Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7245
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7245, 307 aa
1>>>pF1KB7245 307 - 307 aa - 307 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6287+/-0.0012; mu= 13.7763+/- 0.070
mean_var=183.6835+/-67.882, 0's: 0 Z-trim(103.1): 387 B-trim: 444 in 1/45
Lambda= 0.094632
statistics sampled from 6775 (7260) to 6775 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.578), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 2.140
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 ( 307) 2025 289.7 1.9e-78
CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 ( 310) 1631 235.9 3e-62
CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 ( 314) 1373 200.7 1.2e-51
CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 ( 311) 1351 197.7 9.6e-51
CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 ( 311) 1323 193.9 1.4e-49
CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 ( 314) 1322 193.7 1.5e-49
CCDS31699.1 OR4D5 gene_id:219875|Hs108|chr11 ( 318) 1235 181.9 5.7e-46
CCDS32020.1 OR4Q3 gene_id:441669|Hs108|chr14 ( 313) 1174 173.5 1.8e-43
CCDS32031.1 OR4N5 gene_id:390437|Hs108|chr14 ( 308) 1151 170.4 1.6e-42
CCDS32021.1 OR4M1 gene_id:441670|Hs108|chr14 ( 313) 1144 169.4 3.1e-42
CCDS32022.1 OR4N2 gene_id:390429|Hs108|chr14 ( 307) 1124 166.7 2e-41
CCDS32172.1 OR4M2 gene_id:390538|Hs108|chr15 ( 313) 1084 161.2 9e-40
CCDS32173.1 OR4N4 gene_id:283694|Hs108|chr15 ( 316) 1081 160.8 1.2e-39
CCDS32027.1 OR4K14 gene_id:122740|Hs108|chr14 ( 310) 1079 160.6 1.4e-39
CCDS32343.1 OR4F4 gene_id:26682|Hs108|chr15 ( 305) 1073 159.7 2.5e-39
CCDS30547.1 OR4F5 gene_id:79501|Hs108|chr1 ( 305) 1061 158.1 7.8e-39
CCDS32854.1 OR4F17 gene_id:81099|Hs108|chr19 ( 305) 1061 158.1 7.8e-39
CCDS41916.1 OR4E2 gene_id:26686|Hs108|chr14 ( 313) 1060 158.0 8.7e-39
CCDS32028.1 OR4K13 gene_id:390433|Hs108|chr14 ( 304) 1055 157.3 1.4e-38
CCDS31505.1 OR4S2 gene_id:219431|Hs108|chr11 ( 311) 1040 155.2 5.8e-38
CCDS31500.1 OR4A15 gene_id:81328|Hs108|chr11 ( 344) 1035 154.6 9.8e-38
CCDS32029.1 OR4L1 gene_id:122742|Hs108|chr14 ( 312) 1029 153.7 1.6e-37
CCDS31489.1 OR4C3 gene_id:256144|Hs108|chr11 ( 329) 1021 152.7 3.6e-37
CCDS32023.1 OR4K2 gene_id:390431|Hs108|chr14 ( 314) 1020 152.5 3.9e-37
CCDS32024.1 OR4K5 gene_id:79317|Hs108|chr14 ( 323) 1020 152.5 3.9e-37
CCDS32026.1 OR4K15 gene_id:81127|Hs108|chr14 ( 348) 1020 152.6 4.1e-37
CCDS31488.1 OR4S1 gene_id:256148|Hs108|chr11 ( 309) 1016 152.0 5.6e-37
CCDS32025.1 OR4K1 gene_id:79544|Hs108|chr14 ( 311) 1014 151.7 6.8e-37
CCDS31485.1 OR4B1 gene_id:119765|Hs108|chr11 ( 309) 1010 151.1 9.9e-37
CCDS32341.1 OR4F6 gene_id:390648|Hs108|chr15 ( 312) 1010 151.1 9.9e-37
CCDS31490.1 OR4A47 gene_id:403253|Hs108|chr11 ( 309) 1007 150.7 1.3e-36
CCDS31501.1 OR4C15 gene_id:81309|Hs108|chr11 ( 370) 1008 151.0 1.3e-36
CCDS31503.1 OR4C11 gene_id:219429|Hs108|chr11 ( 310) 1002 150.0 2.1e-36
CCDS32342.1 OR4F15 gene_id:390649|Hs108|chr15 ( 312) 1000 149.8 2.6e-36
CCDS31506.1 OR4C6 gene_id:219432|Hs108|chr11 ( 309) 999 149.6 2.8e-36
CCDS31504.1 OR4P4 gene_id:81300|Hs108|chr11 ( 312) 992 148.7 5.4e-36
CCDS73288.1 OR4C46 gene_id:119749|Hs108|chr11 ( 309) 989 148.3 7.2e-36
CCDS72675.1 OR4F29 gene_id:729759|Hs108|chr1 ( 312) 981 147.2 1.5e-35
CCDS43415.1 OR4F3 gene_id:26683|Hs108|chr5 ( 312) 981 147.2 1.5e-35
CCDS41221.1 OR4F16 gene_id:81399|Hs108|chr1 ( 312) 981 147.2 1.5e-35
CCDS34792.1 OR4F21 gene_id:441308|Hs108|chr8 ( 312) 978 146.8 2e-35
CCDS31487.1 OR4X1 gene_id:390113|Hs108|chr11 ( 305) 970 145.7 4.3e-35
CCDS73289.1 OR4A5 gene_id:81318|Hs108|chr11 ( 315) 964 144.9 7.7e-35
CCDS31495.1 OR4C13 gene_id:283092|Hs108|chr11 ( 309) 960 144.3 1.1e-34
CCDS32030.1 OR4K17 gene_id:390436|Hs108|chr14 ( 343) 957 144.0 1.6e-34
CCDS31499.1 OR4A16 gene_id:81327|Hs108|chr11 ( 328) 949 142.8 3.3e-34
CCDS31496.1 OR4C12 gene_id:283093|Hs108|chr11 ( 309) 938 141.3 9e-34
CCDS4657.1 OR5V1 gene_id:81696|Hs108|chr6 ( 321) 911 137.6 1.2e-32
CCDS31815.1 OR10A7 gene_id:121364|Hs108|chr12 ( 316) 898 135.9 4e-32
CCDS32047.1 OR10G2 gene_id:26534|Hs108|chr14 ( 310) 892 135.0 7e-32
>>CCDS32688.1 OR4D2 gene_id:124538|Hs108|chr17 (307 aa)
initn: 2025 init1: 2025 opt: 2025 Z-score: 1521.9 bits: 289.7 E(32554): 1.9e-78
Smith-Waterman score: 2025; 100.0% identity (100.0% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPGEARRKAASTC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPGEARRKAASTC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LGRHRLV
:::::::
CCDS32 LGRHRLV
>>CCDS42365.1 OR4D1 gene_id:26689|Hs108|chr17 (310 aa)
initn: 1657 init1: 1631 opt: 1631 Z-score: 1231.1 bits: 235.9 E(32554): 3e-62
Smith-Waterman score: 1631; 79.9% identity (93.1% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
:: : : :: ::.::.:::.:::.::::.::.::.::..::.::..::: : .::::::
CCDS42 MEPQNTTQVSMFVLLGFSQTQELQKFLFLLFLLVYVTTIVGNLLIMVTVTFDCRLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
:::::::..:::.:.::.::::::.: : :::::::::.::::::.:::. ::::::::.
CCDS42 FLLRNLALIDLCYSTVTSPKMLVDFLHETKTISYQGCMAQIFFFHLLGGGTVFFLSVMAY
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130 140 150 160 170 180
pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
:: ::::.::::::.::::: ::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::
CCDS42 DRYIAISQPLRYVTIMNTQLCVGLVVAAWVGGFVHSIVQLALILPLPFCGPNILDNFYCD
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pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPGEARRKAASTC
:::::::::::::::::: ::::::: ..::.:::.:: :::::::: :.:::::::::
CCDS42 VPQVLRLACTDTSLLEFLMISNSGLLVIIWFLLLLISYTVILVMLRSHSGKARRKAASTC
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250 260 270 280 290 300
pF1KB7 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
:::::::::::.: ::.:. ::::: ::: :::..:::::::::::::::::::.::.::
CCDS42 TTHIIVVSMIFIPCIYIYTWPFTPFLMDKAVSISYTVMTPMLNPMIYTLRNQDMKAAMRR
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LGRHRLV
::.
CCDS42 LGKCLVICRE
310
>>CCDS31564.1 OR4D9 gene_id:390199|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1371 init1: 1345 opt: 1373 Z-score: 1040.7 bits: 200.7 E(32554): 1.2e-51
Smith-Waterman score: 1373; 65.0% identity (87.8% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
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CCDS31 MDQRNYTRVKEFTFLGITQSRELSQVLFTFLFLVYMTTLMGNFLIMVTVTCESHLHTPMY
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pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
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CCDS31 FLLRNLSILDICFSSITAPKVLIDLLSETKTISFSGCVTQMFFFHLLGGADVFSLSVMAF
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pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
:: ::::.::.:.:.:. .::.::.:::::::::.:..:.:::::::::.::.::::
CCDS31 DRYIAISKPLHYMTIMSRGRCTGLIVASWVGGFVHSIAQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPGEARRKAASTC
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CCDS31 VPQVLKLACTDTFTLELLMISNNGLVSWFVFFFLLISYTVILMMLRSHTGEGRRKAISTC
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pF1KB7 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
:.:: ::.. ::: ::.:::::: .: : .:. ::..:.:::.:::::::.:. :.:.
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTDTAISVTFTVISPLLNPIIYTLRNQEMKLAMRK
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LGRHRLV
: :
CCDS31 LKRRLGQSERILIQ
310
>>CCDS31563.1 OR4D11 gene_id:219986|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1398 init1: 1346 opt: 1351 Z-score: 1024.5 bits: 197.7 E(32554): 9.6e-51
Smith-Waterman score: 1351; 63.8% identity (87.6% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
:: ::.: :..:.::::.:... . :::.. .::.::..::.::..::: .:.::::::
CCDS31 MELGNVTRVKEFIFLGLTQSQDQSLVLFLFLCLVYMTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
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pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
:::::::.::.::::.::::.:.::::.:::::: .:: :::.::.:::: .: ::::::
CCDS31 FLLRNLAILDICFSSTTAPKVLLDLLSKKKTISYTSCMTQIFLFHLLGGADIFSLSVMAF
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pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
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CCDS31 DCYMAISKPLHYVTIMSRGQCTALISASWMGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
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pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPGEARRKAASTC
:::::.:.:::: :::: :::.::. ..::..::.:: ::. :::. : .:::: :::
CCDS31 VPQVLKLTCTDTFALEFLMISNNGLVTTLWFIFLLVSYTVILMTLRSQAGGGRRKAISTC
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pF1KB7 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
:.:: ::.. ::: ::.:::::: .: .: .:. ::..:.:::.:::::::.:..:.::
CCDS31 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPTEKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNQEMKSAMRR
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LGRHRLV
: : :::
CCDS31 LKR-RLVPSERE
310
>>CCDS53636.1 OR4D10 gene_id:390197|Hs108|chr11 (311 aa)
initn: 1390 init1: 1318 opt: 1323 Z-score: 1003.9 bits: 193.9 E(32554): 1.4e-49
Smith-Waterman score: 1323; 62.2% identity (88.3% similar) in 307 aa overlap (1-307:1-306)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
:: : : :..:.::::.:.::.. :::..:.::.::..::.::..::: .:.::::::
CCDS53 MEMENCTRVKEFIFLGLTQNREVSLVLFLFLLLVYVTTLLGNLLIMVTVTCESRLHTPMY
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pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
:::.::.. :.::::.:.::.:::::::.::::.. :. :.:.::..::. :: :::::.
CCDS53 FLLHNLSIADICFSSITVPKVLVDLLSERKTISFNHCFTQMFLFHLIGGVDVFSLSVMAL
70 80 90 100 110 120
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pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
:: .:::.::.:.:.:. . .::.::.:.:::::::::..:.:::::::::.::.::::
CCDS53 DRYVAISKPLHYATIMSRDHCIGLTVAAWLGGFVHSIVQISLLLPLPFCGPNVLDTFYCD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPGEARRKAASTC
: .::.:: :: .::.: :::.::: ..::::::.::. :: . .:. ::.:::: :::
CCDS53 VHRVLKLAHTDIFILELLMISNNGLLTTLWFFLLLVSYIVILSLPKSQAGEGRRKAISTC
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pF1KB7 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
:.:: ::.. ::: ::.:::::: .:::: .:. ::..:.:::.::::::..:..:.::
CCDS53 TSHITVVTLHFVPCIYVYARPFTALPMDKAISVTFTVISPLLNPLIYTLRNHEMKSAMRR
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LGRHRLV
: : :::
CCDS53 LKR-RLVPSDRK
310
>>CCDS31562.1 OR4D6 gene_id:219983|Hs108|chr11 (314 aa)
initn: 1326 init1: 1299 opt: 1322 Z-score: 1003.1 bits: 193.7 E(32554): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 1322; 62.4% identity (86.1% similar) in 303 aa overlap (1-303:1-303)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
:. : : :..: :: :...:::. :::..:. ::..::.:: ::..:.: .:.::::::
CCDS31 MDQINHTNVKEFFFLELTRSRELEFFLFVVFFAVYVATVLGNALIVVTITCESRLHTPMY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]