FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7127, 314 aa 1>>>pF1KB7127 314 - 314 aa - 314 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8048+/-0.000725; mu= 9.7149+/- 0.044 mean_var=106.3442+/-21.242, 0's: 0 Z-trim(112.3): 50 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.124370 statistics sampled from 13035 (13085) to 13035 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.754), E-opt: 0.2 (0.402), width: 16 Scan time: 2.650 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX ( 314) 2098 386.4 1.5e-107 CCDS76050.1 MAGEA6 gene_id:4105|Hs108|chrX ( 314) 2028 373.9 9.2e-104 CCDS76048.1 MAGEA12 gene_id:4111|Hs108|chrX ( 314) 1797 332.4 2.8e-91 CCDS76046.1 MAGEA2B gene_id:266740|Hs108|chrX ( 314) 1756 325.1 4.5e-89 CCDS76049.1 MAGEA2 gene_id:4101|Hs108|chrX ( 314) 1756 325.1 4.5e-89 CCDS14702.1 MAGEA4 gene_id:4103|Hs108|chrX ( 317) 1376 256.9 1.5e-68 CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX ( 309) 1310 245.0 5.5e-65 CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX ( 318) 1244 233.2 2.1e-61 CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX ( 429) 1191 223.7 1.9e-58 CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX ( 315) 1175 220.8 1.1e-57 CCDS14691.1 MAGEA9 gene_id:4108|Hs108|chrX ( 315) 1175 220.8 1.1e-57 CCDS14705.1 MAGEA10 gene_id:4109|Hs108|chrX ( 369) 918 174.7 9.5e-44 CCDS43927.1 MAGEB16 gene_id:139604|Hs108|chrX ( 324) 773 148.7 5.8e-36 CCDS14677.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 346) 738 142.4 4.8e-34 CCDS14221.1 MAGEB4 gene_id:4115|Hs108|chrX ( 346) 734 141.7 7.8e-34 CCDS14216.1 MAGEB18 gene_id:286514|Hs108|chrX ( 343) 733 141.5 8.8e-34 CCDS14222.1 MAGEB1 gene_id:4112|Hs108|chrX ( 347) 711 137.6 1.4e-32 CCDS14678.1 MAGEC2 gene_id:51438|Hs108|chrX ( 373) 710 137.4 1.7e-32 CCDS35221.1 MAGEB10 gene_id:139422|Hs108|chrX ( 347) 690 133.8 1.9e-31 CCDS14219.1 MAGEB2 gene_id:4113|Hs108|chrX ( 319) 673 130.7 1.4e-30 CCDS14220.1 MAGEB3 gene_id:4114|Hs108|chrX ( 346) 659 128.2 8.8e-30 CCDS59524.1 MAGEB17 gene_id:645864|Hs108|chrX ( 336) 658 128.1 9.7e-30 CCDS35417.1 MAGEC1 gene_id:9947|Hs108|chrX (1142) 601 118.1 3.3e-26 CCDS14217.1 MAGEB6 gene_id:158809|Hs108|chrX ( 407) 570 112.3 6.5e-25 CCDS65233.1 MAGEB5 gene_id:347541|Hs108|chrX ( 275) 548 108.3 7.2e-24 CCDS10023.1 NSMCE3 gene_id:56160|Hs108|chr15 ( 304) 543 107.4 1.5e-23 CCDS14676.1 MAGEC3 gene_id:139081|Hs108|chrX ( 643) 511 101.8 1.5e-21 CCDS14362.1 MAGED2 gene_id:10916|Hs108|chrX ( 606) 471 94.6 2e-19 CCDS14433.1 MAGEE1 gene_id:57692|Hs108|chrX ( 957) 471 94.7 3e-19 CCDS3269.1 MAGEF1 gene_id:64110|Hs108|chr3 ( 307) 455 91.6 8.3e-19 CCDS14337.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 778) 456 92.0 1.6e-18 CCDS35279.1 MAGED1 gene_id:9500|Hs108|chrX ( 834) 456 92.0 1.7e-18 CCDS59527.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 309) 443 89.5 3.7e-18 CCDS73700.1 MAGEL2 gene_id:54551|Hs108|chr15 (1249) 448 90.7 6.5e-18 CCDS43958.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 706) 443 89.6 7.5e-18 CCDS59528.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1034) 443 89.7 1e-17 CCDS43959.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX (1431) 443 89.8 1.4e-17 CCDS35281.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 739) 438 88.8 1.4e-17 CCDS48116.1 MAGED4 gene_id:728239|Hs108|chrX ( 739) 438 88.8 1.4e-17 CCDS14338.1 MAGED4B gene_id:81557|Hs108|chrX ( 741) 438 88.8 1.5e-17 CCDS59529.1 TRO gene_id:7216|Hs108|chrX ( 962) 384 79.1 1.5e-14 CCDS10014.1 NDN gene_id:4692|Hs108|chr15 ( 321) 376 77.4 1.6e-14 CCDS14431.1 MAGEE2 gene_id:139599|Hs108|chrX ( 523) 345 72.0 1.1e-12 CCDS14369.1 MAGEH1 gene_id:28986|Hs108|chrX ( 219) 314 66.2 2.6e-11 >>CCDS76045.1 MAGEA3 gene_id:4102|Hs108|chrX (314 aa) initn: 2098 init1: 2098 opt: 2098 Z-score: 2044.2 bits: 386.4 E(32554): 1.5e-107 Smith-Waterman score: 2098; 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CCDS14 LLRKYRAKELVTKAEMLERVIKNYKRCFPVIFGKASESLKMIFGIDVKEVDPASNTYTLV 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 TCLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSIL ::::::::::::.:::.::.:::::::. :: ::: : ::.:::::.:. :..::: .. CCDS14 TCLGLSYDGLLGNNQIFPKTGLLIIVLGTIAMEGDSASEEEIWEELGVMGVYDGREHTVY 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 GDPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHI :.:.::::: .::::::::::::::.:: ::::::::::.::::::::.:.:.... .: CCDS14 GEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSNPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARVRI 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KB7 SYPPLHEWVLREGEE .:: :.: .: : :: CCDS14 AYPSLREAALLEEEEGV 310 >>CCDS76051.1 MAGEA1 gene_id:4100|Hs108|chrX (309 aa) initn: 1197 init1: 1197 opt: 1310 Z-score: 1280.2 bits: 245.0 E(32554): 5.5e-65 Smith-Waterman score: 1310; 66.9% identity (83.4% similar) in 314 aa overlap (1-314:1-307) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPD : ::::: ::::::.:::. :::::: .:: :.:::: :: :: :::.: : : CCDS76 MSLEQRSLHCKPEEALEAQQEALGLVCVQA-------ATSSSSPLVLGTLEEVPTAGSTD 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 PPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPDLESEFQAALSRKVAELVHFL :::::::::..:::.:. : : ::..::::::: ::: :.:....:::.:: :: CCDS76 PPQSPQGASAFPTTINFTRQRQPSEGSSSREEEGPSTSCILESLFRAVITKKVADLVGFL 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 LLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFAT :::::::::::::::: ::. :... :: ::.::: ::::::::.. :.:: :: :...: CCDS76 LLKYRAREPVTKAEMLESVIKNYKHCFPEIFGKASESLQLVFGIDVKEADPTGHSYVLVT 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 CLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSILG ::::::::::::::::::.:.:::::..:: :: ::::.:::::::.::..::: : : CCDS76 CLGLSYDGLLGDNQIMPKTGFLIIVLVMIAMEGGHAPEEEIWEELSVMEVYDGREHSAYG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 DPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHIS .:.::::: .:::.:::::::: :::: ::::::::::.::::::::....:.:. .. CCDS76 EPRKLLTQDLVQEKYLEYRQVPDSDPARYEFLWGPRALAETSYVKVLEYVIKVSARVRFF 240 250 260 270 280 290 310 pF1KB7 YPPLHEWVLREGEE .: :.: .::: :: CCDS76 FPSLREAALREEEEGV 300 >>CCDS14692.1 MAGEA8 gene_id:4107|Hs108|chrX (318 aa) initn: 1243 init1: 891 opt: 1244 Z-score: 1216.0 bits: 233.2 E(32554): 2.1e-61 Smith-Waterman score: 1244; 63.7% identity (81.7% similar) in 317 aa overlap (1-314:1-315) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPD : : :.::. : ::::.:.::: ::. .: :..:::.::::::::. :: :: . ::. CCDS14 MLLGQKSQRYKAEEGLQAQGEAPGLMDVQIPTAEEQKAASSSSTLIMGTLEEVTDSGSPS 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPD---LESEFQAALSRKVAELV :::::.:::: :. . ::::: : ::..::::::: :: ::: :. ::..:::::: CCDS14 PPQSPEGASSSLTVTDSTLWSQSDEGSSSNEEEGPSTSPDPAHLESLFREALDEKVAELV 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 HFLLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYI .::: ::. .::::::::: ::. :.. :: :::::: .:..:::.. :::: :: :: CCDS14 RFLLRKYQIKEPVTKAEMLESVIKNYKNHFPDIFSKASECMQVIFGIDVKEVDPAGHSYI 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 FATCLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDS ..:::::::::::::.: ::.:::::::..: ::. :::: ::: :::. ...::: : CCDS14 LVTCLGLSYDGLLGDDQSTPKTGLLIIVLGMILMEGSRAPEEAIWEALSVMGLYDGREHS 190 200 210 220 230 240 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 ILGDPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGP . .:::::..::::::::::.:::::. ::::::::::.::::::::.:.:.... CCDS14 VYWKLRKLLTQEWVQENYLEYRQAPGSDPVRYEFLWGPRALAETSYVKVLEHVVRVNARV 250 260 270 280 290 300 300 310 pF1KB7 HISYPPLHEWVLREGEE .:::: ::: .: ::: CCDS14 RISYPSLHEEAL--GEEKGV 310 >>CCDS48180.1 MAGEA11 gene_id:4110|Hs108|chrX (429 aa) initn: 800 init1: 800 opt: 1191 Z-score: 1162.6 bits: 223.7 E(32554): 1.9e-58 Smith-Waterman score: 1191; 59.9% identity (78.9% similar) in 317 aa overlap (1-313:111-427) 10 20 30 pF1KB7 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQA ::::::::::::::::.:. : :::::::: CCDS48 QRITGGEQVLWGPITQIFPTVRPADLTRVIMPLEQRSQHCKPEEGLQAQEEDLGLVGAQA 90 100 110 120 130 140 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 PATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPDPPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQ .:::::: :::: :: :.::::::.:::::: : ::.:. . : : : :..: CCDS48 LQAEEQEAAFFSSTLNVGTLEELPAAESPSPPQSPQEESFSPTAMDAIFGSLSDEGSGSQ 150 160 170 180 190 200 100 110 120 130 140 pF1KB7 EEEGPSTFPDL---ESEFQAALSRKVAELVHFLLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFF :.::::: ::: :: : : :. .:::.:: :::.. .:::::::::. :.. .: CCDS48 EKEGPSTSPDLIDPESFSQDILHDKIIDLVHLLLRKYRVKGLITKAEMLGSVIKNYEDYF 210 220 230 240 250 260 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 PVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYIFATCLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLA : :: .:: .::.:::.. :::: .: :...: :.:::::. ..: :::.:::::::. CCDS48 PEIFREASVCMQLLFGIDVKEVDPTSHSYVLVTSLNLSYDGIQCNEQSMPKSGLLIIVLG 270 280 290 300 310 320 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 IIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDSILGDPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPA .: ::.: ::: .:: ::.. :. ::: ..:.::.::::..:::.:: ::::::.::: CCDS48 VIFMEGNCIPEEVMWEVLSIMGVYAGREHFLFGEPKRLLTQNWVQEKYLVYRQVPGTDPA 330 340 350 360 370 380 270 280 290 300 310 pF1KB7 CYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGPHISYPPLHEWVLRE-GEE :::::::::: .::: .:::..... .: ::: :.: .::: :: CCDS48 CYEFLWGPRAHAETSKMKVLEYIANANGRDPTSYPSLYEDALREEGEGV 390 400 410 420 >>CCDS35423.1 MAGEA9B gene_id:728269|Hs108|chrX (315 aa) initn: 1237 init1: 860 opt: 1175 Z-score: 1149.1 bits: 220.8 E(32554): 1.1e-57 Smith-Waterman score: 1175; 59.6% identity (77.9% similar) in 317 aa overlap (1-314:1-313) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MPLEQRSQHCKPEEGLEARGEALGLVGAQAPATEEQEAASSSSTLVEVTLGEVPAAESPD : ::::: ::::.: :::.:: :::.::: :. ::.:..:::.. : :: :: : . CCDS35 MSLEQRSPHCKPDEDLEAQGEDLGLMGAQEPTGEEEETTSSSDSKEE----EVSAAGSSS 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB7 PPQSPQGASSLPTTMNYPLWSQSYEDSSNQEEEGPSTFPD---LESEFQAALSRKVAELV :::::::..: .. : :::: : ::.:::: ::. : :: :: ::. :::::: CCDS35 PPQSPQGGASSSISVYYTLWSQFDEGSSSQEEEEPSSSVDPAQLEFMFQEALKLKVAELV 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 HFLLLKYRAREPVTKAEMLGSVVGNWQYFFPVIFSKASSSLQLVFGIELMEVDPIGHLYI :::: :::..::::::::: ::. :.. .:::::.::: .:..:: .. :::: :: :: CCDS35 HFLLHKYRVKEPVTKAEMLESVIKNYKRYFPVIFGKASEFMQVIFGTDVKEVDPAGHSYI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 FATCLGLSYDGLLGDNQIMPKAGLLIIVLAIIAREGDCAPEEKIWEELSVLEVFEGREDS ..: :::: :..:::.. ::::.::::::..: . .::::: ::: :::. :. :.: CCDS35 LVTALGLSCDSMLGDGHSMPKAALLIIVLGVILTKDNCAPEEVIWEALSVMGVYVGKEHM 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 ILGDPKKLLTQHFVQENYLEYRQVPGSDPACYEFLWGPRALVETSYVKVLHHMVKISGGP . :.:.::::: .::::::::::::::::: :::::: .: .:::: ::....: ... CCDS35 FYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPGSDPAHYEFLWGSKAHAETSYEKVINYLVMLNARE 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 HISYPPLHEWVLREGEE : :: :.: :: : .: CCDS35 PICYPSLYEEVLGEEQEGV 300 310 314 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 04:59:37 2016 done: Fri Nov 4 04:59:37 2016 Total Scan time: 2.650 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]