Result of FASTA (omim) for
pF1KB7161
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7161, 373 aa
1>>>pF1KB7161 373 - 373 aa - 373 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5005+/-0.000301; mu= 2.3398+/- 0.019
mean_var=144.4462+/-29.149, 0's: 0 Z-trim(121.5): 128 B-trim: 674 in 1/60
Lambda= 0.106714
statistics sampled from 38119 (38247) to 38119 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.775), E-opt: 0.2 (0.448), width: 16
Scan time: 9.080
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057333 (OMIM: 300468) melanoma-associated antig ( 373) 2469 391.1 2.2e-108
NP_005453 (OMIM: 300223) melanoma-associated antig (1142) 1157 189.2 3.9e-47
XP_011529720 (OMIM: 300223) PREDICTED: melanoma-as (1142) 1157 189.2 3.9e-47
NP_803251 (OMIM: 300469) melanoma-associated antig ( 346) 1013 166.9 6.2e-41
XP_016884754 (OMIM: 300469) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1013 166.9 6.2e-41
XP_011529569 (OMIM: 300469) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 1013 166.9 6.2e-41
NP_001011543 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 983 162.3 1.6e-39
NP_001238757 (OMIM: 300343) melanoma-associated an ( 369) 983 162.3 1.6e-39
NP_066386 (OMIM: 300343) melanoma-associated antig ( 369) 983 162.3 1.6e-39
NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antig ( 346) 822 137.5 4.4e-32
NP_872312 (OMIM: 300761) melanoma-associated antig ( 347) 805 134.9 2.7e-31
XP_011543869 (OMIM: 300763) PREDICTED: melanoma-as ( 336) 798 133.8 5.6e-31
NP_001264236 (OMIM: 300763) melanoma-associated an ( 336) 798 133.8 5.6e-31
XP_005278249 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 795 133.3 7.3e-31
NP_001074259 (OMIM: 300764) melanoma-associated an ( 315) 795 133.3 7.3e-31
XP_005262391 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 795 133.3 7.3e-31
XP_005262392 (OMIM: 300342) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 795 133.3 7.3e-31
NP_005356 (OMIM: 300342) melanoma-associated antig ( 315) 795 133.3 7.3e-31
XP_005278250 (OMIM: 300764) PREDICTED: melanoma-as ( 315) 795 133.3 7.3e-31
XP_016885011 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 394) 790 132.6 1.5e-30
NP_001011544 (OMIM: 300344) melanoma-associated an ( 400) 790 132.6 1.5e-30
XP_011529466 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 421) 790 132.6 1.6e-30
XP_016885010 (OMIM: 300344) PREDICTED: melanoma-as ( 429) 790 132.6 1.6e-30
NP_005357 (OMIM: 300344) melanoma-associated antig ( 429) 790 132.6 1.6e-30
NP_796379 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 773 130.0 8.3e-30
NP_002354 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 773 130.0 8.3e-30
NP_803134 (OMIM: 300097) melanoma-associated antig ( 347) 773 130.0 8.3e-30
NP_001093391 (OMIM: 300762) melanoma-associated an ( 324) 767 129.0 1.5e-29
XP_011543756 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 767 129.0 1.5e-29
XP_011543755 (OMIM: 300762) PREDICTED: melanoma-as ( 324) 767 129.0 1.5e-29
XP_005274735 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 746 125.8 1.4e-28
NP_001011549 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 746 125.8 1.4e-28
NP_001011548 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 746 125.8 1.4e-28
NP_002353 (OMIM: 300175) melanoma-associated antig ( 317) 746 125.8 1.4e-28
NP_001011550 (OMIM: 300175) melanoma-associated an ( 317) 746 125.8 1.4e-28
XP_005274736 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 317) 746 125.8 1.4e-28
XP_005274734 (OMIM: 300175) PREDICTED: melanoma-as ( 397) 746 125.8 1.7e-28
XP_011543814 (OMIM: 300098) PREDICTED: melanoma-as ( 319) 738 124.6 3.2e-28
NP_002355 (OMIM: 300098) melanoma-associated antig ( 319) 738 124.6 3.2e-28
XP_016885009 (OMIM: 300341) PREDICTED: melanoma-as ( 318) 732 123.6 6.1e-28
NP_005355 (OMIM: 300341) melanoma-associated antig ( 318) 732 123.6 6.1e-28
NP_001159873 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 732 123.6 6.1e-28
NP_001159872 (OMIM: 300341) melanoma-associated an ( 318) 732 123.6 6.1e-28
NP_619647 (OMIM: 300469) melanoma-associated antig ( 643) 731 123.6 1.3e-27
XP_011543815 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 717 121.3 3.3e-27
XP_011543816 (OMIM: 300152) PREDICTED: melanoma-as ( 346) 717 121.3 3.3e-27
NP_002356 (OMIM: 300152) melanoma-associated antig ( 346) 717 121.3 3.3e-27
NP_005354 (OMIM: 300176) melanoma-associated antig ( 314) 714 120.9 4.1e-27
NP_787064 (OMIM: 300176) melanoma-associated antig ( 314) 714 120.9 4.1e-27
NP_005353 (OMIM: 300174) melanoma-associated antig ( 314) 710 120.3 6.3e-27
>>NP_057333 (OMIM: 300468) melanoma-associated antigen C (373 aa)
initn: 2469 init1: 2469 opt: 2469 Z-score: 2066.7 bits: 391.1 E(85289): 2.2e-108
Smith-Waterman score: 2469; 100.0% identity (100.0% similar) in 373 aa overlap (1-373:1-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCSSFSWSSFSEESSSQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCSSFSWSSFSEESSSQK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIKYKDYFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIKYKDYFPV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 ILKRAREFMELLFGLALIEVGPDHFCVFANTVGLTDEGSDDEGMPENSLLIIILSVIFIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 ILKRAREFMELLFGLALIEVGPDHFCVFANTVGLTDEGSDDEGMPENSLLIIILSVIFIK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 GNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTADDATVMASE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 WGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTADDATVMASE
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB7 SLSVMSSNVSFSE
:::::::::::::
NP_057 SLSVMSSNVSFSE
370
>>NP_005453 (OMIM: 300223) melanoma-associated antigen C (1142 aa)
initn: 1131 init1: 750 opt: 1157 Z-score: 967.2 bits: 189.2 E(85289): 3.9e-47
Smith-Waterman score: 1176; 57.0% identity (74.3% similar) in 370 aa overlap (19-370:784-1140)
10 20 30 40
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYL
: : . ....: . . :. :.: :
NP_005 SLPQSFPESPQSPPEGPAQSPLQRPVSSFFSYTLASLLQSSHESPQSPPEGP-AQSPLQ-
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50 60 70 80 90 100
pF1KB7 VFSP-SSF--STSSSLILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCS
:: ::: :::::: ..: . .. : :: .. :..: :::. : :
NP_005 --SPVSSFPSSTSSSLSQSSP---------VSSFPSSTSSSLSKSSPESPLQSPVISFSS
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110 120 130 140 150
pF1KB7 SFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQ------GLPDSESS------FTYTLDEKVAELVEFLL
: : : ::::::: : :.. . .: :::: ::::::::: ::..:::
NP_005 STSLSPFSEESSSPVDEYTSSSDTLLESDSLTDSESLIESEPLFTYTLDEKVDELARFLL
870 880 890 900 910 920
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LKYEAEEPVTEAEMLMIVI-KYKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPDHFCVFANTV
:::....:.:.:::: :: .: :::::...::::.:.:::..: :: :: ::.::.
NP_005 LKYQVKQPITKAEMLTNVISRYTGYFPVIFRKAREFIEILFGISLREVDPDDSYVFVNTL
930 940 950 960 970 980
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 GLTDEG--SDDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEP
::.:: ::..:: .: :::.:::.:::::. :::::::.::...:: ::::::..:::
NP_005 DLTSEGCLSDEQGMSQNRLLILILSIIFIKGTYASEEVIWDVLSGIGVRAGREHFAFGEP
990 1000 1010 1020 1030 1040
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFP
:::::::::: :::::::::.:::: :::::::::::: ::.::.:::: :.:::: .::
NP_005 RELLTKVWVQEHYLEYREVPNSSPPRYEFLWGPRAHSEVIKRKVVEFLAMLKNTVPITFP
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pF1KB7 SWYKDALKDVEERVQATIDTADDATVMASESLSVMSSNVSFSE
: :::::::::::.:: :::.::.:. : : :::: . :
NP_005 SSYKDALKDVEERAQAIIDTTDDSTATESASSSVMSPSFSSE
1110 1120 1130 1140
>>XP_011529720 (OMIM: 300223) PREDICTED: melanoma-associ (1142 aa)
initn: 1131 init1: 750 opt: 1157 Z-score: 967.2 bits: 189.2 E(85289): 3.9e-47
Smith-Waterman score: 1176; 57.0% identity (74.3% similar) in 370 aa overlap (19-370:784-1140)
10 20 30 40
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYL
: : . ....: . . :. :.: :
XP_011 SLPQSFPESPQSPPEGPAQSPLQRPVSSFFSYTLASLLQSSHESPQSPPEGP-AQSPLQ-
760 770 780 790 800 810
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 VFSP-SSF--STSSSLILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCS
:: ::: :::::: ..: . .. : :: .. :..: :::. : :
XP_011 --SPVSSFPSSTSSSLSQSSP---------VSSFPSSTSSSLSKSSPESPLQSPVISFSS
820 830 840 850 860
110 120 130 140 150
pF1KB7 SFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQ------GLPDSESS------FTYTLDEKVAELVEFLL
: : : ::::::: : :.. . .: :::: ::::::::: ::..:::
XP_011 STSLSPFSEESSSPVDEYTSSSDTLLESDSLTDSESLIESEPLFTYTLDEKVDELARFLL
870 880 890 900 910 920
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 LKYEAEEPVTEAEMLMIVI-KYKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPDHFCVFANTV
:::....:.:.:::: :: .: :::::...::::.:.:::..: :: :: ::.::.
XP_011 LKYQVKQPITKAEMLTNVISRYTGYFPVIFRKAREFIEILFGISLREVDPDDSYVFVNTL
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220 230 240 250 260 270
pF1KB7 GLTDEG--SDDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEP
::.:: ::..:: .: :::.:::.:::::. :::::::.::...:: ::::::..:::
XP_011 DLTSEGCLSDEQGMSQNRLLILILSIIFIKGTYASEEVIWDVLSGIGVRAGREHFAFGEP
990 1000 1010 1020 1030 1040
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFP
:::::::::: :::::::::.:::: :::::::::::: ::.::.:::: :.:::: .::
XP_011 RELLTKVWVQEHYLEYREVPNSSPPRYEFLWGPRAHSEVIKRKVVEFLAMLKNTVPITFP
1050 1060 1070 1080 1090 1100
340 350 360 370
pF1KB7 SWYKDALKDVEERVQATIDTADDATVMASESLSVMSSNVSFSE
: :::::::::::.:: :::.::.:. : : :::: . :
XP_011 SSYKDALKDVEERAQAIIDTTDDSTATESASSSVMSPSFSSE
1110 1120 1130 1140
>>NP_803251 (OMIM: 300469) melanoma-associated antigen C (346 aa)
initn: 1252 init1: 499 opt: 1013 Z-score: 855.8 bits: 166.9 E(85289): 6.2e-41
Smith-Waterman score: 1180; 56.8% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (1-318:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSS
:: :..: . ..: . :: :::: :::::.:::.::. . . ::: : :::
NP_803 MPLFPNLPRLSFEEDFQNPSVTEDLVDAQDSIDEEEEDASSTSSSSFHFLFPSSSSLSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB7 ----------LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPP--------QGPSQSPLSS
:::: ::.:..:.. .: : .: : :::::: :.: ::::.:
NP_803 SPLSSPLPSTLILGVPEDEDMPAAGMPPLPQSPPEIPPQGPPKISPQGPPQSPPQSPLDS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 CCSSFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPV
: : . :. ..:::::.. :::.: ..::.::: :.:::::::::.::::::...:::
NP_803 CSSPLLWTRLDEESSSEE-EDTATWHALPESESLPRYALDEKVAELVQFLLLKYQTKEPV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 TEAEMLMIVIK-YKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPD-HFCVFANTVGLTDEGS-
:.:::: ::: ::::::.:. .:.::.::.::.:: .. :: : : .:. :: :::
NP_803 TKAEMLTTVIKKYKDYFPMIFGKAHEFIELIFGIALTDMDPDNHSYFFEDTLDLTYEGSL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 -DDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVW
::.:::.: :::.:::.:::::.:. ::::::::.:.:: ::::::.::.::.::: :
NP_803 IDDQGMPKNCLLILILSMIFIKGSCVPEEVIWEVLSAIGVCAGREHFIYGDPRKLLTIHW
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALK
:: .::::::::.:.:: ::::::::::::. :... :.
NP_803 VQRKYLEYREVPNSAPPRYEFLWGPRAHSEASKRSLRVFIQAIQYHP
300 310 320 330 340
340 350 360 370
pF1KB7 DVEERVQATIDTADDATVMASESLSVMSSNVSFSE
>>XP_016884754 (OMIM: 300469) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa)
initn: 1252 init1: 499 opt: 1013 Z-score: 855.8 bits: 166.9 E(85289): 6.2e-41
Smith-Waterman score: 1180; 56.8% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (1-318:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSS
:: :..: . ..: . :: :::: :::::.:::.::. . . ::: : :::
XP_016 MPLFPNLPRLSFEEDFQNPSVTEDLVDAQDSIDEEEEDASSTSSSSFHFLFPSSSSLSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB7 ----------LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPP--------QGPSQSPLSS
:::: ::.:..:.. .: : .: : :::::: :.: ::::.:
XP_016 SPLSSPLPSTLILGVPEDEDMPAAGMPPLPQSPPEIPPQGPPKISPQGPPQSPPQSPLDS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 CCSSFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPV
: : . :. ..:::::.. :::.: ..::.::: :.:::::::::.::::::...:::
XP_016 CSSPLLWTRLDEESSSEE-EDTATWHALPESESLPRYALDEKVAELVQFLLLKYQTKEPV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 TEAEMLMIVIK-YKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPD-HFCVFANTVGLTDEGS-
:.:::: ::: ::::::.:. .:.::.::.::.:: .. :: : : .:. :: :::
XP_016 TKAEMLTTVIKKYKDYFPMIFGKAHEFIELIFGIALTDMDPDNHSYFFEDTLDLTYEGSL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 -DDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVW
::.:::.: :::.:::.:::::.:. ::::::::.:.:: ::::::.::.::.::: :
XP_016 IDDQGMPKNCLLILILSMIFIKGSCVPEEVIWEVLSAIGVCAGREHFIYGDPRKLLTIHW
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALK
:: .::::::::.:.:: ::::::::::::. :... :.
XP_016 VQRKYLEYREVPNSAPPRYEFLWGPRAHSEASKRSLRVFIQAIQYHP
300 310 320 330 340
340 350 360 370
pF1KB7 DVEERVQATIDTADDATVMASESLSVMSSNVSFSE
>>XP_011529569 (OMIM: 300469) PREDICTED: melanoma-associ (346 aa)
initn: 1252 init1: 499 opt: 1013 Z-score: 855.8 bits: 166.9 E(85289): 6.2e-41
Smith-Waterman score: 1180; 56.8% identity (76.2% similar) in 340 aa overlap (1-318:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSS
:: :..: . ..: . :: :::: :::::.:::.::. . . ::: : :::
XP_011 MPLFPNLPRLSFEEDFQNPSVTEDLVDAQDSIDEEEEDASSTSSSSFHFLFPSSSSLSSS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KB7 ----------LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPP--------QGPSQSPLSS
:::: ::.:..:.. .: : .: : :::::: :.: ::::.:
XP_011 SPLSSPLPSTLILGVPEDEDMPAAGMPPLPQSPPEIPPQGPPKISPQGPPQSPPQSPLDS
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 CCSSFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPV
: : . :. ..:::::.. :::.: ..::.::: :.:::::::::.::::::...:::
XP_011 CSSPLLWTRLDEESSSEE-EDTATWHALPESESLPRYALDEKVAELVQFLLLKYQTKEPV
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB7 TEAEMLMIVIK-YKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPD-HFCVFANTVGLTDEGS-
:.:::: ::: ::::::.:. .:.::.::.::.:: .. :: : : .:. :: :::
XP_011 TKAEMLTTVIKKYKDYFPMIFGKAHEFIELIFGIALTDMDPDNHSYFFEDTLDLTYEGSL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 -DDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVW
::.:::.: :::.:::.:::::.:. ::::::::.:.:: ::::::.::.::.::: :
XP_011 IDDQGMPKNCLLILILSMIFIKGSCVPEEVIWEVLSAIGVCAGREHFIYGDPRKLLTIHW
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALK
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XP_011 VQRKYLEYREVPNSAPPRYEFLWGPRAHSEASKRSLRVFIQAIQYHP
300 310 320 330 340
340 350 360 370
pF1KB7 DVEERVQATIDTADDATVMASESLSVMSSNVSFSE
>>NP_001011543 (OMIM: 300343) melanoma-associated antige (369 aa)
initn: 854 init1: 614 opt: 983 Z-score: 830.4 bits: 162.3 E(85289): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 983; 47.4% identity (70.7% similar) in 382 aa overlap (1-373:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFS-PSSFSTSS
:: .: ..: .. : . :: : ::. .::.:.. . : ::: :.::
NP_001 MPRAPKRQRCMPEEDLQSQSETQGLEGAQAPLAVEEDASSSTSTSSSFPSSFPSSSSSSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 S----LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCSSFSWSSFSEE
: :: . ::: . . . :: :::. : .:: : .:. .. .:
NP_001 SSCYPLIPSTPEEVSADDET-PN--------PPQSA-QIACSSP--SVVASLPLDQSDEG
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIK-Y
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NP_001 SSSQKEESPSTLQVLPDSESLPRSEIDEKVTDLVQFLLFKYQMKEPITKAEILESVIRNY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPD-HFCVFANTVGLTDEG--SDDEGMPENSLLI
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NP_001 EDHFPLLFSEASECMLLVFGIDVKEVDPTGHSFVLVTSLGLTYDGMLSDVQSMPKTGILI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPH
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NP_001 LILSIIFIEGYCTPEEVIWEALNMMGLYDGMEHLIYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTA
:.: ::::::::::.: : ..:.::::.:.. : ::: ::..:::: :::.: : :.
NP_001 SDPARYEFLWGPRAHAEIRKMSLLKFLAKVNGSDPRSFPLWYEEALKDEEERAQDRIATT
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KB7 DDATVMASESLSVMSSNVSFSE
::.:.::: : :. .: :. :
NP_001 DDTTAMASASSSATGS-FSYPE
350 360
>>NP_001238757 (OMIM: 300343) melanoma-associated antige (369 aa)
initn: 854 init1: 614 opt: 983 Z-score: 830.4 bits: 162.3 E(85289): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 983; 47.4% identity (70.7% similar) in 382 aa overlap (1-373:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFS-PSSFSTSS
:: .: ..: .. : . :: : ::. .::.:.. . : ::: :.::
NP_001 MPRAPKRQRCMPEEDLQSQSETQGLEGAQAPLAVEEDASSSTSTSSSFPSSFPSSSSSSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 S----LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCSSFSWSSFSEE
: :: . ::: . . . :: :::. : .:: : .:. .. .:
NP_001 SSCYPLIPSTPEEVSADDET-PN--------PPQSA-QIACSSP--SVVASLPLDQSDEG
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIK-Y
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NP_001 SSSQKEESPSTLQVLPDSESLPRSEIDEKVTDLVQFLLFKYQMKEPITKAEILESVIRNY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPD-HFCVFANTVGLTDEG--SDDEGMPENSLLI
.:.::.....: : : :.::. . :: : : :.....::: .: :: ..::....::
NP_001 EDHFPLLFSEASECMLLVFGIDVKEVDPTGHSFVLVTSLGLTYDGMLSDVQSMPKTGILI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPH
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NP_001 LILSIIFIEGYCTPEEVIWEALNMMGLYDGMEHLIYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTA
:.: ::::::::::.: : ..:.::::.:.. : ::: ::..:::: :::.: : :.
NP_001 SDPARYEFLWGPRAHAEIRKMSLLKFLAKVNGSDPRSFPLWYEEALKDEEERAQDRIATT
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KB7 DDATVMASESLSVMSSNVSFSE
::.:.::: : :. .: :. :
NP_001 DDTTAMASASSSATGS-FSYPE
350 360
>>NP_066386 (OMIM: 300343) melanoma-associated antigen 1 (369 aa)
initn: 854 init1: 614 opt: 983 Z-score: 830.4 bits: 162.3 E(85289): 1.6e-39
Smith-Waterman score: 983; 47.4% identity (70.7% similar) in 382 aa overlap (1-373:1-369)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPPVPGVPFRNVDNDSPTSVELEDWVDAQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFS-PSSFSTSS
:: .: ..: .. : . :: : ::. .::.:.. . : ::: :.::
NP_066 MPRAPKRQRCMPEEDLQSQSETQGLEGAQAPLAVEEDASSSTSTSSSFPSSFPSSSSSSS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 S----LILGGPEEEEVPSGVIPNLTESIPSSPPQGPPQGPSQSPLSSCCSSFSWSSFSEE
: :: . ::: . . . :: :::. : .:: : .:. .. .:
NP_066 SSCYPLIPSTPEEVSADDET-PN--------PPQSA-QIACSSP--SVVASLPLDQSDEG
70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDEKVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIK-Y
::::: :. .: : :::::: .::::..::.:::.::. .::.:.::.: ::. :
NP_066 SSSQKEESPSTLQVLPDSESLPRSEIDEKVTDLVQFLLFKYQMKEPITKAEILESVIRNY
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGPD-HFCVFANTVGLTDEG--SDDEGMPENSLLI
.:.::.....: : : :.::. . :: : : :.....::: .: :: ..::....::
NP_066 EDHFPLLFSEASECMLLVFGIDVKEVDPTGHSFVLVTSLGLTYDGMLSDVQSMPKTGILI
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 IILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYAGREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPH
.:::.:::.: :. ::::::.:: .:.: : ::..:::::.:::. ::: .:::::.::
NP_066 LILSIIFIEGYCTPEEVIWEALNMMGLYDGMEHLIYGEPRKLLTQDWVQENYLEYRQVPG
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAKLNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTA
:.: ::::::::::.: : ..:.::::.:.. : ::: ::..:::: :::.: : :.
NP_066 SDPARYEFLWGPRAHAEIRKMSLLKFLAKVNGSDPRSFPLWYEEALKDEEERAQDRIATT
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KB7 DDATVMASESLSVMSSNVSFSE
::.:.::: : :. .: :. :
NP_066 DDTTAMASASSSATGS-FSYPE
350 360
>>NP_002358 (OMIM: 300153) melanoma-associated antigen B (346 aa)
initn: 758 init1: 511 opt: 822 Z-score: 696.9 bits: 137.5 E(85289): 4.4e-32
Smith-Waterman score: 822; 43.8% identity (72.7% similar) in 322 aa overlap (58-370:22-343)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 AQHPTDEEEEEASSASSTLYLVFSPSSFSTSSSLILGGP---EEEEVPSGVIPNLTESIP
...: .: : :.:: ::. : ..
NP_002 MPRGQKSKLRAREKRQRTRGQTQDLKVGQPTAAEKEESPSSSSSVLRDTAS
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 SSPPQGPPQGPS-QSPLSSCCSSFSWSSFSEESSSQKGEDTGTCQGLPDSESSFTYTLDE
:: : :: :. . : .: ...: .. .. . :: :.... :. ..: :. .: .
NP_002 SSLAFGIPQEPQREPPTTSAAAAMSCTGSDKGDESQDEENASSSQASTSTERSLKDSLTR
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 KVAELVEFLLLKYEAEEPVTEAEMLMIVIK-YKDYFPVILKRAREFMELLFGLALIEVGP
:. ::.::: ::. .::.:.:::: :. : ::..:: :.... . ::.::::: ::.:
NP_002 KTKMLVQFLLYKYKMKEPTTKAEMLKIISKKYKEHFPEIFRKVSQRTELVFGLALKEVNP
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 D-HFCVFANTVGLTD-EGSDDEGMPENSLLIIILSVIFIKGNCASEEVIWEVLNAVGVYA
: .... .: .: . :. .:.:.::. .:::::..:::: :: ::: :: .:.:
NP_002 TTHSYILVSMLGPNDGNQSSAWTLPRNGLLMPLLSVIFLNGNCAREEEIWEFLNMLGIYD
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 GREHFVYGEPRELLTKVWVQGHYLEYREVPHSSPPYYEFLWGPRAHSESIKKKVLEFLAK
:..:...::::.:.:. :: .::::..::.:.:: :.::::::::.:. : ::::::::
NP_002 GKRHLIFGEPRKLITQDLVQEKYLEYQQVPNSDPPRYQFLWGPRAHAETSKMKVLEFLAK
240 250 260 270 280 290
330 340 350 360 370
pF1KB7 LNNTVPSSFPSWYKDALKDVEERVQATIDTAD--DATVMASESLSVMSSNVSFSE
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NP_002 VNDTTPNNFPLLYEEALRDEEERAGARPRVAARRGTTAMTSAYSRATSSSSSQPM
300 310 320 330 340
373 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:23:16 2016 done: Fri Nov 4 05:23:18 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]