Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7269
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7269, 431 aa
1>>>pF1KB7269 431 - 431 aa - 431 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4165+/-0.00122; mu= 8.5104+/- 0.072
mean_var=233.1357+/-49.993, 0's: 0 Z-trim(109.6): 887 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.083998
statistics sampled from 10043 (11029) to 10043 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.686), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16
Scan time: 2.260
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2693.1 ZNF621 gene_id:285268|Hs108|chr3 ( 439) 2739 345.3 6.8e-95
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CCDS46803.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 ( 576) 1358 178.1 1.9e-44
CCDS46802.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 ( 616) 1358 178.2 2e-44
CCDS58825.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 ( 308) 987 132.8 4.4e-31
CCDS33740.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 ( 422) 987 133.0 5.4e-31
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CCDS33102.1 ZNF331 gene_id:55422|Hs108|chr19 ( 463) 943 127.7 2.3e-29
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 314) 931 126.1 5e-29
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 932 126.4 5.7e-29
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 931 126.2 5.9e-29
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 931 126.2 5.9e-29
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 922 125.2 1.4e-28
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 921 125.1 1.6e-28
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 921 125.2 1.7e-28
CCDS74207.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 307) 916 124.2 1.7e-28
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 920 125.1 1.8e-28
CCDS46097.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 679) 921 125.3 1.9e-28
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 920 125.1 2e-28
CCDS12491.1 ZNF565 gene_id:147929|Hs108|chr19 ( 499) 917 124.6 2.1e-28
CCDS42427.1 ZSCAN30 gene_id:100101467|Hs108|chr18 ( 494) 916 124.5 2.3e-28
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 921 125.5 2.4e-28
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 921 125.5 2.5e-28
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 911 123.9 3.5e-28
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 913 124.3 3.7e-28
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 910 123.9 4.2e-28
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 904 122.9 5.2e-28
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 904 123.0 6.2e-28
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 904 123.0 6.4e-28
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 904 123.1 6.7e-28
CCDS33121.1 ZNF582 gene_id:147948|Hs108|chr19 ( 517) 903 122.9 7.1e-28
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 904 123.1 7.1e-28
CCDS82335.1 ZNF529 gene_id:57711|Hs108|chr19 ( 458) 901 122.6 7.8e-28
CCDS33002.1 ZFP14 gene_id:57677|Hs108|chr19 ( 533) 901 122.7 8.6e-28
CCDS54256.1 ZNF529 gene_id:57711|Hs108|chr19 ( 563) 901 122.7 8.9e-28
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 901 122.8 9.4e-28
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 901 122.8 9.8e-28
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 901 122.8 9.9e-28
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 901 122.9 1e-27
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 900 122.7 1e-27
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 900 122.7 1e-27
CCDS13812.1 ZNF70 gene_id:7621|Hs108|chr22 ( 446) 897 122.1 1.1e-27
CCDS74348.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 540) 897 122.2 1.2e-27
CCDS54257.1 ZNF461 gene_id:92283|Hs108|chr19 ( 563) 897 122.3 1.2e-27
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 893 121.7 1.5e-27
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 890 121.5 2.6e-27
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 886 121.0 3.5e-27
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 886 121.0 3.5e-27
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 886 121.0 3.6e-27
CCDS12972.1 ZNF329 gene_id:79673|Hs108|chr19 ( 541) 884 120.7 3.6e-27
>>CCDS2693.1 ZNF621 gene_id:285268|Hs108|chr3 (439 aa)
initn: 2739 init1: 2739 opt: 2739 Z-score: 1817.2 bits: 345.3 E(32554): 6.8e-95
Smith-Waterman score: 2739; 100.0% identity (100.0% similar) in 390 aa overlap (42-431:50-439)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 NLASDVLGILVALGFDDFRGEFCNQQPPEILVAFPFPKPALISHLERGEAPWGPDPWDTE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 FTQNQWASLDPAQRALYGEVMLENYANVASLVAFPFPKPALISHLERGEAPWGPDPWDTE
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 ILRGISQGGESWIKNEGLVIKQEASEETELHRMPVGGLLRNVSQHFDFKRKALKQTFNLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 ILRGISQGGESWIKNEGLVIKQEASEETELHRMPVGGLLRNVSQHFDFKRKALKQTFNLN
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 PNLILRGGMKFYECKECGKIFRYNSKLIRHQMSHTGEKPFKCKECGKAFKSSYDCIVHEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 PNLILRGGMKFYECKECGKIFRYNSKLIRHQMSHTGEKPFKCKECGKAFKSSYDCIVHEK
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 NHIGEGPYECKECGKGLSSNTALTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFRRSAAYLQHQRLHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 NHIGEGPYECKECGKGLSSNTALTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFRRSAAYLQHQRLHTG
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 EKLYKCKECWKAFGCRSLFIVHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 EKLYKCKECWKAFGCRSLFIVHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPY
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 ECKVCGKAFKWYGSFVQHQKLHPVEKKPVKVLGPSLVSPQCSSPAIPPVLLQGSCSASAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 ECKVCGKAFKWYGSFVQHQKLHPVEKKPVKVLGPSLVSPQCSSPAIPPVLLQGSCSASAV
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 AVPSLTFPHAVLIPTSGNFFMLLPTSGIPSSSAQIVRVFQGLTPTVKPSPVILTPSSHSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 AVPSLTFPHAVLIPTSGNFFMLLPTSGIPSSSAQIVRVFQGLTPTVKPSPVILTPSSHSS
380 390 400 410 420 430
>>CCDS46801.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 (532 aa)
initn: 1191 init1: 1191 opt: 1358 Z-score: 911.8 bits: 178.1 E(32554): 1.8e-44
Smith-Waterman score: 1358; 62.6% identity (79.4% similar) in 310 aa overlap (126-430:223-531)
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pF1KB7 SEETELHRMPVGGLLRNVSQHFDFKRKALKQTFNLNPNLI----LRGGMKFYECKECGKI
:.:. : .:. :.::.. ::: .:::
CCDS46 CGKTFRYNSKLSRHQKIHTGEKPYSCEECGQAFSQNSHLLQHQKLHGGQRPYECTDCGKT
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FRYNSKLIRHQMSHTGEKPFKCKECGKAFKSSYDCIVHEKNHIGEGPYECKECGKGLSSN
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CCDS46 FSYNSKLIRHQRIHTGEKPFKCKECGKAFSCSYDCIIHERIHNGEKPYECKECGKSLSSN
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 TALTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFRRSAAYLQHQRLHTGEKLYKCKECWKAFGCRSLFI
..: :::::::::::::::::::::.::...:::::.::::.::::.::::.:.: : ::
CCDS46 SVLIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFHRSSVFLQHQRFHTGEQLYKCNECWKTFSCSSRFI
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPYECKVCGKAFKWYGSFVQHQK
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CCDS46 VHQRIHNGEKPYECQECGKTFSQKITLVQHQRVHTGEKPYECKECGKAFRWNASFIQHQK
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 LHPVEKKPVKVLGPSLVSPQCSSPAIPPVLLQGSCSASAVAVPSLTFPHAVLIPTSGNFF
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CCDS46 WH-TRKKLINGTGLSAVKPYCPCAILSPLPPQHTCSALAPPGPPLSSSHAVVLPPSVPFF
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430
pF1KB7 MLLPTSGIPSSS-AQIVRVFQGLTPTVKPSPVILTPSSHSS
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CCDS46 LLLPSSEKANPSPVQIAHFFQDLAFPGKSSLQSPNPLSHSL
500 510 520 530
>>CCDS46803.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 (576 aa)
initn: 1191 init1: 1191 opt: 1358 Z-score: 911.4 bits: 178.1 E(32554): 1.9e-44
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pF1KB7 SEETELHRMPVGGLLRNVSQHFDFKRKALKQTFNLNPNLI----LRGGMKFYECKECGKI
:.:. : .:. :.::.. ::: .:::
CCDS46 CGKTFRYNSKLSRHQKIHTGEKPYSCEECGQAFSQNSHLLQHQKLHGGQRPYECTDCGKT
240 250 260 270 280 290
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FRYNSKLIRHQMSHTGEKPFKCKECGKAFKSSYDCIVHEKNHIGEGPYECKECGKGLSSN
: ::::::::: ::::::::::::::::. :::::.::. : :: :::::::::.::::
CCDS46 FSYNSKLIRHQRIHTGEKPFKCKECGKAFSCSYDCIIHERIHNGEKPYECKECGKSLSSN
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220 230 240 250 260 270
pF1KB7 TALTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFRRSAAYLQHQRLHTGEKLYKCKECWKAFGCRSLFI
..: :::::::::::::::::::::.::...:::::.::::.::::.::::.:.: : ::
CCDS46 SVLIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFHRSSVFLQHQRFHTGEQLYKCNECWKTFSCSSRFI
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280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPYECKVCGKAFKWYGSFVQHQK
::::::.:::::.:.::::.:.:::. .::::::::::::::: :::::.: .::.::::
CCDS46 VHQRIHNGEKPYECQECGKTFSQKITLVQHQRVHTGEKPYECKECGKAFRWNASFIQHQK
420 430 440 450 460 470
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 LHPVEKKPVKVLGPSLVSPQCSSPAIPPVLLQGSCSASAVAVPSLTFPHAVLIPTSGNFF
: ..:: .. : : :.: : . :. : .::: : : :. :::..: : ::
CCDS46 WH-TRKKLINGTGLSAVKPYCPCAILSPLPPQHTCSALAPPGPPLSSSHAVVLPPSVPFF
480 490 500 510 520 530
400 410 420 430
pF1KB7 MLLPTSGIPSSS-AQIVRVFQGLTPTVKPSPVILTPSSHSS
.:::.: . : .::.. :: :. : : .: :::
CCDS46 LLLPSSEKANPSPVQIAHFFQDLAFPGKSSLQSPNPLSHSL
540 550 560 570
>>CCDS46802.1 ZNF619 gene_id:285267|Hs108|chr3 (616 aa)
initn: 1191 init1: 1191 opt: 1358 Z-score: 911.1 bits: 178.2 E(32554): 2e-44
Smith-Waterman score: 1358; 62.6% identity (79.4% similar) in 310 aa overlap (126-430:307-615)
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 SEETELHRMPVGGLLRNVSQHFDFKRKALKQTFNLNPNLI----LRGGMKFYECKECGKI
:.:. : .:. :.::.. ::: .:::
CCDS46 CGKTFRYNSKLSRHQKIHTGEKPYSCEECGQAFSQNSHLLQHQKLHGGQRPYECTDCGKT
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 FRYNSKLIRHQMSHTGEKPFKCKECGKAFKSSYDCIVHEKNHIGEGPYECKECGKGLSSN
: ::::::::: ::::::::::::::::. :::::.::. : :: :::::::::.::::
CCDS46 FSYNSKLIRHQRIHTGEKPFKCKECGKAFSCSYDCIIHERIHNGEKPYECKECGKSLSSN
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 TALTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFRRSAAYLQHQRLHTGEKLYKCKECWKAFGCRSLFI
..: :::::::::::::::::::::.::...:::::.::::.::::.::::.:.: : ::
CCDS46 SVLIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFHRSSVFLQHQRFHTGEQLYKCNECWKTFSCSSRFI
400 410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 VHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPYECKVCGKAFKWYGSFVQHQK
::::::.:::::.:.::::.:.:::. .::::::::::::::: :::::.: .::.::::
CCDS46 VHQRIHNGEKPYECQECGKTFSQKITLVQHQRVHTGEKPYECKECGKAFRWNASFIQHQK
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 LHPVEKKPVKVLGPSLVSPQCSSPAIPPVLLQGSCSASAVAVPSLTFPHAVLIPTSGNFF
: ..:: .. : : :.: : . :. : .::: : : :. :::..: : ::
CCDS46 WH-TRKKLINGTGLSAVKPYCPCAILSPLPPQHTCSALAPPGPPLSSSHAVVLPPSVPFF
520 530 540 550 560 570
400 410 420 430
pF1KB7 MLLPTSGIPSSS-AQIVRVFQGLTPTVKPSPVILTPSSHSS
.:::.: . : .::.. :: :. : : .: :::
CCDS46 LLLPSSEKANPSPVQIAHFFQDLAFPGKSSLQSPNPLSHSL
580 590 600 610
>>CCDS58825.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 (308 aa)
initn: 1334 init1: 975 opt: 987 Z-score: 671.4 bits: 132.8 E(32554): 4.4e-31
Smith-Waterman score: 987; 65.5% identity (83.7% similar) in 203 aa overlap (139-341:106-307)
110 120 130 140 150 160
pF1KB7 LLRNVSQHFDFKRKALKQTFNLNPNLILRGGMKFYECKECGKIFRYNSKLIRHQMSHTGE
: : .::::::: ::::: :::::. :::.
CCDS58 PSGQISYECGQCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGK
80 90 100 110 120 130
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 KPFKCKECGKAFKSSYDCIVHEKNHIGEGPYECKECGKGLSSNTALTQHQRIHTGEKPYE
::::::::::...:. : :.. : :: :::::::::..::.... ::::.::::: ::
CCDS58 KPFKCKECGKGLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYE
140 150 160 170 180 190
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 CKECGKAFRRSAAYLQHQRLHTGEKLYKCKECWKAFGCRSLFIVHQRIHTGEKPYQCKEC
:.:: :.: :... :::.::::: :.:::: : .. . . ::::::::::..::::
CCDS58 CNECWKTFSCSSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKEC
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 GKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPYECKVCGKAFKWYGSFVQHQKLHPVEKKPVKVLGPSLV
::::.:::. ::::::::::::::::::::.:.: : :. ::::: ..: ::.
CCDS58 GKAFNQKITLIQHQRVHTGEKPYECKVCGKTFSWCGRFILHQKLH-TQKTPVQA
260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 SPQCSSPAIPPVLLQGSCSASAVAVPSLTFPHAVLIPTSGNFFMLLPTSGIPSSSAQIVR
>>CCDS33740.1 ZNF620 gene_id:253639|Hs108|chr3 (422 aa)
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20 30 40 50 60 70
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20 30 40 50 60 70
80 90 100 110
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: :::: : :. ..:::. :...:.::: :. :::: :::::.::
CCDS33 REALRGICPGDEARTEKEGLTPKDHVSKETESFRLMVGGLPGNVSQHLDFGSSLEQPQGH
80 90 100 110 120 130
120 130 140
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CCDS33 WIIKTKSKRRHFTDTSARHHEAYEVKNGEKFEKLGKNISVSTQLTTNQTNPSGQISYECG
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
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CCDS33 QCGRYFIQMADFHRHEKCHTGEKSFECKECGKYFRYNSLLIRHQIIHTGKKPFKCKECGK
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210 220 230 240 250 260
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::::.::: ::::::::::::::::::::: :...:::::.:::::::.:.::::.:.:
CCDS33 GLSSDTALIQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSSSVFLQHQRFHTGEKLYECNECWKTFSC
260 270 280 290 300 310
270 280 290
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: : ::::.:::::::.:::::: ::.:::.
CCDS33 SSSFTVHQRMHTGEKPYECKECGKRLSSNTALTQHQRIHTGEKPFECKECGKAFNQKITL
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300 310 320 330 340 350
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::::::::::::::::::::.:.: : :. ::::: ..: ::.
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360 370 380 390 400 410
pF1KB7 PVLLQGSCSASAVAVPSLTFPHAVLIPTSGNFFMLLPTSGIPSSSAQIVRVFQGLTPTVK
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20 30 40 50 60
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...: ::::::: ::::. :: . :
CCDS10 FTKTEWTGLSPAQRALYRSVMLENFGNLTALGYPVPKPALISLLERGDMAWGLEAQDDPP
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70 80 90 100 110 120
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CCDS10 AERTKNVCKDVETNIDSESTLI-QGISEERD--GMMSHGQLKSVPQRTDFPETRNVEKHQ
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130 140 150 160 170 180
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CCDS10 DIPTVKNIQGKVPRIPCARKPFICEECGKSFSYFSYYARHQRIHTGEKPFECSECGKAFN
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190 200 210 220 230 240
pF1KB7 SSYDCIVHEKNHIGEGPYECKECGKGLSSNTALTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFRRSAA
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CCDS10 GNSSLIRHQRIHTGERPYQCEECGRAFNDNANLIRHQRIHSGDRPYYCTECGNSFTSSSE
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pF1KB7 YLQHQRLHTGEKLYKCKECWKAFGCRSLFIVHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQH
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CCDS10 FVIHQRIHTGEKPYECNECGKAFVGNSPLLRHQKIHTGEKPYECNECGKSFGRTSHLSQH
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 QRVHTGEKPYECKVCGKAFKWYGSFVQHQKLHPVEKKPVKVLGPSLVSPQCSSPAIPPVL
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CCDS10 QRIHTGEKPYSCKVCGQAFNFHTKLTRHQRIHS-EEKPFDCVDCGKAFSAQEQLKRHLRI
320 330 340 350 360 370
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 LQGSCSASAVAVPSLTFPHAVLIPTSGNFFMLLPTSGIPSSSAQIVRVFQGLTPTVKPSP
CCDS10 HTQESSYVCDECGKALTSKRNLHQHQRIHTGEKPYECSKYEKAFGTSSQLGHLEHVYSGE
380 390 400 410 420 430
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CCDS33 VKRPATREGTPPRTHQRHHKENSFECKDCGKAFSRGYQLSQHQKIHTGEKPYECKECKKA
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pF1KB7 FRYNSKLIRHQMSHTGEKPFKCKECGKAFKSSYDCIVHEKNHIGEGPYECKECGKGLSSN
::....: .:: ::::::..::.:::::. . . ..:.. : :: :::::.:::.. .
CCDS33 FRWGNQLTQHQKIHTGEKPYECKDCGKAFRWGSSLVIHKRIHTGEKPYECKDCGKAFRRG
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220 230 240 250 260 270
pF1KB7 TALTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFRRSAAYLQHQRLHTGEKLYKCKECWKAFGCRSLFI
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CCDS33 DELTQHQRFHTGEKDYECKDCGKTFSRVYKLIQHKRIHSGEKPYECKDCGKAFICGSSLI
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pF1KB7 VHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPYECKVCGKAFKWYGSFVQHQK
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CCDS33 QHKRIHTGEKPYECQECGKAFTRVNYLTQHQKIHTGEKPHECKECGKAFRWGSSLVKHER
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.: :: : :
CCDS33 IHTGEK-PYKCTECGKAFNCGYHLTQHERIHTGETPYKCKECGKAFIYGSSLVKHERIHT
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CCDS74 EDLPTLSHHPSFTLQQIINSKKKFCASKEYRKTFRHGSQFATHEIIHTIEKPYECKECGK
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CCDS74 SFRHPSRLTHHQKIHTGKKPFECKECGKTFICGSDLTRHHRIHTGEKPYECKECGKAFSS
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CCDS74 GSNFTRHQRIHTGEKPYECKECGKAFSSGSNFTQHQRIHTGEKPYECKECGNAFSQSSQL
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pF1KB7 IVHQRIHTGEKPYQCKECGKAFTQKIASIQHQRVHTGEKPYECKVCGKAFKWYGSFVQHQ
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CCDS74 IKHQRIHTGEKPYECKECEKAFRSGSDLTRHQRIHTGEKPYECKICGKAYSQSSQLISHH
230 240 250 260 270 280
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pF1KB7 KLHPVEKKPVKVLGPSLVSPQCSSPAIPPVLLQGSCSASAVAVPSLTFPHAVLIPTSGNF
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CCDS74 RIHTSEKPYEYRECGKNFNYDPQLIQHQNLYW
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pF1KB7 ILRGISQGGESWIKNEGLVIKQEASEETELHRMPVGGLLRNVSQHFDFKRKALKQTFNLN
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CCDS43 EEKLTPRGERSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVG----DRPHKCDECSKSFNRTSDLI
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CCDS43 QHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSALILHRR
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CCDS43 EKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHTGENPY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]