Result of FASTA (ccds) for
pF1KB7272
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7272, 442 aa
1>>>pF1KB7272 442 - 442 aa - 442 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8334+/-0.000818; mu= 16.1017+/- 0.050
mean_var=105.1919+/-20.112, 0's: 0 Z-trim(111.4): 50 B-trim: 79 in 1/50
Lambda= 0.125050
statistics sampled from 12262 (12311) to 12262 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.378), width: 16
Scan time: 3.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4191.1 SPOCK1 gene_id:6695|Hs108|chr5 ( 439) 3140 577.0 1.3e-164
CCDS54817.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 ( 436) 1679 313.4 2.9e-85
CCDS34095.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 ( 433) 1646 307.4 1.8e-83
CCDS56344.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 ( 385) 1471 275.8 5.2e-74
CCDS7313.1 SPOCK2 gene_id:9806|Hs108|chr10 ( 424) 1350 254.0 2.1e-67
CCDS75207.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 ( 344) 1288 242.8 4.1e-64
CCDS56347.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 ( 313) 1265 238.6 6.8e-63
CCDS56343.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 ( 316) 1163 220.2 2.4e-57
CCDS58931.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 ( 338) 1021 194.6 1.3e-49
CCDS56346.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 ( 393) 814 157.3 2.5e-38
>>CCDS4191.1 SPOCK1 gene_id:6695|Hs108|chr5 (439 aa)
initn: 2719 init1: 2719 opt: 3140 Z-score: 3068.8 bits: 577.0 E(32554): 1.3e-164
Smith-Waterman score: 3140; 99.3% identity (99.3% similar) in 442 aa overlap (1-442:1-439)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MPAIAVLAAAAAAWCFLQVESRHLDALAGGAGPNHGNFLDNDQWLSTVSQYDRDKYWNRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MPAIAVLAAAAAAWCFLQVESRHLDALAGGAGPNHGNFLDNDQWLSTVSQYDRDKYWNRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 RDEVEDDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLPRQ
:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 RD---DDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLPRQ
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATLCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATLCD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 GPCPCLPEPEPPKHKAERSACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKPTSSNTAQGRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 GPCPCLPEPEPPKHKAERSACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKPTSSNTAQGRF
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKDGKLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKDGKLS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 NNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTGQCWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 NNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTGQCWC
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 VDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKLRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 VDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKLRVHT
360 370 380 390 400 410
430 440
pF1KB7 RAVTEDDEDEDDDKEDEVGYIW
::::::::::::::::::::::
CCDS41 RAVTEDDEDEDDDKEDEVGYIW
420 430
>>CCDS54817.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 (436 aa)
initn: 1523 init1: 1113 opt: 1679 Z-score: 1644.4 bits: 313.4 E(32554): 2.9e-85
Smith-Waterman score: 1687; 54.4% identity (75.6% similar) in 434 aa overlap (5-435:6-427)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPAIAVLAAAAAAWCFLQVESRHLDALAGGAGPNHGNFLDNDQWLSTVSQYDRD-KYWN
::: . ::::: .. . : ::: . . :::::. :::.:.::::.. ::
CCDS54 MLKVSAVLCVCAAAWCSQSLAAAAAVAAAGGRS-DGGNFLDDKQWLTTISQYDKEVGQWN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RFRDEVEDDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLP
.:::::::::::.:.:.:::::::::.::::::.::: ::::..:: :::.:.:...:
CCDS54 KFRDEVEDDYFRTWSPGKPFDQALDPAKDPCLKMKCSRHKVCIAQDSQTAVCISHRRLTH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RQKKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATL
:.:...: ...: :: : :: :::. . :::::::.:. .::::..:: ::....
CCDS54 RMKEAGVDHRQWRGPI-LSTCKQCPVVYPSPVCGSDGHTYSFQCKLEYQACVLGKQISVK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CDGPCPCLPEPEPPK-HKAERSACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKP-TSSNTA
:.: ::: : .: . . . ::.: :.:..:.::.::: ::::.... : :
CCDS54 CEGHCPC-PSDKPTSTSRNVKRACSDLEFREVANRLRDWFKALHESGSQNKKTKTLLRPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 QGRFDTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKD
..:::::::::::::::::::.:: ::::::: ::. .::::: : : : .:::::..::
CCDS54 RSRFDTSILPICKDSLGWMFNRLDTNYDLLLDQSELRSIYLDKNEQCTKAFFNSCDTYKD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GKLSNNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTG
. .::::::::::. :::.:.. ::: . :.::: .:: :.:.:::: ::::::.:
CCDS54 SLISNNEWCYCFQRQQDPPCQTELSNIQKRQGVKKLLGQYIPLCDEDGYYKPTQCHGSVG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 QCWCVDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKL
::::::.::::. ::: .:...: . : ::::.:: :: . : .. . :
CCDS54 QCWCVDRYGNEVMGSRINGVADCAIDFEISGDFASGDFHEWTDDEDDEDDIMNDEDE---
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KB7 RVHTRAVTEDDEDEDDDKEDEVGYIW
. .::::: :: .
CCDS54 ------IEDDDEDEGDDDDGGDDHDVYI
420 430
>>CCDS34095.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 (433 aa)
initn: 1581 init1: 1008 opt: 1646 Z-score: 1612.2 bits: 307.4 E(32554): 1.8e-83
Smith-Waterman score: 1654; 53.7% identity (74.9% similar) in 434 aa overlap (5-435:6-424)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPAIAVLAAAAAAWCFLQVESRHLDALAGGAGPNHGNFLDNDQWLSTVSQYDRD-KYWN
::: . ::::: .. . : ::: . . :::::. :::.:.::::.. ::
CCDS34 MLKVSAVLCVCAAAWCSQSLAAAAAVAAAGGRS-DGGNFLDDKQWLTTISQYDKEVGQWN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RFRDEVEDDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLP
.::: :::::.:.:.:::::::::.::::::.::: ::::..:: :::.:.:...:
CCDS34 KFRD---DDYFRTWSPGKPFDQALDPAKDPCLKMKCSRHKVCIAQDSQTAVCISHRRLTH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RQKKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATL
:.:...: ...: :: : :: :::. . :::::::.:. .::::..:: ::....
CCDS34 RMKEAGVDHRQWRGPI-LSTCKQCPVVYPSPVCGSDGHTYSFQCKLEYQACVLGKQISVK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CDGPCPCLPEPEPPK-HKAERSACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKP-TSSNTA
:.: ::: : .: . . . ::.: :.:..:.::.::: ::::.... : :
CCDS34 CEGHCPC-PSDKPTSTSRNVKRACSDLEFREVANRLRDWFKALHESGSQNKKTKTLLRPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 QGRFDTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKD
..:::::::::::::::::::.:: ::::::: ::. .::::: : : : .:::::..::
CCDS34 RSRFDTSILPICKDSLGWMFNRLDTNYDLLLDQSELRSIYLDKNEQCTKAFFNSCDTYKD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GKLSNNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTG
. .::::::::::. :::.:.. ::: . :.::: .:: :.:.:::: ::::::.:
CCDS34 SLISNNEWCYCFQRQQDPPCQTELSNIQKRQGVKKLLGQYIPLCDEDGYYKPTQCHGSVG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 QCWCVDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKL
::::::.::::. ::: .:...: . : ::::.:: :: . : .. . :
CCDS34 QCWCVDRYGNEVMGSRINGVADCAIDFEISGDFASGDFHEWTDDEDDEDDIMNDEDE---
360 370 380 390 400 410
420 430 440
pF1KB7 RVHTRAVTEDDEDEDDDKEDEVGYIW
. .::::: :: .
CCDS34 ------IEDDDEDEGDDDDGGDDHDVYI
420 430
>>CCDS56344.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 (385 aa)
initn: 1401 init1: 1003 opt: 1471 Z-score: 1442.3 bits: 275.8 E(32554): 5.2e-74
Smith-Waterman score: 1479; 54.4% identity (76.1% similar) in 373 aa overlap (65-435:15-376)
40 50 60 70 80 90
pF1KB7 HGNFLDNDQWLSTVSQYDRDKYWNRFRDEVEDDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKC
.:::::.:.:.:::::::::.::::::.::
CCDS56 MITQDHIHMSSGLSQDDYFRTWSPGKPFDQALDPAKDPCLKMKC
10 20 30 40
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 SPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLPRQKKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSD
: ::::..:: :::.:.:...: :.:...: ...: :: : :: :::. . :::::
CCDS56 SRHKVCIAQDSQTAVCISHRRLTHRMKEAGVDHRQWRGPI-LSTCKQCPVVYPSPVCGSD
50 60 70 80 90 100
160 170 180 190 200 210
pF1KB7 GHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATLCDGPCPCLPEPEPPK-HKAERSACTDKELRNLASRL
::.:. .::::..:: ::.... :.: ::: : .: . . . ::.: :.:..:.::
CCDS56 GHTYSFQCKLEYQACVLGKQISVKCEGHCPC-PSDKPTSTSRNVKRACSDLEFREVANRL
110 120 130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB7 KDWFGALHEDANRVIKP-TSSNTAQGRFDTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEI
.::: ::::.... : : ..:::::::::::::::::::.:: ::::::: ::.
CCDS56 RDWFKALHESGSQNKKTKTLLRPERSRFDTSILPICKDSLGWMFNRLDTNYDLLLDQSEL
170 180 190 200 210 220
280 290 300 310 320 330
pF1KB7 NAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKDGKLSNNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSL
.::::: : : : .:::::..::. .::::::::::. :::.:.. ::: . :.:
CCDS56 RSIYLDKNEQCTKAFFNSCDTYKDSLISNNEWCYCFQRQQDPPCQTELSNIQKRQGVKKL
230 240 250 260 270 280
340 350 360 370 380 390
pF1KB7 LGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTGQCWCVDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSG
:: .:: :.:.:::: ::::::.:::::::.::::. ::: .:...: . : ::::.::
CCDS56 LGQYIPLCDEDGYYKPTQCHGSVGQCWCVDRYGNEVMGSRINGVADCAIDFEISGDFASG
290 300 310 320 330 340
400 410 420 430 440
pF1KB7 GSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKLRVHTRAVTEDDEDEDDDKEDEVGYIW
:: . : .. . : . .::::: :: .
CCDS56 DFHEWTDDEDDEDDIMNDEDE---------IEDDDEDEGDDDDGGDDHDVYI
350 360 370 380
>>CCDS7313.1 SPOCK2 gene_id:9806|Hs108|chr10 (424 aa)
initn: 868 init1: 427 opt: 1350 Z-score: 1323.7 bits: 254.0 E(32554): 2.1e-67
Smith-Waterman score: 1366; 47.3% identity (71.1% similar) in 425 aa overlap (25-442:25-424)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPAIAVLAAAAAAWCFLQVESRHLDALAGGAGPNHGNFLDNDQWLSTVSQYD-RDKYWNR
:: . : . :::....::::..:::. . :.:::
CCDS73 MRAPGCGRLVLPLLLLAAAALAEGDAKGLKEGETPGNFMEDEQWLSSISQYSGKIKHWNR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 FRDEVEDDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLPR
:::::::::...:. :. :.::: .:::: ::::: ::::..: :: :.:.:::.: :
CCDS73 FRDEVEDDYIKSWEDNQQGDEALDTTKDPCQKVKCSRHKVCIAQGYQRAMCISRKKLEHR
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 QKKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATLC
:. .: . : : .. . :::: .:: : :::::::.:.: :::: .:: ..:.::. :
CCDS73 IKQPTV-KLH--GNKDSI-CKPCHMAQLASVCGSDGHTYSSVCKLEQQACLSSKQLAVRC
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 DGPCPCLPEPEPPKHKAERS--ACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKPTSSNTAQ
.::::: : . :. . .:: ..: .:..::.::: :::.... . .:
CCDS73 EGPCPC-PTEQAATSTADGKPETCTGQDLADLGDRLRDWFQLLHENSKQNGSASSVAGPA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 GRFDTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKDG
. .: :. ::::.::::.::: . ::.:: .:. :: ::::: ::.:.:::::..:::
CCDS73 SGLDKSLGASCKDSIGWMFSKLDTSADLFLDQTELAAINLDKYEVCIRPFFNSCDTYKDG
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 KLSNNEWCYCF--QKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGST
..:. :::.:: .:: :: :..::: .:. : ::: :.:.:::. :: :.
CCDS73 RVSTAEWCFCFWREKP---PCLAELERIQIQEAAKKKPGIFIPSCDEDGYYRKMQCDQSS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 GQCWCVDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGK
:.:::::. : ::.:.: .:. .:.. ::::::: .: .:.: :
CCDS73 GDCWCVDQLGLELTGTRTHGSPDCDDIVGFSGDFGSG--------------VGWEDEEEK
360 370 380 390
420 430 440
pF1KB7 LRVHTRAVTEDDEDEDDD--KEDEVGYIW
.:. . :. :.:. . . :. ::::
CCDS73 ---ETEEAGEEAEEEEGEAGEADDGGYIW
400 410 420
>>CCDS75207.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 (344 aa)
initn: 1219 init1: 821 opt: 1288 Z-score: 1264.5 bits: 242.8 E(32554): 4.1e-64
Smith-Waterman score: 1296; 52.3% identity (74.3% similar) in 346 aa overlap (92-435:1-335)
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 DEVEDDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLPRQK
.::: ::::..:: :::.:.:...: :.:
CCDS75 MKCSRHKVCIAQDSQTAVCISHRRLTHRMK
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 KGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATLCDG
...: ...: :: : :: :::. . :::::::.:. .::::..:: ::.... :.:
CCDS75 EAGVDHRQWRGPI-LSTCKQCPVVYPSPVCGSDGHTYSFQCKLEYQACVLGKQISVKCEG
40 50 60 70 80
190 200 210 220 230
pF1KB7 PCPCLPEPEPPK-HKAERSACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKP-TSSNTAQGR
::: : .: . . . ::.: :.:..:.::.::: ::::.... : : ..:
CCDS75 HCPC-PSDKPTSTSRNVKRACSDLEFREVANRLRDWFKALHESGSQNKKTKTLLRPERSR
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 FDTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKDGKL
::::::::::::::::::.:: ::::::: ::. .::::: : : : .:::::..::. .
CCDS75 FDTSILPICKDSLGWMFNRLDTNYDLLLDQSELRSIYLDKNEQCTKAFFNSCDTYKDSLI
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 SNNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTGQCW
::::::::::. :::.:.. ::: . :.::: .:: :.:.:::: ::::::.::::
CCDS75 SNNEWCYCFQRQQDPPCQTELSNIQKRQGVKKLLGQYIPLCDEDGYYKPTQCHGSVGQCW
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 CVDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKLRVH
:::.::::. ::: .:...: . : ::::.:: :: . : .. . :
CCDS75 CVDRYGNEVMGSRINGVADCAIDFEISGDFASGDFHEWTDDEDDEDDIMNDEDE------
270 280 290 300 310 320
420 430 440
pF1KB7 TRAVTEDDEDEDDDKEDEVGYIW
. .::::: :: .
CCDS75 ---IEDDDEDEGDDDDGGDDHDVYI
330 340
>>CCDS56347.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 (313 aa)
initn: 1153 init1: 649 opt: 1265 Z-score: 1242.6 bits: 238.6 E(32554): 6.8e-63
Smith-Waterman score: 1265; 56.1% identity (77.9% similar) in 312 aa overlap (5-313:6-311)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPAIAVLAAAAAAWCFLQVESRHLDALAGGAGPNHGNFLDNDQWLSTVSQYDRD-KYWN
::: . ::::: .. . : ::: . . :::::. :::.:.::::.. ::
CCDS56 MLKVSAVLCVCAAAWCSQSLAAAAAVAAAGGRS-DGGNFLDDKQWLTTISQYDKEVGQWN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RFRDEVEDDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLP
.::: :::::.:.:.:::::::::.::::::.::: ::::..:: :::.:.:...:
CCDS56 KFRD---DDYFRTWSPGKPFDQALDPAKDPCLKMKCSRHKVCIAQDSQTAVCISHRRLTH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RQKKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATL
:.:...: ...: :: : :: :::. . :::::::.:. .::::..:: ::....
CCDS56 RMKEAGVDHRQWRGPI-LSTCKQCPVVYPSPVCGSDGHTYSFQCKLEYQACVLGKQISVK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CDGPCPCLPEPEPPK-HKAERSACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKP-TSSNTA
:.: ::: : .: . . . ::.: :.:..:.::.::: ::::.... : :
CCDS56 CEGHCPC-PSDKPTSTSRNVKRACSDLEFREVANRLRDWFKALHESGSQNKKTKTLLRPE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 QGRFDTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKD
..:::::::::::::::::::.:: ::::::: ::. .::::: : : : .:::::..::
CCDS56 RSRFDTSILPICKDSLGWMFNRLDTNYDLLLDQSELRSIYLDKNEQCTKAFFNSCDTYKD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 GKLSNNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTG
. .::::::::::. :
CCDS56 SLISNNEWCYCFQRQQGKR
300 310
>>CCDS56343.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 (316 aa)
initn: 1180 init1: 782 opt: 1163 Z-score: 1143.1 bits: 220.2 E(32554): 2.4e-57
Smith-Waterman score: 1171; 52.1% identity (73.2% similar) in 317 aa overlap (121-435:2-307)
100 110 120 130 140 150
pF1KB7 KVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLPRQKKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMV
:...: ...: :: : :: :::. . :
CCDS56 MKEAGVDHRQWRGPI-LSTCKQCPVVYPSPV
10 20 30
160 170 180 190 200
pF1KB7 CGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATLCDGPCPCLPEPEPPK-HKAERSACTDKELRNL
::::::.:. .::::..:: ::.... :.: ::: : .: . . . ::.: :.:..
CCDS56 CGSDGHTYSFQCKLEYQACVLGKQISVKCEGHCPC-PSDKPTSTSRNVKRACSDLEFREV
40 50 60 70 80
210 220 230 240 250 260
pF1KB7 ASRLKDWFGALHEDANRVIKP-TSSNTAQGRFDTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLD
:.::.::: ::::.... : : ..:::::::::::::::::::.:: :::::::
CCDS56 ANRLRDWFKALHESGSQNKKTKTLLRPERSRFDTSILPICKDSLGWMFNRLDTNYDLLLD
90 100 110 120 130 140
270 280 290 300 310 320
pF1KB7 PSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKDGKLSNNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSK
::. .::::: : : : .:::::..::. .::::::::::. :::.:.. ::: .
CCDS56 QSELRSIYLDKNEQCTKAFFNSCDTYKDSLISNNEWCYCFQRQQDPPCQTELSNIQKRQG
150 160 170 180 190 200
330 340 350 360 370 380
pF1KB7 GKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTGQCWCVDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGD
:.::: .:: :.:.:::: ::::::.:::::::.::::. ::: .:...: . : :::
CCDS56 VKKLLGQYIPLCDEDGYYKPTQCHGSVGQCWCVDRYGNEVMGSRINGVADCAIDFEISGD
210 220 230 240 250 260
390 400 410 420 430 440
pF1KB7 FGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKLRVHTRAVTEDDEDEDDDKEDEVGYIW
:.:: :: . : .. . : . .::::: :: .
CCDS56 FASGDFHEWTDDEDDEDDIMNDEDE---------IEDDDEDEGDDDDGGDDHDVYI
270 280 290 300 310
>>CCDS58931.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 (338 aa)
initn: 1162 init1: 782 opt: 1021 Z-score: 1004.2 bits: 194.6 E(32554): 1.3e-49
Smith-Waterman score: 1029; 52.9% identity (73.2% similar) in 276 aa overlap (162-435:64-329)
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 GPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATLCDGPCPCLPEPEP
::::..:: ::.... :.: ::: : .:
CCDS58 DGGNFLDDKQWLTTISQYDKEVGQWNKFRDCKLEYQACVLGKQISVKCEGHCPC-PSDKP
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240
pF1KB7 PK-HKAERSACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKP-TSSNTAQGRFDTSILPICK
. . . ::.: :.:..:.::.::: ::::.... : : ..:::::::::::
CCDS58 TSTSRNVKRACSDLEFREVANRLRDWFKALHESGSQNKKTKTLLRPERSRFDTSILPICK
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 DSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKDGKLSNNEWCYCFQ
::::::::.:: ::::::: ::. .::::: : : : .:::::..::. .::::::::::
CCDS58 DSLGWMFNRLDTNYDLLLDQSELRSIYLDKNEQCTKAFFNSCDTYKDSLISNNEWCYCFQ
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 KPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTGQCWCVDKYGNELA
. :::.:.. ::: . :.::: .:: :.:.:::: ::::::.:::::::.::::.
CCDS58 RQQDPPCQTELSNIQKRQGVKKLLGQYIPLCDEDGYYKPTQCHGSVGQCWCVDRYGNEVM
220 230 240 250 260 270
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKLRVHTRAVTEDDED
::: .:...: . : ::::.:: :: . : .. . : . .::::
CCDS58 GSRINGVADCAIDFEISGDFASGDFHEWTDDEDDEDDIMNDEDE---------IEDDDED
280 290 300 310 320
430 440
pF1KB7 EDDDKEDEVGYIW
: :: .
CCDS58 EGDDDDGGDDHDVYI
330
>>CCDS56346.1 SPOCK3 gene_id:50859|Hs108|chr4 (393 aa)
initn: 1405 init1: 775 opt: 814 Z-score: 801.6 bits: 157.3 E(32554): 2.5e-38
Smith-Waterman score: 1485; 50.7% identity (69.2% similar) in 432 aa overlap (5-435:6-384)
10 20 30 40 50
pF1KB7 MPAIAVLAAAAAAWCFLQVESRHLDALAGGAGPNHGNFLDNDQWLSTVSQYDRD-KYWN
::: . ::::: .. . : ::: . . :::::. :::.:.::::.. ::
CCDS56 MLKVSAVLCVCAAAWCSQSLAAAAAVAAAGGRS-DGGNFLDDKQWLTTISQYDKEVGQWN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB7 RFRDEVEDDYFRNWNPNKPFDQALDPSKDPCLKVKCSPHKVCVTQDYQTALCVSRKHLLP
.::: :::::.:.:.:::::::::.::::::.::: ::::..:: :::.:.:...:
CCDS56 KFRD---DDYFRTWSPGKPFDQALDPAKDPCLKMKCSRHKVCIAQDSQTAVCISHRRLTH
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB7 RQKKGNVAQKHWVGPSNLVKCKPCPVAQSAMVCGSDGHSYTSKCKLEFHACSTGKSLATL
:.:...: ...: :: : :: :::. . :::::::.:. .::::..:: ::....
CCDS56 RMKEAGVDHRQWRGPI-LSTCKQCPVVYPSPVCGSDGHTYSFQCKLEYQACVLGKQISVK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB7 CDGPCPCLPEPEPPKHKAERSACTDKELRNLASRLKDWFGALHEDANRVIKPTSSNTAQG
:.: ::: : .: . :: :. .:
CCDS56 CEGHCPC-PSDKPTS-------------------------------------TSRNVKRG
180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KB7 RFDTSILPICKDSLGWMFNKLDMNYDLLLDPSEINAIYLDKYEPCIKPLFNSCDSFKDGK
::::::::::::::::::.:: ::::::: ::. .::::: : : : .:::::..::.
CCDS56 -FDTSILPICKDSLGWMFNRLDTNYDLLLDQSELRSIYLDKNEQCTKAFFNSCDTYKDSL
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB7 LSNNEWCYCFQKPGGLPCQNEMNRIQKLSKGKSLLGAFIPRCNEEGYYKATQCHGSTGQC
.::::::::::. :::.:.. ::: . :.::: .:: :.:.:::: ::::::.:::
CCDS56 ISNNEWCYCFQRQQDPPCQTELSNIQKRQGVKKLLGQYIPLCDEDGYYKPTQCHGSVGQC
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KB7 WCVDKYGNELAGSRKQGAVSCEEEQETSGDFGSGGSVVLLDDLEYERELGPKDKEGKLRV
::::.::::. ::: .:...: . : ::::.:: :: . : .. . :
CCDS56 WCVDRYGNEVMGSRINGVADCAIDFEISGDFASGDFHEWTDDEDDEDDIMNDEDE-----
320 330 340 350 360 370
420 430 440
pF1KB7 HTRAVTEDDEDEDDDKEDEVGYIW
. .::::: :: .
CCDS56 ----IEDDDEDEGDDDDGGDDHDVYI
380 390
442 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 06:32:25 2016 done: Fri Nov 4 06:32:25 2016
Total Scan time: 3.250 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]