FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7294, 769 aa
1>>>pF1KB7294 769 - 769 aa - 769 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9674+/-0.000967; mu= 19.7370+/- 0.059
mean_var=162.5648+/-29.907, 0's: 0 Z-trim(112.1): 89 B-trim: 12 in 1/50
Lambda= 0.100591
statistics sampled from 12795 (12886) to 12795 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.396), width: 16
Scan time: 4.450
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS43608.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 899) 2932 438.3 2.5e-122
CCDS43610.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 859) 2919 436.4 9.2e-122
CCDS47637.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 ( 906) 2919 436.4 9.5e-122
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CCDS7653.1 ADAM12 gene_id:8038|Hs108|chr10 ( 909) 1266 196.5 1.6e-49
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CCDS1085.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 839) 1228 191.0 6.8e-48
CCDS44236.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 862) 1228 191.0 6.9e-48
CCDS1087.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 863) 1228 191.0 6.9e-48
CCDS58031.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 824) 1222 190.1 1.2e-47
CCDS4338.1 ADAM19 gene_id:8728|Hs108|chr5 ( 918) 1210 188.4 4.4e-47
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CCDS60282.1 ADAM15 gene_id:8751|Hs108|chr1 ( 633) 1064 167.0 8.3e-41
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CCDS32111.1 ADAM20 gene_id:8748|Hs108|chr14 ( 776) 935 148.4 4.1e-35
CCDS3823.1 ADAM29 gene_id:11086|Hs108|chr4 ( 820) 919 146.1 2.1e-34
CCDS6045.1 ADAM7 gene_id:8756|Hs108|chr8 ( 754) 913 145.2 3.7e-34
CCDS6113.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 739) 888 141.6 4.5e-33
CCDS34884.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 735) 884 141.0 6.7e-33
CCDS34865.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 ( 775) 859 137.4 8.5e-32
CCDS83287.1 ADAM18 gene_id:8749|Hs108|chr8 ( 715) 850 136.0 2e-31
CCDS64882.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 716) 840 134.6 5.5e-31
CCDS47846.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8 ( 787) 835 133.9 9.6e-31
CCDS58103.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 742) 806 129.7 1.7e-29
CCDS31319.2 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 824) 803 129.3 2.5e-29
CCDS58102.1 ADAM8 gene_id:101|Hs108|chr10 ( 733) 753 122.0 3.5e-27
CCDS907.1 ADAM30 gene_id:11085|Hs108|chr1 ( 790) 752 121.9 4.1e-27
CCDS47830.1 ADAM28 gene_id:10863|Hs108|chr8 ( 540) 743 120.3 8e-27
CCDS64883.1 ADAM2 gene_id:2515|Hs108|chr8 ( 672) 698 113.9 8.4e-25
CCDS83286.1 ADAM32 gene_id:203102|Hs108|chr8 ( 688) 517 87.7 6.9e-17
CCDS55212.1 ADAMDEC1 gene_id:27299|Hs108|chr8 ( 391) 391 69.1 1.6e-11
CCDS6044.1 ADAMDEC1 gene_id:27299|Hs108|chr8 ( 470) 391 69.2 1.8e-11
>>CCDS11486.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17 (769 aa)
initn: 5487 init1: 5487 opt: 5487 Z-score: 4314.1 bits: 809.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5487; 100.0% identity (100.0% similar) in 769 aa overlap (1-769:1-769)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRLLRRWAFAALLLSLLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MRLLRRWAFAALLLSLLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EVRKQQLDTRVRQEPPGGPPVHLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EVRKQQLDTRVRQEPPGGPPVHLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GTTQHSTGAGDHCYYQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GTTQHSTGAGDHCYYQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 GNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSID
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 EYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 HDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 CLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB7 TGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA
730 740 750 760
>>CCDS82139.1 ADAM11 gene_id:4185|Hs108|chr17 (569 aa)
initn: 3902 init1: 3902 opt: 3927 Z-score: 3092.0 bits: 582.4 E(32554): 6.6e-166
Smith-Waterman score: 3927; 96.7% identity (97.7% similar) in 571 aa overlap (199-769:3-569)
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 EPQEVAGPWGAPQGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVR
: : : : : :. :. : . . :..::
CCDS82 MQGTRLPVCC-ACPVGSSKPAEAE---KEKVR
10 20
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 RGHPTVHSETKYVELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RGHPTVHSETKYVELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLV
30 40 50 60 70 80
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 AMETWADGDKIQVQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AMETWADGDKIQVQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGI
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350 360 370 380 390 400
pF1KB7 CSLSHGGGVNEYGNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CSLSHGGGVNEYGNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGF
150 160 170 180 190 200
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 YLPRKFSRCSIDEYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 YLPRKFSRCSIDEYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSR
210 220 230 240 250 260
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 AGGNCCKKCTLTHDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AGGNCCKKCTLTHDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLH
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pF1KB7 KLDGYYCDHEQGRCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KLDGYYCDHEQGRCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGW
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590 600 610 620 630 640
pF1KB7 VQCSKQDVLCGFLLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VQCSKQDVLCGFLLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSY
390 400 410 420 430 440
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pF1KB7 VEDGTACGPNMLCLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 VEDGTACGPNMLCLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKD
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pF1KB7 CSIHNPLPTSPPTGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CSIHNPLPTSPPTGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGG
510 520 530 540 550 560
pF1KB7 A
:
CCDS82 A
>>CCDS43609.1 ADAM22 gene_id:53616|Hs108|chr7 (870 aa)
initn: 2706 init1: 1621 opt: 2932 Z-score: 2309.7 bits: 438.3 E(32554): 2.5e-122
Smith-Waterman score: 2932; 56.5% identity (79.5% similar) in 727 aa overlap (50-768:52-770)
20 30 40 50 60 70
pF1KB7 PGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSG-GEVRKQQLDTRVRQEPPGG
: ::. .:.: : :.. :::::: . ::
CCDS43 PARCGQAGDASLMELEKRKENRFVERQSIVPLRLIYRSGGEDESRHDALDTRVRGDL-GG
30 40 50 60 70 80
80 90 100 110 120 130
pF1KB7 PPV-HLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSREGTTQHSTGAGDHCYYQG
: . :. :.:: . ::...: ::. ::: ::::.:.:::. . : : . : :.::::::
CCDS43 PQLTHVDQASFQVDAFGTSFILDVVLNHDLLSSEYIERHIEHGGKTVEVKG-GEHCYYQG
90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB7 KLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAPQGPLP-HLIYRTPLLP-
..:::: ::.:::::.::::.: ::: ::..::.: . : . : .:.. :.
CCDS43 HIRGNPDSFVALSTCHGLHGMFYDGNHTYLIEPEEN----DTTQEDFHFHSVYKSRLFEF
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KB7 --DPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKYVELIVINDHQLFE
: : : . .:.. ::. : :::.:: .:. ::::.::...::: .:.
CCDS43 SLDDLPS-EFQQVNITPSKFILKPRPK-RSKRQLRRYPRNVEEETKYIELMIVNDHLMFK
200 210 220 230 240 250
260 270 280 290 300 310
pF1KB7 QMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQVQDDLLETLARLM
. : ::: :...::::::.::.:::.::.:::::::::::: .:. .... : :: ..:
CCDS43 KHRLSVVHTNTYAKSVVNMADLIYKDQLKTRIVLVAMETWATDNKFAISENPLITLREFM
260 270 280 290 300 310
320 330 340 350 360 370
pF1KB7 VYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEYGNMGAMAVTLAQT
:::. . : :::.::::: :.:. :::::.:::::: .::::::.:. :::::::.
CCDS43 KYRRDFIKEKSDAVHLFSGSQFESSRSGAAYIGGICSLLKGGGVNEFGKTDLMAVTLAQS
320 330 340 350 360 370
380 390 400 410 420 430
pF1KB7 LGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSIDEYNQFLQEGGGSC
:..:.:.. .:.. ..:.::: : : :::: :::.:::.::..:.:.::..::. :::.:
CCDS43 LAHNIGIISDKRKLASGECKCEDTWSGCIMGDTGYYLPKKFTQCNIEEYHDFLNSGGGAC
380 390 400 410 420 430
440 450 460 470 480 490
pF1KB7 LFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLTHDAMCSDGLCCRR
::::: ::::::::::::.:.:::::::. :: :..::::::::.:..:::::::..
CCDS43 LFNKPSKLLDPPECGNGFIETGEECDCGTPAECVLEGAECCKKCTLTQDSQCSDGLCCKK
440 450 460 470 480 490
500 510 520 530 540 550
pF1KB7 CKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQGRCYGGRCKTRDRQ
::..: :. ::::::.::: :::.:.:::: ::.::.::: :: :: :.::::::::::
CCDS43 CKFQPMGTVCREAVNDCDIRETCSGNSSQCAPNIHKMDGYSCDGVQGICFGGRCKTRDRQ
500 510 520 530 540 550
560 570 580 590 600 610
pF1KB7 CQVLWGH--AAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGFLLCVNISGAPR
:. .::. .:.:..::::::.::::.:.::. . :.::.:.:::::.:::.::.. ::
CCDS43 CKYIWGQKVTASDKYCYEKLNIEGTEKGNCGKDKDTWIQCNKRDVLCGYLLCTNIGNIPR
560 570 580 590 600 610
620 630 640 650 660 670
pF1KB7 LGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNMLCLDHRCLPASA
::.: :.:.:. .::. :.: ::::.: . ::.:::::: :::.:.::.:::::...
CCDS43 LGELDGEITSTLVVQQGRTLNCSGGHVKLEEDVDLGYVEDGTPCGPQMMCLEHRCLPVAS
620 630 640 650 660 670
680 690 700 710 720 730
pF1KB7 FNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPPTGETERYKGPS
:::::: .: : ::: .:::::: ::.:. : :.::. . : . :: : .: .
CCDS43 FNFSTCLSSKEGTICSGNGVCSNELKCVCNRHWIGSDCNTYFPHNDDAKTGITLSGNGVA
680 690 700 710 720 730
740 750 760
pF1KB7 GTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA
::::::: :::..:: :..:: :.::.:: :. ::.:
CCDS43 GTNIIIGIIAGTILVLALILGITAWGYKNYREQRSNGLSHSWSERIPDTKHISDICENGR
740 750 760 770 780 790
CCDS43 PRSNSWQGNLGGNKKKIRGKRFRPRSNSTETLSPAKSPSSSTGSIASSRKYPYPMPPLPD
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]