FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7159, 365 aa 1>>>pF1KB7159 365 - 365 aa - 365 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8195+/-0.000413; mu= 19.3211+/- 0.026 mean_var=88.5587+/-22.018, 0's: 0 Z-trim(111.9): 607 B-trim: 2191 in 2/48 Lambda= 0.136288 statistics sampled from 19899 (20661) to 19899 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16 Scan time: 7.940 The best scores are: opt bits E(85289) NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine recep ( 365) 2404 483.2 4e-136 XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 365) 2404 483.2 4e-136 NP_001309139 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1320 270.1 5.8e-72 XP_011531966 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366) 1320 270.1 5.8e-72 NP_001309138 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1320 270.1 5.8e-72 NP_000857 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recep ( 366) 1320 270.1 5.8e-72 NP_001309137 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1320 270.1 5.8e-72 XP_005264808 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366) 1320 270.1 5.8e-72 NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine recep ( 377) 1074 221.7 2.1e-57 NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390) 1061 219.2 1.3e-56 NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 648 138.0 3.8e-32 NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic ( 477) 629 134.3 5.5e-31 NP_387512 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 367) 599 128.3 2.7e-29 NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 553 119.3 1.6e-26 XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 553 119.4 1.7e-26 NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 553 119.4 1.7e-26 NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 535 115.8 1.9e-25 NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 535 115.8 1.9e-25 NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 535 115.8 2e-25 NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458) 519 112.7 1.7e-24 NP_001243689 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine re ( 458) 519 112.7 1.7e-24 NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 514 111.7 3.4e-24 XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 508 110.3 5.9e-24 XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 508 110.3 6.1e-24 XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 508 110.3 6.2e-24 NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 508 110.4 6.4e-24 NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 508 110.4 6.7e-24 NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 508 110.4 6.7e-24 XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 508 110.5 7.4e-24 NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 508 110.5 7.4e-24 NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 508 110.5 7.7e-24 NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 508 110.5 7.8e-24 XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 508 110.5 7.9e-24 XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 508 110.5 7.9e-24 XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 508 110.5 7.9e-24 NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 508 110.5 7.9e-24 NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 501 109.1 2e-23 XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 490 106.8 7.2e-23 XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 490 106.8 7.3e-23 XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 490 106.9 7.7e-23 XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 490 106.9 8.1e-23 XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 490 106.9 8.2e-23 NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520) 490 107.0 9.8e-23 XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556) 490 107.1 1e-22 NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 477 104.4 5.3e-22 NP_076917 (OMIM: 601305) 5-hydroxytryptamine recep ( 357) 474 103.7 6.7e-22 NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 455 100.1 1.1e-20 XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 454 100.0 1.4e-20 XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 454 100.0 1.4e-20 XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 454 100.0 1.4e-20 >>NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine receptor (365 aa) initn: 2404 init1: 2404 opt: 2404 Z-score: 2564.9 bits: 483.2 E(85289): 4e-136 Smith-Waterman score: 2404; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: NP_000 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 CREHT ::::: NP_000 CREHT >>XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (365 aa) initn: 2404 init1: 2404 opt: 2404 Z-score: 2564.9 bits: 483.2 E(85289): 4e-136 Smith-Waterman score: 2404; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: XP_011 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 CREHT ::::: XP_011 CREHT >>NP_001309139 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa) initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72 Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ : :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::. NP_001 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV :::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: . NP_001 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI :::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: : NP_001 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N .:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: . NP_001 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA . : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.:::::: NP_001 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN : ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: :: NP_001 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN 300 310 320 330 340 350 350 360 pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT :::: ::.::.::: NP_001 EDFKKAFQKLVRCRC 360 >>XP_011531966 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (366 aa) initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72 Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ : :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::. XP_011 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV :::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: . XP_011 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI :::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: : XP_011 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N .:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: . XP_011 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA . : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.:::::: XP_011 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN : ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: :: XP_011 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN 300 310 320 330 340 350 350 360 pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT :::: ::.::.::: XP_011 EDFKKAFQKLVRCRC 360 >>NP_001309138 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa) initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72 Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ : :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::. NP_001 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV :::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: . NP_001 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI :::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: : NP_001 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N .:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: . NP_001 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA . : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.:::::: NP_001 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN : ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: :: NP_001 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN 300 310 320 330 340 350 350 360 pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT :::: ::.::.::: NP_001 EDFKKAFQKLVRCRC 360 >>NP_000857 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine receptor (366 aa) initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72 Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ : :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::. NP_000 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV :::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: . NP_000 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI :::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: : NP_000 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N .:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: . NP_000 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA . : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.:::::: NP_000 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN : ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: :: NP_000 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN 300 310 320 330 340 350 350 360 pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT :::: ::.::.::: NP_000 EDFKKAFQKLVRCRC 360 >>NP_001309137 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa) initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72 Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ : :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::. NP_001 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV :::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: . NP_001 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI :::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: : NP_001 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N .:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: . NP_001 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA . : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.:::::: NP_001 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN : ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: :: NP_001 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN 300 310 320 330 340 350 350 360 pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT :::: ::.::.::: NP_001 EDFKKAFQKLVRCRC 360 >>XP_005264808 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (366 aa) initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72 Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ : :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::. XP_005 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV :::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: . XP_005 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI :::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: : XP_005 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N .:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: . XP_005 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES 180 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA . : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.:::::: XP_005 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA 240 250 260 270 280 290 290 300 310 320 330 340 pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN : ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: :: XP_005 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN 300 310 320 330 340 350 350 360 pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT :::: ::.::.::: XP_005 EDFKKAFQKLVRCRC 360 >>NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine receptor (377 aa) initn: 1056 init1: 591 opt: 1074 Z-score: 1151.4 bits: 221.7 E(85289): 2.1e-57 Smith-Waterman score: 1074; 48.6% identity (72.4% similar) in 366 aa overlap (8-363:23-375) 10 20 30 40 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITE-KMLICMTLVVITTLTTLLNLAVI ::.: : :.:. :. . ..: ::: :.: : :. NP_000 MSPLNQSAEGLPQEASNRSLNATETSEAWDPRTLQALKISLAVVLSVITLATVLSNAFVL 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 100 pF1KB7 MAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMT .: :.::: :::::: :::.:::::..::::.:: : . :..: .::..::: :.: NP_000 TTILLTRKLHTPANYLIGSLATTDLLVSILVMPISIAYTITHTWNFGQILCDIWLSSDIT 70 80 90 100 110 120 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 CCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHR ::: :::::::::::::::::.:.::...::: .:: :: ::.::: ::.:::::: . NP_000 CCTASILHLCVIALDRYWAITDALEYSKRRTAGHAATMIAIVWAISICISIPPLFWR-QA 130 140 150 160 170 170 180 190 200 210 pF1KB7 RLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAK-------SLYQKRG . . :.: .. ... :::::: :::::: .:..::: :::.::. ::: :: NP_000 KAQEEMSDCLVNTSQISYTIYSTCGAFYIPSVLLIILYGRIYRAARNRILNPPSLYGKRF 180 190 200 210 220 230 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 SSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGE .. :: . :. : . :.:.... . .. :. :..:.. : : NP_000 TTAHLITGSAGS----SLCSLNSSLHEGHSHSAGSPLFFN--HVKIKLA------DSALE 240 250 260 270 280 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 RQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYT--VSSEVADFLTWLGYV :..::..:::::..:::.::::::. :::::. :.. . . . . ::.:::::. NP_000 RKRISAARERKATKILGIILGAFIICWLPFFVVSLVLPICRDSCWIHPALFDFFTWLGYL 290 300 310 320 330 340 340 350 360 pF1KB7 NSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT ::::::..:: :::.:. ::.:.. :. NP_000 NSLINPIIYTVFNEEFRQAFQKIVPFRKAS 350 360 370 >>NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine receptor (390 aa) initn: 1063 init1: 627 opt: 1061 Z-score: 1137.4 bits: 219.2 E(85289): 1.3e-56 Smith-Waterman score: 1061; 47.8% identity (71.2% similar) in 364 aa overlap (5-362:32-387) 10 20 30 pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITT ::... . .. :.:. : :..:: NP_000 EEPGAQCAPPPPAGSETWVPQANLSSAPSQNCSAKDYIYQDSISLPWKVLLVMLLALITL 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 LTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFL ::: : :: .. :.::: :::::: :::::::::..::::.: .: : :: :: . NP_000 ATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQVV 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 CEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFIS :. ::: :.:::: :::::::::::::::::.:.::. ::: ::::.:: ::..:: :: NP_000 CDFWLSSDITCCTASILHLCVIALDRYWAITDAVEYSAKRTPKRAAVMIALVWVFSISIS 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 MPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQ .::.::: . . :.:... ::..::.:::.::::.: :.. :: ::: :.: NP_000 LPPFFWR-QAKAEEEVSECVVNTDHILYTVYSTVGAFYFPTLLLIALYGRIYVEARSRIL 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 KRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEK----FHASIRIPPFDN :. .: ..: : .: . . . .: :..... : . :. . .... : NP_000 KQTPNR-TGKRLTRAQ--LITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDA 250 260 270 280 290 280 290 300 310 320 pF1KB7 DLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVA--DF : :.... ..:::::.. ::.::::::. :::::: :.. . . ..: :: NP_000 LL----EKKKLMAARERKATKTLGIILGAFIVCWLPFFIISLVMPICKDACWFHLAIFDF 300 310 320 330 340 350 330 340 350 360 pF1KB7 LTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT .:::::.::::::..:: ::::: ::.:::: . NP_000 FTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS 360 370 380 390 365 residues in 1 query sequences 60827320 residues in 85289 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Fri Nov 4 05:22:39 2016 done: Fri Nov 4 05:22:41 2016 Total Scan time: 7.940 Total Display time: 0.040 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]