FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7166, 396 aa 1>>>pF1KB7166 396 - 396 aa - 396 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6148+/-0.000793; mu= 16.8151+/- 0.048 mean_var=86.0552+/-16.614, 0's: 0 Z-trim(109.4): 24 B-trim: 0 in 0/53 Lambda= 0.138257 statistics sampled from 10865 (10886) to 10865 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.704), E-opt: 0.2 (0.334), width: 16 Scan time: 2.790 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17 ( 396) 2689 546.0 2.3e-155 CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1 ( 439) 663 141.9 1.1e-33 CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1 ( 433) 464 102.2 9.6e-22 CCDS9289.1 GJA3 gene_id:2700|Hs108|chr13 ( 435) 462 101.8 1.3e-21 CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1 ( 358) 449 99.1 6.6e-21 CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1 ( 333) 438 96.9 2.8e-20 CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6 ( 543) 438 97.1 4.2e-20 CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1 ( 515) 432 95.9 9.2e-20 CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15 ( 321) 416 92.5 5.8e-19 CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6 ( 382) 405 90.4 3e-18 CCDS34697.1 GJC3 gene_id:349149|Hs108|chr7 ( 279) 388 86.9 2.5e-17 CCDS14408.1 GJB1 gene_id:2705|Hs108|chrX ( 283) 386 86.5 3.3e-17 CCDS58547.1 GJD3 gene_id:125111|Hs108|chr17 ( 294) 384 86.1 4.5e-17 CCDS9290.1 GJB2 gene_id:2706|Hs108|chr13 ( 226) 377 84.6 9.7e-17 CCDS383.1 GJB4 gene_id:127534|Hs108|chr1 ( 266) 374 84.1 1.7e-16 CCDS9291.1 GJB6 gene_id:10804|Hs108|chr13 ( 261) 369 83.1 3.3e-16 CCDS5008.1 GJB7 gene_id:375519|Hs108|chr6 ( 223) 354 80.0 2.3e-15 CCDS382.1 GJB5 gene_id:2709|Hs108|chr1 ( 273) 343 77.9 1.2e-14 CCDS384.1 GJB3 gene_id:2707|Hs108|chr1 ( 270) 342 77.7 1.4e-14 CCDS7191.1 GJD4 gene_id:219770|Hs108|chr10 ( 370) 327 74.8 1.4e-13 >>CCDS11487.1 GJC1 gene_id:10052|Hs108|chr17 (396 aa) initn: 2689 init1: 2689 opt: 2689 Z-score: 2902.9 bits: 546.0 E(32554): 2.3e-155 Smith-Waterman score: 2689; 100.0% identity (100.0% similar) in 396 aa overlap (1-396:1-396) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPGC :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPGC 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 ENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAMR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 ENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAMR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 WKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVLQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 WKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVLQ 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 LLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVTG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 LLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVTG 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 LCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELEDPGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVKPDQIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 LCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELEDPGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVKPDQIQ 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 YTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYSHQN :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 YTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYSHQN 310 320 330 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 NPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI :::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 NPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI 370 380 390 >>CCDS1569.1 GJC2 gene_id:57165|Hs108|chr1 (439 aa) initn: 1211 init1: 631 opt: 663 Z-score: 718.3 bits: 141.9 E(32554): 1.1e-33 Smith-Waterman score: 1174; 46.5% identity (68.8% similar) in 432 aa overlap (1-386:4-431) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQ ::::::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::.:: :::.::.:::.: CCDS15 MTNMSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKVWLTVLVVFRIVLTAVGGEAIYSDEQAKFTCNTRQ 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 PGCENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPY :::.::::::::::::::::::::....::::::::::.:..:. . : ..: : .: CCDS15 PGCDNVCYDAFAPLSHVRFWVFQIVVISTPSVMYLGYAVHRLARASEQER-RRALRRRPG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 AMRWKQ------HRALEETEEDNEEDPMM-YPEMELESDK-------------------- : . : . : . .::.::. : : : . CCDS15 PRRAPRAHLPPPHAGWPEPADLGEEEPMLGLGEEEEEEETGAAEGAGEEAEEAGAEEACT 120 130 140 150 160 170 160 170 180 190 200 pF1KB7 -----ENKEQSQPKP--KHDGRRRIREDGLMKIYVLQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQV ..: . : : .:::::::...:::..:: ::.::..:::.::.:::.::::.: CCDS15 KAVGADGKAAGTPGPTGQHDGRRRIQREGLMRVYVAQLVARAAFEVAFLVGQYLLYGFEV 180 190 200 210 220 230 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 HPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVTGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLN .::. ::: :::: .:::.:::::::.:::.:: :. ::::::. :: :::.:. .:.. CCDS15 RPFFPCSRQPCPHVVDCFVSRPTEKTVFLLVMYVVSCLCLLLNLCEMAHLGLGSAQDAVR 240 250 260 270 280 290 270 280 290 300 310 pF1KB7 SKRRELED-PGAYNYPFTWNTPSA------PPGYNIAVKPDQ---IQYTELSNAKIAYKQ ..: . :. : :.: :: :...:. . . .:.: . . CCDS15 GRRGPPASAPAPAPRPPPCAFPAAAAGLACPPDYSLVVRAAERARAHDQNLANLALQALR 300 310 320 330 340 350 320 330 340 350 360 370 pF1KB7 NKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYS--HQNNPHGPREKKAK . : ...... .: .::: .. : :. : :..: . .:. : : .:. . CCDS15 DGAAAGDRDRDSSPCVGLPAASRGPPRAGAPAS-RTGSATSAGTVGEQGRP-GTHERPG- 360 370 380 390 400 410 380 390 pF1KB7 VGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI . .:::.:..:::. CCDS15 AKPRAGSEKGSASSRDGKTTVWI 420 430 >>CCDS30834.1 GJA8 gene_id:2703|Hs108|chr1 (433 aa) initn: 817 init1: 454 opt: 464 Z-score: 503.9 bits: 102.2 E(32554): 9.6e-22 Smith-Waterman score: 799; 44.6% identity (72.3% similar) in 271 aa overlap (3-272:4-243) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG :::: .:::...::: .:..:::::..:::.. ....: .. :::: :::::.::: CCDS30 MGDWSFLGNILEEVNEHSTVIGRVWLTVLFIFRILILGTAAEFVWGDEQSDFVCNTQQPG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM ::::::: :.::.:.::.:::.:.:::.::.:.:.: . .:: .:. .: CCDS30 CENVCYDEAFPISHIRLWVLQIIFVSTPSLMYVGHAVHYV-RME----EKRKSR------ 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDG-LMKIYV : : .. :.. :..: : : ...: .: :.. :. 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CCDS92 GFPPYYAHTAAPLGQARAVGYPGAPPPAADFKLLALTEARGKGQSAKLYNGHHHLLMTE- 270 280 290 300 310 320 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 EALQREIRMAQERLDLAVQAYSHQNNPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVW : .: :: :..:: ..: .: . :::.. CCDS92 ---QNWANQAAERQPPALKAYPAASTPAAP----SPVGSSSPPLAHEAEAGAAPLLLDGS 330 340 350 360 370 pF1KB7 I CCDS92 GSSLEGSALAGTPEEEEQAVTTAAQMHQPPLPLGDPGRASKASRASSGRARPEDLAI 380 390 400 410 420 430 >>CCDS929.1 GJA5 gene_id:2702|Hs108|chr1 (358 aa) initn: 759 init1: 436 opt: 449 Z-score: 488.8 bits: 99.1 E(32554): 6.6e-21 Smith-Waterman score: 779; 36.0% identity (64.5% similar) in 386 aa overlap (3-379:4-354) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG :::: .:::.:.::: :::.:::::..::... ....:: . :::. : :.: ::: CCDS92 MGDWSFLGNFLEEVHKHSTVVGKVWLTVLFIFRMLVLGTAAESSWGDEQADFRCDTIQPG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM :.::::: :.::.:.::.:::.:.:::..:.:.:.: . .:.. . ..: :.: CCDS92 CQNVCYDQAFPISHIRYWVLQIIFVSTPSLVYMGHAMHTV-RMQEKRKLREAERAK---- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDG-LMKIYV : . : :. :... . ..: :: .: :.. :: CCDS92 --------EVRGSGSYEYPVA-------------EKAELSCWEEGNGRIALQGTLLNTYV 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 LQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGV ..: ::..::::..::::.::. . ..:: : :::: ..:..::::::..:...: .: CCDS92 CSILIRTTMEVGFIVGQYFIYGIFLTTLHVCRRSPCPHPVNCYVSRPTEKNVFIVFMLAV 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 TGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELED---PGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVK ..: :::.. :. :::. ::. . . :... : :: :: .: .. CCDS92 AALSLLLSLAELYHLGWKKIRQRFVKPRQHMAKCQLSGPSVGIVQSCTP--PPDFNQCLE 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 --PDQIQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAV : .. .:: ..: .:: : . :: : .:. :.. ..:..: . .. CCDS92 NGPGGKFFNPFSN-NMASQQNTDNLVTEQVRG--QEQTPGEGFI---QVRYGQ-KPEVPN 280 290 300 310 320 360 370 380 390 pF1KB7 QAYSHQNNPHG---PREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI . . ::: ... .:..::: :. CCDS92 GVSPGHRLPHGYHSDKRRLSKASSKARSDDLSV 330 340 350 >>CCDS30669.1 GJA4 gene_id:2701|Hs108|chr1 (333 aa) initn: 796 init1: 433 opt: 438 Z-score: 477.4 bits: 96.9 E(32554): 2.8e-20 Smith-Waterman score: 751; 38.0% identity (66.5% similar) in 334 aa overlap (3-334:4-310) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG :.:: .::.....::: :::::::::..:::.. ...:::.. :::: : ::: ::: CCDS30 MGDWGFLEKLLDQVQEHSTVVGKIWLTVLFIFRILILGLAGESVWGDEQSDFECNTAQPG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM : ::::: :.::.:.::.:...:.::...:::..:. ... :. .:.. CCDS30 CTNVCYDQAFPISHIRYWVLQFLFVSTPTLVYLGHVIY-LSRREERLRQKEG-------- 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVL . ::: : :..: ...... . .::: ::: .:: :: CCDS30 ---ELRAL----------PAKDPQVERALAAVERQMAKISVAEDGRLRIR-GALMGTYVA 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVT ..: ..:.:.::: ::. :::. ..: .::.: :::. .:::.:::::::::...: : CCDS30 SVLCKSVLEAGFLYGQWRLYGWTMEPVFVCQRAPCPYLVDCFVSRPTEKTIFIIFMLVVG 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 GLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRELEDP--GAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVKPD . :.::. :..:: . .. ... . : :. . :.: .. : . .: CCDS30 LISLVLNLLELVHLLCRCLSRGMRARQGQDAPPTQGTSSDPYTDQVFFYLPVGQGPSSPP 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 QIQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQAYS :. ::... :: :: . :.. .: . : : CCDS30 CPTYNGLSSSE----QNWANLTTEERLASSRPPLFLDPPPQNGQKPPSRPSSSASKKQYV 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 pF1KB7 HQNNPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI >>CCDS5025.1 GJA10 gene_id:84694|Hs108|chr6 (543 aa) initn: 800 init1: 416 opt: 438 Z-score: 474.5 bits: 97.1 E(32554): 4.2e-20 Smith-Waterman score: 807; 36.8% identity (66.1% similar) in 389 aa overlap (3-385:4-357) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG :..: .:::.:.:::.:::::::.:..::... :..:... :::: :.:::.::: CCDS50 MGDWNLLGGILEEVHSHSTIVGKIWLTILFIFRMLVLRVAAEDVWDDEQSAFACNTRQPG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM :.:.::: :.: .::::.:::.:..::..:.:.:.... .:. :.. CCDS50 CNNICYDDAFPISLIRFWVLQIIFVSSPSLVYMGHALYRLRAFEK---DRQ--------- 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 RWKQH-RALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDG-LMKIY : :.: :: . :.: . : . . :.: .. . : : .. : :.. : CCDS50 RKKSHLRA-------QMENPDLDLEEQQRIDRELRRLEEQKRIH----KVPLKGCLLRTY 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VLQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYG ::..:.:.:.::::.::::.:::::.::.: :.. :::. .:::.:::::::::.:.:.. CCDS50 VLHILTRSVLEVGFMIGQYILYGFQMHPLYKCTQPPCPNAVDCFVSRPTEKTIFMLFMHS 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 VTGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRRE--LEDPGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIAVK .... ::::: :..:::. : .: .: .:: . :: . :. : . CCDS50 IAAISLLLNILEIFHLGIRKIMRTLYKKSSSEGIEDETGP--PFHLKKYSVAQQCMICSS 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 -PDQIQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAVQ :..:. . .: . . . : .. : .: . : :. .. . : . . CCDS50 LPERISPLQANNQQQVIRVNVPKSKTMWQ-------IP---QPRQLEVDPSNGKKDWSEK 280 290 300 310 320 360 370 380 390 pF1KB7 -AYSHQNNPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI .: : . :.: ...:.. ...: :: CCDS50 DQHSGQLHVHSPCPWAGSAGNQHLGQQSDHSSFGLQNTMSQSWLGTTTAPRNCPSFAVGT 330 340 350 360 370 380 CCDS50 WEQSQDPEPSGEPLTDLHSHCRDSEGSMRESGVWIDRSRPGSRKASFLSRLLSEKRHLHS 390 400 410 420 430 440 >>CCDS432.1 GJA9 gene_id:81025|Hs108|chr1 (515 aa) initn: 759 init1: 415 opt: 432 Z-score: 468.3 bits: 95.9 E(32554): 9.2e-20 Smith-Waterman score: 765; 33.2% identity (64.0% similar) in 397 aa overlap (3-393:4-378) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG :..: :::.: :::..::::::.:..::... .:..:... :::: :.::::::: CCDS43 MGDWNLLGDTLEEVHIHSTMIGKIWLTILFIFRMLVLGVAAEDVWNDEQSGFICNTEQPG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM :.::::: :.: .:.::.:.:.:..::..:.:.:.... .:. :.. : CCDS43 CRNVCYDQAFPISLIRYWVLQVIFVSSPSLVYMGHALYRLRVLEE-------ERQR---M 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVL . . . :::.: :: . . ..: : . .. .. .: :. ::. CCDS43 KAQLRVELEEVEF----------EMPRDRRRLEQELCQLEKRKLNKAPLR-GTLLCTYVI 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVT ....:.: ::::.::::.::::...:.. : :::. ::::.:::::::::::.: ... CCDS43 HIFTRSVVEVGFMIGQYLLYGFHLEPLFKCHGHPCPNIIDCFVSRPTEKTIFLLFMQSIA 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 GLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRR------ELEDPGAYNYPFTWNTPSAPPGYNIA . :.::: :..:::: :. .: .: . :.. : . ... :: . CCDS43 TISLFLNILEIFHLGFKKIKRGLWGKYKLKKEHNEFHANKAKQNVAKYQSTSANSLKRLP 220 230 240 250 260 270 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VKPDQIQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADLEALQREIRMAQERLDLAV :: .: .. .: . ..... . . .: : . :. . ...: :.. CCDS43 SAPDYNLLVEKQTHTAVYPSLNSSSVFQPNPDNHSVNDEKCILDEQETV-LSNEISTLST 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 pF1KB7 QAYSHQNNPHGPREKKAKVGSKAGSNKSTASSKSGDGKTSVWI . :. . . :. .: .... .. .:: : CCDS43 SCSHFQHISSNNNKDTHKIFGKELNGNQLMEKRETEGKDSKRNYYSRGHRSIPGVAIDGE 340 350 360 370 380 390 CCDS43 NNMRQSPQTVFSLPANCDWKPRWLRATWGSSTEHENRGSPPKGNLKGQFRKGTVRTLPPS 400 410 420 430 440 450 >>CCDS10040.1 GJD2 gene_id:57369|Hs108|chr15 (321 aa) initn: 680 init1: 385 opt: 416 Z-score: 453.9 bits: 92.5 E(32554): 5.8e-19 Smith-Waterman score: 737; 36.7% identity (70.3% similar) in 300 aa overlap (3-278:4-303) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSWSFLTRLLEE-IHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQP :..: :::: ...:::..:.: :::...:::...:. ::..: :::. ::::: :: CCDS10 MGEWTILERLLEAAVQQHSTMIGRILLTVVVIFRILIVAIVGETVYDDEQTMFVCNTLQP 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 GCENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADK---KAARSK ::...::: :.::.:.::::::.: :::. .. :..:. ::... . . :. CCDS10 GCNQACYDRAFPISHIRYWVFQIIMVCTPSLCFITYSVHQSAKQRERRYSTVFLALDRDP 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 pF1KB7 PYAMRWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEME---LESDKENKEQSQPK--------PKHDG : .. . . ..:: . . :.. ........: :. .: CCDS10 PESIGGPGGTGGGGSGGGKREDKKLQNAIVNGVLQNTENTSKETEPDCLEVKELTPHPSG 130 140 150 160 170 180 170 180 190 200 210 pF1KB7 RRRI------REDGLMKIYVLQLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKI : :..:. ..:..:.. :...:.:::.::::::::.: .: :.: :: ... CCDS10 LRTASKSKLRRQEGISRFYIIQVVFRNALEIGFLVGQYFLYGFSVPGLYECNRYPCIKEV 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 DCFISRPTEKTIFLLIMYGVTGLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSL---NSKRRELEDPGAY .:..:::::::.::..:..:.:.:..::. :. :::. :. .. ..::. . . CCDS10 ECYVSRPTEKTVFLVFMFAVSGICVVLNLAELNHLGWRKIKLAVRGAQAKRKSIYEIRNK 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 NYPFTWNTPSAPPGYNIAVKPDQIQYTELSNAKIAYKQNKANTAQEQQYGSHEENLPADL . : CCDS10 DLPRVSVPNFGRTQSSDSAYV 310 320 >>CCDS5123.1 GJA1 gene_id:2697|Hs108|chr6 (382 aa) initn: 766 init1: 396 opt: 405 Z-score: 441.0 bits: 90.4 E(32554): 3e-18 Smith-Waterman score: 738; 37.0% identity (66.3% similar) in 338 aa overlap (3-322:4-317) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MSWSFLTRLLEEIHNHSTFVGKIWLTVLIVFRIVLTAVGGESIYYDEQSKFVCNTEQPG :: : .::.... .:: ::.::.::..:::.: ... :: . :::: : :::.::: CCDS51 MGDWSALGKLLDKVQAYSTAGGKVWLSVLFIFRILLLGTAVESAWGDEQSAFRCNTQQPG 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 CENVCYDAFAPLSHVRFWVFQIILVATPSVMYLGYAIHKIAKMEHGEADKKAARSKPYAM ::::::: :.:::::::.:::.:..:...::..... . : :. . CCDS51 CENVCYDKSFPISHVRFWVLQIIFVSVPTLLYLAHVFYVMRKEEKLN------------- 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 RWKQHRALEETEEDNEEDPMMYPEMELESDKENKEQSQPKPKHDGRRRIREDGLMKIYVL :... :. .. :. . : ..:... : . :. : :. ..: ::.. :.. CCDS51 --KKEEELKVAQTDGVNVDMHLKQIEIKKFKYGIEE------H-GKVKMR-GGLLRTYII 110 120 130 140 150 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QLLARTVFEVGFLIGQYFLYGFQVHPFYVCSRLPCPHKIDCFISRPTEKTIFLLIMYGVT ..: ...:::.::. :...:::.. :.:.: ::::..:::.:::::::::...: :. CCDS51 SILFKSIFEVAFLLIQWYIYGFSLSAVYTCKRDPCPHQVDCFLSRPTEKTIFIIFMLVVS 160 170 180 190 200 210 240 250 260 270 280 pF1KB7 GLCLLLNIWEMLHLGFGTIRDSLNSKRREL----------EDPGAYNY--------PFTW . : ::: :.... : ..: ...: .: :. .: : . 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