FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 Query: pF1KB7295, 889 aa 1>>>pF1KB7295 889 - 889 aa - 889 aa Library: human.CCDS.faa 18511270 residues in 32554 sequences Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.2949+/-0.00131; mu= -13.6885+/- 0.080 mean_var=770.9960+/-156.539, 0's: 0 Z-trim(117.0): 35 B-trim: 58 in 1/55 Lambda= 0.046190 statistics sampled from 17702 (17734) to 17702 sequences Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized] Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2 ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.545), width: 16 Scan time: 5.510 The best scores are: opt bits E(32554) CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19 ( 889) 6142 425.0 2.9e-118 CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15 (1203) 3530 251.1 8.8e-66 CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5 ( 890) 3344 238.6 3.9e-62 CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1 ( 774) 3083 221.1 6.1e-57 >>CCDS12035.1 HCN2 gene_id:610|Hs108|chr19 (889 aa) initn: 6142 init1: 6142 opt: 6142 Z-score: 2236.7 bits: 425.0 E(32554): 2.9e-118 Smith-Waterman score: 6142; 100.0% identity (100.0% similar) in 889 aa overlap (1-889:1-889) 10 20 30 40 50 60 pF1KB7 MDARGGGGRPGESPGATPAPGPPPPPPPAPPQQQPPPPPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 MDARGGGGRPGESPGATPAPGPPPPPPPAPPQQQPPPPPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEA 10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 pF1KB7 LPPEAADEGGPRGRLRSRDSSCGRPGTPGAASTAKGSPNGECGRGEPQCSPAGPEGPARG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LPPEAADEGGPRGRLRSRDSSCGRPGTPGAASTAKGSPNGECGRGEPQCSPAGPEGPARG 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 pF1KB7 PKVSFSCRGAASGPAPGPGPAEEAGSEEAGPAGEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 PKVSFSCRGAASGPAPGPGPAEEAGSEEAGPAGEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSL 130 140 150 160 170 180 190 200 210 220 230 240 pF1KB7 RMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDET :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 RMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDET 190 200 210 220 230 240 250 260 270 280 290 300 pF1KB7 TAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDNTEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 TAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDNTEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIP 250 260 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 pF1KB7 VDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 VDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVRFTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDL 310 320 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 pF1KB7 ASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 ASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQDFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFK 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 pF1KB7 AMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 AMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKY 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 530 540 pF1KB7 KQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKMFDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 KQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKMFDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVA 490 500 510 520 530 540 550 560 570 580 590 600 pF1KB7 SMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMK :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 SMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMK 550 560 570 580 590 600 610 620 630 640 650 660 pF1KB7 LSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 LSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRL 610 620 630 640 650 660 670 680 690 700 710 720 pF1KB7 DRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQEIVKYDREMVQQAELGQRVGLFPPPPPP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 DRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQEIVKYDREMVQQAELGQRVGLFPPPPPP 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 780 pF1KB7 PQVTSAIATLQQAAAMSFCPQVARPLVGPLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPPPASP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 PQVTSAIATLQQAAAMSFCPQVARPLVGPLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPPPASP 730 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 840 pF1KB7 PGAPASPRAPRTSPYGGLPAAPLAGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRP :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 PGAPASPRAPRTSPYGGLPAAPLAGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRP 790 800 810 820 830 840 850 860 870 880 pF1KB7 ASSSTPRLGPTPAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: CCDS12 ASSSTPRLGPTPAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL 850 860 870 880 >>CCDS10248.1 HCN4 gene_id:10021|Hs108|chr15 (1203 aa) initn: 3567 init1: 3404 opt: 3530 Z-score: 1294.5 bits: 251.1 E(32554): 8.8e-66 Smith-Waterman score: 3604; 65.7% identity (75.5% similar) in 935 aa overlap (41-887:52-971) 20 30 40 50 60 70 pF1KB7 GESPGATPAPGPPPPPPPAPPQQQPPPPPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEALPPEAADEGG : : :.:. : :. :: ::: : CCDS10 KAWIMDEEEDAEEEGAGGRQDPSRRSIRLRPLPSPSPSAAAGGTESRSSALG--AADSEG 30 40 50 60 70 80 90 100 110 pF1KB7 P-RG-----------RLRSRDSSCGRPGTPGAASTAKGSPNG------ECGR--GEPQCS : :: :.:. .: : : :...:..:: .: : : .: . : CCDS10 PARGAGKSSTNGDCRRFRGSLASLGSRGG-GSGGTGSGSSHGHLHDSAEERRLIAEGDAS 80 90 100 110 120 130 120 130 140 150 pF1KB7 PA---GPEGPARGP-KVSFSCRGAASGPAPG--PGPAEEA-------------GSEEAG- :. : : : : . . : . ::: : : : :: . :. :: CCDS10 PGEDRTPPGLAAEPERPGASAQPAASPPPPQQPPQPASASCEQPSVDTAIKVEGGAAAGD 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 pF1KB7 ---PAGEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPY : .: : .::.::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::: :::::: CCDS10 QILPEAEVRLGQAGFMQRQFGAMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGFWIIHPY 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 pF1KB7 SDFRFYWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGI ::::::::.::::.::::::::::::::::::.:.::::::::::::::.:::::::::: CCDS10 SDFRFYWDLTMLLLMVGNLIIIPVGITFFKDENTTPWIVFNVVSDTFFLIDLVLNFRTGI 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 pF1KB7 VIEDNTEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVR :.::::::::::..:: :::..::.:::.::::::::::::: :::::::::::::::: CCDS10 VVEDNTEIILDPQRIKMKYLKSWFMVDFISSIPVDYIFLIVETRIDSEVYKTARALRIVR 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 pF1KB7 FTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::: CCDS10 FTKILSLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIVNLIGMMLLLCHWDGCLQFL 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 440 pF1KB7 VPMLQDFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLS :::::::: .::::::.:::.::.. ::.::::::::::::::::::: .:.:.:::::: CCDS10 VPMLQDFPDDCWVSINNMVNNSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGRQAPVGMSDVWLTMLS 440 450 460 470 480 490 450 460 470 480 490 500 pF1KB7 MIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHR :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: : ::.:::::::: CCDS10 MIVGATCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPPDTRQRIHDYYEHR 500 510 520 530 540 550 510 520 530 540 550 560 pF1KB7 YQGKMFDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQP ::::::::.::::::. ::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::.:::::: CCDS10 YQGKMFDEESILGELSEPLREEIINFNCRKLVASMPLFANADPNFVTSMLTKLRFEVFQP 560 570 580 590 600 610 570 580 590 600 610 620 pF1KB7 GDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTY ::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::::::::::::::::::: CCDS10 GDYIIREGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKETKLADGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTY 620 630 640 650 660 670 630 640 650 660 670 680 pF1KB7 CRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQE :::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: :: CCDS10 CRLYSLSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVALDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNYQE 680 690 700 710 720 730 690 700 710 720 730 740 pF1KB7 NAIIQEIVKYDREMVQQAELGQRVGLFPPPPPPPQVTSAI-ATLQQAAAMSFCPQVARPL : :::.::..::::.. :. : .. : : : : : : :: ::: . .:: : CCDS10 NEIIQQIVQHDREMAHCAHRVQAAASATPTPTPVIWTPLIQAPLQAAAATT---SVAIAL 740 750 760 770 780 790 750 760 770 780 790 pF1KB7 VGPLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPP----------P-----ASPPGAPASPRAPR . : : . ::::: . . . : : : ::: ..:.. .: CCDS10 THHPRL--PAAIFRPPPGSGLGNLGAGQTPRHLKRLQSLIPSALGSASPASSPSQVDTPS 800 810 820 830 840 850 800 810 820 830 840 pF1KB7 TSPY-----GGLPAAPLAGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRP------ .: . .:. : .: ::. : . : . ..:: : . : ::.: CCDS10 SSSFHIQQLAGFSAPAGLSPLLPSS--SSSPPPGACGSPSAPTPSAGVAATTIAGFGHFH 860 870 880 890 900 910 850 860 870 880 pF1KB7 -------ASSSTPRLGPT-PAAR---AAAPSPDRRDSASPGAAGGLD-------PQDSAR .::..: : : :.:: :: ::: : ::: ::: : :.: CCDS10 KALGGSLSSSDSPLLTPLQPGARSPQAAQPSP-----APPGARGGLGLPEHFLPPPPSSR 920 930 940 950 960 pF1KB7 SRLSSNL : :: CCDS10 SPSSSPGQLGQPPGELSLGLATGPLSTPETPPRQPEPPSLVAGASGGASPVGFTPRGGLS 970 980 990 1000 1010 1020 >>CCDS3952.1 HCN1 gene_id:348980|Hs108|chr5 (890 aa) initn: 3294 init1: 3208 opt: 3344 Z-score: 1229.0 bits: 238.6 E(32554): 3.9e-62 Smith-Waterman score: 3392; 65.4% identity (78.3% similar) in 835 aa overlap (68-859:2-823) 40 50 60 70 80 90 pF1KB7 PPPPAPPPGPGPAPPQHPPRAEALPPEAADEGG--PRGRLRSRDSSCGRPGTPGAASTAK ::: : . :::. : :. ::.. CCDS39 MEGGGKPNSSSNSRDD--GNSVFPAKASATG 10 20 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 GSPNGECGR-GEPQCSPAGPEGPAR--GPKVSFSCRGAASGPAPGPGPAEEAGSEEAGPA ..: . : : : :.: . :. : .: :. :...: . : : : ::. : : CCDS39 AGPAAAEKRLGTP---PGGGGAGAKEHGNSVCFKVDGGGGGGGGGGGGEEPAGGFE--DA 30 40 50 60 70 80 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 GEPRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRF :: : .:::::: ..::::::::::::::::::::.::::::.:: ::::::::::: CCDS39 EGPR-RQYGFMQRQFTSMLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEKEQERVKTAGFWIIHPYSDFRF 90 100 110 120 130 140 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 YWDFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDN :::. ::..:::::.::::::::: ..::.:::.:::.::: ::.::..::::: : ::. CCDS39 YWDLIMLIMMVGNLVIIPVGITFFTEQTTTPWIIFNVASDTVFLLDLIMNFRTGTVNEDS 150 160 170 180 190 200 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 TEIILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIVEKGIDSEVYKTARALRIVRFTKIL .::::::. :: .::..::::::.:::::::::::::::.:::::::::::::::::::: CCDS39 SEIILDPKVIKMNYLKSWFVVDFISSIPVDYIFLIVEKGMDSEVYKTARALRIVRFTKIL 210 220 230 240 250 260 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ ::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.:::::::::::::::::.:: CCDS39 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPLLQ 270 280 290 300 310 320 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 DFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGA ::: .::::.: ::: ::.. ::.::::::::::::::: ::: ::.:.:.::::::::: CCDS39 DFPPDCWVSLNEMVNDSWGKQYSYALFKAMSHMLCIGYGAQAPVSMSDLWITMLSMIVGA 330 340 350 360 370 380 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKM ::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::. CCDS39 TCYAMFVGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADMRQKIHDYYEHRYQGKI 390 400 410 420 430 440 520 530 540 550 560 570 pF1KB7 FDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYII :::..::.::: ::::::::::::::::.::::::::::::::::.::.::::::::::: CCDS39 FDEENILNELNDPLREEIVNFNCRKLVATMPLFANADPNFVTAMLSKLRFEVFQPGDYII 450 460 470 480 490 500 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 REGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS :::..:::::::::::..:.::..:::::.::::::::::::.::::::::::::::::: CCDS39 REGAVGKKMYFIQHGVAGVITKSSKEMKLTDGSYFGEICLLTKGRRTASVRADTYCRLYS 510 520 530 540 550 560 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQ :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: :.:::.:::::::: :.. CCDS39 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLQKFQKDLNTGVFNNQENEILK 570 580 590 600 610 620 700 710 720 pF1KB7 EIVKYDREMVQ---------QAELGQRVGLFPPP-------PPPPQVTS----------- .:::.:::::: .. :.. . : :: .:: CCDS39 QIVKHDREMVQAIAPINYPQMTTLNSTSSTTTPTSRMRTQSPPVYTATSLSHSNLHSPSP 630 640 650 660 670 680 730 740 750 760 770 pF1KB7 AIATLQQAAAMSFC--------PQVARPLVG-PLALGSPRLVRRPPPGPAPAAASPGPPP . : : .: .: : : : ::.. . .:: . : : CCDS39 STQTPQPSAILSPCSYTTAVCSPPVQSPLAARTFHYASPTASQLSLMQQQPQQQVQQSQP 690 700 710 720 730 740 780 790 800 810 820 830 pF1KB7 PASPPGAPASPRAPRTSPYGGLPAAPL--AGPALPARRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGP : . : : ::. :.: : .. : . . :: :.: :::::::::::: . CCDS39 PQTQPQQP-SPQ-PQT-PGSSTPKNEVHKSTQALHNTNLTREVRPLSASQPSLPHEVS-- 750 760 770 780 790 840 850 860 870 880 pF1KB7 AASTRPASSSTPRLGPTPAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL . .:: . :. : .:.: CCDS39 TLISRPHPTVGESLASIPQPVTAVPGTGLQAGGRSTVPQRVTLFRQMSSGAIPPNRGVPP 800 810 820 830 840 850 >>CCDS1108.1 HCN3 gene_id:57657|Hs108|chr1 (774 aa) initn: 2350 init1: 2127 opt: 3083 Z-score: 1135.7 bits: 221.1 E(32554): 6.1e-57 Smith-Waterman score: 3098; 64.7% identity (79.9% similar) in 771 aa overlap (129-869:10-765) 100 110 120 130 140 150 pF1KB7 NGECGRGEPQCSPAGPEGPARGPKVSFSCRGAASGPAPG----PGPAEEAGSEEAGPAGE ::. : .:: : : .. .:: CCDS11 MEAEQRPAAGASEGATPGLEAVPPVAPPPATAASGPI-- 10 20 30 160 170 180 190 200 210 pF1KB7 PRGSQASFMQRQFGALLQPGVNKFSLRMFGSQKAVEREQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYW :. : .:..:.:::: :::::::.:::.:::: ::::::::::::::::::::::: CCDS11 PK-SGPEPKRRHLGTLLQPTVNKFSLRVFGSHKAVEIEQERVKSAGAWIIHPYSDFRFYW 40 50 60 70 80 90 220 230 240 250 260 270 pF1KB7 DFTMLLFMVGNLIIIPVGITFFKDETTAPWIVFNVVSDTFFLMDLVLNFRTGIVIEDNTE :. :::.::::::..::::::::.:.. :::::::.::::::.:::::::::::.:...: CCDS11 DLIMLLLMVGNLIVLPVGITFFKEENSPPWIVFNVLSDTFFLLDLVLNFRTGIVVEEGAE 100 110 120 130 140 150 280 290 300 310 320 330 pF1KB7 IILDPEKIKKKYLRTWFVVDFVSSIPVDYIFLIVE--KGIDSEVYKTARALRIVRFTKIL :.: :. :. .::::::.::..::::::::::.:: .:.:::::::::::::::::: CCDS11 ILLAPRAIRTRYLRTWFLVDLISSIPVDYIFLVVELEPRLDAEVYKTARALRIVRFTKIL 160 170 180 190 200 210 340 350 360 370 380 390 pF1KB7 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVMRICNLISMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ ::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :::.:::::::::::::::::::: CCDS11 SLLRLLRLSRLIRYIHQWEEIFHMTYDLASAVVRIFNLIGMMLLLCHWDGCLQFLVPMLQ 220 230 240 250 260 270 400 410 420 430 440 450 pF1KB7 DFPRNCWVSINGMVNHSWSELYSFALFKAMSHMLCIGYGRQAPESMTDIWLTMLSMIVGA ::: .:::::: ::::::.. :: :::::::::::::::.::: .: :.::::::::::: CCDS11 DFPPDCWVSINHMVNHSWGRQYSHALFKAMSHMLCIGYGQQAPVGMPDVWLTMLSMIVGA 280 290 300 310 320 330 460 470 480 490 500 510 pF1KB7 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADFRQKIHDYYEHRYQGKM ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::.:::::::::: CCDS11 TCYAMFIGHATALIQSLDSSRRQYQEKYKQVEQYMSFHKLPADTRQRIHEYYEHRYQGKM 340 350 360 370 380 390 520 530 540 550 560 570 pF1KB7 FDEDSILGELNGPLREEIVNFNCRKLVASMPLFANADPNFVTAMLTKLKFEVFQPGDYII :::.::::::. ::::::.::.:: ::: :::::.:::.::::.::::.:::::::: .. CCDS11 FDEESILGELSEPLREEIINFTCRGLVAHMPLFAHADPSFVTAVLTKLRFEVFQPGDLVV 400 410 420 430 440 450 580 590 600 610 620 630 pF1KB7 REGTIGKKMYFIQHGVVSVLTKGNKEMKLSDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS :::..:.::::::::..:::..: .. .:.:::::::::::::::::::::::::::::: CCDS11 REGSVGRKMYFIQHGLLSVLARGARDTRLTDGSYFGEICLLTRGRRTASVRADTYCRLYS 460 470 480 490 500 510 640 650 660 670 680 690 pF1KB7 LSVDNFNEVLEEYPMMRRAFETVAIDRLDRIGKKNSILLHKVQHDLNSGVFNNQENAIIQ ::::.:: ::::.:::::::::::.::: ::::::::: .: . . . : .. . . : CCDS11 LSVDHFNAVLEEFPMMRRAFETVAMDRLLRIGKKNSILQRK-RSEPSPG---SSGGIMEQ 520 530 540 550 560 570 700 710 720 730 740 pF1KB7 EIVKYDREMVQQ---------AELGQRVGLFPPPPPPPQVTSAIATLQQAAAMSFCPQVA ..:..::.:.. :.:. . :. : : ..:... .:... : . CCDS11 HLVQHDRDMARGVRGRAPSTGAQLSGKPVLWEPLVHAPLQAAAVTS---NVAIALTHQRG 580 590 600 610 620 750 760 770 780 790 pF1KB7 RPLVGPLALGSP-RLVRRPPPGPAPAAASPGPP----PPASPPGAPASP-RAPRTS-PYG :: ::. :: :. : : . ::: : : :: :: : :. ..: . CCDS11 -PL--PLSPDSPATLLARSAWRSAGSPASPLVPVRAGPWASTSRLPAPPARTLHASLSRA 630 640 650 660 670 680 800 810 820 830 840 850 pF1KB7 GLPAAPLAGPALPA---RRLSRASRPLSASQPSLPHGAPGPAASTRPASSSTPRLGPT-- : . : :: :. :::. .:::::::::::. : : .. : .:.: :: :. CCDS11 GRSQVSLLGPP-PGGGGRRLGPRGRPLSASQPSLPQRATGDGSPGRKGSGSE-RLPPSGL 690 700 710 720 730 740 860 870 880 pF1KB7 ---PAARAAAPSPDRRDSASPGAAGGLDPQDSARSRLSSNL : : : : . :.: CCDS11 LAKPPRTAQPPRPPVPEPATPRGLQLSANM 750 760 770 889 residues in 1 query sequences 18511270 residues in 32554 library sequences Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc) start: Sat Nov 5 08:30:28 2016 done: Sat Nov 5 08:30:29 2016 Total Scan time: 5.510 Total Display time: 0.120 Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]