FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7191, 541 aa 1>>>pF1KB7191 541 - 541 aa - 541 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4370+/-0.00111; mu= 12.9753+/- 0.066 mean_var=76.9895+/-15.628, 0's: 0 Z-trim(103.0): 47 B-trim: 50 in 1/49 Lambda= 0.146170 statistics sampled from 7150 (7194) to 7150 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16 Scan time: 2.930 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY ( 541) 3529 754.1 9.5e-218 CCDS35473.1 CDY2B gene_id:203611|Hs108|chrY ( 541) 3529 754.1 9.5e-218 CCDS14802.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 540) 3435 734.3 8.8e-212 CCDS35487.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 540) 3435 734.3 8.8e-212 CCDS35486.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 554) 3376 721.8 5e-208 CCDS14801.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 554) 3376 721.8 5e-208 CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 544) 2295 493.9 2.1e-139 CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 412) 1740 376.8 2.7e-104 CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 ( 506) 1111 244.2 2.8e-64 CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 364) 620 140.6 3e-33 CCDS43420.2 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 394) 620 140.6 3.3e-33 CCDS7681.1 ECHS1 gene_id:1892|Hs108|chr10 ( 290) 312 75.6 8.7e-14 CCDS33014.1 ECH1 gene_id:1891|Hs108|chr19 ( 328) 280 68.9 1.1e-11 CCDS7084.1 ECHDC3 gene_id:79746|Hs108|chr10 ( 303) 276 68.0 1.8e-11 >>CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY (541 aa) initn: 3529 init1: 3529 opt: 3529 Z-score: 4022.8 bits: 754.1 E(32554): 9.5e-218 Smith-Waterman score: 3529; 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97.9% identity (98.9% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-531) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTE 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 KQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDKHHRSKNCKLFAASKNVRR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::: CCDS14 KQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDKHHRSKNRKLFAASKNVRR 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 KAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFKVTE :::: :::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 KAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHK-TVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFKVTE 130 140 150 160 170 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 GKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLAANG :::::::::.:::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 GKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLAANG 180 190 200 210 220 230 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 TTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFTQIVL ::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: :::::::::::::::::: CCDS14 TTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMHFTIRLTESASTYRDIVVKKEDGFTQIVL 240 250 260 270 280 290 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 STRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLRNDRN :::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:: CCDS14 STRSTEKNALNTEVIKEIVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVKHLRNNRN 300 310 320 330 340 350 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 TASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 TASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTT 360 370 380 390 400 410 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 FGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 FGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQI 420 430 440 450 460 470 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 KELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDE ::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS14 KELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKIPLLGYKA 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 F CCDS14 AFPPRKTQNDQRWCP 540 550 >>CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (544 aa) initn: 2148 init1: 1546 opt: 2295 Z-score: 2616.3 bits: 493.9 E(32554): 2.1e-139 Smith-Waterman score: 2295; 63.7% identity (85.5% similar) in 545 aa overlap (1-541:1-544) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MASQE-FEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT :::.: .::: :::::..:.:.:.:::::::::..::::::::::.:::. .::::::.: CCDS44 MASEELYEVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSEDDTWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHT 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDKHHRSKNCKLFAASKNVR ::::. : : :.: ::::.. ::::..:.::.:::. : : :.::: .:::::.. : CCDS44 EKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSPKALVIGKDHESKNSQLFAASQKFR 70 80 90 100 110 120 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 RKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKL--EKLDPIAADQQDTVVFK ...: .::. :::.. .: :. :.: :: . .:.:::. :::::. :.:::. . CCDS44 KNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPE 130 140 150 160 170 180 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 VTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATR-KGIVVLIDPL :. : . : ::::.. . .. ..:::. :. : :::.:::: :. :: ..: : CCDS44 VAAEKPV-GALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDAL 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 AANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFT .:::::...::: : ...:.. :: : ::: :...:..: :::: ::::::.:.:::: CCDS44 TANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFT 240 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 QIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLR .:.:::.:.:.:.:: ::..:. .::..::::::::::.::.:::::::::: ::.:.: CCDS44 HILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLT 300 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 pF1KB7 NDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQT .::. : .:...:.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::.::::::::::: CCDS44 DDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQT 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 pF1KB7 PYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEV :::::::::::::.. :::.:: :::::::..::::::.:::.:::::::: ::::::: CCDS44 PYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEV 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 pF1KB7 MIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVEN :..:::::: : .:::: :::::::.:.:::::::::::::.:::.::::..:::::.. CCDS44 MVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQR 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 KIDEF ::::: CCDS44 KIDEF 540 >>CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (412 aa) initn: 1606 init1: 1546 opt: 1740 Z-score: 1985.9 bits: 376.8 E(32554): 2.7e-104 Smith-Waterman score: 1740; 63.9% identity (85.2% similar) in 413 aa overlap (132-541:1-412) 110 120 130 140 150 160 pF1KB7 KHHRSKNCKLFAASKNVRRKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKL- :.. .: :. :.: :: . .:.:::. CCDS47 MDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSES 10 20 30 170 180 190 200 210 pF1KB7 -EKLDPIAADQQDTVVFKVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASM :::::. :.:::. .:. : . : ::::.. . .. ..:::. :. : :::.: CCDS47 PEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPV-GALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAM 40 50 60 70 80 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 ATGSATR-KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLT ::: :. :: ..: :.:::::...::: : ...:.. :: : ::: :...:..: : CCDS47 ATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQT 90 100 110 120 130 140 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 ESAITYRDIVVKKEDGFTQIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAA ::: ::::::.:.::::.:.:::.:.:.:.:: ::..:. .::..::::::::::.::. CCDS47 ESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAV 150 160 170 180 190 200 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 GSVFCCGLDFGYFVRHLRNDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGAS :::::::::: ::.:.: .::. : .:...:.:::::::::::::.:.::::::::::: CCDS47 GSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGAS 210 220 230 240 250 260 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 ILPLCDLVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREAC ::::::.::::::::::::::::::::::::.. :::.:: :::::::..::::::.::: CCDS47 ILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEAC 270 280 290 300 310 320 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 AKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLR .:::::::: ::::::::..:::::: : .:::: :::::::.:.:::::::::::::. CCDS47 GKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLK 330 340 350 360 370 380 520 530 540 pF1KB7 KIWSSAQGIESMLKYVENKIDEF :::.::::..:::::.. ::::: CCDS47 KIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF 390 400 410 >>CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 (506 aa) initn: 1290 init1: 1068 opt: 1111 Z-score: 1267.5 bits: 244.2 E(32554): 2.8e-64 Smith-Waterman score: 1337; 41.9% identity (70.8% similar) in 544 aa overlap (1-540:1-505) 10 20 30 40 50 pF1KB7 MASQE-FEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT ::: . .::: :::::..:.:. .::.::::: . .::::::.::..::. . .:: . CCDS32 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM 10 20 30 40 50 60 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDK---HHRSKNCKLFAASK :.:.. ... :.. : ::. ... .. :. : .: :.:.. .: : CCDS32 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 pF1KB7 NVRRKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVF . :. .: . . : . :. ::. .: .:. : :....: : CCDS32 KGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPL--KKSQNG---MENGD--AGSEKDERHF 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 KVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPL :. :..: :.. . .. : : .. :: . . : .. 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CCDS32 MLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQD 450 460 470 480 490 500 540 pF1KB7 KIDEF :: : CCDS32 KIYEV >>CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 (364 aa) initn: 612 init1: 553 opt: 620 Z-score: 710.3 bits: 140.6 E(32554): 3e-33 Smith-Waterman score: 620; 33.3% identity (66.4% similar) in 342 aa overlap (197-537:28-361) 170 180 190 200 210 220 pF1KB7 AADQQDTVVFKVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATR : . : ... :..: :. . . . CCDS44 MNRTAMRASQKDFENSMNQVKLLKKDPGNEVKLKLYALYKQ------ATEGPCNMPK 10 20 30 40 50 230 240 250 260 270 280 pF1KB7 KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAIT-YR :. ::. : . . :.:. . : . : .: ... . :. : .. 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