Result of FASTA (omim) for
pF1KB7294
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB7294, 769 aa
1>>>pF1KB7294 769 - 769 aa - 769 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6378+/-0.000384; mu= 15.3972+/- 0.024
mean_var=167.1303+/-31.356, 0's: 0 Z-trim(119.1): 244 B-trim: 151 in 1/55
Lambda= 0.099208
statistics sampled from 32469 (32784) to 32469 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.721), E-opt: 0.2 (0.384), width: 16
Scan time: 12.630
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002381 (OMIM: 155120) disintegrin and metallopr ( 769) 5487 798.2 0
XP_005257430 (OMIM: 155120) PREDICTED: disintegrin ( 774) 5461 794.5 0
NP_001305862 (OMIM: 155120) disintegrin and metall ( 569) 3927 574.8 3.5e-163
XP_016880136 (OMIM: 155120) PREDICTED: disintegrin ( 574) 3901 571.1 4.7e-162
NP_068367 (OMIM: 603709) disintegrin and metallopr ( 823) 2932 432.6 3.3e-120
NP_001311346 (OMIM: 603709) disintegrin and metall ( 869) 2932 432.6 3.4e-120
NP_057435 (OMIM: 603709) disintegrin and metallopr ( 870) 2932 432.6 3.4e-120
NP_001311350 (OMIM: 603709) disintegrin and metall ( 890) 2932 432.6 3.5e-120
NP_068368 (OMIM: 603709) disintegrin and metallopr ( 899) 2932 432.6 3.5e-120
XP_016867825 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 907) 2932 432.6 3.5e-120
XP_016867820 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 935) 2932 432.6 3.6e-120
XP_011514625 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 936) 2932 432.6 3.6e-120
NP_004185 (OMIM: 603709) disintegrin and metallopr ( 859) 2919 430.7 1.2e-119
XP_016867827 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 905) 2919 430.7 1.3e-119
NP_068369 (OMIM: 603709) disintegrin and metallopr ( 906) 2919 430.7 1.3e-119
XP_016867822 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 926) 2919 430.7 1.3e-119
NP_001311349 (OMIM: 603709) disintegrin and metall ( 935) 2919 430.8 1.3e-119
XP_016867821 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 935) 2919 430.8 1.3e-119
XP_005250502 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 958) 2919 430.8 1.3e-119
NP_001311348 (OMIM: 603709) disintegrin and metall ( 963) 2919 430.8 1.3e-119
NP_001311347 (OMIM: 603709) disintegrin and metall ( 964) 2919 430.8 1.3e-119
XP_011514624 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 972) 2919 430.8 1.3e-119
XP_006716092 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 978) 2919 430.8 1.4e-119
XP_011514623 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 987) 2919 430.8 1.4e-119
XP_011514622 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 995) 2919 430.8 1.4e-119
XP_011514621 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin (1000) 2919 430.8 1.4e-119
XP_011514620 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin (1001) 2919 430.8 1.4e-119
XP_006716091 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin (1024) 2919 430.8 1.4e-119
XP_016867828 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 887) 2866 423.1 2.4e-117
XP_016867826 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 907) 2866 423.2 2.5e-117
XP_016867824 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 916) 2866 423.2 2.5e-117
XP_016867823 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 924) 2866 423.2 2.5e-117
XP_016867818 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 953) 2866 423.2 2.6e-117
XP_016867819 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 952) 2853 421.3 9.3e-117
XP_011514626 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 927) 2852 421.2 1e-116
NP_003803 (OMIM: 603710) disintegrin and metallopr ( 832) 2621 388.0 8.4e-107
XP_011510388 (OMIM: 603710) PREDICTED: disintegrin ( 832) 2531 375.2 6.3e-103
XP_005246989 (OMIM: 603710) PREDICTED: disintegrin ( 832) 2424 359.8 2.6e-98
XP_016867830 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 505) 1953 292.2 3.7e-78
XP_016867829 (OMIM: 603709) PREDICTED: disintegrin ( 636) 1940 290.4 1.5e-77
NP_001275904 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 735) 1269 194.5 1.4e-48
NP_001275903 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 737) 1269 194.5 1.4e-48
NP_001275902 (OMIM: 602714) disintegrin and metall ( 906) 1269 194.6 1.6e-48
NP_067673 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 738) 1266 194.0 1.9e-48
NP_003465 (OMIM: 602714) disintegrin and metallopr ( 909) 1266 194.1 2.1e-48
NP_997074 (OMIM: 605548) disintegrin and metallopr ( 772) 1228 188.6 8.3e-47
NP_001248394 (OMIM: 605548) disintegrin and metall ( 796) 1228 188.6 8.5e-47
NP_003806 (OMIM: 605548) disintegrin and metallopr ( 814) 1228 188.7 8.6e-47
NP_997078 (OMIM: 605548) disintegrin and metallopr ( 838) 1228 188.7 8.8e-47
NP_997077 (OMIM: 605548) disintegrin and metallopr ( 839) 1228 188.7 8.8e-47
>>NP_002381 (OMIM: 155120) disintegrin and metalloprotei (769 aa)
initn: 5487 init1: 5487 opt: 5487 Z-score: 4255.7 bits: 798.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5487; 100.0% identity (100.0% similar) in 769 aa overlap (1-769:1-769)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRLLRRWAFAALLLSLLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MRLLRRWAFAALLLSLLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EVRKQQLDTRVRQEPPGGPPVHLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EVRKQQLDTRVRQEPPGGPPVHLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GTTQHSTGAGDHCYYQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GTTQHSTGAGDHCYYQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 QGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 GNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSID
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 EYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 HDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 CLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 CLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB7 TGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA
730 740 750 760
>>XP_005257430 (OMIM: 155120) PREDICTED: disintegrin and (774 aa)
initn: 5461 init1: 5461 opt: 5461 Z-score: 4235.6 bits: 794.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5461; 100.0% identity (100.0% similar) in 765 aa overlap (1-765:1-765)
10 20 30 40 50 60
pF1KB7 MRLLRRWAFAALLLSLLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MRLLRRWAFAALLLSLLPTPGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSGG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB7 EVRKQQLDTRVRQEPPGGPPVHLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EVRKQQLDTRVRQEPPGGPPVHLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSRE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB7 GTTQHSTGAGDHCYYQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GTTQHSTGAGDHCYYQGKLRGNPHSFAALSTCQGLHGVFSDGNLTYIVEPQEVAGPWGAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB7 QGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVRRGHPTVHSETKY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB7 VELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLVAMETWADGDKIQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB7 VQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGICSLSHGGGVNEY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB7 GNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGFYLPRKFSRCSID
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB7 EYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSRAGGNCCKKCTLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB7 HDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 HDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLHKLDGYYCDHEQG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB7 RCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGWVQCSKQDVLCGF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB7 LLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSYVEDGTACGPNML
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB7 CLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CLDHRCLPASAFNFSTCPGSGERRICSHHGVCSNEGKCICQPDWTGKDCSIHNPLPTSPP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB7 TGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRSGGA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TGETERYKGPSGTNIIIGSIAGAVLVAAIVLGGTGWGFKNIRRGRYDPTQQGAV
730 740 750 760 770
>>NP_001305862 (OMIM: 155120) disintegrin and metallopro (569 aa)
initn: 3902 init1: 3902 opt: 3927 Z-score: 3050.6 bits: 574.8 E(85289): 3.5e-163
Smith-Waterman score: 3927; 96.7% identity (97.7% similar) in 571 aa overlap (199-769:3-569)
170 180 190 200 210 220
pF1KB7 EPQEVAGPWGAPQGPLPHLIYRTPLLPDPLGCREPGCLFAVPAQSAPPNRPRLRRKRQVR
: : : : : :. :. : . . :..::
NP_001 MQGTRLPVCC-ACPVGSSKPAEAE---KEKVR
10 20
230 240 250 260 270 280
pF1KB7 RGHPTVHSETKYVELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGHPTVHSETKYVELIVINDHQLFEQMRQSVVLTSNFAKSVVNLADVIYKEQLNTRIVLV
30 40 50 60 70 80
290 300 310 320 330 340
pF1KB7 AMETWADGDKIQVQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AMETWADGDKIQVQDDLLETLARLMVYRREGLPEPSDATHLFSGRTFQSTSSGAAYVGGI
90 100 110 120 130 140
350 360 370 380 390 400
pF1KB7 CSLSHGGGVNEYGNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CSLSHGGGVNEYGNMGAMAVTLAQTLGQNLGMMWNKHRSSAGDCKCPDIWLGCIMEDTGF
150 160 170 180 190 200
410 420 430 440 450 460
pF1KB7 YLPRKFSRCSIDEYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLPRKFSRCSIDEYNQFLQEGGGSCLFNKPLKLLDPPECGNGFVEAGEECDCGSVQECSR
210 220 230 240 250 260
470 480 490 500 510 520
pF1KB7 AGGNCCKKCTLTHDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGGNCCKKCTLTHDAMCSDGLCCRRCKYEPRGVSCREAVNECDIAETCTGDSSQCPPNLH
270 280 290 300 310 320
530 540 550 560 570 580
pF1KB7 KLDGYYCDHEQGRCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KLDGYYCDHEQGRCYGGRCKTRDRQCQVLWGHAAADRFCYEKLNVEGTERGSCGRKGSGW
330 340 350 360 370 380
590 600 610 620 630 640
pF1KB7 VQCSKQDVLCGFLLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VQCSKQDVLCGFLLCVNISGAPRLGDLVGDISSVTFYHQGKELDCRGGHVQLADGSDLSY
390 400 410 420 430 440
650 660 670 680 690 700
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:
NP_001 A
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>>NP_057435 (OMIM: 603709) disintegrin and metalloprotei (870 aa)
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pF1KB7 PGLGTQGPAGALRWGGLPQLGGPGAPEVTEPSRLVRESSG-GEVRKQQLDTRVRQEPPGG
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pF1KB7 PPV-HLAQVSFVIPAFNSNFTLDLELNHHLLSSQYVERHFSREGTTQHSTGAGDHCYYQG
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NP_057 PQLTHVDQASFQVDAFGTSFILDVVLNHDLLSSEYIERHIEHGGKTVEVKG-GEHCYYQG
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769 residues in 1 query sequences
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Total Scan time: 12.630 Total Display time: 0.210
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]