Result of FASTA (omim) for
pF1KB7150
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7150, 347 aa
1>>>pF1KB7150 347 - 347 aa - 347 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1853+/-0.000346; mu= 17.5474+/- 0.022
mean_var=73.5572+/-14.819, 0's: 0 Z-trim(114.9): 128 B-trim: 1247 in 1/56
Lambda= 0.149541
statistics sampled from 24924 (25052) to 24924 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.673), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 7.060
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antig ( 347) 2270 498.9 6.8e-141
NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antig ( 346) 1143 255.7 1.1e-67
NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1109 248.4 1.7e-65
NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1109 248.4 1.7e-65
NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 1109 248.4 1.7e-65
XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1025 230.3 4.9e-60
XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1025 230.3 4.9e-60
NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antig ( 346) 1025 230.3 4.9e-60
NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated an ( 336) 998 224.4 2.7e-58
XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-as ( 336) 998 224.4 2.7e-58
NP_001011543 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 988 222.3 1.3e-57
NP_066386 (OMIM: 300343) melanoma-associated antig ( 369) 988 222.3 1.3e-57
NP_001238757 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 988 222.3 1.3e-57
NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antig ( 319) 962 216.7 5.7e-56
XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-as ( 319) 962 216.7 5.7e-56
NP_001093391 (OMIM: 300762) melanoma-associated an ( 324) 932 210.2 5.1e-54
XP_011543756 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 932 210.2 5.1e-54
XP_011543755 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 932 210.2 5.1e-54
NP_005355 (OMIM: 300341) melanoma-associated antig ( 318) 821 186.2 8.1e-47
NP_001159873 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 821 186.2 8.1e-47
NP_001159872 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 821 186.2 8.1e-47
XP_016885009 (OMIM: 300341) PREDICTED: melanoma-as ( 318) 821 186.2 8.1e-47
NP_005356 (OMIM: 300342) melanoma-associated antig ( 315) 820 186.0 9.3e-47
XP_005262392 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 820 186.0 9.3e-47
NP_001074259 (OMIM: 300764) melanoma-associated an ( 315) 820 186.0 9.3e-47
XP_005262391 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 820 186.0 9.3e-47
XP_005278249 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 820 186.0 9.3e-47
XP_005278250 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 820 186.0 9.3e-47
XP_016885011 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 394) 810 183.9 5e-46
NP_001011544 (OMIM: 300344) melanoma-associated an ( 400) 810 183.9 5e-46
XP_011529466 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 421) 810 184.0 5.2e-46
NP_005357 (OMIM: 300344) melanoma-associated antig ( 429) 810 184.0 5.3e-46
XP_016885010 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 429) 810 184.0 5.3e-46
NP_057333 (OMIM: 300468) melanoma-associated antig ( 373) 805 182.8 1e-45
NP_001258681 (OMIM: 300466) melanoma-associated an ( 275) 792 179.9 5.5e-45
NP_001011550 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 756 172.2 1.3e-42
NP_002353 (OMIM: 300175) melanoma-associated antig ( 317) 756 172.2 1.3e-42
NP_001011549 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 756 172.2 1.3e-42
XP_005274736 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 756 172.2 1.3e-42
XP_005274735 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 756 172.2 1.3e-42
NP_001011548 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 756 172.2 1.3e-42
XP_005274734 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 397) 756 172.3 1.6e-42
XP_011529720 (OMIM: 300223) PREDICTED: melanoma-as (1142) 756 172.6 3.6e-42
NP_005453 (OMIM: 300223) melanoma-associated antig (1142) 756 172.6 3.6e-42
NP_001308332 (OMIM: 300549) melanoma-associated an ( 314) 745 169.8 6.9e-42
NP_001269434 (OMIM: 300173) melanoma-associated an ( 314) 745 169.8 6.9e-42
NP_001308330 (OMIM: 300549) melanoma-associated an ( 314) 745 169.8 6.9e-42
NP_705692 (OMIM: 300549) melanoma-associated antig ( 314) 745 169.8 6.9e-42
NP_001308329 (OMIM: 300549) melanoma-associated an ( 314) 745 169.8 6.9e-42
NP_786884 (OMIM: 300173) melanoma-associated antig ( 314) 745 169.8 6.9e-42
>>NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 2270 init1: 2270 opt: 2270 Z-score: 2650.5 bits: 498.9 E(85289): 6.8e-141
Smith-Waterman score: 2270; 100.0% identity (100.0% similar) in 347 aa overlap (1-347:1-347)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 PHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 YLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYVL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 VNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 FGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 FGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTAP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB7 SEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_872 SEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
310 320 330 340
>>NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antigen B (346 aa)
initn: 1089 init1: 655 opt: 1143 Z-score: 1336.4 bits: 255.7 E(85289): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1143; 53.7% identity (77.3% similar) in 348 aa overlap (1-345:1-344)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLD-GASN
:::::::::::::::...:: .:: . :.:::: :.:. :.:. .::: : .
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTASSSLAFGIPQ
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
.:. :: .:: .:.: : : .: ..: :: .: .:. . . .:. .::
NP_002 EPQ--REPPTTS-AAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTRKTKMLV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
..:::::.:::: :::.::. ... : .:: :. ..:.. ::.::: ::::.:. : :.
NP_002 QFLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNPTTHSYI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
::. : . :.. :. .:..:::: .:..:: ::::. :::.:. .: .:.::: .:.
NP_002 LVSMLGPN-DGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYDGKRHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
.:::::::.:.:::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
NP_002 IFGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSEFSNWYTEALQDEEERA--RARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
:..: : :::.:::::: : ::::. ..: ..: :.. ::.:::
NP_002 PNNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
>>NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1088 init1: 950 opt: 1109 Z-score: 1296.8 bits: 248.4 E(85289): 1.7e-65
Smith-Waterman score: 1109; 52.4% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSS-LDGASN
::::::::::::::::.:: . : : :.:: : :.: : :. :: : .
NP_803 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECP-SSSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
.:.: : :.:.:.:.: :. ::.. : :: .: .:.: . :: .. .:.
NP_803 KPQG---APPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
:..: ::.:.::: :::::. : . :..: ::. ::..:::.::::::: .:. : :.
NP_803 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
::.::.: :..::.. :..:::: .::.:: .:: ..:::.:: .:..: ::: ::.
NP_803 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
..:::::..:.:::.:.::.:.::::::::::::::::::.:::.::::::::::.: ..
NP_803 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAG---ARSKVKSSKSSQLQ
: .: . : :::.::::::..: ...:: .:: :::.. :.::.
NP_803 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1088 init1: 950 opt: 1109 Z-score: 1296.8 bits: 248.4 E(85289): 1.7e-65
Smith-Waterman score: 1109; 52.4% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSS-LDGASN
::::::::::::::::.:: . : : :.:: : :.: : :. :: : .
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECP-SSSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
.:.: : :.:.:.:.: :. ::.. : :: .: .:.: . :: .. .:.
NP_002 KPQG---APPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
:..: ::.:.::: :::::. : . :..: ::. ::..:::.::::::: .:. : :.
NP_002 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
::.::.: :..::.. :..:::: .::.:: .:: ..:::.:: .:..: ::: ::.
NP_002 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
..:::::..:.:::.:.::.:.::::::::::::::::::.:::.::::::::::.: ..
NP_002 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAG---ARSKVKSSKSSQLQ
: .: . : :::.::::::..: ...:: .:: :::.. :.::.
NP_002 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antigen B (347 aa)
initn: 1088 init1: 950 opt: 1109 Z-score: 1296.8 bits: 248.4 E(85289): 1.7e-65
Smith-Waterman score: 1109; 52.4% identity (76.2% similar) in 349 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSS-LDGASN
::::::::::::::::.:: . : : :.:: : :.: : :. :: : .
NP_796 MPRGQKSKLRAREKRRKAREETQGLKVAHATAAEKEECP-SSSPVLGDTPTSSPAAGIPQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
.:.: : :.:.:.:.: :. ::.. : :: .: .:.: . :: .. .:.
NP_796 KPQG---APPTTTAAAAVSCTESDEGAKCQGEENASFSQATTSTESSVKDPVAWEAGMLM
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
:..: ::.:.::: :::::. : . :..: ::. ::..:::.::::::: .:. : :.
NP_796 HFILRKYKMREPIMKADMLKVVDEKYKDHFTEILNGASRRLELVFGLDLKEDNPSGHTYT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
::.::.: :..::.. :..:::: .::.:: .:: ..:::.:: .:..: ::: ::.
NP_796 LVSKLNLTNDGNLSNDWDFPRNGLLMPLLGVIFLKGNSATEEEIWKFMNVLGAYDGEEHL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
..:::::..:.:::.:.::.:.::::::::::::::::::.:::.::::::::::.: ..
NP_796 IYGEPRKFITQDLVQEKYLKYEQVPNSDPPRYQFLWGPRAYAETTKMKVLEFLAKMNGAT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAG---ARSKVKSSKSSQLQ
: .: . : :::.::::::..: ...:: .:: :::.. :.::.
NP_796 PRDFPSHYEEALRDEEERAQVRSSVRARRRTTATTFRARSRAPFSRSSHPM
300 310 320 330 340
>>XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa)
initn: 1045 init1: 1023 opt: 1025 Z-score: 1198.9 bits: 230.3 E(85289): 4.9e-60
Smith-Waterman score: 1025; 47.6% identity (74.6% similar) in 347 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
::::::: :.:::::.:.:: .: : .... :. : ..:.. : : .
XP_011 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 PHGLREAQS--TSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIIL
.:.. : ..:... .:. . .:.:...:.. .: : .: . :. :. .:
XP_011 --ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTNML
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VHYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIY
:..:. :.::.:: :::::. : . :. :: ::..:: ..:..::.:::.:. .: :
XP_011 VQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VLVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEH
:::.:.:: .. .. : ::::::...::.:: .:::..::..:. .: : .::: .:
XP_011 VLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FMFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDT
:.:::::::.:.:::: .::::.:::::.: ::.::::::::::::::::::: :::: :
XP_011 FIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
.:: :. :: :::.:::::..: . . :: . ::.:.:.::.
XP_011 VPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
>>XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa)
initn: 1045 init1: 1023 opt: 1025 Z-score: 1198.9 bits: 230.3 E(85289): 4.9e-60
Smith-Waterman score: 1025; 47.6% identity (74.6% similar) in 347 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
::::::: :.:::::.:.:: .: : .... :. : ..:.. : : .
XP_011 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 PHGLREAQS--TSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIIL
.:.. : ..:... .:. . .:.:...:.. .: : .: . :. :. .:
XP_011 --ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTNML
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VHYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIY
:..:. :.::.:: :::::. : . :. :: ::..:: ..:..::.:::.:. .: :
XP_011 VQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VLVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEH
:::.:.:: .. .. : ::::::...::.:: .:::..::..:. .: : .::: .:
XP_011 VLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FMFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDT
:.:::::::.:.:::: .::::.:::::.: ::.::::::::::::::::::: :::: :
XP_011 FIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
.:: :. :: :::.:::::..: . . :: . ::.:.:.::.
XP_011 VPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
>>NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antigen B (346 aa)
initn: 1045 init1: 1023 opt: 1025 Z-score: 1198.9 bits: 230.3 E(85289): 4.9e-60
Smith-Waterman score: 1025; 47.6% identity (74.6% similar) in 347 aa overlap (1-345:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSASACLKDVFQSSLDGASNN
::::::: :.:::::.:.:: .: : .... :. : ..:.. : : .
NP_002 MPRGQKSTLHAREKRQQTRGQTQDHQGAQITATNKKKVSFSSPLILGATIQKKSAGRSRS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB7 PHGLREAQS--TSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIIL
.:.. : ..:... .:. . .:.:...:.. .: : .: . :. :. .:
NP_002 --ALKKPQRALSTTTSVDVSYKKSYKGANSKIEKKQSFSQGLSSTVQSRTDPLIMKTNML
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 VHYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIY
:..:. :.::.:: :::::. : . :. :: ::..:: ..:..::.:::.:. .: :
NP_002 VQFLMEMYKMKKPIMKADMLKIVQKSHKNCFPEILKKASFNMEVVFGVDLKKVDSTKDSY
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VLVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEH
:::.:.:: .. .. : ::::::...::.:: .:::..::..:. .: : .::: .:
NP_002 VLVSKMDLPNNGTVTRGRGFPKTGLLLNLLGVIFMKGNCATEEKIWEFLNKMRIYDGKKH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FMFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDT
:.:::::::.:.:::: .::::.:::::.: ::.::::::::::::::::::: :::: :
NP_002 FIFGEPRKLITQDLVKLKYLEYRQVPNSNPARYEFLWGPRAHAETSKMKVLEFWAKVNKT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 APSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
.:: :. :: :::.:::::..: . . :: . ::.:.:.::.
NP_002 VPSAFQFWYEEALRDEEERVQAAAMLNDGSSAMGRKCSKAKASSSSHA
300 310 320 330 340
>>NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated antige (336 aa)
initn: 1036 init1: 820 opt: 998 Z-score: 1167.6 bits: 224.4 E(85289): 2.7e-58
Smith-Waterman score: 998; 49.6% identity (75.7% similar) in 337 aa overlap (1-336:1-333)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSAS-ACLKDVFQSSLDGASN
::::: :: ::::::::::: . : : :.:. : :.: :: . .:. .:.
NP_001 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSP--PQSFPNAGI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
:. ..:. :. :.:.: : ::.. : : : . ...: : .. :. ::
NP_001 -PQESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSFHGPSSSESTGRDLLNTKTGELV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
..:: :: :::::. ::. ... :..:: :: :..:..:..::: :::..:... ::
NP_001 QFLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
::.:::. ...::: : : .::::..:. :: .:: ..:::.:. .:..:.: : .::
NP_001 LVGKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
..:::..:.:::::.:.::::::::.::::::.:::::::.:::::::::::.::.:::.
NP_001 IYGEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
: ... : :::..:::.::::..:. . : : .::
NP_001 ASTYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARA-SRSFQP
300 310 320 330
>>XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-associ (336 aa)
initn: 1036 init1: 820 opt: 998 Z-score: 1167.6 bits: 224.4 E(85289): 2.7e-58
Smith-Waterman score: 998; 49.6% identity (75.7% similar) in 337 aa overlap (1-336:1-333)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPRGQKSKLRAREKRRQARGGLEDLIDALDILEEEEESPPSAS-ACLKDVFQSSLDGASN
::::: :: ::::::::::: . : : :.:. : :.: :: . .:. .:.
XP_011 MPRGQASKRRAREKRRQARGEDQCLGGAQATAAEKEKLPSSSSPACQSP--PQSFPNAGI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 NPHGLREAQSTSTSATAASHTRHPEGVNDQMEERPICTQDLEATDSFPRGPVDEKVIILV
:. ..:. :. :.:.: : ::.. : : : . ...: : .. :. ::
XP_011 -PQESQRASYPSSPASAVSLTSSDEGAKGQKGESPNSFHGPSSSESTGRDLLNTKTGELV
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 HYLLYKYQMKEPITKADMLRNVTQMSKSQFPVILSRASEHLELIFGLDLKEVEPNKHIYV
..:: :: :::::. ::. ... :..:: :: :..:..:..::: :::..:... ::
XP_011 QFLLNKYIRKEPITREAMLKVINRKYKQHFPEILRRSTENVEVVFGLYLKEMDPSRQSYV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 LVNKLDLGCDAKLSDETGVPKTGLLMTVLGIIFTNGNCVAEEEVWKVFNTMGLYDGIEHF
::.:::. ...::: : : .::::..:. :: .:: ..:::.:. .:..:.: : .::
XP_011 LVGKLDFPNQGSLSDGGGFPLSGLLMVLLSTIFMHGNRATEEEMWECLNALGMYKGRKHF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MFGEPRKLLTKDLVKENYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAKVNDTA
..:::..:.:::::.:.::::::::.::::::.:::::::.:::::::::::.::.:::.
XP_011 IYGEPQELVTKDLVREGYLEYQQVPSSDPPRYEFLWGPRARAETSKMKVLEFVAKLNDTV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB7 PSEFSNWYTEALQDEEERARARVAAKARVSATAGARSKVKSSKSSQLQ
: ... : :::..:::.::::..:. . : : .::
XP_011 ASTYKSRYEEALREEEEQARARAVARDSARARA-SRSFQP
300 310 320 330
347 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:18:36 2016 done: Fri Nov 4 05:18:37 2016
Total Scan time: 7.060 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]