Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7140
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7140, 333 aa
1>>>pF1KB7140 333 - 333 aa - 333 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5305+/-0.00118; mu= 14.6881+/- 0.070
mean_var=130.0499+/-40.203, 0's: 0 Z-trim(102.9): 205 B-trim: 1006 in 2/47
Lambda= 0.112465
statistics sampled from 6860 (7183) to 6860 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.564), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.430
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 ( 354) 2193 368.0 6.2e-102
CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 ( 342) 1083 187.9 1e-47
CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 ( 338) 1031 179.5 3.5e-45
CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 ( 358) 913 160.4 2.1e-39
CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 ( 319) 687 123.6 2.1e-28
CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX ( 381) 537 99.4 5e-21
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CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 479 89.9 3.3e-18
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 464 87.5 1.7e-17
CCDS318.1 PTAFR gene_id:5724|Hs108|chr1 ( 342) 447 84.7 1.2e-16
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 432 82.3 6.5e-16
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 432 82.4 6.8e-16
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 432 82.4 6.9e-16
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 415 79.6 4.4e-15
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 410 78.7 7.5e-15
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 403 77.6 1.7e-14
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 401 77.3 2.2e-14
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 397 76.6 3.3e-14
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 397 76.7 3.4e-14
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 393 76.0 5.4e-14
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 385 74.7 1.3e-13
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 385 74.7 1.4e-13
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 385 74.7 1.4e-13
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 385 74.7 1.4e-13
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 385 74.7 1.4e-13
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 385 74.8 1.4e-13
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 385 74.8 1.4e-13
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 385 74.8 1.4e-13
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 385 74.8 1.5e-13
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 384 74.6 1.5e-13
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 385 74.9 1.6e-13
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 382 74.2 1.8e-13
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 382 74.2 1.8e-13
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 382 74.2 1.9e-13
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 379 73.7 2.5e-13
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 368 71.9 8.7e-13
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 367 71.8 1e-12
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14 ( 353) 366 71.6 1.1e-12
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 360 70.6 2e-12
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 356 70.1 3.7e-12
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 354 69.6 4.1e-12
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 353 69.5 4.8e-12
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 348 68.7 8.8e-12
CCDS53842.1 HCAR3 gene_id:8843|Hs108|chr12 ( 387) 347 68.6 9.6e-12
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 345 68.2 1.2e-11
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 345 68.2 1.2e-11
CCDS9235.1 HCAR2 gene_id:338442|Hs108|chr12 ( 363) 345 68.2 1.2e-11
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 345 68.2 1.2e-11
CCDS9879.1 GPR65 gene_id:8477|Hs108|chr14 ( 337) 343 67.8 1.4e-11
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 341 67.6 1.8e-11
>>CCDS3158.2 P2RY13 gene_id:53829|Hs108|chr3 (354 aa)
initn: 2193 init1: 2193 opt: 2193 Z-score: 1943.5 bits: 368.0 E(32554): 6.2e-102
Smith-Waterman score: 2193; 99.7% identity (99.7% similar) in 333 aa overlap (1-333:22-354)
10 20 30
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS31 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
310 320 330 340 350
>>CCDS3159.1 P2RY12 gene_id:64805|Hs108|chr3 (342 aa)
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Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (15-328:17-332)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLALWVFVHIPSSSTFI
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CCDS31 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
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60 70 80 90 100 110
pF1KB7 IYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAF
:.::::...::.: : .:::::::..:. ::.:::. .::::: :::..: .::::..
CCDS31 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
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120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKEATPSSVKKCASLKG
::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:.. ..::::. ::.
CCDS31 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSKDRKNNKKLEGKVFV
.:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: .... . ::.. :::.
CCDS31 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFLAATNICMDPLIYIF
..::::.::.::::::.::: ::: . :: .: :: .::.::.:.. : :.::.::.:
CCDS31 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
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300 310 320 330
pF1KB7 LCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG
:::.: ..: : ..:.: :.:.... :
CCDS31 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
310 320 330 340
>>CCDS3156.1 P2RY14 gene_id:9934|Hs108|chr3 (338 aa)
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Smith-Waterman score: 1031; 46.6% identity (79.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:2-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLALWVFVHIPSSSTFII
.:.: : ..: : .. :.: ..:.:: .::..::::: .. :.: ..:::..:::
CCDS31 MINSTSTQPPDES--CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFII
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pF1KB7 YLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAFD
:::: ..::..:.: .:::::.:: :.:::: .:::: :.:.:: .:::.::..:::.::
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pF1KB7 RFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKEATPSSVKKCASLKGP
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CCDS31 RYYKIVKPLWTSFIQSVSYSKLLSVIVWMLMLLLAVPNIILTNQSVREVTQIKCIELKSE
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180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSKDRKNNKKLEGKVFVV
:: :::. : : ::: ::.:..:::..:.::.. :. ::. .. . .:: ..: .
CCDS31 LGRKWHKASNYIFVAIFWIVFLLLIVFYTAITKKIFKSHLKSSRNSTSVKKKSSRNIFSI
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pF1KB7 VAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFLAATNICMDPLIYIFL
: ::::::.:.:.::.:::.:::. . .:. .. : :: ::.:.:.:.:.::.::.::
CCDS31 VFVFFVCFVPYHIARIPYTKSQTEAHYSCQSKEILRYMKEFTLLLSAANVCLDPIIYFFL
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300 310 320 330
pF1KB7 CKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
:. : : : :
CCDS31 CQPFREIL-CKKLHIPLKAQNDLDISRIKRGNTTLESTDTL
300 310 320 330
>>CCDS3157.1 GPR87 gene_id:53836|Hs108|chr3 (358 aa)
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Smith-Waterman score: 913; 41.0% identity (78.0% similar) in 305 aa overlap (10-307:25-325)
10 20 30 40
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQ----LVFPALYTVVFLTGILLN
:::. ..: . . .:.:.:: ..:...::::
CCDS31 MGFNLTLAKLPNNELHGQESHNSGNRSDGPGKNTTLHNEFDTIVLPVLYLIIFVASILLN
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 TLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVI
::.:.: :: ....::.:::: .:::::::: .::.:. :. ..:: .. ..::..::.
CCDS31 GLAVWIFFHIRNKTSFIFYLKNIVVADLIMTLTFPFRIVHDAGFGPWYFKFILCRYTSVL
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110 120 130 140 150 160
pF1KB7 FYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILS
:: .::..::.::::..::.::...:. . . . .:.:..:. .: .. .::::.::.
CCDS31 FYANMYTSIVFLGLISIDRYLKVVKPFGDSRMYSITFTKVLSVCVWVIMAVLSLPNIILT
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 NKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRK-
: . : .... :..::.:::.::: :. . . .: .:..... :..:.. .. : :.
CCDS31 NGQPTEDNIHDCSKLKSPLGVKWHTAVTYVNSCLFVAVLVILIGCYIAISRYIHKSSRQF
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270
pF1KB7 --SKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAK
..:. ::.:.... :::::::.:: :.:. :.:.: :. . : :. :. :
CCDS31 ISQSSRKRKHNQSIR----VVVAVFFTCFLPYHLCRIPFTFSHLDRLLDESAQKILYYCK
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 ETTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
: ::::.: :.:.::.::.:.:..:...:
CCDS31 EITLFLSACNVCLDPIIYFFMCRSFSRRLFKKSNIRTRSESIRSLQSVRRSEVRIYYDYT
300 310 320 330 340 350
>>CCDS3155.1 GPR171 gene_id:29909|Hs108|chr3 (319 aa)
initn: 702 init1: 379 opt: 687 Z-score: 623.4 bits: 123.6 E(32554): 2.1e-28
Smith-Waterman score: 687; 33.3% identity (67.3% similar) in 318 aa overlap (10-326:3-310)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLALWVFVHIPSSSTFI-I
: : :: . : .. .:::.::. . .: :.:.. .. . :
CCDS31 MTNSSFFCPVYKDLEP--FTYFFYLVFLVGIIGSCFATWAFIQKNTNHRCVSI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAFD
:: : :.::...:: :: ::. : .:::.:. : :. .. ..: .::..:..:.....:
CCDS31 YLINLLTADFLLTLALPVKIVVDLGVAPWKLKIFHCQVTACLIYINMYLSIIFLAFVSID
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKEATPSSVKKCASLKGP
: :.. . . ...: ::: .: .:.....: .:::.. :. .: : .:
CCDS31 RCLQLTHSCKIYRIQEPGFAKMISTVVWLMVLLIMVPNMMIPIKDIKEKSNVGCMEFKKE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSKDRKNNKKLEGKVFVV
.: .:: ..: :: :: . ..:. .. ...: :.. ... : :: ....:
CCDS31 FGRNWHLLTNFICVAIFLNFSAIILISNCLVIRQLY---RNKDNENYPNVKKALINILLV
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFLAATNICMDPLIYIFL
.. ...::.:.:..:.::: :::. ::: . .:: :::.::.::..:.:.::..: :
CCDS31 TTGYIICFVPYHIVRIPYTLSQTEVITDCSTRISLFKAKEATLLLAVSNLCFDPILYYHL
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330
pF1KB7 CKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
: : :. .: :: .:.....
CCDS31 SKAFRSKVT-----ETFASPKETKAQKEKLRCENNA
290 300 310
>>CCDS14258.1 GPR34 gene_id:2857|Hs108|chrX (381 aa)
initn: 384 init1: 269 opt: 537 Z-score: 491.0 bits: 99.4 E(32554): 5e-21
Smith-Waterman score: 537; 30.7% identity (63.0% similar) in 300 aa overlap (15-309:46-339)
10 20 30 40
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLA
:: : .... :. . :.:.:..:.. : .:
CCDS14 WPYSSHRMRFITNHSDQPPQNFSATPNVTTCPMDEKLLSTVLTTSYSVIFIVGLVGNIIA
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CCDS94 NKKALNTIILIIVVFVLCFTPYHVAIIQHMIKKLRFSNFLECSQRHSFQISLHFTVCLMN
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CCDS94 NGK
360
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CCDS21 TSCLTSLNGALDPIMYFFVAEKFRHALCNLLCGKRLKGPPPSFEGKTNESSLSAKSEL
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CCDS14 RCIAIVFPVQNINLVTQKKARFVCVGIWIFVILTSSP-FLMAKPQKDEKNNTKCFEPPQD
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CCDS31 RRALWMVCTVLAVFIICFVPHHVVQLPWTLAELGFQ-DSKFHQAINDAHQVTLCLLSTNC
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