Result of FASTA (ccds) for pF1KB7232
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7232, 396 aa
  1>>>pF1KB7232 396 - 396 aa - 396 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7109+/-0.000725; mu= 15.4024+/- 0.044
 mean_var=77.2623+/-15.089, 0's: 0 Z-trim(110.1): 43  B-trim: 0 in 0/51
 Lambda= 0.145912
 statistics sampled from 11341 (11384) to 11341 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.35), width:  16
 Scan time:  2.800

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20           ( 396) 2695 576.5 1.5e-164
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14            ( 408) 1548 335.0 7.3e-92
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12           ( 364)  524 119.5 5.1e-27
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6             ( 513)  497 113.9 3.5e-25
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1          ( 402)  495 113.4 3.8e-25
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1             ( 402)  491 112.5 6.9e-25
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20           ( 431)  489 112.1 9.8e-25
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6             ( 454)  488 111.9 1.2e-24
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8         ( 455)  475 109.2 7.9e-24
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20          ( 501)  473 108.8 1.1e-23
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2          ( 450)  467 107.5 2.5e-23
CCDS1890.1 BMP10 gene_id:27302|Hs108|chr2          ( 424)  430 99.7 5.3e-21
CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4             ( 472)  414 96.4   6e-20
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10          ( 429)  394 92.1   1e-18
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7           ( 426)  393 91.9 1.2e-18
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10         ( 478)  390 91.3   2e-18
CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10          ( 347)  365 86.0 5.9e-17
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX          ( 392)  360 85.0 1.3e-16
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12         ( 350)  353 83.5 3.4e-16
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19          ( 372)  352 83.3 4.1e-16
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2           ( 407)  347 82.2 9.3e-16
CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19         ( 390)  328 78.2 1.4e-14
CCDS8938.1 INHBC gene_id:3626|Hs108|chr12          ( 352)  306 73.6 3.3e-13
CCDS75299.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5           ( 366)  296 71.5 1.4e-12
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2            ( 375)  295 71.3 1.7e-12
CCDS4162.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5            ( 454)  296 71.5 1.7e-12
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12         ( 407)  293 70.9 2.5e-12


>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20                (396 aa)
 initn: 2695 init1: 2695 opt: 2695  Z-score: 3067.8  bits: 576.5 E(32554): 1.5e-164
Smith-Waterman score: 2695; 100.0% identity (100.0% similar) in 396 aa overlap (1-396:1-396)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSM
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 FGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 LPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPA
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPA
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 TANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVS
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVS
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 KRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKSSCKRHP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKSSCKRHP
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 LYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKAC
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKAC
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390      
pF1KB7 CVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
              370       380       390      

>>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14                 (408 aa)
 initn: 947 init1: 687 opt: 1548  Z-score: 1762.7  bits: 335.0 E(32554): 7.3e-92
Smith-Waterman score: 1650; 62.8% identity (82.0% similar) in 411 aa overlap (1-396:1-408)

               10        20          30           40        50     
pF1KB7 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGA--AGLVPELGRRKFAAA---SSGRPSSQPSDEVLSEFEL
       :. :.: :...:: :::::::  :.:.:: :..: :     ..:: :.: : :.: .:: 
CCDS97 MIPGNRMLMVVLLCQVLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQ-SHELLRDFEA
               10        20        30        40         50         

          60        70        80             90       100       110
pF1KB7 RLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSG-----QPGSPAPDHRLERAASRANTVR
        ::.::::..:: ::..::.: :: :::: .::     :  : . ..  :: ::::::::
CCDS97 TLLQMFGLRRRPQPSKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYP-ERPASRANTVR
      60        70        80        90       100        110        

              120       130       140       150       160       170
pF1KB7 SFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHR
       :::::: ::..: :: ... ::.::::::: .: :.::::..::::....   . .:: :
CCDS97 SFHHEEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEVISSAELRLFREQVDQGPDWERGFH-R
      120       130       140       150       160       170        

               180       190       200       210       220         
pF1KB7 INIYEIIKP-ATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVE
       :::::..:: : .     .:::::::::..:..:::.:::.:::.::: . . :.:...:
CCDS97 INIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIE
       180       190       200       210       220       230       

     230       240       250       260       270         280       
pF1KB7 VAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPL--HKREKRQAKHK
       :.::.. .  . .:::::::: :   .:.:.:::::::::::.:: :  ..: ::. ::.
CCDS97 VTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGHALTRRRRAKRSPKHH
       240       250       260       270       280       290       

        290        300       310       320       330       340     
pF1KB7 -QRKRLKS-SCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIV
        :: : :. .:.:: ::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS97 SQRARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIV
       300       310       320       330       340       350       

         350       360       370       380       390      
pF1KB7 QTLVNSVNSKIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
       :::::::::.::::::::::::::::::::: .::::::::.:::::::::
CCDS97 QTLVNSVNSSIPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR
       360       370       380       390       400        

>>CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12                (364 aa)
 initn: 462 init1: 462 opt: 524  Z-score: 598.5  bits: 119.5 E(32554): 5.1e-27
Smith-Waterman score: 569; 31.7% identity (62.4% similar) in 356 aa overlap (54-395:26-363)

            30        40        50        60        70        80   
pF1KB7 LVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLY
                                     :  .:...:: . :.:..   ::  .  ..
CCDS85      MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIF
                    10        20        30        40        50     

              90       100       110       120           130       
pF1KB7 --RRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELP----ETSGKTTRRFFFNLS
         :. ..  :       ... . :.:..: :  ....   :    ..:.   . ..::::
CCDS85 QDREAAATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLR-FLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLS
          60        70        80         90       100       110    

       140       150       160           170       180        190  
pF1KB7 SIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHH----RINIYEIIKPATANSKFPVT-RLL
       .:  .: .: :.: .      : :: :: ..     .. .. . .: . ..  :   ...
CCDS85 AIKEREQLTLAQLGL------D-LGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMF
          120             130        140       150       160       

              200       210       220       230        240         
pF1KB7 DTRLVN--QNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQ-GVSKRHVRISRS
         : :   :.: ... .::.     :. . . : :. .:.   :... ::. .       
CCDS85 VLRSVPWPQGAVHFNLLDVAKD---WNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSGVNFQPEDTCAR
       170       180          190       200       210       220    

     250       260       270       280       290       300         
pF1KB7 LHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKSSCKRHPLYVDFSDVG
       :. . :.      :.::.. : . ::  .:..: :    .   :. :.:: :...: :.:
CCDS85 LRCSLHA----SLLVVTLNPD-QCHP--SRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINFRDLG
          230           240          250       260       270       

     310       320       330       340       350       360         
pF1KB7 WNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKACCVPTELSAI
       :. ::.:: :. : :::::::: :.  :::.:.:..:.:...:. .::.: :.::.:: :
CCDS85 WHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAVCIPTKLSPI
       280       290       300       310       320       330       

     370       380       390      
pF1KB7 SMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
       :::: :.:..:.:..:.::::. ::: 
CCDS85 SMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG
       340       350       360    

>>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6                  (513 aa)
 initn: 703 init1: 313 opt: 497  Z-score: 565.5  bits: 113.9 E(32554): 3.5e-25
Smith-Waterman score: 637; 34.5% identity (59.9% similar) in 357 aa overlap (65-395:170-512)

           40        50        60        70        80        90    
pF1KB7 AASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPG-SP
                                     ::  :   :. :    .:    ::. : ::
CCDS45 YNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASP
     140       150       160       170       180       190         

           100       110       120       130       140       150   
pF1KB7 APDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVF
         . .     . :. : :: .    ..      .  ..: ::::.::  : .:.::....
CCDS45 LTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIY
     200       210       220       230       240       250         

           160       170       180       190       200       210   
pF1KB7 REQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAV
       .. .. .. :.. .   :.::....    . .     :::::.:  .   :  ::.: . 
CCDS45 KDCVMGSFKNQTFL---ISIYQVLQE--HQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATS
     260       270          280         290       300       310    

           220       230       240       250       260       270   
pF1KB7 MRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKG
         :..  . : :. . :.    ..:: . : : .  . .:    .:  :..:.:    : 
CCDS45 NLWVVTPQHNMGLQLSVV---TRDGV-HVHPRAAGLVGRDGPYDKQ--PFMVAF---FKV
          320       330           340       350         360        

           280       290                               300         
pF1KB7 HPLHKREKRQAKHKQRKR------------------------LKSSCKRHPLYVDFSDVG
         .: :  :.:. ..:..                        ::..:..: :::.:.:.:
CCDS45 SEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLG
         370       380       390       400       410       420     

     310       320       330       340       350        360        
pF1KB7 WNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSK-IPKACCVPTELSA
       :.:::.:: :: : :: ::: :::  :.:.::::::::::. .: . .:: ::.::.:.:
CCDS45 WQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNA
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      370       380       390      
pF1KB7 ISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
       ::.::.:.: .:.::.:..:::..::: 
CCDS45 ISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
         490       500       510   

>>CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1               (402 aa)
 initn: 572 init1: 285 opt: 495  Z-score: 564.9  bits: 113.4 E(32554): 3.8e-25
Smith-Waterman score: 616; 31.9% identity (60.5% similar) in 423 aa overlap (8-395:10-401)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLL
                ::.: :  .: ::. :: :            : :. . . .   . . ..:
CCDS43 MAARPGPLWLLGLTL-CALGGGGPGLRPP----------PGCPQRRLGARERRDVQREIL
               10         20                  30        40         

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pF1KB7 SMFGLKQRPTP------SR-DAVVPPYMLDLYRRHSG---QPGSPAPDHRLERAASRANT
       ...::  :: :      ::  : .: .:::::.  .:   . :.:: ..::    .::. 
CCDS43 AVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDEDGAPA-EQRL----GRADL
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pF1KB7 VRSFHHEESLEELPETSGKTT---RRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNS
       : ::    .. :  .. :.     ..: :.:..::. : .:.::.....      :  : 
CCDS43 VMSF---VNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYKVPSIHLL--NR
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pF1KB7 SFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHG
       ..:  ........  .  ..     .:: . .  .   :  .::: :   :  . : . :
CCDS43 TLH--VSMFQVVQEQS--NRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKDLG
     160         170         180       190       200       210     

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pF1KB7 FVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKG--------HPLH
       . . : . :. ..:.   .    .:  ..   :: .:..::: . . .        .::.
CCDS43 LRLYV-ETEDGHSVDPGLA----GLLGQRAPRSQ-QPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRPLR
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pF1KB7 KRE-KRQAKHKQRKRL------------KSSCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFY
       .:. :.. .  : .::            .. :.:: :::.:.:.:: ::..:: :: :.:
CCDS43 RRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVRGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGYSAYY
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pF1KB7 CHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVN-SKIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLK
       :.::: ::: . .:.:::::.:.::. .. . .:::::.::.::: :.:: : ...:.:.
CCDS43 CEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMKPNAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVILR
     330       340       350       360       370       380         

           390      
pF1KB7 NYQDMVVEGCGCR
       ....:::..::: 
CCDS43 KHRNMVVKACGCH
     390       400  

>>CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1                  (402 aa)
 initn: 580 init1: 285 opt: 491  Z-score: 560.3  bits: 112.5 E(32554): 6.9e-25
Smith-Waterman score: 617; 31.9% identity (59.8% similar) in 423 aa overlap (8-395:10-401)

                 10        20        30        40        50        
pF1KB7   MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLL
                ::.: :  .: ::. :: :            : :. . . .   . . ..:
CCDS44 MTALPGPLWLLGLAL-CALGGGGPGLRPP----------PGCPQRRLGARERRDVQREIL
               10         20                  30        40         

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pF1KB7 SMFGLKQRPTP------SR-DAVVPPYMLDLYRRHSG---QPGSPAPDHRLERAASRANT
       ...::  :: :      ::  : .: .:::::.  .:   . :.::     ::  .::. 
CCDS44 AVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDEDGAPA-----ERRLGRADL
      50        60        70        80        90            100    

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pF1KB7 VRSFHHEESLEELPETSGKTT---RRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNS
       : ::    .. :  .. :.     ..: :.:..::. : .:.::.....      :  : 
CCDS44 VMSF---VNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYKVPSIHLL--NR
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pF1KB7 SFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHG
       ..:  ........  .  ..     .:: . .  .   :  .::: :   :  . : . :
CCDS44 TLH--VSMFQVVQEQS--NRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKDLG
     160         170         180       190       200       210     

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pF1KB7 FVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKG--------HPLH
       . . : . :. ..:.   .    .:  ..   :: .:..::: . . .        .::.
CCDS44 LRLYV-ETEDGHSVDPGLA----GLLGQRAPRSQ-QPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRPLR
         220        230           240        250       260         

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pF1KB7 KRE-KRQAKHKQRKRL------------KSSCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFY
       .:. :.. .  : .::            .. :.:: :::.:.:.:: ::..:: :: :.:
CCDS44 RRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVHGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGYSAYY
     270       280       290       300       310       320         

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pF1KB7 CHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVN-SVNSKIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLK
       :.::: ::: . .:.:::::.:.::.  . . .:::::.::.::: :.:: : ...:.:.
CCDS44 CEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVILR
     330       340       350       360       370       380         

           390      
pF1KB7 NYQDMVVEGCGCR
       ....:::..::: 
CCDS44 KHRNMVVKACGCH
     390       400  

>>CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20                (431 aa)
 initn: 669 init1: 307 opt: 489  Z-score: 557.6  bits: 112.1 E(32554): 9.8e-25
Smith-Waterman score: 655; 33.1% identity (60.8% similar) in 393 aa overlap (52-395:53-430)

              30        40        50        60           70        
pF1KB7 AGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTP---SRDAVVPPY
                                     :.. ..::..:: .:: :   ..   .: .
CCDS13 LLRSALADFSLDNEVHSSFIHRRLRSQERREMQREILSILGLPHRPRPHLQGKHNSAPMF
             30        40        50        60        70        80  

       80            90                     100         110        
pF1KB7 MLDLYR----RHSGQPGSPA--------------PDHRLERAA--SRANTVRSF-HHEES
       :::::     ...: ::. .              :   :. .   . :. : :: .  : 
CCDS13 MLDLYNAMAVEEGGGPGGQGFSYPYKAVFSTQGPPLASLQDSHFLTDADMVMSFVNLVEH
             90       100       110       120       130       140  

       120       130       140       150       160       170       
pF1KB7 LEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEII
        .:. .   .  :.: :.::.::  : .:.::...... ... . .: .:  ::..:...
CCDS13 DKEFFHPRYHH-REFRFDLSKIPEGEAVTAAEFRIYKDYIRERF-DNETF--RISVYQVL
            150        160       170       180        190          

       180       190       200       210       220       230       
pF1KB7 KPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQ
       .   .  .     :::.: .  .   :  ::.: .  .:... . : :. . :  :. ..
CCDS13 QEHLG--RESDLFLLDSRTLWASEEGWLVFDITATSNHWVVNPRHNLGLQLSVETLDGQS
      200         210       220       230       240       250      

       240       250       260       270       280       290       
pF1KB7 GVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKS---
          :    :.:   :...      :..:.:    :.  .: :  :..  :::.. .:   
CCDS13 INPKLAGLIGRHGPQNKQ------PFMVAFF---KATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTP
        260       270             280          290       300       

                               300       310       320       330   
pF1KB7 ---------------------SCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPL
                            .::.: :::.: :.::.:::.:: :: :.::.::: :::
CCDS13 KNQEALRMANVAENSSSDQRQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAPEGYAAYYCEGECAFPL
       310       320       330       340       350       360       

           340       350        360       370       380       390  
pF1KB7 ADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSK-IPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEG
        ...:.::::::::::. .: . .:: ::.::.:.:::.::.:.. .:.::.:..:::..
CCDS13 NSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRA
       370       380       390       400       410       420       

           
pF1KB7 CGCR
       ::: 
CCDS13 CGCH
       430 

>>CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6                  (454 aa)
 initn: 614 init1: 308 opt: 488  Z-score: 556.1  bits: 111.9 E(32554): 1.2e-24
Smith-Waterman score: 600; 32.3% identity (58.7% similar) in 409 aa overlap (52-395:50-453)

              30        40        50        60           70        
pF1KB7 AGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRP---TPSRDAVVPP-
                                     :.. ..::..:: .::   .:...:   : 
CCDS49 VLVGYAKGGLGDNHVHSSFIYRRLRNHERREIQREILSILGLPHRPRPFSPGKQASSAPL
      20        30        40        50        60        70         

        80                                 90          100         
pF1KB7 YMLDLYR---------------RHS----------GQPGSPAPDHR---LERAA---SRA
       .:::::                : :          : :.::    :   : :..   ...
CCDS49 FMLDLYNAMTNEENPEESEYSVRASLAEETRGARKGYPASPNGYPRRIQLSRTTPLTTQS
      80        90       100       110       120       130         

        110       120                  130           140       150 
pF1KB7 NTVRSFHHEESLEE---------LPETSGKTT--RR----FFFNLSSIPTEEFITSAELQ
         . :.:  . :..         : : .   .  ::    : :.:..::  : .:.::..
CCDS49 PPLASLHDTNFLNDADMVMSFVNLVERDKDFSHQRRHYKEFRFDLTQIPHGEAVTAAEFR
     140       150       160       170       180       190         

             160       170       180       190       200       210 
pF1KB7 VFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTP
       ..... .. . :..    .:.::.:::  :  ..     ::::: ..     :  ::.: 
CCDS49 IYKDRSNNRFENETI---KISIYQIIKEYT--NRDADLFLLDTRKAQALDVGWLVFDITV
     200       210          220         230       240       250    

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pF1KB7 AVMRWTAQGHANHGFV------------VEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQ
       .  .:. . . : :.             :. : :  .:: ....  .   .. .:    .
CCDS49 TSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPFMVAFFKASEVLLRS
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     260       270       280         290       300       310       
pF1KB7 IRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAK--HKQRKRLKSSCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAP
       .:      ... .    :.  .:...    . .. :..::.: :::.: :.::.:::.::
CCDS49 VRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAP
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pF1KB7 PGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSV-NSKIPKACCVPTELSAISMLYLDE
        :: :::: ::: :::  :.:.::::::::::. .  ...:: ::.::.:.:::.::.:.
CCDS49 EGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDD
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        380       390      
pF1KB7 NEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
       . .:.::.:..:::..::: 
CCDS49 SSNVILKKYRNMVVRSCGCH
          440       450    

>>CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8              (455 aa)
 initn: 488 init1: 253 opt: 475  Z-score: 541.3  bits: 109.2 E(32554): 7.9e-24
Smith-Waterman score: 528; 30.5% identity (58.5% similar) in 443 aa overlap (18-396:37-455)

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pF1KB7              MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVP-ELGRRKFAAASS--GR----
                                     ::.. :.   . :. . :  .:  ::    
CCDS34 LLSAVFLISFLWDLPGFQQASISSSSSSAELGSTKGMRSRKEGKMQRAPRDSDAGREGQE
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pF1KB7 PSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPP--YMLDLYRRHSGQPGSPAPDHR
       :. .:.::  .. . :        :.: :.:   : :  :::..:: .:    . . .  
CCDS34 PQPRPQDEPRAQ-QPR-------AQEP-PGRGPRVVPHEYMLSIYRTYSIAE-KLGINAS
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pF1KB7 LERAASRANTVRSFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQ
       . .... :::. ::  ...:..: .:  .  ....:..: .  .: ...:::..::.  .
CCDS34 FFQSSKSANTITSFV-DRGLDDLSHTPLRR-QKYLFDVSMLSDKEELVGAELRLFRQAPS
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pF1KB7 DALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVN-QNA--SRWESFDVTPAVMR
          :  ..  : ....  ..:           :::.: .. :.:  . :: :::  .. .
CCDS34 APWGPPAGPLH-VQLFPCLSPL----------LLDARTLDPQGAPPAGWEVFDVWQGLRH
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pF1KB7 --W--------TAQGHANHGFVVEVAHLEEKQ--------GVSKRHVRIS--RSL-----
         :        .: :. . : .   :.  ..         : ..: ::    :.:     
CCDS34 QPWKQLCLELRAAWGELDAGEAEARARGPQQPPPPDLRSLGFGRR-VRPPQERALLVVFT
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pF1KB7 -HQDEHSWSQIRPLLVTF-------GHDGKGHPLH-------------KREKRQA---KH
         : .. ....:  : .        : .:.  :               .:..: :   .:
CCDS34 RSQRKNLFAEMREQLGSAEAAGPGAGAEGSWPPPSGAPDARPWLPSPGRRRRRTAFASRH
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pF1KB7 KQR--KRLKSSCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAI
        .:  :. .  :...::.:.:...::.:::.::  :.:..:.: : ::: .::. :::::
CCDS34 GKRHGKKSRLRCSKKPLHVNFKELGWDDWIIAPLEYEAYHCEGVCDFPLRSHLEPTNHAI
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pF1KB7 VQTLVNSVN-SKIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
       .:::.::.. .. : .:::::.:. ::.::.: ...:: :.:.:::::.::::
CCDS34 IQTLMNSMDPGSTPPSCCVPTKLTPISILYIDAGNNVVYKQYEDMVVESCGCR
            410       420       430       440       450     

>>CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20               (501 aa)
 initn: 536 init1: 282 opt: 473  Z-score: 538.4  bits: 108.8 E(32554): 1.1e-23
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pF1KB7 LALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPT
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CCDS13 RPGGPEPKPGHPPQTRQATARTVTPKGQLPGGKAPPKAGSVPSSFLLKKAREPGPPREPK
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pF1KB7 -PSRDAVVPP--YMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELPETS
        : :   . :  :::.:::  : .    . .  ..  :. :::. ::     ...  .  
CCDS13 EPFRPPPITPHEYMLSLYRTLS-DADRKGGNSSVKLEAGLANTITSF-----IDKGQDDR
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pF1KB7 GKTTR--RFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATAN
       : ..:  :. :..:..  . .. .:::...:.. .:.    .    :    ..   .  .
CCDS13 GPVVRKQRYVFDISALEKDGLL-GAELRILRKKPSDTAKPAAPGGGRAAQLKL--SSCPS
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pF1KB7 SKFPVTRLLDTRLV-NQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVSKR
       .. :.. :::.: : . ..: :: ::.      .  ...    . .:.   :. ..:. :
CCDS13 GRQPAA-LLDVRSVPGLDGSGWEVFDIWKLFRNFKNSAQ----LCLELEAWERGRAVDLR
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pF1KB7 HV---RISRSLHQDE----HSWSQIRPLLVTF-----GHDGKG---HPLHKREKRQAK--
        .   : .:..:.       . .. : :. .      :.: :    . . .:.::.:   
CCDS13 GLGFDRAARQVHEKALFLVFGRTKKRDLFFNEIKARSGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLA
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pF1KB7 HKQRKR----LKSSCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTN
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CCDS13 TRQGKRPSKNLKARCSRKALHVNFKDMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTN
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pF1KB7 HAIVQTLVNSVNSK-IPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
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CCDS13 HAVIQTLMNSMDPESTPPTCCVPTRLSPISILFIDSANNVVYKQYEDMVVESCGCR
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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