Result of FASTA (omim) for
pF1KB7149
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7149, 347 aa
1>>>pF1KB7149 347 - 347 aa - 347 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8286+/-0.00033; mu= 10.6746+/- 0.021
mean_var=117.3956+/-23.333, 0's: 0 Z-trim(119.0): 128 B-trim: 325 in 1/54
Lambda= 0.118372
statistics sampled from 32478 (32606) to 32478 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.729), E-opt: 0.2 (0.382), width: 16
Scan time: 9.120
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 2303 403.7 3e-112
NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 2303 403.7 3e-112
NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 2303 403.7 3e-112
NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antig ( 346) 1500 266.6 5.6e-71
XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-as ( 319) 1368 244.0 3.2e-64
NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antig ( 319) 1368 244.0 3.2e-64
XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-as ( 336) 1145 206.0 9.8e-53
NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated an ( 336) 1145 206.0 9.8e-53
NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antig ( 347) 1109 199.8 7.1e-51
NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antig ( 346) 1078 194.5 2.8e-49
XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1078 194.5 2.8e-49
XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1078 194.5 2.8e-49
XP_011543756 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 949 172.5 1.1e-42
XP_011543755 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 949 172.5 1.1e-42
NP_001093391 (OMIM: 300762) melanoma-associated an ( 324) 949 172.5 1.1e-42
NP_066386 (OMIM: 300343) melanoma-associated antig ( 369) 897 163.7 5.9e-40
NP_001238757 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 897 163.7 5.9e-40
NP_001011543 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 897 163.7 5.9e-40
NP_775794 (OMIM: 300467) melanoma-associated antig ( 407) 871 159.2 1.4e-38
XP_016885011 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 394) 861 157.5 4.4e-38
NP_001011544 (OMIM: 300344) melanoma-associated an ( 400) 861 157.5 4.5e-38
XP_011529466 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 421) 861 157.5 4.7e-38
NP_005357 (OMIM: 300344) melanoma-associated antig ( 429) 861 157.5 4.8e-38
XP_016885010 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 429) 861 157.5 4.8e-38
NP_002353 (OMIM: 300175) melanoma-associated antig ( 317) 855 156.4 7.6e-38
NP_001011548 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 855 156.4 7.6e-38
NP_001011549 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 855 156.4 7.6e-38
XP_005274736 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 855 156.4 7.6e-38
NP_001011550 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 855 156.4 7.6e-38
XP_005274735 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 855 156.4 7.6e-38
XP_005274734 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 397) 855 156.5 9.1e-38
NP_001258681 (OMIM: 300466) melanoma-associated an ( 275) 847 155.0 1.7e-37
XP_016885009 (OMIM: 300341) PREDICTED: melanoma-as ( 318) 830 152.2 1.5e-36
NP_001159872 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 830 152.2 1.5e-36
NP_005355 (OMIM: 300341) melanoma-associated antig ( 318) 830 152.2 1.5e-36
NP_001159873 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 830 152.2 1.5e-36
NP_004979 (OMIM: 300016) melanoma-associated antig ( 309) 800 147.0 5e-35
XP_005278250 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 790 145.3 1.7e-34
XP_005262392 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 790 145.3 1.7e-34
NP_001074259 (OMIM: 300764) melanoma-associated an ( 315) 790 145.3 1.7e-34
NP_005356 (OMIM: 300342) melanoma-associated antig ( 315) 790 145.3 1.7e-34
XP_005278249 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 790 145.3 1.7e-34
XP_005262391 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 790 145.3 1.7e-34
NP_057333 (OMIM: 300468) melanoma-associated antig ( 373) 773 142.5 1.4e-33
NP_001269433 (OMIM: 300173) melanoma-associated an ( 314) 729 134.9 2.3e-31
NP_001269430 (OMIM: 300173) melanoma-associated an ( 314) 729 134.9 2.3e-31
NP_005352 (OMIM: 300173) melanoma-associated antig ( 314) 729 134.9 2.3e-31
NP_786885 (OMIM: 300173) melanoma-associated antig ( 314) 729 134.9 2.3e-31
NP_001308333 (OMIM: 300549) melanoma-associated an ( 314) 729 134.9 2.3e-31
NP_001308331 (OMIM: 300549) melanoma-associated an ( 314) 729 134.9 2.3e-31
>>NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 2303 init1: 2303 opt: 2303 Z-score: 2136.3 bits: 403.7 E(85289): 3e-112
Smith-Waterman score: 2303; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
310 320 330 340
>>NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 2303 init1: 2303 opt: 2303 Z-score: 2136.3 bits: 403.7 E(85289): 3e-112
Smith-Waterman score: 2303; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_796 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
310 320 330 340
>>NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 2303 init1: 2303 opt: 2303 Z-score: 2136.3 bits: 403.7 E(85289): 3e-112
Smith-Waterman score: 2303; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSPVLGDTPTSSPAAGIPQK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 PQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFIL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 RKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 LNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYGE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 PRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_803 PSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
310 320 330 340
>>NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antigen B (346 aa)
initn: 1436 init1: 884 opt: 1500 Z-score: 1395.2 bits: 266.6 E(85289): 5.6e-71
Smith-Waterman score: 1500; 68.1% identity (83.6% similar) in 348 aa overlap (1-347:1-346)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSP-VLGDTPTSSPAAGIPQ
:::::::::::::::...: .:: :::.. ::::::: :::: :: :: .:: : ::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAFGIPQ
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pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHFI
.:: ::::.::::.::: ::.: . : ::::: :::.:::: :.:: .. .. ::..:.
NP_002 EPQREPPTTSAAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLVQFL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLVS
: ::::.:: ::.:::....:::.:: ::. .:.: :::::: ::: ::. :.: :::
NP_002 LYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYILVS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIYG
:. :::: :. : .::::::::::.::::.:: : :::::.:.:.:: :::..:::.:
NP_002 MLG-PNDGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHLIFG
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 EPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPRD
::::.:::::::::::.:.::::::::::::::::::.:::.::::::::::.: .:: .
NP_002 EPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTTPNN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 FPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
:: :::::::::::: .: : ::: ::: : : ::: : ::.::
NP_002 FPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMT-SAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-associ (319 aa)
initn: 1264 init1: 1043 opt: 1368 Z-score: 1273.9 bits: 244.0 E(85289): 3.2e-64
Smith-Waterman score: 1368; 65.2% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-313:1-316)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
:::::::::::::::::::.::.::.: ..: ::.:: : :: : : . .:::::::::
XP_011 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
.:: :: :..:::: :: :.: .::: :::.::: :::.:::.: .::.. ..: :..
XP_011 EPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
:.: :::... . :..:::.: .....:: :::. ::. : .::::.:.. ::.:::::.
XP_011 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
..:..::.. .: ..::::: :::::::::::.::::::::::.:.:.::.:::::: .
XP_011 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
.::: :.::.::::::::.:.:::.:::::.::::::::::::.::::::::::.::.::
XP_011 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB7 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
::.::::::.:::.
XP_011 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
310
>>NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antigen B (319 aa)
initn: 1264 init1: 1043 opt: 1368 Z-score: 1273.9 bits: 244.0 E(85289): 3.2e-64
Smith-Waterman score: 1368; 65.2% identity (88.0% similar) in 316 aa overlap (1-313:1-316)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPS-SSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
:::::::::::::::::::.::.::.: ..: ::.:: : :: : : . .:::::::::
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRRKARDETRGLNVPQVTEAEEEEAPCCSSSVSGGAASSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAA-VSCTESDEGAKC-QGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMH
.:: :: :..:::: :: :.: .::: :::.::: :::.:::.: .::.. ..: :..
NP_002 EPQRAPTTAAAAAAGVSSTKSKKGAKSHQGEKNASSSQASTSTKSPSEDPLTRKSGSLVQ
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 FILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTL
:.: :::... . :..:::.: .....:: :::. ::. : .::::.:.. ::.:::::.
NP_002 FLLYKYKIKKSVTKGEMLKIVGKRFREHFPEILKKASEGLSVVFGLELNKVNPNGHTYTF
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLI
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NP_002 IDKVDLTDEESLLSSWDFPRRKLLMPLLGVIFLNGNSATEEEIWEFLNMLGVYDGEEHSV
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATP
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NP_002 FGEPWKLITKDLVQEKYLEYKQVPSSDPPRFQFLWGPRAYAETSKMKVLEFLAKVNGTTP
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KB7 RDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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NP_002 CAFPTHYEEALKDEEKAGV
310
>>XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-associ (336 aa)
initn: 1174 init1: 983 opt: 1145 Z-score: 1067.8 bits: 206.0 E(85289): 9.8e-53
Smith-Waterman score: 1145; 55.1% identity (78.9% similar) in 332 aa overlap (1-330:1-331)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSS-PVLGDTPTSSPAAGIPQ
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XP_011 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQ-GEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHF
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XP_011 ESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSF-HGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQF
70 80 90 100 110
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pF1KB7 ILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLV
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XP_011 LLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVLV
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pF1KB7 SKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIY
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XP_011 GKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFIY
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pF1KB7 GEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPR
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XP_011 GEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVAS
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 DFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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XP_011 TYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
300 310 320 330
>>NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated antige (336 aa)
initn: 1174 init1: 983 opt: 1145 Z-score: 1067.8 bits: 206.0 E(85289): 9.8e-53
Smith-Waterman score: 1145; 55.1% identity (78.9% similar) in 332 aa overlap (1-330:1-331)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSS-PVLGDTPTSSPAAGIPQ
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NP_001 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSPPQSFPNAGIPQ
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pF1KB7 KPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQ-GEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLMHF
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NP_001 ESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSF-HGPSSSESTGRDLLNTKTGELVQF
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 ILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYTLV
.: :: .::: . ::::...:::.:: ::: ... .:.:::: ::: .:: ..:.::
NP_001 LLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYVLV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 SKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHLIY
.::.. :.:.::. :: .:::: ::..::..:: :::::.:. .:.:: : :..:.::
NP_001 GKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHFIY
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGATPR
:::....:.:::.: ::.:.:::.::::::.::::::: :::.:::::::.::.: ..
NP_001 GEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTVAS
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 DFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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NP_001 TYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARASRSFQP
300 310 320 330
>>NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1088 init1: 950 opt: 1109 Z-score: 1034.3 bits: 199.8 E(85289): 7.1e-51
Smith-Waterman score: 1109; 52.4% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECP-SSSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
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NP_872 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSS-LDGASN
10 20 30 40 50
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pF1KB7 KPQG---APPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
.:.: : :.:.:.:.: :. ::.. : :: .: .:.: . :: .. .:.
NP_872 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
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NP_872 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
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NP_872 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
..:::::..:.:::.:.::.:.::::::::::::::::::.:::.::::::::::.: ..
NP_872 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
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pF1KB7 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
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NP_872 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAG---ARSKVKSSKSSQLQ
300 310 320 330 340
>>NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antigen B (346 aa)
initn: 1112 init1: 928 opt: 1078 Z-score: 1005.7 bits: 194.5 E(85289): 2.8e-49
Smith-Waterman score: 1078; 51.0% identity (77.1% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECPSSSP-VLGDTPTSSPAA---G
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NP_002 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 IPQKPQGAPPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
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NP_002 ALKKPQRALSTTTSVD-VSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTNMLV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
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NP_002 QFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSYV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
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NP_002 LVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
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NP_002 IFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
: : :::::::::::.:. . . ... : :.: : :::
NP_002 PSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLND---GSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
347 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:17:55 2016 done: Fri Nov 4 05:17:57 2016
Total Scan time: 9.120 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]