Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7233
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7233, 449 aa
1>>>pF1KB7233 449 - 449 aa - 449 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.3519+/-0.00104; mu= 9.9093+/- 0.062
mean_var=186.5888+/-35.662, 0's: 0 Z-trim(111.3): 110 B-trim: 82 in 2/50
Lambda= 0.093893
statistics sampled from 12163 (12280) to 12163 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.724), E-opt: 0.2 (0.377), width: 16
Scan time: 2.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 ( 449) 2997 418.4 7.3e-117
CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 ( 456) 2729 382.1 6.3e-106
CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 ( 416) 1579 226.3 4.6e-59
CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 ( 404) 1569 224.9 1.2e-58
CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 ( 404) 1556 223.2 3.9e-58
CCDS11390.1 KRT34 gene_id:3885|Hs108|chr17 ( 436) 1554 222.9 5e-58
CCDS11393.1 KRT32 gene_id:3882|Hs108|chr17 ( 448) 1513 217.4 2.4e-56
CCDS11395.1 KRT36 gene_id:8689|Hs108|chr17 ( 467) 1495 215.0 1.3e-55
CCDS11394.2 KRT35 gene_id:3886|Hs108|chr17 ( 455) 1484 213.5 3.7e-55
CCDS42320.1 KRT40 gene_id:125115|Hs108|chr17 ( 431) 1342 194.2 2.2e-49
CCDS11382.1 KRT39 gene_id:390792|Hs108|chr17 ( 491) 1282 186.1 6.7e-47
CCDS11402.1 KRT17 gene_id:3872|Hs108|chr17 ( 432) 1060 156.0 6.9e-38
CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 1036 152.8 6.8e-37
CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 1034 152.5 8.4e-37
CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 1020 150.6 3.1e-36
CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 1016 150.1 4.6e-36
CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 1005 148.5 1.2e-35
CCDS11399.1 KRT19 gene_id:3880|Hs108|chr17 ( 400) 998 147.6 2.2e-35
CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 960 142.6 1e-33
CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 922 137.4 3.2e-32
CCDS11379.1 KRT20 gene_id:54474|Hs108|chr17 ( 424) 911 135.8 8.1e-32
CCDS11376.1 KRT28 gene_id:162605|Hs108|chr17 ( 464) 858 128.7 1.2e-29
CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 835 125.6 1.2e-28
CCDS11375.1 KRT27 gene_id:342574|Hs108|chr17 ( 459) 834 125.4 1.2e-28
CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 814 122.7 7.4e-28
CCDS11380.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 422) 809 122.0 1.2e-27
CCDS11373.1 KRT25 gene_id:147183|Hs108|chr17 ( 450) 804 121.3 1.9e-27
CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 798 120.7 4.3e-27
CCDS11374.1 KRT26 gene_id:353288|Hs108|chr17 ( 468) 788 119.2 9e-27
CCDS62182.1 KRT23 gene_id:25984|Hs108|chr17 ( 285) 621 96.4 4.1e-20
CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 574 90.2 4.8e-18
CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 558 88.0 2e-17
CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 558 88.0 2e-17
CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 558 88.0 2.1e-17
CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 555 87.7 3.2e-17
CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 546 86.5 7.9e-17
CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 543 86.0 9.4e-17
CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 535 84.9 1.9e-16
CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 535 84.9 1.9e-16
CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 530 84.3 3.1e-16
CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 527 83.9 4.2e-16
CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 525 83.6 4.8e-16
CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 521 83.2 8.6e-16
CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 520 83.0 8.9e-16
CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 516 82.4 1.3e-15
CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 515 82.3 1.4e-15
CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 514 82.2 1.5e-15
CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 513 82.0 1.6e-15
CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 512 81.8 1.7e-15
CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 511 81.7 1.9e-15
>>CCDS32653.1 KRT37 gene_id:8688|Hs108|chr17 (449 aa)
initn: 2997 init1: 2997 opt: 2997 Z-score: 2211.5 bits: 418.4 E(32554): 7.3e-117
Smith-Waterman score: 2997; 100.0% identity (100.0% similar) in 449 aa overlap (1-449:1-449)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTSFYSTSSCPLGCTMAPGARNVFVSPIDVGCQPVAEANAASMCLLANVAHANRVRVGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTSFYSTSSCPLGCTMAPGARNVFVSPIDVGCQPVAEANAASMCLLANVAHANRVRVGST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICGAYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 PLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICGAYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQSYFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQSYFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQID
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKLLDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKLLDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVLGEMRAQYEAMVETNHQDVEQWFQAQSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 NHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVLGEMRAQYEAMVETNHQDVEQWFQAQSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVERQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTELA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 GISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVERQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTELA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDVKARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDVKARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPC
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB7 STPASCTSCPSCGPVTGGSPSGHGASMGR
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STPASCTSCPSCGPVTGGSPSGHGASMGR
430 440
>>CCDS11392.1 KRT38 gene_id:8687|Hs108|chr17 (456 aa)
initn: 2873 init1: 2693 opt: 2729 Z-score: 2015.2 bits: 382.1 E(32554): 6.3e-106
Smith-Waterman score: 2729; 91.2% identity (95.6% similar) in 453 aa overlap (1-448:1-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MTSFYSTSSCPLGCTMAPGARNVFVSPIDVGCQPVAEANAASMCLLANVAHANRVRVGST
::: ::.:::::::::::::::: :::::.:::: :::: : ::::::::::::::::::
CCDS11 MTSSYSSSSCPLGCTMAPGARNVSVSPIDIGCQPGAEANIAPMCLLANVAHANRVRVGST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 PLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICGAYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYLE
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::.:::::::::::.:::::::::::
CCDS11 PLGRPSLCLPPTCHTACPLPGTCHIPGNIGICGAYGENTLNGHEKETMQFLNDRLANYLE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQSYFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQID
:::::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KVRQLEQENAELEATLLERSKCHESTVCPDYQSYFHTIEELQQKILCSKAENARLIVQID
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 NAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKLLDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKS
:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 NAKLAADDFRIKLESERSLRQLVEADKCGTQKLLDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 NHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVLGEMRAQYEAMVETNHQDVEQWFQAQSE
::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::::::::
CCDS11 NHEQEVKILRSQLGEKLRIELDIEPTIDLNRVLGEMRAQYEAMLETNRQDVEQWFQAQSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 GISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVERQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTELA
::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS11 GISLQDMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVERQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRFGTELA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 QMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDVKARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPC
::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QMQSLISNVEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDVKTRLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPC
370 380 390 400 410 420
430 440
pF1KB7 STPASCTS--C---PSCGPVTGGSPSGHGASMGR
:: ::.. : ::::: : .:. ... :
CCDS11 STSPSCVTAPCAPRPSCGPCTTCGPTCGASTTGSRF
430 440 450
>>CCDS11391.1 KRT31 gene_id:3881|Hs108|chr17 (416 aa)
initn: 1641 init1: 1526 opt: 1579 Z-score: 1173.8 bits: 226.3 E(32554): 4.6e-59
Smith-Waterman score: 1588; 62.4% identity (83.9% similar) in 386 aa overlap (64-440:19-401)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PVAEANAASMCLLANVAHANRVRVGSTPLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICG
:: :.::. :. : :::.:.::.:.. :.
CCDS11 MPYNFCLPSLSCRTSCSSRP--CVPPSCHS-CTLPGACNIPANVSNCN
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 AYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYLEKVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQS
. ....:: :::::.:::::::.:::::::::..:::::. . :::. .: .::.:::
CCDS11 WFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRERSQQQEPLLCPSYQS
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 YFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQIDNAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKL
::.:::::::::::.:.:::::.:::::::::::::: : ..: ::.::::.: : ...
CCDS11 YFKTIEELQQKILCTKSENARLVVQIDNAKLAADDFRTKYQTELSLRQLVESDINGLRRI
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKSNHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVL
::. :: :.::::: :::::: : :::::::::. :: :::... .:.: ::.::::::
CCDS11 LDELTLCKSDLEAQVESLKEELLCLKSNHEQEVNTLRCQLGDRLNVEVDAAPTVDLNRVL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GEMRAQYEAMVETNHQDVEQWFQAQSEGISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVE
.: :.::::.::::...::::: .:.: .. :..: ::.:: :.::.::: ::::::.:
CCDS11 NETRSQYEALVETNRREVEQWFTTQTEELNKQVVSSSEQLQSYQAEIIELRRTVNALEIE
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 RQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTELAQMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDV
::::.:.: :.:.: :.: ::...:.:.::::.:.: ::.:::.:::::::::::::::
CCDS11 LQAQHNLRDSLENTLTESEARYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRSDLERQNQEYQVLLDV
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440
pF1KB7 KARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPCSTPASCTS---------CPSCGPVTGGSPSGHG
.:::: :: :::.:::::::.:: :::.: .:.. : :: : . .:
CCDS11 RARLECEINTYRSLLESEDCNLPSNPCATTNACSKPIGPCLSNPCTSCVPPAPCTPCAPR
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 ASMGR
CCDS11 PRCGPCNSFVR
410
>>CCDS11388.1 KRT33A gene_id:3883|Hs108|chr17 (404 aa)
initn: 1581 init1: 1506 opt: 1569 Z-score: 1166.7 bits: 224.9 E(32554): 1.2e-58
Smith-Waterman score: 1569; 62.6% identity (83.9% similar) in 385 aa overlap (64-448:19-397)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PVAEANAASMCLLANVAHANRVRVGSTPLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICG
:: :.::. : .: :::.:.::.:.. :.
CCDS11 MSYSCGLPSLSCRTSCSSRP--CVPPSCH-GCTLPGACNIPANVSNCN
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 AYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYLEKVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQS
. ....:: :::::.:::::::.:::::::::..:::::. . :::. .: :: .:::
CCDS11 WFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRERSQQQEPLVCASYQS
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 YFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQIDNAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKL
::.:::::::::::::.:::::.:::::::::.:::: : :.: ::.::::.: : ...
CCDS11 YFKTIEELQQKILCSKSENARLVVQIDNAKLASDDFRTKYETELSLRQLVESDINGLRRI
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKSNHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVL
::. :: ..::::: :::::: : ::.::::::. :: :::... .:.: ::.:::.::
CCDS11 LDELTLCRSDLEAQVESLKEELLCLKQNHEQEVNTLRCQLGDRLNVEVDAAPTVDLNQVL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GEMRAQYEAMVETNHQDVEQWFQAQSEGISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVE
.: :.::::.::::...::::: .:.: .. :..: ::.:: :.::.::: ::::::.:
CCDS11 NETRSQYEALVETNRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQLQSYQAEIIELRRTVNALEIE
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 RQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTELAQMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDV
::::.:.: :.:.: :.: ::...:.:.: ::.:.: ::.:::.:::::::::::::::
CCDS11 LQAQHNLRDSLENTLTESEARYSSQLSQVQRLITNVESQLAEIRSDLERQNQEYQVLLDV
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440
pF1KB7 KARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPCSTPASCTSCPSCGPVTGGSPSGHGASMGR
.:::: :: :::.:::::::::: :::.: .: . : :: . .: : : :
CCDS11 RARLECEINTYRSLLESEDCKLPSNPCATTNACDK--STGPCIS-NPCGLRARCGPCNTF
350 360 370 380 390 400
CCDS11 GY
>>CCDS11389.1 KRT33B gene_id:3884|Hs108|chr17 (404 aa)
initn: 1596 init1: 1506 opt: 1556 Z-score: 1157.2 bits: 223.2 E(32554): 3.9e-58
Smith-Waterman score: 1556; 62.1% identity (84.6% similar) in 383 aa overlap (64-440:19-398)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PVAEANAASMCLLANVAHANRVRVGSTPLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICG
:: :.::. : . :::.:.::.:.. :.
CCDS11 MPYNFCLPSLSCRTSCSSRP--CVPPSCH-GYTLPGACNIPANVSNCN
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 AYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYLEKVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQS
. ....:: :::::.:::::::.:::::::::..:::::. . :::. .: .::.:::
CCDS11 WFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELENLIRERSQQQEPLLCPSYQS
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 YFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQIDNAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKL
::.:::::::::::::.:::::.:::::::::::::: : ..:.::.::::.: . ...
CCDS11 YFKTIEELQQKILCSKSENARLVVQIDNAKLAADDFRTKYQTEQSLRQLVESDINSLRRI
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKSNHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVL
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CCDS11 LDELTLCRSDLEAQMESLKEELLSLKQNHEQEVNTLRCQLGDRLNVEVDAAPAVDLNQVL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GEMRAQYEAMVETNHQDVEQWFQAQSEGISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVE
.: : ::::.::::...::::: .:.: .. :..: ::.:: :.::.::: ::::::.:
CCDS11 NETRNQYEALVETNRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQLQSYQAEIIELRRTVNALEIE
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 RQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTELAQMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDV
::::.:. :.:.: :.: ::...:.:.::::.:.: ::.:::.:::::::::::::::
CCDS11 LQAQHNLRYSLENTLTESEARYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRSDLERQNQEYQVLLDV
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440
pF1KB7 KARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPCSTPASCT----SCPS--CGPVTGGSPSGHGASM
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CCDS11 RARLECEINTYRSLLESEDCKLPSNPCATTNACEKPIGSCVTNPCGPRSRCGPCNTFGY
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 GR
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40 50 60 70 80 90
pF1KB7 PVAEANAASMCLLANVAHANRVRVGSTPLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICG
:: :.::. : . :::.:.::.:.. :.
CCDS11 QLTCFSITCSSTMSYSCCLPSLGCRTSCSSRP--CVPPSCH-GYTLPGACNIPANVSNCN
40 50 60 70 80
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pF1KB7 AYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYLEKVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQS
. ....:: :::::.:::::::.:::::::::..::::: . :::. .: .::.:::
CCDS11 WFCEGSFNGSEKETMQFLNDRLASYLEKVRQLERDNAELEKLIQERSQQQEPLLCPSYQS
90 100 110 120 130 140
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pF1KB7 YFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQIDNAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKL
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CCDS11 YFKTIEELQQKILCAKAENARLVVNIDNAKLASDDFRSKYQTEQSLRLLVESDINSIRRI
150 160 170 180 190 200
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pF1KB7 LDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKSNHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVL
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CCDS11 LDELTLCKSDLESQVESLREELICLKKNHEEEVNTLRSQLGDRLNVEVDTAPTVDLNQVL
210 220 230 240 250 260
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 GEMRAQYEAMVETNHQDVEQWFQAQSEGISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVE
.: :.::::.:: :...::::: .:.: .. :..: ::.:: ::.::.::: ::::::.:
CCDS11 NETRSQYEALVEINRREVEQWFATQTEELNKQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIE
270 280 290 300 310 320
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pF1KB7 RQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTELAQMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDV
::::.:.: :.:.: :.: .:...:.:.::::.:.: ::.::: :::::::::::::::
CCDS11 LQAQHNLRDSLENTLTESEAHYSSQLSQVQSLITNVESQLAEIRCDLERQNQEYQVLLDV
330 340 350 360 370 380
400 410 420 430 440
pF1KB7 KARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPCSTP-ASCTSCPSCGPVTGGSPSGHGASMGR
.:::: :: :::.::::::::::::::.: :: .:: :: :
CCDS11 RARLECEINTYRSLLESEDCKLPCNPCATTNASGNSCGPCGTSQKGCCN
390 400 410 420 430
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40 50 60 70 80
pF1KB7 VAEANAASMCLLANVAHANRVRVGSTPLGRPSLCLPPTSHTA-C----PLPGTCH----I
::.::: : . : : : ..:. :
CCDS11 CPRPASVCSSGVNCRPELCLGYVCQPMACLPSVCLPTTFRPASCLSKTYLSSSCQAASGI
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pF1KB7 PGNIGICGAYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYLEKVRQLEQENAELETTLLERSKCHES
:..: . :.....::.:::::.:::::::.:: .::::::::::::. . : :. .
CCDS11 SGSMGPGSWYSEGAFNGNEKETMQFLNDRLASYLTRVRQLEQENAELESRIQEASHSQVL
80 90 100 110 120 130
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pF1KB7 TVCPDYQSYFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQIDNAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEA
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CCDS11 TMTPDYQSHFRTIEELQQKILCTKAENARMVVNIDNAKLAADDFRAKYEAELAMRQLVEA
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 DKCGTQKLLDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLKSNHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEP
: : ...::: :: ::::::: :::::: . ::.:::.:: :: :::... ::.: :
CCDS11 DINGLRRILDDLTLCKADLEAQVESLKEELMCLKKNHEEEVGSLRCQLGDRLNIEVDAAP
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 TIDLNRVLGEMRAQYEAMVETNHQDVEQWFQAQSEGISLQAMSCSEELQCCQSEILELRC
.::.::: ::: :::::::.:..:::.::. : : .. :. . ::.:: ::.:..::
CCDS11 PVDLTRVLEEMRCQYEAMVEANRRDVEEWFNMQMEELNQQVATSSEQLQNYQSDIIDLRR
260 270 280 290 300 310
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pF1KB7 TVNALEVERQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTELAQMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQ
:::.::.: ::::.:.: :.:.: :.: ::...::::: .:.:.: ::.:::::::::::
CCDS11 TVNTLEIELQAQHSLRDSLENTLTESEARYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQ
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 EYQVLLDVKARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNPCSTPASCTSC-PS-CGPVTGGSPSGH
::::::::.::::.:: :::.:::.::::::::::::: :::.: :: : : : :
CCDS11 EYQVLLDVRARLEGEINTYRSLLENEDCKLPCNPCSTP-SCTTCVPSPCVPRTVCVPRTV
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 GASMGR
:
CCDS11 GMPCSPCPQGRY
440
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MTSFYSTSSCPLGCTMAPGARNVFVSPIDVG-CQPVAEANAASMCLLANVAHANR
: .::.: : : : : : .:: :. . :.::. . .
CCDS11 MATQTCTPTFSTGSIKGLCGTAGGISRV-SSIRSVGSCRVPSLAGAAG--------YISS
10 20 30 40 50
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pF1KB7 VRVGSTPLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICGAYGKNTLNGHEKETMKFLNDR
.: : . :: ::: . : . :: : .: : . ....:: :::::.:::::
CCDS11 ARSGLSGLGS---CLPGSY-----LSSECHTSGFVGSGGWFCEGSFNGSEKETMQFLNDR
60 70 80 90 100
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pF1KB7 LANYLEKVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQSYFRTIEELQQKILCSKAENAR
::::::::::::.::::::. . : . . .::::::::.:::..::::: .:.::::
CCDS11 LANYLEKVRQLERENAELESRIQEWYEFQIPYICPDYQSYFKTIEDFQQKILLTKSENAR
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 LIVQIDNAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKLLDDATLAKADLEAQQESLKEE
:..::::::::::::: : :.: ::.:::::: : ...::. :: ::::::: ::::::
CCDS11 LVLQIDNAKLAADDFRTKYETELSLRQLVEADINGLRRILDELTLCKADLEAQVESLKEE
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 QLSLKSNHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVLGEMRAQYEAMVETNHQDVEQW
. ::.:::.::..:: :::... .:.: : .:::..: .:: ::::.::.:..::: :
CCDS11 LMCLKKNHEEEVSVLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNKILEDMRCQYEALVENNRRDVEAW
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 FQAQSEGISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVERQAQHTLKDCLQNSLCEAEDR
:..:.: .. :..: ::.:::::.::.::: ::::::.: ::::.... :...: :.: :
CCDS11 FNTQTEELNQQVVSSSEQLQCCQTEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRNSLESTLAETEAR
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:...::::: ::::.: :::::: ::::::::::::::::::::.::::::.:::.::::
CCDS11 YSSQLAQMQCLISNVEAQLSEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEIATYRHLLEGEDCK
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pF1KB7 LPCNPCSTPAS-CTSCPSCGPVTGGSPSGHGASMGR
:: .::.: . :: ::
CCDS11 LPPQPCATACKPVIRVPSVPPVPCVPSVPCTPAPQVGTQIRTITEEIRDGKVISSREHVQ
410 420 430 440 450 460
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pF1KB7 MTSFYSTSSCPLGCTMAPGARNVFVSPIDV--GCQPVAEANAASMCLLANVAHANR-VRV
: : . . . :: . : :. ..: : : ... . : .
CCDS11 MASKCLKAGFSSGSLKSPGGASGGSTRVSAMYSSSSCKLPSLSPVARSFSA
10 20 30 40 50
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pF1KB7 GSTPLGRPSL----CLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICGAYGKNTLNGHEKETMKFLND
:. ::: : ::: : ::. . : : .:.. :.:.:::::. :::
CCDS11 CSVGLGRSSYRATSCLPAL----C-LPAGGFATSYSGGGGWFGEGILTGNEKETMQSLND
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pF1KB7 RLANYLEKVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQSYFRTIEELQQKILCSKAENA
:::.::::::::::::: ::. . : . . .:::::::::::::::.: ::::::::
CCDS11 RLAGYLEKVRQLEQENASLESRIREWCEQQVPYMCPDYQSYFRTIEELQKKTLCSKAENA
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 RLIVQIDNAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKLLDDATLAKADLEAQQESLKE
::.:.:::::::::::: : :.: ::.::::.: : ...::: :: :.::::: :::::
CCDS11 RLVVEIDNAKLAADDFRTKYETEVSLRQLVESDINGLRRILDDLTLCKSDLEAQVESLKE
170 180 190 200 210 220
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pF1KB7 EQLSLKSNHEQEVKILRSQLGEKFRIELDIEPTIDLNRVLGEMRAQYEAMVETNHQDVEQ
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CCDS11 ELLCLKKNHEEEVNSLRCQLGDRLNVEVDAAPPVDLNRVLEEMRCQYETLVENNRRDAED
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 WFQAQSEGISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVERQAQHTLKDCLQNSLCEAED
:...::: .. :..: ::.:: ::.::.::: ::::::.: ::::...: :...: :.:
CCDS11 WLDTQSEELNQQVVSSSEQLQSCQAEIIELRRTVNALEIELQAQHSMRDALESTLAETEA
290 300 310 320 330 340
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pF1KB7 RYGTELAQMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDVKARLENEIATYRNLLESEDC
::...::::: .:.:.: ::.:::::::::::::::::::.:::: :: :::.::::::
CCDS11 RYSSQLAQMQCMITNVEAQLAEIRADLERQNQEYQVLLDVRARLECEINTYRGLLESEDS
350 360 370 380 390 400
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pF1KB7 KLPCNPCS---TPA-SCTSC-P--SCGPVTGGSPSGHGASMGR
:::::::. .:. :: : : ::::
CCDS11 KLPCNPCAPDYSPSKSCLPCLPAASCGPSAARTNCSPRPICVPCPGGRF
410 420 430 440 450
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10 20 30 40 50
pF1KB7 MTSFYSTSSC-PLGCTMAPGARNVFVSPIDVGCQPVAEANAASMCLLANVAHANRVRVGS
::: :.. : : .: : : . ....: : . :.: : . .: .:
CCDS42 MTSDCSSTHCSPESCGTASGCAPASSCSVETACLP--GTCATSRCQTPSFLSRSRGLTG-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 TPLGRPSLCLPPTSHTACPLPGTCHIPGNIGICGAYGKNTLNGHEKETMKFLNDRLANYL
:: : : . :.:. : .: :. ......:::::.:::::::.::
CCDS42 --------CLLP-----CYFTGSCNSPCLVGNCAWCEDGVFTSNEKETMQFLNDRLASYL
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 EKVRQLEQENAELETTLLERSKCHESTVCPDYQSYFRTIEELQQKILCSKAENARLIVQI
::::.::. :::::. . :. . :::::: :: :::.:::::::.::::.:: ::.
CCDS42 EKVRSLEETNAELESRIQEQCEQDIPMVCPDYQRYFNTIEDLQQKILCTKAENSRLAVQL
110 120 130 140 150 160
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pF1KB7 DNAKLAADDFRIKLESERSLHQLVEADKCGTQKLLDDATLAKADLEAQQESLKEEQLSLK
:: :::.:::. : ::: ::.::.::: . . .:.. :: :.::::. :::::. : ::
CCDS42 DNCKLATDDFKSKYESELSLRQLLEADISSLHGILEELTLCKSDLEAHVESLKEDLLCLK
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CCDS42 KNHEEEVNLLREQLGDRLSVELDTAPTLDLNRVLDEMRCQCETVLANNRREAEEWLAVQT
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 EGISLQAMSCSEELQCCQSEILELRCTVNALEVERQAQHTLKDCLQNSLCEAEDRYGTEL
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CCDS42 EELNQQQLSSAEQLQGCQMEILELKRTASALEIELQAQQSLTESLECTVAETEAQYSSQL
290 300 310 320 330 340
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pF1KB7 AQMQSLISNLEEQLSEIRADLERQNQEYQVLLDVKARLENEIATYRNLLESEDCKLPCNP
::.: ::.:::.::.::: ::::::::::::::::::::.:: :: .::.::: .: :.:
CCDS42 AQIQCLIDNLENQLAEIRCDLERQNQEYQVLLDVKARLEGEINTYWGLLDSEDSRLSCSP
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pF1KB7 CSTPASCTSCPSCGPVTGGSPSGHGASMGR
::: .::: .: : .
CCDS42 CST--TCTSSNTCEPCSAYVICTVENCCL
410 420 430
449 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 06:10:00 2016 done: Fri Nov 4 06:10:00 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]