FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7196, 490 aa
1>>>pF1KB7196 490 - 490 aa - 490 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9666+/-0.000347; mu= 19.9905+/- 0.022
mean_var=63.3940+/-12.671, 0's: 0 Z-trim(114.5): 182 B-trim: 20 in 1/50
Lambda= 0.161083
statistics sampled from 24166 (24354) to 24166 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 9.760
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C ( 490) 3298 775.2 0
XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cyto ( 490) 3044 716.1 5.4e-206
NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C ( 490) 3044 716.1 5.4e-206
NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isof ( 490) 2842 669.2 7.4e-192
NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofo ( 490) 2681 631.8 1.4e-180
NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 2293 541.6 1.7e-153
NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 420) 2293 541.6 1.7e-153
NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 is ( 388) 2125 502.5 8.8e-142
NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precu ( 493) 2023 478.9 1.5e-134
NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Hom ( 494) 1745 414.2 4.1e-115
NP_000765 (OMIM: 124070) cytochrome P450 2F1 precu ( 491) 1732 411.2 3.3e-114
XP_016881874 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 566) 1732 411.3 3.7e-114
NP_000753 (OMIM: 122700,122720,188890,211980) cyto ( 494) 1721 408.7 2e-113
NP_000755 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 494) 1681 399.4 1.2e-110
NP_000758 (OMIM: 123930,614546) cytochrome P450 2B ( 491) 1667 396.1 1.2e-109
XP_011524853 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1509 359.4 1.3e-98
XP_011524854 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 498) 1509 359.4 1.3e-98
XP_016881873 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 573) 1509 359.4 1.5e-98
NP_085125 (OMIM: 611529) cytochrome P450 2S1 precu ( 504) 1443 344.1 5.6e-94
XP_006723113 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 457) 1429 340.8 4.9e-93
XP_011524856 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 434) 1340 320.1 8e-87
NP_085079 (OMIM: 608054) cytochrome P450 2A7 isofo ( 443) 1301 311.0 4.3e-84
XP_005258626 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 422) 1284 307.1 6.4e-83
NP_001122397 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 i ( 431) 1278 305.7 1.7e-82
XP_011524849 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 386) 1272 304.3 4.1e-82
XP_011524848 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 416) 1272 304.3 4.4e-82
NP_000766 (OMIM: 601258) cytochrome P450 2J2 [Homo ( 502) 1240 296.9 8.9e-80
NP_000097 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 2D ( 497) 1193 286.0 1.7e-76
XP_011528270 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 491) 1167 279.9 1.1e-74
XP_011528268 (OMIM: 124030,608902) PREDICTED: cyto ( 502) 1167 279.9 1.1e-74
NP_060251 (OMIM: 615967) cytochrome P450 2W1 precu ( 490) 1135 272.5 1.9e-72
XP_011513742 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 564) 1082 260.2 1.1e-68
XP_011513743 (OMIM: 615967) PREDICTED: cytochrome ( 475) 1081 259.9 1.1e-68
XP_011524855 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 456) 1050 252.7 1.6e-66
NP_078790 (OMIM: 600081,608713) vitamin D 25-hydro ( 501) 1047 252.0 2.8e-66
NP_898898 (OMIM: 610670,615030) cytochrome P450 2U ( 544) 1023 246.5 1.4e-64
XP_011524857 (OMIM: 124070) PREDICTED: cytochrome ( 415) 985 237.6 5.3e-62
XP_011524851 (OMIM: 123930,614546) PREDICTED: cyto ( 294) 972 234.5 3.2e-61
XP_016872679 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 446) 968 233.6 8.6e-61
XP_005252846 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 447) 963 232.5 1.9e-60
XP_005252845 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 453) 963 232.5 2e-60
XP_005262774 (OMIM: 610670,615030) PREDICTED: cyto ( 562) 915 221.4 5.3e-57
XP_016872684 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 867 210.1 8.9e-54
XP_016872683 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 867 210.1 8.9e-54
XP_011518197 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 867 210.1 8.9e-54
XP_011518200 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 867 210.1 8.9e-54
XP_016872681 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 867 210.1 8.9e-54
XP_016872680 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 867 210.1 8.9e-54
XP_016872682 (OMIM: 600081,608713) PREDICTED: vita ( 386) 867 210.1 8.9e-54
NP_001020332 (OMIM: 124030,608902) cytochrome P450 ( 446) 863 209.2 1.9e-53
>>NP_000760 (OMIM: 124020,609535) cytochrome P450 2C19 p (490 aa)
initn: 3298 init1: 3298 opt: 3298 Z-score: 4138.2 bits: 775.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3298; 99.8% identity (100.0% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 PFYQLCFIPV
::::::::::
NP_000 PFYQLCFIPV
490
>>XP_016871247 (OMIM: 122700,601130) PREDICTED: cytochro (490 aa)
initn: 3044 init1: 3044 opt: 3044 Z-score: 3819.2 bits: 716.1 E(85289): 5.4e-206
Smith-Waterman score: 3044; 91.2% identity (97.3% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
:: .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::.
XP_016 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
:::::::::::. .:::::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::::.:
XP_016 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
:::.:::::::::::::::::::::.:.:.::::::::: :::::::::::::::.:::
XP_016 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
.: :::::::::::::.:::.:::::::.::::::.:: ::::::.: ::.::.:::::
XP_016 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::
XP_016 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
:.:::::::::::.:::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::
XP_016 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
::.:::::::::::::::.:: :::::::: ::::::::::.:::.::::::::::::::
XP_016 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 PFYQLCFIPV
::::::::::
XP_016 PFYQLCFIPV
490
>>NP_000762 (OMIM: 122700,601130) cytochrome P450 2C9 pr (490 aa)
initn: 3044 init1: 3044 opt: 3044 Z-score: 3819.2 bits: 716.1 E(85289): 5.4e-206
Smith-Waterman score: 3044; 91.2% identity (97.3% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
:: .::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::: :::.:::::::::.
NP_000 MDSLVVLVLCLSCLLLLSLWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIGIKDISKSLTNLSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
:::::::::::. .:::::::.:::::::::::::::: :::::::::::::::::::.:
NP_000 YGPVFTLYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDLGEEFSGRGIFPLAERANRGFGIVFSNGKKW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
:::.:::::::::::::::::::::.:.:.::::::::: :::::::::::::::.:::
NP_000 IIFHKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIKILSSPWIQICNNFSPIIDYFPGTHNKLLKNVAFM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
.: :::::::::::::.:::.:::::::.::::::.:: ::::::.: ::.::.:::::
NP_000 KSYILEKVKEHQESMDMNNPQDFIDCFLMKMEKEKHNQPSEFTIESLENTAVDLFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::::::::
NP_000 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVIGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEVQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
:.:::::::::::.:::::::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::
NP_000 LLPTSLPHAVTCDIKFRNYLIPKGTTILISLTSVLHDNKEFPNPEMFDPHHFLDEGGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
::.:::::::::::::::.:: :::::::: ::::::::::.:::.::::::::::::::
NP_000 KSKYFMPFSAGKRICVGEALAGMELFLFLTSILQNFNLKSLVDPKNLDTTPVVNGFASVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 PFYQLCFIPV
::::::::::
NP_000 PFYQLCFIPV
490
>>NP_000763 (OMIM: 601131) cytochrome P450 2C18 isoform (490 aa)
initn: 2842 init1: 2842 opt: 2842 Z-score: 3565.5 bits: 669.2 E(85289): 7.4e-192
Smith-Waterman score: 2842; 81.0% identity (96.5% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
::: :.::::::::.:::.::::::::.:: ::::::.::::::.:.::.::::::.::.
NP_000 MDPAVALVLCLSCLFLLSLWRQSSGRGRLPSGPTPLPIIGNILQLDVKDMSKSLTNFSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
::::::.::::. .:::::::.::::::: :::::::: ::.::..:.:.::.:::::::
NP_000 YGPVFTVYFGLKPIVVLHGYEAVKEALIDHGEEFSGRGSFPVAEKVNKGLGILFSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFCLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTNASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
.::. :::::::.:::::::.:::.::.:.::::.:::::..:::.::.:::. .:.:..
NP_000 VIFHDRFDYKDQRFLNLMEKFNENLRILSSPWIQVCNNFPALIDYLPGSHNKIAENFAYI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
.: .::..::::::.:.:. ::::::::::::.::.:::::::.:.:. :..:..:::::
NP_000 KSYVLERIKEHQESLDMNSARDFIDCFLIKMEQEKHNQQSEFTVESLIATVTDMFGAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::.::::::.:::::::::::: :::::::::::::.:::::::::::.:::::
NP_000 TTSTTLRYGLLLLLKYPEVTAKVQEEIECVVGRNRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYID
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
:.::.:::::::::::.::::::::::.::::::::..::::::::::: ::::..::::
NP_000 LLPTNLPHAVTCDVKFKNYLIPKGTTIITSLTSVLHNDKEFPNPEMFDPGHFLDKSGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
::.::::::::::.:.:::::::::::::: ::::::::: .::::.: ::..:.:. ::
NP_000 KSDYFMPFSAGKRMCMGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSQVDPKDIDITPIANAFGRVP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 PFYQLCFIPV
:.::::::::
NP_000 PLYQLCFIPV
490
>>NP_000761 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isoform a (490 aa)
initn: 2681 init1: 2681 opt: 2681 Z-score: 3363.3 bits: 631.8 E(85289): 1.4e-180
Smith-Waterman score: 2681; 78.0% identity (94.3% similar) in 490 aa overlap (1-490:1-490)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNLSKI
:.:::::::::: .::.:.:::: : ::::::::::.:::.::::.::. ::.::.::.
NP_000 MEPFVVLVLCLSFMLLFSLWRQSCRRRKLPPGPTPLPIIGNMLQIDVKDICKSFTNFSKV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 YGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRW
::::::.:::.. .::.::::.::::::: ::::::::. :...: ..:.::. ::::::
NP_000 YGPVFTVYFGMNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPISQRITKGLGIISSNGKRW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
:::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 IIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFM
..::::::::::.::.::...:::.::...::::.::::: .:: :::::::.:::.:.
NP_000 VVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 ESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTE
.: : ::::::: :.:.:::::::::::::::.::.::.:::.::::: :.:::. ::::
NP_000 RSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 TTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYID
::::::::.::::::::::::::::::..:.::.::::::::.:::::::::::.::: :
NP_000 TTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFK
:.::..::::: :.:::::::::::::.. :::::::.::::::..::: ::::..::::
NP_000 LVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 KSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVP
::.::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::. : :.:.:: :..:..:.:
NP_000 KSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB7 PFYQLCFIPV
: ::.:::::
NP_000 PSYQICFIPV
490
>>NP_001185782 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (420 aa)
initn: 2293 init1: 2293 opt: 2293 Z-score: 2876.9 bits: 541.6 E(85289): 1.7e-153
Smith-Waterman score: 2293; 78.9% identity (94.7% similar) in 417 aa overlap (74-490:4-420)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 QIDIKDVSKSLTNLSKIYGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLA
.::.::::.::::::: ::::::::. :..
NP_001 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPIS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ERANRGFGIVFSNGKRWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASP
.: ..:.::. :::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_001 QRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASP
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 CDPTFILGCAPCNVICSIIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTII
:::::::::::::::::..::::::::::.::.::...:::.::...::::.::::: .:
NP_001 CDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 DYFPGTHNKLLKNLAFMESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFT
: :::::::.:::.:. .: : ::::::: :.:.:::::::::::::::.::.::.:::.
NP_001 DCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 IENLVITAADLLGAGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRG
::::: :.:::. ::::::::::::.::::::::::::::::::..:.::.::::::::.
NP_001 IENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRS
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 HMPYTDAVVHEVQRYIDLIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPN
:::::::::::.::: ::.::..::::: :.:::::::::::::.. :::::::.:::::
NP_001 HMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPN
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 PEMFDPRHFLDEGGNFKKSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLID
:..::: ::::..::::::.::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::. :
NP_001 PNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDD
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KB7 PKDLDTTPVVNGFASVPPFYQLCFIPV
:.:.:: :..:..:.:: ::.:::::
NP_001 LKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>NP_001185784 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (420 aa)
initn: 2293 init1: 2293 opt: 2293 Z-score: 2876.9 bits: 541.6 E(85289): 1.7e-153
Smith-Waterman score: 2293; 78.9% identity (94.7% similar) in 417 aa overlap (74-490:4-420)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 QIDIKDVSKSLTNLSKIYGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLA
.::.::::.::::::: ::::::::. :..
NP_001 MNPIVVFHGYEAVKEALIDNGEEFSGRGNSPIS
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 ERANRGFGIVFSNGKRWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASP
.: ..:.::. :::::::::::::: ::::::::::::::::::::.:::::::::::::
NP_001 QRITKGLGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRSIEDRVQEEAHCLVEELRKTKASP
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 CDPTFILGCAPCNVICSIIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTII
:::::::::::::::::..::::::::::.::.::...:::.::...::::.::::: .:
NP_001 CDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKRFNENFRILNSPWIQVCNNFPLLI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 DYFPGTHNKLLKNLAFMESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFT
: :::::::.:::.:. .: : ::::::: :.:.:::::::::::::::.::.::.:::.
NP_001 DCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNPRDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFN
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 IENLVITAADLLGAGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRG
::::: :.:::. ::::::::::::.::::::::::::::::::..:.::.::::::::.
NP_001 IENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVTAKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRS
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 HMPYTDAVVHEVQRYIDLIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPN
:::::::::::.::: ::.::..::::: :.:::::::::::::.. :::::::.:::::
NP_001 HMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYLIPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPN
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 PEMFDPRHFLDEGGNFKKSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLID
:..::: ::::..::::::.::::::::::::.:::::::::::::: :::::::::. :
NP_001 PNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGLARMELFLFLTTILQNFNLKSVDD
340 350 360 370 380 390
470 480 490
pF1KB7 PKDLDTTPVVNGFASVPPFYQLCFIPV
:.:.:: :..:..:.:: ::.:::::
NP_001 LKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
400 410 420
>>NP_001185783 (OMIM: 601129) cytochrome P450 2C8 isofor (388 aa)
initn: 2125 init1: 2125 opt: 2125 Z-score: 2666.4 bits: 502.5 E(85289): 8.8e-142
Smith-Waterman score: 2125; 80.3% identity (95.0% similar) in 380 aa overlap (111-490:9-388)
90 100 110 120 130 140
pF1KB7 EVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNGKRWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRS
::. :::::::::::::: :::::::::::
NP_001 MFLQPIAKGIISSNGKRWKEIRRFSLTTLRNFGMGKRS
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB7 IEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICSIIFQKRFDYKDQQFLNLMEK
:::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::..::::::::::.::.::..
NP_001 IEDRVQEEAHCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNVICSVVFQKRFDYKDQNFLTLMKR
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 LNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNLAFMESDILEKVKEHQESMDINNP
.:::.::...::::.::::: .:: :::::::.:::.:. .: : ::::::: :.:.:::
NP_001 FNENFRILNSPWIQVCNNFPLLIDCFPGTHNKVLKNVALTRSYIREKVKEHQASLDVNNP
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 RDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGAGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVT
::::::::::::.::.::.:::.::::: :.:::. ::::::::::::.:::::::::::
NP_001 RDFIDCFLIKMEQEKDNQKSEFNIENLVGTVADLFVAGTETTSTTLRYGLLLLLKHPEVT
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 AKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQRYIDLIPTSLPHAVTCDVKFRNYL
:::::::..:.::.::::::::.:::::::::::.::: ::.::..::::: :.::::::
NP_001 AKVQEEIDHVIGRHRSPCMQDRSHMPYTDAVVHEIQRYSDLVPTGVPHAVTTDTKFRNYL
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 IPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGGNFKKSNYFMPFSAGKRICVGEGL
:::::::.. :::::::.::::::..::: ::::..::::::.::::::::::::.::::
NP_001 IPKGTTIMALLTSVLHDDKEFPNPNIFDPGHFLDKNGNFKKSDYFMPFSAGKRICAGEGL
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490
pF1KB7 ARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFASVPPFYQLCFIPV
:::::::::: :::::::::. : :.:.:: :..:..:.:: ::.:::::
NP_001 ARMELFLFLTTILQNFNLKSVDDLKNLNTTAVTKGIVSLPPSYQICFIPV
340 350 360 370 380
>>NP_000764 (OMIM: 124040) cytochrome P450 2E1 precursor (493 aa)
initn: 2017 init1: 1648 opt: 2023 Z-score: 2536.8 bits: 478.9 E(85289): 1.5e-134
Smith-Waterman score: 2023; 57.5% identity (85.4% similar) in 485 aa overlap (5-489:8-491)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTNL
:.:.. . :::.:.::: . .::::: :::.:::..:...:.. ::.: :
NP_000 MSALGVTVALLVWAAFLLLVSMWRQVHSSWNLPPGPFPLPIIGNLFQLELKNIPKSFTRL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 SKIYGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSNG
.. .::::::: : .::::.:::..:::::.: .:::::: .: : .:.: ::.:.::
NP_000 AQRFGPVFTLYVGSQRMVVMHGYKAVKEALLDYKDEFSGRGDLP-AFHAHRDRGIIFNNG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 KRWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCNV
::.:::::: ::::.::::.. :.:.:.::. :.: ::::...: ::::..:::::::
NP_000 PTWKDIRRFSLTTLRNYGMGKQGNESRIQREAHFLLEALRKTQGQPFDPTFLIGCAPCNV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 ICSIIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKNL
: .:.:.:.:::.:..:: :: .:::....::::.:. ::::... :.::.: :..::.
NP_000 IADILFRKHFDYNDEKFLRLMYLFNENFHLLSTPWLQLYNNFPSFLHYLPGSHRKVIKNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 AFMESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLGA
: .. . :.::::..:.: : :::. ::.:..:::::.. . .:......:.:::. :
NP_000 AEVKEYVSERVKEHHQSLDPNCPRDLTDCLLVEMEKEKHSAERLYTMDGITVTVADLFFA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQR
:::::::::::.::.:.:.::. :..:::.::.: .: : ..:: .::: ::::::.::
NP_000 GTETTSTTLRYGLLILMKYPEIEEKLHEEIDRVIGPSRIPAIKDRQEMPYMDAVVHEIQR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 YIDLIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEGG
.: :.:..::: .: :. ::.:::::::... .: :::.::.:::.:: : :.:::.:.:
NP_000 FITLVPSNLPHEATRDTIFRGYLIPKGTVVVPTLDSVLYDNQEFPDPEKFKPEHFLNENG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB7 NFKKSNYFMPFSAGKRICVGEGLARMELFLFLTFILQNFNLKSLIDPKDLDTTPVVNGFA
.:: :.:: :::.:::.:.:::::::::::.: :::.:::: :.::::.: .:. ::.
NP_000 KFKYSDYFKPFSTGKRVCAGEGLARMELFLLLCAILQHFNLKPLVDPKDIDLSPIHIGFG
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KB7 SVPPFYQLCFIPV
.:: :.:: ::
NP_000 CIPPRYKLCVIPRS
480 490
>>NP_000757 (OMIM: 608055) cytochrome P450 2A13 [Homo sa (494 aa)
initn: 1740 init1: 1713 opt: 1745 Z-score: 2187.6 bits: 414.2 E(85289): 4.1e-115
Smith-Waterman score: 1745; 51.6% identity (82.3% similar) in 486 aa overlap (4-489:8-493)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MDPFVVLVLCLSCLLLLSIWRQSSGRGKLPPGPTPLPVIGNILQIDIKDVSKSLTN
.:.:. ::. ..:.:.::: ..:::::::::::: ::: ::.. ... .:: .
NP_000 MLASGLLLVTLLACLTVMVLMSVWRQRKSRGKLPPGPTPLPFIGNYLQLNTEQMYNSLMK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 LSKIYGPVFTLYFGLERMVVLHGYEVVKEALIDLGEEFSGRGHFPLAERANRGFGIVFSN
.:. ::::::...: .:.::: :...:::::.: .:::::::. . .:.:..:::
NP_000 ISERYGPVFTIHLGPRRVVVLCGHDAVKEALVDQAEEFSGRGEQATFDWLFKGYGVAFSN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 GKRWKEIRRFSLMTLRNFGMGKRSIEDRVQEEARCLVEELRKTKASPCDPTFILGCAPCN
:.: :..::::. :::.::.:::.::.:.:::: :.. :: :... ::::.:. . :
NP_000 GERAKQLRRFSIATLRGFGVGKRGIEERIQEEAGFLIDALRGTHGANIDPTFFLSRTVSN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 VICSIIFQKRFDYKDQQFLNLMEKLNENIRIVSTPWIQICNNFPTIIDYFPGTHNKLLKN
:: ::.: ::::.:..::.:.. . ......: :. . : ... ..:: ... .:.
NP_000 VISSIVFGDRFDYEDKEFLSLLRMMLGSFQFTATSTGQLYEMFSSVMKHLPGPQQQAFKE
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 LAFMESDILEKVKEHQESMDINNPRDFIDCFLIKMEKEKQNQQSEFTIENLVITAADLLG
: .:. : .::...:...: :.:::::: :::.:..:..: ..:: ..:::.:. .:.
NP_000 LQGLEDFIAKKVEHNQRTLDPNSPRDFIDSFLIRMQEEEKNPNTEFYLKNLVMTTLNLFF
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 AGTETTSTTLRYALLLLLKHPEVTAKVQEEIERVVGRNRSPCMQDRGHMPYTDAVVHEVQ
:::::.::::::..:::.::::: :::.:::.::.:.::.: ..::..::::.::.::.:
NP_000 AGTETVSTTLRYGFLLLMKHPEVEAKVHEEIDRVIGKNRQPKFEDRAKMPYTEAVIHEIQ
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 RYIDLIPTSLPHAVTCDVKFRNYLIPKGTTILTSLTSVLHDNKEFPNPEMFDPRHFLDEG
:. :..: .: : :. :.:::....:::: .. : :::.: . : ::. :.:.::::.
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