FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7191, 541 aa
1>>>pF1KB7191 541 - 541 aa - 541 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4370+/-0.00111; mu= 12.9753+/- 0.066
mean_var=76.9895+/-15.628, 0's: 0 Z-trim(103.0): 47 B-trim: 50 in 1/49
Lambda= 0.146170
statistics sampled from 7150 (7194) to 7150 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.221), width: 16
Scan time: 2.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY ( 541) 3529 754.1 9.5e-218
CCDS35473.1 CDY2B gene_id:203611|Hs108|chrY ( 541) 3529 754.1 9.5e-218
CCDS14802.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 540) 3435 734.3 8.8e-212
CCDS35487.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 540) 3435 734.3 8.8e-212
CCDS35486.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 554) 3376 721.8 5e-208
CCDS14801.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 554) 3376 721.8 5e-208
CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 544) 2295 493.9 2.1e-139
CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 412) 1740 376.8 2.7e-104
CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 ( 506) 1111 244.2 2.8e-64
CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 364) 620 140.6 3e-33
CCDS43420.2 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 394) 620 140.6 3.3e-33
CCDS7681.1 ECHS1 gene_id:1892|Hs108|chr10 ( 290) 312 75.6 8.7e-14
CCDS33014.1 ECH1 gene_id:1891|Hs108|chr19 ( 328) 280 68.9 1.1e-11
CCDS7084.1 ECHDC3 gene_id:79746|Hs108|chr10 ( 303) 276 68.0 1.8e-11
>>CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY (541 aa)
initn: 3529 init1: 3529 opt: 3529 Z-score: 4022.8 bits: 754.1 E(32554): 9.5e-218
Smith-Waterman score: 3529; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
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CCDS14 KELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDE
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 F
:
CCDS14 F
>>CCDS35473.1 CDY2B gene_id:203611|Hs108|chrY (541 aa)
initn: 3529 init1: 3529 opt: 3529 Z-score: 4022.8 bits: 754.1 E(32554): 9.5e-218
Smith-Waterman score: 3529; 100.0% identity (100.0% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-541)
10 20 30 40 50 60
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CCDS35 TTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFTQIVL
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430 440 450 460 470 480
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CCDS35 KELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDE
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 F
:
CCDS35 F
>>CCDS14802.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY (540 aa)
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Smith-Waterman score: 3435; 98.0% identity (98.9% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-540)
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 KELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDE
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pF1KB7 F
:
CCDS14 F
540
>>CCDS35487.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY (540 aa)
initn: 2462 init1: 2462 opt: 3435 Z-score: 3915.6 bits: 734.3 E(32554): 8.8e-212
Smith-Waterman score: 3435; 98.0% identity (98.9% similar) in 541 aa overlap (1-541:1-540)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTE
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pF1KB7 TTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFTQIVL
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTT
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CCDS35 FGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQI
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pF1KB7 KELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDE
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDE
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 F
:
CCDS35 F
540
>>CCDS35486.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY (554 aa)
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Smith-Waterman score: 3376; 97.9% identity (98.9% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTE
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 KQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDKHHRSKNCKLFAASKNVRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS35 KQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDKHHRSKNRKLFAASKNVRR
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pF1KB7 KAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFKVTE
:::: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHK-TVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFKVTE
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLAANG
:::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLAANG
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 TTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFTQIVL
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS35 TTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMHFTIRLTESASTYRDIVVKKEDGFTQIVL
240 250 260 270 280 290
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pF1KB7 STRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLRNDRN
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
CCDS35 STRSTEKNALNTEVIKEIVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVKHLRNNRN
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pF1KB7 TASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTT
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pF1KB7 FGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQI
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pF1KB7 KELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDE
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKIPLLGYKA
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pF1KB7 F
CCDS35 AFPPRKTQNDQRWCP
540 550
>>CCDS14801.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY (554 aa)
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Smith-Waterman score: 3376; 97.9% identity (98.9% similar) in 532 aa overlap (1-532:1-531)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 KQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDKHHRSKNCKLFAASKNVRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::
CCDS14 KQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDKHHRSKNRKLFAASKNVRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFKVTE
:::: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHK-TVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVFKVTE
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLAANG
:::::::::.:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPLAANG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFTQIVL
::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS14 TTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMHFTIRLTESASTYRDIVVKKEDGFTQIVL
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 STRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLRNDRN
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::
CCDS14 STRSTEKNALNTEVIKEIVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVKHLRNNRN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 TASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 TASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTT
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 FGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQI
420 430 440 450 460 470
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pF1KB7 KELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDE
::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKIPLLGYKA
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 F
CCDS14 AFPPRKTQNDQRWCP
540 550
>>CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (544 aa)
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Smith-Waterman score: 2295; 63.7% identity (85.5% similar) in 545 aa overlap (1-541:1-544)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MASQE-FEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
:::.: .::: :::::..:.:.:.:::::::::..::::::::::.:::. .::::::.:
CCDS44 MASEELYEVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSEDDTWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHT
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDKHHRSKNCKLFAASKNVR
::::. : : :.: ::::.. ::::..:.::.:::. : : :.::: .:::::.. :
CCDS44 EKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSPKALVIGKDHESKNSQLFAASQKFR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKL--EKLDPIAADQQDTVVFK
...: .::. :::.. .: :. :.: :: . .:.:::. :::::. :.:::. .
CCDS44 KNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPE
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATR-KGIVVLIDPL
:. : . : ::::.. . .. ..:::. :. : :::.:::: :. :: ..: :
CCDS44 VAAEKPV-GALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDAL
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFT
.:::::...::: : ...:.. :: : ::: :...:..: :::: ::::::.:.::::
CCDS44 TANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFT
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLR
.:.:::.:.:.:.:: ::..:. .::..::::::::::.::.:::::::::: ::.:.:
CCDS44 HILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 NDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQT
.::. : .:...:.:::::::::::::.:.:::::::::::::::::.:::::::::::
CCDS44 DDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASILPLCDVVWANEKAWFQT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 PYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEV
:::::::::::::.. :::.:: :::::::..::::::.:::.:::::::: :::::::
CCDS44 PYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEV
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB7 MIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVEN
:..:::::: : .:::: :::::::.:.:::::::::::::.:::.::::..:::::..
CCDS44 MVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQR
480 490 500 510 520 530
540
pF1KB7 KIDEF
:::::
CCDS44 KIDEF
540
>>CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (412 aa)
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Smith-Waterman score: 1740; 63.9% identity (85.2% similar) in 413 aa overlap (132-541:1-412)
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 KHHRSKNCKLFAASKNVRRKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKL-
:.. .: :. :.: :: . .:.:::.
CCDS47 MDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSES
10 20 30
170 180 190 200 210
pF1KB7 -EKLDPIAADQQDTVVFKVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASM
:::::. :.:::. .:. : . : ::::.. . .. ..:::. :. : :::.:
CCDS47 PEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPV-GALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAM
40 50 60 70 80
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 ATGSATR-KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLT
::: :. :: ..: :.:::::...::: : ...:.. :: : ::: :...:..: :
CCDS47 ATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQT
90 100 110 120 130 140
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 ESAITYRDIVVKKEDGFTQIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAA
::: ::::::.:.::::.:.:::.:.:.:.:: ::..:. .::..::::::::::.::.
CCDS47 ESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAV
150 160 170 180 190 200
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 GSVFCCGLDFGYFVRHLRNDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGAS
:::::::::: ::.:.: .::. : .:...:.:::::::::::::.:.:::::::::::
CCDS47 GSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGAS
210 220 230 240 250 260
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 ILPLCDLVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREAC
::::::.::::::::::::::::::::::::.. :::.:: :::::::..::::::.:::
CCDS47 ILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEAC
270 280 290 300 310 320
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 AKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLR
.:::::::: ::::::::..:::::: : .:::: :::::::.:.:::::::::::::.
CCDS47 GKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLK
330 340 350 360 370 380
520 530 540
pF1KB7 KIWSSAQGIESMLKYVENKIDEF
:::.::::..:::::.. :::::
CCDS47 KIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
390 400 410
>>CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 (506 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MASQE-FEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQDDTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQT
::: . .::: :::::..:.:. .::.::::: . .::::::.::..::. . .:: .
CCDS32 MASGDLYEVERIVDKRKNKKGKWEYLIRWKGYGSTEDTWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHM
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 EKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSPKTPVTDK---HHRSKNCKLFAASK
:.:.. ... :.. : ::. ... .. :. : .: :.:.. .: :
CCDS32 SKDKRIK---SGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHRPSDPGKSKGTSHKRKRINPPLAKPK
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 NVRRKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVSGFQKLEKLDPIAADQQDTVVF
. :. .: . . : . :. ::. .: .:. : :....: :
CCDS32 KGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSGLQIMPL--KKSQNG---MENGD--AGSEKDERHF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 KVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATRKGIVVLIDPL
:. :..: :.. . .. : : .. :: . . : ..
CCDS32 ----GN---------GSHQPGLDLNDHVGE---QDMGECDVNHATLAENGLGSAL-----
180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFT
.:: ..:. : : .... . : :......: .:: .:::::.::.:::
CCDS32 -TNGGLNLHSPVKRKLEAEKDYV-------FDKRLRYSVRQNESNCRFRDIVVRKEEGFT
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 QIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLR
.:.::......:::. :..::. :: .::.:::::.:.::.::::: :::..:.. .:
CCDS32 HILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLLLSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLS
270 280 290 300 310 320
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pF1KB7 NDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDLVWANEKAWFQT
.:: : .....:..::..::::::::::..::::.:::::::::::.:::.:::::::
CCDS32 SDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALGLGASILPLCDIVWASEKAWFQT
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 PYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEV
::.:. .: :::: :::...: : :::::. ::::::.:::..::::::: ::.:::
CCDS32 PYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTAQEACSRGLVSQVFWPTTFSQEV
390 400 410 420 430 440
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pF1KB7 MIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVEN
:...::.:: .:.:::: : ::: .: ::..::.:: .:...:::..:..:...:...
CCDS32 MLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKECLMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQD
450 460 470 480 490 500
540
pF1KB7 KIDEF
:: :
CCDS32 KIYEV
>>CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 (364 aa)
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170 180 190 200 210 220
pF1KB7 AADQQDTVVFKVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSGSVTASMATGSATR
: . : ... :..: :. . . .
CCDS44 MNRTAMRASQKDFENSMNQVKLLKKDPGNEVKLKLYALYKQ------ATEGPCNMPK
10 20 30 40 50
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMHFTIRLTESAIT-YR
:. ::. : . . :.:. . : . : .: ... . :. : ..
CCDS44 PGVFDLINK-AKWDAWNALGSLPKEAARQNYVDLVSSLSPSLESSSQVEPGTDRKSTGFE
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 DIVVKKEDGFTQIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKLVLFSAAGSVFCCG
.:: .:::.:.:... : .:::.:::. .:.. ::..:. ::: ...... :. . :
CCDS44 TLVVTSEDGITKIMFN-RPKKKNAINTEMYHEIMRALKAASKDDSIITVLTGNGDYYSSG
120 130 140 150 160
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 LDFGYFVRHLRNDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPAIGLGASILPLCDL
:. :. . . . . . ...::. ::.: ::... :::::.:.....: : :
CCDS44 NDLTNFTDIPPGGVEEKAKNNAVLLREFVGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDA
170 180 190 200 210 220
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 VWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKLTAREACAKGLVSQ
:.:...: :.::.. .::::.:::: ::::.:. :.:.:::: :.:::: ::::.:::..
CCDS44 VYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYTFPKIMSPAKATEMLIFGKKLTAGEACAQGLVTE
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 VFLTGTFTQEVMIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANERECEVLRKIWSSAQ
:: .:: .:: ..: .:. .:. : ..: . .:. .: .::.::. : : .
CCDS44 VFPDSTFQKEVWTRLKAFAKLPPNALRISKEVIRKREREKLHAVNAEECNVLQGRWLSDE
290 300 310 320 330 340
530 540
pF1KB7 GIESMLKYVENKIDEF
....... :
CCDS44 CTNAVVNFLSRKSKL
350 360
541 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 05:46:06 2016 done: Fri Nov 4 05:46:07 2016
Total Scan time: 2.930 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]