Result of FASTA (ccds) for pF1KB7294
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

Query: pF1KB7294, 769 aa
  1>>>pF1KB7294 769 - 769 aa - 769 aa
Library: human.CCDS.faa
  18511270 residues in 32554 sequences

Statistics:  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9674+/-0.000967; mu= 19.7370+/- 0.059
 mean_var=162.5648+/-29.907, 0's: 0 Z-trim(112.1): 89  B-trim: 12 in 1/50
 Lambda= 0.100591
 statistics sampled from 12795 (12886) to 12795 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
 ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.396), width:  16
 Scan time:  4.450

The best scores are:                                      opt bits E(32554)
CCDS11486.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17        ( 769) 5487 809.0       0
CCDS82139.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17        ( 569) 3927 582.4 6.6e-166
CCDS43609.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7        ( 870) 2932 438.3 2.5e-122
CCDS43608.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7        ( 899) 2932 438.3 2.5e-122
CCDS43610.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7        ( 859) 2919 436.4 9.2e-122
CCDS47637.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7        ( 906) 2919 436.4 9.5e-122
CCDS2369.1 ADAM23 gene_id:8745|Hs108|chr2          ( 832) 2621 393.1 9.4e-109
CCDS7654.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10         ( 738) 1266 196.4 1.4e-49
CCDS7653.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10         ( 909) 1266 196.5 1.6e-49
CCDS1088.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1          ( 772) 1228 190.9 6.4e-48
CCDS58032.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1         ( 796) 1228 191.0 6.5e-48
CCDS1084.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1          ( 814) 1228 191.0 6.6e-48
CCDS1086.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1          ( 838) 1228 191.0 6.8e-48
CCDS1085.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1          ( 839) 1228 191.0 6.8e-48
CCDS44236.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1         ( 862) 1228 191.0 6.9e-48
CCDS1087.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1          ( 863) 1228 191.0 6.9e-48
CCDS58031.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1         ( 824) 1222 190.1 1.2e-47
CCDS4338.1 ADAM19 gene_id:8728|Hs108|chr5          ( 918) 1210 188.4 4.4e-47
CCDS63219.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20       ( 812) 1168 182.3 2.8e-45
CCDS13058.1 ADAM33 gene_id:80332|Hs108|chr20       ( 813) 1168 182.3 2.8e-45
CCDS60282.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1         ( 633) 1064 167.0 8.3e-41
CCDS6112.1 ADAM9 gene_id:8754|Hs108|chr8           ( 819) 1060 166.6 1.5e-40
CCDS9804.1 ADAM21 gene_id:8747|Hs108|chr14         ( 722)  964 152.6 2.1e-36
CCDS32111.1 ADAM20 gene_id:8748|Hs108|chr14        ( 776)  935 148.4 4.1e-35
CCDS3823.1 ADAM29 gene_id:11086|Hs108|chr4         ( 820)  919 146.1 2.1e-34
CCDS6045.1 ADAM7 gene_id:8756|Hs108|chr8           ( 754)  913 145.2 3.7e-34
CCDS6113.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8          ( 739)  888 141.6 4.5e-33
CCDS34884.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8          ( 735)  884 141.0 6.7e-33
CCDS34865.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8        ( 775)  859 137.4 8.5e-32
CCDS83287.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8         ( 715)  850 136.0   2e-31
CCDS64882.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8          ( 716)  840 134.6 5.5e-31
CCDS47846.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8       ( 787)  835 133.9 9.6e-31
CCDS58103.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10          ( 742)  806 129.7 1.7e-29
CCDS31319.2 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10          ( 824)  803 129.3 2.5e-29
CCDS58102.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10          ( 733)  753 122.0 3.5e-27
CCDS907.1 ADAM30 gene_id:11085|Hs108|chr1          ( 790)  752 121.9 4.1e-27
CCDS47830.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8        ( 540)  743 120.3   8e-27
CCDS64883.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8          ( 672)  698 113.9 8.4e-25
CCDS83286.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8       ( 688)  517 87.7 6.9e-17
CCDS55212.1 ADAMDEC1 gene_id:27299|Hs108|chr8      ( 391)  391 69.1 1.6e-11
CCDS6044.1 ADAMDEC1 gene_id:27299|Hs108|chr8       ( 470)  391 69.2 1.8e-11


>>CCDS11486.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17             (769 aa)
 initn: 5487 init1: 5487 opt: 5487  Z-score: 4314.1  bits: 809.0 E(32554):    0
Smith-Waterman score: 5487; 100.0% identity (100.0% similar) in 769 aa overlap (1-769:1-769)

               10        20        30        40        50        60
pF1KB7 MRLLRRWAFAALLLSLLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSGG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRLLRRWAFAALLLSLLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSGG
               10        20        30        40        50        60

               70        80        90       100       110       120
pF1KB7 EVRKQQLDTRVRQEPPGGPPVHLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSRE
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVRKQQLDTRVRQEPPGGPPVHLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSRE
               70        80        90       100       110       120

              130       140       150       160       170       180
pF1KB7 GTTQHSTGAGDHCYYQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GTTQHSTGAGDHCYYQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAP
              130       140       150       160       170       180

              190       200       210       220       230       240
pF1KB7 QGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKY
              190       200       210       220       230       240

              250       260       270       280       290       300
pF1KB7 VELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQ
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQ
              250       260       270       280       290       300

              310       320       330       340       350       360
pF1KB7 VQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEY
              310       320       330       340       350       360

              370       380       390       400       410       420
pF1KB7 GNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSID
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSID
              370       380       390       400       410       420

              430       440       450       460       470       480
pF1KB7 EYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLT
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLT
              430       440       450       460       470       480

              490       500       510       520       530       540
pF1KB7 HDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQG
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQG
              490       500       510       520       530       540

              550       560       570       580       590       600
pF1KB7 RCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGF
              550       560       570       580       590       600

              610       620       630       640       650       660
pF1KB7 LLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNML
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNML
              610       620       630       640       650       660

              670       680       690       700       710       720
pF1KB7 CLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPP
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPP
              670       680       690       700       710       720

              730       740       750       760         
pF1KB7 TGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA
       :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA
              730       740       750       760         

>>CCDS82139.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17             (569 aa)
 initn: 3902 init1: 3902 opt: 3927  Z-score: 3092.0  bits: 582.4 E(32554): 6.6e-166
Smith-Waterman score: 3927; 96.7% identity (97.7% similar) in 571 aa overlap (199-769:3-569)

      170       180       190       200       210       220        
pF1KB7 EPQEVAGPWGAPQGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVR
                                     : : : :  : :. :. : . .   :..::
CCDS82                             MQGTRLPVCC-ACPVGSSKPAEAE---KEKVR
                                           10         20           

      230       240       250       260       270       280        
pF1KB7 RGHPTVHSETKYVELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLV
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RGHPTVHSETKYVELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLV
       30        40        50        60        70        80        

      290       300       310       320       330       340        
pF1KB7 AMETWADGDKIQVQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGI
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AMETWADGDKIQVQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGI
       90       100       110       120       130       140        

      350       360       370       380       390       400        
pF1KB7 CSLSHGGGVNEYGNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGF
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CSLSHGGGVNEYGNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGF
      150       160       170       180       190       200        

      410       420       430       440       450       460        
pF1KB7 YLPRKFSRCSIDEYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSR
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YLPRKFSRCSIDEYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSR
      210       220       230       240       250       260        

      470       480       490       500       510       520        
pF1KB7 AGGNCCKKCTLTHDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLH
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AGGNCCKKCTLTHDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLH
      270       280       290       300       310       320        

      530       540       550       560       570       580        
pF1KB7 KLDGYYCDHEQGRCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGW
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KLDGYYCDHEQGRCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGW
      330       340       350       360       370       380        

      590       600       610       620       630       640        
pF1KB7 VQCSKQDVLCGFLLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSY
       ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VQCSKQDVLCGFLLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSY
      390       400       410       420       430       440        

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CCDS82 A
        

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CCDS43 LAHNIGIISDKRKLASGECKCEDTWSGCIMGDTGYYLPKKFTQCNIEEYHDFLNSGGGAC
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CCDS43 LFNKPSKLLDPPECGNGFIETGEECDCGTPAECVLEGAECCKKCTLTQDSQCSDGLCCKK
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CCDS43 GTNIIIGIIAGTILVLALILGITAWGYKNYREQRSNGLSHSWSERIPDTKHISDICENGR
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CCDS43 PRSNSWQGNLGGNKKKIRGKRFRPRSNSTEYLNPWFKRDYNVAKWVEDVNKNTEGPYFRT
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>>CCDS43610.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7             (859 aa)
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CCDS43 PARCGQAGDASLMELEKRKENRFVERQSIVPLRLIYRSGGEDESRHDALDTRVRGDL-GG
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       ..:::: ::.:::::.::::.: ::: ::..::.:      . :  .  : .:.. :.  
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         : :   :   .  .:..     ::. : :::.::   .:. ::::.::...::: .:.
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        :::. . : :::.:::::  :.:. :::::.:::::: .::::::.:.   :::::::.
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CCDS47 KYRRDFIKEKSDAVHLFSGSQFESSRSGAAYIGGICSLLKGGGVNEFGKTDLMAVTLAQS
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CCDS47 LAHNIGIISDKRKLASGECKCEDTWSGCIMGDTGYYLPKKFTQCNIEEYHDFLNSGGGAC
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CCDS47 LFNKPSKLLDPPECGNGFIETGEECDCGTPAECVLEGAECCKKCTLTQDSQCSDGLCCKK
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pF1KB7 CQVLWGH--AAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGFLLCVNISGAPR
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CCDS47 CKYIWGQKVTASDKYCYEKLNIEGTEKGNCGKDKDTWIQCNKRDVLCGYLLCTNIGNIPR
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CCDS47 LGELDGEITSTLVVQQGRTLNCSGGHVKLEEDVDLGYVEDGTPCGPQMMCLEHRCLPVAS
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CCDS47 FNFSTCLSSKEGTICSGNGVCSNELKCVCNRHWIGSDCNTYFPHNDDAKTGITLSGNGVA
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pF1KB7 GTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA                      
       ::::::: :::..:: :..:: :.::.:: :. :                          
CCDS47 GTNIIIGIIAGTILVLALILGITAWGYKNYREQRQLPQGDYVKKPGDGDSFYSDIPPGVS
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CCDS47 TNSASSSKKRSNGLSHSWSERIPDTKHISDICENGRPRSNSWQGNLGGNKKKIRGKRFRP
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>>CCDS2369.1 ADAM23 gene_id:8745|Hs108|chr2               (832 aa)
 initn: 1826 init1: 744 opt: 2621  Z-score: 2065.9  bits: 393.1 E(32554): 9.4e-109
Smith-Waterman score: 2621; 52.7% identity (75.4% similar) in 728 aa overlap (46-765:110-823)

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pF1KB7 LLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRE-SSGGEVRKQQLDTRVRQE
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CCDS23 EKNLGVLADEDNTLQQNSSSNISYSNAMQKEITLPSRLIYYINQDSESPYHVLDTKARHQ
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CCDS23 QKHNKAVHLAQASFQIEAFGSKFILDLILNNGLLSSDYVEIHY-ENGKPQYSKG-GEHCY
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pF1KB7 YQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAPQGPLPHLIYRTPLL
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CCDS23 YHGSIRGVKDSKVALSTCNGLHGMFEDDTFVYMIEPLELVH--DEKSTGRPHIIQKT--L
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pF1KB7 PDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPT--VHSETKYVELIVINDHQLF
           . ..   :    ... :        ::. :  .:.  .  : ::.::...:::. .
CCDS23 AGQYS-KQMKNLTMERGDQWPFLSELQWLKRRKRAVNPSRGIFEEMKYLELMIVNDHKTY
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pF1KB7 EQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQVQDDLLETLARL
       .. :.: . :.:::::::::.: :::::::::.::::.:::.. :.:..  . .. : ..
CCDS23 KKHRSSHAHTNNFAKSVVNLVDSIYKEQLNTRVVLVAVETWTEKDQIDITTNPVQMLHEF
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