Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7265
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7265, 352 aa
1>>>pF1KB7265 352 - 352 aa - 352 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7243+/-0.000685; mu= 15.1684+/- 0.042
mean_var=73.0389+/-14.569, 0's: 0 Z-trim(111.4): 25 B-trim: 384 in 1/49
Lambda= 0.150071
statistics sampled from 12329 (12353) to 12329 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.741), E-opt: 0.2 (0.379), width: 16
Scan time: 3.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS46069.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 352) 2387 525.4 2.8e-149
CCDS12523.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 389) 2387 525.4 3e-149
CCDS74361.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 ( 234) 1551 344.3 6e-95
CCDS7691.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 ( 399) 882 199.6 3.8e-51
CCDS53590.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 ( 257) 827 187.6 1e-47
CCDS7273.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 747) 721 164.9 2e-40
CCDS44412.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 452) 572 132.5 6.8e-31
CCDS81469.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 ( 444) 485 113.7 3.1e-25
CCDS54966.1 SIRT5 gene_id:23408|Hs108|chr6 ( 292) 266 66.2 4.1e-11
>>CCDS46069.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (352 aa)
initn: 2387 init1: 2387 opt: 2387 Z-score: 2793.6 bits: 525.4 E(32554): 2.8e-149
Smith-Waterman score: 2387; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (1-352:1-352)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFR
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CCDS46 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 TPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGW
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB7 KKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPPAKDEARTTEREKPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 KKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPPAKDEARTTEREKPQ
310 320 330 340 350
>>CCDS12523.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (389 aa)
initn: 2387 init1: 2387 opt: 2387 Z-score: 2792.9 bits: 525.4 E(32554): 3e-149
Smith-Waterman score: 2387; 100.0% identity (100.0% similar) in 352 aa overlap (1-352:38-389)
10 20 30
pF1KB7 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HPLETQAGKVQEAQDSDSDSEGGAAGGEADMDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGV
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 ARYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ARYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKH
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 PEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAH
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 GTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCM
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 QSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGM
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 DFDSKKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DFDSKKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSA
310 320 330 340 350 360
340 350
pF1KB7 SPKKSPPPAKDEARTTEREKPQ
::::::::::::::::::::::
CCDS12 SPKKSPPPAKDEARTTEREKPQ
370 380
>>CCDS74361.1 SIRT2 gene_id:22933|Hs108|chr19 (234 aa)
initn: 1550 init1: 1550 opt: 1551 Z-score: 1818.1 bits: 344.3 E(32554): 6e-95
Smith-Waterman score: 1551; 98.3% identity (99.1% similar) in 233 aa overlap (1-233:1-233)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 SPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 SPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 TPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: . .:
CCDS74 TPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQGRGLAG
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 LSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGW
>>CCDS7691.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 (399 aa)
initn: 962 init1: 610 opt: 882 Z-score: 1031.7 bits: 199.6 E(32554): 3.8e-51
Smith-Waterman score: 968; 48.7% identity (75.6% similar) in 308 aa overlap (9-316:109-395)
10 20 30
pF1KB7 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSER
:.... :..... .:.:. ::. ....
CCDS76 FRRQPRAAAPSFFFSSIKGGRRSISFSVGASSVVGSGGSSDK--GKLSLQDVAELIRARA
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 CRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALA
:.::. .::::::: .::::::::..:::.::..: :::::::::. .: ..:.:::.::
CCDS76 CQRVVVMVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYDLPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLA
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 KELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHC
::::::..::.. :::.:::.::::::: :::::: :::..:. :::::::: .. :
CCDS76 KELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDGLERVSGIPASKLVEAHGTFASATC
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 VSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVD
. :.. .: .. .... .:.: : ..:::::::::: :: ::. . :: .:
CCDS76 TV--CQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPDIVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMAD
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAY
:::..::::.:.::::: . :.::::::.. : : . . ..
CCDS76 LLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRD--------------LVGPLAWHPRS--
320 330 340 350
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 RDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPP
:::: ::. .: .:.::::: .:..:::.:: ...:
CCDS76 RDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGKLDGPDK
360 370 380 390
340 350
pF1KB7 AKDEARTTEREKPQ
>>CCDS53590.1 SIRT3 gene_id:23410|Hs108|chr11 (257 aa)
initn: 905 init1: 553 opt: 827 Z-score: 970.3 bits: 187.6 E(32554): 1e-47
Smith-Waterman score: 913; 51.8% identity (75.4% similar) in 272 aa overlap (45-316:1-253)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 GSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRRVICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYH
.::::::: .::::::::..:::.::..:
CCDS53 MVGAGISTPSGIPDFRSPGSGLYSNLQQYD
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 LPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDT
:::::::::. .: ..:.:::.::::::::..::.. :::.:::.::::::: ::::::
CCDS53 LPYPEAIFELPFFFHNPKPFFTLAKELYPGNYKPNVTHYFLRLLHDKGLLLRLYTQNIDG
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 LERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQSLVKPD
:::..:. :::::::: .. :. :.. .: .. .... .:.: : ..::::
CCDS53 LERVSGIPASKLVEAHGTFASATCTV--CQRPFPGEDIRADVMADRVPRCPVCTGVVKPD
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 IVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAG
:::::: :: ::. . :: .::::..::::.:.::::: . :.::::::..
CCDS53 IVFFGEPLPQRFLLHV-VDFPMADLLLILGTSLEVEPFASLTEAVRSSVPRLLINRD---
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 QSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHAS
: : . . .. :::: ::. .: .:.::::: .:..:::.:: ..
CCDS53 -----------LVGPLAWHPRS--RDVAQLGDVVHGVESLVELLGWTEEMRDLVQRETGK
210 220 230 240 250
320 330 340 350
pF1KB7 IDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPPAKDEARTTEREKPQ
.:
CCDS53 LDGPDK
>>CCDS7273.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (747 aa)
initn: 675 init1: 310 opt: 721 Z-score: 839.1 bits: 164.9 E(32554): 2e-40
Smith-Waterman score: 721; 37.4% identity (64.7% similar) in 334 aa overlap (12-338:228-547)
10 20 30 40
pF1KB7 MDFLRNLFSQTLSLGSQKERLLDELTLEGVARYMQSERCRR
:: .... : :.: ... .: .:..
CCDS72 PRTILKDLLPETIPPPELDDMTLWQIVINILSEPPKRKKRKDINTIEDAVKLLQ--ECKK
200 210 220 230 240 250
50 60 70 80 90
pF1KB7 VICLVGAGISTSAGIPDFRSPSTGLYDNL--EKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAK
.: :.:::.:.: ::::::: :.: : . :: :.:.:.: ::.: :.::: .::
CCDS72 IIVLTGAGVSVSCGIPDFRS-RDGIYARLAVDFPDLPDPQAMFDIEYFRKDPRPFFKFAK
260 270 280 290 300 310
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 ELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCV
:.:::::.:..:: :. : .: ::: :::::::::..::... ... ::.: :. :.
CCDS72 EIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQR--IIQCHGSFATASCL
320 330 340 350 360 370
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 SASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQS-----LVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDF
:... .. ::..:.:.: : . ..::.::::::.:: .: :. :
CCDS72 I--CKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDK
380 390 400 410 420 430
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 LKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDS
.::::.:.:.::.:.: : . :. : .:..:::.: : : . . : : :
CCDS72 DEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPL----PHLHFDVELLGDCDVII
440 450 460 470 480
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 KKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKK
.. . .. :: . : ..: . : ...: : .. . . :.::..
CCDS72 NELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPER
490 500 510 520 530 540
340 350
pF1KB7 SPPPAKDEARTTEREKPQ
. ::
CCDS72 TSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDLKNV
550 560 570 580 590 600
>>CCDS44412.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (452 aa)
initn: 541 init1: 281 opt: 572 Z-score: 668.2 bits: 132.5 E(32554): 6.8e-31
Smith-Waterman score: 572; 36.9% identity (64.3% similar) in 263 aa overlap (81-338:1-252)
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 STSAGIPDFRSPSTGLYDNLEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTI
.:.: ::.: :.::: .:::.:::::.:..
CCDS44 MFDIEYFRKDPRPFFKFAKEIYPGQFQPSL
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 CHYFMRLLKDKGLLLRCYTQNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLS
:: :. : .: ::: :::::::::..::... ... ::.: :. :. :...
CCDS44 CHKFIALSDKEGKLLRNYTQNIDTLEQVAGIQR--IIQCHGSFATASCL--ICKYKVDCE
40 50 60 70 80
180 190 200 210 220
pF1KB7 WMKEKIFSEVTPKCEDCQS-----LVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGT
.. ::..:.:.: : . ..::.::::::.:: .: :. : .::::.:.:.
CCDS44 AVRGDIFNQVVPRCPRCPADEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGS
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 SLQVQPFASLISKAPLSTPRLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLG
::.:.: : . :. : .:..:::.: : : . . : : : .. . .. :
CCDS44 SLKVRPVALIPSSIPHEVPQILINREPL----PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLG--G
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 ECDQGCLALAELLGWKKELEDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPPAKDEART
: . : ..: . : ...: : .. . . :.::... ::
CCDS44 EYAKLCCNPVKL-SEITEKPPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVT
210 220 230 240 250
350
pF1KB7 TEREKPQ
CCDS44 LLDQAAKSNDDLDVSESKGCMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDLKNVGSSTGEKNERT
260 270 280 290 300 310
>>CCDS81469.1 SIRT1 gene_id:23411|Hs108|chr10 (444 aa)
initn: 454 init1: 210 opt: 485 Z-score: 566.5 bits: 113.7 E(32554): 3.1e-25
Smith-Waterman score: 485; 35.2% identity (62.7% similar) in 244 aa overlap (100-338:12-244)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 LEKYHLPYPEAIFEISYFKKHPEPFFALAKELYPGQFKPTICHYFMRLLKDKGLLLRCYT
:.:::::.:..:: :. : .: ::: ::
CCDS81 MCLCSGRKTILEIYPGQFQPSLCHKFIALSDKEGKLLRNYT
10 20 30 40
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 QNIDTLERIAGLEQEDLVEAHGTFYTSHCVSASCRHEYPLSWMKEKIFSEVTPKCEDCQS
:::::::..::... ... ::.: :. :. :... .. ::..:.:.: : .
CCDS81 QNIDTLEQVAGIQR--IIQCHGSFATASCL--ICKYKVDCEAVRGDIFNQVVPRCPRCPA
50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 -----LVKPDIVFFGESLPARFFSCMQSDFLKVDLLLVMGTSLQVQPFASLISKAPLSTP
..::.::::::.:: .: :. : .::::.:.:.::.:.: : . :. : .:
CCDS81 DEPLAIMKPEIVFFGENLPEQFHRAMKYDKDEVDLLIVIGSSLKVRPVALIPSSIPHEVP
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 RLLINKEKAGQSDPFLGMIMGLGGGMDFDSKKAYRDVAWLGECDQGCLALAELLGWKKEL
..:::.: : : . . : : : .. . .. :: . : ..: . :
CCDS81 QILINREPL----PHLHFDVELLGDCDVIINELCHRLG--GEYAKLCCNPVKL-SEITEK
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350
pF1KB7 EDLVRREHASIDAQSGAGVPNPSTSASPKKSPPPAKDEARTTEREKPQ
...: : .. . . :.::... ::
CCDS81 PPRTQKELAYLSELPPTPLHVSEDSSSPERTSPPDSSVIVTLLDQAAKSNDDLDVSESKG
220 230 240 250 260 270
CCDS81 CMEEKPQEVQTSRNVESIAEQMENPDLKNVGSSTGEKNERTSVAGTVRKCWPNRVAKEQI
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