Result of FASTA (omim) for
pF1KB7254
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7254, 644 aa
1>>>pF1KB7254 644 - 644 aa - 644 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1691+/-0.000471; mu= 11.3619+/- 0.029
mean_var=148.9601+/-29.243, 0's: 0 Z-trim(113.6): 97 B-trim: 311 in 1/50
Lambda= 0.105085
statistics sampled from 22913 (23011) to 22913 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 9.790
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_065740 (OMIM: 609839) sodium/potassium/calcium ( 644) 4295 663.8 5.4e-190
XP_011534740 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTE ( 645) 1281 206.8 1.9e-52
XP_005251483 (OMIM: 609838) PREDICTED: sodium/pota ( 661) 1262 204.0 1.4e-51
NP_065077 (OMIM: 609838) sodium/potassium/calcium ( 661) 1262 204.0 1.4e-51
XP_016870081 (OMIM: 609838) PREDICTED: sodium/pota ( 661) 1262 204.0 1.4e-51
XP_005251482 (OMIM: 609838) PREDICTED: sodium/pota ( 661) 1262 204.0 1.4e-51
XP_006720831 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi ( 985) 1215 197.0 2.7e-49
XP_011534743 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTE ( 316) 1167 189.3 1.8e-47
XP_011534744 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTE ( 316) 1167 189.3 1.8e-47
XP_011534742 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTE ( 372) 1167 189.4 2e-47
NP_705934 (OMIM: 210750,609840,615887) sodium/pota ( 558) 1167 189.5 2.8e-47
NP_705933 (OMIM: 210750,609840,615887) sodium/pota ( 603) 1167 189.5 2.9e-47
NP_705932 (OMIM: 210750,609840,615887) sodium/pota ( 622) 1167 189.5 3e-47
XP_011534739 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTE ( 650) 1167 189.6 3.1e-47
XP_011534738 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTE ( 669) 1167 189.6 3.2e-47
XP_011534741 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTE ( 626) 1008 165.4 5.4e-40
XP_016870082 (OMIM: 609838) PREDICTED: sodium/pota ( 644) 745 125.6 5.6e-28
NP_001180217 (OMIM: 609838) sodium/potassium/calci ( 644) 745 125.6 5.6e-28
XP_006716813 (OMIM: 609838) PREDICTED: sodium/pota ( 644) 745 125.6 5.6e-28
XP_016878214 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi ( 966) 718 121.6 1.3e-26
XP_011520524 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi (1030) 718 121.7 1.4e-26
XP_016878213 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi (1049) 718 121.7 1.4e-26
NP_001287960 (OMIM: 603617,613830) sodium/potassiu (1069) 718 121.7 1.4e-26
XP_011520523 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi (1069) 718 121.7 1.4e-26
XP_011520521 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi (1099) 718 121.7 1.4e-26
XP_005254835 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi (1099) 718 121.7 1.4e-26
NP_004718 (OMIM: 603617,613830) sodium/potassium/c (1099) 718 121.7 1.4e-26
XP_011520528 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi ( 688) 685 116.5 3.2e-25
XP_005254838 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi ( 717) 685 116.5 3.3e-25
NP_001287962 (OMIM: 603617,613830) sodium/potassiu (1012) 685 116.6 4.3e-25
XP_011520522 (OMIM: 603617,613830) PREDICTED: sodi (1081) 685 116.7 4.5e-25
NP_001287961 (OMIM: 603617,613830) sodium/potassiu (1081) 685 116.7 4.5e-25
NP_995322 (OMIM: 113750,609802) sodium/potassium/c ( 500) 631 108.2 7.3e-23
NP_001241669 (OMIM: 603617,613830) sodium/potassiu ( 426) 625 107.2 1.2e-22
XP_005267399 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTE ( 352) 398 72.8 2.4e-12
XP_016877568 (OMIM: 113750,609802) PREDICTED: sodi ( 314) 314 60.0 1.5e-08
XP_016877569 (OMIM: 113750,609802) PREDICTED: sodi ( 314) 314 60.0 1.5e-08
XP_006719670 (OMIM: 609841) PREDICTED: sodium/pota ( 389) 289 56.3 2.5e-07
XP_011537054 (OMIM: 609841) PREDICTED: sodium/pota ( 389) 289 56.3 2.5e-07
NP_001317395 (OMIM: 609841) sodium/potassium/calci ( 528) 289 56.4 3.1e-07
XP_011537051 (OMIM: 609841) PREDICTED: sodium/pota ( 584) 289 56.4 3.3e-07
NP_079235 (OMIM: 609841) sodium/potassium/calcium ( 584) 289 56.4 3.3e-07
NP_891981 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchanger ( 284) 230 47.2 9.6e-05
NP_001123889 (OMIM: 607991) sodium/calcium exchang ( 298) 230 47.2 9.9e-05
XP_006720303 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calc ( 304) 230 47.2 0.0001
XP_016877100 (OMIM: 607991) PREDICTED: sodium/calc ( 311) 230 47.2 0.0001
XP_016875467 (OMIM: 609841) PREDICTED: sodium/pota ( 422) 230 47.4 0.00013
XP_016882648 (OMIM: 601901) PREDICTED: sodium/calc ( 345) 210 44.2 0.00091
>>NP_065740 (OMIM: 609839) sodium/potassium/calcium exch (644 aa)
initn: 4295 init1: 4295 opt: 4295 Z-score: 3532.0 bits: 663.8 E(85289): 5.4e-190
Smith-Waterman score: 4295; 100.0% identity (100.0% similar) in 644 aa overlap (1-644:1-644)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLLLSQLCFLASVALLLWSLSSLREQKELDLMDLVGEDRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLLLSQLCFLASVALLLWSLSSLREQKELDLMDLVGEDRK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 WMMARKLMQVNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 WMMARKLMQVNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 FYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 FYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 GTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 SLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNMVNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLKK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 ANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLINERQRLIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMITSHFPPKTRLSMASRMLINERQRLIN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 SRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNETENENEDNEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 SRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRGVNGTRRDDVVAEAGNETENENEDNEN
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 DEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 DEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 ASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 ASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDM
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 AVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 AVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB7 LNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_065 LNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFTFVNLPMCGDH
610 620 630 640
>>XP_011534740 (OMIM: 210750,609840,615887) PREDICTED: s (645 aa)
initn: 2112 init1: 999 opt: 1281 Z-score: 1062.5 bits: 206.8 E(85289): 1.9e-52
Smith-Waterman score: 2101; 61.0% identity (80.8% similar) in 531 aa overlap (71-595:108-619)
50 60 70 80 90 100
pF1KB7 SSLREQKELDLMDLVGEDRKWMMARKLMQVNDTLTSEDAGLRNSKNCTEPALHEFPNDIF
: : . : ...::::.::.::::.:.:
XP_011 LRAAPGGAQDAAAGHKTASASKRVLPDTWRNRKLMAPVNGTQTAKNCTDPAIHEFPTDLF
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 TNEDRRQGAVVLHVLCAIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSS
.:..:..:::.::.: :.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SNKERQHGAVLLHILGALYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFMAAGSS
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 APELFTSVIGVFITKGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLRDSIYY
.::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::: :. : . :::.::
XP_011 TPELFASVIGVFITHGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVRLTWWAVCRDSVYY
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270
pF1KB7 TLSVIALIVFIYDEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGA--GNMVNG
:.:::.::::::::.. :::.:::...:..::.:::::. .. : . :. :: ::.
XP_011 TISVIVLIVFIYDEQIVWWEGLVLIILYVFYILIMKYNVKMQAFFTVKQKSIANGNPVNS
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 -LANNAEIDDSSNCDATVVLL---KKANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMI
: . .. :.: : .: :: :. . : :.::::..:. : ...: ::::::::
XP_011 ELEAGNDFYDGSYDDPSVPLLGQVKEKPQYGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMI
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 TSHFPPKTRLSMASRMLINERQRLINSRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSAPDRG
:..: :.::: ::::..:::::::::: .:: : .. ....:::. : :.
XP_011 TNKFGPRTRLRMASRIIINERQRLINS---ANGVSSKPLQNGRHENIENGNVPVENPE--
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KB7 VNGTRRDDVVAEAGNETENENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKLETVKWAFTW
. .:.... . : : . .::..: .. . :::.:::
XP_011 --------------DPQQNQEQQPPPQPPPPEPEPVEADFLSPFSVPEARGDKVKWVFTW
440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB7 PLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTLGIPDVIMGI
:: :.: :.:::.::::::.::::: ..:::::.:::.:::.:::::::::::::::::
XP_011 PLIFLLCVTIPNCSKPRWEKFFMVTFITATLWIAVFSYIMVWLVTIIGYTLGIPDVIMGI
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB7 TFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQTLAVDYGSYI
::::::::::::::::::::::.:::::::.:::::::::.:::.::.:::..:.::: .
XP_011 TFLAAGTSVPDCMASLIVARQGLGDMAVSNTIGSNVFDILVGLGVPWGLQTMVVNYGSTV
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB7 RLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFSIMTEFNVFT
..:::::.::: :::.:: .:
XP_011 KINSRGLVYSVVLLLGSVALTCSSEVPGIQPQEALIEGQGGRQWKER
600 610 620 630 640
>>XP_005251483 (OMIM: 609838) PREDICTED: sodium/potassiu (661 aa)
initn: 1248 init1: 716 opt: 1262 Z-score: 1046.8 bits: 204.0 E(85289): 1.4e-51
Smith-Waterman score: 1267; 36.3% identity (66.8% similar) in 645 aa overlap (11-634:25-656)
10 20 30 40
pF1KB7 MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLL--LSQLCFLASVALLLWSLSSLR
::. ... :. :. . :.... . .:.:..
XP_005 MDLQQSTTITSLEKWCLDESLSGCRRHYSVKKKLKLIRVLGLFMGLVAISTVSFSISAFS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB7 EQ--KELDLMDLVGEDR--KWMMARKLMQVNDTLT--SEDAGLRN---SKNCTEPALHEF
: . ..:. : . . : :...:: . . . : . :.: :. : ..
XP_005 ETDTQSTGEASVVSGPRVAQGYHQRTLLDLNDKILDYTPQPPLSKEGESENSTDHAQGDY
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 PNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFM
:.:::. :.::.::..:::. :::: :::::::.:::::: : :.: .:.::::::::
XP_005 PKDIFSLEERRKGAIILHVIGMIYMFIALAIVCDEFFVPSLTVITEKLGISDDVAGATFM
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 AAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLR
:::.::::::::.:::::....::.:::::::::::: .::.:.::. ... :. : :.:
XP_005 AAGGSAPELFTSLIGVFIAHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGMCALFSREILNLTWWPLFR
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 DSIYYTLSVIALIVFIYDEKVSWWESLVLVLMYLIYIVIMKYNACIHQCFERRTKGAGNM
: .: ...: ::.:. :. . :::::.:. :. :.:.::.:. ... . .. . ...
XP_005 DVSFYIVDLIMLIIFFLDNVIMWWESLLLLTAYFCYVVFMKFNVQVEK-WVKQMINRNKV
250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLK-KANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMI
:. : .:. :. : : : ..: .: :: :. . .. ...::
XP_005 VKVTAPEAQAKPSAARDKDEPTLPAKPRLQRGGS--------SASLHNSLMRNSIFQLMI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 TSHFPPKTRLSMASRM----LINERQRLINSRAYTNGESEVAIKIPIKHTVENGTGPSSA
. : .:. ... ..:. :. .. . . .. .. .. .::..
XP_005 HTLDPLAEELGSYGKLKYYDTMTEEGRFREKASILHKIAKKKCHVD-ENERQNGAANHVE
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KB7 PDRGVNGTRRDDVVAEAGNETE-----NENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKL
. :.: : .. ... .: : ... :. : . ::..:. : . . ::
XP_005 KIELPNSTSTDVEMTPSSDASEPVQNGNLSHNIEGAEAQTADEEEDQ-PLS-LAWPSETR
420 430 440 450 460
450 460 470 480 490 500
pF1KB7 ETVKWAFTWPLSFVLYFTVPNCNKPRWEKWFMVTFASSTLWIAAFSYMMVWMVTIIGYTL
. : . ...:. : :..:.:. :: .:.: .:: .: :::.:::.::: . .: :.
XP_005 KQVTFLIVFPIVFPLWITLPDVRKPSSRKFFPITFFGSITWIAVFSYLMVWWAHQVGETI
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 GIPDVIMGITFLAAGTSVPDCMASLIVARQGMGDMAVSNSIGSNVFDILIGLGLPWALQT
:: . :::.:.::::::.:: ..:.::::.:.::::::.:.:::.::: .:: ::: : :
XP_005 GISEEIMGLTILAAGTSIPDLITSVIVARKGLGDMAVSSSVGSNIFDITVGLPLPWLLYT
530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 LAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFS
. . . . ..: ::. .. ::. .. ..... : ::...: :: . :: ::: :
XP_005 V-IHRFQPVAVSSNGLFCAIVLLFIMLLFVILSIALCKWRMNKILGFIMFGLYFVFLVVS
590 600 610 620 630 640
630 640
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NP_065 VLLEDRILTCPVSI
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pF1KB7 IMTEFNVFTFVNLPMCGDH
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XP_016 VLLEDRILTCPVSI
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>>XP_005251482 (OMIM: 609838) PREDICTED: sodium/potassiu (661 aa)
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pF1KB7 MRPSGDEDRARRRRRRRRRRDLL--LSQLCFLASVALLLWSLSSLR
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pF1KB7 PNDIFTNEDRRQGAVVLHVLCAIYMFYALAIVCDDFFVPSLEKICERLHLSEDVAGATFM
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XP_005 PKDIFSLEERRKGAIILHVIGMIYMFIALAIVCDEFFVPSLTVITEKLGISDDVAGATFM
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160 170 180 190 200 210
pF1KB7 AAGSSAPELFTSVIGVFITKGDVGVGTIVGSAVFNILCIIGVCGLFAGQVVALSSWCLLR
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XP_005 AAGGSAPELFTSLIGVFIAHSNVGIGTIVGSAVFNILFVIGMCALFSREILNLTWWPLFR
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220 230 240 250 260 270
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XP_005 DVSFYIVDLIMLIIFFLDNVIMWWESLLLLTAYFCYVVFMKFNVQVEK-WVKQMINRNKV
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280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VNGLANNAEIDDSSNCDATVVLLK-KANFHRKASVIMVDELLSAYPHQLSFSEAGLRIMI
:. : .:. :. : : : ..: .: :: :. . .. ...::
XP_005 VKVTAPEAQAKPSAARDKDEPTLPAKPRLQRGGS--------SASLHNSLMRNSIFQLMI
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. : .:. ... ..:. :. .. . . .. .. .. .::..
XP_005 HTLDPLAEELGSYGKLKYYDTMTEEGRFREKASILHKIAKKKCHVD-ENERQNGAANHVE
360 370 380 390 400 410
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pF1KB7 PDRGVNGTRRDDVVAEAGNETE-----NENEDNENDEEEEEDEDDDEGPYTPFDTPSGKL
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XP_005 KQVTFLIVFPIVFPLWITLPDVRKPSSRKFFPITFFGSITWIAVFSYLMVWWAHQVGETI
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530 540 550 560 570 580
570 580 590 600 610 620
pF1KB7 LAVDYGSYIRLNSRGLIYSVGLLLASVFVTVFGVHLNKWQLDKKLGCGCLLLYGVFLCFS
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XP_005 V-IHRFQPVAVSSNGLFCAIVLLFIMLLFVILSIALCKWRMNKILGFIMFGLYFVFLVVS
590 600 610 620 630 640
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pF1KB7 IMTEFNVFTFVNLPMCGDH
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XP_005 VLLEDRILTCPVSI
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:
XP_011 CREDD
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.... . :: ::. : . .. :.: : .
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: :: :. . : :.::::..:. : ...: :::::::::..: :.::: ::::..
XP_011 VPLLGQVKEKPQYGKNPVVMVDEIMSSSPPKFTFPEAGLRIMITNKFGPRTRLRMASRII
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]