FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7159, 365 aa
1>>>pF1KB7159 365 - 365 aa - 365 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8195+/-0.000413; mu= 19.3211+/- 0.026
mean_var=88.5587+/-22.018, 0's: 0 Z-trim(111.9): 607 B-trim: 2191 in 2/48
Lambda= 0.136288
statistics sampled from 19899 (20661) to 19899 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.603), E-opt: 0.2 (0.242), width: 16
Scan time: 7.940
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine recep ( 365) 2404 483.2 4e-136
XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 365) 2404 483.2 4e-136
NP_001309139 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1320 270.1 5.8e-72
XP_011531966 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366) 1320 270.1 5.8e-72
NP_001309138 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1320 270.1 5.8e-72
NP_000857 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recep ( 366) 1320 270.1 5.8e-72
NP_001309137 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine re ( 366) 1320 270.1 5.8e-72
XP_005264808 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 366) 1320 270.1 5.8e-72
NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine recep ( 377) 1074 221.7 2.1e-57
NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine recep ( 390) 1061 219.2 1.3e-56
NP_000515 (OMIM: 109760,614674) 5-hydroxytryptamin ( 422) 648 138.0 3.8e-32
NP_000675 (OMIM: 109630,607276) beta-1 adrenergic ( 477) 629 134.3 5.5e-31
NP_387512 (OMIM: 126451,181500,190300) D(3) dopami ( 367) 599 128.3 2.7e-29
NP_001307687 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine re ( 439) 553 119.3 1.6e-26
XP_006712545 (OMIM: 601122) PREDICTED: 5-hydroxytr ( 456) 553 119.4 1.7e-26
NP_000858 (OMIM: 601122) 5-hydroxytryptamine recep ( 481) 553 119.4 1.7e-26
NP_062874 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 432) 535 115.8 1.9e-25
NP_000863 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 445) 535 115.8 1.9e-25
NP_062873 (OMIM: 182137) 5-hydroxytryptamine recep ( 479) 535 115.8 2e-25
NP_000859 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine recep ( 458) 519 112.7 1.7e-24
NP_001243689 (OMIM: 312861) 5-hydroxytryptamine re ( 458) 519 112.7 1.7e-24
NP_000672 (OMIM: 104210) alpha-2A adrenergic recep ( 465) 514 111.7 3.4e-24
XP_011542714 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 308) 508 110.3 5.9e-24
XP_016868585 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 317) 508 110.3 6.1e-24
XP_011542713 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 324) 508 110.3 6.2e-24
NP_001309433 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 342) 508 110.4 6.4e-24
NP_001309432 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 370) 508 110.4 6.7e-24
NP_001309431 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic re ( 372) 508 110.4 6.7e-24
XP_006716356 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 429) 508 110.5 7.4e-24
NP_150645 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 429) 508 110.5 7.4e-24
NP_150647 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 455) 508 110.5 7.7e-24
NP_000671 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 466) 508 110.5 7.8e-24
XP_006716355 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 508 110.5 7.9e-24
XP_016868583 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 508 110.5 7.9e-24
XP_016868584 (OMIM: 104221) PREDICTED: alpha-1A ad ( 475) 508 110.5 7.9e-24
NP_150646 (OMIM: 104221) alpha-1A adrenergic recep ( 475) 508 110.5 7.9e-24
NP_000673 (OMIM: 104260,607876) alpha-2B adrenergi ( 450) 501 109.1 2e-23
XP_005265876 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 328) 490 106.8 7.2e-23
XP_006714884 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 331) 490 106.8 7.3e-23
XP_005265875 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 366) 490 106.9 7.7e-23
XP_011532740 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 389) 490 106.9 8.1e-23
XP_011532739 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 402) 490 106.9 8.2e-23
NP_000670 (OMIM: 104220) alpha-1B adrenergic recep ( 520) 490 107.0 9.8e-23
XP_011532737 (OMIM: 104220) PREDICTED: alpha-1B ad ( 556) 490 107.1 1e-22
NP_000674 (OMIM: 104250) alpha-2C adrenergic recep ( 462) 477 104.4 5.3e-22
NP_076917 (OMIM: 601305) 5-hydroxytryptamine recep ( 357) 474 103.7 6.7e-22
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 455 100.1 1.1e-20
XP_016855642 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 454 100.0 1.4e-20
XP_016855645 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 454 100.0 1.4e-20
XP_011542348 (OMIM: 100100,118494) PREDICTED: musc ( 590) 454 100.0 1.4e-20
>>NP_000856 (OMIM: 182132) 5-hydroxytryptamine receptor (365 aa)
initn: 2404 init1: 2404 opt: 2404 Z-score: 2564.9 bits: 483.2 E(85289): 4e-136
Smith-Waterman score: 2404; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 CREHT
:::::
NP_000 CREHT
>>XP_011534091 (OMIM: 182132) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (365 aa)
initn: 2404 init1: 2404 opt: 2404 Z-score: 2564.9 bits: 483.2 E(85289): 4e-136
Smith-Waterman score: 2404; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQPANYL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 IYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIR
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 CREHT
:::::
XP_011 CREHT
>>NP_001309139 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa)
initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72
Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ
: :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::.
NP_001 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV
:::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: .
NP_001 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI
:::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: :
NP_001 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N
.:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: .
NP_001 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA
. : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.::::::
NP_001 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN
: ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: ::
NP_001 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT
:::: ::.::.:::
NP_001 EDFKKAFQKLVRCRC
360
>>XP_011531966 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (366 aa)
initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72
Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ
: :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::.
XP_011 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV
:::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: .
XP_011 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI
:::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: :
XP_011 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N
.:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: .
XP_011 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA
. : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.::::::
XP_011 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN
: ::::::::.. :::::.:::.:.. . .: :...::.::::.:::::::.:: ::
XP_011 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT
:::: ::.::.:::
XP_011 EDFKKAFQKLVRCRC
360
>>NP_001309138 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa)
initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72
Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ
: :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::.
NP_001 MDFLNSSDQNLTSEELLNRMPS----KILVSLTLSGLALMTTTINSLVIAAIIVTRKLHH
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 PANYLICSLAVTDLLVAVLVMPLSIIYIVMDRWKLGYFLCEVWLSVDMTCCTCSILHLCV
:::::::::::::.::::::::.::.::: . : .: .:..:::::.:::::::::: .
NP_001 PANYLICSLAVTDFLVAVLVMPFSIVYIVRESWIMGQVVCDIWLSVDITCCTCSILHLSA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 IALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFISMPPLFWRSHRRLSPPPSQCTI
:::::: :::.:.::::::: :.:..:: :: ::.:::::::::: :. : ..: :
NP_001 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N
.:::.. :::::.:::::::.:::::::.::.:::.::.:: .:: .... ...: .
NP_001 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KB7 SFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEKFHASIRIPPFDNDLDHPG--ERQQISSTRERKA
. : : ..: : . : :::.:.:.:.:...: . ... : .::.::.::::::
NP_001 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
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360
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NP_000 EDFKKAFQKLVRCRC
360
>>NP_001309137 (OMIM: 182134) 5-hydroxytryptamine recept (366 aa)
initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72
Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365)
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pF1KB7 QHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQKRGSSRHLSNRSTDSQ----N
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NP_001 KHDHIVSTIYSTFGAFYIPLALILILYYKIYRAAKTLYHKRQASR-IAKEEVNGQVLLES
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NP_001 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN
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NP_001 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN
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pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT
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NP_001 EDFKKAFQKLVRCRC
360
>>XP_005264808 (OMIM: 182134) PREDICTED: 5-hydroxytrypta (366 aa)
initn: 1326 init1: 650 opt: 1320 Z-score: 1413.0 bits: 270.1 E(85289): 5.8e-72
Smith-Waterman score: 1320; 57.0% identity (80.0% similar) in 365 aa overlap (5-362:10-365)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MNITNCTTEASMAIRPKTITEKMLICMTLVVITTLTTLLNLAVIMAIGTTKKLHQ
: :.: . :. :.:. .:: .. .:: .: :: :: .:.:::.
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XP_005 IALDRYRAITDAVEYARKRTPKHAGIMITIVWIISVFISMPPLFWR-HQGTSRD-DECII
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XP_005 GEKSTKSVSTSYVLEKSLSDPSTDFDKIHSTVR--SLRSEFKHEKSWRRQKISGTRERKA
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGL-SIYTVSSEVADFLTWLGYVNSLINPLLYTSFN
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XP_005 ATTLGLILGAFVICWLPFFVKELVVNVCDKCKISEEMSNFLAWLGYLNSLINPLIYTIFN
300 310 320 330 340 350
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pF1KB7 EDFKLAFKKLIRCREHT
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XP_005 EDFKKAFQKLVRCRC
360
>>NP_000855 (OMIM: 182133) 5-hydroxytryptamine receptor (377 aa)
initn: 1056 init1: 591 opt: 1074 Z-score: 1151.4 bits: 221.7 E(85289): 2.1e-57
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>>NP_000854 (OMIM: 182131) 5-hydroxytryptamine receptor (390 aa)
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10 20 30
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NP_000 ATTLSNAFVIATVYRTRKLHTPANYLIASLAVTDLLVSILVMPISTMYTVTGRWTLGQVV
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pF1KB7 CEVWLSVDMTCCTCSILHLCVIALDRYWAITNAIEYARKRTAKRAALMILTVWTISIFIS
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pF1KB7 MPPLFWRSHRRLSPPPSQCTIQHDHVIYTIYSTLGAFYIPLTLILILYYRIYHAAKSLYQ
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pF1KB7 KRGSSRHLSNRSTDSQNSFASCKLTQTFCVSDFSTSDPTTEFEK----FHASIRIPPFDN
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NP_000 KQTPNR-TGKRLTRAQ--LITDSPGSTSSVTSINSRVPDVPSESGSPVYVNQVKVRVSDA
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pF1KB7 DLDHPGERQQISSTRERKAARILGLILGAFILSWLPFFIKELIVGLSIYTVSSEVA--DF
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pF1KB7 LTWLGYVNSLINPLLYTSFNEDFKLAFKKLIRCREHT
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NP_000 FTWLGYLNSLINPIIYTMSNEDFKQAFHKLIRFKCTS
360 370 380 390
365 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:22:39 2016 done: Fri Nov 4 05:22:41 2016
Total Scan time: 7.940 Total Display time: 0.040
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]