FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7246, 520 aa 1>>>pF1KB7246 520 - 520 aa - 520 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9668+/-0.00112; mu= 2.4944+/- 0.067 mean_var=260.9382+/-50.899, 0's: 0 Z-trim(111.4): 104 B-trim: 14 in 1/52 Lambda= 0.079397 statistics sampled from 12244 (12348) to 12244 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16 Scan time: 2.830 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 520) 3364 398.9 7.3e-111 CCDS73473.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 ( 410) 2494 299.1 6.2e-81 CCDS41787.2 KRT4 gene_id:3851|Hs108|chr12 ( 520) 1643 201.8 1.6e-51 CCDS41786.1 KRT6A gene_id:3853|Hs108|chr12 ( 564) 1622 199.4 9e-51 CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 ( 564) 1615 198.6 1.6e-50 CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 ( 590) 1615 198.6 1.6e-50 CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 ( 564) 1613 198.4 1.8e-50 CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 ( 540) 1580 194.6 2.5e-49 CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 ( 638) 1567 193.1 7.8e-49 CCDS8836.1 KRT1 gene_id:3848|Hs108|chr12 ( 644) 1562 192.6 1.2e-48 CCDS8839.1 KRT79 gene_id:338785|Hs108|chr12 ( 535) 1544 190.4 4.3e-48 CCDS8827.1 KRT75 gene_id:9119|Hs108|chr12 ( 551) 1533 189.2 1e-47 CCDS44895.1 KRT3 gene_id:3850|Hs108|chr12 ( 628) 1534 189.4 1.1e-47 CCDS8831.1 KRT71 gene_id:112802|Hs108|chr12 ( 523) 1522 187.9 2.4e-47 CCDS8833.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 511) 1514 187.0 4.5e-47 CCDS8832.1 KRT74 gene_id:121391|Hs108|chr12 ( 529) 1506 186.1 8.6e-47 CCDS8837.1 KRT77 gene_id:374454|Hs108|chr12 ( 578) 1457 180.5 4.5e-45 CCDS8835.1 KRT2 gene_id:3849|Hs108|chr12 ( 639) 1441 178.7 1.7e-44 CCDS8822.1 KRT7 gene_id:3855|Hs108|chr12 ( 469) 1375 171.0 2.6e-42 CCDS58234.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 511) 1362 169.6 7.8e-42 CCDS8841.1 KRT8 gene_id:3856|Hs108|chr12 ( 483) 1361 169.4 8.1e-42 CCDS8825.1 KRT84 gene_id:3890|Hs108|chr12 ( 600) 1244 156.1 1e-37 CCDS8824.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 507) 1215 152.7 9.1e-37 CCDS8826.1 KRT82 gene_id:3888|Hs108|chr12 ( 513) 1195 150.4 4.5e-36 CCDS31805.1 KRT81 gene_id:3887|Hs108|chr12 ( 505) 1171 147.7 3e-35 CCDS8823.1 KRT83 gene_id:3889|Hs108|chr12 ( 493) 1150 145.3 1.5e-34 CCDS41785.1 KRT86 gene_id:3892|Hs108|chr12 ( 486) 1141 144.2 3.1e-34 CCDS53795.1 KRT72 gene_id:140807|Hs108|chr12 ( 469) 994 127.4 3.6e-29 CCDS8821.2 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 452) 914 118.2 2e-26 CCDS41784.1 KRT80 gene_id:144501|Hs108|chr12 ( 422) 911 117.8 2.4e-26 CCDS7120.1 VIM gene_id:7431|Hs108|chr10 ( 466) 692 92.8 9.2e-19 CCDS73472.1 KRT85 gene_id:3891|Hs108|chr12 ( 295) 672 90.3 3.3e-18 CCDS8783.1 PRPH gene_id:5630|Hs108|chr12 ( 470) 669 90.2 5.8e-18 CCDS33383.1 DES gene_id:1674|Hs108|chr2 ( 470) 662 89.4 1e-17 CCDS75712.1 NEFL gene_id:4747|Hs108|chr8 ( 543) 639 86.8 6.9e-17 CCDS45708.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 431) 619 84.4 2.9e-16 CCDS11491.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 432) 611 83.5 5.4e-16 CCDS59296.1 GFAP gene_id:2670|Hs108|chr17 ( 438) 611 83.5 5.5e-16 CCDS11377.1 KRT10 gene_id:3858|Hs108|chr17 ( 584) 608 83.3 8.5e-16 CCDS7545.1 INA gene_id:9118|Hs108|chr10 ( 499) 588 80.9 3.7e-15 CCDS6046.1 NEFM gene_id:4741|Hs108|chr8 ( 916) 582 80.5 9.3e-15 CCDS32654.1 KRT9 gene_id:3857|Hs108|chr17 ( 623) 567 78.6 2.3e-14 CCDS11398.1 KRT15 gene_id:3866|Hs108|chr17 ( 456) 532 74.5 3e-13 CCDS11400.1 KRT14 gene_id:3861|Hs108|chr17 ( 472) 532 74.5 3.1e-13 CCDS11396.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 458) 529 74.1 3.8e-13 CCDS11378.1 KRT12 gene_id:3859|Hs108|chr17 ( 494) 529 74.1 4e-13 CCDS11401.1 KRT16 gene_id:3868|Hs108|chr17 ( 473) 526 73.8 4.9e-13 CCDS11397.1 KRT13 gene_id:3860|Hs108|chr17 ( 420) 511 72.0 1.5e-12 CCDS31809.1 KRT18 gene_id:3875|Hs108|chr12 ( 430) 507 71.6 2.1e-12 CCDS11372.1 KRT24 gene_id:192666|Hs108|chr17 ( 525) 502 71.1 3.6e-12 >>CCDS8840.1 KRT78 gene_id:196374|Hs108|chr12 (520 aa) initn: 3364 init1: 3364 opt: 3364 Z-score: 2103.8 bits: 398.9 E(32554): 7.3e-111 Smith-Waterman score: 3364; 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CCDS41 LPGVSRSGFSSVSVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYG 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 pF1KB7 SRSLNSFGGCLEGSRGSTWGSGGRLGVRFGEWSG--------GPGLSLCPPGGIQEVTIN ::. .:.: :. :: .: :: :. :: .: :::. .::::::::::.: CCDS41 SRAGGSYG---FGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVN 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 QNLLTPLKIEIDPQFQVVRTQETQEIRTLNNQFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWHLLQQQ :.:::::...::: .: ::..: ..:.::::.:::::::::::::::::::::: :::.: CCDS41 QSLLTPLNLQIDPTIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWTLLQEQ 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 GLSGSQQGLEPVFEACLDQLRKQLEQLQGERGALDAELKACRDQEEEYKSKYEEEAHRRA : . .:.:::.:: ...::.::... :::: ::.::.. .: :..:.:::.: ..:. CCDS41 GTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRGMQDLVEDFKNKYEDEINKRT 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 TLENDFVVLKKDVDGVFLSKMELEGKLEALREYLYFLKHLNEEELGQLQTQASDTSVVLS . ::.::.::::::.....:.::..: ..: . . ::. : . ::.:.::. :::::::: CCDS41 AAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLS 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 MDNNRYLDFSSIITEVRARYEEIARSSKAEAEALYQTKYQELQVSAQLHGDRMQETKVQI ::::: ::..:::.::.:.:::::. :.::::. :::::.::::.: ::: ...:: .: CCDS41 MDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEI 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 SQLHQEIQRLQSQTENLKKQNASLQAAITDAEQRGELALKDAQAKVDELEAALRMAKQNL ..... ::::.:. ...::: :.:::::.:::::::.:::::. :.. :: ::. :::.: CCDS41 AEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDL 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 ARLLCEYQELTSTKLSLDVEIATYRRLLEGEECRMSGECTSQVTISSVGGSAVMSGGVGG :::: ::::: ..::.:::::::::.::::::::..:: ..::.:: : ....:.: :: CCDS41 ARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVV--QSTVSSGYGG 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 GLGSTCGLGSGKGSPGSCCTSIVTGGSNIILGSGKDPVLDSCSVSG--SSAGSSCHTILK . : ::: : :: : ... .::. . .::. ...: ::.:.. :: CCDS41 ASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGVGGG-FSSSSGR-------AIGGGLSSVGGGSSTIKY 500 510 520 530 540 550 510 520 pF1KB7 KTVESSLKTSITY :. :: . : CCDS41 TTTSSSSRKSYKH 560 >>CCDS8829.1 KRT6C gene_id:286887|Hs108|chr12 (564 aa) initn: 1585 init1: 1519 opt: 1615 Z-score: 1020.6 bits: 198.6 E(32554): 1.6e-50 Smith-Waterman score: 1618; 52.9% identity (78.1% similar) in 520 aa overlap (11-517:55-561) 10 20 30 pF1KB7 MSLSPCRAQRGFSARSACSARSRGR-SRGGFSS--RGGFS ::..:: . . : : :: : ::.. CCDS88 LPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYG 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 pF1KB7 SRSLNSFGGCLEGSRGSTWGSGGRLGVRFGEWSG--------GPGLSLCPPGGIQEVTIN ::. .:.: :. :: .: :: :. :: .: :::. .::::::::::.: CCDS88 SRAGGSYG---FGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVN 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 QNLLTPLKIEIDPQFQVVRTQETQEIRTLNNQFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWHLLQQQ :.:::::...::: .: ::..: ..:.::::.::::::::::::::::::.::: :::.: CCDS88 QSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQ 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 GLSGSQQGLEPVFEACLDQLRKQLEQLQGERGALDAELKACRDQEEEYKSKYEEEAHRRA : . .:.:::.:: ...::.::... :::: ::.::. .: :. :.:::.: ..:. CCDS88 GTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRT 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 TLENDFVVLKKDVDGVFLSKMELEGKLEALREYLYFLKHLNEEELGQLQTQASDTSVVLS . ::.::.::::::.....:.::..: ..: . . ::. : . ::.:.::. :::::::: CCDS88 AAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLS 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 MDNNRYLDFSSIITEVRARYEEIARSSKAEAEALYQTKYQELQVSAQLHGDRMQETKVQI ::::: ::..:::.::.:.:::::. :.::::. :::::.::::.: ::: ...:: .: CCDS88 MDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQVTAGRHGDDLRNTKQEI 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 SQLHQEIQRLQSQTENLKKQNASLQAAITDAEQRGELALKDAQAKVDELEAALRMAKQNL ..... ::::.:. ...::: :::::::.:::::::.:::::. :.. :: ::. :::.: CCDS88 AEINRMIQRLRSEIDHVKKQCASLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDL 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 ARLLCEYQELTSTKLSLDVEIATYRRLLEGEECRMSGECTSQVTISSVGGSAVMSGGVGG :::: ::::: ..::.:::::::::.::::::::..:: ..::..: : ....:.: :: CCDS88 ARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNVSVV--QSTISSGYGG 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 GLGSTCGLGSGKGSPGSCCTSIVTGGSNIILGSGKDPVLDSCSVSG--SSAGSSCHTILK . : ::: : :: : ... ::. . .::. ...: ::.:.. :: CCDS88 ASGVGSGLGLGGGSSYSYGSGLGIGGG-FSSSSGR-------AIGGGLSSVGGGSSTIKY 500 510 520 530 540 550 510 520 pF1KB7 KTVESSLKTSITY :. :: . : CCDS88 TTTSSSSRKSYKH 560 >>CCDS8830.1 KRT5 gene_id:3852|Hs108|chr12 (590 aa) initn: 1629 init1: 1547 opt: 1615 Z-score: 1020.4 bits: 198.6 E(32554): 1.6e-50 Smith-Waterman score: 1624; 53.0% identity (78.3% similar) in 521 aa overlap (11-516:69-587) 10 20 30 pF1KB7 MSLSPCRAQRGFSAR-SACSARSRGRSRGGFSSRGGFSSR : : : : .. . :.: : .. ::.. CCDS88 GGGGGGGFGRVSLAGACGVGGYGSRSLYNLGGSKRISISTSGGSFRNRFGAGAGGGYGFG 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 SLNSFGGCLEGSRGSTWGSGGRLGVRFGEWSGGPGLSLCPPGGIQEVTINQNLLTPLKIE . . : . :. :. .: :: :. :: ::::. .::::::::::.::.:::::... CCDS88 GGAGSGFGFGGGAGGGFGLGG--GAGFGGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVNQSLLTPLNLQ 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 IDPQFQVVRTQETQEIRTLNNQFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWHLLQQQGLSGSQQGLE :::..: :::.: ..:.::::.::::::::::::::::::.::: :::.:: . .:.:: CCDS88 IDPSIQRVRTEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQGTKTVRQNLE 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 PVFEACLDQLRKQLEQLQGERGALDAELKACRDQEEEYKSKYEEEAHRRATLENDFVVLK :.:: ...::.::... :::: ::.::. .: :..:.:::.: ..:.: ::.::.:: CCDS88 PLFEQYINNLRRQLDSIVGERGRLDSELRNMQDLVEDFKNKYEDEINKRTTAENEFVMLK 220 230 240 250 260 270 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 KDVDGVFLSKMELEGKLEALREYLYFLKHLNEEELGQLQTQASDTSVVLSMDNNRYLDFS ::::.....:.:::.:..:: . . :.: . . ::.:.::..::::::::::::: ::.. CCDS88 KDVDAAYMNKVELEAKVDALMDEINFMKMFFDAELSQMQTHVSDTSVVLSMDNNRNLDLD 280 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 SIITEVRARYEEIARSSKAEAEALYQTKYQELQVSAQLHGDRMQETKVQISQLHQEIQRL :::.::.:.::::: :..:::. :::::.::: .: ::: ...:: .::.... :::: CCDS88 SIIAEVKAQYEEIANRSRTEAESWYQTKYEELQQTAGRHGDDLRNTKHEISEMNRMIQRL 340 350 360 370 380 390 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 QSQTENLKKQNASLQAAITDAEQRGELALKDAQAKVDELEAALRMAKQNLARLLCEYQEL ... .:.::: :.:: ::.:::::::::::::. :. ::: ::. :::..:::: ::::: CCDS88 RAEIDNVKKQCANLQNAIADAEQRGELALKDARNKLAELEEALQKAKQDMARLLREYQEL 400 410 420 430 440 450 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 TSTKLSLDVEIATYRRLLEGEECRMSGECTSQVTISSV--------GGSAVMSGGVGGGL .:::.:::::::::.::::::::.::: .. :.:: : :... ..::.:::: CCDS88 MNTKLALDVEIATYRKLLEGEECRLSGEGVGPVNISVVTSSVSSGYGSGSGYGGGLGGGL 460 470 480 490 500 510 460 470 480 490 500 pF1KB7 GSTCGLGSGKGSPGSCCTS----IVTGGSNIILGSGKDPVLD-SCSVS-GSSAGSSCHTI :. : : . :: :: .: . ::. . ::: . . .:. ::..::: . CCDS88 GGGLGGGLAGGSSGSYYSSSSGGVGLGGGLSVGGSGFSASSGRGLGVGFGSGGGSSSSVK 520 530 540 550 560 570 510 520 pF1KB7 LKKTVESSLKTSITY . .:. :: :. CCDS88 FVSTTSSSRKSFKS 580 590 >>CCDS8828.1 KRT6B gene_id:3854|Hs108|chr12 (564 aa) initn: 1582 init1: 1516 opt: 1613 Z-score: 1019.4 bits: 198.4 E(32554): 1.8e-50 Smith-Waterman score: 1613; 52.8% identity (77.6% similar) in 519 aa overlap (11-517:55-561) 10 20 30 pF1KB7 MSLSPCRAQRGFSARSACSARSRGR-SRGGFSS--RGGFS ::..:: . . : : :: : ::.. CCDS88 LPGVSRSGFSSISVSRSRGSGGLGGACGGAGFGSRSLYGLGGSKRISIGGGSCAISGGYG 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 pF1KB7 SRSLNSFGGCLEGSRGSTWGSGGRLGVRFGEWSG--------GPGLSLCPPGGIQEVTIN ::. .:.: :. :: .: :: :. :: .: :::. .::::::::::.: CCDS88 SRAGGSYG---FGGAGSGFGFGGGAGIGFGLGGGAGLAGGFGGPGFPVCPPGGIQEVTVN 90 100 110 120 130 140 90 100 110 120 130 140 pF1KB7 QNLLTPLKIEIDPQFQVVRTQETQEIRTLNNQFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWHLLQQQ :.:::::...::: .: ::..: ..:.::::.::::::::::::::::::.::: :::.: CCDS88 QSLLTPLNLQIDPAIQRVRAEEREQIKTLNNKFASFIDKVRFLEQQNKVLDTKWTLLQEQ 150 160 170 180 190 200 150 160 170 180 190 200 pF1KB7 GLSGSQQGLEPVFEACLDQLRKQLEQLQGERGALDAELKACRDQEEEYKSKYEEEAHRRA : . .:.:::.:: ...::.::... :::: ::.::. .: :. :.:::.: ..:. CCDS88 GTKTVRQNLEPLFEQYINNLRRQLDNIVGERGRLDSELRNMQDLVEDLKNKYEDEINKRT 210 220 230 240 250 260 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 TLENDFVVLKKDVDGVFLSKMELEGKLEALREYLYFLKHLNEEELGQLQTQASDTSVVLS . ::.::.::::::.....:.::..: ..: . . ::. : . ::.:.::. :::::::: CCDS88 AAENEFVTLKKDVDAAYMNKVELQAKADTLTDEINFLRALYDAELSQMQTHISDTSVVLS 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 MDNNRYLDFSSIITEVRARYEEIARSSKAEAEALYQTKYQELQVSAQLHGDRMQETKVQI ::::: ::..:::.::.:.:::::. :.::::. :::::.:::..: ::: ...:: .: CCDS88 MDNNRNLDLDSIIAEVKAQYEEIAQRSRAEAESWYQTKYEELQITAGRHGDDLRNTKQEI 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 SQLHQEIQRLQSQTENLKKQNASLQAAITDAEQRGELALKDAQAKVDELEAALRMAKQNL ..... ::::.:. ...::: :.:::::.:::::::.:::::. :.. :: ::. :::.: CCDS88 AEINRMIQRLRSEIDHVKKQCANLQAAIADAEQRGEMALKDAKNKLEGLEDALQKAKQDL 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 ARLLCEYQELTSTKLSLDVEIATYRRLLEGEECRMSGECTSQVTISSVGGSAVMSGGVGG :::: ::::: ..::.:::::::::.::::::::..:: ..::.:: : ....:.: :: CCDS88 ARLLKEYQELMNVKLALDVEIATYRKLLEGEECRLNGEGVGQVNISVV--QSTVSSGYGG 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 GLGSTCGLGSGKGSPGSCCTSIVTGGSNIILGSGKDPVLDSCSVSG-SSAGSSCHTILKK . : ::: : :: : ::.. .:.: . . .: ::.:.. :: CCDS88 ASGVGSGLGLGGGSSYSY-------GSGLGVGGGFSSSSGRATGGGLSSVGGGSSTIKYT 500 510 520 530 540 550 510 520 pF1KB7 TVESSLKTSITY :. :: . : CCDS88 TTSSSSRKSYKH 560 >>CCDS8834.1 KRT73 gene_id:319101|Hs108|chr12 (540 aa) initn: 1585 init1: 1501 opt: 1580 Z-score: 999.2 bits: 194.6 E(32554): 2.5e-49 Smith-Waterman score: 1604; 55.0% identity (79.2% similar) in 505 aa overlap (8-495:13-509) 10 20 30 40 pF1KB7 MSLSPCRAQRGFSARSAC-SARSRGRSR-GGFSSRGGFSSRSLNSFGGC----LE :. :::. :: :. : . : :: . :::::::: :.:: .. CCDS88 MSRQFTYKSGAAAKGGFSGCSAVLSGGSSSSYRAGGKGLSGGFSSRSLYSLGGARSISFN 10 20 30 40 50 60 50 60 70 80 90 pF1KB7 GSRGSTWGSG---GR------LGVRFGEWS-GGPGLSLCPPGGIQEVTINQNLLTPLKIE . :: :..: :: : :: . :. ::::::::..::::..::.::..: CCDS88 VASGSGWAGGYGFGRGRASGFAGSMFGSVALGSVCPSLCPPGGIHQVTINKSLLAPLNVE 70 80 90 100 110 120 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 IDPQFQVVRTQETQEIRTLNNQFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWHLLQQQGLSGSQQGLE .::..: ::.:: ..:..:::.:::::::::::::::.::::::.:::: :.. ...:: CCDS88 LDPEIQKVRAQEREQIKVLNNKFASFIDKVRFLEQQNQVLETKWELLQQLDLNNCKNNLE 130 140 150 160 170 180 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 PVFEACLDQLRKQLEQLQGERGALDAELKACRDQEEEYKSKYEEEAHRRATLENDFVVLK :..:. ...:::::: :.:.: ::.::.. :. :.::..:::: ..:.: ::.::::: CCDS88 PILEGYISNLRKQLETLSGDRVRLDSELRSVREVVEDYKKRYEEEINKRTTAENEFVVLK 190 200 210 220 230 240 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 KDVDGVFLSKMELEGKLEALREYLYFLKHLNEEELGQLQTQASDTSVVLSMDNNRYLDFS ::::... ::.::..:..:: . :.: : : : .:.:.. ::::..::::::: ::.. CCDS88 KDVDAAYTSKVELQAKVDALDGEIKFFKCLYEGETAQIQSHISDTSIILSMDNNRNLDLD 250 260 270 280 290 300 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 SIITEVRARYEEIARSSKAEAEALYQTKYQELQVSAQLHGDRMQETKVQISQLHQEIQRL :::.::::.::::::.::::::::::::.::::..: ::: ...:: .::.: . :::: CCDS88 SIIAEVRAQYEEIARKSKAEAEALYQTKFQELQLAAGRHGDDLKHTKNEISELTRLIQRL 310 320 330 340 350 360 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 QSQTENLKKQNASLQAAITDAEQRGELALKDAQAKVDELEAALRMAKQNLARLLCEYQEL .:. :..::: :.:..::.::::::. :::::.::.::::.::..::..:::.: ::::: CCDS88 RSEIESVKKQCANLETAIADAEQRGDCALKDARAKLDELEGALQQAKEELARMLREYQEL 370 380 390 400 410 420 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 TSTKLSLDVEIATYRRLLEGEECRMSGECTSQVTISSVGGSAVMSGGVGGGLG-STCGLG :.:::::.::::::.:::::::::::: :..:.:: ...: . .:.:.:.: :. : CCDS88 LSVKLSLDIEIATYRKLLEGEECRMSGEYTNSVSISVINSSMAGMAGTGAGFGFSNAGTY 430 440 450 460 470 480 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 SGKGSPGSCCTSIVTGGSNIILGSGKDPVLDSCSVSGSSAGSSCHTILKKTVESSLKTSI . : : :.. :: . ::: .:: : CCDS88 GYWPSSVSGGYSMLPGGC--VTGSG------NCSPRGEARTRLGSASEFRDSQGKTLALS 490 500 510 520 530 520 pF1KB7 TY CCDS88 SPTKKTMR 540 >>CCDS8838.1 KRT76 gene_id:51350|Hs108|chr12 (638 aa) initn: 1513 init1: 1441 opt: 1567 Z-score: 990.2 bits: 193.1 E(32554): 7.8e-49 Smith-Waterman score: 1567; 55.9% identity (80.0% similar) in 506 aa overlap (11-500:80-575) 10 20 30 pF1KB7 MSLSPCRAQRGFSA-RSACS-ARSRGRSRGGFSSRGGFSS ::.. ::.:. : . : . :: : :::.. CCDS88 AGSFGSRSLYNLGSNKSISISVAAGSSRAGGFGGGRSSCGFAGGYGGGFGG-SYGGGFGG 50 60 70 80 90 100 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 -RSLNS-FGGCLEGSRGSTWGSGGRLGVRFGEWS-GGPGLSLCP---PGGIQEVTINQNL :...: ::: :. :.. : :: :: : : :::: .. : ::::::: .::.: CCDS88 GRGVGSGFGGA--GGFGGAGGFGGP-GVFGGPGSFGGPG-GFGPGGFPGGIQEVIVNQSL 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 LTPLKIEIDPQFQVVRTQETQEIRTLNNQFASFIDKVRFLEQQNKVLETKWHLLQQQGLS : ::..:::::. :..:: ..:.::::.::::::::::::::::::::::.::::: . 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CCDS88 REQIKSLNNQFASFIDKVRFLEQQNQVLQTKWELLQQVDTSTRTHNLEPYFESFINNLRR 190 200 210 220 230 240 180 190 200 210 220 230 pF1KB7 QLEQLQGERGALDAELKACRDQEEEYKSKYEEEAHRRATLENDFVVLKKDVDGVFLSKME ...::..... ::.::: .:. :.:..:::.: ..:.. ::.::..::::::....:.. CCDS88 RVDQLKSDQSRLDSELKNMQDMVEDYRNKYEDEINKRTNAENEFVTIKKDVDGAYMTKVD 250 260 270 280 290 300 240 250 260 270 280 290 pF1KB7 LEGKLEALREYLYFLKHLNEEELGQLQTQASDTSVVLSMDNNRYLDFSSIITEVRARYEE :..::. :.. . :: : . ::.:.::: :.:.:.::::::: ::..:::.::.:.::. CCDS88 LQAKLDNLQQEIDFLTALYQAELSQMQTQISETNVILSMDNNRSLDLDSIIAEVKAQYED 310 320 330 340 350 360 300 310 320 330 340 350 pF1KB7 IARSSKAEAEALYQTKYQELQVSAQLHGDRMQETKVQISQLHQEIQRLQSQTENLKKQNA ::..::::::.:::.::.:::..: ::: ....:..::.:.. ::::.:. .:.::: . 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