FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7139, 333 aa 1>>>pF1KB7139 333 - 333 aa - 333 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6010+/-0.000678; mu= 11.1660+/- 0.041 mean_var=104.1230+/-20.224, 0's: 0 Z-trim(113.8): 21 B-trim: 0 in 0/52 Lambda= 0.125690 statistics sampled from 14428 (14449) to 14428 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.444), width: 16 Scan time: 3.040 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1 ( 333) 2274 422.1 3e-118 CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6 ( 382) 995 190.2 2.2e-48 CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13 ( 435) 989 189.2 5.3e-48 CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1 ( 358) 935 179.4 4e-45 CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1 ( 515) 887 170.7 2.2e-42 CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1 ( 433) 881 169.6 4.1e-42 CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6 ( 543) 882 169.8 4.4e-42 CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13 ( 226) 487 98.0 7.7e-21 CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1 ( 270) 477 96.2 3.1e-20 CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13 ( 261) 464 93.9 1.6e-19 CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1 ( 439) 449 91.3 1.6e-18 CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1 ( 266) 441 89.7 2.9e-18 CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX ( 283) 439 89.4 3.9e-18 CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17 ( 396) 438 89.3 5.8e-18 CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15 ( 321) 428 87.4 1.7e-17 CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1 ( 273) 425 86.8 2.2e-17 CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6 ( 223) 419 85.7 3.9e-17 CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17 ( 294) 387 79.9 2.8e-15 CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7 ( 279) 322 68.1 9.4e-12 >>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1 (333 aa) initn: 2274 init1: 2274 opt: 2274 Z-score: 2236.3 bits: 422.1 E(32554): 3e-118 Smith-Waterman score: 2274; 99.7% identity (99.7% similar) in 333 aa overlap (1-333:1-333) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWT 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 MEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRGM :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 MEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRGM 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 RARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEERL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS30 RARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEERL 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 ASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV :::::::::::::::::: :::::::::::::: CCDS30 ASSRPPLFLDPPPQNGQKPPSRPSSSASKKQYV 310 320 330 >>CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6 (382 aa) initn: 1039 init1: 967 opt: 995 Z-score: 982.0 bits: 190.2 E(32554): 2.2e-48 Smith-Waterman score: 1023; 49.1% identity (73.9% similar) in 322 aa overlap (1-298:1-317) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG ::::. : ::::.:: .::. ::.::.::::::::.:: : ::.:::::: :.::: ::: CCDS51 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD : :::::..:::::.:.::::..:::.:::.::.::.:. :.::.: .:: ::.. . CCDS51 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLNKKEEELKVAQTDG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWT .:. : .: . : .. : :....::.:. ::. :.: ::..:..:: :: .::.. CCDS51 VNVDMHLKQIEIKKFKYGIEEHGKVKMRGGLLRTYIISILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFS 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 MEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRGM . :..:.: :::. ::::.::::::::::::::::.:.::.::..:: ... . :. CCDS51 LSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVSLVSLALNIIELFYVFFK----GV 190 200 210 220 230 250 260 270 pF1KB7 RARQGQDAPPTQGTSS--DPYTD---QVFFYL-----PVGQ-GPSSPP------------ . : . : ..::. .: : : . :. :.. .: ::: CCDS51 KDRVKGKSDPYHATSGALSPAKDCGSQKYAYFNGCSSPTAPLSPMSPPGYKLVTGDRNNS 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 -CPTYNGLSSSEQNWANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV : .:: ..::::::: ..:. CCDS51 SCRNYNK-QASEQNWANYSAEQNRMGQAGSTISNSHAQPFDFPDDNQNSKKLAAGHELQP 300 310 320 330 340 350 >>CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13 (435 aa) initn: 1064 init1: 603 opt: 989 Z-score: 975.3 bits: 189.2 E(32554): 5.3e-48 Smith-Waterman score: 1020; 46.8% identity (67.2% similar) in 372 aa overlap (1-328:1-359) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG ::::.:: .::...::::::.::.:::::::::::.:: :.:.::::::::: ::: ::: CCDS92 MGDWSFLGRLLENAQEHSTVIGKVWLTVLFIFRILVLGAAAEDVWGDEQSDFTCNTQQPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD : :::::.::::::::.:.::..:::::::.:::::... : ::. ...: : . : .. CCDS92 CENVCYDRAFPISHIRFWALQIIFVSTPTLIYLGHVLHIVRMEEKKKEREEE-EQLKRES 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAED-GRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGW :. . : . . : .: ::.:. :::. ::: ... :...:.::. ::. :::. CCDS92 PSPK------EPPQDNPSSRDDRGRVRMAGALLRTYVFNIIFKTLFEVGFIAGQYFLYGF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 TMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSRG ..:.. :.: ::: ::::.::::::::::::::.:. ::.::.::. :: . :..: CCDS92 ELKPLYRCDRWPCPNTVDCFISRPTEKTIFIIFMLAVACASLLLNMLEIYHLGWKKLKQG 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 MRARQGQDA---------PPTQGTSSDPYTDQVFF--YL-----PVGQG-----PSSPP- . .: : :: :: :: : . . : : :.::. :..:: CCDS92 VTSRLGPDASEAPLGTADPPPLPPSSRPPAVAIGFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPP 240 250 260 270 280 290 280 290 300 310 pF1KB7 ------------------CPTYNG---LSSSEQNWANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNG ::: : .:::::: ..:.. :: . : . CCDS92 AADFKLLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTEQNWANQAAERQ-----PPALKAYPAAST 300 310 320 330 340 320 330 pF1KB7 QKSPSRPSSSASKKQYV .:: : .:.: CCDS92 PAAPS-PVGSSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGSGSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQP 350 360 370 380 390 400 >>CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1 (358 aa) initn: 944 init1: 579 opt: 935 Z-score: 923.7 bits: 179.4 E(32554): 4e-45 Smith-Waterman score: 935; 45.8% identity (71.9% similar) in 334 aa overlap (1-324:1-325) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG ::::.:: ..:..:..:::::::.:::::::::.:.:: :.:: :::::.::.:.: ::: CCDS92 MGDWSFLGNFLEEVHKHSTVVGKVWLTVLFIFRMLVLGTAAESSWGDEQADFRCDTIQPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD : :::::::::::::::::::..:::::.:::.::... : .:. . .:.: :: .. CCDS92 CQNVCYDQAFPISHIRYWVLQIIFVSTPSLVYMGHAMHTVRMQEKRKLREAE-RAKEVRG 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB7 P-QVERALAAVERQMAKISVAEDG--RLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY . : .: . :..: :.: :. ..:.:..::: :.: ....:.::. ::. .: CCDS92 SGSYEYPVA----EKAELSCWEEGNGRIALQGTLLNTYVCSILIRTTMEVGFIVGQYFIY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GWTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCL- : . . ::.:.:::. :.:.:::::::..::.:::.:. .::.:.: :: :: . . CCDS92 GIFLTTLHVCRRSPCPHPVNCYVSRPTEKNVFIVFMLAVAALSLLLSLAELYHLGWKKIR 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 SRGMRARQG----QDAPPTQGT--SSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQN .: .. :: : . :. : : : : : . .::.. ... .:.:: CCDS92 QRFVKPRQHMAKCQLSGPSVGIVQSCTPPPD---FNQCLENGPGGKFFNPFSNNMASQQN 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 WANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV ::.::. .. . : . ::: : :. CCDS92 TDNLVTEQVRGQEQTPGEGFIQVRYGQK-PEVPNGVSPGHRLPHGYHSDKRRLSKASSKA 300 310 320 330 340 350 CCDS92 RSDDLSV >>CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1 (515 aa) initn: 903 init1: 529 opt: 887 Z-score: 874.3 bits: 170.7 E(32554): 2.2e-42 Smith-Waterman score: 887; 52.7% identity (78.6% similar) in 243 aa overlap (1-240:1-242) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG ::::..: :..:. :::..::::::.:::::.:.::.:.:.::.:::: : ::: ::: CCDS43 MGDWNLLGDTLEEVHIHSTMIGKIWLTILFIFRMLVLGVAAEDVWNDEQSGFICNTEQPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSR--REERLRQKEGELRA-LP : ::::::::::: ::::::: .:::.:.:::.::..: : .::: :.: ..::. : CCDS43 CRNVCYDQAFPISLIRYWVLQVIFVSSPSLVYMGHALYRLRVLEEERQRMK-AQLRVELE 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 AKDPQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY . .. : .:... .. . .. .::.:. ::: .. .::.:.::. ::. :: CCDS43 EVEFEMPRDRRRLEQELCQLEKRKLNKAPLRGTLLCTYVIHIFTRSVVEVGFMIGQYLLY 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 GWTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLS :. .::.: :. ::: ..:::::::::::::..:: .. ::: ::.::. :: . .. CCDS43 GFHLEPLFKCHGHPCPNIIDCFVSRPTEKTIFLLFMQSIATISLFLNILEIFHLGFKKIK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 RGMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTE ::. CCDS43 RGLWGKYKLKKEHNEFHANKAKQNVAKYQSTSANSLKRLPSAPDYNLLVEKQTHTAVYPS 240 250 260 270 280 290 >>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1 (433 aa) initn: 904 init1: 577 opt: 881 Z-score: 869.5 bits: 169.6 E(32554): 4.1e-42 Smith-Waterman score: 881; 54.5% identity (79.4% similar) in 233 aa overlap (1-231:1-227) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG ::::.:: ..:..:.:::::.:..:::::::::::::: :.: ::::::::: ::: ::: CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD : :::::.:::::::: ::::..:::::.:.:.::... : ::. ...:.: . : CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYVRMEEKRKSREAEELGQQAGT 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDG--RLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLYG .. .. .: : . : ..:..:.:. ::. .. :...:.::. :.. ::: CCDS30 N------GGPDQGSVKKSSGSKGTKKFRLEGTLLRTYICHIIFKTLFEVGFIVGHYFLYG 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 WTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSR . . :.. :.: ::: .:::::::::::::::.::: :. .:: ::..:: :: CCDS30 FRILPLYRCSRWPCPNVVDCFVSRPTEKTIFILFMLSVASVSLFLNVMELGHLGLKGIRS 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 GMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEE CCDS30 ALKRPVEQPLGEIPEKSLHSIAVSSIQKAKGYQLLEEEKIVSHYFPLTEVGMVETSPLPA 240 250 260 270 280 290 >>CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6 (543 aa) initn: 909 init1: 522 opt: 882 Z-score: 869.0 bits: 169.8 E(32554): 4.4e-42 Smith-Waterman score: 882; 41.8% identity (71.2% similar) in 337 aa overlap (1-329:1-331) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG ::::..: .:..:. :::.:::::::.:::::.:.: .:.:.:: :::: : ::: ::: CCDS50 MGDWNLLGGILEEVHSHSTIVGKIWLTILFIFRMLVLRVAAEDVWDDEQSAFACNTRQPG 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQ-KEGELRALPAK :.:.:::.::::: ::.::::..:::.:.:::.::..: : :. :: :...::: . CCDS50 CNNICYDDAFPISLIRFWVLQIIFVSSPSLVYMGHALYRLRAFEKDRQRKKSHLRA-QME 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 DPQVE-RALAAVERQMAKISVAEDGRLR---IRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWR .:... . ..:.. .. :. :.. ..: :. ::: .: .::::.::. ::. CCDS50 NPDLDLEEQQRIDRELRRLE--EQKRIHKVPLKGCLLRTYVLHILTRSVLEVGFMIGQYI 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 LYGWTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRC :::. :.:.. : . ::: ::::::::::::::..:: .. :::.::.::. :: : CCDS50 LYGFQMHPLYKCTQPPCPNAVDCFVSRPTEKTIFMLFMHSIAAISLLLNILEIFHLGIRK 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 LSRGMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWA--- . : . ...... . .. :. . . . :: : . :....:. . CCDS50 IMRTLYKKSSSEG--IEDETGPPFHLKKYSVAQQCMICSSLP-ERISPLQANNQQQVIRV 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 NLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV :. . . . : :. :.::.:. :. .. ... CCDS50 NVPKSKTMWQIPQPRQLEVDPSNGKKDWSEKDQHSGQLHVHSPCPWAGSAGNQHLGQQSD 300 310 320 330 340 350 CCDS50 HSSFGLQNTMSQSWLGTTTAPRNCPSFAVGTWEQSQDPEPSGEPLTDLHSHCRDSEGSMR 360 370 380 390 400 410 >>CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13 (226 aa) initn: 715 init1: 471 opt: 487 Z-score: 487.6 bits: 98.0 E(32554): 7.7e-21 Smith-Waterman score: 734; 47.9% identity (72.3% similar) in 242 aa overlap (3-241:2-224) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG ::: :. .: :..::: .:::::::::::::.:: .:.. ::::::.:: ::: ::: CCDS92 MDWGTLQTILGGVNKHSTSIGKIWLTVLFIFRIMILVVAAKEVWGDEQADFVCNTLQPG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQ-KEGELRALPAK : :::::. ::::::: :.::..:::::.:. :: : ::.:. :. .::... : CCDS92 CKNVCYDHYFPISHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAY--RRHEKKRKFIKGEIKS-EFK 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 DPQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY-G : . .. : ..::.:.: ::..:.. . ..::.:.: . .: : CCDS92 D------IEEIKTQ----------KVRIEGSLWWTYTSSIFFRVIFEAAFMYVFYVMYDG 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 WTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCR-CLS ..:. . :. ::: ::::::::::::.: .::..:. : ..::. :: .:: : : . CCDS92 FSMQRLVKCNAWPCPNTVDCFVSRPTEKTVFTVFMIAVSGICILLNVTELCYLLIRYCSG 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 RGMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTE .. . CCDS92 KSKKPV >>CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1 (270 aa) initn: 740 init1: 477 opt: 477 Z-score: 476.6 bits: 96.2 E(32554): 3.1e-20 Smith-Waterman score: 677; 40.0% identity (64.5% similar) in 290 aa overlap (3-290:2-266) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG :: :. ::. :...::. :.:::.:.:.::.:. .:.: ::::::.::.::: ::: CCDS38 MDWKTLQALLSGVNKYSTAFGRIWLSVVFVFRVLVYVVAAERVWGDEQKDFDCNTKQPG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD :::::::. ::::.:: :.::..::. :.:. . :: : .::.: :::.:. CCDS38 CTNVCYDNYFPISNIRLWALQLIFVTCPSLLVILHVAYREERERRHRQKHGD-------- 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY-GW : ::. :. . .:.: ::. :.. : ..: ::: :. :. CCDS38 ------------QCAKLY---DNAGKKHGGLWWTYLFSLIFKLIIEFLFLYLLHTLWHGF 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 TMEPVFVCQR-APCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCRCLSR .: . : :::: .:::...::::: :: ::. .. . .::.. :: .:.:. . : CCDS38 NMPRLVQCANVAPCPNIVDCYIARPTEKKIFTYFMVGASAVCIVLTICELCYLICHRVLR 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 GMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEE :.. . . . ....: : . : : : .: : : :..: : CCDS38 GLHKDKPRGGCSPSSSASRASTCRCHHKL-VEAGEVDPD-PGNNKLQASAPNLTPI 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 pF1KB7 RLASSRPPLFLDPPPQNGQKSPSRPSSSASKKQYV >>CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13 (261 aa) initn: 718 init1: 452 opt: 464 Z-score: 464.1 bits: 93.9 E(32554): 1.6e-19 Smith-Waterman score: 732; 45.4% identity (70.3% similar) in 249 aa overlap (3-249:2-232) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG ::: :. .. :..::: .::.:.::.::::..:: .:.. :::::: :: ::: ::: CCDS92 MDWGTLHTFIGGVNKHSTSIGKVWITVIFIFRVMILVVAAQEVWGDEQEDFVCNTLQPG 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIYLSRREERLRQKEGELRALPAKD : :::::. ::.:::: :.::..:::::.:. :: : :.: . ..:: : :: CCDS92 CKNVCYDHFFPVSHIRLWALQLIFVSTPALLVAMHVAYY-RHETTRKFRRGEKRN-DFKD 60 70 80 90 100 110 130 140 150 160 170 pF1KB7 PQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIRGALMGTYVASVLCKSVLEAGFLYGQWRLY-GW . ...: ..::.:.: ::..:.. . ..::.:.: . :: :. CCDS92 ------IEDIKKQ----------KVRIEGSLWWTYTSSIFFRIIFEAAFMYVFYFLYNGY 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 TMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVGLISLVLNLLELVHLLCR-CLSR . :. : ::: :::::.:::::::.: :::. ...: ..::. :: .:: . :. : CCDS92 HLPWVLKCGIDPCPNLVDCFISRPTEKTVFTIFMISASVICMLLNVAELCYLLLKVCFRR 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 GMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPPCPTYNGLSSSEQNWANLTTEE . ::. .. : CCDS92 SKRAQTQKNHPNHALKESKQNEMNELISDSGQNAITGFPS 230 240 250 260 333 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 05:12:34 2016 done: Fri Nov 4 05:12:35 2016 Total Scan time: 3.040 Total Display time: 0.030 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]