS31 PMYLFLCLLSLTDLALSSTTVPKMLAILWLHAGEISFGGCLAQMFCVHSIYALESSILLA
               70        80        90       100       110       120

     120       130       140       150       160       170         
pF1KB7 MALDRYVAICYPLRHANIFTHQLVIQIGTMVVLRAAILVAPCLVLIKCRFQFYHTTVISH
       ::.::::::: :::...:..: .. .:: . ..:.. .:.: . :.. :. .    :..:
CCDS31 MAFDRYVAICNPLRYTTILNHAVIGRIGFVGLFRSVAIVSPFIFLLR-RLPYCGHRVMTH
              130       140       150       160        170         

     180       190       200       210       220       230         
pF1KB7 SYCEHMAIVKLAAANVQVNKIYGLFVAFTVAGFDLTFITLSYIQIFITVFRLPQKEARFK
       .:::::.:..:: ::. :: .::: ::. . :.:  .:..::  :. .::.::...:. :
CCDS31 TYCEHMGIARLACANITVNIVYGLTVALLAMGLDSILIAISYGFILHAVFHLPSHDAQHK
     180       190       200       210       220       230         

     240       250       260       270        280       290        
pF1KB7 AFNTCIAHICVFLQFYLLAFFSFFTHRFGSH-IPPYIHILFSSIYLLVPPFLNPLVYGAK
       :..:: .:: ..: ::. :::::.::::: : .: ..::.....:.:::: :::..:::.
CCDS31 ALSTCGSHIGIILVFYIPAFFSFLTHRFGHHEVPKHVHIFLANLYVLVPPVLNPILYGAR
     240       250       260       270       280       290         

      300       310       
pF1KB7 TTQIRIHVVKMFCS     
       : .:: ...:..       
CCDS31 TKEIRSRLLKLLHLGKTSI
     300       310        




312 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 04:59:08 2016 done: Fri Nov  4 04:59:08 2016
 Total Scan time:  2.040 Total Display time:  0.010

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com