FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7268, 548 aa 1>>>pF1KB7268 548 - 548 aa - 548 aa Library: /omim/omim.rfq.tfa 60827320 residues in 85289 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3588+/-0.000824; mu= 21.7799+/- 0.051 mean_var=299.4313+/-60.624, 0's: 0 Z-trim(110.3): 2140 B-trim: 79 in 2/50 Lambda= 0.074118 statistics sampled from 16263 (18606) to 16263 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16 Scan time: 7.380 The best scores are: opt bits E(85289) NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 58 ( 548) 3840 425.9 1.6e-118 NP_653291 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 i ( 517) 3644 404.9 3.2e-112 NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 56 ( 499) 1963 225.1 4e-58 XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1963 225.1 4e-58 XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1963 225.1 4e-58 XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1963 225.1 4e-58 NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [ ( 499) 1963 225.1 4e-58 XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1663 192.9 1.7e-48 XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1663 192.9 1.7e-48 NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1597 186.1 2.6e-46 NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1552 181.2 7.1e-45 XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 1473 172.8 2.4e-42 NP_001316584 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 455) 1469 172.2 3.1e-42 NP_001316580 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42 NP_001316583 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42 NP_001316581 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42 NP_001316582 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42 NP_659448 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 is ( 456) 1462 171.5 5.2e-42 NP_001316579 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42 NP_001316577 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1462 171.5 5.2e-42 NP_001316578 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1462 171.5 5.2e-42 XP_011517656 (OMIM: 194528) PREDICTED: zinc finger ( 460) 1462 171.5 5.2e-42 NP_001316576 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1462 171.5 5.2e-42 NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 1452 170.5 1.1e-41 NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1439 169.3 3.2e-41 XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1439 169.3 3.2e-41 XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1439 169.3 3.2e-41 XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1439 169.3 3.3e-41 NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1439 169.3 3.3e-41 XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1439 169.3 3.3e-41 NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1439 169.3 3.3e-41 XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1439 169.3 3.3e-41 XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1439 169.3 3.3e-41 NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1439 169.3 3.4e-41 NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1427 167.9 7.7e-41 NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1427 167.9 7.7e-41 NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1427 168.0 8e-41 NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1427 168.0 8e-41 NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 554) 1423 167.5 1e-40 NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1422 167.5 1.2e-40 XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1422 167.5 1.2e-40 NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1422 167.6 1.2e-40 NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1422 167.6 1.2e-40 NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1422 167.6 1.2e-40 XP_016882860 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 519) 1405 165.5 3.7e-40 XP_011526665 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40 XP_011526669 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40 XP_011526671 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40 XP_016882858 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40 XP_011526668 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40 >>NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 is (548 aa) initn: 3840 init1: 3840 opt: 3840 Z-score: 2248.9 bits: 425.9 E(85289): 1.6e-118 Smith-Waterman score: 3840; 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