Result of FASTA (ccds) for pF1KB7254
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7254, 644 aa
  1>>>pF1KB7254 644 - 644 aa - 644 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4991+/-0.00118; mu= 9.3705+/- 0.071
 mean_var=135.0191+/-26.338, 0's: 0 Z-trim(106.5): 31  B-trim: 353 in 1/49
 Lambda= 0.110377
 statistics sampled from 8981 (9006) to 8981 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.277), width:  16
 Scan time:  3.830

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS13140.1 SLC24A3 gene_id:57419|Hs108|chr20      ( 644) 4295 696.1 3.9e-200
CCDS6493.1 SLC24A2 gene_id:25769|Hs108|chr9        ( 661) 1262 213.1 9.8e-55
CCDS45156.1 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14     ( 558) 1167 197.9 3.1e-50
CCDS45155.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14     ( 603) 1167 197.9 3.3e-50
CCDS9903.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14      ( 622) 1167 198.0 3.3e-50
CCDS55297.1 SLC24A2 gene_id:25769|Hs108|chr9       ( 644)  745 130.8 5.8e-30
CCDS73742.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15       (1069)  718 126.6 1.7e-28
CCDS45284.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15       (1099)  718 126.6 1.8e-28
CCDS73744.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15       (1012)  685 121.3 6.4e-27
CCDS73743.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15       (1081)  685 121.3 6.7e-27
CCDS10128.1 SLC24A5 gene_id:283652|Hs108|chr15     ( 500)  631 112.6 1.4e-24


>>CCDS13140.1 SLC24A3 gene_id:57419|Hs108|chr20           (644 aa)
 initn: 4295 init1: 4295 opt: 4295  Z-score: 3706.5  bits: 696.1 E(32554): 3.9e-200
Smith-Waterman score: 4295; 100.0% identity (100.0% similar) in 644 aa overlap (1-644:1-644)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLLLSQLCFLASVALLLWSLSSLREQKELDLMDLVGEDRK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLLLSQLCFLASVALLLWSLSSLREQKELDLMDLVGEDRK
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 WMMARKLMQVNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 WMMARKLMQVNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYM
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 FYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGV
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 GTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWE
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 SLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLKK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLKK
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 ANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLINERQRLIN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLINERQRLIN
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 SRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNETENENEDNEN
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNETENENEDNEN
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 DEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTF
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 ASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDM
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 AVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVH
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640    
pF1KB7 LNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH
              610       620       630       640    

>>CCDS6493.1 SLC24A2 gene_id:25769|Hs108|chr9             (661 aa)
 initn: 1248 init1: 716 opt: 1262  Z-score: 1096.1  bits: 213.1 E(32554): 9.8e-55
Smith-Waterman score: 1267; 36.3% identity (66.8% similar) in 645 aa overlap (11-634:25-656)

                             10        20          30        40    
pF1KB7               MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLL--LSQLCFLASVALLLWSLSSLR
                               ::.   ...  :.  :. .  :.... . .:.:.. 
CCDS64 MDLQQSTTITSLEKWCLDESLSGCRRHYSVKKKLKLIRVLGLFMGLVAISTVSFSISAFS
               10        20        30        40        50        60

             50          60        70          80           90     
pF1KB7 EQ--KELDLMDLVGEDR--KWMMARKLMQVNDTLT--SEDAGLRN---SKNCTEPALHEF
       :   .     ..:.  :  . .  : :...:: .   . .  : .   :.: :. :  ..
CCDS64 ETDTQSTGEASVVSGPRVAQGYHQRTLLDLNDKILDYTPQPPLSKEGESENSTDHAQGDY
               70        80        90       100       110       120

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB7 PNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFM
       :.:::. :.::.::..:::.  :::: :::::::.::::::  : :.: .:.::::::::
CCDS64 PKDIFSLEERRKGAIILHVIGMIYMFIALAIVCDEFFVPSLTVITEKLGISDDVAGATFM
              130       140       150       160       170       180

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB7 AAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLR
       :::.::::::::.:::::....::.:::::::::::: .::.:.::. ... :. : :.:
CCDS64 AAGGSAPELFTSLIGVFIAHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGMCALFSREILNLTWWPLFR
              190       200       210       220       230       240

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB7 DSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNM
       :  .: ...: ::.:. :. . :::::.:.  :. :.:.::.:. ... . ..  . ...
CCDS64 DVSFYIVDLIMLIIFFLDNVIMWWESLLLLTAYFCYVVFMKFNVQVEK-WVKQMINRNKV
              250       260       270       280        290         

         280       290        300       310       320       330    
pF1KB7 VNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLK-KANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMI
       :.  : .:.   :.  :     :  :  ..: .:        ::  :.  . .. ...::
CCDS64 VKVTAPEAQAKPSAARDKDEPTLPAKPRLQRGGS--------SASLHNSLMRNSIFQLMI
     300       310       320       330               340       350 

          340       350           360       370       380       390
pF1KB7 TSHFPPKTRLSMASRM----LINERQRLINSRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSA
        .  :   .:.  ...     ..:. :. .. .  .  ..   ..  ..  .::..    
CCDS64 HTLDPLAEELGSYGKLKYYDTMTEEGRFREKASILHKIAKKKCHVD-ENERQNGAANHVE
             360       370       380       390        400       410

              400       410            420       430       440     
pF1KB7 PDRGVNGTRRDDVVAEAGNETE-----NENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKL
         .  :.:  :  .. ... .:     : ... :. : .  ::..:. : . .  ::   
CCDS64 KIELPNSTSTDVEMTPSSDASEPVQNGNLSHNIEGAEAQTADEEEDQ-PLS-LAWPSETR
              420       430       440       450        460         

         450       460       470       480       490       500     
pF1KB7 ETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTL
       . : . ...:. : :..:.:.  ::  .:.: .:: .:  :::.:::.::: .  .: :.
CCDS64 KQVTFLIVFPIVFPLWITLPDVRKPSSRKFFPITFFGSITWIAVFSYLMVWWAHQVGETI
      470       480       490       500       510       520        

         510       520       530       540       550       560     
pF1KB7 GIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQT
       :: . :::.:.::::::.:: ..:.::::.:.::::::.:.:::.::: .:: ::: : :
CCDS64 GISEEIMGLTILAAGTSIPDLITSVIVARKGLGDMAVSSSVGSNIFDITVGLPLPWLLYT
      530       540       550       560       570       580        

         570       580       590       600       610       620     
pF1KB7 LAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFS
       . .   . . ..: ::. .. ::.  .. ..... : ::...: ::   . :: :::  :
CCDS64 V-IHRFQPVAVSSNGLFCAIVLLFIMLLFVILSIALCKWRMNKILGFIMFGLYFVFLVVS
       590       600       610       620       630       640       

         630       640    
pF1KB7 IMTEFNVFTFVNLPMCGDH
       .. :  ..:          
CCDS64 VLLEDRILTCPVSI     
       650       660      

>>CCDS45156.1 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14          (558 aa)
 initn: 2373 init1: 1116 opt: 1167  Z-score: 1015.5  bits: 197.9 E(32554): 3.1e-50
Smith-Waterman score: 2357; 62.9% identity (82.4% similar) in 568 aa overlap (80-641:6-554)

      50        60        70        80        90       100         
pF1KB7 DLMDLVGEDRKWMMARKLMQVNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGA
                                     : ...::::.::.::::.:.:.:..:..::
CCDS45                          MAPVNGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGA
                                        10        20        30     

     110       120       130       140       150       160         
pF1KB7 VVLHVLCAIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVI
       :.::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:::
CCDS45 VLLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVI
          40        50        60        70        80        90     

     170       180       190       200       210       220         
pF1KB7 GVFITKGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIV
       :::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :. : . :::.:::.:::.:::
CCDS45 GVFITHGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIV
         100       110       120       130       140       150     

     230       240       250       260       270          280      
pF1KB7 FIYDEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGA--GNMVNG-LANNAEID
       :::::.. :::.:::...:..::.:::::. ..  :  . :.   :: ::. :  . .. 
CCDS45 FIYDEQIVWWEGLVLIILYVFYILIMKYNVKMQAFFTVKQKSIANGNPVNSELEAGNDFY
         160       170       180       190       200       210     

        290          300       310       320       330       340   
pF1KB7 DSSNCDATVVLL---KKANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTR
       :.:  : .: ::   :.   . :  :.::::..:. : ...: :::::::::..: :.::
CCDS45 DGSYDDPSVPLLGQVKEKPQYGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTR
         220       230       240       250       260       270     

           350       360       370       380       390       400   
pF1KB7 LSMASRMLINERQRLINSRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDV
       : ::::..::::::::::   .:: :   ..   ....:::. :   :.           
CCDS45 LRMASRIIINERQRLINS---ANGVSSKPLQNGRHENIENGNVPVENPE-----------
         280       290          300       310       320            

           410       420       430       440       450       460   
pF1KB7 VAEAGNETENENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFT
            .  .:....   .    : :  .    .::..: .. . :::.::::: :.:  :
CCDS45 -----DPQQNQEQQPPPQPPPPEPEPVEADFLSPFSVPEARGDKVKWVFTWPLIFLLCVT
                  330       340       350       360       370      

           470       480       490       500       510       520   
pF1KB7 VPNCNKPRWEKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSV
       .:::.::::::.::::: ..:::::.:::.:::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 IPNCSKPRWEKFFMVTFITATLWIAVFSYIMVWLVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSV
        380       390       400       410       420       430      

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pF1KB7 PDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIY
       :::::::::::::.:::::::.:::::::::.:::.::.:::..:.::: ...:::::.:
CCDS45 PDCMASLIVARQGLGDMAVSNTIGSNVFDILVGLGVPWGLQTMVVNYGSTVKINSRGLVY
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pF1KB7 SVGLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGD
       :: :::.:: .::.:.:::::.::.:::   :.::..::::::: :::::::::::::  
CCDS45 SVVLLLGSVALTVLGIHLNKWRLDRKLGVYVLVLYAIFLCFSIMIEFNVFTFVNLPMCRE
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pF1KB7 H 
         
CCDS45 DD
         

>>CCDS45155.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14          (603 aa)
 initn: 2373 init1: 1116 opt: 1167  Z-score: 1015.0  bits: 197.9 E(32554): 3.3e-50
Smith-Waterman score: 2353; 58.7% identity (77.9% similar) in 634 aa overlap (12-641:8-599)

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pF1KB7 MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLLLSQLCFLASVALLLWSLSSLRE---QKELDLMDLVGE
                  :  . ::::..: .:. :. .:  :.   :.:     .:  .    :  
CCDS45     MALRGTLRPLKVRRRREMLPQQVGFVCAVLALVCCASGLFGSLGHKTASASKRVLP
                   10        20        30        40        50      

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pF1KB7 DRKWMMARKLMQ-VNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGAVVLHVLC
       :  :   ::::  ::        : ...::::.::.::::.:.:.:..:..:::.::.: 
CCDS45 DT-WR-NRKLMAPVN--------GTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAVLLHILG
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pF1KB7 AIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKG
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::.:
CCDS45 ALYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIGVFITHG
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pF1KB7 DVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKV
       :::::::::::::::::::::::::::::: :. : . :::.:::.:::.::::::::..
CCDS45 DVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIVFIYDEQI
        170       180       190       200       210       220      

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pF1KB7 SWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCDATVV
        :::.:::...:..::.:::::. ..  :  . :   ...::   :.:..          
CCDS45 VWWEGLVLIILYVFYILIMKYNVKMQAFFTVKQK---SIANGNPVNSELE----------
        230       240       250       260          270             

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pF1KB7 LLKKANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLINERQ
        .:.   . :  :.::::..:. : ...: :::::::::..: :.::: ::::..:::::
CCDS45 AVKEKPQYGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTRLRMASRIIINERQ
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pF1KB7 RLINSRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNETENENE
       :::::   .:: :   ..   ....:::. :   :.                .  .:...
CCDS45 RLINS---ANGVSSKPLQNGRHENIENGNVPVENPE----------------DPQQNQEQ
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pF1KB7 DNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWF
       .   .    : :  .    .::..: .. . :::.::::: :.:  :.:::.::::::.:
CCDS45 QPPPQPPPPEPEPVEADFLSPFSVPEARGDKVKWVFTWPLIFLLCVTIPNCSKPRWEKFF
          380       390       400       410       420       430    

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pF1KB7 MVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQG
       :::: ..:::::.:::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MVTFITATLWIAVFSYIMVWLVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQG
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pF1KB7 MGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTV
       .:::::::.:::::::::.:::.::.:::..:.::: ...:::::.::: :::.:: .::
CCDS45 LGDMAVSNTIGSNVFDILVGLGVPWGLQTMVVNYGSTVKINSRGLVYSVVLLLGSVALTV
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pF1KB7 FGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH 
       .:.:::::.::.:::   :.::..::::::: :::::::::::::    
CCDS45 LGIHLNKWRLDRKLGVYVLVLYAIFLCFSIMIEFNVFTFVNLPMCREDD
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>>CCDS9903.2 SLC24A4 gene_id:123041|Hs108|chr14           (622 aa)
 initn: 2373 init1: 1116 opt: 1167  Z-score: 1014.8  bits: 198.0 E(32554): 3.3e-50
Smith-Waterman score: 2382; 59.2% identity (78.3% similar) in 640 aa overlap (12-641:8-618)

               10        20        30        40           50       
pF1KB7 MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLLLSQLCFLASVALLLWSLSSLRE---QKELDLMDLVGE
                  :  . ::::..: .:. :. .:  :.   :.:     .:  .    :  
CCDS99     MALRGTLRPLKVRRRREMLPQQVGFVCAVLALVCCASGLFGSLGHKTASASKRVLP
                   10        20        30        40        50      

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pF1KB7 DRKWMMARKLMQ-VNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGAVVLHVLC
       :  :   ::::  ::        : ...::::.::.::::.:.:.:..:..:::.::.: 
CCDS99 DT-WR-NRKLMAPVN--------GTQTAKNCTDPAIHEFPTDLFSNKERQHGAVLLHILG
          60                 70        80        90       100      

        120       130       140       150       160       170      
pF1KB7 AIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKG
       :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::.:
CCDS99 ALYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSTPELFASVIGVFITHG
        110       120       130       140       150       160      

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pF1KB7 DVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKV
       :::::::::::::::::::::::::::::: :. : . :::.:::.:::.::::::::..
CCDS99 DVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYYTISVIVLIVFIYDEQI
        170       180       190       200       210       220      

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pF1KB7 SWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGA--GNMVNG-LANNAEIDDSSNCDA
        :::.:::...:..::.:::::. ..  :  . :.   :: ::. :  . .. :.:  : 
CCDS99 VWWEGLVLIILYVFYILIMKYNVKMQAFFTVKQKSIANGNPVNSELEAGNDFYDGSYDDP
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pF1KB7 TVVLL---KKANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRM
       .: ::   :.   . :  :.::::..:. : ...: :::::::::..: :.::: ::::.
CCDS99 SVPLLGQVKEKPQYGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTRLRMASRI
        290       300       310       320       330       340      

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pF1KB7 LINERQRLINSRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNE
       .::::::::::   .:: :   ..   ....:::. :   :.                . 
CCDS99 IINERQRLINS---ANGVSSKPLQNGRHENIENGNVPVENPE----------------DP
        350          360       370       380                       

              420       430       440       450       460       470
pF1KB7 TENENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKP
        .:....   .    : :  .    .::..: .. . :::.::::: :.:  :.:::.::
CCDS99 QQNQEQQPPPQPPPPEPEPVEADFLSPFSVPEARGDKVKWVFTWPLIFLLCVTIPNCSKP
       390       400       410       420       430       440       

              480       490       500       510       520       530
pF1KB7 RWEKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASL
       ::::.::::: ..:::::.:::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS99 RWEKFFMVTFITATLWIAVFSYIMVWLVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASL
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pF1KB7 IVARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLA
       ::::::.:::::::.:::::::::.:::.::.:::..:.::: ...:::::.::: :::.
CCDS99 IVARQGLGDMAVSNTIGSNVFDILVGLGVPWGLQTMVVNYGSTVKINSRGLVYSVVLLLG
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pF1KB7 SVFVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH 
       :: .::.:.:::::.::.:::   :.::..::::::: :::::::::::::    
CCDS99 SVALTVLGIHLNKWRLDRKLGVYVLVLYAIFLCFSIMIEFNVFTFVNLPMCREDD
       570       580       590       600       610       620  

>>CCDS55297.1 SLC24A2 gene_id:25769|Hs108|chr9            (644 aa)
 initn: 1242 init1: 682 opt: 745  Z-score: 651.4  bits: 130.8 E(32554): 5.8e-30
Smith-Waterman score: 1277; 37.1% identity (66.3% similar) in 641 aa overlap (11-634:25-639)

                             10        20          30        40    
pF1KB7               MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLL--LSQLCFLASVALLLWSLSSLR
                               ::.   ...  :.  :. .  :.... . .:.:.. 
CCDS55 MDLQQSTTITSLEKWCLDESLSGCRRHYSVKKKLKLIRVLGLFMGLVAISTVSFSISAFS
               10        20        30        40        50        60

             50          60        70          80           90     
pF1KB7 EQ--KELDLMDLVGEDR--KWMMARKLMQVNDTLT--SEDAGLRN---SKNCTEPALHEF
       :   .     ..:.  :  . .  : :...:: .   . .  : .   :.: :. :  ..
CCDS55 ETDTQSTGEASVVSGPRVAQGYHQRTLLDLNDKILDYTPQPPLSKEGESENSTDHAQGDY
               70        80        90       100       110       120

         100       110       120       130       140       150     
pF1KB7 PNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFM
       :.:::. :.::.::..:::.  :::: :::::::.::::::  : :.: .:.::::::::
CCDS55 PKDIFSLEERRKGAIILHVIGMIYMFIALAIVCDEFFVPSLTVITEKLGISDDVAGATFM
              130       140       150       160       170       180

         160       170       180       190       200       210     
pF1KB7 AAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLR
       :::.::::::::.:::::....::.:::::::::::: .::.:.::. ... :. : :.:
CCDS55 AAGGSAPELFTSLIGVFIAHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGMCALFSREILNLTWWPLFR
              190       200       210       220       230       240

         220       230       240       250       260       270     
pF1KB7 DSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNM
       :  .: ...: ::.:. :. . :::::.:.  :. :.:.::.:. ... . ..  . ...
CCDS55 DVSFYIVDLIMLIIFFLDNVIMWWESLLLLTAYFCYVVFMKFNVQVEK-WVKQMINRNKV
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pF1KB7 VNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLK-KANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMI
       :.  : .:.   :.  :     :  :  ..: .:        ::  :.  . .. ...::
CCDS55 VKVTAPEAQAKPSAARDKDEPTLPAKPRLQRGGS--------SASLHNSLMRNSIFQLMI
     300       310       320       330               340       350 

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pF1KB7 TSHFP-PKTRLSMASRML--INERQRLINSRAYTNGESEVA--IKIPIKHTVENGTGPSS
        .  :  . :.   . .:  : ...  ..     :: .. .  :..: . ...    :::
CCDS55 HTLDPLAEGRFREKASILHKIAKKKCHVDENERQNGAANHVEKIELPNSTSTDVEMTPSS
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pF1KB7 APDRGVNGTRRDDVVAEAGNETENENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVK
         .. :          . :: ..:     :. : .  ::..:. : . .  ::   . : 
CCDS55 DASEPV----------QNGNLSHN----IEGAEAQTADEEEDQ-PLS-LAWPSETRKQVT
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pF1KB7 WAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPD
       . ...:. : :..:.:.  ::  .:.: .:: .:  :::.:::.::: .  .: :.:: .
CCDS55 FLIVFPIVFPLWITLPDVRKPSSRKFFPITFFGSITWIAVFSYLMVWWAHQVGETIGISE
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pF1KB7 VIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVD
        :::.:.::::::.:: ..:.::::.:.::::::.:.:::.::: .:: ::: : :. . 
CCDS55 EIMGLTILAAGTSIPDLITSVIVARKGLGDMAVSSSVGSNIFDITVGLPLPWLLYTV-IH
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pF1KB7 YGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTE
         . . ..: ::. .. ::.  .. ..... : ::...: ::   . :: :::  :.. :
CCDS55 RFQPVAVSSNGLFCAIVLLFIMLLFVILSIALCKWRMNKILGFIMFGLYFVFLVVSVLLE
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     630       640    
pF1KB7 FNVFTFVNLPMCGDH
         ..:          
CCDS55 DRILTCPVSI     
          640         

>>CCDS73742.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15            (1069 aa)
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pF1KB7 AIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKG
        .:.: :::::::..:::.:  : ..:..:::::::::::::.::::::::.:::::...
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       .::.:::::::::::: .::.:.::. ... :. : :.::  .: :..: ::.:. :  .
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       .:::::.:.: : .:.  ::.:  :.    . . ::           .: : : . :. :
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pF1KB7 ANNAEI----------DDSSNCDATV------VLLKKANFHRKASVIMVDELLS------
        .: ..          ...:  ..:.      ..:.. .  :.. .    :  :      
CCDS73 QDNKKLKLPSLLTRGSSSTSLHNSTIRSTIYQLMLHSLDPLREVRLAKEKEEESLNQGAR
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pF1KB7 AYPHQLSFSE------AGLRIMITSHFP-PKTRLSM----ASRMLINERQ---RLINSRA
       : :.  . :.      : :  . ..  : :  . ..    ...  . : .   .. . ..
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pF1KB7 YTNGESEVAIKIPIK-------HTVENGTGP-----SSAPDRGVN-GTRRDDVVAE----
        : ::.:.  :   .       .:  .: :      . :  .: : :  . .. ::    
CCDS73 ETAGEGETEEKSGGETQPEGEGETETQGKGEECEDENEAEGKGDNEGEDEGEIHAEDGEM
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pF1KB7 AGNETENENE--------------------------DNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDT
        ::: :.:..                          :.:..:::::.....:      . 
CCDS73 KGNEGETESQELSAENHGEAKNDEKGVEDGGGSDGGDSEEEEEEEEEQEEEEEEEEQEEE
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pF1KB7 PSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTI
          . :  . .   :::.      :.  . .    :.. ..   ::... .     .   
CCDS73 EEEEEEEEEKGNEEPLSL----DWPETRQKQAIYLFLLPIVFP-LWLTVPD-----VRRQ
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pF1KB7 IGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLP
       .: :.:: . :::.:.::::::.:: ..:.::::.:.::::::.:.:::.::: .:: .:
CCDS73 VGETIGISEEIMGLTILAAGTSIPDLITSVIVARKGLGDMAVSSSVGSNIFDITVGLPVP
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pF1KB7 WALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGV
       : : .: ..  . . ..: ::. .. ::.                               
CCDS73 WLLFSL-INGLQPVPVSSNGLFCAIVLLFLMLLFVISSIASCKWRMNKILGFTMFLLYFV
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>>CCDS45284.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15            (1099 aa)
 initn: 1268 init1: 678 opt: 718  Z-score: 624.7  bits: 126.6 E(32554): 1.8e-28
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pF1KB7 AIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKG
        .:.: :::::::..:::.:  : ..:..:::::::::::::.::::::::.:::::...
CCDS45 MMYVFVALAIVCDEYFVPALGVITDKLQISEDVAGATFMAAGGSAPELFTSLIGVFISHS
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pF1KB7 DVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKV
       .::.:::::::::::: .::.:.::. ... :. : :.::  .: :..: ::.:. :  .
CCDS45 NVGIGTIVGSAVFNILFVIGTCSLFSREILNLTWWPLFRDVSFYILDLIMLILFFLDSLI
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pF1KB7 SWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIH----QCFERR-----------TK-GAGNM-VNGL
       .:::::.:.: : .:.  ::.:  :.    . . ::           .: : : . :. :
CCDS45 AWWESLLLLLAYAFYVFTMKWNKHIEVWVKEQLSRRPVAKVMALEDLSKPGDGAIAVDEL
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pF1KB7 ANNAEI----------DDSSNCDATV------VLLKKANFHRKASVIMVDELLS------
        .: ..          ...:  ..:.      ..:.. .  :.. .    :  :      
CCDS45 QDNKKLKLPSLLTRGSSSTSLHNSTIRSTIYQLMLHSLDPLREVRLAKEKEEESLNQGAR
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pF1KB7 AYPHQLSFSE------AGLRIMITSHFP-PKTRLSM----ASRMLINERQ---RLINSRA
       : :.  . :.      : :  . ..  : :  . ..    ...  . : .   .. . ..
CCDS45 AQPQAKAESKPEEEEPAKLPAVTVTPAPVPDIKGDQKENPGGQEDVAEAESTGEMPGEEG
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pF1KB7 YTNGESEVAIKIPIKHTVEN--------------------GTGPSSAPDRG--------V
        : ::.:.  :   .   :.                    : : . . :.:        .
CCDS45 ETAGEGETEEKSGGETQPEGEGETETQGKGEECEDENEAEGKGDNEGEDEGEIHAEDGEM
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pF1KB7 NG----TRRDDVVAEA------------------GNETENENEDNENDEEEEEDEDDDE-
       .:    :. ... ::                   :...:.:.:..:..:::::.:...: 
CCDS45 KGNEGETESQELSAENHGEAKNDEKGVEDGGGSDGGDSEEEEEEEEEQEEEEEEEEQEEE
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pF1KB7 ----------GPYTPF--DTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTF
                 :   :.  : :  . . . . :  :. : :..:::.  . . .:.:. ::
CCDS45 EEEEEEEEEKGNEEPLSLDWPETRQKQAIYLFLLPIVFPLWLTVPDVRRQESRKFFVFTF
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pF1KB7 ASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDM
        .: .::: :::.::: .  .: :.:: . :::.:.::::::.:: ..:.::::.:.:::
CCDS45 LGSIMWIAMFSYLMVWWAHQVGETIGISEEIMGLTILAAGTSIPDLITSVIVARKGLGDM
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pF1KB7 AVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVH
       :::.:.:::.::: .:: .:                                        
CCDS45 AVSSSVGSNIFDITVGLPVPWLLFSLINGLQPVPVSSNGLFCAIVLLFLMLLFVISSIAS
            1010      1020      1030      1040      1050      1060 

>>CCDS73744.1 SLC24A1 gene_id:9187|Hs108|chr15            (1012 aa)
 initn: 1122 init1: 635 opt: 685  Z-score: 596.8  bits: 121.3 E(32554): 6.4e-27
Smith-Waterman score: 1000; 36.1% identity (61.2% similar) in 570 aa overlap (90-558:432-1001)

      60        70        80        90          100       110      
pF1KB7 KWMMARKLMQVNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALH---EFPNDIFTNEDRRQGAVVLHVLC
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CCDS73 AMLTTPSPSLTTALLPEELSPSPSVLPPSLPDLHPKGEYPPDLFSVEERRQGWVVLHVFG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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