FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7133, 319 aa 1>>>pF1KB7133 319 - 319 aa - 319 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4686+/-0.000319; mu= 6.8197+/- 0.020 mean_var=139.3365+/-27.752, 0's: 0 Z-trim(120.3): 128 B-trim: 0 in 0/60 Lambda= 0.108653 statistics sampled from 35320 (35448) to 35320 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.766), E-opt: 0.2 (0.416), width: 16 Scan time: 8.170 The best scores are: opt bits E(85289) NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antig ( 319) 2080 337.0 3.2e-92 XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-as ( 319) 2080 337.0 3.2e-92 NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1373 226.2 7.8e-59 NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1373 226.2 7.8e-59 NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1373 226.2 7.8e-59 NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antig ( 346) 1311 216.4 6.6e-56 XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-as ( 336) 1060 177.1 4.5e-44 NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated an ( 336) 1060 177.1 4.5e-44 XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 995 166.9 5.4e-41 XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 995 166.9 5.4e-41 NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antig ( 346) 995 166.9 5.4e-41 NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antig ( 347) 963 161.9 1.7e-39 XP_011543755 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 867 146.8 5.6e-35 NP_001093391 (OMIM: 300762) melanoma-associated an ( 324) 867 146.8 5.6e-35 XP_011543756 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 867 146.8 5.6e-35 XP_016885011 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 394) 809 137.8 3.6e-32 NP_001011544 (OMIM: 300344) melanoma-associated an ( 400) 809 137.8 3.6e-32 XP_011529466 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 421) 809 137.8 3.8e-32 NP_005357 (OMIM: 300344) melanoma-associated antig ( 429) 809 137.8 3.8e-32 XP_016885010 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 429) 809 137.8 3.8e-32 XP_016885009 (OMIM: 300341) PREDICTED: melanoma-as ( 318) 783 133.7 5.1e-31 NP_001159872 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 783 133.7 5.1e-31 NP_005355 (OMIM: 300341) melanoma-associated antig ( 318) 783 133.7 5.1e-31 NP_001159873 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 783 133.7 5.1e-31 NP_001238757 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 784 133.8 5.1e-31 NP_066386 (OMIM: 300343) melanoma-associated antig ( 369) 784 133.8 5.1e-31 NP_001011543 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 784 133.8 5.1e-31 NP_775794 (OMIM: 300467) melanoma-associated antig ( 407) 780 133.2 8.6e-31 NP_002353 (OMIM: 300175) melanoma-associated antig ( 317) 777 132.7 9.7e-31 NP_001011550 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 777 132.7 9.7e-31 NP_001011549 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 777 132.7 9.7e-31 NP_001011548 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 777 132.7 9.7e-31 XP_005274735 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 777 132.7 9.7e-31 XP_005274736 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 777 132.7 9.7e-31 XP_005274734 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 397) 777 132.8 1.2e-30 NP_001258681 (OMIM: 300466) melanoma-associated an ( 275) 765 130.8 3.2e-30 NP_057333 (OMIM: 300468) melanoma-associated antig ( 373) 739 126.8 6.9e-29 NP_005356 (OMIM: 300342) melanoma-associated antig ( 315) 724 124.4 3.1e-28 NP_001074259 (OMIM: 300764) melanoma-associated an ( 315) 724 124.4 3.1e-28 XP_005278249 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 724 124.4 3.1e-28 XP_005262391 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 724 124.4 3.1e-28 XP_005278250 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 724 124.4 3.1e-28 XP_005262392 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 724 124.4 3.1e-28 NP_004979 (OMIM: 300016) melanoma-associated antig ( 309) 723 124.2 3.3e-28 NP_005354 (OMIM: 300176) melanoma-associated antig ( 314) 684 118.1 2.3e-26 NP_787064 (OMIM: 300176) melanoma-associated antig ( 314) 684 118.1 2.3e-26 XP_011529463 (OMIM: 300174) PREDICTED: melanoma-as ( 314) 673 116.4 7.8e-26 NP_005353 (OMIM: 300174) melanoma-associated antig ( 314) 673 116.4 7.8e-26 XP_006724881 (OMIM: 300174) PREDICTED: melanoma-as ( 314) 673 116.4 7.8e-26 XP_011529462 (OMIM: 300174) PREDICTED: melanoma-as ( 314) 673 116.4 7.8e-26 >>NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antigen B (319 aa) initn: 2080 init1: 2080 opt: 2080 Z-score: 1776.7 bits: 337.0 E(85289): 3.2e-92 Smith-Waterman score: 2080; 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NP_803 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM 300 310 320 330 340 >>NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antigen B (346 aa) initn: 1030 init1: 651 opt: 1311 Z-score: 1124.7 bits: 216.4 E(85289): 6.6e-56 Smith-Waterman score: 1311; 65.5% identity (83.4% similar) in 319 aa overlap (1-318:1-316) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ :::::::::::::::...: .:. :.: : : ::.::.: :::: .:::: : :::: NP_002 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAFGIPQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ .::: : :..:::: .: : : :: .: : :.:::::::::::. .: ::::. ::: NP_002 EPQREPPTTSAAAA-MSCTGSDKGDES-QDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLVQ 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF :::::::.:. .::.:::::..:...::::::..:.:. .:::: :..:::. :.: . NP_002 FLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYIL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV .. . .: .. :.: .:: ::::::.::::::: : ::::::::::::.:::..: . NP_002 VSMLGPNDGNQS-SAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHLI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP :::: ::::.::::::::::.:::.:::::.::::::::.:::::::::::::::: ::: NP_002 FGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTTP 240 250 260 270 280 290 310 pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEE-KAGV :: :::::.::: .:: NP_002 NNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM 300 310 320 330 340 >>XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-associ (336 aa) initn: 1018 init1: 771 opt: 1060 Z-score: 912.3 bits: 177.1 E(85289): 4.5e-44 Smith-Waterman score: 1060; 51.6% identity (79.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ ::::: :: :::::::.:: : . :. :.: ::.:. : :: . . .: : ::::: XP_011 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ . ::: .. :.: :: :.: .:::...:: . .: .. .:..: ..: :. :.: ::: XP_011 ESQRASYPSSPASA-VSLTSSDEGAKGQKGE-SPNSFHGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQ 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF ::: :: :. .:. :::........::::::....:.. ::::: :....:. ..:.. XP_011 FLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV . :.:. .. :: .. :: ::: ::..::..:: :::::.:: :: ::.: :..: . XP_011 VGKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP .::: .:.:::::.: ::::.:::::::::..::::::: :::::::::::.::.: :. XP_011 YGEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVA 240 250 260 270 280 290 310 pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV .. ..:::::..::. XP_011 STYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP 300 310 320 330 >>NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated antige (336 aa) initn: 1018 init1: 771 opt: 1060 Z-score: 912.3 bits: 177.1 E(85289): 4.5e-44 Smith-Waterman score: 1060; 51.6% identity (79.4% similar) in 316 aa overlap (1-316:1-314) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ ::::: :: :::::::.:: : . :. :.: ::.:. : :: . . .: : ::::: NP_001 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 KPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ . ::: .. :.: :: :.: .:::...:: . .: .. .:..: ..: :. :.: ::: NP_001 ESQRASYPSSPASA-VSLTSSDEGAKGQKGE-SPNSFHGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQ 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF ::: :: :. .:. :::........::::::....:.. ::::: :....:. ..:.. NP_001 FLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVL 120 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV . :.:. .. :: .. :: ::: ::..::..:: :::::.:: :: ::.: :..: . NP_001 VGKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFI 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP .::: .:.:::::.: ::::.:::::::::..::::::: :::::::::::.::.: :. NP_001 YGEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVA 240 250 260 270 280 290 310 pF1KB7 CAFPTHYEEALKDEEKAGV .. ..:::::..::. NP_001 STYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP 300 310 320 330 >>XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa) initn: 1001 init1: 944 opt: 995 Z-score: 857.0 bits: 166.9 E(85289): 5.4e-41 Smith-Waterman score: 995; 51.9% identity (76.6% similar) in 320 aa overlap (1-316:1-316) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIP- ::::::: :.:::::...: .:. . :.: ...... :: . ::. .. .:: XP_011 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSF-SSPLILGATIQKKSAGRSR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 ---QKPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSG .::::: .:.... :: :: :::.: . ::. : ::. .:: . ::: :.. XP_011 SALKKPQRALSTTTSV--DVSYKKSYKGANS-KIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SLVQFLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGH :::::. ::.:: . :..::::: : .. ::::::::: .. ::::..:.::. . XP_011 MLVQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 TYTFIDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGE .:....:.:: .. .. . ::. ::. ::::::..:: ::::.:::::: . .:::. XP_011 SYVLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 EHSVFGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVN .: .:::: ::::.:::. :::::.:::.:.: :..:::::::.::::::::::: :::: XP_011 KHFIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVN 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 GTTPCAFPTHYEEALKDEEKAGV :.: :: :::::.:::. XP_011 KTVPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA 300 310 320 330 340 >>XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa) initn: 1001 init1: 944 opt: 995 Z-score: 857.0 bits: 166.9 E(85289): 5.4e-41 Smith-Waterman score: 995; 51.9% identity (76.6% similar) in 320 aa overlap (1-316:1-316) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIP- ::::::: :.:::::...: .:. . :.: ...... :: . ::. .. .:: XP_011 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSF-SSPLILGATIQKKSAGRSR 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 ---QKPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSG .::::: .:.... :: :: :::.: . ::. : ::. .:: . ::: :.. XP_011 SALKKPQRALSTTTSV--DVSYKKSYKGANS-KIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTN 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 SLVQFLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGH :::::. ::.:: . :..::::: : .. ::::::::: .. ::::..:.::. . XP_011 MLVQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKD 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 TYTFIDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGE .:....:.:: .. .. . ::. ::. ::::::..:: ::::.:::::: . .:::. XP_011 SYVLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 EHSVFGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVN .: .:::: ::::.:::. :::::.:::.:.: :..:::::::.::::::::::: :::: XP_011 KHFIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVN 240 250 260 270 280 290 300 310 pF1KB7 GTTPCAFPTHYEEALKDEEKAGV :.: :: :::::.:::. XP_011 KTVPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA 300 310 320 330 340 319 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 05:09:41 2016 done: Fri Nov 4 05:09:43 2016 Total Scan time: 8.170 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]