Result of FASTA (ccds) for pF1KB7154
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7154, 353 aa
  1>>>pF1KB7154 353 - 353 aa - 353 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3942+/-0.00119; mu= 15.7223+/- 0.071
 mean_var=118.7331+/-37.437, 0's: 0 Z-trim(101.9): 277  B-trim: 878 in 2/48
 Lambda= 0.117703
 statistics sampled from 6365 (6735) to 6365 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.556), E-opt: 0.2 (0.207), width:  16
 Scan time:  2.350

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19          ( 353) 2339 409.2 2.7e-114
CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19          ( 351) 1712 302.7   3e-82
CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19          ( 350) 1341 239.7 2.8e-63
CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12        ( 371)  738 137.3 1.9e-32
CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12        ( 373)  738 137.3 1.9e-32
CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19         ( 356)  723 134.8 1.1e-31
CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14         ( 333)  633 119.4 4.2e-27
CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11        ( 395)  628 118.7 8.5e-27
CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2            ( 355)  528 101.7   1e-21
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3            ( 359)  526 101.3 1.3e-21
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 388)  526 101.4 1.4e-21
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3           ( 394)  526 101.4 1.4e-21
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2          ( 362)  510 98.6 8.6e-21
CCDS8588.1 C3AR1 gene_id:719|Hs108|chr12           ( 482)  506 98.1 1.7e-20
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 357)  466 91.1 1.5e-18
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3           ( 369)  466 91.1 1.5e-18
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22         ( 418)  461 90.4   3e-18
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 418)  442 87.1 2.8e-17
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11           ( 380)  436 86.1 5.4e-17
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8           ( 380)  435 85.9 6.1e-17
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 403)  431 85.2   1e-16
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 446)  429 85.0 1.4e-16
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 389)  428 84.7 1.4e-16
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 406)  428 84.7 1.4e-16
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 392)  427 84.6 1.6e-16
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 397)  427 84.6 1.6e-16
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 400)  427 84.6 1.6e-16
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 420)  427 84.6 1.7e-16
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 493)  427 84.7 1.8e-16
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17         ( 369)  424 84.0 2.2e-16
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1            ( 372)  419 83.2 3.9e-16
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11           ( 372)  406 81.0 1.8e-15
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14          ( 391)  399 79.8 4.3e-15
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6            ( 374)  398 79.6 4.7e-15
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX       ( 337)  397 79.4 4.9e-15
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY        ( 359)  394 78.9 7.3e-15
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX        ( 359)  394 78.9 7.3e-15
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX           ( 363)  390 78.2 1.2e-14
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8          ( 328)  389 78.0 1.2e-14
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 300)  388 77.8 1.3e-14
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6          ( 319)  388 77.8 1.4e-14
CCDS9943.1 BDKRB1 gene_id:623|Hs108|chr14          ( 353)  385 77.4 2.1e-14
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20         ( 370)  384 77.2 2.4e-14
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20         ( 388)  384 77.2 2.5e-14
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13         ( 344)  383 77.0 2.6e-14
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20        ( 333)  382 76.8 2.9e-14
CCDS33063.1 C5AR1 gene_id:728|Hs108|chr19          ( 350)  382 76.9 2.9e-14
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX          ( 370)  382 76.9 3.1e-14
CCDS64895.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8          ( 291)  378 76.1 4.2e-14
CCDS3664.1 TACR3 gene_id:6870|Hs108|chr4           ( 465)  377 76.2 6.4e-14


>>CCDS12841.1 FPR3 gene_id:2359|Hs108|chr19               (353 aa)
 initn: 2339 init1: 2339 opt: 2339  Z-score: 2165.4  bits: 409.2 E(32554): 2.7e-114
Smith-Waterman score: 2339; 100.0% identity (100.0% similar) in 353 aa overlap (1-353:1-353)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVN
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLITIIA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLITIIA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGDTYCIFNF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGDTYCIFNF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 AFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRNHMIKSSRPL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRNHMIKSSRPL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 RVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSLAFFNSCLNPI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSLAFFNSCLNPI
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350   
pF1KB7 LYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETELQAM
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETELQAM
              310       320       330       340       350   

>>CCDS12840.1 FPR2 gene_id:2358|Hs108|chr19               (351 aa)
 initn: 1771 init1: 1623 opt: 1712  Z-score: 1590.0  bits: 302.7 E(32554): 3e-82
Smith-Waterman score: 1712; 72.2% identity (89.0% similar) in 353 aa overlap (1-353:1-351)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVN
       :::::: :::: :::  : ::.::: :. :.: :::::.::::::::::::::::::::.
CCDS12 METNFSTPLNEYEEVSYESAGYTVLRILPLVVLGVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLITIIA
       ::::::::::::::.: ::: .::.:: :::::: :::::.:...::::: ::.:: .::
CCDS12 TICYLNLALADFSFTATLPFLIVSMAMGEKWPFGWFLCKLIHIVVDINLFGSVFLIGFIA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGDTYCIFNF
       ::::::::::.:::::::.::: .:..: ::...::::: :.: ::..  :::::: :::
CCDS12 LDRCICVLHPVWAQNHRTVSLAMKVIVGPWILALVLTLPVFLFLTTVTIPNGDTYCTFNF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 AFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRNHMIKSSRPL
       : :: :  :::.: :::  .  :..:.::::.::::...:::.::::::.. ::::::::
CCDS12 ASWGGTPEERLKVAITMLTARGIIRFVIGFSLPMSIVAICYGLIAAKIHKKGMIKSSRPL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 RVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSLAFFNSCLNPI
       ::..::::::::::::..:...: .:::::::. :::::: .:.:::::::::::::::.
CCDS12 RVLTAVVASFFICWFPFQLVALLGTVWLKEMLFYGKYKIIDILVNPTSSLAFFNSCLNPM
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350   
pF1KB7 LYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETELQAM
       ::::.:..:.::::.::::::::::.:  ::: :..: ..::::: :::::::
CCDS12 LYVFVGQDFRERLIHSLPTSLERALSE--DSAPTNDTAANSASPPAETELQAM
              310       320         330       340       350 

>>CCDS12839.1 FPR1 gene_id:2357|Hs108|chr19               (350 aa)
 initn: 1107 init1: 1042 opt: 1341  Z-score: 1249.5  bits: 239.7 E(32554): 2.8e-63
Smith-Waterman score: 1341; 58.5% identity (81.8% similar) in 352 aa overlap (1-352:1-349)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMTRTVN
       :::: :.: : .  .    ::.  : :.. :: .::::.:::::::::::::::::.::.
CCDS12 METNSSLPTNISGGTPAVSAGYLFLDIITYLVFAVTFVLGVLGNGLVIWVAGFRMTHTVT
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 TICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLITIIA
       :: :::::.::: :.. ::: ::  ::  .:::: ::::.: ...::::: ::.::..::
CCDS12 TISYLNLAVADFCFTSTLPFFMVRKAMGGHWPFGWFLCKFVFTIVDINLFGSVFLIALIA
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGDTYCIFNF
       ::::.:::::.:.:::::.::::.:. : :.....:::: .:  ::.   .: . : :::
CCDS12 LDRCVCVLHPVWTQNHRTVSLAKKVIIGPWVMALLLTLPVIIRVTTVPGKTGTVACTFNF
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 AFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRNHMIKSSRPL
       . : .   ::.:: ..:  :  :..::::::.::::..: ::.::.:::.. .:::::::
CCDS12 SPWTNDPKERINVAVAMLTVRGIIRFIIGFSAPMSIVAVSYGLIATKIHKQGLIKSSRPL
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 RVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSLAFFNSCLNPI
       ::.. :.:.::.:: ::...... .: ..: ::.: :: : . .. ::.::::::::::.
CCDS12 RVLSFVAAAFFLCWSPYQVVALIATVRIRE-LLQGMYKEIGIAVDVTSALAFFNSCLNPM
              250       260       270        280       290         

              310       320       330       340       350   
pF1KB7 LYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETELQAM
       ::::::..:.::::..::.::::::::  ::.:::.: :.:. :  :.:::: 
CCDS12 LYVFMGQDFRERLIHALPASLERALTE--DSTQTSDTATNSTLPSAEVELQAK
     300       310       320         330       340       350

>>CCDS41829.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12             (371 aa)
 initn: 618 init1: 438 opt: 738  Z-score: 695.9  bits: 137.3 E(32554): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 738; 36.9% identity (69.5% similar) in 325 aa overlap (19-335:31-344)

                           10        20        30        40        
pF1KB7             METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVI
                                     :    :  :: ..:....  .:.:::::::
CCDS41 MEDEDYNTSISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVI
               10        20        30        40        50        60

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB7 WVAGFRMTRTVNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDIN
        .: :.: .::: . .::::.::: :...::.... .::  .: ::. .::. . ..  :
CCDS41 IIATFKMKKTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHN
               70        80        90       100       110       120

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB7 LFVSVYLITIIALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTIS
       .:.::.:.:::. :::: :: :.:.::::.. ::  .   .:.... :. :...:  : .
CCDS41 MFTSVFLLTIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDT-A
              130       140       150       160       170          

      170       180              190       200       210       220 
pF1KB7 TTNGDTYCIFNFAF-------WGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCY
       . .:   :. ::..       :  :  .   :  .   :  . .:. :: ::. :::.::
CCDS41 NLHGKISCFNNFSLSTPGSSSW-PTHSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITACY
     180       190       200        210       220       230        

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB7 GIIAAKIHRNHMIKSSRPLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIIL
         :. :..::.. :...:........ .::.:: ::. ...:    :..  . :.   ..
CCDS41 LTIVCKLQRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLE---LHHTAMPGS---VF
      240       250       260       270       280          290     

              290       300       310       320       330       340
pF1KB7 VLINP-TSSLAFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTT
        :  : ...::. :::.:::::::::..:..  . .: . :  ::.:  :....:     
CCDS41 SLGLPLATALAIANSCMNPILYVFMGQDFKKFKV-ALFSRLVNALSE--DTGHSSYPSHR
            300       310       320        330         340         

              350            
pF1KB7 SASPPEETELQAM         
                             
CCDS41 SFTKMSSMNERTSMNERETGML
     350       360       370 

>>CCDS44965.1 CMKLR1 gene_id:1240|Hs108|chr12             (373 aa)
 initn: 618 init1: 438 opt: 738  Z-score: 695.8  bits: 137.3 E(32554): 1.9e-32
Smith-Waterman score: 738; 36.9% identity (69.5% similar) in 325 aa overlap (19-335:33-346)

                           10        20        30        40        
pF1KB7             METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVI
                                     :    :  :: ..:....  .:.:::::::
CCDS44 MEDEDYNTSISYGDEYPDYLDSIVVLEDLSPLEARVTRIFLVVVYSIVCFLGILGNGLVI
             10        20        30        40        50        60  

       50        60        70        80        90       100        
pF1KB7 WVAGFRMTRTVNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDIN
        .: :.: .::: . .::::.::: :...::.... .::  .: ::. .::. . ..  :
CCDS44 IIATFKMKKTVNMVWFLNLAVADFLFNVFLPIHITYAAMDYHWVFGTAMCKISNFLLIHN
             70        80        90       100       110       120  

      110       120       130       140       150       160        
pF1KB7 LFVSVYLITIIALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTIS
       .:.::.:.:::. :::: :: :.:.::::.. ::  .   .:.... :. :...:  : .
CCDS44 MFTSVFLLTIISSDRCISVLLPVWSQNHRSVRLAYMACMVIWVLAFFLSSPSLVFRDT-A
            130       140       150       160       170       180  

      170       180              190       200       210       220 
pF1KB7 TTNGDTYCIFNFAF-------WGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCY
       . .:   :. ::..       :  :  .   :  .   :  . .:. :: ::. :::.::
CCDS44 NLHGKISCFNNFSLSTPGSSSW-PTHSQMDPVGYSRHMVVTVTRFLCGFLVPVLIITACY
             190       200        210       220       230       240

             230       240       250       260       270       280 
pF1KB7 GIIAAKIHRNHMIKSSRPLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIIL
         :. :..::.. :...:........ .::.:: ::. ...:    :..  . :.   ..
CCDS44 LTIVCKLQRNRLAKTKKPFKIIVTIIITFFLCWCPYHTLNLLE---LHHTAMPGS---VF
              250       260       270       280          290       

              290       300       310       320       330       340
pF1KB7 VLINP-TSSLAFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTT
        :  : ...::. :::.:::::::::..:..  . .: . :  ::.:  :....:     
CCDS44 SLGLPLATALAIANSCMNPILYVFMGQDFKKFKV-ALFSRLVNALSE--DTGHSSYPSHR
          300       310       320        330       340         350 

              350            
pF1KB7 SASPPEETELQAM         
                             
CCDS44 SFTKMSSMNERTSMNERETGML
             360       370   

>>CCDS12801.1 GPR32 gene_id:2854|Hs108|chr19              (356 aa)
 initn: 544 init1: 208 opt: 723  Z-score: 682.3  bits: 134.8 E(32554): 1.1e-31
Smith-Waterman score: 723; 37.5% identity (70.8% similar) in 312 aa overlap (16-327:35-341)

                              10        20        30        40     
pF1KB7                METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNG
                                     : : .:   :  ..... ....: ::::::
CCDS12 SEGTRGCSDRQPGVLTRDRSCSRKMNSSGCLSEEVGS--LRPLTVVILSASIVVGVLGNG
           10        20        30        40          50        60  

          50        60        70        80        90       100     
pF1KB7 LVIWVAGFRMTRTVNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMI
       ::.:.. :::.:::.:.:...:::::: .:  ::. :  .. :. : .: . :::  ...
CCDS12 LVLWMTVFRMARTVSTVCFFHLALADFMLSLSLPIAMYYIVSRQ-WLLGEWACKLYITFV
             70        80        90       100        110       120 

         110       120       130       140       150       160     
pF1KB7 DINLFVSVYLITIIALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWT
        .. :.:  :...:..:::: ::.:.:: ::::.. :. .  :.:... .:   .. : :
CCDS12 FLSYFASNCLLVFISVDRCISVLYPVWALNHRTVQRASWLAFGVWLLAAALCSAHLKFRT
             130       140       150       160       170       180 

         170       180       190       200       210       220     
pF1KB7 TISTTNGDTYCIFNFAFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIA
       :    :: :.: . :   ..::   ..  .    .  : ::..::  :..:: .:  .: 
CCDS12 T-RKWNGCTHCYLAFNSDNETAQIWIEGVVEGHIIGTIGHFLLGFLGPLAIIGTCAHLIR
              190       200       210       220       230       240

         230       240       250       260       270       280     
pF1KB7 AKIHRNHMIKSSRPLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLIN
       ::. :.  ....:: :.. ..:..::: : :.... .:. .: . :: .  .  .:....
CCDS12 AKLLREGWVHANRPKRLLLVLVSAFFIFWSPFNVV-LLVHLWRRVMLKEIYHPRMLLILQ
              250       260       270        280       290         

         290       300       310       320       330       340     
pF1KB7 PTSSLAFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPP
        . .:.  :: :::.::::.::.:::....:: ..: ::. :                  
CCDS12 ASFALGCVNSSLNPFLYVFVGRDFQEKFFQSLTSALARAFGEEEFLSSCPRGNAPRE   
     300       310       320       330       340       350         

         350   
pF1KB7 EETELQAM

>>CCDS73628.1 GPR33 gene_id:2856|Hs108|chr14              (333 aa)
 initn: 624 init1: 382 opt: 633  Z-score: 600.0  bits: 119.4 E(32554): 4.2e-27
Smith-Waterman score: 633; 33.0% identity (67.6% similar) in 312 aa overlap (19-327:26-324)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB7        METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGF
                                ::.. ..  .:: . .   ..:.. ::: .::  :
CCDS73 MDLINSTDYLINASTLVRNSTQFLAPASKMII-ALSLYISS---IIGTITNGLYLWVLRF
               10        20        30         40           50      

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB7 RMTRTVNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSV
       .: .::::. ...: :. :  . ::::  .:  . ..: ::. :::. .  .....:.::
CCDS73 KMKQTVNTLLFFHLILSYFISTMILPFMATSQLQDNHWNFGTALCKVFNGTLSLGMFTSV
         60        70        80        90       100       110      

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB7 YLITIIALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGD
       .... :.::: . .:::.:.:.:::   :. .. :.:: . .:..: .::  :    .: 
CCDS73 FFLSAIGLDRYLLTLHPVWSQQHRTPRWASSIVLGVWISAAALSIPYLIFRETHHDRKGK
        120       130       140       150       160       170      

           180          190       200       210       220       230
pF1KB7 TYCIFNFAF---WGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHR
       . :  :.:    : .  ..    .: .:   .: .:..:: .:. ::  ::  .:.:...
CCDS73 VTCQNNYAVSTNWESKEMQASRQWIHVA--CFISRFLLGFLLPFFIIIFCYERVASKVKE
        180       190       200         210       220       230    

              240       250       260       270       280       290
pF1KB7 NHMIKSSRPLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSL
         ..:::.:..:. ... :::.::.::..   :. .  . .::    .. :.:   :.: 
CCDS73 RSLFKSSKPFKVMMTAIISFFVCWMPYHIHQGLLLTTNQSLLL----ELTLILTVLTTS-
          240       250       260       270           280          

              300       310       320       330       340       350
pF1KB7 AFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETEL
         ::. ..: ::.:.:.::.. . .:. . .: ...:                       
CCDS73 --FNTIFSPTLYLFVGENFKKVFKKSILALFESTFSEDSSVERTQT              
       290       300       310       320       330                 

          
pF1KB7 QAM

>>CCDS7994.1 PTGDR2 gene_id:11251|Hs108|chr11             (395 aa)
 initn: 627 init1: 418 opt: 628  Z-score: 594.6  bits: 118.7 E(32554): 8.5e-27
Smith-Waterman score: 628; 34.1% identity (66.9% similar) in 323 aa overlap (29-344:35-353)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMTRT
                                     ..:.::.. ..:.. ::....:.: :: .:
CCDS79 ATLKPLCPILEQMSRLQSHSNTSIRYIDHAAVLLHGLASLLGLVENGVILFVVGCRMRQT
           10        20        30        40        50        60    

       60        70        80        90       100       110        
pF1KB7 VNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLITI
       : :   :.:::.:.  :: :::    .:. ..: .:. .:::   .. .:.:.: .:.. 
CCDS79 VVTTWVLHLALSDLLASASLPFFTYFLAVGHSWELGTTFCKLHSSIFFLNMFASGFLLSA
           70        80        90       100       110       120    

      120       130       140       150       160       170        
pF1KB7 IALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGDTYCIF
       :.::::. :..:.:::::::.. :..:   :: .... :.: :.:  :::  .:  .: .
CCDS79 ISLDRCLQVVRPVWAQNHRTVAAAHKVCLVLWALAVLNTVPYFVFRDTISRLDGRIMCYY
          130       140       150       160       170       180    

      180       190       200       210       220       230        
pF1KB7 NFAFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRNHMIKSSR
       :  .  . . .:  .  .   .. . .:...: ::..::.  .. .. ....    . .:
CCDS79 NVLLL-NPGPDRDATCNSRQVALAVSKFLLAFLVPLAIIASSHAAVSLRLQHRGRRRPGR
           190       200       210       220       230       240   

      240       250       260       270       280       290        
pF1KB7 PLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINPTSSLAFFNSCLN
        .:. :::::.: .:: ::.....: :   .     :   ..   .  ..:::::::  :
CCDS79 FVRLVAAVVAAFALCWGPYHVFSLLEA---RAHANPGLRPLVWRGLPFVTSLAFFNSVAN
           250       260       270          280       290       300

      300       310       320       330            340         350 
pF1KB7 PILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPD-----SAQTSNTDTT--SASPPEETELQ
       :.:::.   .. ..: ::: : :: .:..  .     :..   :..:  ::::       
CCDS79 PVLYVLTCPDMLRKLRRSLRTVLESVLVDDSELGGAGSSRRRRTSSTARSASPLALCSRP
              310       320       330       340       350       360

                                          
pF1KB7 AM                                 
                                          
CCDS79 EEPRGPARLLGWLLGSCAASPQTGPLNRALSSTSS
              370       380       390     

>>CCDS2368.1 GPR1 gene_id:2825|Hs108|chr2                 (355 aa)
 initn: 612 init1: 347 opt: 528  Z-score: 503.3  bits: 101.7 E(32554): 1e-21
Smith-Waterman score: 649; 34.6% identity (67.3% similar) in 315 aa overlap (24-335:37-337)

                      10        20        30        40        50   
pF1KB7        METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGF
                                     : :. ::... ..::.:. ::..::: .::
CCDS23 TLFEEFENYSYDLDYYSLESDLEEKVQLGVVHWV-SLVLYCLAFVLGIPGNAIVIWFTGF
         10        20        30        40         50        60     

            60        70        80        90       100       110   
pF1KB7 RMTRTVNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSV
       .  .::.:. .::::.::: :  .::. .  :::  .:::: .:::      ..:.:.::
CCDS23 KWKKTVTTLWFLNLAIADFIFLLFLPLYISYVAMNFHWPFGIWLCKANSFTAQLNMFASV
          70        80        90       100       110       120     

           120       130       140       150       160       170   
pF1KB7 YLITIIALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGD
       ...:.:.::. : ..::. .. :::.. .  :.  .:... ..  : . :  :.  .:  
CCDS23 FFLTVISLDHYIHLIHPVLSHRHRTLKNSLIVIIFIWLLASLIGGPALYFRDTVEFNN-H
         130       140       150       160       170       180     

           180       190         200       210       220       230 
pF1KB7 TYCIFNFAFWGDTAVERLNVFITMAK--VFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRN
       : :  ::        .. .  .:. .  :.  ..::::.  :.  ...::  .  :... 
CCDS23 TLCYNNF--------QKHDPDLTLIRHHVLTWVKFIIGYLFPLLTMSICYLCLIFKVKKR
          190               200       210       220       230      

             240       250       260       270        280       290
pF1KB7 HMIKSSRPLRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNG-KYKIILVLINPTSSL
        .. ::: . .. .::..: .:: ::.:..:    :   .  :. ..... . :  ...:
CCDS23 SILISSRHFWTILVVVVAFVVCWTPYHLFSI----WELTIHHNSYSHHVMQAGIPLSTGL
        240       250       260           270       280       290  

              300       310       320       330       340       350
pF1KB7 AFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETEL
       ::.::::::::::.....:: :.  :.   :. .: ::  :. .:               
CCDS23 AFLNSCLNPILYVLISKKFQARFRSSVAEILKYTLWEVSCSGTVSEQLRNSETKNLCLLE
            300       310       320       330       340       350  

          
pF1KB7 QAM
          
CCDS23 TAQ
          

>>CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3                 (359 aa)
 initn: 375 init1: 294 opt: 526  Z-score: 501.5  bits: 101.3 E(32554): 1.3e-21
Smith-Waterman score: 547; 28.7% identity (63.3% similar) in 338 aa overlap (17-346:19-343)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   METNFSIPLNETEEVLPEPAGHTVLWIFSLLVHGVTFVFGVLGNGLVIWVAGFRMT-R
                         :. . :. ....   .... :: :..::.::. :  : :  .
CCDS31 MILNSSTEDGIKRIQDDCPKAGRHNYIFVMIPTLYSIIFVVGIFGNSLVVIVIYFYMKLK
               10        20        30        40        50        60

        60        70        80        90       100       110       
pF1KB7 TVNTICYLNLALADFSFSAILPFRMVSVAMREKWPFGSFLCKLVHVMIDINLFVSVYLIT
       :: ..  :::::::. :   ::.  : .::. .::::..:::.. . ...::..::.:.:
CCDS31 TVASVFLLNLALADLCFLLTLPLWAVYTAMEYRWPFGNYLCKIASASVSFNLYASVFLLT
               70        80        90       100       110       120

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 IIALDRCICVLHPAWAQNHRTMSLAKRVMTGLWIFTIVLTLPNFIFWTTISTTNGD-TYC
        ...:: . ..::  .. .::: .:: .   .:... . .:: .:  ...   : . : :
CCDS31 CLSIDRYLAIVHPMKSRLRRTMLVAKVTCIIIWLLAGLASLPAIIHRNVFFIENTNITVC
              130       140       150       160       170       180

        180       190       200       210       220       230      
pF1KB7 IFNFAFWGDTAVERLNVFITMAKVFLILHFIIGFSVPMSIITVCYGIIAAKIHRNHMIKS
        :..   ..:    : . . ..:       :.::  :. :: . : .:   ... . :..
CCDS31 AFHYESQNST----LPIGLGLTKN------ILGFLFPFLIILTSYTLIWKALKKAYEIQK
              190           200             210       220       230

             240       250       260       270       280        290
pF1KB7 SRP-----LRVFAAVVASFFICWFPYELIGILMAVWLKEMLLNGKYKIILVLINP-TSSL
       ..:     .... :.:  ::. :.:.... .: ..    .. . .   :.    : :  .
CCDS31 NKPRNDDIFKIIMAIVLFFFFSWIPHQIFTFLDVLIQLGIIRDCRIADIVDTAMPITICI
              240       250       260       270       280       290

              300       310       320       330       340       350
pF1KB7 AFFNSCLNPILYVFMGRNFQERLIRSLPTSLERALTEVPDSAQTSNTDTTSASPPEETEL
       :.::.::::..: :.:..:.. ... :     .: ..   :  ... .: :  : .    
CCDS31 AYFNNCLNPLFYGFLGKKFKRYFLQLLKYIPPKAKSH---SNLSTKMSTLSYRPSDNVSS
              300       310       320          330       340       

                   
pF1KB7 QAM         
                   
CCDS31 STKKPAPCFEVE
       350         




353 residues in 1 query   sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
 Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
 start: Fri Nov  4 05:20:22 2016 done: Fri Nov  4 05:20:23 2016
 Total Scan time:  2.350 Total Display time:  0.030

Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
Inquiries or Suggestions ?
Send a message to flexiclone AT kazusagt.com