Result of FASTA (omim) for
pF1KB7245
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7245, 307 aa
1>>>pF1KB7245 307 - 307 aa - 307 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1572+/-0.000493; mu= 16.5857+/- 0.031
mean_var=117.0878+/-34.532, 0's: 0 Z-trim(108.7): 306 B-trim: 1058 in 1/49
Lambda= 0.118527
statistics sampled from 16306 (16779) to 16306 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.197), width: 16
Scan time: 5.840
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C4 ( 309) 989 180.9 2.8e-45
NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [ ( 317) 827 153.3 6.1e-37
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XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory r ( 317) 821 152.2 1.2e-36
NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [H ( 317) 821 152.2 1.2e-36
NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G ( 307) 816 151.4 2.2e-36
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NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [H ( 314) 810 150.3 4.6e-36
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NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [H ( 312) 794 147.6 3e-35
XP_011520808 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory r ( 322) 794 147.6 3.1e-35
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NP_001004729 (OMIM: 615702) olfactory receptor 5AN ( 311) 778 144.9 2e-34
NP_001005191 (OMIM: 611538) olfactory receptor 7D4 ( 312) 774 144.2 3.2e-34
NP_001005216 (OMIM: 615016,615082) olfactory recep ( 311) 772 143.8 4.1e-34
XP_011513214 (OMIM: 600578) PREDICTED: olfactory r ( 300) 763 142.3 1.2e-33
NP_003691 (OMIM: 608494) olfactory receptor 2D2 [H ( 308) 762 142.1 1.3e-33
NP_002539 (OMIM: 164342) olfactory receptor 1D2 [H ( 312) 760 141.8 1.7e-33
NP_003687 (OMIM: 608495) olfactory receptor 6A2 [H ( 327) 732 137.0 4.8e-32
NP_001001957 (OMIM: 616729) olfactory receptor 2W3 ( 314) 724 135.6 1.2e-31
NP_689643 (OMIM: 611267) olfactory receptor 51E1 [ ( 318) 508 98.7 1.6e-20
NP_110401 (OMIM: 611268) olfactory receptor 51E2 [ ( 320) 473 92.7 1e-18
XP_011535421 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 671) 222 50.2 1.3e-05
XP_005268094 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) P ( 764) 222 50.3 1.5e-05
NP_000360 (OMIM: 275200,603372,603373,609152) thyr ( 764) 222 50.3 1.5e-05
NP_612200 (OMIM: 609333) trace amine-associated re ( 339) 213 48.3 2.6e-05
NP_150598 (OMIM: 606665) melanopsin isoform 1 [Hom ( 478) 195 45.4 0.00027
XP_016872445 (OMIM: 606665) PREDICTED: melanopsin ( 528) 195 45.5 0.00028
NP_063941 (OMIM: 155540,602025,607948) melanocorti ( 323) 189 44.2 0.00043
NP_006574 (OMIM: 605224) visual pigment-like recep ( 337) 186 43.7 0.00063
NP_001265428 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 186 43.8 0.00071
NP_001265427 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 186 43.8 0.00071
NP_001265429 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 186 43.8 0.00071
NP_001265426 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a ( 412) 186 43.8 0.00071
NP_000666 (OMIM: 102776) adenosine receptor A2a [H ( 412) 186 43.8 0.00071
XP_011508791 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 313) 183 43.1 0.00086
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XP_006712259 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 333) 183 43.2 0.00089
XP_006712258 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 370) 183 43.2 0.00095
XP_011508790 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 376) 183 43.2 0.00096
XP_011508789 (OMIM: 604153) PREDICTED: neuromedin- ( 403) 183 43.3 0.001
NP_006047 (OMIM: 604153) neuromedin-U receptor 1 [ ( 426) 183 43.3 0.001
XP_005264366 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 380) 181 42.9 0.0012
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XP_006712078 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 389) 181 42.9 0.0012
NP_000612 (OMIM: 103780,164230,181500,182135,60678 ( 471) 181 43.0 0.0014
XP_016859579 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 181 43.0 0.0014
XP_011531133 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 487) 181 43.0 0.0014
XP_016859578 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 614) 181 43.2 0.0016
XP_011531130 (OMIM: 152790,176410,238320) PREDICTE ( 674) 181 43.2 0.0017
>>NP_001004703 (OMIM: 614273) olfactory receptor 4C46 [H (309 aa)
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Smith-Waterman score: 989; 46.8% identity (80.9% similar) in 293 aa overlap (9-301:7-299)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
...::.:::... ..:...:..:. .:: ::.: .::..:.:.. .: .:::
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pF1KB7 TTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAAVRR
..:: :: ..::: :..: :: . .:.:: :.: .:..::::::.::::.: .:. :.:.
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pF1KB7 LGRHRLV
:
NP_001 LCSRKDISGDK
300
>>NP_835462 (OMIM: 608493) olfactory receptor 10A5 [Homo (317 aa)
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pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQT-RELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPM
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pF1KB7 FDRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYC
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pF1KB7 DVPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPG-EARRKAAS
: : ::.:.:.::.:.:. : .. :. .. .:.: :: : . . . :. ....:: :
NP_835 DSPPVLKLVCADTALFEIYAIVGTILVVMIPCLLILCSYTRIAAAILKIPSAKGKHKAFS
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pF1KB7 TCTTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTP-FPMDK-LVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQA
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NP_835 TCSSHLLVVSLFYISSSLTYFWPKSNNSPESKKLLSLSYTVVTPMLNPIIYSLRNSEVKN
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300
pF1KB7 AVRRLGRHRLV
:. :
NP_835 ALSRTFHKVLALRNCIP
310
>>XP_011514321 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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: : : ::::.:..::::. . . ::..:: .:..::.:: ::.. . ::.::::::
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:: .:. ::: ..:. : . :....::.::. : :: :. . ::.: ...:.. :.
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. :.::::.::: : . .: .: .. : :.:.::. :. ..:. . :.:.:: :
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:..:. ::.. . .:. : .: . : . .:: :. ....:::::::::.:::.....:
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300
pF1KB7 VRRLGRHRLV
..:
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310
>>XP_011514322 (OMIM: 608497) PREDICTED: olfactory recep (317 aa)
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: : : ::::.:..::::. . . ::..:: .:..::.:: ::.. . ::.::::::
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pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
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. :.::::.::: : . .: .: .. : :.:.::. :. ..:. . :.:.:: :
XP_011 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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pF1KB7 CTTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFT-PFPM-DKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAA
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300
pF1KB7 VRRLGRHRLV
..:
XP_011 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_036501 (OMIM: 608497) olfactory receptor 2F1 [Homo (317 aa)
initn: 808 init1: 626 opt: 821 Z-score: 778.6 bits: 152.2 E(85289): 1.2e-36
Smith-Waterman score: 821; 40.8% identity (75.0% similar) in 304 aa overlap (1-301:1-304)
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pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
: : : ::::.:..::::. . . ::..:: .:..::.:: ::.. . ::.::::::
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pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
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pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
:: .:. ::: ..:. : . :....::.::. : :: :. . ::.: ...:.. :.
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pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFIL-VMLRSHPGEARRKAAST
. :.::::.::: : . .: .: .. : :.:.::. :. ..:. . :.:.:: :
NP_036 LLAVVRLACVDTSSNEVTIMVSSIVLLMTPFCLVLLSYIQIISTILKIQSREGRKKAFHT
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NP_036 CASHLTVVALCYGVAIFTYIQPHSSPSVLQEKLFSVFYAILTPMLNPMIYSLRNKEVKGA
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pF1KB7 VRRLGRHRLV
..:
NP_036 WQKLLWKFSGLTSKLAT
310
>>NP_001005487 (OMIM: 611677) olfactory receptor 13G1 [H (307 aa)
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Smith-Waterman score: 816; 42.7% identity (74.2% similar) in 302 aa overlap (5-301:2-301)
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pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
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NP_001 MNHSVVTEFIILGLTKKPELQGIIFLFFLIVYLVAFLGNMLIIIAKIYNNTLHTPMY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB7 FLLRNLAVLDL-CFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHF-LGGAMVFFLSVM
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NP_001 VFLLTLAVVDIICTTSII-PKMLGTMLTSENTISYAGCMSQLFLFTWSLGAEMVLF-TTM
60 70 80 90 100 110
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pF1KB7 AFDRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFY
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NP_001 AYDRYVAICFPLHYSTIMNHHMCVALLSMVMAIAVTNSWVHTALIMRLTFCGPNTIDHFF
120 130 140 150 160 170
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pF1KB7 CDVPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILV-MLRSHPGEARRKAA
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NP_001 CEIPPLLALSCSPVRINEVMVYVADITLAIGDFILTCISYGFIIVAILRIRTVEGKRKAF
180 190 200 210 220 230
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pF1KB7 STCTTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTP--FPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQ
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NP_001 STCSSHLTVVTLYYSPVIYTYIRPASSYTFERDKVVAALYTLVTPTLNPMVYSFQNREMQ
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300
pF1KB7 AAVRRLGRHRLV
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NP_001 AGIRKVFAFLKH
300
>>NP_003688 (OMIM: 608492) olfactory receptor 5F1 [Homo (314 aa)
initn: 815 init1: 594 opt: 814 Z-score: 772.2 bits: 151.0 E(85289): 2.8e-36
Smith-Waterman score: 814; 40.1% identity (74.1% similar) in 309 aa overlap (1-305:1-309)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
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NP_003 MTRKNYTSLTEFVLLGLADTLELQIILFLFFLVIYTLTVLGNLGMILLIRIDSQLHTPMY
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pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
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NP_003 FFLANLSFVDVCNSTTITPKMLADLLSEKKTISFAGCFLQMYFFISLATTECILFGLMAY
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pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
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NP_003 DRYAAICRPLLYSLIMSRTVYLKMAAGAFAAGLLNFMVNTSHVSSLSFCDSNVIHHFFCD
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pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRS-HPGEARRKAAST
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NP_003 SPPLFKLSCSDTILKESISSILAGVNIVGTLLVILSSYSYVLFSIFSMHSGEGRHRAFST
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pF1KB7 CTTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPM--DKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAA
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NP_003 CASHLTAIILFYATCIYTYLRPSSSYSLNQDKVASVFYTVVIPMLNPLIYSLRSKEVKKA
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300
pF1KB7 VRR-LGRHRLV
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NP_003 LANVISRKRTSSFL
310
>>NP_006628 (OMIM: 608496) olfactory receptor 5I1 [Homo (314 aa)
initn: 809 init1: 629 opt: 810 Z-score: 768.5 bits: 150.3 E(85289): 4.6e-36
Smith-Waterman score: 810; 39.0% identity (73.7% similar) in 308 aa overlap (5-306:7-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTP
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pF1KB7 MYFLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVM
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pF1KB7 AFDRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFY
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NP_006 AYDRYVAICNPLLYTVVMSRGICMRLIVLSYLGGNMSSLVHTSFAFILKYCDKNVINHFF
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pF1KB7 CDVPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVM---LRSHPGEARRK
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NP_006 CDLPPLLKLSCTDTTINEWLLSTYGSSVEIICFIIIIISYFFILLSVLKIRSFSG--RKK
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pF1KB7 AASTCTTHIIVVSMIFVPSIYLYARP---FTPFPMDKLVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQ
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NP_006 TFSTCASHLTSVTIYQGTLLFIYSRPSYLYSP-NTDKIISVFYTIFIPVLNPLIYSLRNK
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300
pF1KB7 DMQAAVRRLGRHRLV
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NP_006 DVKDAAEKVLRSKVDSS
300 310
>>XP_011520809 (OMIM: 603232) PREDICTED: olfactory recep (312 aa)
initn: 773 init1: 619 opt: 794 Z-score: 753.8 bits: 147.6 E(85289): 3e-35
Smith-Waterman score: 794; 40.4% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (1-303:1-307)
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pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
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pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
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XP_011 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
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XP_011 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPG-EARRKAAST
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XP_011 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KB7 CTTHIIVVSMIFVPSIYLYARPFTPFPMDK--LVSIGHTVMTPMLNPMIYTLRNQDMQAA
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XP_011 CGSHLAVVLLFYSTIIAVYFNPLSSHSAEKDTMATVLYTVVTPMLNPFIYSLRNRYLKGA
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300
pF1KB7 VRRL-GRHRLV
.... ::
XP_011 LKKVVGRVVFSV
310
>>NP_036492 (OMIM: 603232) olfactory receptor 1F1 [Homo (312 aa)
initn: 773 init1: 619 opt: 794 Z-score: 753.8 bits: 147.6 E(85289): 3e-35
Smith-Waterman score: 794; 40.4% identity (74.3% similar) in 307 aa overlap (1-303:1-307)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 METGNLTWVSDFVFLGLSQTRELQRFLFLMFLFVYITTVMGNILIIITVTSDSQLHTPMY
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NP_036 MSGTNQSSVSEFLLLGLSRQPQQQHLLFVFFLSMYLATVLGNLLIILSVSIDSCLHTPMY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 FLLRNLAVLDLCFSSVTAPKMLVDLLSEKKTISYQGCMGQIFFFHFLGGAMVFFLSVMAF
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NP_036 FFLSNLSFVDICFSFTTVPKMLANHILETQTISFCGCLTQMYFVFMFVDMDNFLLAVMAY
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pF1KB7 DRLIAISRPLRYVTVMNTQLWVGLVVATWVGGFVHSIVQLALMLPLPFCGPNILDNFYCD
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NP_036 DHFVAVCHPLHYTAKMTHQLCALLVAGLWVVANLNVLLHTLLMAPLSFCADNAITHFFCD
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pF1KB7 VPQVLRLACTDTSLLEFLKISNSGLLDVVWFFLLLMSYLFILVMLRSHPG-EARRKAAST
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NP_036 VTPLLKLSCSDTHLNEVIILSEGALVMITPFLCILASYMHITCTVLKVPSTKGRWKAFST
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pF1KB7 VRRL-GRHRLV
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NP_036 LKKVVGRVVFSV
310
307 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 06:17:04 2016 done: Fri Nov 4 06:17:05 2016
Total Scan time: 5.840 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]