FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7232, 396 aa
1>>>pF1KB7232 396 - 396 aa - 396 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7109+/-0.000725; mu= 15.4024+/- 0.044
mean_var=77.2623+/-15.089, 0's: 0 Z-trim(110.1): 43 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.145912
statistics sampled from 11341 (11384) to 11341 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.72), E-opt: 0.2 (0.35), width: 16
Scan time: 2.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 ( 396) 2695 576.5 1.5e-164
CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 ( 408) 1548 335.0 7.3e-92
CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 ( 364) 524 119.5 5.1e-27
CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 ( 513) 497 113.9 3.5e-25
CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 ( 402) 495 113.4 3.8e-25
CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 ( 402) 491 112.5 6.9e-25
CCDS13455.1 BMP7 gene_id:655|Hs108|chr20 ( 431) 489 112.1 9.8e-25
CCDS4958.1 BMP5 gene_id:653|Hs108|chr6 ( 454) 488 111.9 1.2e-24
CCDS34926.1 GDF6 gene_id:392255|Hs108|chr8 ( 455) 475 109.2 7.9e-24
CCDS13254.1 GDF5 gene_id:8200|Hs108|chr20 ( 501) 473 108.8 1.1e-23
CCDS1701.1 GDF7 gene_id:151449|Hs108|chr2 ( 450) 467 107.5 2.5e-23
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CCDS3588.1 BMP3 gene_id:651|Hs108|chr4 ( 472) 414 96.4 6e-20
CCDS73118.1 GDF2 gene_id:2658|Hs108|chr10 ( 429) 394 92.1 1e-18
CCDS5464.1 INHBA gene_id:3624|Hs108|chr7 ( 426) 393 91.9 1.2e-18
CCDS73117.1 GDF10 gene_id:2662|Hs108|chr10 ( 478) 390 91.3 2e-18
CCDS7304.1 NODAL gene_id:4838|Hs108|chr10 ( 347) 365 86.0 5.9e-17
CCDS14334.1 BMP15 gene_id:9210|Hs108|chrX ( 392) 360 85.0 1.3e-16
CCDS8939.1 INHBE gene_id:83729|Hs108|chr12 ( 350) 353 83.5 3.4e-16
CCDS42526.1 GDF1 gene_id:2657|Hs108|chr19 ( 372) 352 83.3 4.1e-16
CCDS2132.1 INHBB gene_id:3625|Hs108|chr2 ( 407) 347 82.2 9.3e-16
CCDS33031.1 TGFB1 gene_id:7040|Hs108|chr19 ( 390) 328 78.2 1.4e-14
CCDS8938.1 INHBC gene_id:3626|Hs108|chr12 ( 352) 306 73.6 3.3e-13
CCDS75299.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 366) 296 71.5 1.4e-12
CCDS2303.1 MSTN gene_id:2660|Hs108|chr2 ( 375) 295 71.3 1.7e-12
CCDS4162.1 GDF9 gene_id:2661|Hs108|chr5 ( 454) 296 71.5 1.7e-12
CCDS8891.1 GDF11 gene_id:10220|Hs108|chr12 ( 407) 293 70.9 2.5e-12
>>CCDS13099.1 BMP2 gene_id:650|Hs108|chr20 (396 aa)
initn: 2695 init1: 2695 opt: 2695 Z-score: 3067.8 bits: 576.5 E(32554): 1.5e-164
Smith-Waterman score: 2695; 100.0% identity (100.0% similar) in 396 aa overlap (1-396:1-396)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 LPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 KRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKSSCKRHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKSSCKRHP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 LYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKAC
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB7 CVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
370 380 390
>>CCDS9715.1 BMP4 gene_id:652|Hs108|chr14 (408 aa)
initn: 947 init1: 687 opt: 1548 Z-score: 1762.7 bits: 335.0 E(32554): 7.3e-92
Smith-Waterman score: 1650; 62.8% identity (82.0% similar) in 411 aa overlap (1-396:1-408)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGA--AGLVPELGRRKFAAA---SSGRPSSQPSDEVLSEFEL
:. :.: :...:: ::::::: :.:.:: :..: : ..:: :.: : :.: .::
CCDS97 MIPGNRMLMVVLLCQVLLGGASHASLIPETGKKKVAEIQGHAGGRRSGQ-SHELLRDFEA
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSG-----QPGSPAPDHRLERAASRANTVR
::.::::..:: ::..::.: :: :::: .:: : : . .. :: ::::::::
CCDS97 TLLQMFGLRRRPQPSKSAVIPDYMRDLYRLQSGEEEEEQIHSTGLEYP-ERPASRANTVR
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 SFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHHR
:::::: ::..: :: ... ::.::::::: .: :.::::..::::.... . .:: :
CCDS97 SFHHEEHLENIPGTSENSAFRFLFNLSSIPENEVISSAELRLFREQVDQGPDWERGFH-R
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB7 INIYEIIKP-ATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVE
:::::..:: : . .:::::::::..:..:::.:::.:::.::: . . :.:...:
CCDS97 INIYEVMKPPAEVVPGHLITRLLDTRLVHHNVTRWETFDVSPAVLRWTREKQPNYGLAIE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 VAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPL--HKREKRQAKHK
:.::.. . . .:::::::: : .:.:.:::::::::::.:: : ..: ::. ::.
CCDS97 VTHLHQTRTHQGQHVRISRSLPQGSGNWAQLRPLLVTFGHDGRGHALTRRRRAKRSPKHH
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 -QRKRLKS-SCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIV
:: : :. .:.:: ::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS97 SQRARKKNKNCRRHSLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYQAFYCHGDCPFPLADHLNSTNHAIV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390
pF1KB7 QTLVNSVNSKIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
:::::::::.::::::::::::::::::::: .::::::::.:::::::::
CCDS97 QTLVNSVNSSIPKACCVPTELSAISMLYLDEYDKVVLKNYQEMVVEGCGCR
360 370 380 390 400
>>CCDS8581.1 GDF3 gene_id:9573|Hs108|chr12 (364 aa)
initn: 462 init1: 462 opt: 524 Z-score: 598.5 bits: 119.5 E(32554): 5.1e-27
Smith-Waterman score: 569; 31.7% identity (62.4% similar) in 356 aa overlap (54-395:26-363)
30 40 50 60 70 80
pF1KB7 LVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLY
: .:...:: . :.:.. :: . ..
CCDS85 MLRFLPDLAFSFLLILALGQAVQFQEYVFLQFLGLDKAPSPQKFQPVPYILKKIF
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130
pF1KB7 --RRHSGQPGSPAPDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELP----ETSGKTTRRFFFNLS
:. .. : ... . :.:..: : .... : ..:. . ..::::
CCDS85 QDREAAATTGVSRDLCYVKELGVRGNVLR-FLPDQGFFLYPKKISQASSCLQKLLYFNLS
60 70 80 90 100 110
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 SIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNSSFHH----RINIYEIIKPATANSKFPVT-RLL
.: .: .: :.: . : :: :: .. .. .. . .: . .. : ...
CCDS85 AIKEREQLTLAQLGL------D-LGPNSYYNLGPELELALFLVQEPHVWGQTTPKPGKMF
120 130 140 150 160
200 210 220 230 240
pF1KB7 DTRLVN--QNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQ-GVSKRHVRISRS
: : :.: ... .::. :. . . : :. .:. :... ::. .
CCDS85 VLRSVPWPQGAVHFNLLDVAKD---WNDNPRKNFGLFLEILVKEDRDSGVNFQPEDTCAR
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAKHKQRKRLKSSCKRHPLYVDFSDVG
:. . :. :.::.. : . :: .:..: : . :. :.:: :...: :.:
CCDS85 LRCSLHA----SLLVVTLNPD-QCHP--SRKRRAAIPVPKLSCKNLCHRHQLFINFRDLG
230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSKIPKACCVPTELSAI
:. ::.:: :. : :::::::: :. :::.:.:..:.:...:. .::.: :.::.:: :
CCDS85 WHKWIIAPKGFMANYCHGECPFSLTISLNSSNYAFMQALMHAVDPEIPQAVCIPTKLSPI
280 290 300 310 320 330
370 380 390
pF1KB7 SMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
:::: :.:..:.:..:.::::. :::
CCDS85 SMLYQDNNDNVILRHYEDMVVDECGCG
340 350 360
>>CCDS4503.1 BMP6 gene_id:654|Hs108|chr6 (513 aa)
initn: 703 init1: 313 opt: 497 Z-score: 565.5 bits: 113.9 E(32554): 3.5e-25
Smith-Waterman score: 637; 34.5% identity (59.9% similar) in 357 aa overlap (65-395:170-512)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 AASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLLSMFGLKQRPTPSRDAVVPPYMLDLYRRHSGQPG-SP
:: : :. : .: ::. : ::
CCDS45 YNALSADNDEDGASEGERQQSWPHEAASSSQRRQPPPGAAHPLNRKSLLAPGSGSGGASP
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 APDHRLERAASRANTVRSFHHEESLEELPETSGKTTRRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVF
. . . :. : :: . .. . ..: ::::.:: : .:.::....
CCDS45 LTSAQDSAFLNDADMVMSFVNLVEYDKEFSPRQRHHKEFKFNLSQIPEGEVVTAAEFRIY
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 REQMQDALGNNSSFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAV
.. .. .. :.. . :.::.... . . :::::.: . : ::.: .
CCDS45 KDCVMGSFKNQTFL---ISIYQVLQE--HQHRDSDLFLLDTRVVWASEEGWLEFDITATS
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 MRWTAQGHANHGFVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKG
:.. . : :. . :. ..:: . : : . . .: .: :..:.: :
CCDS45 NLWVVTPQHNMGLQLSVV---TRDGV-HVHPRAAGLVGRDGPYDKQ--PFMVAF---FKV
320 330 340 350 360
280 290 300
pF1KB7 HPLHKREKRQAKHKQRKR------------------------LKSSCKRHPLYVDFSDVG
.: : :.:. ..:.. ::..:..: :::.:.:.:
CCDS45 SEVHVRTTRSASSRRRQQSRNRSTQSQDVARVSSASDYNSSELKTACRKHELYVSFQDLG
370 380 390 400 410 420
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 WNDWIVAPPGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVNSK-IPKACCVPTELSA
:.:::.:: :: : :: ::: ::: :.:.::::::::::. .: . .:: ::.::.:.:
CCDS45 WQDWIIAPKGYAANYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMNPEYVPKPCCAPTKLNA
430 440 450 460 470 480
370 380 390
pF1KB7 ISMLYLDENEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
::.::.:.: .:.::.:..:::..:::
CCDS45 ISVLYFDDNSNVILKKYRNMVVRACGCH
490 500 510
>>CCDS437.1 BMP8A gene_id:353500|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 572 init1: 285 opt: 495 Z-score: 564.9 bits: 113.4 E(32554): 3.8e-25
Smith-Waterman score: 616; 31.9% identity (60.5% similar) in 423 aa overlap (8-395:10-401)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLL
::.: : .: ::. :: : : :. . . . . . ..:
CCDS43 MAARPGPLWLLGLTL-CALGGGGPGLRPP----------PGCPQRRLGARERRDVQREIL
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB7 SMFGLKQRPTP------SR-DAVVPPYMLDLYRRHSG---QPGSPAPDHRLERAASRANT
...:: :: : :: : .: .:::::. .: . :.:: ..:: .::.
CCDS43 AVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDEDGAPA-EQRL----GRADL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 VRSFHHEESLEELPETSGKTT---RRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNS
: :: .. : .. :. ..: :.:..::. : .:.::..... : :
CCDS43 VMSF---VNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYKVPSIHLL--NR
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 SFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHG
..: ........ . .. .:: . . . : .::: : : . : . :
CCDS43 TLH--VSMFQVVQEQS--NRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKDLG
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KB7 FVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKG--------HPLH
. . : . :. ..:. . .: .. :: .:..::: . . . .::.
CCDS43 LRLYV-ETEDGHSVDPGLA----GLLGQRAPRSQ-QPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRPLR
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
pF1KB7 KRE-KRQAKHKQRKRL------------KSSCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAPPGYHAFY
.:. :.. . : .:: .. :.:: :::.:.:.:: ::..:: :: :.:
CCDS43 RRQPKKSNELPQANRLPGIFDDVRGSHGRQVCRRHELYVSFQDLGWLDWVIAPQGYSAYY
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 CHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSVN-SKIPKACCVPTELSAISMLYLDENEKVVLK
:.::: ::: . .:.:::::.:.::. .. . .:::::.::.::: :.:: : ...:.:.
CCDS43 CEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMKPNAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVILR
330 340 350 360 370 380
390
pF1KB7 NYQDMVVEGCGCR
....:::..:::
CCDS43 KHRNMVVKACGCH
390 400
>>CCDS444.1 BMP8B gene_id:656|Hs108|chr1 (402 aa)
initn: 580 init1: 285 opt: 491 Z-score: 560.3 bits: 112.5 E(32554): 6.9e-25
Smith-Waterman score: 617; 31.9% identity (59.8% similar) in 423 aa overlap (8-395:10-401)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MVAGTRCLLALLLPQVLLGGAAGLVPELGRRKFAAASSGRPSSQPSDEVLSEFELRLL
::.: : .: ::. :: : : :. . . . . . ..:
CCDS44 MTALPGPLWLLGLAL-CALGGGGPGLRPP----------PGCPQRRLGARERRDVQREIL
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KB7 SMFGLKQRPTP------SR-DAVVPPYMLDLYRRHSG---QPGSPAPDHRLERAASRANT
...:: :: : :: : .: .:::::. .: . :.:: :: .::.
CCDS44 AVLGLPGRPRPRAPPAASRLPASAPLFMLDLYHAMAGDDDEDGAPA-----ERRLGRADL
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 VRSFHHEESLEELPETSGKTT---RRFFFNLSSIPTEEFITSAELQVFREQMQDALGNNS
: :: .. : .. :. ..: :.:..::. : .:.::..... : :
CCDS44 VMSF---VNMVERDRALGHQEPHWKEFRFDLTQIPAGEAVTAAEFRIYKVPSIHLL--NR
110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 SFHHRINIYEIIKPATANSKFPVTRLLDTRLVNQNASRWESFDVTPAVMRWTAQGHANHG
..: ........ . .. .:: . . . : .::: : : . : . :
CCDS44 TLH--VSMFQVVQEQS--NRESDLFFLDLQTLRAGDEGWLVLDVTAASDCWLLKRHKDLG
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270
pF1KB7 FVVEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQIRPLLVTFGHDGKG--------HPLH
. . : . :. ..:. . .: .. :: .:..::: . . . .::.
CCDS44 LRLYV-ETEDGHSVDPGLA----GLLGQRAPRSQ-QPFVVTFFRASPSPIRTPRAVRPLR
220 230 240 250 260
280 290 300 310 320
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.:. :.. . : .:: .. :.:: :::.:.:.:: ::..:: :: :.:
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270 280 290 300 310 320
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:.::: ::: . .:.:::::.:.::. . . .:::::.::.::: :.:: : ...:.:.
CCDS44 CEGECSFPLDSCMNATNHAILQSLVHLMMPDAVPKACCAPTKLSATSVLYYDSSNNVILR
330 340 350 360 370 380
390
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CCDS44 KHRNMVVKACGCH
390 400
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.:. . . :.: :.::.:: : .:.::...... ... . .: .: ::..:...
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. . . :::.: . . : ::.: . .:... . : :. . : :. ..
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240 250 260 270 280 290
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: :.: :... :..:.: :. .: : :.. :::.. .:
CCDS13 INPKLAGLIGRHGPQNKQ------PFMVAFF---KATEVHFRSIRSTGSKQRSQNRSKTP
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.::.: :::.: :.::.:::.:: :: :.::.::: :::
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CCDS13 NSYMNATNHAIVQTLVHFINPETVPKPCCAPTQLNAISVLYFDDSSNVILKKYRNMVVRA
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CCDS13 CGCH
430
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. :.: . :.. : : . . :: : :.:..:: : .:.::..
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..... .. . :.. .:.::.::: : .. ::::: .. : ::.:
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220 230 240 250
pF1KB7 AVMRWTAQGHANHGFV------------VEVAHLEEKQGVSKRHVRISRSLHQDEHSWSQ
. .:. . . : :. :. : : .:: .... . .. .: .
CCDS49 TSNHWVINPQNNLGLQLCAETGDGRSINVKSAGLVGRQGPQSKQPFMVAFFKASEVLLRS
260 270 280 290 300 310
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 IRPLLVTFGHDGKGHPLHKREKRQAK--HKQRKRLKSSCKRHPLYVDFSDVGWNDWIVAP
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CCDS49 VRAANKRKNQNRNKSSSHQDSSRMSSVGDYNTSEQKQACKKHELYVSFRDLGWQDWIIAP
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320 330 340 350 360 370
pF1KB7 PGYHAFYCHGECPFPLADHLNSTNHAIVQTLVNSV-NSKIPKACCVPTELSAISMLYLDE
:: :::: ::: ::: :.:.::::::::::. . ...:: ::.::.:.:::.::.:.
CCDS49 EGYAAFYCDGECSFPLNAHMNATNHAIVQTLVHLMFPDHVPKPCCAPTKLNAISVLYFDD
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380 390
pF1KB7 NEKVVLKNYQDMVVEGCGCR
. .:.::.:..:::..:::
CCDS49 SSNVILKKYRNMVVRSCGCH
440 450
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:. .:.:: .. . : :.: :.: : : :::..:: .: . . .
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. .... :::. :: ...:..: .: . ....:..: . .: ...:::..::. .
CCDS34 FFQSSKSANTITSFV-DRGLDDLSHTPLRR-QKYLFDVSMLSDKEELVGAELRLFRQAPS
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CCDS34 QPWKQLCLELRAAWGELDAGEAEARARGPQQPPPPDLRSLGFGRR-VRPPQERALLVVFT
230 240 250 260 270 280
260 270 280
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: .. ....: : . : .:. : .:..: : .:
CCDS34 RSQRKNLFAEMREQLGSAEAAGPGAGAEGSWPPPSGAPDARPWLPSPGRRRRRTAFASRH
290 300 310 320 330 340
290 300 310 320 330 340
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CCDS34 GKRHGKKSRLRCSKKPLHVNFKELGWDDWIIAPLEYEAYHCEGVCDFPLRSHLEPTNHAI
350 360 370 380 390 400
350 360 370 380 390
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CCDS34 IQTLMNSMDPGSTPPSCCVPTKLTPISILYIDAGNNVVYKQYEDMVVESCGCR
410 420 430 440 450
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CCDS13 EPFRPPPITPHEYMLSLYRTLS-DADRKGGNSSVKLEAGLANTITSF-----IDKGQDDR
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220 230 240 250 260 270
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CCDS13 GRQPAA-LLDVRSVPGLDGSGWEVFDIWKLFRNFKNSAQ----LCLELEAWERGRAVDLR
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CCDS13 GLGFDRAARQVHEKALFLVFGRTKKRDLFFNEIKARSGQDDKTVYEYLFSQRRKRRAPLA
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CCDS13 TRQGKRPSKNLKARCSRKALHVNFKDMGWDDWIIAPLEYEAFHCEGLCEFPLRSHLEPTN
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]