Result of FASTA (omim) for pF1KB7268
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7268, 548 aa
  1>>>pF1KB7268 548 - 548 aa - 548 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
  60827320 residues in 85289 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3588+/-0.000824; mu= 21.7799+/- 0.051
 mean_var=299.4313+/-60.624, 0's: 0 Z-trim(110.3): 2140  B-trim: 79 in 2/50
 Lambda= 0.074118
 statistics sampled from 16263 (18606) to 16263 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.547), E-opt: 0.2 (0.218), width:  16
 Scan time:  7.380

The best scores are:                                      opt bits E(85289)
NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 58 ( 548) 3840 425.9 1.6e-118
NP_653291 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 i ( 517) 3644 404.9 3.2e-112
NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 56 ( 499) 1963 225.1   4e-58
XP_016881830 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1963 225.1   4e-58
XP_011524814 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1963 225.1   4e-58
XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 499) 1963 225.1   4e-58
NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [ ( 499) 1963 225.1   4e-58
XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1663 192.9 1.7e-48
XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger ( 434) 1663 192.9 1.7e-48
NP_001092096 (OMIM: 603980) zinc finger protein 98 ( 572) 1597 186.1 2.6e-46
NP_775802 (OMIM: 603982) zinc finger protein 100 [ ( 542) 1552 181.2 7.1e-45
XP_011526007 (OMIM: 603980) PREDICTED: zinc finger ( 531) 1473 172.8 2.4e-42
NP_001316584 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 455) 1469 172.2 3.1e-42
NP_001316580 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42
NP_001316583 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42
NP_001316581 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42
NP_001316582 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42
NP_659448 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 is ( 456) 1462 171.5 5.2e-42
NP_001316579 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 456) 1462 171.5 5.2e-42
NP_001316577 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1462 171.5 5.2e-42
NP_001316578 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1462 171.5 5.2e-42
XP_011517656 (OMIM: 194528) PREDICTED: zinc finger ( 460) 1462 171.5 5.2e-42
NP_001316576 (OMIM: 194528) zinc finger protein 25 ( 460) 1462 171.5 5.2e-42
NP_001284553 (OMIM: 613910) zinc finger protein 48 ( 492) 1452 170.5 1.1e-41
NP_001276331 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 616) 1439 169.3 3.2e-41
XP_016882731 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 621) 1439 169.3 3.2e-41
XP_016882730 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 628) 1439 169.3 3.2e-41
XP_016882729 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 658) 1439 169.3 3.3e-41
NP_001276330 (OMIM: 604077) zinc finger protein 13 ( 658) 1439 169.3 3.3e-41
XP_005259268 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1439 169.3 3.3e-41
NP_003427 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 670) 1439 169.3 3.3e-41
XP_006723425 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1439 169.3 3.3e-41
XP_006723426 (OMIM: 604077) PREDICTED: zinc finger ( 670) 1439 169.3 3.3e-41
NP_009065 (OMIM: 604077) zinc finger protein 135 i ( 682) 1439 169.3 3.4e-41
NP_001291422 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1427 167.9 7.7e-41
NP_001291423 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 585) 1427 167.9 7.7e-41
NP_666016 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 is ( 643) 1427 168.0   8e-41
NP_001291421 (OMIM: 194527) zinc finger protein 23 ( 643) 1427 168.0   8e-41
NP_001274461 (OMIM: 603974) zinc finger protein 92 ( 554) 1423 167.5   1e-40
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 1422 167.5 1.2e-40
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 1422 167.5 1.2e-40
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1422 167.6 1.2e-40
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 1422 167.6 1.2e-40
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 1422 167.6 1.2e-40
XP_016882860 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 519) 1405 165.5 3.7e-40
XP_011526665 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40
XP_011526669 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40
XP_011526671 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40
XP_016882858 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40
XP_011526668 (OMIM: 611811) PREDICTED: zinc finger ( 556) 1405 165.5 3.8e-40


>>NP_001307300 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 is  (548 aa)
 initn: 3840 init1: 3840 opt: 3840  Z-score: 2248.9  bits: 425.9 E(85289): 1.6e-118
Smith-Waterman score: 3840; 99.6% identity (100.0% similar) in 548 aa overlap (1-548:1-548)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MDPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRD
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRD
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 LYRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LYRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELF
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 PKQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEM
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PKQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEM
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 PTFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFK
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 YGSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YGSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 LIEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LIEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQH
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 QTVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QTVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIH
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 TGEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERK
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
NP_001 TGEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTEKK
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 PYEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNG
       ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PYEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHNRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNG
              490       500       510       520       530       540

               
pF1KB7 SNGESPLA
       ::::::::
NP_001 SNGESPLA
               

>>NP_653291 (OMIM: 615600) zinc finger protein 582 isofo  (517 aa)
 initn: 3644 init1: 3644 opt: 3644  Z-score: 2135.8  bits: 404.9 E(85289): 3.2e-112
Smith-Waterman score: 3644; 99.6% identity (100.0% similar) in 517 aa overlap (32-548:1-517)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB7 DPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
                                     ::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653                               MSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
                                             10        20        30

              70        80        90       100       110       120 
pF1KB7 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFP
               40        50        60        70        80        90

             130       140       150       160       170       180 
pF1KB7 KQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 KQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMP
              100       110       120       130       140       150

             190       200       210       220       230       240 
pF1KB7 TFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 TFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKY
              160       170       180       190       200       210

             250       260       270       280       290       300 
pF1KB7 GSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQL
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 GSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQL
              220       230       240       250       260       270

             310       320       330       340       350       360 
pF1KB7 IEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 IEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQ
              280       290       300       310       320       330

             370       380       390       400       410       420 
pF1KB7 TVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 TVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHT
              340       350       360       370       380       390

             430       440       450       460       470       480 
pF1KB7 GEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERKP
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
NP_653 GEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTEKKP
              400       410       420       430       440       450

             490       500       510       520       530       540 
pF1KB7 YEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGS
       :::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_653 YEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHNRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGS
              460       470       480       490       500       510

              
pF1KB7 NGESPLA
       :::::::
NP_653 NGESPLA
              

>>NP_001035939 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [H  (499 aa)
 initn: 1459 init1: 1459 opt: 1963  Z-score: 1164.5  bits: 225.1 E(85289): 4e-58
Smith-Waterman score: 1963; 58.8% identity (79.1% similar) in 473 aa overlap (32-504:1-469)

              10        20        30        40        50        60 
pF1KB7 DPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
                                     :. :   :::::: :: :::. : ::::::
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>>XP_011524816 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro  (499 aa)
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XP_011                               MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDL
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pF1KB7 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFP
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XP_011 YREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWMIANDVTGPWCPDLESRC---EKFL
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pF1KB7 KQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMP
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XP_011 QKDIFEIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRADWECEGQFERQV-NEECYFKQVNVTYGHMP
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pF1KB7 TFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKY
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XP_011 VFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSR
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pF1KB7 GSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQL
       .:.:.::. ::.:.:::.::.:::::.  :..: :::.::: ::::::.: :.: . :::
XP_011 ASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQL
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pF1KB7 IEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQ
       : ::::::::::: ::.::::: : :.: :: ::::: .:: ::::::.: ..:::  ::
XP_011 ILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTVHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQ
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pF1KB7 TVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHT
        .:::.: ::::::::.: ..: . ::::::.:::::::: ::::::  .:: .:::.::
XP_011 RIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHT
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pF1KB7 GEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERKP
       :..::.:: ::.::.: :.:  : :::::.:::::::::::: . ::: ::: ::: .::
XP_011 GDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKP
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pF1KB7 YEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGS
       :: .::  .. ..:  .. ::.:                                     
XP_011 YECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG       
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>>NP_689690 (OMIM: 614275) zinc finger protein 565 [Homo  (499 aa)
 initn: 1459 init1: 1459 opt: 1963  Z-score: 1164.5  bits: 225.1 E(85289): 4e-58
Smith-Waterman score: 1963; 58.8% identity (79.1% similar) in 473 aa overlap (32-504:1-469)

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pF1KB7 DPLALPSQDSALPQERNQKEDLSALEILKVMSLGSELFRDVAIVFSQEEWQWLAPAQRDL
                                     :. :   :::::: :: :::. : ::::::
NP_689                               MAQGLVTFRDVAIEFSLEEWKCLEPAQRDL
                                             10        20        30

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pF1KB7 YRDVMLETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFP
       ::.: ::....:.::::..:::::.:.:::::::::.   :.:  :: ::::    : : 
NP_689 YREVTLENFGHLASLGLSISKPDVVSLLEQGKEPWMIANDVTGPWCPDLESRC---EKFL
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pF1KB7 KQHVYEVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMP
       .. ..:. . .:::::::    :: :.:. ::::..::.::  : . .:.:. . . .::
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pF1KB7 TFDQHASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKY
       .:..:.: :  :. .: :: .  ..: : : .   ::.:: :.:.:::. ::::::::. 
NP_689 VFQHHTSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSR
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pF1KB7 GSRLIQHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQL
       .:.:.::. ::.:.:::.::.:::::.  :..: :::.::: ::::::.: :.: . :::
NP_689 ASHLVQHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQL
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pF1KB7 IEHQRTHTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQ
       : ::::::::::: ::.::::: : :.: :: ::::: .:: ::::::.: ..:::  ::
NP_689 ILHQRTHTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTVHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQ
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pF1KB7 TVHTGRKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHT
        .:::.: ::::::::.: ..: . ::::::.:::::::: ::::::  .:: .:::.::
NP_689 RIHTGEKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHT
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pF1KB7 GEKPYQCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERKP
       :..::.:: ::.::.: :.:  : :::::.:::::::::::: . ::: ::: ::: .::
NP_689 GDRPYECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKP
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pF1KB7 YEYKECEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGS
       :: .::  .. ..:  .. ::.:                                     
NP_689 YECRECGMAFIRSSQLTEHQRIHPGIKPYECRECGQAFILGSQLIEHYRIHTG       
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>>XP_016881831 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro  (434 aa)
 initn: 1459 init1: 1459 opt: 1663  Z-score: 991.5  bits: 192.9 E(85289): 1.7e-48
Smith-Waterman score: 1663; 57.4% identity (77.9% similar) in 408 aa overlap (97-504:1-404)

         70        80        90       100       110       120      
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XP_016                               MIANDVTGPWCPDLESRC---EKFLQKDIF
                                             10           20       

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pF1KB7 EVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMPTFDQH
       :. . .:::::::    :: :.:. ::::..::.::  : . .:.:. . . .::.:..:
XP_016 EIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRADWECEGQFERQV-NEECYFKQVNVTYGHMPVFQHH
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pF1KB7 ASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKYGSRLI
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pF1KB7 QHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQLIEHQR
       ::. ::.:.:::.::.:::::.  :..: :::.::: ::::::.: :.: . :::: :::
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pF1KB7 THTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQTVHTG
       :::::::: ::.::::: : :.: :: ::::: .:: ::::::.: ..:::  :: .:::
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pF1KB7 RKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHTGEKPY
       .: ::::::::.: ..: . ::::::.:::::::: ::::::  .:: .:::.:::..::
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pF1KB7 QCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERKPYEYKE
       .:: ::.::.: :.:  : :::::.:::::::::::: . ::: ::: ::: .:::: .:
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pF1KB7 CEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGSNGESP
       :  .. ..:  .. ::.:                                          
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>>XP_016881832 (OMIM: 614275) PREDICTED: zinc finger pro  (434 aa)
 initn: 1459 init1: 1459 opt: 1663  Z-score: 991.5  bits: 192.9 E(85289): 1.7e-48
Smith-Waterman score: 1663; 57.4% identity (77.9% similar) in 408 aa overlap (97-504:1-404)

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pF1KB7 LETYSNLVSLGLAVSKPDVISFLEQGKEPWMVERVVSGGLCPVLESRYDTKELFPKQHVY
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XP_016                               MIANDVTGPWCPDLESRC---EKFLQKDIF
                                             10           20       

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pF1KB7 EVESPQWEIMESLTSYGLECSSFQDDWECRNQFDRQQGNPDRHFHQMIIRHEEMPTFDQH
       :. . .:::::::    :: :.:. ::::..::.::  : . .:.:. . . .::.:..:
XP_016 EIGAFNWEIMESLKCSDLEGSDFRADWECEGQFERQV-NEECYFKQVNVTYGHMPVFQHH
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pF1KB7 ASLTFYQKIHTREKPFGYNKCRKDFWQKELLINHQGIYTNEKPYKCKECGKAFKYGSRLI
       .: :  :. .: :: .  ..: : : .   ::.:: :.:.:::. ::::::::. .:.:.
XP_016 TSHTVRQSRETGEKLMECHECGKAFSRGSHLIQHQKIHTGEKPFGCKECGKAFSRASHLV
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pF1KB7 QHENIHSGKKPYECKECGKAFNSGSNFIQHQRVHTGEKPYECKDCEKAFSRSSQLIEHQR
       ::. ::.:.:::.::.:::::.  :..: :::.::: ::::::.: :.: . :::: :::
XP_016 QHQRIHTGEKPYDCKDCGKAFGRTSELILHQRLHTGVKPYECKECGKTFRQHSQLILHQR
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pF1KB7 THTGEKPYQCKECGKAFNRISHLKVHYRIHTGEKPYACKECGKTFSHRSQLIQHQTVHTG
       :::::::: ::.::::: : :.: :: ::::: .:: ::::::.: ..:::  :: .:::
XP_016 THTGEKPYVCKDCGKAFIRGSQLTVHRRIHTGARPYECKECGKAFRQHSQLTVHQRIHTG
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pF1KB7 RKLYECKECGKAFNQGSTLIRHQRIHTGEKPYECKVCGKAFRVSSQLKQHQRIHTGEKPY
       .: ::::::::.: ..: . ::::::.:::::::: ::::::  .:: .:::.:::..::
XP_016 EKPYECKECGKGFIHSSEVTRHQRIHSGEKPYECKECGKAFRQHAQLTRHQRVHTGDRPY
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pF1KB7 QCKVCGRAFKRVSHLTVHYRIHTGEKPYECKECGKAFSHCSQLIHHQVIHTERKPYEYKE
       .:: ::.::.: :.:  : :::::.:::::::::::: . ::: ::: ::: .:::: .:
XP_016 ECKDCGKAFSRSSYLIQHQRIHTGDKPYECKECGKAFIRVSQLTHHQRIHTCEKPYECRE
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pF1KB7 CEKTLSHDSTTVQPQRMHSRETHVNIINVEKPSISSYPLLIIREFMLASNHMNGSNGESP
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]
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