FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7178, 426 aa 1>>>pF1KB7178 426 - 426 aa - 426 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7012+/-0.00127; mu= 9.2128+/- 0.075 mean_var=114.9949+/-22.857, 0's: 0 Z-trim(103.9): 166 B-trim: 107 in 1/50 Lambda= 0.119601 statistics sampled from 7447 (7648) to 7447 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.593), E-opt: 0.2 (0.235), width: 16 Scan time: 2.700 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS5641.1 ASB4 gene_id:51666|Hs108|chr7 ( 426) 2925 516.5 1.9e-146 CCDS5642.1 ASB4 gene_id:51666|Hs108|chr7 ( 349) 2218 394.5 8.7e-110 CCDS46548.1 ASB18 gene_id:401036|Hs108|chr2 ( 466) 847 158.0 1.8e-38 CCDS5921.2 ASB10 gene_id:136371|Hs108|chr7 ( 452) 741 139.7 5.6e-33 CCDS47750.2 ASB10 gene_id:136371|Hs108|chr7 ( 467) 726 137.1 3.5e-32 CCDS11478.1 ASB16 gene_id:92591|Hs108|chr17 ( 453) 564 109.1 8.8e-24 CCDS47749.2 ASB10 gene_id:136371|Hs108|chr7 ( 429) 496 97.4 2.9e-20 >>CCDS5641.1 ASB4 gene_id:51666|Hs108|chr7 (426 aa) initn: 2925 init1: 2925 opt: 2925 Z-score: 2742.5 bits: 516.5 E(32554): 1.9e-146 Smith-Waterman score: 2925; 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CCDS59 ACRIWRPHSRPAWEPPRPSPLLCQDMALQNALYTGDLARLQELFPPHST-ADLLLESRAA 30 40 50 60 70 80 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 NMVLASYKQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFGHVECLLVLLDHNATINCRPNGKTPLHV . .:...: : .:. . . : ::... ::.: : .:: . : . :.:.: :: CCDS59 EPRWSSHQRGLWSLTYEEELT--TPLHVAASRGHTEVLRLLLRRRARPDSAPGGRTALHE 90 100 110 120 130 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 ACEMANVDCVKILCDRGAKLNCYSLSGHTALHFCTTPSSILCAKQLVWRGANVNMKTNNQ :: ... ::..: :: : . .:. ::.: :... ::. :. :: :. ... . CCDS59 ACAAGHTACVHVLLVAGADPNIADQDGKRPLHLCRGPGTLECAELLLRFGARVDGRSE-E 140 150 160 170 180 190 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 DEETPLHTAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNAHMETPLAIAA-YWALRFKEQEYSTEHH .::::::.::..: ::. . ...:: :. ::. ::: : . . : .: . CCDS59 EEETPLHVAARLGHVELADLLLRRGACPDARNAEGWTPLLAACDVRCQSITDAEATTARC 200 210 220 230 240 250 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 L-VCRMLLDYKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCDHVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQY : .: .::. :...: :.: . ::: : ......: :. :: :: .: . .. CCDS59 LQLCSLLLSAGADADAADQDKQRPLHLACRRGHAAVVELLLSCGVSANTMDYGGHTPLHC 260 270 280 290 300 310 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 VLKVTSVRPAAQPEICYQLLLNHGAARIYPPQFHKVIQACHSCPKAIEVVVNAYEHIRWN .:. .. : .:: . ::::::.:..: . ::.. .::..:::..:.: .. CCDS59 ALQGPAAALAQSPEHVVRALLNHGAVRVWPGALPKVLERWSTCPRTIEVLMNTYSVVQLP 320 330 340 350 360 370 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 TKWRRAIPDDDLEKYWDFYHSLFTVCCNSPRTLMHLSRCAIRRTLHNRCHRAIPLLSLPL . . . :.:. :: :::.. .::.:.::::::.: :.. .:.: : :: CCDS59 EEAVGLVTPETLQKHQRFYSSLFALV-RQPRSLQHLSRCALRSHLEGSLPQALPRLPLPP 380 390 400 410 420 430 420 pF1KB7 SLKKYLLLEPEGIIY : .:: :. ::..: CCDS59 RLLRYLQLDFEGVLY 440 450 >>CCDS47750.2 ASB10 gene_id:136371|Hs108|chr7 (467 aa) initn: 624 init1: 265 opt: 726 Z-score: 691.3 bits: 137.1 E(32554): 3.5e-32 Smith-Waterman score: 731; 33.1% identity (61.8% similar) in 432 aa overlap (10-426:40-467) 10 20 30 pF1KB7 MDGTTAPVTKSGAAKLVKRN-------FLEALKSNDFGK ::: . .: :. : .:. ..: : CCDS47 CKGQGEPLDDRHPLCARLVEKPSRGSEEHLKSGPGPIVTRTASGPALAFWQAVLAGDVGC 10 20 30 40 50 60 40 50 60 70 80 pF1KB7 LKAILIQRQIDV--DTVFEVED----ENMVLASYKQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFG .. :: . . . :.::.. : ... . : .:. . . : ::... : CCDS47 VSRILADSSTGLAPDSVFDTSDPERWRDFRFNIRALRLWSLTYEEELT--TPLHVAASRG 70 80 90 100 110 120 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 HVECLLVLLDHNATINCRPNGKTPLHVACEMANVDCVKILCDRGAKLNCYSLSGHTALHF :.: : .:: . : . :.:.: :: :: ... ::..: :: : . .:. ::. CCDS47 HTEVLRLLLRRRARPDSAPGGRTALHEACAAGHTACVHVLLVAGADPNIADQDGKRPLHL 130 140 150 160 170 180 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 CTTPSSILCAKQLVWRGANVNMKTNNQDEETPLHTAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNA : :... ::. :. :: :. ... ..::::::.::..: ::. . ...:: :. :: CCDS47 CRGPGTLECAELLLRFGARVDGRSE-EEEETPLHVAARLGHVELADLLLRRGACPDARNA 190 200 210 220 230 240 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 HMETPLAIAA-YWALRFKEQEYSTEHHL-VCRMLLDYKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCD . ::: : . . : .: . : .: .::. :...: :.: . ::: : CCDS47 EGWTPLLAACDVRCQSITDAEATTARCLQLCSLLLSAGADADAADQDKQRPLHLACRRGH 250 260 270 280 290 300 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 HVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQYVLKVTSVRPAAQPEICYQLLLNHGAARIYPPQF ......: :. :: :: .: . .. .:. .. : .:: . ::::::.:..: . CCDS47 AAVVELLLSCGVSANTMDYGGHTPLHCALQGPAAALAQSPEHVVRALLNHGAVRVWPGAL 310 320 330 340 350 360 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 HKVIQACHSCPKAIEVVVNAYEHIRWNTKWRRAIPDDDLEKYWDFYHSLFTVCCNSPRTL ::.. .::..:::..:.: .. . . . :.:. :: :::.. .::.: CCDS47 PKVLERWSTCPRTIEVLMNTYSVVQLPEEAVGLVTPETLQKHQRFYSSLFALV-RQPRSL 370 380 390 400 410 420 390 400 410 420 pF1KB7 MHLSRCAIRRTLHNRCHRAIPLLSLPLSLKKYLLLEPEGIIY .::::::.: :.. .:.: : :: : .:: :. ::..: CCDS47 QHLSRCALRSHLEGSLPQALPRLPLPPRLLRYLQLDFEGVLY 430 440 450 460 >>CCDS11478.1 ASB16 gene_id:92591|Hs108|chr17 (453 aa) initn: 599 init1: 221 opt: 564 Z-score: 540.4 bits: 109.1 E(32554): 8.8e-24 Smith-Waterman score: 689; 33.8% identity (62.7% similar) in 405 aa overlap (23-425:63-452) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MDGTTAPVTKSGAAKLVKRNFLEALKSNDFGKLKAILIQRQIDVDTVFEVED .:: :... ...: :.: . .. . :. . CCDS11 AQQCRSRRCPSSPRARLTRPHRSCRDPAVHQALFSGNLQQVQA-LFQDEEAANMIVETVS 40 50 60 70 80 90 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 ENMVLASYKQGYWLPSYKLKSSWATGLHLSVLFGHVECLLVLLDHNATINCRPNGKTPLH :.. : .::.:. . : :.. . : ... :...: :. ..: .. : .:.. :: CCDS11 -NQLAWSAEQGFWVLTPKTKQT--APLAIATARGYTDCARHLIRQGAELDARVGGRAALH 100 110 120 130 140 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 VACEMANVDCVKILCDRGAKLNCYSLSGHTALHFCTTPSSILCAKQLVWRGANVNMKTNN :: :. :::..: ::: : . : : ::.:: : :. ::: :. ::.::. .. CCDS11 EACARAQFDCVRLLLTFGAKANVLTEEGTTPLHLCTIPESLQCAKLLLEAGATVNLAAG- 150 160 170 180 190 200 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QDEETPLHTAAHFGLSELVAFYVEHGAIVDSVNAHMETPLAIAAYWALRFKEQEYSTE-H ...:::::.:: :: . ::.:.:::: : ... :: : : : : : . : CCDS11 ESQETPLHVAAARGLEQHVALYLEHGADVGLRTSQGETALNTACAGA----EGPGSCRRH 210 220 230 240 250 260 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 HLVCRMLLDYKAEVNARDDDFKSPLHKAAWNCDHVLMHMMLEAGAEANLMDINGCAAIQY . . : ::. :.. : ..:::.: : : ...:. ::.:.. . : . .. 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