Result of FASTA (omim) for
pF1KB7140
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7140, 333 aa
1>>>pF1KB7140 333 - 333 aa - 333 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9293+/-0.000466; mu= 18.2787+/- 0.029
mean_var=116.1682+/-31.558, 0's: 0 Z-trim(108.7): 484 B-trim: 1002 in 1/48
Lambda= 0.118996
statistics sampled from 16253 (16862) to 16253 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.539), E-opt: 0.2 (0.198), width: 16
Scan time: 6.560
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_795713 (OMIM: 606380) P2Y purinoceptor 13 [Homo ( 354) 2193 388.4 1.2e-107
XP_006713727 (OMIM: 606380) PREDICTED: P2Y purinoc ( 224) 1224 221.8 1.1e-57
XP_016862558 (OMIM: 600515,609821) PREDICTED: P2Y ( 342) 1083 197.8 2.7e-50
NP_795345 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 1083 197.8 2.7e-50
NP_073625 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 1 ( 342) 1083 197.8 2.7e-50
NP_055694 (OMIM: 610116) P2Y purinoceptor 14 [Homo ( 338) 1031 188.9 1.3e-47
XP_005247980 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 188.9 1.3e-47
XP_005247979 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 188.9 1.3e-47
XP_011511642 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 188.9 1.3e-47
XP_016863072 (OMIM: 610116) PREDICTED: P2Y purinoc ( 338) 1031 188.9 1.3e-47
NP_001074924 (OMIM: 610116) P2Y purinoceptor 14 [H ( 338) 1031 188.9 1.3e-47
NP_076404 (OMIM: 606379) G-protein coupled recepto ( 358) 913 168.7 1.7e-41
NP_001091048 (OMIM: 300241) probable G-protein cou ( 381) 537 104.1 4.8e-22
NP_005291 (OMIM: 300241) probable G-protein couple ( 381) 537 104.1 4.8e-22
XP_005272654 (OMIM: 300241) PREDICTED: probable G- ( 381) 537 104.1 4.8e-22
NP_004942 (OMIM: 605741) G-protein coupled recepto ( 361) 500 97.8 3.8e-20
XP_016875894 (OMIM: 605741) PREDICTED: G-protein c ( 361) 500 97.8 3.8e-20
NP_001154889 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 479 94.1 4.5e-19
NP_001154888 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 339) 479 94.1 4.5e-19
XP_016859322 (OMIM: 603071) PREDICTED: uracil nucl ( 367) 479 94.2 4.7e-19
NP_001154887 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cyst ( 367) 479 94.2 4.7e-19
NP_005282 (OMIM: 603071) uracil nucleotide/cystein ( 367) 479 94.2 4.7e-19
NP_001269116 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 91.5 2.7e-18
NP_001269117 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 91.5 2.7e-18
NP_006630 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene rec ( 337) 464 91.5 2.7e-18
NP_001269115 (OMIM: 300201) cysteinyl leukotriene ( 337) 464 91.5 2.7e-18
NP_001158195 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 88.6 2e-17
NP_001158194 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 88.6 2e-17
NP_000943 (OMIM: 173393) platelet-activating facto ( 342) 447 88.6 2e-17
NP_001158193 (OMIM: 173393) platelet-activating fa ( 342) 447 88.6 2e-17
NP_033611 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 432 86.1 1.2e-16
NP_000676 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 359) 432 86.1 1.2e-16
NP_114438 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 388) 432 86.1 1.3e-16
NP_004826 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 432 86.1 1.3e-16
NP_114038 (OMIM: 106165,145500,267430) type-1 angi ( 394) 432 86.1 1.3e-16
NP_002556 (OMIM: 300038) P2Y purinoceptor 4 [Homo ( 365) 415 83.2 9.5e-16
NP_001155970 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidi ( 344) 410 82.3 1.7e-15
NP_001155969 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidi ( 344) 410 82.3 1.7e-15
NP_005758 (OMIM: 278150,609239) lysophosphatidic a ( 344) 410 82.3 1.7e-15
NP_005287 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid rec ( 370) 403 81.1 4e-15
XP_005262183 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 81.1 4e-15
NP_001264929 (OMIM: 300086) lysophosphatidic acid ( 370) 403 81.1 4e-15
XP_016884927 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 81.1 4e-15
XP_016884926 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 81.1 4e-15
XP_006724702 (OMIM: 300086) PREDICTED: lysophospha ( 370) 403 81.1 4e-15
NP_002554 (OMIM: 601167) P2Y purinoceptor 1 [Homo ( 373) 401 80.8 5.1e-15
NP_005281 (OMIM: 601166) G-protein coupled recepto ( 360) 397 80.1 8e-15
XP_011543376 (OMIM: 600041) PREDICTED: P2Y purinoc ( 377) 397 80.1 8.2e-15
XP_016873328 (OMIM: 600041) PREDICTED: P2Y purinoc ( 377) 397 80.1 8.2e-15
NP_002555 (OMIM: 600041) P2Y purinoceptor 2 [Homo ( 377) 397 80.1 8.2e-15
>>NP_795713 (OMIM: 606380) P2Y purinoceptor 13 [Homo sap (354 aa)
initn: 2193 init1: 2193 opt: 2193 Z-score: 2053.5 bits: 388.4 E(85289): 1.2e-107
Smith-Waterman score: 2193; 99.7% identity (99.7% similar) in 333 aa overlap (1-333:22-354)
10 20 30
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
NP_795 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 KSKSKDRKNNKKLEGKVFVVVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKE
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_795 TTLFLAATNICMDPLIYIFLCKKFTEKLPCMQGRKTTASSQENHSSQTDNITLG
310 320 330 340 350
>>XP_006713727 (OMIM: 606380) PREDICTED: P2Y purinocepto (224 aa)
initn: 1245 init1: 1224 opt: 1224 Z-score: 1156.6 bits: 221.8 E(85289): 1.1e-57
Smith-Waterman score: 1224; 98.9% identity (99.5% similar) in 188 aa overlap (1-188:22-209)
10 20 30
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MTAAIRRQRELSILPKVTLEAMNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGIL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LNTLALWVFVHIPSSSTFIIYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSS
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
XP_006 VIFYETMYVGIVLLGLIAFDRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNTI
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYR
::::::::::::::::::::::::::::.
XP_006 LSNKEATPSSVKKCASLKGPLGLKWHQMICAERKKKRPTLEVHC
190 200 210 220
>>XP_016862558 (OMIM: 600515,609821) PREDICTED: P2Y puri (342 aa)
initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1023.8 bits: 197.8 E(85289): 2.7e-50
Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (15-328:17-332)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLALWVFVHIPSSSTFI
: :: .:.:..:: ::::.:..:.. : ::. .: .: :.:.::
XP_016 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 IYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAF
:.::::...::.: : .:::::::..:. ::.:::. .::::: :::..: .::::..
XP_016 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKEATPSSVKKCASLKG
::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:.. ..::::. ::.
XP_016 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSKDRKNNKKLEGKVFV
.:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: .... . ::.. :::.
XP_016 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFLAATNICMDPLIYIF
..::::.::.::::::.::: ::: . :: .: :: .::.::.:.. : :.::.::.:
XP_016 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KB7 LCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG
:::.: ..: : ..:.: :.:.... :
XP_016 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
310 320 330 340
>>NP_795345 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 12 [H (342 aa)
initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1023.8 bits: 197.8 E(85289): 2.7e-50
Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (15-328:17-332)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLALWVFVHIPSSSTFI
: :: .:.:..:: ::::.:..:.. : ::. .: .: :.:.::
NP_795 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 IYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAF
:.::::...::.: : .:::::::..:. ::.:::. .::::: :::..: .::::..
NP_795 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKEATPSSVKKCASLKG
::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:.. ..::::. ::.
NP_795 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSKDRKNNKKLEGKVFV
.:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: .... . ::.. :::.
NP_795 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFLAATNICMDPLIYIF
..::::.::.::::::.::: ::: . :: .: :: .::.::.:.. : :.::.::.:
NP_795 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KB7 LCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG
:::.: ..: : ..:.: :.:.... :
NP_795 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
310 320 330 340
>>NP_073625 (OMIM: 600515,609821) P2Y purinoceptor 12 [H (342 aa)
initn: 1102 init1: 1055 opt: 1083 Z-score: 1023.8 bits: 197.8 E(85289): 2.7e-50
Smith-Waterman score: 1083; 49.1% identity (79.1% similar) in 316 aa overlap (15-328:17-332)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLALWVFVHIPSSSTFI
: :: .:.:..:: ::::.:..:.. : ::. .: .: :.:.::
NP_073 MQAVDNLTSAPGNTSLCTRDYKITQVLFPLLYTVLFFVGLITNGLAMRIFFQIRSKSNFI
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 IYLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAF
:.::::...::.: : .:::::::..:. ::.:::. .::::: :::..: .::::..
NP_073 IFLKNTVISDLLMILTFPFKILSDAKLGTGPLRTFVCQVTSVIFYFTMYISISFLGLITI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 DRFLKIIRPLRNIFLKKPVFAKTVSIFIWFFLFFISLPNMILSNKEATPSSVKKCASLKG
::. : ::... :. . :: .:. :: :.:..:::::::.:.. ..::::. ::.
NP_073 DRYQKTTRPFKTSNPKNLLGAKILSVVIWAFMFLLSLPNMILTNRQPRDKNVKKCSFLKS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 PLGLKWHQMVNNICQFIFWTVFILMLVFYVVIAKKVYDSYRKSKSKDRKNNKKLEGKVFV
.:: ::..:: ::: ::: :....: :..:.:..: :: .... . ::.. :::.
NP_073 EFGLVWHEIVNYICQVIFWINFLIVIVCYTLITKELYRSYVRTRGVGKVPRKKVNVKVFI
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 VVAVFFVCFAPFHFARVPYTHSQTNNKTDCRLQNQLFIAKETTLFLAATNICMDPLIYIF
..::::.::.::::::.::: ::: . :: .: :: .::.::.:.. : :.::.::.:
NP_073 IIAVFFICFVPFHFARIPYTLSQTRDVFDCTAENTLFYVKESTLWLTSLNACLDPFIYFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330
pF1KB7 LCKKFTEKLPCMQGRKTTASS--QENHSSQTDNITLG
:::.: ..: : ..:.: :.:.... :
NP_073 LCKSFRNSLISMLKCPNSATSLSQDNRKKEQDGGDPNEETPM
310 320 330 340
>>NP_055694 (OMIM: 610116) P2Y purinoceptor 14 [Homo sap (338 aa)
initn: 1009 init1: 988 opt: 1031 Z-score: 975.6 bits: 188.9 E(85289): 1.3e-47
Smith-Waterman score: 1031; 46.6% identity (79.0% similar) in 309 aa overlap (1-309:2-307)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNTTVMQGFNRSERCPRDTRIVQLVFPALYTVVFLTGILLNTLALWVFVHIPSSSTFII
.:.: : ..: : .. :.: ..:.:: .::..::::: .. :.: ..:::..:::
NP_055 MINSTSTQPPDES--CSQNLLITQQIIPVLYCMVFIAGILLNGVSGWIFFYVPSSKSFII
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 YLKNTLVADLIMTLMLPFKILSDSHLAPWQLRAFVCRFSSVIFYETMYVGIVLLGLIAFD
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