Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7198
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7198, 463 aa
1>>>pF1KB7198 463 - 463 aa - 463 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9245+/-0.00081; mu= 20.0553+/- 0.049
mean_var=73.0261+/-15.430, 0's: 0 Z-trim(108.4): 74 B-trim: 1039 in 2/48
Lambda= 0.150084
statistics sampled from 10096 (10174) to 10096 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.678), E-opt: 0.2 (0.313), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 ( 463) 3190 700.1 1.3e-201
CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 ( 477) 1425 317.9 1.4e-86
CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 ( 553) 1281 286.8 3.9e-77
CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 466) 1012 228.5 1.2e-59
CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 ( 430) 1003 226.5 4.3e-59
CCDS5950.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 438) 732 167.8 2e-41
CCDS2127.1 SCTR gene_id:6344|Hs108|chr2 ( 440) 705 162.0 1.2e-39
CCDS58827.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 409) 671 154.6 1.8e-37
CCDS78295.1 VIPR2 gene_id:7434|Hs108|chr7 ( 422) 671 154.6 1.9e-37
CCDS58828.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 416) 661 152.4 8.2e-37
CCDS2698.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 457) 661 152.5 8.8e-37
CCDS55125.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 508) 636 147.1 4.1e-35
CCDS5433.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 468) 635 146.8 4.4e-35
CCDS56481.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 447) 611 141.6 1.6e-33
CCDS2747.1 PTH1R gene_id:5745|Hs108|chr3 ( 593) 557 130.0 6.4e-30
CCDS5432.1 GHRHR gene_id:2692|Hs108|chr7 ( 423) 514 120.6 3.2e-27
CCDS5631.1 CALCR gene_id:799|Hs108|chr7 ( 474) 468 110.7 3.4e-24
CCDS45712.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 444) 467 110.4 3.8e-24
CCDS5429.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 411) 446 105.9 8.4e-23
CCDS58829.1 VIPR1 gene_id:7433|Hs108|chr3 ( 247) 443 105.0 9.1e-23
CCDS58556.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 240) 442 104.8 1e-22
CCDS77049.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 314) 442 104.9 1.3e-22
CCDS45714.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 375) 442 105.0 1.4e-22
CCDS56477.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 397) 442 105.0 1.5e-22
CCDS42350.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 415) 442 105.0 1.5e-22
CCDS56478.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 438) 442 105.0 1.6e-22
CCDS2293.1 CALCRL gene_id:10203|Hs108|chr2 ( 461) 417 99.6 7.1e-21
CCDS56480.1 ADCYAP1R1 gene_id:117|Hs108|chr7 ( 496) 405 97.1 4.6e-20
CCDS2383.1 PTH2R gene_id:5746|Hs108|chr2 ( 550) 383 92.3 1.3e-18
CCDS75576.1 CRHR2 gene_id:1395|Hs108|chr7 ( 387) 380 91.5 1.6e-18
CCDS45713.1 CRHR1 gene_id:1394|Hs108|chr17 ( 401) 315 77.5 2.9e-14
CCDS9272.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 874) 316 78.0 4.4e-14
CCDS81753.1 ADGRD1 gene_id:283383|Hs108|chr12 ( 906) 316 78.0 4.5e-14
>>CCDS4839.1 GLP1R gene_id:2740|Hs108|chr6 (463 aa)
initn: 3190 init1: 3190 opt: 3190 Z-score: 3733.2 bits: 700.1 E(32554): 1.3e-201
Smith-Waterman score: 3190; 100.0% identity (100.0% similar) in 463 aa overlap (1-463:1-463)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDL
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CCDS48 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSSLPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 FCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSSLPW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTRNYIH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTRNYIH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 LNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQYCVAAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQYCVAAN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 YYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 YYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 SNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLTLIPLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLTLIPLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRKSWERW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRKSWERW
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB7 RLEHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 RLEHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
430 440 450 460
>>CCDS54177.1 GCGR gene_id:2642|Hs108|chr17 (477 aa)
initn: 1373 init1: 861 opt: 1425 Z-score: 1667.6 bits: 317.9 E(32554): 1.4e-86
Smith-Waterman score: 1425; 47.5% identity (73.7% similar) in 463 aa overlap (7-456:9-461)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETV-QKWREYRRQCQRSLTEDPPPA
:: : ::::. .:: .... . . .::. : ::...:. :::
CCDS54 MPPCQPQRPLLLLLLLLAC------QPQVPSAQVMDFLFEKWKLYGDQCHHNLSLLPPP-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSS
:.: ::::::.:.:::: .. .:.:::::::: .: . :.. : .: :. . .
CCDS54 TELVCNRTFDKYSCWPDTPANTTANISCPWYLPWHHKVQHRFVFKRCGPDGQWV-RGPRG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLFLY----IIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLH
:::: :.:. . ::. .... .: ..:::::.::..::..: ::: :. .::
CCDS54 QPWRDASQCQMD--GEEIEVQKEVAKMYSSFQVMYTVGYSLSLGALLLALAILGGLSKLH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CTRNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTA-AQQHQWDGLLSYQDSLSCRLVFLL
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CCDS54 CTRNAIHANLFASFVLKASSVLVIDGLLRTRYSQKIGDDLSVSTWLSDGAVAGCRVAAVF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 MQYCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYE
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CCDS54 MQYGIVANYCWLLVEGLYLHNLLGLATLPERSFFSLYLGIGWGAPMLFVVPWAVVKCLFE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 DEGCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLMCKTDIKCRLAKS
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CCDS54 NVQCWTSNDNMGFWWILRFPVFLAILINFFIFVRIVQLLVAKLRARQMHHTDYKFRLAKS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 TLTLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLE
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CCDS54 TLTLIPLLGVHEVVFAFVTDEHAQGTLRSAKLFFDLFLSSFQGLLVAVLYCFLNKEVQSE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KB7 FRKSWERWRL-------EHLHIQRDSSMKPLKCPTSSLSSGATAGSSMYTATCQASCS
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CCDS54 LRRRWHRWRLGKVLWEERNTSNHRASSSPGHGPPSKELQFGRGGGSQDSSAETPLAGGLP
420 430 440 450 460 470
CCDS54 RLAESPF
>>CCDS11150.1 GLP2R gene_id:9340|Hs108|chr17 (553 aa)
initn: 1224 init1: 993 opt: 1281 Z-score: 1498.2 bits: 286.8 E(32554): 3.9e-77
Smith-Waterman score: 1287; 45.0% identity (72.2% similar) in 453 aa overlap (4-449:47-487)
10 20 30
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLW
::: :.:.:: . .. :. :
CCDS11 LLPGVHELPMGIPAPWGTSPLSFHRKCSLWAPGRPFLTLVLLVSIKQV----TGSL--LE
20 30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 ETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPATDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWAS
::..:: .:.. : :.: ..: . .::: :::.:.::: . ::. :.: :: :::: :
CCDS11 ETTRKWAQYKQACLRDLLKEP---SGIFCNGTFDQYVCWPHSSPGN-VSVPCPSYLPWWS
80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 SVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSSLPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLL-FLYIIYTVGY
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CCDS11 EESSGRAYRHCLAQGTWQTIENATDIWQDDSECSENHSFKQNVDRYALLSTLQLMYTVGY
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 ALSFSALVIASAILLGFRHLHCTRNYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQ-Q
..:. .: .: ..:: .:.:::::::::.:::::::::.:.:..::... :: . .
CCDS11 SFSLISLFLALTLLLFLRKLHCTRNYIHMNLFASFILRTLAVLVKDVVFYNSYSKRPDNE
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 HQWDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQYCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVS
. : . :: . : ::: : .:..: :.::: ::::::.::.::: .:: :. .. :.
CCDS11 NGWMSYLS-EMSTSCRSVQVLLHYFVGANYLWLLVEGLYLHTLLEPTVLPERRLWPRYLL
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 IGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDEGCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIV
.::. :.:::::::... :. :::: :.: . : ::: :... . :::.::.... ..
CCDS11 LGWAFPVLFVVPWGFARAHLENTGCWTTNGNKKIWWIIRGPMMLCVTVNFFIFLKILKLL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 VSKLKANLMCKTDIKCRLAKSTLTLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFT
.:::::. :: : : :::::::.::::::.::..:.:. :....: ..:.:: .:...
CCDS11 ISKLKAHQMCFRDYKYRLAKSTLVLIPLLGVHEILFSFITDDQVEGFAKLIRLFIQLTLS
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440
pF1KB7 SFQGLMVAILYCFVNNEVQLEFRKSWERWRLEHLHIQRDSSM-KPL----KCPTSSLSSG
::.:..::. : :.:.::. :.:: : :. : . : . : . ::: ..:: :
CCDS11 SFHGFLVALQYGFANGEVKAELRKYWVRFLLARHSGCRACVLGKDFRFLGKCP-KKLSEG
430 440 450 460 470 480
450 460
pF1KB7 ATAGSSMYTATCQASCS
:
CCDS11 DGAEKLRKLQPSLNSGRLLHLAMRGLGELGAQPQQDHARWPRGSSLSECSEGDVTMANTM
490 500 510 520 530 540
>>CCDS12671.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (466 aa)
initn: 1215 init1: 765 opt: 1012 Z-score: 1184.4 bits: 228.5 E(32554): 1.2e-59
Smith-Waterman score: 1282; 45.9% identity (69.8% similar) in 460 aa overlap (8-450:11-453)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPA
:::.: : .. :: .: :.. : :.:..:::.::..:. ::
CCDS12 MTTSPILQLLLRLSLCGL-LLQRAETGSKGQTAG--ELYQRWERYRRECQETLAAAEPP-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSS
. : :: .:: :.:: . :.. . .:::::::: : : : : : ..: : .
CCDS12 SGLACNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQW------G
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLF-LYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTR
: ::: ..::. ...: .. .: : ..:::::.::...:..: :: ::.:::::
CCDS12 L-WRDHTQCENPEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTR
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQ--WDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQ
::::.:::.::.::: ... .: : ..: :. :. .:: . .. :
CCDS12 NYIHINLFTSFMLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALA-----ACRTAQIVTQ
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDE
:::.::: :::::::::..::.. ::. :: :. .:::.: :::.:: ::.::::.
CCDS12 YCVGANYTWLLVEGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENT
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GCWTRNSNMNYWLIIRLPILFAIGVNFLIFVRVICIVVSKLKANLM-CKTDIKCRLAKST
:: :: : ::: :::..: .:::::.:.. :..:::.. : :. : . :::.::
CCDS12 QCWERNEVKAIWWIIRTPILMTILINFLIFIRILGILLSKLRTRQMRCR-DYRLRLARST
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 LTLIPLLGTHEVIFAFVMDEHARGTLRFIKLFTELSFTSFQGLMVAILYCFVNNEVQLEF
:::.::::.:::.:: : .:.:::.::: :: :. ..::::..:..::::.:.::: :.
CCDS12 LTLVPLLGVHEVVFAPVTEEQARGALRFAKLGFEIFLSSFQGFLVSVLYCFINKEVQSEI
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KB7 RKSWERWRLEHL--HIQRD----------SSMKPLKCPTS-SLSSGATAGSSMYTATCQA
:..:.. ::.. . ::. :. : . ::: .::::. :
CCDS12 RRGWHHCRLRRSLGEEQRQLPERAFRALPSGSGPGEVPTSRGLSSGTLPGPGNEASRELE
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 SCS
CCDS12 SYC
>>CCDS82367.1 GIPR gene_id:2696|Hs108|chr19 (430 aa)
initn: 1099 init1: 765 opt: 1003 Z-score: 1174.4 bits: 226.5 E(32554): 4.3e-59
Smith-Waterman score: 1063; 42.4% identity (64.6% similar) in 460 aa overlap (8-450:11-417)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MAGAPGPLRLALLLLGMVGRAGPRPQGATVSLWETVQKWREYRRQCQRSLTEDPPPA
:::.: : .. :: .: :.. : :.:..:::.::..:. ::
CCDS82 MTTSPILQLLLRLSLCGL-LLQRAETGSKGQTAG--ELYQRWERYRRECQETLAAAEPP-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TDLFCNRTFDEYACWPDGEPGSFVNVSCPWYLPWASSVPQGHVYRFCTAEGLWLQKDNSS
:: : : : : ..: : .
CCDS82 ------------------------------------SVAAGFVLRQCGSDGQW------G
60 70
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 LPWRDLSECEESKRGERSSPEEQLLF-LYIIYTVGYALSFSALVIASAILLGFRHLHCTR
: ::: ..::. ...: .. .: : ..:::::.::...:..: :: ::.:::::
CCDS82 L-WRDHTQCENPEKNEAFLDQRLILERLQVMYTVGYSLSLATLLLALLILSLFRRLHCTR
80 90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 NYIHLNLFASFILRALSVFIKDAALKWMYSTAAQQHQ--WDGLLSYQDSLSCRLVFLLMQ
::::.:::.::.::: ... .: : ..: :. :. .:: . .. :
CCDS82 NYIHINLFTSFMLRAAAILSRDRLLPRPGPYLGDQALALWNQALA-----ACRTAQIVTQ
140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 YCVAANYYWLLVEGVYLYTLLAFSVLSEQWIFRLYVSIGWGVPLLFVVPWGIVKYLYEDE
:::.::: :::::::::..::.. ::. :: :. .:::.: :::.:: ::.::::.
CCDS82 YCVGANYTWLLVEGVYLHSLLVLVGGSEEGHFRYYLLLGWGAPALFVIPWVIVRYLYENT
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]