Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7231
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7231, 434 aa
1>>>pF1KB7231 434 - 434 aa - 434 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1761+/-0.00096; mu= 17.8275+/- 0.058
mean_var=63.7113+/-12.961, 0's: 0 Z-trim(104.6): 39 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.160682
statistics sampled from 7948 (7987) to 7948 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.617), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 2.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7051.1 TUBB8 gene_id:347688|Hs108|chr10 ( 444) 2691 632.8 2e-181
CCDS7039.1 TUBB4B gene_id:10383|Hs108|chr9 ( 445) 2533 596.2 2.2e-170
CCDS4687.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 ( 444) 2515 592.0 3.9e-169
CCDS4485.1 TUBB2B gene_id:347733|Hs108|chr6 ( 445) 2513 591.5 5.4e-169
CCDS12168.1 TUBB4A gene_id:10382|Hs108|chr19 ( 444) 2512 591.3 6.3e-169
CCDS4484.1 TUBB2A gene_id:7280|Hs108|chr6 ( 445) 2498 588.0 6e-168
CCDS10988.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 ( 450) 2423 570.7 1e-162
CCDS11858.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 ( 446) 2407 566.9 1.4e-161
CCDS13475.1 TUBB1 gene_id:81027|Hs108|chr20 ( 451) 2154 508.3 6.2e-144
CCDS78124.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 ( 372) 2126 501.8 4.7e-142
CCDS56012.1 TUBB3 gene_id:10381|Hs108|chr16 ( 378) 2063 487.2 1.2e-137
CCDS8782.1 TUBA1C gene_id:84790|Hs108|chr12 ( 449) 958 231.0 1.8e-60
CCDS31792.1 TUBA1B gene_id:10376|Hs108|chr12 ( 451) 957 230.8 2.1e-60
CCDS2438.1 TUBA4A gene_id:7277|Hs108|chr2 ( 448) 952 229.7 4.6e-60
CCDS76556.1 TUBA1C gene_id:84790|Hs108|chr12 ( 519) 951 229.5 6.2e-60
CCDS8781.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 451) 949 229.0 7.6e-60
CCDS58227.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 451) 949 229.0 7.6e-60
CCDS9284.1 TUBA3C gene_id:7278|Hs108|chr13 ( 450) 946 228.3 1.2e-59
CCDS33290.1 TUBA3D gene_id:113457|Hs108|chr2 ( 450) 946 228.3 1.2e-59
CCDS2158.1 TUBA3E gene_id:112714|Hs108|chr2 ( 450) 941 227.1 2.7e-59
CCDS13751.1 TUBA8 gene_id:51807|Hs108|chr22 ( 449) 935 225.7 7.2e-59
CCDS11433.1 TUBG1 gene_id:7283|Hs108|chr17 ( 451) 916 221.3 1.5e-57
CCDS32658.1 TUBG2 gene_id:27175|Hs108|chr17 ( 451) 912 220.4 2.9e-57
CCDS63131.1 TUBA4A gene_id:7277|Hs108|chr2 ( 433) 906 219.0 7.3e-57
CCDS58226.1 TUBA1A gene_id:7846|Hs108|chr12 ( 416) 868 210.2 3.2e-54
CCDS53491.1 TUBAL3 gene_id:79861|Hs108|chr10 ( 406) 819 198.8 8.2e-51
CCDS7066.2 TUBAL3 gene_id:79861|Hs108|chr10 ( 446) 819 198.8 8.8e-51
CCDS54495.1 TUBA8 gene_id:51807|Hs108|chr22 ( 383) 810 196.7 3.3e-50
CCDS5100.1 TUBE1 gene_id:51175|Hs108|chr6 ( 475) 512 127.7 2.5e-29
CCDS77153.1 TUBB6 gene_id:84617|Hs108|chr18 ( 104) 486 121.3 4.6e-28
CCDS54154.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 396) 466 117.0 3.4e-26
CCDS11620.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 453) 466 117.0 3.9e-26
CCDS54152.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 351) 438 110.4 2.8e-24
CCDS54153.1 TUBD1 gene_id:51174|Hs108|chr17 ( 398) 438 110.5 3.1e-24
>>CCDS7051.1 TUBB8 gene_id:347688|Hs108|chr10 (444 aa)
initn: 2359 init1: 2359 opt: 2691 Z-score: 3370.5 bits: 632.8 E(32554): 2e-181
Smith-Waterman score: 2691; 93.5% identity (96.5% similar) in 431 aa overlap (1-430:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRELVLTQTGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVHHHEASGGRYV
:::.:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::...::::::::
CCDS70 MREIVLTQIGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVYYNEASGGRYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFISRQCGAGNNWAKGRYTEGAELTESVMDVV
:::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::.::::::: :::::::
CCDS70 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFIFGQCGAGNNWAKGHYTEGAELMESVMDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIWEEYPDRIINTLSILLLPKVSDTVV
:::::::::::::::::::::::::::::::.::: ::::::::::.::: ::::::::
CCDS70 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLLSKIREEYPDRIINTFSILPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSRTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSKTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CFPDQLNADLRKLAMNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
:: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 AARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWFPNNVKTAVCDIPPWG
:: ::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::: :
CCDS70 AACDPRHGRYLTAAAIFRGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWLPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
::::.:: :::::.::: ::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LKMSATFIGNNTAIQELFKRVSEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 EYQQYQDATAEGGGV
:::::::::::
CCDS70 EYQQYQDATAEEEEDEEYAEEEVA
430 440
>>CCDS7039.1 TUBB4B gene_id:10383|Hs108|chr9 (445 aa)
initn: 2200 init1: 2200 opt: 2533 Z-score: 3172.5 bits: 596.2 E(32554): 2.2e-170
Smith-Waterman score: 2533; 85.9% identity (94.5% similar) in 434 aa overlap (1-433:1-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRELVLTQTGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVHHHEASGGRYV
:::.: :.:::::::::::::::::::.:: .::::::: ::::::::...::.::.::
CCDS70 MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFISRQCGAGNNWAKGRYTEGAELTESVMDVV
::::::::::::::::::::::.::::::. : :::::::::.:::::::..::.:::
CCDS70 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIWEEYPDRIINTLSILLLPKVSDTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::.:.. ::::::::
CCDS70 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSRTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
::::::::::::.::.:::.::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS70 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CFPDQLNADLRKLAMNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
:: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS70 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 AARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWFPNNVKTAVCDIPPWG
:: :::::::::.::.:.::: :.::::::.:.:.::::::..:.::::::::::::: :
CCDS70 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
::::.:: ::.::.::: ::.:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS70 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 EYQQYQDATAEGGGV
::::::::::: :
CCDS70 EYQQYQDATAEEEGEFEEEAEEEVA
430 440
>>CCDS4687.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 (444 aa)
initn: 2184 init1: 2184 opt: 2515 Z-score: 3150.0 bits: 592.0 E(32554): 3.9e-169
Smith-Waterman score: 2515; 85.4% identity (94.9% similar) in 431 aa overlap (1-430:1-431)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRELVLTQTGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVHHHEASGGRYV
:::.: :.:::::::::::::::::::.:: .::::::: :::.::.:...::.::.::
CCDS46 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLDRISVYYNEATGGKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFISRQCGAGNNWAKGRYTEGAELTESVMDVV
::.:::::::::::::::::::.::::::. : :::::::::.:::::::..::.:::
CCDS46 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIWEEYPDRIINTLSILLLPKVSDTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::.:.. ::::::::
CCDS46 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSRTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
::::::::::::.::.:::.::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS46 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CFPDQLNADLRKLAMNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
:: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::.:::::::
CCDS46 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQVFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 AARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWFPNNVKTAVCDIPPWG
:: :::::::::.::.:.::: :.::::::.:.:.::::::..:.::::::::::::: :
CCDS46 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::.::: ::.::.::: ::.:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 EYQQYQDATAEGGGV
:::::::::::
CCDS46 EYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA
430 440
>>CCDS4485.1 TUBB2B gene_id:347733|Hs108|chr6 (445 aa)
initn: 2508 init1: 2183 opt: 2513 Z-score: 3147.4 bits: 591.5 E(32554): 5.4e-169
Smith-Waterman score: 2513; 84.8% identity (94.5% similar) in 434 aa overlap (1-433:1-434)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRELVLTQTGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVHHHEASGGRYV
:::.: :.:::::::::::::::::::.:: .:.::::: ::::::::...::.:..::
CCDS44 MREIVHIQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGSYHGDSDLQLERINVYYNEATGNKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFISRQCGAGNNWAKGRYTEGAELTESVMDVV
::.:::::::::::::::::::.::::::. : :::::::::.:::::::..::.:::
CCDS44 PRAILVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIWEEYPDRIINTLSILLLPKVSDTVV
:::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::.::.:.. ::::::::
CCDS44 RKESESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSRTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
::::::::::::.::.:::.::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS44 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CFPDQLNADLRKLAMNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
:: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::::
CCDS44 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDSKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 AARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWFPNNVKTAVCDIPPWG
:: :::::::::.::::.::: :.::::::.:.:.::::::..:.::::::::::::: :
CCDS44 AACDPRHGRYLTVAAIFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
::::.:: ::.::.::: ::.:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 EYQQYQDATAEGGGV
::::::::::. :
CCDS44 EYQQYQDATADEQGEFEEEEGEDEA
430 440
>>CCDS12168.1 TUBB4A gene_id:10382|Hs108|chr19 (444 aa)
initn: 2510 init1: 2176 opt: 2512 Z-score: 3146.2 bits: 591.3 E(32554): 6.3e-169
Smith-Waterman score: 2512; 85.2% identity (94.5% similar) in 433 aa overlap (1-432:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRELVLTQTGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVHHHEASGGRYV
:::.: :.:::::::::::::::::::.:: .::::::: ::::::::...::.:: ::
CCDS12 MREIVHLQAGQCGNQIGAKFWEVISDEHGIDPTGTYHGDSDLQLERINVYYNEATGGNYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFISRQCGAGNNWAKGRYTEGAELTESVMDVV
::::::::::::::::::::::.::::::. : :::::::::.:::::::...:.:::
CCDS12 PRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIWEEYPDRIINTLSILLLPKVSDTVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.::.:.. ::::::::
CCDS12 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVVPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSRTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
::::::::::::.::.:::.::::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS12 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 CFPDQLNADLRKLAMNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
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CCDS12 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 AARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWFPNNVKTAVCDIPPWG
:: :::::::::.::.:.::: :.::::::...:.::::::..:.::::::::::::: :
CCDS12 AACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLSVQSKNSSYFVEWIPNNVKTAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::..:: ::.::.::: ::.:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LKMAATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
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420 430
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::::::::::: :
CCDS12 EYQQYQDATAEEGEFEEEAEEEVA
430 440
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10 20 30 40 50 60
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:::.: :.:::::::::::::::::::.:: .:.::::: ::::::::...::.:..::
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::.::.:::. :::::::::: ::::: ::::::::::::::::::::::
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pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
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CCDS44 LKMSATFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 EYQQYQDATAEGGGV
::::::::::. :
CCDS44 EYQQYQDATADEQGEFEEEEGEDEA
430 440
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Smith-Waterman score: 2423; 82.7% identity (92.9% similar) in 434 aa overlap (1-433:1-434)
10 20 30 40 50 60
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:::.: :.:::::::::::::::::::.:: .:.: ::: ::::::.:...:::. .::
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CCDS10 PRAILVDLEPGTMDSVRSGAFGHLFRPDNFIFGQSGAGNNWAKGHYTEGAELVDSVLDVV
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::::::::.:::.::.:::.::::::::::: ::::: :::::::::::::::::::: :
CCDS10 EPYNATLSIHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLATPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 CFPDQLNADLRKLAMNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
:: ::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::: :::::::::::::
CCDS10 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTARGSQQYRALTVPELTQQMFDAKNMM
250 260 270 280 290 300
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pF1KB7 AARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWFPNNVKTAVCDIPPWG
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CCDS10 AACDPRHGRYLTVATVFRGRMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::: :: ::.::.::: ::.:::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LKMSSTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 EYQQYQDATAEGGGV
::::::::::: :
CCDS10 EYQQYQDATAEEEGEMYEDDEEESEAQGPK
430 440 450
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRELVLTQTGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVHHHEASGGRYV
:::.: :.::::::::.::::::::::.:: :: : ::: ::::::::...:.:. .::
CCDS11 MREIVHIQAGQCGNQIGTKFWEVISDEHGIDPAGGYVGDSALQLERINVYYNESSSQKYV
10 20 30 40 50 60
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pF1KB7 SRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFISRQCGAGNNWAKGRYTEGAELTESVMDVV
::.:::::::::::::::::::.::::::: : :::::::::.:::::::...:.:::
CCDS11 PRAALVDLEPGTMDSVRSGPFGQLFRPDNFIFGQTGAGNNWAKGHYTEGAELVDAVLDVV
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pF1KB7 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIWEEYPDRIINTLSILLLPKVSDTVV
::: : ::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::.::.:.. ::::::::
CCDS11 RKECEHCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEFPDRIMNTFSVMPSPKVSDTVV
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSRTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
::::::::::::.::.:::.::::::::::: ::::: :::::::::::::::::::: :
CCDS11 EPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSATMSGVTTSL
190 200 210 220 230 240
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pF1KB7 CFPDQLNADLRKLAMNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVAELTQQMFDAKNMM
:: ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::.:::
CCDS11 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYRALTVPELTQQMFDARNMM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 AARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWFPNNVKTAVCDIPPWG
:: :::::::::.:..:.: : :.::::::. ::.::::::..:.:::::.::::::: :
CCDS11 AACDPRHGRYLTVATVFRGPMSMKEVDEQMLAIQSKNSSYFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
:::. :: ::.::.::: ::.::::.: :::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS11 LKMASTFIGNSTAIQELFKRISEQFSAMFRRKAFLHWFTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 EYQQYQDATAEGGGV
::::::::::. :
CCDS11 EYQQYQDATANDGEEAFEDEEEEIDG
430 440
>>CCDS13475.1 TUBB1 gene_id:81027|Hs108|chr20 (451 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRELVLTQTGQCGNQIGAKFWEVISDEHAIDSAGTYHGDSHLQLERINVHHHEASGGRYV
:::.: : :::::::::::::.:..::.:: ::. .: : ::::::.:...:: : .::
CCDS13 MREIVHIQIGQCGNQIGAKFWEMIGEEHGIDLAGSDRGASALQLERISVYYNEAYGRKYV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFISRQCGAGNNWAKGRYTEGAELTESVMDVV
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CCDS13 PRAVLVDLEPGTMDSIRSSKLGALFQPDSFVHGNSGAGNNWAKGHYTEGAELIENVLEVV
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pF1KB7 RKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIWEEYPDRIINTLSILLLPKVSDTVV
:.:.::::::::::..:::::::::::::::..:: :::::::.:..:.. ::::::::
CCDS13 RHESESCDCLQGFQIVHSLGGGTGSGMGTLLMNKIREEYPDRIMNSFSVMPSPKVSDTVV
130 140 150 160 170 180
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pF1KB7 EPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSRTLKLPTPTYGDLNHLVSATMSGVTTCL
:::::.::.:::::::: :::::::::::: ::::: :::::::::::: ::::.:: :
CCDS13 EPYNAVLSIHQLIENADACFCIDNEALYDICFRTLKLTTPTYGDLNHLVSLTMSGITTSL
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:: ::::::::::.:::::::::::::::::::..::::::::.:::::::::::.: :
CCDS13 RFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTAQGSQQYRALSVAELTQQMFDARNTM
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pF1KB7 AARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFADWFPNNVKTAVCDIPPWG
:: : :.:::::.: ::.:.: .:::.:....: .::: :..:.:::::.::::::: :
CCDS13 AACDLRRGRYLTVACIFRGKMSTKEVDQQLLSVQTRNSSCFVEWIPNNVKVAVCDIPPRG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KB7 LKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEGMDEMEFTEAESNMNDLVS
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CCDS13 LSMAATFIGNNTAIQEIFNRVSEHFSAMFKRKAFVHWYTSEGMDINEFGEAENNIHDLVS
370 380 390 400 410 420
420 430
pF1KB7 EYQQYQDATAEGGGV
::::.::: :
CCDS13 EYQQFQDAKAVLEEDEEVTEEAEMEPEDKGH
430 440 450
>>CCDS78124.1 TUBB gene_id:203068|Hs108|chr6 (372 aa)
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50 60 70 80 90 100
pF1KB7 QLERINVHHHEASGGRYVSRAVLVDLEPGTMDSVRSGPFGQVFRPDNFISRQCGAGNNWA
:::::::::::.::::::. : :::::::
CCDS78 MDSVRSGPFGQIFRPDNFVFGQSGAGNNWA
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 KGRYTEGAELTESVMDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIWEEYPDR
::.:::::::..::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS78 KGHYTEGAELVDSVLDVVRKEAESCDCLQGFQLTHSLGGGTGSGMGTLLISKIREEYPDR
40 50 60 70 80 90
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pF1KB7 IINTLSILLLPKVSDTVVEPYNATLSVHQLIENADETFCIDNEALYDICSRTLKLPTPTY
:.::.:.. ::::::::::::::::::::.::.:::.::::::::::: ::::: ::::
CCDS78 IMNTFSVVPSPKVSDTVVEPYNATLSVHQLVENTDETYCIDNEALYDICFRTLKLTTPTY
100 110 120 130 140 150
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pF1KB7 GDLNHLVSATMSGVTTCLCFPDQLNADLRKLAMNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYR
:::::::::::::::::: :: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GDLNHLVSATMSGVTTCLRFPGQLNADLRKLAVNMVPFPRLHFFMPGFAPLTSRGSQQYR
160 170 180 190 200 210
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pF1KB7 ALTVAELTQQMFDAKNMMAARDPRHGRYLTAAAIFQGRMPMREVDEQMFNIQDKNSSYFA
:::: :::::.::::::::: :::::::::.::.:.::: :.::::::.:.:.::::::.
CCDS78 ALTVPELTQQVFDAKNMMAACDPRHGRYLTVAAVFRGRMSMKEVDEQMLNVQNKNSSYFV
220 230 240 250 260 270
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pF1KB7 DWFPNNVKTAVCDIPPWGLKMSVTFTGNNTAVQEL-KRVSEQFTATFRRKAFLHWYTGEG
.:.::::::::::::: ::::.::: ::.::.::: ::.:::::: ::::::::::::::
CCDS78 EWIPNNVKTAVCDIPPRGLKMAVTFIGNSTAIQELFKRISEQFTAMFRRKAFLHWYTGEG
280 290 300 310 320 330
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pF1KB7 MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEGGGV
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MDEMEFTEAESNMNDLVSEYQQYQDATAEEEEDFGEEAEEEA
340 350 360 370
434 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 06:08:45 2016 done: Fri Nov 4 06:08:45 2016
Total Scan time: 2.800 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]